3D22A

Crystal structure of a poplar thioredoxin h mutant, pttrxh4c61s
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
138
structure length
129
Chain Sequence
GLCLAEPHIELAGGNVHLITTKERWDQKLSEASRDGKIVLANFSARWCGPSRQIAPYYIELSENYPSLMFLVIDVDELSDFSASWEIKATPTFFFLRDGQQVDKLVGANKPELHKKITAILDSLPPSDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title An Atypical Catalytic Mechanism Involving Three Cysteines of Thioredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Populus trichocarpa x populus deltoides
molecule keywords Thioredoxin H-type
total genus 43
structure length 129
sequence length 138
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3d22A00
6GSYA 3J7Yb 2O8VB 1PSQA 3GFKA 3N9JA 3L9SA 2H66A 2RIIA 2VD1A 1F2EA 2R5GA 2F8AA 4EDZA 2HZEB 3IA1A 5IO0A 3U5RE 1CQGA 4XS4B 5CRHA 3LXZA 3UVTA 4K7OA 5C00A 4MA9A 2EIQA 1ILOA 4CHSA 2F8FA 5IQYA 4PQHA 5J9BA 3ME7A 13GSA 4KSMA 2LNSA 2PWJA 2DLXA 1GSYA 2VCTA 3FW2A 1MDJA 1XOAA 3TGZA 1GL8A 2H6ZA 1WPIA 4EXJA 3I43A 2MMAA 4KSOA 1M9BA 1MD3A 4IP6A 2VL3A 2CVBA 1F9MA 4GSSA 5HFGA 3A2VA 3PR8A 1A0RP 5DCGA 2PMTA 1FOVA 4K0GA 1V98A 2IFQB 2NVLA 4K6XA 3QAVA 5H5SA 3F3RA 3VWXA 2PGTA 3ERWA 3O6TA 2DIYA 1A2MA 5HR2A 5D9XA 2I1UA 2WCIA 1DUGA 2E2MA 1X5EA 1FO5A 1XW6A 1GTIA 1OE7A 2D2ZA 2C8UA 3PINA 4OFNA 1IYIA 3GIXA 3C73A 4K8MA 1YKAA 1FW1A 2X8CA 3D5JA 2PPTA 3E9JB 1ZZYA 3V1WA 9GSSA 1XZOA 3Q6OA 4LMVA 4K9ZA 2FWEA 1PX6A 1XOBA 3GNJA 3GSSA 2L4CA 4ZL7A 3IAM2 2FD3A 2LQOA 1AXDA 2CZ2A 4I97A 2O89A 5D9VA 3KEBA 5C04A 1AIUA 1O81A 4XS1A 1M7TA 1H4OA 2C3TA 3BBYA 2JZSA 3C71A 3DVXA 3FR9A 2NTOA 1M2DA 4ML1A 5FT3A 4MH3A 4XRAA 5DAKA 2K8SA 1G6WA 1PD21 3BCIA 3QFAC 2LNTA 2LRTA 5CO3A 1KNGA 2YWOA 1WOUA 3CBUA 2K8VA 4GQCA 3F6FA 3BCKA 2GZYA 2AHEA 3QAGA 3APQA 1TI3A 2GVPA 4GCIA 5ECNB 1EV4A 3NIVA 2FY6A 3ERGA 1DE2A 4BWSA 3H8QA 2X8GA 2VOCA 4IN0A 3QOUA 3CSIA 2GSRA 1M9AA 1ERVA 1VF4A 4HU9A 3Q74A 4G10A 3UIWA 1WE0A 1A0FA 1GNEA 5F05A 2WFCA 3HYPA 5J4UA 4L0UA 2GQKA 2GS3A 5IPGA 2X64A 3RAZA 1QUWA 1G7EA 1OC9B 5A4UA 1AW9A 3JCML 4EO3A 4FYUA 3A5WA 2DJJA 6GSTA 4RI6A 4JR4A 1FAAA 3G7IA 1URMA 1T00A 1GNWA 3DXBA 5CRWA 4FYBA 4TR0A 3H1NA 3UJ1A 3CXGA 2R2JA 2YPMA 1PRXA 5IOWA 3APSA 3C1RA 3GURA 3VI5A 1PQNA 2RM6A 3TRPA 5IIZA 2L6DA 1ML6A 3M3MA 2CT6A 5E59A 4KGIA 5A4WA 4D73B 2YV7A 4QQ7A 2IMIA 2VCQA 1A23A 4Q5FA 2O7KA 2P5QA 4BA7A 3WT2A 3VPTA 1OC3A 5JCWA 3OR5A 8GSSA 2WDUA 3IAS2 3HCZA 1HYUA 2GQLA 3KP9A 1EZKA 2VCWA 1TKDB 14GSA 1W4VA 1Z6NA 2CVDA 3TDGA 4JE1A 5IMCA 2CV4A 2YP6A 3F63A 4ZL9A 5AN1A 2VD0A 3TJKA 1GTAA 2LUSA 2MMOA 2PERA 1AQVA 3MNGA 2FGXA 3GKMA 3ZTLA 4POLA 3DRNA 1SU9A 4ILFA 3A2XA 20GSA 2C0GA 2G2QA 4HI7A 5F8BA 3VWVA 1FB0A 4K1FA 2K6VA 2IN3A 1Z7RA 4GQFA 4NV5A 2VLTA 3P7XA 2M80A 3L9UA 2JACA 4OCFA 1SENA 5G30A 2K9FA 3GUSA 5F0GA 5DCHA 1XW5A 4HS1A 2PVOC 4DEJA 5D96A 2OE1A 4AJ6A 5DVBA 3GTUB 6GSWA 1OKTA 5B8AA 1A8LA 2JSZA 1XCCA 1ZL9A 2VO4A 10GSA 1O6JA 2FHEA 4JU5A 1YEPA 5AIXA 3LFLA 3G9BA 6GSVA 2VL2C 1OVNA 2WS2A 2A2RA 4N10A 4KDUA 3I6AA 1EV9A 1USBA 1TTZA 3TRQA 2DJ0A 1Y6EA 4TR3A 2YJHA 3LQ7A 4RQXA 2HI7A 5DALB 3KH7A 1PKWA 4BVYA 4PUAA 3ZMLA 4WF5A 1U6TA 2NDOA 4MZCA 1GSUA 1I5GA 5DJMA 3HVXA 4KDXA 1XWGA 3FKFA 5LCZA 1B4QA 5ELGA 2HFDA 2H71A 1GUMA 3M9JA 2WB9A 4IBPA 2L57A 1C72A 5EY6A 2LTKA 1ZMAA 2V2GA 4N30A 4TXOB 4V2LA 4OCEA 1K0AA 4HQZA 1HNAA 1Z3EA 4DSSB 4WXTA 5CNWA 2CVKA 1Z6MA 2OACA 3QMXA 2B1KA 3O3TA 3LYPA 2XPEA 2O85A 4XHMA 2VLUA 1J9BA 2GSTA 2LJAA 3M1GA 4MZWA 5IO2A 2TIRA 3ERFA 5ID2B 2DJ3A 2KOKA 5G5EA 2LS5A 3CRTA 3HDCA 2C3NA 1QGVA 1Y25A 3P90A 3GHAA 1SYRA 2L5LA 2WZ9A 3G7JA 2YWNA 3VLNA 2YANA 4PQIA 1WP0A 3BOAA 2VL2A 3DKSA 5DBQA 5ECKB 1BEDA 2PN8A 3GX0A 4NAXA 3APOA 3FR6A 3S9FA 3KMOA 4RQRA 2GZPA 3ZFLA 1GSSA 1WIKA 1O8WA 3CRUA 3CYNA 3NOFA 4MMMA 3TJGA 1TK8B 2JSYA 4IS0A 3IDVA 1BAYA 2V41A 1GWCA 1QQ2A 4XCSA 1VF3A 2HSYA 1TK5B 1R5AA 2RUEA 4WF4A 4ZBBA 3H93A 3MSZA 1WMJA 1YQ1A 1XWBA 5FWGA 1U88A 4ID0A 3IV4A 3KXOA 1UN2A 2LSTA 3IK9A 2HXKA 4K7IA 1TU7A 3RPNA 2A4VA 4H86A 2GLRA 2HRNA 3DWVA 1XIYA 1GRXA 1VRSD 4L5LA 4ZB8A 5H5RA 4PGTA 5KN2A 3M9KA 3EVIA 2R4VA 3KTBA 5D9TA 2H76A 1GSEA 1M2AA 5J41A 4TW5A 1SYXA 2J9HA 3RHCA 2GSQA 1EGRA 3FR3A 1K0CA 4HDEA 1ABAA 3PGTA 1NM3A 3UEMA 5J9CA 1XBSA 2XHFA 3A2WA 3HVSA 4MF7A 3TJJA 4O7HA 3FEUA 1W89A 3HXSA 1V57A 3HY2A 5HFKA 3P8WA 1BJXA 3HZ8A 3TUEA 6GSUA 3F8UA 3ME8A 6GSSA 1O85A 4WR4A 4EVMA 5GAND 1KEBA 4XTSA 4WKWA 3L9VA 5CYYA 1BQ7A 2LV3A 3GKXA 4MK3A 4F82A 3GSTA 2DC5A 3VWWA 3FZ9A 2H72A 3EU4A 3LSZA 5AGYA 3TOTA 2DJ2A 4KCEA 2YOIA 4F0CA 4QL9A 2B5EA 2KLXA 2PUKC 2HZEA 5D93A 1O73A 4XS4A 5IMVA 2B6MA 2R3XA 1JZWA 4QL7A 2QGVA 2QKEA 2AB6A 2C80A 2VCXA 5FHIA 1K0NA 2ES7A 2X99A 3SWLA 2MMNA 2E0QA 4TN8A 2CAIA 3FYGA 2G0FA 1GP1A 2LQQA 2ZUPA 1R26A 2MZCA 2H1AA 3M0FA 1PA3A 1GUHA 4ZBDA 4JR6A 2LKUA 2H75A 2C0FA 1GSDA 4TR1B 3D4MA 4IKHA 3EINA 1TJDA 3GMFA 3L0HA 1SD9A 3UBLA 1NW2A 1XVQA 3Q19A 2LRCA 5DDLA 4XIHA 1TU8A 4LL1B 3FZ4A 2C0EA 4DSQA 2IFQA 4N0ZA 4NHZA 5B6MA 4MJBA 1WWJA 3EMPA 3W6GA 1A24A 1R7HA 1O7UA 2WGRA 2C3QA 1A2JA 2IWTA 3F4TA 2JZRA 1XWAA 4JRRA 4EKZA 2C4JA 3EMXA 5JWQB 1F3BA 4ZXGA 1S3CA 1PL2A 1ST9A 3GN3A 1B8XA 3GRXA 1NHYA 5ECQB 1TDIA 2WJUA 3E3EA 5G31A 1E2YA 4O5RA 1F6MC 3WGDA 2JADA 2C0DA 2AV4A 4OWYA 2NBSA 1YEXA 3TOUA 3ZZXA 1GTUA 1SJIA 2L6CA 4BWQA 18GSA 3EYTA 3WD6A 5ECPB 1X9MB 3HHVA 1EOGA 1AQWA 3FK8A 3IE3A 2IMFA 2JL4A 4MF5A 1YKCA 2L4QA 2JZTA 1T7PB 2KP1A 3U6VA 1QK8A 3QDNA 2HT9A 4JEDA 5J3RA 2B7KA 3KD0A 3L4NA 3HKRA 3ZVJD 3C1SA 2N5FA 1X0RA 3LYKA 4V2NA 3KJYA 3HJOA 1U87A 3LG6A 4PURA 4TVEA 2OJLA 1A2LA 4POMA 3KM6A 4KCAA 5DJLA 5HQPA 1O8XA 2IPAA 1XFLA 2EC4A 4IQ1A 5CP1A 3GYKA 2KHPA 2FWGA 4HJ2A 5KN3A 1OC9A 4WEYA 1VGLA 2GT6A 2OADA 2HNLA 1EWXA 4L0WA 3TKQA 3DGQA 4F9ZA 2JU5A 4CW9A 4ZILA 2MBTA 1F3AA 1M0UA 5D8IA 5IMFA 3ZIJA 3EC3A 1K0DA 2GZZA 3EURA 1SL1B 1X5CA 1EGOA 2F51A 5CRGA 5GSSA 2RUFA 2ALBA 2MMZA 1SD8A 1KTEA 4GF0A 4Q5RA 2IIYA 3ZYWA 4J56E 1K0OA 3GKKA 4GLTA 1ERUA 3D22A 5ABRA 2YWIA 2KP2A 2GQMA 4DSRA 3F9UA 1PN9A 2B1LA 2M46A 1V9WA 2X8HA 4I2TA 2N5BA 4ECJA 1TRVA 2DSAA 2IL3A 2C1YA 1NSWA 3HZ4A 5J5NA 4E8EA 3TCOA 3DVWA 2LJRA 1K3OA 3IC4A 5H5QA 2P31A 3VK9A 1BX9A 2ON5A 1MD4A 4OD7A 2V6OA 2M72A 2N5AA 1XXUA 1ERTA 2KUCA 3O76A 3WYWA 4X1UA 3W8SA 1ZYEA 2OBKA 1TI1A 2H6YA 3D0ZA 3CTFA 3VFIA 2CAQA 1B9XC 4YQUA 3CTGA 3QR6A 3LJRA 3LXTA 2XPDA 1PL1A 2GT5A 5LNKe 4ACSA 2VUPA 4BPYA 1ACVA 3ZIVA 2OA7A 2P0GA 2AAWA 5CREA 1WRYA 5IMAA 3GH9A 4HQSA 4GXZA 1J08A 4L8EA 3PH9A 4FH8A 1TW9A 3ZREA 3BD2A 2AYTA 3HD5A 3DIEA 3D21A 1HD2A 3IBHA 1ZCPA 3QAWA 1LBKA 5JCUA 5G2ZA 1CQHA 2DMMA 1JZRA 4POKA 1MDKA 4MP4A 5G1KA 3IK7A 4IHUA 1JHBA 3GV1A 4GTUA 4G2EA 4WR5A 4K0NA 2EIRA 3GTUA 2IJYA 4WBRD 1S3AA 1ZYQB 4AJ8A 1THOA 2B7JA 2I81A 3LORA 2DIZA 1B9YC 1LJRA 4HEA2 2ZCTA 4TOPA 4MJAA 4CDOA 5CAXA 1GULA 3D6IA 3HJMA 3LWAA 3TKRA 4Q5NA 2AUVA 1GTBA 5D73A 2DBCA 3ZFBA 4TKYA 3WGXA 4KX4A 5EVOA 4RUVA 1RK4A 5AISA 2FA8A 1PMTA 2CX4A 2YNXA 4MDCA 3ISOA 5DALA 5HFIA 2GTUA 1K3LA 19GSA 3I9V2 1Q98A 3WGEA 1X5DA 3RHBA 2I9HA 4G19A 3TRXA 4J2FA 3LGCA 4LL4B 1K3YA 3DYRA 4GRFA 1GLPA 1V2AA 5KEJA 2IMKA 4FO5A 1OAZA 1GLQA 3IRAA 5EL8A 4TXOA 1WJKA 3W8JA 1K0MA 2VCZA 2REMA 4PXOA 5D9WA 4TRXA 4DSSA 1RW1A 3MDKA 3ZRDA 1G0TA 4I6XA 3RPPA 2MYGA 4ZIJA 3WT1A 2PVQA 4HZ4A 2K18A 2H1BA 2F9SA 1R5PA 2OE3A 1AUCA 1EEJA 2R37A 3R2QA 5ID2A 2FWHA 5ECSA 1FB6A 5DAKB 1HQOA 4DVCA 1SJ6A 2FCHA 2TRCP 4PX1A 3UMAA 5B7CA 4KE3A 4GSTA 3H4KA 1ZOFA 4AF2A 1V40A 2IMEA 4MJEA 1N2AA 2XBIA 5ECIB 1OKDA 3GL3A 4ECCA 5IMDA 3DMLA 5HR0A 2L59A 3IPZA 3IXRA 1UA5A 5G5FA 2CA8A 1UVZA 1T1VA 4F03A 3TJBA 4GSNA 4IGJA 3KIJA 5JWRB 2NPBA 4HUAA 3UOMA 2HE3A 5HR3A 2PBJA 5ECMB 4EL1A 3A3TA 3KTLA 1TXXA 11GSA 1Q4JA 3IOSA 5KN1A 5F06A 4YQMA 2QC7A 2BTOT 3VI7A 1THXA 4O32A 1TRWA 3KZQA 3P2AA 1G7OA 2CX3A 2DJKA 4I5QA 4NHWA 2YWMA 2VIMA 4GWRA 4IJ3A 4G9HA 1ZGNA 5A5KA 5IM9A 3N5OA 1XW9A 4HU7A 1U3IA 4OFTA 3CSJA 1G6YA 2Z9SA 3UVHA 3VWUA 4Z7XA 3FY7A 1X9WB 2HSHA 5B8BA 1E6BA 2I4AA 1IYHA 3TB2A 5ECOB 5HR1A 4V1Ag 3IR4A 1M2BA 1XVWA 4I8BA 3TJFA 3L78A 2YCDA 3TKSE 4L5OA 1M99A 1FHEA 1HNBA 4OMVA 2H70A 3EU3A 2FA4A 2B5XA 1SL2B 2BJXA 3F4RA 3F3QA 1EOHA 22GSA 2H0HA 2LRNA 6GSXA 1EP8A 5B6NA 4KH7A 1GUKA 4TXVA 2FWFA 4NXIA 3E0UA 3M8NA 1OYJA 1JLWA 2ZNMA 1MEKA 4JZQA 5ECHB 2EIOA 3FZAA 3RDWA 5IPHA 4PQ1A 3F0IA 4MCUA 1AAZA 2YV9A 4EE0A 1B48A 3MWHA 4HZ2A 1YF0A 3NZNA 2VAFA 3F4SA 3HVVA 4V1Ap 1V58A 1YF1A 1X9SB 1YJ6A 3FZ5A 2YJ7A 2XBQA 1TP9A 4JBBA 3CMIA 4MPFA 3KMNA 1F37A 4LMWA 4K2DA 2H0IA 5KN0A 2J23A 4FYCA 4KUNA 3KGKA 2V6KA 2QSIA 2FUG2 4TR1A 2YZHA 2E2GA 4KA0A 4PUFC 3UL3A 2BMXA 1TRSA 4MZBA 3MAKA 4NV2A 1SKRB 5EPFA 1T8EB 1EP7A 4F0BA 3GX8A 2VCVA 2OBIA 5CRDA 5COHA 4YAPA 1YDKA 3G7YA 4TR4A 2TRXA 5DQSA 3AY8A 1QMVA 1VF1A 2E7PA 2ON7A 4YQVA 4MLYA 2OKAA 2OE0A 1PX7A 2CQ9A 2VM2A 2XC2A 4IELA 4E8HA 1JLVA 4YAVA 1PKZA 1R4WA 3KCMA 3VURA 4ZB6A 1B4PA 1SKSB 3Q18A 1VF2A 3QD9A 4ECBA 1TOFA 4WETA 2H8LA 2V1MA 2H1GA 2VLVA 5AIVA 3C7MA 17GSA 4ML6A 3US3A 4YH2A 2WRTA 3HJPA 4KB3A 5DQYA 5G1LA 1Z7PA 4RI7A 1SJZA 4EC0A 2H1DA 3C8EA 1U3AA 1FG4A 4PNGA 1NHOA 5GSTA 1AC1A 4ZBAA 1RQMA 4IP1A 5IMZA 16GSA 5E4WA 4KAEA 1T4ZA 1H75A 4MJCA 4KDYA 4Q5QA 1MDIA 4MH2A 1EEMA 3GKNA 4X43A 1Z9HA 4NWYA 3CSHA 3TKPA 4ZB9A 1DE1A 1QFNA 1GSFA 2IMDA 2GGTA 4EUYA 4LA1A 2FLSA 3EE2A 2VM1A 3TKSC 5IOXA 1J0FA 4D73A 5GZZB 2GDRA 1XWCA 1BYEA 1ON4A 5GAPD 4ULXA 2P5RA 1KBNA 5L71A 3RBTA 4EF0A 1SK2A 1ERWA 5ECLB 2L5OA 4MPGA 3QCPA 1QXHA 2F3MA 3FRCA 2O87A 5A4VA 3ZMKA 3ZVJA 3LEFA 4AJ7A 5ECRB 7GSSA 2HYXA 1LU4A 4ISDA 4O92A 1OE8A 3BJ5A 2I3YA 4EDYA 4BL7A 2LEGA 2H19A 4XRDA 1S3DA 4J57E 5LD0A 2HRFA 2H30A 2DJ1A 2YN1A 4ECIA 2B5YA 3VPQA 4PNFA 4LLRA 4ZL8A 1I9DA 4WBJA 1A8YA 2VL9A 4BVXA 1T3BA 1MTCA 3UAPA 1HNCA 1GSQA 3ZLPA 4IJIA 5ENUA 5INYA 1JFUA 3UBKA 1T4YA 3GA4A 4P3YB 4I2UA 12GSA 2R6KA 2H01A 3GH6A 1SK1A 2V32A 3GL5A 1JZDA 3QPMA 1DBYA 1K0BA 3IHQA 2H6XA 2HLSA 4OFMA 3EWLA 1SK0A 2RM5A 4V2MA 4KW6A 4IQAA 3UARA 4MF6A 2B3SA 4NPBA 4N11A 1SL0B 1XWKA 4N0VA 3D4TA 4K7NA 1N8JA 4F2IA 2CZ3A 4XS6A 5F07A 3KH9A 1YY7A 3FHKA 4KNDA 2HZFA 2H73A 5JCGA 1JZOA 4OO4A 3DEXA 3ZITA 3TKSA 1TRUA 4HOJA 1DSBA 3DD3A 3K8NA 1UC7A 3HA9A 2RLIA 2H0GA 3F6DA 1FVKA 2MBSA 3QFBC 4POBA 2WULA 3J7Yk 2AJQB 3I69A 1YZXA 4HJMA 1AQXA 5JWOB 2LJKA 4IW9A 4X0XA 2YZUA 4FIWA 1FVJA 2H74A 2FNOA 1XPVA 3KP8A 4OO5A 5ELAA 1SKWB 2DMLA 3ZL5A 1GH2A 1OC8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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