2M72A

Solution structure of uncharacterized thioredoxin-like protein pg_2175 from porphyromonas gingivalis
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
153
structure length
153
Chain Sequence
NTYAQLPAVSLKNIEGKTVQTNKLENAGKPMIISFFATNCKPCLRELKAIQEVYADWQDETGVRLIAVSIDEGQNAQKVKPLADGNGWEYEVLLDSNGDFKRAMNVSLIPAVFIVDGNGKIVYNHTGYTEGGEAELIKKVRELVKEGHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Unknown function
source organism Porphyromonas gingivalis
publication title Solution structure of uncharacterized thioredoxin-like protein PG_2175 from Porphyromonas gingivalis
rcsb
molecule keywords Uncharacterized thioredoxin-like protein
total genus 37
structure length 153
sequence length 153
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-04-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2m72A00
4EC0A 1FOVA 4CDOA 1XBSA 3GURA 1F3AA 3QR6A 4X0XA 1QMVA 2LJAA 3H1NA 2VLVA 1Z5YE 4GSNA 1U87A 5JCGA 2FWFA 4ECBA 5CYYA 3ERGA 4XS4A 2QKEA 3IAS2 3L4NA 3VWVA 3HD5A 3P8WA 3HZ8A 5ID2B 3HJMA 5D9TA 3CTGA 5IO0A 2C0EA 3L0HA 3QFAC 2IMKA 5DJLA 5HQPA 2B5EA 4DSQA 1Z6MA 2R4VA 3MSZA 5IMCA 3FHKA 3IE3A 4TXOA 1JLWA 3CSIA 2MZCA 2RM5A 3M9JA 2RUFA 5AISA 2RIIA 2XBIA 3ZL5A 2FWEA 1EV9A 2PUKC 5DJMA 3ZIVA 4K0NA 1T7PB 3TRXA 1QXHA 1XPVA 4IKHA 3N5OA 2JZSA 3DD3A 1MDJA 3CXGA 4KDUA 2K6VA 4WKWA 2V41A 6GSWA 3EURA 4JR6A 1GUHA 4YAVA 2X8CA 5IIZA 3H93A 2JADA 2VCWA 5DQSA 2AJQB 2CVKA 1VF1A 1B9XC 2I81A 1NHOA 2H76A 3TJGA 4KCEA 2IJYA 4JE1A 2ES7A 5B6NA 1AXDA 3H8QA 5H5RA 2PWJA 1PX7A 1FB0A 1TJDA 3LYKA 1AC1A 4OO4A 3CRUA 5C00A 4EXJA 12GSA 3KZQA 3TGZA 3EWLA 1B9YC 5E4WA 3GTUA 14GSA 3W8JA 1EWXA 5E59A 5HFIA 2OE0A 5HFKA 5JWOB 3FW2A 1BAYA 5AIVA 3RBTA 2C3NA 2YWOA 2H1AA 3I9V2 1GSYA 3APSA 3RAZA 1OVNA 3FZ5A 4ZBBA 3TJFA 4NHWA 1GL8A 1M0UA 5AIXA 3KMOA 4G9HA 2VD1A 5ECNB 4MZWA 1E2YA 3G9BA 4KDXA 1I5GA 5L71A 3HVSA 16GSA 3MAKA 1MEKA 1LU4A 5J9CA 4RI7A 4I5QA 4RUVA 1RQMA 5B8AA 1U88A 2YP6A 2MMZA 4HU9A 4Q5RA 3KIJA 3KEBA 1XOAA 3ZIJA 3DMLA 3BJ5A 5JCUA 1GNWA 2H72A 4GTUA 1WRYA 4MJAA 4PUAA 2L6CA 3VWWA 3DVXA 1TI1A 4NHZA 3GL3A 2X99A 2GZZA 1S3DA 1GTIA 2YJHA 2VCQA 3CSJA 4V2NA 3UJ1A 2FUG2 4EDYA 4GWRA 4YQMA 5J5NA 1I9DA 3F3RA 1YKAA 4FO5A 1EP8A 3C7MA 1BJXA 1XIYA 3TRQA 3FY7A 3A3TA 2B6MA 2CQ9A 1VF4A 4JBBA 4EF0A 1EGOA 5DAKA 5DALA 2LTKA 5D8IA 1GULA 2YWNA 4F82A 4MA9A 3EINA 1UA5A 1T1VA 3ERFA 3LQ7A 2IMFA 4J57E 4KB3A 5ECMB 1FG4A 2B3SA 2H75A 2VUPA 5INYA 1UVZA 3ZLPA 1U3IA 1VRSD 1H75A 4XIHA 1V9WA 3WYWA 3DYRA 4F03A 5DQYA 5DCHA 1SKSB 1FO5A 5G31A 2CV4A 10GSA 2H01A 1OC9A 4XRDA 3HYPA 4ZL7A 4D73A 3IC4A 3O3TA 1O8WA 2KHPA 1BX9A 3VWUA 1KNGA 1AW9A 1Q98A 3IK7A 4ECJA 1V98A 5DDLA 2ON5A 5LCZA 2EC4A 1B4QA 4I97A 4MPGA 3GYKA 2B7JA 4EKZA 3HJPA 1GUMA 2WGRA 4HEA2 3ZMLA 4GXZA 2C80A 4CW9A 2O8VB 1A2MA 3VI7A 4J56E 2KP1A 1TI3A 3I69A 2HRNA 3HDCA 4G19A 1G7OA 2H19A 1G7EA 1A8LA 1K0MA 1V2AA 4ZB9A 2GSTA 1A2JA 2JSYA 3BBYA 4FIWA 2JSZA 5GAPD 3UEMA 1T4ZA 1PKWA 3C71A 4PQIA 3F4TA 1T4YA 1OKTA 4KAEA 4OO5A 1SL2B 4I2TA 1XWGA 2B5YA 1FW1A 3BCKA 3DGQA 5KN2A 5F06A 3M1GA 4H86A 5ECRB 5G5EA 2IL3A 5ECQB 2GQKA 2HZFA 4ZB8A 5IOWA 1K3LA 2VL2A 3GL5A 2YANA 1ERWA 4Q5NA 4YQVA 1Z3EA 1FVJA 2FWHA 3I43A 4V1Ap 2IN3A 4MDCA 1THXA 1TU7A 3WT1A 3GSTA 2L6DA 4TXOB 3KP9A 1ZOFA 1AUCA 3FR6A 4HJ2A 4MZBA 2P5QA 5F07A 1T3BA 3RPPA 2YWMA 2LSTA 2FLSA 4ZL8A 4N30A 3IR4A 1EGRA 2O89A 2C1YA 2R37A 5D96A 3VLNA 1S3AA 3TDGA 3KCMA 3Q18A 4WBJA 4MK3A 4N0VA 3GNJA 3MWHA 3QDNA 5IO2A 2DIYA 2LV3A 2VCXA 2L57A 5ELGA 5IMAA 3LORA 5ECHB 1PX6A 3D21A 5CNWA 4BWQA 5DBQA 2IMDA 1MD4A 2G0FA 3JCML 1SL0B 2XC2A 3A5WA 2DLXA 4AJ7A 4ZILA 4MP4A 1GTAA 3G7IA 2CX3A 1XW9A 3VK9A 1QFNA 4GSTA 2H6YA 2K9FA 4ZL9A 4WR4A 3H79A 2CT6A 4IGJA 3J7Yb 3W6GA 3VPTA 5CRWA 2F3MA 4ZB6A 1M2DA 2OBIA 4TXVA 3P2AA 1EOGA 1A23A 4L5LA 1SJ6A 3G7JA 3ISOA 3O6TA 1HQOA 3LXTA 3EMPA 1WPIA 4OFTA 5G2ZA 1TRUA 4KE3A 2WDUA 4PQ1A 1HYUA 5EVOA 3D6IA 1ML6A 4EE0A 4KUNA 1YF1A 2J23A 1GSSA 1URMA 2HLSA 4MZCA 1K3YA 3WD6A 4YQUA 2VL3A 2H6ZA 2IIYA 3OR5A 5DCGA 5CREA 2LUSA 1E6BA 3KD0A 2IMIA 3LEFA 4E8HA 2OE1A 3PINA 1DE1A 5F05A 2CX4A 1AQWA 2NTOA 3BOAA 3GH9A 1O7UA 1R7HA 3KH9A 1SK0A 5A4VA 2HXKA 1YEPA 2TRCP 2GSSA 4IJIA 2E7PA 5KN0A 1YEXA 4ECCA 3VWXA 3RDWA 3IK9A 1XCCA 1ON4A 2F9SA 3PH9A 2HSHA 1JZRA 4OWYA 3HY2A 3LFLA 1F6MC 1PMTA 2BJXA 2AUVA 2ALBA 2R2JA 1F37A 1SU9A 2GSQA 1GH2A 1NM3A 2FY6A 4IW9A 4GCIA 4K7OA 5IM9A 3WGEA 2H6XA 1K0CA 2BMXA 4WXTA 3ZFLA 2IMEA 4G10A 2C0DA 2O87A 2PPTA 3F4SA 2YWIA 1OC3A 5FHIA 3NZNA 4TRXA 1GSUA 4DSSB 3HA9A 5AN1A 5DVBA 2CAQA 2EIQA 4IQAA 6GSVA 5J4UA 4POBA 4E8EA 5A4UA 5GZZB 5DAKB 5DALB 4MF5A 4L5OA 3GKMA 3IBHA 3IHQA 4TW5A 11GSA 2RLIA 2A4VA 1ZYQB 4K8MA 1ST9A 4TVEA 4KW6A 1NW2A 2X8HA 1U6TA 5IMFA 4V1Ag 1J08A 4NV2A 1X5EA 2VL2C 3ME8A 1GSFA 2OJLA 2FCHA 5D9XA 2H70A 2H0IA 3L9UA 3E0UA 1B8XA 4OFNA 2I9HA 2GQMA 2DIZA 2XPDA 3IRAA 5GSSA 1OC9B 2IFQA 4ILFA 4ZBAA 1DUGA 4D73B 3E9JB 3M3MA 5F8BA 1ZCPA 2GT5A 1YKCA 1SKWB 3CBUA 3ME7A 1DSBA 3EE2A 3EVIA 1GTBA 1NSWA 2HFDA 1GSDA 1GLPA 3GH6A 5HR0A 1NHYA 3TOTA 1ZGNA 1ILOA 2MMOA 4X1UA 1LJRA 1YF0A 4WF4A 3IXRA 3KH7A 3NOFA 4NWYA 4RQXA 1XWAA 2I4AA 2HE3A 3US3A 1K0BA 1SYXA 1OE7A 4MJEA 1Q4JA 2FD3A 3TJBA 2CZ2A 5LNKe 4EDZA 4NMUA 2O7KA 1OAZA 2FHEA 1O81A 2GSRA 1JFUA 1HNCA 2ZCTA 1T8EB 2VCZA 2HRFA 1SYRA 2RM6A 2C0FA 2GDRA 4CHSA 2DC5A 5IPGA 5GAND 3F8UA 4PNGA 3CRTA 1R4WA 5D73A 1XW6A 2DJ2A 6GSUA 1TK0B 4MH2A 4OMVA 4HZ4A 1G0TA 3EMXA 3HCZA 1TK8B 3Q19A 1TK5B 1R26A 3ZRDA 2ON7A 9GSSA 1M99A 2LQOA 1H4OA 1QQ2A 4K2DA 2H74A 4DSSA 3ZVJD 2M72A 1K0AA 4RI6A 1X0RA 1M9AA 3F4RA 4OFMA 1KTEA 1OKDA 1T00A 1ABAA 2DBCA 2CA8A 1X5DA 4AJ8A 2AB6A 4BA7A 2LRNA 4BVYA 3TOUA 1TP9A 6GSYA 3W8SA 3HJOA 4N0ZA 2DJ1A 4XHMA 4FYBA 1BG5A 2LJRA 5ECLB 3ED3A 1GWCA 4HU7A 5COHA 2DMMA 4IS0A 1JZDA 2PERA 3HVVA 4GSSA 1F2EA 2BTOT 3P90A 1MDKA 4OCEA 1WP0A 5JWRB 4KH7A 1UN2A 5B7CA 3A2XA 2XBQA 2K8SA 1YQ1A 1WOUA 1VF3A 2VCVA 4MF7A 4YAPA 3ZYWA 1O8XA 1JHBA 4FYUA 1YZXA 4FYCA 4KA0A 1SD9A 2V32A 2OBKA 4MH3A 4PNFA 1TW9A 3PGTA 3FR3A 3CYNA 1A24A 22GSA 5EPFA 3R2QA 13GSA 4MABA 2H0GA 2OE3A 2MMAA 2VL9A 4KNDA 4WETA 1WWJA 3ZITA 2VCTA 3D0ZA 4AGSA 3DWVA 2QSIA 3HVXA 2FA4A 4L0UA 5KEJA 2C0GA 1CQHA 5J9BA 3F63A 3QMXA 1IYHA 3HKRA 3QFBC 3D5JA 3QAWA 4ML6A 5ECSA 5CO3A 4AJ6A 5G5FA 1TOFA 2KOKA 4MLYA 2OKAA 3LG6A 3GMFA 3AY8A 5B6MA 3C1RA 3TKSA 3APQA 2MYGA 3HZ4A 4OD7A 3ZMKA 1V57A 2DJKA 5F0GA 3WT2A 4IBPA 1SENA 2D2ZA 2LNSA 4DSRA 4BL7A 2QGVA 3F3QA 3VPQA 2IPAA 1XWCA 1Z6NA 1EOHA 1ACVA 4TR1A 5IOXA 3M8NA 2TIRA 1S3CA 2WRTA 4MJBA 1EEMA 1PA3A 3FZ9A 3KM6A 4G2EA 2ZNMA 4L0WA 1FVKA 5CRHA 1V40A 1FHEA 3D22A 2H71A 2P5RA 3L9VA 20GSA 4HZ2A 4AF2A 3GSSA 3FRCA 3UAPA 4XS1A 2CZ3A 1XZOA 4HOJA 1SL1B 4ZIJA 5JWQB 2VLTA 4POMA 3ZFBA 2I1UA 1Y6EA 5IMVA 2H1BA 4O5RA 5CRDA 3KJYA 1SK1A 2V2GA 4Q5QA 1F3BA 2WS2A 19GSA 2E2MA 4PQHA 5J3RA 3LXZA 3UMAA 3QPMA 2VIMA 1A2LA 1EV4A 4NV5A 2FNOA 4LA1A 1XOBA 3GV1A 3FK8A 2H66A 3EU4A 4ID0A 1OE8A 2OACA 4L8EA 4Q5FA 4POKA 1JZOA 2L59A 5IPHA 2H0HA 1YY7A 1BYEA 2C4JA 3CSHA 4F0CA 3DXBA 2CVBA 1ZZYA 2IFQB 3H4KA 1ZMAA 2GT6A 4HI7A 1XWBA 1M2AA 2GLRA 4P3YB 4XRAA 1V58A 3G7YA 2C3QA 4WF5A 1TXXA 4DEJA 1W4VA 3ZREA 1WE0A 5ABRA 5ECPB 5EL8A 2FA8A 2PMTA 5H5SA 4LMVA 2JZTA 2XHFA 2CVDA 4JU5A 6GSSA 2F51A 2R6KA 3Q74A 2DSAA 2DJJA 5HR2A 2GQLA 2HI7A 2JL4A 1JZWA 3TKSE 3GX0A 4LMWA 1PL1A 1K0OA 2OADA 4PGTA 3FR9A 2PU9C 3QCPA 4NPBA 3V1WA 1A0RP 1GSEA 2DJ3A 1OYJA 1YJ6A 3PR8A 1Z7RA 1GP1A 2HZEA 4OCFA 1PQNA 3WGXA 2DJ0A 2L4CA 1GTUA 3F6DA 2DMLA 4O7HA 3EU3A 5ELAA 2LRTA 3E3EA 4F0BA 1OC8A 3HHVA 5HR1A 4N10A 1A0FA 4JZQA 2R3XA 1X5CA 2WB9A 4FH8A 1A8YA 1QK8A 2RUEA 3MNGA 4K1FA 5ENUA 4DVCA 2A2SA 3KXOA 3BD2A 2NDOA 2MMNA 1ZYEA 4JRRA 5KN1A 4LLRA 1ERUA 3APOA 1AIUA 1R5AA 3GIXA 4RQRA 2REMA 2YV7A 4KGIA 2MBSA 2V1MA 2GVPA 2CAIA 1HNAA 3F0IA 1DE2A 4Z7XA 1PKZA 5HFGA 4K6XA 1XVWA 1G6WA 3FEUA 1SJZA 1C72A 2LEGA 4POLA 1LBKA 3UIWA 3QD9A 4YH2A 4HS1A 3TKSC 1TU8A 4ZXGA 1RW1A 4QL9A 2VO4A 2GS3A 1GLQA 2WCIA 2R5GA 2HNLA 2IWTA 2LS5A 3UVHA 1MTCA 1SD8A 5J41A 2AAWA 3KMNA 3GKXA 3GHAA 3VFIA 2AYTA 2B1KA 2YOIA 3IDVA 4IJ3A 2J9HA 2C8UA 1CQGA 4GQFA 4GQCA 2M46A 18GSA 2I3YA 2GGTA 1EEJA 2N5AA 2VLUA 3J7Yk 3VURA 1XVQA 2YNXA 3DVWA 2LNTA 3KTLA 3LYPA 3VI5A 1O6JA 1N8JA 4O92A 2JU5A 2C3TA 1ERTA 5ECOB 4JR4A 2EIRA 2LJKA 2GTUA 4HUAA 1FB6A 3WGDA 3GFKA 3GX8A 2LRCA 5H5QA 1GNEA 4GLTA 2FGXA 3TKQA 5ID2A 4BPYA 1RK4A 3CTFA 3LJRA 5G1LA 2ZUPA 2O85A 1N2AA 2JZRA 6GSXA 3UVTA 4KSOA 2YCDA 4N11A 3M0FA 2KUCA 1BQ7A 1SK2A 5HR3A 1YDKA 1BEDA 5AGYA 4WBRD 2JACA 3DEXA 1DBYA 3C73A 2P31A 3C8EA 2V6KA 1JLVA 4NXIA 5G1KA 3F6FA 3KTBA 4EL1A 3S9FA 2OA7A 4ZBDA 3LGCA 5EY6A 2KP2A 4MPFA 1B48A 3TKRA 3TKPA 1TRSA 3IV4A 4IHUA 4BVXA 1J9BA 4TR1B 3DIEA 1WIKA 5A5KA 4KCAA 3EYTA 4K9ZA 4HQSA 2E2GA 1HNBA 2B5XA 2K18A 3A2VA 3UARA 4HDEA 2H73A 5D93A 4EVMA 3KP8A 3N9JA 2GZPA 2K8VA 2VM1A 5ECIB 3U5RE 1TRVA 1THOA 2WJUA 1GUKA 2FWGA 2NBSA 2P0GA 3LSZA 5B8BA 3A2WA 4V2LA 1XFLA 1TTZA 2LKUA 2B7KA 1PRXA 2PN8A 5JCWA 3P7XA 1EP7A 1KBNA 3DRNA 4KDYA 3FZAA 3DKSA 3CMIA 1K0NA 3L9SA 5G30A 3M9KA 4EUYA 4MF6A 3RHCA 2A2RA 1K0DA 1W89A 4K0GA 4EO3A 2F8FA 4TR3A 5D9VA 4QL7A 1Z9HA 4PURA 2B1LA 5IMZA 6GSTA 5CP1A 3QAVA 4WEYA 4LL4B 2XPEA 3UOMA 1X9WB 4IELA 2YZUA 2X64A 1K3OA 4GRFA 1R5PA 1QUWA 2NPBA 2YJ7A 3GKKA 1FAAA 1PD21 2PBJA 1WJKA 2WZ9A 3GKNA 1AQXA 1XXUA 1MD3A 4IP6A 3IPZA 2VAFA 4ULXA 1TDIA 4XTSA 3RHBA 1GSQA 2H30A 4TOPA 3K8NA 5ECKB 3IA1A 4QQ7A 1ZL9A 3RPNA 5CRGA 2HT9A 3UBKA 8GSSA 1AAZA 5IMDA 4F9ZA 3O76A 17GSA 2YN1A 3KGKA 3TRPA 3C1SA 4I6XA 2H8LA 2WFCA 2H1GA 5C04A 4V2MA 2LQQA 4MJCA 3ZTLA 4X43A 1QGVA 1M2BA 4HQZA 4TR4A 2E0QA 5FT3A 1M7TA 2PVQA 4HJMA 3SBCA 1MDIA 1HD2A 4TR0A 3EC3A 4XS4B 1SJIA 1TKDB 3GA4A 2GZYA 2Z9SA 2HZEB 4K7IA 4PX1A 4TN8A 4MCUA 3LWAA 1O85A 1B4PA 1F9MA 1SKRB 2M80A 2AHEA 4IN0A 4MMMA 3QAGA 1Y25A 2YZHA 2YPMA 3UBLA 3BCIA 2KLXA 1VGLA 3GRXA 1PL2A 3GUSA 2G2QA 2WULA 1PSQA 1ERVA 4O32A 2H1DA 4ECIA 1EZKA 1PGTA 2L5LA 2TRXA 1KEBA 3NIVA 2QC7A 3ZVJA 4LL1B 1U3AA 3TCOA 1O73A 4J2FA 4XCSA 2L4QA 3TJKA 4IP1A 1UC7A 4I8BA 4GF0A 2YV9A 3TJJA 1TRWA 1XWKA 1IYIA 2HSYA 3IOSA 4BWSA 4IQ1A 3GN3A 1GRXA 1XW5A 4KSMA 4K7NA 1AQVA 2MBTA 4XS6A 1G6YA 5FWGA 3TB2A 5CAXA 5KN3A 1J0FA 4ACSA 1X9MB 1USBA 3SWLA 3L78A 3QOUA 2F8AA 3F9UA 5LD0A 1M9BA 1Z7PA 3IAM2 3MDKA 4NAXA 3FKFA 3FZ4A 2N5BA 2PVOC 3UL3A 5IQYA 2EIOA 1WMJA 4I2UA 4PUFC 4ML1A 4JEDA 5A4WA 1VF2A 4IVFA 2V6OA 4F2IA 3D4TA 3I6AA 2VD0A 4TKYA 2L5OA 2VOCA 3FYGA 3D4MA 5GSTA 3HXSA 2VM2A 2N5FA 3GTUB 4ISDA 2X8GA 4KX4A 2AV4A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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