4KNDA

Thioredoxin from anaeromyxobacter dehalogenans.
Total Genus 28
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
28
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
DVVVLQDSTFEQEVLKSDTPVLVDFWAVWCGPCKAIAPVVDDLAARYKGKLKVAKMDVDQHQGVPQQYGIRSIPTLLVFKGGRVVDTVIGADKTRLEDSVKKAIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Thioredoxin from Anaeromyxobacter dehalogenans.
rcsb
molecule keywords Thioredoxin
molecule tags Oxidoreductase
source organism Anaeromyxobacter dehalogenans
total genus 28
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4kndA00
2HE3A 4IGJA 4HQSA 4HI7A 3ERWA 1TJDA 2VL9A 1ZL9A 6GSVA 2GLRA 1K0MA 3ZVJA 1K0AA 4AJ8A 4G19A 2MBTA 1YKAA 1R5PA 2PPTA 1XIYA 3HDCA 1GUKA 1KEBA 5C00A 3A2VA 1B4QA 3KMOA 4ULXA 1B48A 2WDUA 3MAKA 3KTLA 1PX6A 2VLTA 3EINA 4HDEA 3E0UA 4JBBA 5A5KA 1YEXA 2L6CA 1S3DA 1VF2A 2CT6A 2B5EA 5IM9A 3TOUA 3ZFBA 3G7JA 1GSSA 1Z9HA 2YWOA 2REMA 1FB6A 2VM1A 3D4MA 2C80A 4EO3A 5CRWA 4YQUA 3C1SA 5IQYA 3JCML 5EY6A 2H1GA 4RQXA 3O6TA 4KW6A 4YQVA 5GSSA 1B9XC 3NIVA 2DMLA 2N5FA 1PMTA 1U6TA 3LEFA 1OC9A 4OWYA 5KN2A 5IMAA 2DJJA 1EOHA 3ISOA 4WKWA 1TW9A 1YJ6A 4XS1A 4ZXGA 2IMFA 2OBKA 1KTEA 2F8FA 4ECCA 1G6YA 4ZIJA 4ML1A 1CQHA 12GSA 2H74A 2HNLA 2IIYA 4GSNA 2YOIA 1FAAA 2CA8A 1N2AA 3CXGA 5AIVA 2HXKA 2E2MA 3FYGA 4PNGA 3ZITA 4BWSA 1ILOA 3ZMLA 5ECRB 4XS4A 5G1LA 4G9HA 4JR6A 4POKA 4E8HA 1JZDA 2BMXA 3UIWA 1NM3A 2F9SA 1IYIA 1A24A 3F0IA 2R2JA 1B4PA 2A2RA 2QC7A 3F4TA 4HJ2A 3TJFA 1VF3A 2V32A 3PINA 2QSIA 2B6MA 4K8MA 5B8AA 1AIUA 1M2DA 13GSA 4DSSA 2M72A 2X99A 2DMMA 5L71A 2JL4A 2E0QA 19GSA 4TOPA 2B7JA 4TR1A 4BVYA 16GSA 4LA1A 3HY2A 5C04A 1G6WA 1V58A 2HZEA 4KX4A 2VD0A 1M9AA 2WS2A 1EGOA 3ME8A 3DMLA 5DJMA 1S3CA 1X9WB 1OAZA 4WBJA 1EEMA 5CAXA 5DALA 3W8SA 4HU7A 5IIZA 3HYPA 5FT3A 5EL8A 3GA4A 4LMVA 4HJMA 3I9V2 2O87A 4PNFA 3QOUA 1SJZA 5B6NA 4MJBA 2L5LA 2E2GA 3LORA 2O89A 2GZYA 4WF4A 5LNKe 3FZ4A 2V6OA 4OO5A 3U6VA 5DBQA 2HT9A 3GFKA 1SJ6A 4KDYA 1O7UA 1HNBA 3WGXA 4EKZA 3FR9A 3RAZA 2IL3A 1ZYEA 1WJKA 4MZBA 1USBA 1OYJA 4JU5A 1EV4A 5ECKB 3BBYA 1F37A 2WULA 2C3TA 1ZOFA 2C0GA 11GSA 3PGTA 3WGEA 2CVKA 1J0FA 5D8IA 1H4OA 1PKWA 2PU9C 5AGYA 2RUEA 3F4RA 3KP8A 4EUYA 3KJYA 5KN1A 4Q5NA 1XFLA 5D73A 2H73A 2F3MA 4TXOB 2HSHA 4QQ7A 2B3SA 2AAWA 2GS3A 5IPHA 2O85A 1TP9A 4O92A 4BVXA 1AAZA 2EIQA 1B8XA 2VLUA 4HZ4A 3HVVA 4J57E 3IXRA 1TK0B 1OVNA 4V1Ag 1LJRA 2R5GA 4KH7A 3LXTA 2JZRA 5ECPB 2WCIA 4EE0A 1BG5A 2VCXA 3EE2A 3M9JA 4IBPA 2C8UA 3UAPA 1JLWA 1UVZA 1PSQA 4K7OA 4N0ZA 3US3A 1PQNA 1YF0A 3L4NA 2AB6A 2VIMA 2JU5A 2YJHA 4DVCA 4LL1B 4AF2A 4YAVA 4BL7A 1W89A 5EPFA 3I43A 1SKRB 1QMVA 3UARA 1ZZYA 4D73A 3L0HA 3FR3A 4GWRA 3MWHA 5J9CA 3HA9A 4XHMA 4Q5FA 4JZQA 2YZHA 5AISA 1G7OA 2QGVA 2HSYA 1XXUA 2CX4A 4ZB8A 2LV3A 3VWXA 2IMDA 1TRVA 3TCOA 5ID2A 5ECOB 2LNSA 1BX9A 2H71A 2R3XA 4AGSA 1YDKA 3D4TA 4GTUA 3F63A 2DIYA 2FWEA 3F3QA 3DWVA 4FO5A 4V2NA 5B6MA 2G0FA 5DCGA 2DJ2A 1DE1A 1XWKA 4EF0A 1A2JA 4XTSA 2H1DA 5JWQB 1ZCPA 3IAM2 3GX8A 1HNCA 2WFCA 1PX7A 2P5QA 2V41A 4LL4B 3TRQA 3DVWA 2GDRA 2DIZA 3GUSA 5DAKA 2HI7A 1TK5B 2VOCA 4PXOA 2JACA 4K0NA 1RK4A 4PX1A 5G2ZA 4K7NA 1YEPA 2YJ7A 4ML6A 4MJCA 1Z5YE 3UL3A 4F0BA 2TRCP 4L0WA 1F6MC 1HQOA 4KDXA 4CHSA 4OFTA 2CZ2A 3E3EA 4NPBA 4IKHA 2C0EA 3ERFA 2V2GA 1MDJA 4XCSA 1XW5A 2OBIA 3IA1A 1GP1A 2H30A 3PH9A 4WR4A 3QR6A 4K9ZA 1O85A 3TDGA 3DGQA 4OFMA 1SKSB 3CSHA 1TRUA 2PVOC 4GF0A 3VWUA 4YQMA 3H79A 3OR5A 2YV7A 3D0ZA 3IPZA 1YKCA 4EC0A 4IQ1A 3TRXA 4WXTA 4F9ZA 3KP9A 5ELGA 3GKMA 3FR6A 1T1VA 1HYUA 5LD0A 1JZWA 5H5RA 1YY7A 2LTKA 3Q19A 4KDUA 1VRSD 2JSYA 2YV9A 4KSOA 5J9BA 4OCEA 2L5OA 2OE3A 3P7XA 2MMAA 3APOA 5D9TA 2P31A 4KCAA 4L5OA 2FCHA 5DQYA 2HFDA 1LBKA 4Q5QA 3GURA 2XBQA 3EMPA 2AYTA 2L59A 1ZGNA 1PKZA 4N0VA 2KOKA 3EVIA 4LMWA 2GTUA 5HFKA 4NWYA 2V6KA 2JZSA 2RLIA 1SENA 2AHEA 2F51A 2PN8A 4I8BA 1Z7RA 4EDYA 4KA0A 4X1UA 3DVXA 1R4WA 3FRCA 4WF5A 1K0OA 1BYEA 1ERVA 2LRCA 3TUEA 3P8WA 4X0XA 4X43A 4GSSA 3RHBA 1F3BA 2RUFA 2K6VA 5CRHA 2H19A 1GLPA 5GSTA 1SYRA 1XBSA 2CV4A 3GIXA 2IPAA 2OACA 4KB3A 3DIEA 3VLNA 5G5EA 1SL2B 1XWCA 1H75A 5A4WA 3HVXA 3H93A 1TI3A 3QFBC 9GSSA 1GRXA 3NOFA 3TB2A 1GSQA 1GSEA 4EL1A 4ILFA 5E4WA 4E8EA 4RI6A 4HQZA 3ZRDA 2EIOA 4NXIA 3EU4A 5IPGA 3IBHA 3GTUA 3F3RA 4I5QA 1XWBA 4O5RA 3GHAA 3D5JA 1TU7A 3BCKA 1ERTA 4EDZA 3HXSA 1OC9B 1EOGA 1UC7A 1O73A 4RI7A 3UMAA 3P2AA 3FK8A 5J3RA 1OE7A 5H5QA 5HR1A 5B8BA 3LSZA 3U5RE 4ECIA 2L4CA 1YQ1A 2H01A 5KEJA 3MDKA 5HQPA 2LRTA 1SKWB 2O8VB 2V1MA 2GSQA 1C72A 1VGLA 3LJRA 1GLQA 3HHVA 3HVSA 1R5AA 1GL8A 3KXOA 2VUPA 2KHPA 1U3IA 4V1Ap 4XS4B 2I3YA 1GUMA 3DEXA 3LFLA 2VCZA 4ZBBA 2VCVA 4KCEA 1DBYA 1K3LA 1ZYQB 3IV4A 1V57A 3CTFA 2HYXA 2H70A 1U88A 3TKRA 3DYRA 1GSYA 4PUAA 3Q6OA 1B9YC 2GSRA 2H72A 3TKSE 3ZREA 3H1NA 1AUCA 2X8HA 2K18A 4TR4A 3KEBA 1UN2A 2YPMA 2C0DA 1F9MA 4DSSB 3FZ5A 3L78A 4I6XA 1MDKA 1EP7A 8GSSA 1PA3A 4GRFA 5HR0A 2PMTA 3SWLA 4O7HA 1GH2A 4PURA 4TR1B 2EIRA 1X9MB 3LYKA 1AQXA 1GSUA 1Y25A 3EMXA 3VPTA 3IOSA 4F0CA 5ENUA 5DCHA 3ZFLA 2AV4A 3ZTLA 2IMKA 2OKAA 1OC3A 2DSAA 4KGIA 3IRAA 2DLXA 2LQOA 4ZL8A 7GSSA 1TDIA 4NHZA 1GTUA 5G30A 2VD1A 1GTBA 5DALB 1PL2A 2R6KA 5D9WA 3RPNA 5ECIB 3P90A 4MA9A 1F3AA 1X0RA 3H4KA 3G9BA 1AC1A 1U87A 2ZCTA 2LRNA 3APSA 1FB0A 3KTBA 2C4JA 5A4VA 4MP4A 4ZL9A 5DJLA 1PL1A 3GYKA 5AIXA 5JCWA 3GH6A 3MSZA 5F07A 5KN0A 1A0FA 2WB9A 4PQ1A 3FHKA 4IQAA 3SBCA 2GZZA 5IMFA 4L0UA 1GNEA 1BJXA 1FVKA 2PWJA 1Y6EA 2DJ0A 3TKSA 2LJRA 4EVMA 3A2WA 3F6DA 1R7HA 1AQWA 2F8AA 4WBRD 1HNAA 1O8WA 1JFUA 2HZFA 4TKYA 4MH3A 1SL1B 3HD5A 1QK8A 5IMCA 2FWHA 1SYXA 2QKEA 4F03A 4NV2A 5JWOB 3VK9A 3A5WA 3WD6A 3GRXA 3D6IA 5COHA 4POMA 4K7IA 2IJYA 3LYPA 5JCGA 3DKSA 4K0GA 1AXDA 4GSTA 4MF5A 5D9XA 3EURA 3I69A 5J5NA 1GWCA 3DXBA 5DVBA 4OO4A 1F2EA 2O7KA 2IFQA 1GULA 2CVDA 4GCIA 5CRGA 5ABRA 1EGRA 5DQSA 5HR3A 3CRUA 1YZXA 2DJKA 4QL9A 2YNXA 4XRAA 3TJJA 3ZLPA 2TIRA 3QPMA 2HLSA 3BOAA 4WEYA 2OA7A 1XZOA 3QDNA 4FYBA 1XOAA 4YH2A 2H6YA 1UA5A 3IK9A 4IELA 4D73B 5GAND 3IC4A 3F9UA 3F4SA 4IN0A 3ME7A 3BJ5A 5E59A 3G7YA 4TVEA 1I9DA 1OKTA 4KE3A 1EZKA 2EC4A 1OKDA 3Q74A 1SU9A 2RM6A 5IMDA 1FHEA 3CSJA 4CW9A 2GT6A 3GH9A 2MMZA 3QD9A 2GVPA 1EEJA 4GXZA 5CNWA 6GSXA 4ECJA 2VL2A 5CYYA 2LUSA 2GQKA 3KCMA 4IHUA 5INYA 2GT5A 1TU8A 2YWMA 5ECQB 2L6DA 3QFAC 3RBTA 5ECHB 2OJLA 2K8SA 2B7KA 2MBSA 2IWTA 1K0DA 2NDOA 3VURA 3CSIA 2FA4A 1NHOA 5FHIA 2K9FA 5DAKB 5J41A 18GSA 2JSZA 3WT1A 2H76A 2RIIA 4ZBDA 1MTCA 5IMZA 2XC2A 4HOJA 2FD3A 3EWLA 3C1RA 3ERGA 1ON4A 5G5FA 3KM6A 2X64A 3CBUA 3IDVA 1ABAA 2ES7A 5ECMB 1XWAA 3GN3A 3M8NA 2WJUA 2H6XA 4MJAA 1T7PB 1JZRA 4HZ2A 4K2DA 5JCUA 5D93A 2GGTA 2NVLA 4NMUA 3WYWA 1SL0B 4IJ3A 4GLTA 3ZIJA 1GTIA 3EU3A 3G7IA 3WT2A 1GTAA 2PUKC 3KZQA 3J7Yb 4G10A 3DRNA 3WGDA 1ACVA 1XOBA 2PGTA 1EP8A 1X5CA 4N30A 2LKUA 1SK0A 4MZWA 3VWVA 2XHFA 1K0NA 5ECNB 4MJEA 1TRWA 2LNTA 2B1KA 1FO5A 3IK7A 2MZCA 2YZUA 1QXHA 2VCQA 1X5DA 1GUHA 1V40A 1Z7PA 2YCDA 3ED3A 3GL5A 5B7CA 1R26A 4IP6A 3TKPA 3LGCA 4KUNA 2H8LA 5IO2A 3GL3A 2H1BA 5G1KA 3AY8A 1M9BA 1THOA 2XPDA 2B1LA 3ZMKA 2PBJA 4FIWA 3FKFA 3N9JA 2VAFA 2RM5A 6GSUA 3KGKA 1NSWA 3GX0A 4BPYA 1J08A 4ZILA 3VPQA 2H0IA 10GSA 2G2QA 2I9HA 3K8NA 1E2YA 1FOVA 3KH7A 5AN1A 3GKKA 3GKNA 3LWAA 2J9HA 2ON5A 2I81A 2M80A 3L9SA 1XVWA 4FYUA 4MF7A 1KBNA 1JHBA 1V98A 4JRRA 4IVFA 4DSQA 2C0FA 5F0GA 4OD7A 4RUVA 3F6FA 3KD0A 1XVQA 4I97A 5HFGA 5CP1A 2MMNA 2LS5A 17GSA 1M2BA 3LG6A 1QUWA 2ZNMA 4MCUA 4I2UA 4MMMA 3W6GA 1O6JA 1FW1A 4TR3A 3QAGA 4ZB9A 3DD3A 2DBCA 2KP1A 2IMIA 1PGTA 2HRNA 1NHYA 2HRFA 3GTUB 1J9BA 2MYGA 1V9WA 4V2MA 4Q5RA 5KN3A 5IOXA 1A0RP 2H6ZA 3V1WA 2P5RA 1KNGA 2YN1A 4FYCA 3TOTA 1URMA 1TXXA 4PGTA 4KSMA 3GNJA 2PERA 2C1YA 5J4UA 1O81A 1K0BA 1ERUA 3ZVJD 4HEA2 5HFIA 2IN3A 2VM2A 4G2EA 1E6BA 4CDOA 3HZ8A 3RDWA 3UJ1A 3PR8A 2J23A 3TRPA 3GV1A 3W8JA 3RPPA 3C8EA 3A3TA 1VF4A 1Z6MA 3L9VA 1X9SB 1O8XA 3KMNA 1A2MA 3QAWA 2NPBA 4Z7XA 2LJKA 3M3MA 1WWJA 14GSA 2IMEA 3HJPA 2CQ9A 1ST9A 2LSTA 3IR4A 1GSFA 3FEUA 4L5LA 3GMFA 2CVBA 5IO0A 1DSBA 4DEJA 2FUG2 3LXZA 1GNWA 4MZCA 4BWQA 5G31A 2HZEB 4HS1A 1A23A 4BA7A 2MMOA 4ZL7A 1THXA 1Q4JA 3LQ7A 1ZMAA 5HR2A 4MH2A 5EVOA 3C7MA 4J2FA 2JZTA 4F2IA 6GSTA 4OFNA 5F06A 3HJMA 2L4QA 4GQFA 5A4UA 4OCFA 3HKRA 4PUFC 1U3AA 4DSRA 1K3OA 5CO3A 3TGZA 1WOUA 2D2ZA 1JZOA 4MDCA 4QL7A 3HZ4A 4ECBA 3UBKA 2OADA 4JR4A 3VFIA 1AQVA 1T4ZA 2K8VA 2ON7A 1EWXA 1VF1A 1NW2A 2GQMA 3HCZA 3BD2A 3C73A 3FY7A 5ELAA 1WE0A 2FNOA 4PQIA 4AJ7A 4TXOA 2CAIA 1T8EB 2OE1A 1M99A 3TJBA 2VO4A 3TKSC 2DC5A 2GSTA 5D9VA 1M7TA 1SD9A 3L9UA 4IW9A 20GSA 4XRDA 4WR5A 1TI1A 2XPEA 3O3TA 1AW9A 3ZZXA 4ISDA 4TW5A 4PQHA 2JADA 1WP0A 1FG4A 1ML6A 2ZUPA 2NTOA 4MF6A 4J56E 4L8EA 2PVQA 1MD4A 2VCWA 4F82A 1MDIA 1A8YA 1MEKA 4XS6A 3UEMA 1I5GA 4P3YB 2FY6A 3M0FA 2H75A 3J7Yk 2LQQA 2WGRA 2B5XA 1TRSA 1XW6A 4IP1A 4POBA 4FH8A 3KH9A 3VI5A 1RQMA 1XPVA 1A2LA 4MPGA 2B5YA 2FGXA 1A8LA 4MPFA 2ALBA 1CQGA 3O76A 6GSSA 4ZB6A 2VL3A 4KAEA 3IAS2 4OMVA 2GSSA 5H5SA 1SD8A 1M2AA 1N8JA 3ZYWA 4K6XA 1ERWA 1S3AA 4TR0A 2DJ1A 1PRXA 2FA8A 5IOWA 1GSDA 4NHWA 2CAQA 4ACSA 4K1FA 3GSTA 4TRXA 2N5AA 1Z6NA 2FWFA 2IFQB 1XWGA 2R4VA 2H1AA 4IJIA 4ID0A 3F8UA 5IMVA 1WMJA 3D22A 2BTOT 5D96A 1WIKA 1X5EA 2KP2A 5F8BA 3M1GA 3TJKA 3RHCA 2VLVA 5CRDA 1SK2A 3EC3A 4EXJA 2R37A 6GSYA 2CZ3A 4IS0A 3E9JB 3S9FA 1TTZA 2X8GA 2OE0A 1G7EA 1V2AA 5GAPD 5ID2B 5JWRB 1T3BA 1SJIA 2H0GA 4JEDA 4NV5A 4YAPA 5FWGA 1M0UA 2VL2C 3QCPA 4I2TA 3BCIA 5CREA 2H0HA 3FZAA 3MNGA 1HD2A 2FWGA 2H66A 2XBIA 3FZ9A 2KUCA 5ECSA 2X8CA 3VI7A 3D21A 5LCZA 3CTGA 3GSSA 3Q18A 4JE1A 1IYHA 3UVTA 3CMIA 1TKDB 1PN9A 1FVJA 3HJOA 2AJQB 1QGVA 4NAXA 3CRTA 2WZ9A 3QAVA 2N5BA 1T00A 4GQCA 1YF1A 2I1UA 2P0GA 3UVHA 4POLA 3R2QA 2VCTA 2YANA 2CX3A 4TN8A 3A2XA 1XW9A 2C3NA 3ZIVA 4V2LA 3APQA 1EV9A 1Z3EA 1PD21 2LJAA 3EYTA 4LLRA 3GKXA 1QFNA 1MD3A 1BAYA 2BJXA 4H86A 1SK1A 1K0CA 1BQ7A 3M9KA 3I6AA 4O32A 2C3QA 5F05A 3VWWA 2FHEA 3QMXA 2GZPA 3FW2A 2YWIA 3IE3A 4KNDA 1T4YA 2DJ3A 5ECLB 4N10A 3ZL5A 2LEGA 2AUVA 1Q98A 1BEDA 3H8QA 4HUAA 1DE2A 3UOMA 2M46A 1WPIA 2NBSA 3TJGA 5DDLA 1XCCA 4TXVA 6GSWA 4ZBAA 1TOFA 2I4AA 2KLXA 3IHQA 1K3YA 1LU4A 2FLSA 2E7PA 3KIJA 2A2SA 2TRXA 1OC8A 4AJ6A 1TK8B 3N5OA 1DUGA 4MK3A 4MLYA 3NZNA 4N11A 4MABA 2WRTA 1W4VA 5GZZB 22GSA 3C71A 2Z9SA 2YP6A 3CYNA 3TKQA 1G0TA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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