1V98A

Crystal structure analysis of thioredoxin from thermus thermophilus
Total Genus 23
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
23
sequence length
92
structure length
92
Chain Sequence
GAPLTLVDFFAPWCGPCRLVSPILEELARDHAGRLKVVKVNVDEHPGLAARYGVRSVPTLVLFRRGAPVATWVGASPRRVLEERLRPYLEGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Thermus thermophilus
publication title Crystallographic Analysis of Thioredoxin from the Thermophilic Bacteria Thermus thermophilus
rcsb
molecule keywords thioredoxin
total genus 23
structure length 92
sequence length 92
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.8.1.9: Thioredoxin-disulfide reductase.
pdb deposition date 2004-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1v98A00
3EYTA 4MZCA 1HQOA 3D6IA 3TJJA 1PKWA 5IPHA 3J7Yk 1OAZA 2DIZA 2VUPA 3GFKA 1X9SB 5ENUA 4TR3A 4NMUA 4K7IA 3J7Yb 1A0FA 1T8EB 2RUEA 3RBTA 2LRTA 4XS6A 1T3BA 4BVYA 3G9BA 4POMA 3ZZXA 4TXOA 2MMZA 4XIHA 2E2MA 2R3XA 1ZOFA 7GSSA 4TVEA 1LU4A 5GAND 1I9DA 6GSVA 5IMAA 4MPFA 1USBA 4ZIJA 5G2ZA 4TXOB 1QQ2A 2QKEA 4LA1A 5J3RA 2B6MA 2JSZA 5ECOB 3WT1A 4IJIA 4ZILA 2DC5A 3IA1A 3UL3A 1QFNA 1RW1A 3ZMKA 1CQGA 4GSNA 1GNWA 1KBNA 2CVDA 1TRVA 3M0FA 3KEBA 2OJLA 2DJ1A 3M9JA 3KGKA 1XXUA 4IKHA 5CRGA 1EV9A 1SKSB 2HRNA 1X9MB 2BTOT 2KHPA 3KP9A 2IN3A 3RPPA 1RK4A 1JLWA 3HXSA 2C4JA 4IQ1A 3EE2A 5JCGA 2VCVA 3GN3A 4KAEA 4N0ZA 4ECJA 4D73B 1AUCA 4AGSA 3GKNA 1K0CA 3TRXA 3O6TA 1TI3A 1ERWA 2L5LA 1GSYA 1SKRB 1SL0B 3IRAA 2PERA 3N5OA 3PH9A 4YAPA 1YQ1A 1GTBA 3KD0A 5H5SA 3TDGA 1A8YA 2DIYA 2MZCA 1ACVA 1U87A 3UIWA 5HQPA 3VPTA 3KMNA 1ZYQB 2A2RA 3P8WA 3DXBA 3EVIA 2V41A 4PGTA 1X0RA 5F07A 2V6KA 2E2GA 4PUFC 4GLTA 1SK1A 5FHIA 1XWKA 5IM9A 3U5RE 2FWGA 3BJ5A 3KXOA 4NAXA 4PQIA 2OKAA 3QFBC 1OC8A 2A4VA 1F37A 4AJ8A 2B3SA 9GSSA 1PQNA 4EVMA 1TP9A 2YANA 2JADA 3DYRA 1EV4A 4HQZA 2KUCA 4K1FA 5AIXA 1EZKA 3H1NA 2ZCTA 4EDYA 2MBTA 4MJCA 2PU9C 2ON5A 4XS1A 3C71A 3HCZA 4JZQA 1SD9A 2OACA 2H0HA 1V2AA 4ECIA 4ZL7A 3HZ4A 5ID2A 3NOFA 3UVTA 3TUEA 4NV2A 2MBSA 4WF5A 3L9UA 2LJKA 1XBSA 1LBKA 5GAPD 4V2MA 1G0TA 4EDZA 3DKSA 4N0VA 1DUGA 5G1KA 1JLVA 1HYUA 4KB3A 1ABAA 2AV4A 5IPGA 1EGRA 2KP1A 2X8HA 3E0UA 1FVKA 1I5GA 3FZ9A 2L5OA 5F8BA 1TRWA 1R26A 4POBA 2VCXA 3IAS2 1SD8A 4Q5QA 2GZZA 3DIEA 1GTUA 2KOKA 2F8FA 1SL1B 3M8NA 2MYGA 1WIKA 3VURA 1H75A 1GH2A 1GSSA 3IK9A 3KJYA 3NZNA 3GH6A 4XCSA 2CQ9A 4DEJA 2OE0A 3HY2A 1BQ7A 4F2IA 4TKYA 1K0MA 1DE2A 2B5YA 2OBIA 1MEKA 5KN1A 1OE7A 2IMDA 5DQSA 5DAKA 5ECQB 3UVHA 2IL3A 4L5LA 4IW9A 2EC4A 4MF5A 4JRRA 5G31A 1F3AA 5D9XA 3UARA 4GRFA 3TRPA 3QAVA 5IMVA 3GMFA 4KA0A 3QOUA 2IMKA 1FAAA 4EC0A 1T1VA 4GWRA 1KNGA 1TU8A 4NHWA 1XIYA 3Q6OA 4CW9A 2GLRA 3PR8A 4F0BA 1YJ6A 2FNOA 4LL1B 1ML6A 1NHYA 1WOUA 2BJXA 3GTUA 3C1SA 3FYGA 1BAYA 3F9UA 4KGIA 4G19A 2CT6A 4E8EA 5LD0A 3GX8A 2L4QA 2IFQB 3G7JA 2FCHA 1S3AA 2TRCP 4KDXA 2J23A 2V6OA 4N11A 3HD5A 1XWBA 1SU9A 3GTUB 4LLRA 2J9HA 1NW2A 2NDOA 1GLQA 2VL2A 4NV5A 3LORA 4KNDA 4ZBDA 4O7HA 2F51A 3ZRDA 4KDUA 3I69A 4F0CA 3W6GA 1AQXA 5J9CA 2A2SA 1EP7A 1A8LA 3KIJA 1A2MA 4ISDA 4ZB9A 5EVOA 3ERFA 4MLYA 1YKCA 2FY6A 3FEUA 2H74A 3WGXA 2FD3A 4AF2A 1HD2A 3IAM2 3G7YA 2LKUA 6GSYA 3O76A 4TXVA 3F63A 3DVXA 4AJ7A 2FWFA 4QL7A 2X8GA 5CRHA 2VD0A 2L6CA 1OYJA 3DGQA 5ABRA 4XHMA 4PUAA 5IQYA 3RDWA 3IXRA 4PQHA 2LQQA 2VCWA 3CSHA 1EP8A 4YQVA 20GSA 1XZOA 4I5QA 4MH2A 1X5EA 1OC3A 3CRTA 2C0GA 4N10A 1TDIA 5COHA 5F0GA 3IPZA 5CO3A 1K3OA 2R4VA 2YOIA 3C7MA 3VPQA 4PNGA 5CAXA 1SK0A 3HKRA 4I2UA 4JR6A 2ZNMA 4ECCA 2VLVA 2FA4A 4ZB8A 3ME7A 1R4WA 3RHBA 2WDUA 2QSIA 3R2QA 5E4WA 4JBBA 2H71A 4WEYA 1J0FA 2H1BA 4BA7A 1GWCA 2H66A 3P2AA 1VF3A 3TKSE 4CDOA 4GCIA 1H4OA 1C72A 5HFGA 5ECSA 1K0BA 4O5RA 5AN1A 5GSTA 2M72A 1A2LA 5DVBA 2GVPA 4OCEA 2X8CA 3GKKA 4TOPA 4EE0A 2WGRA 2CVBA 3N9JA 2EIRA 2WCIA 2L57A 2YWOA 4OO5A 1EOHA 3MDKA 5A4WA 4ZXGA 2HNLA 5HFIA 4KCEA 5CP1A 4WXTA 3GA4A 2FUG2 1BEDA 1MTCA 4GQFA 6GSUA 5AGYA 4MH3A 4KH7A 2LJAA 4FO5A 1EEMA 3LFLA 5ECHB 2AB6A 3US3A 3TKSC 2RLIA 1OKDA 2K8SA 2PBJA 4EL1A 2R5GA 4TR4A 2V1MA 1FW1A 4FIWA 4F9ZA 1U3AA 1YEPA 3Q19A 1DE1A 3F8UA 2MMAA 1IYIA 1YEXA 8GSSA 2H01A 3VK9A 2OBKA 11GSA 3HJPA 1TK0B 1JZOA 1PL2A 2K6VA 5HFKA 4MJEA 4POKA 4HDEA 1JFUA 1J9BA 4BL7A 2H0GA 5ECPB 2IPAA 2AAWA 1T00A 2H30A 1VRSD 5KN3A 4PQ1A 3FK8A 2PVQA 1MD4A 4OO4A 4ILFA 1GNEA 1BG5A 14GSA 3NIVA 4HUAA 1LJRA 4GXZA 4IELA 4K7OA 3DRNA 3GX0A 1T4ZA 2CV4A 4IBPA 1ON4A 1JZDA 3L4NA 2R6KA 2KLXA 2VCQA 1FB0A 5J5NA 3EC3A 1MD3A 1GTAA 2VCTA 2GZPA 3C8EA 1TK8B 3TJFA 2Z9SA 4GQCA 4POLA 5IMZA 4EUYA 2VCZA 1G7OA 1KTEA 1ST9A 1SKWB 3TKRA 2VD1A 5G5FA 2RIIA 1NSWA 2P31A 3LQ7A 1ERUA 3D0ZA 3GHAA 2JZSA 1GLPA 1XCCA 3ZVJA 1HNAA 5DCHA 3P90A 1FO5A 4MF6A 3ZYWA 2GZYA 3GURA 4KCAA 4KSOA 3QFAC 2PPTA 2H70A 3KH7A 2P0GA 4G9HA 1TI1A 2CAIA 2CZ2A 3D4TA 2V32A 2YV7A 5J9BA 1CQHA 1AAZA 5CREA 4HU9A 1AC1A 2PVOC 2XC2A 2I81A 2IJYA 3L9VA 1GSEA 3C1RA 3CMIA 1YF0A 2DLXA 1K0NA 2OE3A 3KP8A 3FY7A 4HJMA 1R5AA 4NPBA 4EF0A 2I9HA 1SJIA 1YDKA 1XOBA 2N5FA 1BJXA 5D9VA 2P5RA 3LSZA 3FR9A 4N30A 4PNFA 3HYPA 2PGTA 2VIMA 3CTFA 1A23A 3LWAA 3M1GA 3ZITA 4OMVA 2JZTA 2GSRA 4MF7A 4PX1A 1K0DA 3RHCA 3QR6A 22GSA 19GSA 4IVFA 4RI7A 3E3EA 5DQYA 4XRAA 3L0HA 3I43A 3GSSA 2WB9A 1XPVA 2DJ3A 2CVKA 5G30A 3A2XA 5IMDA 5ID2B 3HJMA 1FVJA 18GSA 2O7KA 1Z3EA 4K8MA 5D96A 2YN1A 3PGTA 4WBRD 4FH8A 5A5KA 3WT2A 1AIUA 2EIQA 5EL8A 3VWXA 1YKAA 5ECMB 2FWEA 3A5WA 1ZGNA 1XFLA 3W8SA 1SYXA 3IC4A 3I6AA 6GSXA 2C8UA 3WD6A 3A2VA 1ZCPA 2YZUA 4V2LA 3ZMLA 4FYCA 3I9V2 2YWIA 4OFTA 1OKTA 3BCIA 17GSA 16GSA 5IOXA 4IQAA 4HQSA 2AJQB 3IDVA 2O87A 1GSQA 2C80A 3TB2A 6GSTA 4IS0A 2I3YA 2LQOA 3GSTA 2GSTA 4IP6A 5KN2A 2H6ZA 5J4UA 4QQ7A 3FZ4A 2IMEA 1UA5A 5INYA 3ZFBA 4HU7A 4KUNA 3SBCA 2HRFA 1B9XC 3TJBA 2YJHA 2EIOA 2H6YA 2YWMA 1F6MC 1SENA 1WP0A 1B4PA 3LJRA 2FWHA 4KDYA 1IYHA 5DALA 1TJDA 3EMXA 5IMCA 1V9WA 3EMPA 5ECNB 1HNCA 4GF0A 5DAKB 1SJZA 1U6TA 4ID0A 5A4UA 2C1YA 1AQVA 3EURA 5B7CA 4NWYA 1F2EA 3IBHA 1B4QA 2WS2A 1W4VA 1QUWA 4WR5A 1YZXA 5C04A 5B8BA 5DALB 1BYEA 3DMLA 2VO4A 4ML6A 1GUMA 2XPEA 4ZL9A 1JZWA 1E6BA 1O8XA 3VI7A 2TIRA 3TKPA 3U6VA 2YPMA 5B6MA 3H4KA 4KSMA 4J57E 2LJRA 4HI7A 1XW5A 2VL9A 3OR5A 4IN0A 3JCML 1Z7PA 1YY7A 4KE3A 4MPGA 2GDRA 3L9SA 1V40A 1YF1A 5CNWA 3F4RA 2H1GA 5JCWA 3VI5A 5IO0A 5HR3A 4K2DA 1SK2A 1O85A 1VF1A 4X1UA 1NHOA 1G6WA 5A4VA 4ML1A 5B6NA 2H76A 1B48A 2WRTA 2DMLA 3CRUA 5LCZA 3UEMA 5DJMA 2RM6A 2I4AA 3GIXA 3ME8A 2CA8A 2H72A 1A0RP 3F6FA 4FYUA 2KP2A 2MMOA 2L4CA 3EWLA 2RUFA 3UOMA 4HJ2A 4GSTA 10GSA 1AW9A 1M2AA 5H5QA 1FB6A 2JL4A 5G1LA 4MDCA 1ZL9A 1X5CA 5ECRB 3ZVJD 1TXXA 2MMNA 3UAPA 1ZMAA 1K3LA 3HVSA 5ELGA 2H73A 2GQMA 5CYYA 2M46A 4YH2A 1M0UA 1XOAA 3FKFA 1K0AA 4TRXA 4MP4A 1VF2A 3ZIJA 4WETA 5D9TA 2R37A 1QMVA 2JZRA 1A2JA 1GUHA 5B8AA 2F8AA 1Q98A 4Q5RA 4MJAA 1PL1A 4HOJA 4WBJA 3TKSA 2O85A 2PN8A 3BCKA 2BMXA 3APOA 2VM1A 2VAFA 2B1KA 5D8IA 2DBCA 2K18A 1EGOA 3TKQA 1TRUA 2NBSA 2CX4A 5KN0A 2JSYA 3ZL5A 3HJOA 12GSA 3APSA 5ECKB 1O7UA 2LRNA 1TTZA 3HZ8A 4P3YB 3KZQA 2DMMA 1XW9A 2QC7A 1U88A 13GSA 4TN8A 4J56E 4KW6A 2H19A 4O92A 2CZ3A 4MJBA 4WF4A 1EWXA 2RM5A 1O8WA 5GSSA 1PN9A 5DBQA 3ZIVA 2VLUA 3UBLA 4XTSA 2K8VA 3F4SA 3LYKA 5DJLA 3HDCA 2P5QA 1SJ6A 3ZTLA 2HI7A 4L5OA 1Z6MA 2PWJA 5ELAA 2D2ZA 1S3CA 3Q18A 4BPYA 2DSAA 3TOTA 1A24A 2CX3A 3GNJA 1V58A 3GUSA 3ERGA 1R5PA 1THXA 3CSJA 4GTUA 1MDJA 3F6DA 4OWYA 3QCPA 4RUVA 5EPFA 2FHEA 4Z7XA 3CTGA 3FZAA 1TU7A 4DVCA 1ILOA 2HSHA 4MA9A 3KM6A 4YQMA 3MNGA 1T7PB 3FR6A 3SWLA 3ZFLA 5JCUA 4YAVA 1NM3A 4K0GA 2F9SA 4RI6A 1GTIA 1E2YA 2YWNA 4PXOA 5AISA 1OVNA 2G0FA 4L0UA 4LMWA 3IE3A 4L0WA 4TR0A 2E7PA 1ZZYA 2LSTA 1EEJA 4HZ4A 1UN2A 2HLSA 1XWGA 1WMJA 2DJKA 4ZL8A 4EO3A 3GV1A 1GL8A 3WGDA 4BVXA 4OD7A 1TW9A 4NXIA 1JZRA 2HZEA 3G7IA 1XVQA 4K9ZA 2HYXA 1FHEA 5FT3A 3VWVA 3H93A 4BWSA 1GUKA 1K3YA 4I6XA 3HVVA 1S3DA 2XBIA 4D73A 3D22A 4GSSA 2XBQA 2GSSA 4JEDA 1G7EA 4YQUA 2NTOA 4RQXA 3DD3A 2HZEB 4H86A 1WWJA 3IK7A 1SL2B 3IR4A 2YP6A 2ZUPA 4WKWA 1AQWA 1ERTA 3K8NA 4ZBBA 3KH9A 3IHQA 2WFCA 4TW5A 5DDLA 5HR0A 2F3MA 2OE1A 3EINA 1PA3A 3D4MA 2LUSA 5JWOB 5DCGA 1XWAA 1QXHA 2VOCA 2FLSA 5D9WA 3RPNA 2C3QA 3EU3A 4I97A 4ZBAA 3ISOA 1K0OA 4JU5A 4V2NA 2QGVA 1X5DA 2YCDA 5LNKe 2V2GA 2LNSA 2AHEA 1AXDA 1M2BA 4JR4A 2PMTA 1M7TA 1PX7A 5ECLB 2B1LA 2E0QA 1N8JA 3GL3A 1WRYA 3F0IA 1XW6A 2X99A 3VFIA 3CXGA 4DSSA 2R2JA 1F3BA 2HSYA 4ECBA 4K6XA 1GP1A 1TRSA 4ZB6A 1TKDB 3H8QA 1FOVA 2H6XA 3M3MA 4JE1A 4HZ2A 4DSSB 3GL5A 1MDIA 1GSFA 3LG6A 1SYRA 4PURA 3QMXA 4MK3A 2C0FA 4X43A 2G2QA 3EU4A 5HR2A 1XVWA 2IMIA 1URMA 1B8XA 3H79A 3FHKA 1O6JA 3WYWA 2XPDA 3M9KA 1W89A 4AJ6A 1R7HA 3QAWA 1OC9A 1THOA 2YZHA 1UC7A 2GS3A 3FW2A 1GSUA 2HT9A 1DBYA 1FG4A 2YV9A 3DEXA 4L8EA 3MAKA 4O32A 3UBKA 3ERWA 4E8HA 4MCUA 3KTBA 3GKXA 1KEBA 2IMFA 1MDKA 1OC9B 2FGXA 1Z7RA 5E59A 1Z9HA 2C3NA 2N5BA 2LRCA 4FYBA 1M9AA 6GSWA 1Y25A 3BD2A 2H0IA 1QGVA 4J2FA 3QAGA 2GSQA 5AIVA 3F3RA 2LTKA 2M80A 4LMVA 4ULXA 2JU5A 5IO2A 2GQLA 2H1AA 3UJ1A 2VL3A 4K7NA 4CHSA 4LL4B 3DWVA 2LV3A 3HHVA 2GT6A 1GSDA 1EOGA 5CRWA 4OFNA 2YJ7A 5H5RA 5FWGA 3F4TA 2IWTA 3C73A 3LYPA 2YNXA 2B5EA 1O73A 1Q4JA 2WJUA 5JWRB 5L71A 3APQA 5J41A 4MMMA 3VLNA 2GTUA 3Q74A 3KMOA 2IFQA 2HXKA 4XS4A 3PINA 5JWQB 3GKMA 2N5AA 4TR1A 4G10A 1GRXA 3GH9A 3FZ5A 2ON7A 5ECIB 1RQMA 1WJKA 1UVZA 4XS4B 3A2WA 5EY6A 1QK8A 1PGTA 2NPBA 2B5XA 4TR1B 4V1Ap 4EXJA 3S9FA 4DSRA 2L59A 4XRDA 2CAQA 2B7JA 1F9MA 3IV4A 3A3TA 2PUKC 1BX9A 3TRQA 2HZFA 4Q5FA 1V57A 1VGLA 3RAZA 4HEA2 5HR1A 1HNBA 4RQRA 5IOWA 4EKZA 3QPMA 2IIYA 3VWWA 1GULA 2K9FA 1J08A 3LGCA 3ZREA 4IHUA 2AUVA 3FRCA 3QD9A 3GYKA 1U3IA 3LEFA 3TJKA 3W8JA 3DVWA 4V1Ag 3HA9A 1Z5YE 4OCFA 1VF4A 3IOSA 3P7XA 3FR3A 2LNTA 3ZLPA 4NHZA 1PRXA 1OE8A 4ACSA 3KCMA 4MABA 3F3QA 2DJ0A 1N2AA 3QDNA 3AY8A 4X0XA 1JHBA 4I2TA 1O81A 3MSZA 2VL2C 2OA7A 2OADA 2HE3A 1WE0A 1ZYEA 3KTLA 3L78A 2LEGA 3CSIA 3TJGA 2XHFA 5GZZB 3LXZA 1PKZA 2L6DA 2H75A 1PX6A 5F06A 3HVXA 5G5EA 1V98A 1PD21 2GT5A 3TCOA 5CRDA 3D21A 4WR4A 3VWUA 4IJ3A 1Y6EA 2I1UA 3CYNA 3D5JA 1DSBA 1X9WB 3CBUA 2DJJA 5D93A 4K0NA 3E9JB 2REMA 1PSQA 1B9YC 2DJ2A 1XWCA 5D73A 4BWQA 2B7KA 2GQKA 1Z6NA 2O8VB 4IP1A 2C0EA 2JACA 2TRXA 4Q5NA 6GSSA 4MZWA 2FA8A 4G2EA 2X64A 1M9BA 2HFDA 2GGTA 4OFMA 2ES7A 4F03A 1PMTA 4KX4A 1TK5B 2O89A 3O3TA 2VLTA 2NVLA 3TGZA 2AYTA 2VM2A 4HS1A 1ERVA 2H8LA 2LS5A 4IGJA 4DSQA 4QL9A 1G6YA 3BBYA 3GRXA 5IMFA 2C3TA 3BOAA 2C0DA 2WZ9A 5F05A 3UMAA 3V1WA 3MWHA 2ALBA 3LXTA 4MZBA 3TOUA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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