1V98A

Crystal structure analysis of thioredoxin from thermus thermophilus
Total Genus 23
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
23
sequence length
92
structure length
92
Chain Sequence
GAPLTLVDFFAPWCGPCRLVSPILEELARDHAGRLKVVKVNVDEHPGLAARYGVRSVPTLVLFRRGAPVATWVGASPRRVLEERLRPYLEGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords thioredoxin
publication title Crystallographic Analysis of Thioredoxin from the Thermophilic Bacteria Thermus thermophilus
rcsb
source organism Thermus thermophilus
total genus 23
structure length 92
sequence length 92
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.8.1.9: Thioredoxin-disulfide reductase.
pdb deposition date 2004-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1v98A00
3IAM2 1A0RP 2BTOT 1SJ6A 4TR0A 1ZCPA 2CAIA 2YV9A 3GX8A 2J9HA 2H0GA 1XIYA 4Q5NA 1F3BA 22GSA 5DALB 2AB6A 5GSTA 1T3BA 3TUEA 3GKKA 2MMAA 3TOUA 1J0FA 5JCGA 5GAPD 2F8FA 5LCZA 5ID2B 3HYPA 2M80A 2VL9A 3QAGA 2PGTA 4XRDA 13GSA 2VLVA 3EC3A 3QCPA 1EV9A 3IE3A 1PD21 10GSA 3FKFA 3A2WA 1VF3A 3HDCA 3UVHA 2LRTA 3EU3A 1T4ZA 2JZSA 2FWGA 3HKRA 2DJKA 1KTEA 1S3AA 1R7HA 3ED3A 3F3QA 1AXDA 1A2LA 1EP7A 4GSTA 3E3EA 3QOUA 2NPBA 4JZQA 4DVCA 2X8HA 4MH3A 2FUG2 2JADA 3ERWA 2OBKA 4N30A 2IMEA 4XHMA 3C7MA 5CO3A 2HZEB 1YZXA 4PQHA 4WR4A 4HJ2A 4GQCA 1HNBA 2OE3A 4L5OA 4F0BA 5COHA 2C0EA 3HD5A 5JWOB 2WJUA 3I9V2 2DJ1A 3VLNA 2V6KA 3A3TA 1YKCA 3U5RE 4MABA 1IYHA 4G2EA 1ON4A 2YJHA 2RIIA 1GSFA 5B8BA 2ZUPA 4DSSB 5JCUA 2P5QA 2L4QA 2DIYA 4PUFC 4PQIA 4POKA 3EWLA 4KDYA 5FT3A 1E6BA 4ECCA 3WT2A 2H76A 3IBHA 1TK0B 2JSYA 4MF7A 5D9WA 2HE3A 2G0FA 2AUVA 3PINA 2FA8A 5IM9A 7GSSA 1QGVA 1XW6A 2VIMA 3HJMA 1TOFA 1A23A 3M9JA 4WF4A 1BEDA 1B9YC 3FZAA 3LYPA 2NBSA 4KDXA 2GZZA 2WULA 2R4VA 2VAFA 1T8EB 3LSZA 2YZUA 2N5AA 3RPNA 4XTSA 4YQVA 2IN3A 5J3RA 2H6YA 4WETA 3Q74A 4MJCA 3VI7A 1K3LA 1M2DA 1TTZA 2IMIA 4DSSA 4JR6A 3EU4A 1F3AA 4NXIA 3F0IA 2BJXA 1A24A 1VF2A 3TJBA 1JZDA 5JWRB 1KEBA 3ERFA 5ABRA 2VD0A 3P2AA 1M0UA 2L5LA 2KHPA 2C0GA 5JWQB 3DRNA 1E2YA 3ZMKA 4ECBA 2H73A 3GMFA 1N2AA 4OFTA 4GCIA 2WFCA 3S9FA 4JBBA 3KEBA 3CRUA 3LJRA 1SK1A 4CDOA 4MF5A 4GWRA 3KGKA 3ZVJA 4E8EA 1T4YA 2DIZA 4YQMA 1GRXA 1YDKA 2E7PA 4PUAA 2H30A 4I6XA 4EKZA 5ECNB 3FR3A 4IELA 1EOHA 4F9ZA 4I8BA 1TRVA 1OC9B 3Q18A 1M2BA 5IPGA 1OKDA 2HRFA 1G6YA 1O8WA 3QPMA 4IS0A 4WXTA 1V57A 3RHCA 3SWLA 4X1UA 2HZFA 2GQMA 2X8GA 1F2EA 2H1BA 5D9TA 4MMMA 2FWHA 4ECJA 3QFAC 4L0UA 2YJ7A 1AC1A 4V2MA 4PNGA 3FW2A 3VI5A 5KN3A 2FY6A 1ERVA 3EMXA 2C0FA 1MDJA 2H70A 2R5GA 1URMA 1SJZA 1K0OA 4KAEA 4ULXA 1M2AA 1PN9A 1GNEA 1X9SB 1OKTA 4O7HA 5DJLA 3RAZA 1EWXA 2OA7A 2PVOC 1TJDA 2VCWA 1UA5A 5IMVA 2NVLA 4N0VA 5J9CA 1LBKA 1T00A 2XHFA 3GIXA 3EYTA 4LL1B 1QQ2A 4OD7A 3L9UA 1YEXA 2CQ9A 3KIJA 1MTCA 2X99A 3QFBC 2HFDA 2HSYA 2I81A 4J2FA 2YANA 1BJXA 1YY7A 3D5JA 2VCQA 1DUGA 3G7YA 2D2ZA 3ZVJD 5INYA 2DBCA 4TXOA 1EEJA 5EVOA 2B7KA 4ZB9A 5C00A 2X8CA 1FVKA 4I97A 1C72A 3M0FA 5KN1A 1GUMA 1U87A 2AAWA 2L57A 3MDKA 3A5WA 4V1Ap 2QKEA 2FLSA 1AAZA 1GUHA 4JR4A 3J7Yk 5DJMA 5DQYA 1XWCA 1JZOA 4X0XA 4I5QA 2N5FA 2CVKA 1M9AA 3O3TA 1G7OA 2RLIA 2E2MA 4LA1A 3DVXA 4OWYA 5CRDA 3CSJA 3MAKA 4BVXA 3HVVA 4MLYA 5D73A 2M46A 3F4TA 4HUAA 4IJ3A 3UVTA 2LJKA 4ML6A 2EIQA 4HEA2 2DMLA 1ML6A 3TJKA 2GDRA 3KH7A 4MP4A 4K2DA 1PQNA 3GTUA 1SK0A 3F4SA 4CHSA 2WB9A 2ON7A 2MBSA 5DVBA 3GYKA 1ZGNA 1QXHA 2MYGA 6GSVA 3ZREA 2MMZA 4BL7A 3FEUA 3HJOA 4TW5A 2E0QA 3LG6A 4OO4A 2C80A 3D6IA 4ZBDA 4F2IA 1PRXA 3ERGA 1KBNA 3QR6A 4IQAA 2H1GA 3KP9A 1WJKA 1B4PA 2YCDA 4YAVA 3GSSA 2AV4A 2O8VB 3UIWA 5IPHA 1A8LA 1OVNA 2V2GA 3W8SA 1Z7RA 2IMKA 4G9HA 4TR1B 4ZBAA 4J56E 1Q98A 1TI1A 4O5RA 4MA9A 2ON5A 1XXUA 5HR2A 4HU9A 3VPTA 2KOKA 1Z6MA 3IXRA 3DWVA 5ECQB 4ACSA 2X64A 1V2AA 3APOA 3KMOA 4TN8A 5CREA 3VK9A 2DC5A 5CRWA 3CSIA 4YQUA 3I6AA 1Y25A 3KXOA 4ILFA 1SL0B 4O32A 5G5FA 2CZ3A 5IMCA 5IMZA 1TI3A 1TU7A 1OE7A 1EP8A 2LTKA 2YWMA 1DE2A 1Y6EA 1JLVA 3L0HA 3F4RA 3US3A 2GSRA 2RUEA 1A8YA 3A2XA 5G30A 3HZ4A 1PGTA 3GA4A 3JCML 3VWVA 3D0ZA 2VOCA 3F3RA 4AGSA 2GTUA 4EDZA 4AJ6A 4POMA 1T7PB 1Z6NA 2DJ3A 5B7CA 2FCHA 3LFLA 5F05A 5CYYA 4NV5A 2GGTA 2HI7A 2HYXA 2MBTA 1GSUA 1B9XC 3GL3A 2GSQA 1WRYA 4YAPA 2O85A 2RM6A 4GRFA 4H86A 4RI7A 3LORA 4HZ2A 3TKSC 5L71A 1WIKA 2HRNA 2B1LA 1EV4A 1U3IA 2HNLA 1XW9A 3GL5A 2GSTA 5GSSA 1CQHA 4KA0A 1EZKA 3QD9A 1V58A 5G5EA 4FYCA 1XVQA 4EO3A 3KTLA 3IK9A 6GSXA 2PWJA 4GF0A 3TRPA 4XS6A 2EIRA 1Z3EA 4DEJA 5DALA 5H5RA 4F0CA 2G2QA 2MZCA 3N9JA 4JRRA 3WYWA 2XBIA 2H0HA 2CZ2A 5AISA 4HS1A 5ID2A 5ECRB 3CTFA 1TXXA 3CYNA 2AHEA 4NWYA 2C1YA 3FK8A 4NPBA 4QL9A 3IR4A 1Z5YE 3EURA 3M3MA 2K8SA 2OE1A 1GSQA 4XS1A 3Q19A 3SBCA 3UBKA 2JZRA 3EE2A 1JZWA 2N5BA 4EXJA 4NHWA 2V41A 2H72A 2H1AA 3C1RA 3U6VA 3K8NA 2OE0A 1USBA 2FGXA 2IMFA 4MJAA 2LJAA 3DD3A 1O8XA 16GSA 1GTUA 2LQQA 4EDYA 3CMIA 3F6FA 1EEMA 3L9SA 4ZL9A 2FWEA 3DXBA 2GQKA 5CRGA 2HZEA 1V9WA 3DMLA 4ZXGA 1I9DA 3IAS2 4N0ZA 2B3SA 5IOWA 2XPDA 3IHQA 1K0AA 5FWGA 2H0IA 5B6MA 2YV7A 2AYTA 2VL2C 4ZBBA 3H1NA 5G1KA 1M7TA 4L5LA 3TCOA 6GSTA 3D4TA 2OADA 2OJLA 1GH2A 3Q6OA 4MJBA 1BAYA 1Z9HA 1M99A 2F9SA 5E59A 4GLTA 1TP9A 2P5RA 2LQOA 3VPQA 2WCIA 1ILOA 1TK8B 4RUVA 3E0UA 4POLA 1OE8A 5B6NA 3UOMA 1GSDA 1JZRA 3ZLPA 2L4CA 4GTUA 4DSRA 2KUCA 4XRAA 2YPMA 4KCEA 2C0DA 3CTGA 3GKNA 5LD0A 9GSSA 2PBJA 5ELAA 5ECLB 3TRQA 2WZ9A 2L5OA 3M9KA 1N8JA 3PH9A 4PXOA 4O92A 1GULA 2R37A 2RUFA 1QK8A 3TKSE 1SYXA 3L4NA 2I3YA 2LS5A 3GUSA 4OCEA 2XPEA 2H1DA 4BVYA 3UMAA 1YJ6A 4ZIJA 3HHVA 1RW1A 3NZNA 1OYJA 5DCHA 3E9JB 3F8UA 4MZBA 5DDLA 2HSHA 3QAVA 4OFMA 2PERA 2MMNA 2VCXA 4BWQA 4EC0A 4G19A 1W89A 1IYIA 1S3CA 3GH6A 2REMA 3DYRA 1TRUA 3LWAA 5IO0A 5CAXA 4BA7A 2VLTA 5IMAA 2O7KA 2K8VA 1H75A 1EGRA 3KD0A 1G7EA 1XWAA 1K0DA 2YOIA 5IMDA 6GSSA 3O6TA 3D22A 4ZB8A 4TXVA 4OO5A 4TR4A 1F37A 1M9BA 1ZOFA 1GL8A 4F82A 1OC9A 4K7OA 1K3OA 2OACA 5AN1A 3TGZA 1FW1A 3FZ9A 1O73A 4K6XA 1GSEA 4WR5A 1O85A 1HD2A 2I9HA 1JLWA 3DGQA 1VRSD 1TRSA 4L0WA 5G2ZA 5HQPA 1XOBA 4WBRD 1GP1A 1AIUA 2H71A 1A0FA 2VUPA 3GX0A 2LUSA 4Q5RA 1MDIA 2C4JA 2FWFA 1R5PA 3F6DA 3H8QA 5H5QA 3FZ5A 3LXZA 1AQVA 5FHIA 3TJGA 14GSA 4TKYA 5H5SA 1CQGA 2LRNA 4KSOA 3J7Yb 1SYRA 4RQXA 3GSTA 1LJRA 1WP0A 2VCTA 18GSA 2CVDA 1BYEA 3DKSA 3ZZXA 2CX3A 3TDGA 2K9FA 2MMOA 5HR0A 1PKZA 3RDWA 4TRXA 2HLSA 1XCCA 1X5DA 5F8BA 5DQSA 1O6JA 2YWOA 2GT6A 4K7NA 4V2LA 3WGEA 4HQZA 2DJ0A 2CT6A 3L78A 1A2JA 1XWGA 4HOJA 4PX1A 1V40A 3GKXA 4LMVA 2VM2A 1F9MA 3KP8A 5J41A 1OC3A 3KTBA 5ECKB 2HXKA 2WDUA 4QL7A 1H4OA 1MDKA 2DJJA 5HFKA 1DBYA 3UARA 3BCKA 4HDEA 3ME8A 5HR1A 3VWXA 3HJPA 2GT5A 3DEXA 4POBA 5ECPB 3KM6A 2C3QA 2L6DA 1YKAA 3FR6A 5F0GA 1XWKA 2QC7A 3RBTA 2CA8A 2BMXA 4TR3A 1SJIA 4N11A 3BCIA 2F8AA 2GS3A 1FOVA 1FHEA 4ZILA 4ZL7A 3FHKA 4PNFA 4IKHA 1VF4A 4AJ7A 2YWNA 1QUWA 1XOAA 4OFNA 5ECSA 3WD6A 4K0GA 3FZ4A 2K18A 2GVPA 2IMDA 2K6VA 1GLQA 3ME7A 2PN8A 4EE0A 3IDVA 2PUKC 3GNJA 4I2UA 2VL3A 1Z7PA 1ERUA 2B1KA 2LV3A 2NDOA 4EL1A 3AY8A 5DAKB 4HU7A 1FB0A 3WGXA 1O7UA 2B5YA 1YF1A 3I43A 2H01A 3P90A 4WF5A 4KB3A 6GSYA 1FB6A 3O76A 1WPIA 2DMMA 2WRTA 2JZTA 3RPPA 4MK3A 4OMVA 4IGJA 2Z9SA 2DLXA 4D73B 3ZIJA 3HVXA 4FYUA 3TKPA 2R3XA 12GSA 4TR1A 3I69A 1O81A 3GFKA 3FR9A 2LRCA 2GLRA 1YQ1A 2IFQB 4IN0A 2WGRA 4RQRA 1V98A 5CNWA 4F03A 3F63A 5F06A 4TVEA 2AJQB 4HZ4A 1PL2A 1XW5A 4JU5A 2I1UA 1X5CA 1G0TA 3IPZA 5DAKA 2PU9C 4XIHA 1XZOA 5D93A 2H19A 4XCSA 5GAND 4PGTA 3MNGA 2C8UA 3GRXA 3EMPA 2ES7A 5D9XA 1X9MB 1R26A 4Q5QA 3ZRDA 5EY6A 2VD1A 1LU4A 1ST9A 1JFUA 3ZFBA 3QMXA 2LEGA 1GTIA 3VFIA 4ZL8A 2A2SA 1AQXA 4D73A 1SD8A 4MPFA 1PX7A 4PQ1A 1AQWA 3LQ7A 4AF2A 3UJ1A 3LEFA 1T1VA 1NHYA 4N10A 2IFQA 1ZL9A 1UN2A 2P0GA 1OC8A 2B5XA 5J9BA 4Q5FA 1J9BA 1OAZA 4LL4B 4ZB6A 2C3TA 4HJMA 5D9VA 2ALBA 1SL2B 1FAAA 4GXZA 2VCZA 4RI6A 2R6KA 1BG5A 4MH2A 3ZIVA 2JL4A 4Z7XA 3BOAA 3A2VA 2WS2A 2FNOA 1HQOA 1PL1A 4XS4B 3L9VA 1K0NA 2B7JA 2QGVA 3FRCA 4ML1A 3TOTA 3HA9A 4NMUA 4OCFA 5F07A 4GSNA 3KMNA 2EC4A 2H75A 2CV4A 1AW9A 4K0NA 3TKSA 5AGYA 5IQYA 1MEKA 1TDIA 1Q4JA 3M1GA 2IIYA 3C71A 1VF1A 3W6GA 2NTOA 4FH8A 4IP6A 3TJFA 4KDUA 4LLRA 5E4WA 4I2TA 4XS4A 3PR8A 2YNXA 4WEYA 2VLUA 2TIRA 3HVSA 2A4VA 4MF6A 5IMFA 3ZFLA 1GSSA 1WMJA 2H66A 1NSWA 4FYBA 1U6TA 2LNTA 1SENA 3H93A 3P7XA 4IP1A 3DVWA 4DSQA 1SU9A 1ZMAA 2H6XA 1MD4A 1RK4A 4KUNA 1X0RA 2FA4A 1NM3A 4K9ZA 4L8EA 2XC2A 2LNSA 2H8LA 3H4KA 1UVZA 1BX9A 4WKWA 1K3YA 3F9UA 6GSUA 5HR3A 4ISDA 5ECIB 2E2GA 4BPYA 1BQ7A 5D96A 1GTAA 4FO5A 3EVIA 4HQSA 5DCGA 2XBQA 1HNCA 1AUCA 1I5GA 5KN0A 3ZYWA 3WGDA 4KNDA 1GUKA 2C3NA 1XFLA 4WBJA 2LJRA 3QDNA 4MCUA 1TW9A 3D4MA 4NV2A 3NOFA 5LNKe 3G7JA 1B8XA 1FVJA 2YZHA 2PMTA 4K1FA 1MD3A 5EL8A 3HCZA 4JE1A 2VO4A 1SD9A 5G31A 3BBYA 2VL2A 2TRCP 2VM1A 5HFGA 5IIZA 3G9BA 3HY2A 3CXGA 20GSA 4TOPA 3LYKA 1PKWA 3HZ8A 3TKRA 4CW9A 3KCMA 2ZCTA 3V1WA 2LKUA 3P8WA 4K8MA 4MDCA 4BWSA 4KE3A 2L59A 1B4QA 1XPVA 3KH9A 2CAQA 3D21A 2KP1A 4K7IA 3VWUA 2OKAA 3VWWA 5ECHB 1FG4A 1DE1A 2LSTA 4HI7A 5KEJA 3IOSA 1ERTA 2YP6A 1SKSB 1G6WA 4NAXA 5JCWA 4X43A 5HFIA 3OR5A 3IA1A 1GLPA 3RHBA 5C04A 3CRTA 2I4AA 4ECIA 1YF0A 8GSSA 4IVFA 2F3MA 3N5OA 3VURA 2H74A 3LXTA 1SKWB 3GKMA 1EGOA 1SK2A 2A2RA 4TXOB 2RM5A 1A2MA 1B48A 4MZWA 4NHZA 2L6CA 3C1SA 4IW9A 5AIXA 2PVQA 3HXSA 4MZCA 1QMVA 5ENUA 1K0MA 1THOA 3IC4A 1K0BA 1U3AA 2JU5A 4EF0A 5GZZB 2IJYA 4KSMA 1SKRB 5EPFA 1XBSA 4G10A 4EUYA 4P3YB 4V2NA 5ELGA 3NIVA 1HYUA 1NHOA 1ZZYA 1WWJA 3FY7A 3MSZA 3UL3A 3ZTLA 1F6MC 5B8AA 2O89A 3KZQA 1VGLA 1FO5A 1THXA 1ZYQB 3GN3A 4IQ1A 4IHUA 1ZYEA 2V1MA 1ERWA 2QSIA 3APSA 2DJ2A 3ZITA 3GTUB 5KN2A 4KH7A 1KNGA 2ZNMA 3PGTA 5J5NA 19GSA 4EVMA 3QAWA 1R5AA 3LGCA 3TB2A 2CVBA 3WT1A 1TK5B 1WE0A 1PA3A 2FHEA 3ZL5A 5A4VA 1UC7A 4IBPA 5ECOB 6GSWA 1GTBA 4KCAA 1HNAA 3C8EA 11GSA 2FD3A 3BJ5A 5A4WA 2DSAA 2V32A 1TRWA 3GHAA 1JHBA 3FYGA 1WOUA 5AIVA 3CSHA 1DSBA 5DBQA 4KW6A 2IL3A 2R2JA 3GH9A 2H6ZA 4GQFA 5CP1A 1ABAA 3IRAA 1PSQA 1TU8A 1X9WB 4GSSA 3W8JA 17GSA 3CBUA 4JEDA 1PX6A 2GQLA 1S3DA 2YN1A 2M72A 2KLXA 5IO2A 5CRHA 5J4UA 1J08A 4AJ8A 2GZYA 2EIOA 1SL1B 2J23A 3R2QA 4MPGA 4PURA 1GSYA 1W4VA 1GNWA 1R4WA 5D8IA 4E8HA 2CX4A 3C73A 2TRXA 3EINA 4ID0A 4QQ7A 3UAPA 3ISOA 3ZMLA 2GZPA 1RQMA 2KP2A 2VCVA 1K0CA 1NW2A 1PMTA 4KGIA 3BD2A 4KX4A 2PPTA 3TJJA 3TKQA 2IPAA 2JACA 1EOGA 5ECMB 1GWCA 1QFNA 1XVWA 1YEPA 3H79A 3GV1A 5A5KA 5IOXA 3APQA 4LMWA 3TRXA 3UBLA 3DIEA 3UEMA 1X5EA 2P31A 3KJYA 4V1Ag 2O87A 5A4UA 1XWBA 2IWTA 3GURA 2GSSA 1TKDB 2V6OA 4YH2A 4MJEA 2YWIA 1U88A 2OBIA 2F51A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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