4FIWA

X-ray crystal structure of corynebacterium glutamicum nrdh-redoxin at 1.5a
Total Genus 21
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
21
sequence length
76
structure length
76
Chain Sequence
AITVYTKPACVQCNATKKALDRAGLEYDLVDISLDEEAREYVLALGYLQAPVVVADGSHWSGFRPERIREMATAAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Corynebacterium glutamicum
publication title NrdH-redoxin of Mycobacterium tuberculosis and Corynebacterium glutamicum Dimerizes at High Protein Concentration and Exclusively Receives Electrons from Thioredoxin Reductase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative glutaredoxin NrdH
total genus 21
structure length 76
sequence length 76
ec nomenclature ec 1.20.4.3: Mycoredoxin.
pdb deposition date 2012-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4fiwA00
3US3A 1SL1B 2H0HA 4JR6A 4GRFA 5G1KA 2YZHA 4MPGA 5LCZA 4EO3A 4YAPA 4DSRA 2JZRA 4HZ2A 3IDVA 1AQVA 3GFKA 2GVPA 1HNCA 4HU7A 2JL4A 1WIKA 4K1FA 4KAEA 3ZYWA 2PMTA 3KTBA 2QKEA 4GWRA 2NBSA 1TK8B 2WZ9A 5B7CA 2IMDA 4NV2A 2RUFA 4KGIA 2VLUA 3UOMA 3KEBA 4XS4B 4BWQA 1E2YA 4ZB9A 4MZCA 4OFMA 4AGSA 2LS5A 4QL7A 2B5EA 2M72A 4K0NA 2FWGA 1X9WB 5CYYA 4KUNA 4ZIJA 4YQUA 1A0RP 4ZB8A 3M3MA 5DCGA 2VD1A 2WULA 4LA1A 3IA1A 3HVXA 1X9MB 3CSIA 1Q4JA 1TI1A 2GT6A 4I97A 4POLA 1AC1A 2KHPA 1XW6A 3GYKA 4GXZA 4ECJA 3Q74A 3LJRA 2O8VB 3KMNA 22GSA 1SJ6A 4ID0A 5DQSA 1PL1A 3F63A 3GURA 2DJ1A 1V40A 1FVKA 2JADA 3ZRDA 1YQ1A 1M2DA 3DRNA 4QQ7A 3KD0A 3L9VA 3IHQA 3ZFBA 2H1BA 1X9SB 4L8EA 6GSSA 1AIUA 4Z7XA 1MEKA 2VL9A 2L59A 2OE3A 5B8AA 2VIMA 2YN1A 6GSTA 6GSVA 3RDWA 2F9SA 3DWVA 1OKTA 3E9JB 3RBTA 1G6WA 1TJDA 2J23A 4HUAA 4N10A 1O8WA 2HNLA 2IMKA 1BG5A 4V1Ap 3I69A 5DCHA 3GTUA 1FG4A 4XHMA 2XHFA 4F9ZA 3GSTA 4L0UA 3I9V2 2CT6A 5AIVA 2AHEA 1WP0A 1PGTA 1W4VA 4TR3A 2LJRA 2B7JA 4MK3A 3IOSA 5E4WA 4KB3A 5COHA 3MNGA 2BJXA 4GLTA 1K0DA 3KIJA 5ECMB 4ILFA 1KBNA 3UAPA 3LGCA 3P2AA 2FD3A 5JWOB 2KLXA 1FHEA 2IFQB 1THOA 20GSA 11GSA 2H6ZA 4DSQA 2P5RA 1G6YA 2LNTA 4NWYA 3CMIA 4Q5FA 3D5JA 2VCZA 3BOAA 1ERWA 4V2MA 1GL8A 1R5PA 2I81A 1WMJA 3D6IA 3QAWA 5D73A 2H0GA 3M8NA 1OE7A 3U6VA 1GULA 3GKMA 2Z9SA 1R4WA 4GF0A 1VF3A 1SK2A 4NHZA 4OCEA 5DAKA 2V6KA 3N5OA 5ABRA 3TB2A 1NW2A 3IE3A 2R37A 1DUGA 4HU9A 5LD0A 3DEXA 1YJ6A 1ON4A 1U88A 3IAM2 4HI7A 8GSSA 3TJKA 1ZYQB 2GTUA 1SK0A 2X99A 4MZWA 3GKXA 4NXIA 2X8GA 4CW9A 2VLTA 1O73A 3CBUA 3GX0A 1TK5B 1J9BA 1Z6NA 2ZCTA 4I8BA 3QDNA 4MMMA 3H4KA 1C72A 2H75A 3MAKA 2K9FA 4KCEA 5ID2A 2WDUA 1I5GA 3FW2A 2B1KA 1XCCA 3MDKA 1UVZA 2FGXA 5G1LA 4G19A 3KZQA 2B5XA 1B48A 3EMXA 2JSYA 1A8LA 2GDRA 4K8MA 4ML1A 4MJAA 3EU3A 2PUKC 4OD7A 1NHYA 3J7Yk 2JZSA 2DJ3A 1SD9A 4EKZA 2TIRA 5INYA 3H93A 4LLRA 3APSA 4AJ7A 4OFNA 4HZ4A 2I4AA 3A2WA 2R5GA 1Z3EA 2MYGA 2V1MA 3QAGA 4TRXA 3DVXA 4JRRA 1JZWA 3F0IA 4ZILA 5IIZA 1O6JA 5FHIA 2YJ7A 1MDKA 1EGRA 9GSSA 3E3EA 2CVKA 1G7OA 2B5YA 3WGXA 4LMVA 1XVWA 2C0DA 1CQGA 2L4QA 1GUKA 1IYIA 1XW9A 1TW9A 4ZBAA 3SWLA 4IQ1A 4F82A 3O6TA 2DIYA 1SKWB 3FRCA 3EMPA 4CHSA 3VWVA 5CRWA 1AQWA 5G31A 5FWGA 2FNOA 1F3BA 2GZYA 2H1DA 1GSSA 1A8YA 1USBA 2ES7A 4HOJA 4KH7A 5G30A 2L4CA 3GIXA 1X5DA 4I6XA 3G7JA 2JACA 16GSA 2H30A 6GSWA 2IPAA 4TN8A 1O85A 3GMFA 3QOUA 2F51A 3EC3A 5IQYA 2PVQA 2CAIA 3BCKA 4HQZA 2JU5A 2HYXA 3EE2A 2RUEA 3ZVJA 4WR4A 4L0WA 1OC9B 5D9VA 3HJMA 3KM6A 1JZRA 1BYEA 2HT9A 1CQHA 2PGTA 2YV9A 1J0FA 5DALB 3GSSA 4JEDA 3LQ7A 1GLQA 5CRDA 3G9BA 1T3BA 4MF7A 4MF5A 3FR3A 3TOUA 1EEJA 4EDYA 1K0AA 2C8UA 1TRVA 2WJUA 3H8QA 3F3RA 2AUVA 1DE2A 2F8AA 3RPNA 5AISA 2H0IA 4POMA 3A2XA 5DJMA 3QR6A 3DVWA 3QD9A 2HFDA 5JCUA 2I9HA 2YANA 4FYUA 4WBRD 3ZZXA 1EWXA 4MH3A 3S9FA 4MJCA 3VPQA 5D96A 4BVYA 4MCUA 5F8BA 1TP9A 2H1GA 1R7HA 2PBJA 1ZZYA 2YWIA 1G7EA 5HFGA 5CNWA 2LEGA 1A23A 4ZL7A 2WCIA 2FY6A 3QFBC 1GNEA 2ZNMA 3WGEA 4PUFC 1HD2A 3KH9A 2H19A 4IJIA 1M2BA 2FWHA 5LNKe 4ZB6A 4RQXA 5DDLA 4N30A 4X43A 2H1AA 1SJZA 5B8BA 2HSYA 3HDCA 5F05A 3LORA 2WS2A 4KX4A 2H6YA 4TR1A 1VRSD 4ZL8A 1T7PB 4YH2A 3ZIVA 3IBHA 3FR6A 2R2JA 2E2GA 5D8IA 4AJ8A 2QGVA 3IV4A 1SL0B 4TXVA 3ZREA 2HRNA 3UARA 2P0GA 4OFTA 3A2VA 12GSA 1ZL9A 5D9WA 1M7TA 3G7YA 1WJKA 4ECCA 2X64A 3VWUA 2R3XA 2VCTA 1TK0B 3LXTA 2YOIA 2IMIA 3TKPA 4WBJA 2GSSA 5J4UA 1YEPA 2HE3A 2QC7A 1VF2A 3HVVA 5G2ZA 3N9JA 1GNWA 3HZ8A 1A24A 3TKSE 4OCFA 1SYXA 4NPBA 4GQFA 4RI7A 4PQIA 2IMFA 2F8FA 4TXOA 5G5FA 3HY2A 4TR0A 2K18A 2VUPA 1HNBA 1OYJA 2ON7A 1RQMA 3GTUB 5CRGA 1SYRA 2N5AA 2RLIA 2OE1A 1TDIA 2IMEA 4IQAA 2CZ3A 3FZ9A 2L5LA 1NSWA 5IMFA 4IKHA 1HYUA 2A4VA 1GTUA 2V32A 2B1LA 2HLSA 3VI7A 1GRXA 4BA7A 1F2EA 2VCQA 3TRXA 3P7XA 1FB0A 2CQ9A 2YZUA 3DD3A 1ZGNA 4KDUA 1PX6A 3WT2A 4OO4A 1SJIA 2XPEA 2H71A 2E2MA 5H5QA 4TKYA 1FO5A 3TJGA 5CAXA 1EV9A 4PUAA 3WD6A 3DYRA 2NPBA 4GTUA 1Y25A 2OBKA 1BEDA 2TRXA 1W89A 3TJFA 1K0OA 2H66A 2VL2C 3UBKA 2YV7A 5DAKB 2IJYA 4N0ZA 1O7UA 3O3TA 1T00A 1V2AA 5A5KA 3APOA 4KW6A 2P31A 3LG6A 4IW9A 3TKQA 4D73A 2VCXA 1XVQA 4V2NA 5H5SA 2FUG2 2N5BA 4PX1A 2TRCP 2M46A 1F6MC 2GQMA 3HYPA 5ELGA 3JCML 4PGTA 4KDXA 3M9KA 2VCWA 3ERGA 2YPMA 3IK9A 1EGOA 4TW5A 1QQ2A 4MLYA 5HR2A 5ID2B 3ZIJA 3FR9A 5IMVA 5F0GA 3D0ZA 1VF1A 1GLPA 3D22A 1BX9A 3TRPA 4PURA 3NOFA 4KDYA 3BJ5A 3Q19A 1XWKA 1JLVA 2WRTA 1TTZA 4EXJA 1K0MA 1Z9HA 1XWBA 4ML6A 3FEUA 1H4OA 4KNDA 2C3TA 1PN9A 3LXZA 4IJ3A 5KN1A 2DSAA 1F3AA 2K8VA 4FO5A 4IGJA 2GLRA 4N0VA 5IMAA 4P3YB 1WOUA 5ECSA 5J41A 1JLWA 2VO4A 4OO5A 3RHCA 2GT5A 2DMMA 2LNSA 1EEMA 2HSHA 3KCMA 1YF1A 2B7KA 3QMXA 3APQA 2PN8A 1KEBA 2V2GA 4HJ2A 1BQ7A 1GTAA 5D9XA 18GSA 14GSA 3EYTA 4BWSA 3GUSA 1PA3A 3U5RE 1K0NA 3I43A 2VL2A 3CTGA 1LJRA 3FZAA 1OAZA 5B6MA 3F8UA 3KTLA 2DJ0A 2RM5A 2H72A 3HZ4A 3NZNA 3TGZA 2G0FA 1R5AA 1GSQA 1S3AA 2LTKA 4K2DA 2GZZA 3W8JA 4JE1A 2DBCA 5A4UA 2O89A 3WT1A 1IYHA 2J9HA 3HVSA 3KH7A 2LRCA 1GH2A 2KP2A 1DBYA 4MP4A 4HQSA 1XWGA 5F07A 4NV5A 2IIYA 4WF4A 4XS6A 1T1VA 5GAPD 4V2LA 1GSUA 3WGDA 4O92A 4WKWA 3ZITA 3EINA 1A0FA 1TI3A 1Q98A 1ACVA 3GKKA 2AJQB 4J57E 3TOTA 1AQXA 1XFLA 2H8LA 4XRDA 2YNXA 3GN3A 5H5RA 3D4MA 5AGYA 1K0CA 3F6FA 1F37A 1QK8A 1M99A 4KCAA 1XWAA 4ISDA 1Z7RA 17GSA 2K8SA 5JWQB 2HZEA 2MBTA 2YP6A 2X8HA 1URMA 1T4ZA 3ZTLA 2GSQA 2H74A 2GS3A 3K8NA 1J08A 3VURA 2HXKA 1EP7A 3LFLA 3GL5A 3VLNA 2FWEA 10GSA 1QGVA 3M9JA 2F3MA 4G9HA 2DJKA 4EDZA 4IVFA 4MF6A 4EC0A 1XIYA 3IC4A 4IHUA 13GSA 1BJXA 1FAAA 1B8XA 3TKRA 1ZOFA 3FZ4A 2GGTA 2LJAA 3LYPA 5HR1A 5HFIA 3QFAC 1DSBA 3CRUA 5J5NA 3D4TA 6GSYA 1YEXA 3VWWA 4XIHA 4FIWA 4ACSA 1YZXA 3F4RA 4ULXA 1GSEA 1PMTA 2YWNA 1O81A 2LKUA 3C8EA 4JZQA 1PQNA 2MMAA 5E59A 4KA0A 3PH9A 1SK1A 3F4SA 5ECLB 1QUWA 5JCGA 3BBYA 5IO0A 3KGKA 4EUYA 1AAZA 4KSOA 5DVBA 4BL7A 1WWJA 4Q5QA 2VOCA 3DXBA 5GAND 1XWCA 3C1SA 2I3YA 4DEJA 5DBQA 3D21A 1EOGA 4TR1B 1ABAA 2P5QA 1PSQA 2GSTA 3HJOA 2WGRA 2LRTA 4WF5A 4LL4B 1ILOA 3UEMA 1NM3A 4X1UA 5ECIB 2VM2A 3BD2A 4KSMA 2XBIA 1UN2A 5CP1A 2OKAA 4MDCA 1FOVA 3P8WA 1YKCA 2CVDA 2BMXA 4EF0A 1XXUA 2PPTA 1MD3A 1GSDA 1XZOA 1G0TA 3FKFA 3W6GA 5CREA 1TKDB 1ST9A 3C73A 3HXSA 2NDOA 1EV4A 2OA7A 2HRFA 2EIOA 1B4QA 3ZLPA 2OADA 1VGLA 4I2UA 1SENA 1TRUA 2IN3A 3C1RA 1K0BA 4TXOB 3TDGA 4MPFA 2RM6A 2FA4A 3HJPA 1PRXA 5J3RA 4GSSA 6GSXA 5C04A 3J7Yb 2HI7A 4MJEA 1QMVA 1T8EB 3I6AA 5EVOA 2LSTA 3ZVJD 4YAVA 2BTOT 1EZKA 2OBIA 4NMUA 1MDJA 4RI6A 2KOKA 3L0HA 1U3AA 4X0XA 1SU9A 3IPZA 1YKAA 2VL3A 5IMZA 1OC8A 4OMVA 4NHWA 3ZMLA 4L5LA 4MABA 1N8JA 3UVTA 2ZUPA 3IXRA 5D9TA 3VK9A 4YQVA 5DJLA 2ON5A 1XPVA 2H6XA 2M80A 3G7IA 3RHBA 3QCPA 4MJBA 4PNFA 2CA8A 2XC2A 1ERUA 1NHOA 4Q5RA 4IP6A 3VI5A 3IR4A 3GA4A 3FY7A 3RPPA 3CSHA 2O87A 3FZ5A 1U6TA 3TKSC 5C00A 2CX4A 3GH9A 4L5OA 3E0UA 3KP8A 1ZCPA 5IPHA 1EOHA 1MD4A 4XCSA 4D73B 3OR5A 2VCVA 4J56E 5A4WA 3BCIA 3GRXA 2A2SA 3FYGA 2H73A 3TJJA 3A5WA 2GSRA 2H76A 3PINA 1X5EA 3DIEA 1ZMAA 3W8SA 4DSSA 5A4VA 4BPYA 4HS1A 1TU7A 2L6DA 3IRAA 1Y6EA 4GQCA 3RAZA 4YQMA 5JWRB 2YJHA 4TVEA 4CDOA 2C4JA 4E8HA 2EIRA 1F9MA 4ZBDA 3QPMA 3CTFA 3EU4A 1Z7PA 4ECIA 3GV1A 1H75A 1GSYA 5JCWA 5IPGA 5F06A 5ECNB 4K7IA 2LQOA 5EL8A 2FHEA 1WRYA 2FCHA 1OKDA 1JZDA 4BVXA 1UA5A 1O8XA 3TRQA 3UL3A 1JFUA 5KN3A 1A2LA 4IN0A 2A2RA 3HHVA 2MMZA 2N5FA 1B9YC 1M9AA 2DJ2A 3LWAA 4MH2A 2NVLA 4WR5A 1AXDA 4G10A 1KNGA 4EVMA 1JHBA 2PERA 4XS4A 2V6OA 3KP9A 2JSZA 5ECQB 3ZMKA 1TU8A 1Z5YE 3ME8A 3DKSA 2YWOA 1Z6MA 1FVJA 1RK4A 2VLVA 3NIVA 4F2IA 1GUHA 4XTSA 3TKSA 4K7OA 6GSUA 2YCDA 1B4PA 3Q18A 2C3QA 3Q6OA 2GQLA 4WXTA 3R2QA 1M9BA 1SD8A 1WE0A 1ERVA 2PVOC 2K6VA 5GSSA 1K3YA 4ECBA 5GZZB 5ENUA 4O7HA 4AJ6A 1N2AA 3UJ1A 1BAYA 1OVNA 1XOAA 1M2AA 1E6BA 5J9CA 1MDIA 4K0GA 4F0BA 2R4VA 4Q5NA 3CRTA 3IK7A 4KE3A 1MTCA 2FWFA 4ZL9A 2FLSA 1PL2A 4K9ZA 2MZCA 4PQHA 4JR4A 4E8EA 3LEFA 5HQPA 2KUCA 3HCZA 2V41A 2L6CA 3GL3A 3ISOA 2HZEB 2QSIA 1X0RA 1QFNA 1TXXA 2JZTA 5B6NA 2L5OA 1KTEA 2LRNA 3HA9A 4LMWA 2VD0A 3DMLA 4JU5A 2IWTA 4PQ1A 2MMOA 1V57A 2D2ZA 1S3CA 5ELAA 2EIQA 1GSFA 3UBLA 2DJJA 4TOPA 1K3OA 2NTOA 3O76A 2HZFA 4XRAA 1YF0A 1GP1A 4WETA 5IM9A 3M1GA 2B3SA 1TOFA 3CSJA 1UC7A 2LV3A 2WB9A 3TCOA 2CAQA 1ZYEA 4RUVA 2IFQA 4K7NA 3EURA 5ECRB 4EL1A 3L4NA 5KEJA 3HKRA 3EWLA 5CO3A 2CV4A 4IP1A 1V98A 3GNJA 4NAXA 3GX8A 3UMAA 3GH6A 5ECKB 3CYNA 2DLXA 3PGTA 4HJMA 4IELA 2WFCA 3VFIA 3ME7A 2YWMA 1SKSB 2O85A 2C1YA 3TUEA 4FYBA 2H01A 1X5CA 3IAS2 3KXOA 5IOWA 2AB6A 2DC5A 3L9UA 1I9DA 1AUCA 2IL3A 4FH8A 5AIXA 1LBKA 3LYKA 1GUMA 3F6DA 4HDEA 5HR3A 1GWCA 5IMCA 3CXGA 4POKA 3KJYA 4F0CA 3ZFLA 4H86A 4G2EA 19GSA 2G2QA 1PX7A 1SL2B 2AV4A 4J2FA 2E7PA 2DIZA 2XBQA 1RW1A 2C80A 4FYCA 1THXA 3EVIA 5J9BA 1A2JA 2OE0A 1TRWA 4POBA 2OACA 3FHKA 4HEA2 4AF2A 3SBCA 3H79A 3PR8A 2DMLA 2C0EA 2CX3A 3WYWA 2B6MA 5HR0A 1XBSA 1GTBA 1TRSA 3GHAA 4GCIA 5CRHA 1A2MA 2GQKA 4MZBA 2ALBA 2CVBA 2LJKA 3MWHA 5ECOB 2C0GA 3GKNA 2X8CA 2REMA 1VF4A 4ZXGA 1T4YA 1FW1A 4V1Ag 3HD5A 4I5QA 1V58A 5DQYA 1XW5A 3M0FA 5KN2A 1FB6A 4GSTA 3MSZA 5D93A 3V1WA 5ECHB 3UVHA 3F3QA 2C0FA 1U87A 3P90A 2VAFA 4GSNA 2GZPA 5EPFA 2AYTA 5FT3A 1PKWA 4OWYA 2E0QA 1S3DA 1XOBA 3UIWA 1YY7A 4JBBA 1ML6A 1V9WA 2KP1A 4EE0A 2RIIA 4ZBBA 1WPIA 4N11A 5IO2A 1U3IA 2CZ2A 4MA9A 2O7KA 5IMDA 3C71A 2H70A 4O5RA 3AY8A 2LUSA 1HQOA 3VWXA 3ERWA 1EP8A 3TJBA 2I1UA 4I2TA 2R6KA 4RQRA 3ED3A 3FK8A 3L78A 4QL9A 5KN0A 1K3LA 4TR4A 3H1NA 4WEYA 2FA8A 2MMNA 4PNGA 3F4TA 4LL1B 3KMOA 3ERFA 1ERTA 3VPTA 1AW9A 2XPDA 3LSZA 1OC9A 1M0UA 2VM1A 5GSTA 4O32A 5AN1A 3ZL5A 2AAWA 1B9XC 4DSSB 2EC4A 2OJLA 4DVCA 5DALA 5G5EA 5IOXA 4K6XA 1DE1A 2MBSA 1OE8A 4PXOA 5EY6A 1HNAA 1JZOA 1PD21 3QAVA 4F03A 1R26A 2LQQA 4XS1A 5L71A 3F9UA 2PWJA 1GTIA 3C7MA 1SKRB 1QXHA 2PU9C 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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