4KNDA

Thioredoxin from anaeromyxobacter dehalogenans.
Total Genus 28
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
28
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
b'DVVVLQDSTFEQEVLKSDTPVLVDFWAVWCGPCKAIAPVVDDLAARYKGKLKVAKMDVDQHQGVPQQYGIRSIPTLLVFKGGRVVDTVIGADKTRLEDSVKKAIG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Thioredoxin from Anaeromyxobacter dehalogenans.
rcsb
molecule keywords Thioredoxin
source organism Anaeromyxobacter dehalogenans
molecule tags Oxidoreductase
total genus 28
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4kndA00
1OC9A 1MDIA 1YJ6A 2VUPA 2GSQA 2O7KA 1BAYA 5HR2A 4KCAA 2I1UA 1H75A 4GSSA 1K3YA 2QC7A 3G7JA 5LD0A 2HI7A 3G7IA 2H8LA 2DC5A 3E9JB 5DALB 2P5RA 3CBUA 2X99A 2VCZA 3J7Yk 4YAPA 2QKEA 2GQMA 1GLQA 2RUFA 4IKHA 3HY2A 3VWVA 3GKMA 3QFAC 1EV9A 5IMZA 7GSSA 4POKA 2YJHA 1ERVA 3HJPA 3LFLA 1M2DA 2I81A 5F8BA 4OMVA 5ID2A 3EURA 2ALBA 2WCIA 2YZHA 2H6ZA 2C0GA 3UOMA 3GTUB 3GA4A 4RUVA 5F0GA 4PNGA 19GSA 4IN0A 1QK8A 1DE2A 4H86A 2GZZA 3RBTA 2C8UA 2L4CA 3QFBC 1TW9A 3HA9A 4TKYA 1TRUA 2C0DA 2LJAA 4IW9A 2V32A 4OO4A 3BCKA 4QL9A 5CREA 3CTGA 2H74A 2IPAA 2R2JA 1TXXA 4Q5NA 2GDRA 3IXRA 2R37A 2B5XA 1EP7A 5D96A 4D73B 2X8HA 16GSA 3HVVA 2K8VA 3KZQA 1YKAA 2VAFA 4MF5A 4ZBAA 1TI1A 5CYYA 5JCWA 4HQZA 4WETA 2CVDA 2RM5A 4NMUA 2V6OA 3AY8A 2K9FA 3I69A 2ON5A 3BBYA 2L6DA 4IP6A 3W8JA 5H5RA 5CP1A 2N5AA 1OYJA 3L9UA 2K18A 2O8VB 3IPZA 3ZFLA 1KEBA 2MMOA 4WR5A 1UVZA 3F3QA 5ECHB 10GSA 4LL1B 4O92A 1YEPA 3TJKA 3ZIVA 17GSA 3EU4A 1TK5B 1V58A 4TR3A 1ZGNA 3F8UA 4YAVA 1ST9A 1GL8A 3GSSA 4RQXA 2B1LA 2LKUA 3G7YA 2FWHA 2XPEA 1FVKA 2F8AA 3UL3A 2HE3A 2HFDA 2GQKA 2DIZA 5FHIA 5HR0A 2EIRA 1WPIA 3WT2A 1E6BA 4QQ7A 4EF0A 2IMFA 3TJGA 5G31A 1A2LA 1IYHA 1OAZA 3QAGA 2AV4A 1GUKA 2JSZA 2IFQB 2GS3A 2C3TA 3HJMA 4MJCA 4GLTA 4J57E 3QDNA 2OBKA 2LTKA 2JSYA 3GX8A 2R6KA 3ED3A 5ECPB 2E2MA 4GXZA 2H0GA 3NOFA 2MMZA 4X43A 4YQUA 3L9VA 4KAEA 4LL4B 2YJ7A 2PVQA 2YWIA 4XS4A 3EU3A 4EDYA 1GNWA 1KBNA 6GSXA 1EOHA 5D9WA 5IOXA 1WMJA 1FHEA 1GRXA 1VF1A 3TGZA 3UVHA 1EWXA 3FEUA 2RIIA 3UAPA 3TJBA 3LYKA 3EINA 1AXDA 1H4OA 2A2SA 3N9JA 5GSSA 5DQYA 1OC9B 2VCTA 3GURA 3WT1A 1SU9A 2N5FA 2OE3A 4F0CA 1ZL9A 1GSYA 5G1KA 3RHBA 3DXBA 4V2MA 3MSZA 3RHCA 2XPDA 4XCSA 1AW9A 1LJRA 3M3MA 2YV7A 4I6XA 1SYRA 4EO3A 1T4ZA 2VLVA 4EL1A 1UN2A 1FB6A 1Z9HA 4FIWA 4WEYA 1K0AA 4GCIA 4MK3A 5IMDA 2ON7A 1JLWA 2X8GA 1HNAA 2AUVA 3HHVA 1EZKA 5ID2B 4EVMA 2KUCA 3VURA 2VD0A 1EP8A 4PUAA 2BJXA 4DEJA 2VM2A 4HJMA 4PGTA 1XBSA 4N30A 4V1Ag 2VM1A 3KP9A 5IMAA 2L6CA 4IQAA 2L5LA 3ZYWA 3IV4A 5AIVA 3ZRDA 4KW6A 2TRXA 5ECMB 1F2EA 2F51A 2KOKA 4KB3A 2F3MA 4PQ1A 4I5QA 5IO2A 3QD9A 1NM3A 4JBBA 2D2ZA 3FR3A 1XZOA 3CSHA 3F6DA 3L0HA 1XCCA 3WGEA 3Q19A 3ZITA 1U3AA 1B4PA 1V98A 5ECSA 2ZUPA 3LGCA 3CTFA 4K0NA 4N11A 5AISA 5H5SA 4NHWA 2B7KA 2YOIA 2TRCP 3EMPA 1G6YA 2OJLA 2MBTA 2WRTA 4HZ2A 4Q5RA 5DJMA 4MP4A 5COHA 1XW6A 1TRSA 3F63A 2EC4A 3FHKA 2C1YA 3C7MA 4OFNA 4IHUA 1T00A 3IR4A 4AJ6A 2KHPA 1RK4A 1DE1A 1R26A 3QOUA 2YPMA 2FCHA 1SL2B 4CDOA 3C71A 2R5GA 1U3IA 4ULXA 3US3A 2HLSA 1GTAA 1M99A 3DWVA 3EE2A 4IS0A 3FKFA 5G5EA 3DKSA 2DJJA 12GSA 1BQ7A 1WJKA 5LCZA 5IIZA 1BEDA 5GAND 3PINA 1XW5A 2KP2A 2WJUA 2FUG2 2X64A 3Q18A 2FWGA 4KA0A 4WXTA 1VF4A 4EE0A 3TKRA 1JFUA 1AAZA 1JZWA 1K0CA 4GQCA 1HD2A 3CRTA 3VPQA 1J08A 4MLYA 1QUWA 1XOBA 2DLXA 4HS1A 1FOVA 2B7JA 4ZILA 4GF0A 5ELGA 3TRPA 2OBIA 4FYUA 3UEMA 1R5PA 3APSA 3LXTA 4PQHA 5A4WA 2DSAA 1B8XA 3D4TA 2IN3A 1U6TA 1ZYQB 1ZYEA 2L4QA 1N2AA 3WGXA 1YQ1A 3C73A 2DMMA 3FZAA 1YKCA 1T7PB 4ZL9A 1E2YA 2PERA 5CRHA 1F3AA 1M0UA 4XS6A 3O3TA 3LQ7A 4FYBA 6GSWA 1XVQA 1KNGA 4JZQA 4MABA 4HZ4A 4K7NA 1ZCPA 3KIJA 2GT5A 1YEXA 3LORA 2C80A 3R2QA 4BWSA 4TOPA 4MF7A 5E4WA 4XS4B 1FVJA 3DMLA 2R4VA 2C4JA 1X9SB 3GIXA 5EVOA 3E0UA 3MWHA 2BTOT 1C72A 3TRXA 3J7Yb 3ISOA 2JL4A 4MA9A 2XBIA 4ZIJA 2H19A 2FWEA 4KDYA 1PL2A 1T1VA 2WB9A 1NHYA 3HCZA 2CZ2A 3P8WA 3M1GA 1FG4A 1TK0B 4TVEA 5EY6A 2CX3A 20GSA 1HNCA 1TRVA 2LRTA 2YCDA 4PUFC 4MH3A 1K3LA 2IMKA 1PA3A 1O8XA 3UIWA 4XRDA 4K1FA 1A0FA 4BWQA 4PX1A 4PXOA 3H8QA 4N0VA 4XIHA 2C0EA 1PKWA 3ZFBA 4MDCA 2RUEA 3DVWA 1CQHA 3KGKA 1GSDA 4KH7A 3KH9A 5CRWA 3D21A 3OR5A 1IYIA 3GL3A 2GT6A 1AQVA 4KSOA 3LJRA 4HU7A 5CRDA 4V1Ap 1ZMAA 3TDGA 4ID0A 4TR0A 2AJQB 1EEMA 1JHBA 5KN0A 4NAXA 1O7UA 4IBPA 4E8EA 5FT3A 1OC8A 4MZBA 4XRAA 4O5RA 4K8MA 2VL3A 4IP1A 1QXHA 1BG5A 3M0FA 1EV4A 3DEXA 4MH2A 3GKKA 2HNLA 4KUNA 2V6KA 1TK8B 4GQFA 2DJ3A 3M9KA 1HQOA 2IMEA 1V40A 3VFIA 2VD1A 3KTBA 4AGSA 2OA7A 2DJKA 4MZWA 2H6XA 5CRGA 3Q74A 1SK0A 2V41A 2H73A 2JU5A 2I4AA 5ABRA 1VF2A 2I9HA 2FA4A 5J3RA 5HQPA 2EIQA 2VCQA 9GSSA 1WOUA 5ECRB 1SL0B 3HYPA 3U5RE 4EXJA 4GRFA 3RPPA 1AQXA 3MDKA 3MAKA 4ZL8A 4MF6A 3DVXA 5D73A 1FB0A 2HRFA 3VWUA 2L59A 4BVXA 1GWCA 4GSNA 1B9XC 4IJIA 2MYGA 3ERFA 5KEJA 1XWAA 1SYXA 4OD7A 1PKZA 1VRSD 3ZREA 2LUSA 4IGJA 1VGLA 1B4QA 3ZIJA 2VLTA 1PN9A 1K0DA 4TRXA 2OKAA 2VL2A 4EKZA 1V2AA 5J9BA 6GSVA 2F8FA 2GSSA 5EL8A 2X8CA 3S9FA 1SL1B 3GYKA 3BJ5A 3NIVA 3IAS2 3F4SA 4PNFA 2VLUA 4ZB9A 1MD3A 4HOJA 4KNDA 3TKQA 3O76A 5D9VA 4HQSA 3D4MA 5IO0A 4TXOA 3P90A 2PU9C 4F9ZA 4GSTA 4DSRA 3HDCA 2CAQA 3TB2A 1K0BA 3DRNA 4K6XA 5B7CA 1YZXA 4HU9A 1PD21 1A24A 3GNJA 1QQ2A 3E3EA 3N5OA 1AUCA 1BX9A 2H01A 2K8SA 2MMNA 5ELAA 5HR1A 5C00A 1BJXA 2PUKC 5D9TA 1Z5YE 5ENUA 2H30A 2LS5A 3MNGA 5D9XA 4IJ3A 5IPHA 1QFNA 2H0HA 3K8NA 1GNEA 1T3BA 1OKTA 1SKWB 4IELA 2LQOA 2B5EA 2GTUA 2MBSA 5IPGA 2VOCA 3EWLA 4TN8A 3I6AA 3KXOA 4GTUA 4KE3A 2H71A 1NW2A 8GSSA 4HI7A 3BD2A 4AJ8A 4NWYA 1G6WA 1A23A 3VPTA 5HFIA 5IMVA 3FZ9A 2O85A 5ECNB 4E8HA 4WKWA 3Q6OA 4LLRA 3GFKA 2IL3A 2L5OA 4ECBA 2GZPA 4G2EA 1YDKA 1TU7A 3TRQA 3HKRA 4EC0A 4X1UA 3D5JA 4K9ZA 4LA1A 2VCWA 3GKNA 5C04A 2YV9A 2YWMA 5E59A 1GLPA 1EOGA 1PL1A 4JR6A 5ECIB 4BPYA 5INYA 3FK8A 3VWXA 3GHAA 3GX0A 3TJFA 1SJIA 1GSQA 1O73A 4FH8A 3RDWA 5AN1A 3LEFA 1MD4A 3GN3A 2PVOC 1EGOA 5AGYA 3EYTA 2FWFA 4K2DA 4MJEA 1AC1A 5G2ZA 2PGTA 1XWKA 3KH7A 1GULA 2CV4A 3WD6A 3HZ8A 4MJBA 3FZ4A 4L5OA 2A2RA 5EPFA 4QL7A 2WS2A 3CRUA 4ZBBA 5ECKB 4O7HA 4NXIA 2DMLA 4ZB8A 2YZUA 3IK7A 2LSTA 2FLSA 11GSA 4NV2A 2JZRA 5LNKe 4ZB6A 4RQRA 2YWOA 1Z7PA 1A2MA 2JZSA 1GTUA 2ES7A 14GSA 3F4RA 4MJAA 3EMXA 3QAVA 2IJYA 4FYCA 2HZEA 2LRCA 5JCUA 1MDJA 4POMA 1XXUA 1K0MA 1CQGA 4KDXA 3KD0A 4EUYA 3TKPA 4K7OA 2ZCTA 3A2WA 3VWWA 4KSMA 1KTEA 5HFKA 1Z7RA 2WZ9A 1EGRA 2WDUA 5FWGA 4MZCA 4MPFA 1MTCA 2FY6A 1SKSB 2WFCA 4X0XA 5HR3A 4K7IA 1TRWA 3APQA 2CT6A 3HD5A 4KCEA 3IK9A 3I43A 2PMTA 3LSZA 4YQMA 5ECQB 4I97A 4ISDA 1I5GA 4ILFA 2P31A 1XWBA 2CAIA 3FR6A 5A4UA 1WIKA 2OACA 1B9YC 3HZ4A 4Z7XA 5IQYA 3ZZXA 2DBCA 1THXA 3TKSC 1GTBA 4OFMA 1DBYA 1FW1A 1Q98A 2C3NA 1S3CA 1GP1A 2P5QA 1NHOA 4OCFA 4POLA 2OE0A 1TP9A 2CQ9A 1SK1A 2RLIA 1VF3A 4TXOB 1U88A 5DCHA 1R5AA 4EDZA 3BCIA 4L0UA 3TUEA 3PR8A 1F3BA 3H93A 1M2AA 1ABAA 2M46A 1TKDB 4RI6A 1Y6EA 5KN1A 4OWYA 1DUGA 3IE3A 3KCMA 1GSEA 3GL5A 1TDIA 2J23A 1XIYA 4I2UA 4DSSA 3FY7A 3ZLPA 4JRRA 5IM9A 2PBJA 1LU4A 1ON4A 4O32A 1MDKA 1TI3A 2VCXA 4ECCA 5GSTA 2XC2A 4G10A 4F82A 4YQVA 2DJ1A 3KMOA 3APOA 2H72A 4TR1A 1YF0A 3F4TA 2B1KA 1F37A 3LYPA 3L78A 2YANA 1SKRB 4V2NA 3PH9A 3ZVJA 5F06A 2HYXA 1X9WB 1V57A 3W6GA 3IOSA 2P0GA 5B8BA 3D6IA 3LWAA 5J9CA 2VO4A 3GRXA 4XTSA 2NBSA 3CMIA 2QGVA 3FYGA 3H79A 2H1GA 5DVBA 4N10A 5G5FA 3HXSA 1GSUA 1XVWA 2O87A 2V1MA 3IBHA 3O6TA 4YH2A 2JADA 1M9AA 2J9HA 1M7TA 4WF4A 3FZ5A 1TJDA 1X5DA 2HXKA 2E2GA 4L5LA 5L71A 2GQLA 4V2LA 1WWJA 1LBKA 3QMXA 4XHMA 4JEDA 1GUHA 3UVTA 2AYTA 5B6NA 3QCPA 4OFTA 1XFLA 1OE7A 1AIUA 3H1NA 4WBJA 3UMAA 5KN3A 4KGIA 2H1AA 3UARA 3L9SA 3DYRA 1OC3A 3LG6A 3ZL5A 4G19A 5JWQB 2F9SA 3ZMLA 4HUAA 2VCVA 1PSQA 4POBA 5DAKB 1G7EA 3LXZA 4Q5QA 2DIYA 5F07A 2KLXA 3GV1A 3P2AA 2FD3A 1S3DA 1HYUA 1K3OA 2G2QA 2H0IA 1G0TA 18GSA 3IDVA 2LEGA 4ZBDA 1NSWA 1F6MC 1JZRA 2HRNA 2GSRA 6GSTA 1R4WA 4J56E 4GWRA 3UBLA 4L8EA 2OE1A 2HZEB 1A2JA 1SJZA 1M9BA 3KTLA 1GH2A 4JU5A 3QR6A 2M72A 5JWRB 1THOA 1ILOA 3VLNA 3DD3A 4ML1A 1PRXA 4IQ1A 3VK9A 1EEJA 4CW9A 5CO3A 2AAWA 3EVIA 3TCOA 3KMNA 3IC4A 2FHEA 2Z9SA 5GZZB 1YF1A 4I8BA 2R3XA 2PN8A 1JZOA 4MMMA 4CHSA 1F9MA 3CYNA 3SBCA 3FW2A 4L0WA 5B8AA 3WYWA 2V2GA 3A2VA 2WGRA 5D93A 1ERUA 2DJ0A 4TR4A 1W89A 2K6VA 1USBA 2XBQA 3GKXA 5J5NA 2WULA 4AF2A 1ACVA 3WGDA 4OO5A 4HDEA 3HVSA 4F03A 4I2TA 1PQNA 5D8IA 2RM6A 2GSTA 3SWLA 1A8YA 2G0FA 3GH6A 5J4UA 2LRNA 2JACA 2FNOA 1WE0A 3DIEA 3H4KA 1GTIA 2C0FA 3A5WA 5H5QA 1JZDA 1T8EB 3M8NA 3ME8A 4WF5A 3TKSA 2CZ3A 1FAAA 3P7XA 1WP0A 1HNBA 2YNXA 1YY7A 4DSSB 2AHEA 4N0ZA 2LQQA 1XWCA 2OADA 4ECJA 4K0GA 1JLVA 1OE8A 2VL9A 4J2FA 1XOAA 1TU8A 3IA1A 2HSYA 4TR1B 2DJ2A 2NVLA 2GZYA 1OKDA 5KN2A 5A4VA 1PGTA 2GGTA 3C1RA 4JE1A 3U6VA 3TKSE 1SJ6A 4NHZA 1AQWA 1ERTA 2NTOA 2B5YA 4LMWA 4HJ2A 1SD9A 1XPVA 3C8EA 3A2XA 5DALA 3FR9A 3GMFA 5A5KA 1B48A 3W8SA 4F0BA 3V1WA 1URMA 2CX4A 1ZZYA 1J9BA 4TXVA 2IIYA 3A3TA 5IMCA 3F0IA 4JR4A 5ECLB 6GSSA 4BL7A 5CAXA 3D22A 1Z3EA 3HJOA 2NPBA 1GSSA 3CSJA 2QSIA 1O6JA 2LNTA 1ERWA 3GSTA 3TOTA 3F3RA 2AB6A 6GSUA 3GTUA 3M9JA 5CNWA 5DCGA 1S3AA 2HZFA 4AJ7A 1Z6MA 5DDLA 1T4YA 1X5EA 1I9DA 1OVNA 5DQSA 3ERGA 5IMFA 3IRAA 3NZNA 4Q5FA 2MMAA 1SD8A 4FO5A 2N5BA 4XS1A 5ECOB 2C3QA 5JCGA 3ZTLA 2H75A 4IVFA 2H1BA 2VIMA 5DAKA 1TTZA 2IMIA 1QMVA 2M80A 4D73A 4BVYA 3GH9A 3ME7A 3ZMKA 4ZXGA 2GLRA 4ZL7A 2LJKA 4HEA2 3RAZA 3VI7A 1ZOFA 2H76A 1K0NA 3L4NA 1GSFA 2B3SA 3C1SA 5AIXA 1Z6NA 3UJ1A 2YWNA 2HSHA 2IMDA 2KP1A 4KX4A 1SK2A 4BA7A 2NDOA 1Y25A 3ERWA 1TOFA 1O81A 2A4VA 1W4VA 1RQMA 1G7OA 2LJRA 3TJJA 2H6YA 1J0FA 3QAWA 1WRYA 2LV3A 3DGQA 4DSQA 4MCUA 4P3YB 2H66A 6GSYA 2CA8A 3RPNA 3VI5A 2VL2C 1O85A 1XW9A 3QPMA 5G30A 1U87A 3I9V2 1PX7A 1X5CA 3F9UA 1DSBA 2ZNMA 1PX6A 4MPGA 3FRCA 3UBKA 2H70A 1XWGA 1Q4JA 1UC7A 1FO5A 2LNSA 1GUMA 5HFGA 4NV5A 4G9HA 3CSIA 3CXGA 5DJLA 1QGVA 2MZCA 1R7HA 5GAPD 2CVBA 2TIRA 2GVPA 2EIOA 2CVKA 4TW5A 5J41A 2JZTA 1M2BA 1O8WA 1N8JA 2FA8A 1X0RA 4WR4A 2E7PA 2YN1A 5JWOB 2IFQA 2H1DA 4NPBA 2L57A 3HVXA 3G9BA 1MEKA 4ECIA 4KDUA 1BYEA 3F6FA 1UA5A 5B6MA 4ACSA 2FGXA 13GSA 4PURA 2PPTA 3JCML 4DVCA 1RW1A 2BMXA 3GUSA 4PQIA 2XHFA 4F2IA 2E0QA 4OCEA 5DBQA 4ML6A 2IWTA 1A0RP 3BOAA 2REMA 2HT9A 1K0OA 3IHQA 1ML6A 3KJYA 3TOUA 1X9MB 1V9WA 4WBRD 5IOWA 1A8LA 3KP8A 2O89A 1PMTA 3IAM2 1SENA 22GSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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