2DKIA

Crystal structure of 3-hydroxybenzoate hydroxylase from comamonas testosteroni, under pressure of xenon gas (12 atm)
Total Genus 197
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
197
sequence length
639
structure length
615
Chain Sequence
b'MQFHLNGFRPGNPLIAPASPLAPAHTEAVPSQVDVLIVGCGPAGLTLAAQLAAFPDIRTCIVEQKEGPMELGQADGIACRTMEMFEAFEFADSILKEACWINDVTFWKPDPGQPGRIARHGRVQDTEDGLSEFPHVILNQARVHDHYLERMRNSPSRLEPHYARRVLDVKVDHGAADYPVTVTLERCDAAHAGQIETVQARYVVGCDGARSNVRRAIGRQLVGDSANQAWGVMDVLAVTDFPDVRYKVAIQSEQGNVLIIPREGGHLVRFYVEMDRNITVEQLIATAQRVLHPYKLEVKNVPWWSVYEIGQRICAKYDDVVDAVATPDSPLPRVFIAGDACHTHSPKAGQGMNFSMQDSFNLGWKLAAVLRKQCAPELLHTYSSERQVVAQQLIDFDREWAKDPKEFQKYFEQHGRFTAGVGTHYAPSLLTGQAKHQALASGFTVGMRFHSAPVVRVCDAKPVQLGHCGKADGRWRLYAFAAQNDLAQPESGLLALCRFLEGDAASPLRRFTPAGQDIDSIFDLRAVFPQAYTEVALETLPALLLPPKGQLGMIDYEKVFSPDLKNAGQDIFELRGIDRQQGALVVVRPDQYVAQVLPLGDHAALSAYFESFMRA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords 3-HYDROXYBENZOATE HYDROXYLASE
publication title Crystal structure of 3-hydroxybenzoate hydroxylase from Comamonas testosteroni has a large tunnel for substrate and oxygen access to the active site
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
total genus 197
structure length 615
sequence length 639
ec nomenclature ec 1.14.13.23: 3-hydroxybenzoate 4-monooxygenase.
pdb deposition date 2006-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
A PF07976 Phe_hydrox_dim Phenol hydroxylase, C-terminal dimerisation domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2dkiA02
3.40.30.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2dkiA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2dkiA01
1E39A 4A65A 3AE6A 1NHPA 3QSSA 4USRA 4ECHA 3KKJA 4JDRA 2XFOA 1YQ3A 1DJQA 4CRTA 2YLZA 3ADAB 3DGHA 4LIIA 5LV9A 1GEUA 2F5ZA 2WETA 3V3NA 5BUKA 1F8SA 1JRYA 1PBFA 5IPYA 4KPRA 3NG7X 3UOYA 3NN6X 3AB1A 1CL0A 2WOIA 1UKVG 2WP5A 4D04A 1N4UA 4EIQA 4ZN0A 1ZMDA 1TDKA 3EANA 2R0PA 1S3BA 1FEBA 2RGJA 4TLXA 1HYUA 4GR1A 2C65A 1TDOA 2GEWA 3LZXA 3QFBA 2VOUA 1JRZA 4YTNA 1F8WA 2OALA 2YLXA 4NTEA 2PYXA 4J33A 2CFYA 3VRBA 5M0ZA 4BK3A 4YSXA 2BCGG 3EF6A 5J7XA 2APGA 2GR3A 2XVHA 2YAUA 3H8IA 1NHRA 1Y0PA 3CNPA 3UTGA 1VQWA 4C3YA 1PN0A 2V61A 3P9UA 4J34A 1KF6A 2YM2A 4Y4NA 4ZCCA 1CJ2A 3AE4A 1N4WA 2XVIA 2VVLG 4RSLA 2BA9A 3AEBA 4BURA 4EQSA 2BS4A 1JOAA 2GV8A 2XFNA 3AXBA 3CPHG 1PBDA 2BYBA 3CN8A 1OJDA 2XLRA 4JNQA 2X50A 1DODA 1CF3A 1D7YA 3DJDA 4J2WA 5TR3A 1W4XA 3AYJA 3DK9A 4NEVA 3DH9A 2GAGB 2YG6A 4B1BA 2C3CA 1FCDA 1IUWA 2VVLA 3NTAA 5KVIA 3QVPA 3RP7A 1OJ9A 2IVEA 3F8PA 2CULA 5FS7A 3DGZA 4Z2RA 4H4ZA 1CJ3A 1D4DA 1X31B 3G5SA 4YSYA 2C3DA 1RYIA 4X9NA 4FK1C 5JCMA 4DNAA 5KWFA 3NYEA 4H4TA 4H2PA 3M0OA 2XLTA 4CBQA 4TM3A 1FEAA 1GRGA 1ZY8A 2BXSA 4CCQA 4OPGA 4GUVA 2VVMA 4B69A 2C76A 3LADA 3FMWA 1QJDA 3SFDA 2X3NA 4OPTA 1H6VA 1K0LA 4YKGA 5KXJA 4K2XA 4B63A 3NN0X 1TYTA 3LOVA 3H4KA 1K0IA 3URHA 4E0VA 3P4RA 2WPFA 4J31A 4Y4LA 1GTEA 1REOA 3AE1A 3VRAA 3K30A 2XLSA 3CGBA 5HHFA 2Z5XA 3NIXA 4IV9A 2E4GA 5GRTA 3E1TA 4NTDA 1Y56B 3FG2P 2C66A 2UZZA 5BULA 1BGJA 4YSHA 4EIPA 1LTXR 1DNCA 3HZLA 1K0JA 1EBDA 2R46A 3S61A 3M12A 3DMEA 1E1LA 3P1WA 1GRFA 1NAAA 3QSMA 1AOGA 3NYFA 1VDCA 3P4PA 1YQ4A 4N9XA 4KX6A 1F6MA 4K7ZA 3GD4A 5EOWA 3ZYXA 2NPXA 1VG9A 3AD8B 3AEDA 2GH5A 2B76A 2BK5A 4H4QA 1PBBA 2JK6A 4YKFA 3UKKA 3ITJA 3GYJA 3SQPA 1BKWA 1ZOVA 4EMWA 3H8LA 4IVOB 3UKAA 5IQ1A 2ZZ0A 4IVMB 2E1MA 3D1CA 2AQJA 1IUVA 3NK1X 2R4EA 4HA6A 3UTFA 3AEAA 2YLWA 1SEZA 3O0HA 5HXIA 4O5UA 1OJTA 2EQ7A 3VR9A 4C3XA 4EQWA 3CNJA 2GR2A 3CNSA 2GQFA 2GMJA 4BJYA 4X4JA 2QCUA 3NKSA 2C73A 4H4SA 2BXRA 1Z6LA 3EAOA 5J60A 2C7GA 4ADWA 4JNAA 2XDOA 4USQA 1N4VA 2IVDA 1GRHA 2EQ8A 4XXGA 4UDPA 4C74A 3LB8A 3NT6A 3KA7A 4FK1A 4H4VA 4GRTA 3CPIG 1PS9A 1DOCA 2W0HA 2B9WA 3M13A 3GMBA 1GALA 3I3LA 1YKJA 1GOSA 4C5OA 2WHDA 3AD7B 3QSEA 4NTCA 1D4CA 4Z2UA 1CC2A 2JB2A 2JKCA 3AE2A 5FS8A 5FS6A 4EQRA 1EL8A 1IUUA 1D4EA 2XCGA 1IUSA 2BC0A 4A99A 5JCLA 5CKUA 1O5WA 3ZDNA 2YG4A 3ALMA 2VZ2A 3CPJG 3NTDA 3UOVA 4DSHA 2Q0KA 3QJ4A 4NZHA 3F8DA 2BABA 3UP4A 4H4PA 1EL9A 2C67A 2GMHA 2B7RA 2VRMA 5U63A 4U8OA 1ZKQA 3UKHA 3UOZA 4K5RA 1QLBA 3GDPA 1LPFA 1H81A 2RGHA 3LJPA 4O5QA 4A9WA 4BK2A 2A8XA 1NHSA 2FJEA 3P4QA 4X9MA 1KNRA 1GESA 3V76A 3C4NA 2FJDA 3UOXA 2DKIA 3S5WA 1BZLA 1B4VA 4JY3A 3IHMA 4EMIA 1NHQA 1GREA 3ICTA 4U2LA 2WU5A 3GWDA 4WCTA 1PXCA 3VRDB 1PBCA 2ARDA 1VRQB 2YQUA 3IWAA 5EB5A 4FX9A 3UKFA 2J3NA 3C4AA 4AP3A 3D8XA 2WDVA 3RHAA 1KSUA 1OJAA 4BV6A 2YLRA 3ALLA 4H50A 1L9CA 2GR1A 3VR8A 1DOEA 3AEFA 4PAAA 2V3AA 3BI2A 5HY5A 2Z5YA 2GB0A 3CIRA 4GDPA 4H2NA 2GRTA 4OVIA 2BCPA 3CGDA 2OA1A 4IA5A 2Q0LA 3SFEA 3ALJA 2R45A 3GD3A 1TDFA 4TLZA 1D5TA 2IIDA 1EL5A 3BI5A 3GRSA 4U2TA 1BF3A 3G5RA 4DGKA 4UDQA 4LU6A 1GTHA 2YR6A 3IHGA 1KSSA 1PJ6A 2NVKX 2H89A 2BK4A 1TRBA 1E6EA 2B7SA 3OC4A 4AOSA 2TPRA 1ZOYA 4GCMA 2Q6UA 2YWLA 4WX1A 2WESA 2VRLA 2B9YA 1GRTA 2A89A 4U8LA 2OLOA 3FPZA 4YTMA 2YG5A 1DJNA 3NHOX 2BS2A 1H83A 1ONFA 4I58A 4J56A 4YSZA 2V5ZA 1NG4A 1XDIA 2WPEA 1H86A 3PVCA 4B68A 2Y6QA 4A6NA 1F8RA 1NEKA 4AOXA 3UKPA 1ELIA 3CNTA 3AYIA 4LA1A 4RG4A 3KD9A 4BJZA 4HB9A 3BHKA 2ZZBA 1OJCA 3UTHA 2ZZCA 5BVAA 3P4SA 1KNPA 5JCIA 5EB4A 4I59A 1P2HA 5KRQA 2V3BA 4H2RA 1MXTA 3NNEA 2WOVA 2XVFA 1GRBA 2GAHB 3AEGA 3BNUA 5FS9A 4Z44A 1XHCA 1MO9A 4YXDA 3AD9B 1BGNA 4M52A 4U8PA 1L0VA 1NG3A 4A7AA 4REKA 4DSGA 5JCNA 1FOHA 2GF3A 2C64A 3AECA 1PJ5A 5CQFA 2ACZA 3SM8A 4A6NB 4BK1A 5M10A 3KVEA 4AP1A 2BACA 2CVJA 3B6DA 2JBVA 2XVEA 3AE3A 4H4XA 2XFPA 3K7MX 3K7QX 4PABA 1ZDLA 2AAQA 2GVCA 3LXDA 2XYOA 4FDCB 2WQYA 4OPLA 3GMCA 1ZX9A 3AWIA 1LQTA 5DBJA 3DA1A 2V60A 2Y6RA 4TM4A 2RABA 1CC6A 3NH3X 2VQ7A 5JCKA 2X99A 1LQUA 4J36A 5GSNA 4Z25A 1TDNA 1ZP0A 3PO7A 4Z43A 3UCLA 1QO8A 4ZCDA 3GYIA 4K8DA 2R9ZA 2VQBA 1IUTA 1KFYA 4XWZA 1BWCA 1DXLA 4XWRA 4AT0A 3KU9A 3GDNA 4Z26A 3ATQA 3AE5A 4EM4A 4NEWA 1JRXA 3ATRA 2YLTA 5L46A 2EQ6A 3WE0A 1H84A 1PDHA 1PHHA 2JB3A 2YR4A 2YM1A 4P9SA 4AT2A 3DJGX 1GRAA 1N1PA 1B8SA 1FL2A 4U8JA 1P2EA 5KOXA 2FBWA 3IF9A 5BRTA 4OPIA 4A79A 3NK0X 1H7WA 5U1OA 3FIMB 3Q6JA 4OPUA 1GETA 4H4WA 4U2SA 5C3JA 2QA1A 3NRNA 3RP6A 1M6IA 3AYLA 4RG3A 1GPEA 3GRTA 2WEUA 2ZBWA 1IJHA 3OZ2A 4Z2TA 4EMJA 3PS9A 4JY2A 2OLNA 4ICYA 2WP9A 1JU2A 2OAMA 3CGCA 2C70A 2QA2A 1O95A 4Z24A 1JEHA 4IA6A 1KDGA 1GERA 2CDUA 2R4JA 4H7UA 1E1KA 1H82A 3ICRA 3UTEA 1RP0A 3I6DA 3KLJA 2WDRA 1Q1RA 1RSGA 2YG3A 2H88A 1E7PA 2JB1A 2XVJA 4CY8A 2C72A 2O9ZA 4GDEA 1LV0A 5KVHA 1GNDA 3BI4A 5C2TA 4GF7A 1S2YA 3DJEA 2R0CA 1TDEA 3L1RA 4CNKA 4APNA 1JNZA 4YTPA 3NGCX 1GT8A 1D7LA 4TM0A 2R0GA 3CGEA 1S2QA 2WPCA 2C75A 1LJ1A 1Q1WA 1PXAA 3F8RA 1E1NA 4J57A 4U8IA 4B64A 1LVLA 2WP6A 2QAEA 3UP5A 2DKHA 3GSIA 3RP8A 4U8MA 4H2QA 4JQ9A 2YLSA 2EQ9A 2RGOA 1PJ7A 1VG0A 2WOWA 2WU2A 2YVGA 1CBOA 1L9DA 2FJBA 2X8HA 3Q9TA 3II4A 2Q7VA 3G5QA 1E1MA 4YWOA 1H7XA 4U8NA 3IC9A 4D03A 2PHHA 1YQZA 1V59A 2WDQA 3REDA 4B67A 1Y56A 3V3OA 2GQWA 2YVFA 5ER0A 1FECA 3EPTA 2BC1A 1PXBA 2I0ZA 4EQXA 2BK3A 3T37A 5IQ4A 2YVJA 5HYMA 1COYA 1S3EA 4H4RA 1CC4A 3LZWA 1F3PA 1ZK7A 3FBSA 3KPFA 4C77A 3CTYA 4UDRA 2YR5A 4CNJA 1O94A 1B37A 4B65A 3AE7A 2XLPA 3ISHA 1PBEA 2TMDA 2XFQA 3DK8A 1K4QA 5U25A 3L8KA 2JAEA 3NK2X 3QFAA 3UKLA 3QVRA 3VQRA 3B3RA 2FJAA 3JSKA 3GWFA 5EBKA 4Y4MA 4OPCA 4TM1A 2E5VA 3C96A 3R9UA 2GR0A 2WS3A 3AE8A 4OPDA 4A5LA 1NPXA 1ZMCA 2XFUA 3DJJA 2AR8A 2WBAA 3K7TA 1B5QA 2YG7A 2X8CA 3ICSA 3UKQA 1Q9IA 2B9XA 1MOKA 3RNMA 1NDAA 1NENA 1GSNA 1GV4A 1CJ4A 3CNDA 4U8KA 1XANA 4JN9A 2BS3A 4OCGA 1CHUA 2X8GA 4B66A 3SGLA 4CCRA 4K22A 4UP3A 1YY5A 1L9EA 2XLUA 4MJWA 5KOWA 3BHFA 2HQMA 1TYPA 1JNRA 3NYCA 4EM3A 3AE9A 1IUXA 1GXFA 1M64A 2V6OA 3NLCA 4H4UA 5FMHA 1CJCA 3BNMA 3AEEA 4CY6A 1XPQA 2A87A 1EL7A 3COXA 4H4YA 1DOBA 4K5SA 3DK4A 3ABVA 4YT0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WGEA 1E39A 3L0HA 1OKDA 1V2AA 4JDRA 2XFOA 4V1Ap 1DJQA 4CRTA 4J57E 1EZKA 2WETA 1JRYA 2F8FA 4X0XA 1C0IA 2NDOA 1AN9A 1K3OA 4PUFC 3NN6X 1KBNA 1FO5A 1UKVG 2WP5A 4WEYA 4EIQA 4MPGA 1TDKA 3EANA 1B4PA 4POLA 4TXOB 1PRXA 4N10A 3CSIA 3HXSA 1EGRA 4LL1B 3ZITA 3QFBA 1TU8A 1F8WA 2YLXA 2DMMA 4G74A 2VL2A 3VRBA 5M0ZA 1B8XA 4MA9A 4L5LA 3H8IA 3KH7A 1Y0PA 3CNPA 1A2JA 2VUPA 2OADA 2C4CA 3H93A 4WR5A 4J34A 5ECLB 2GDRA 1J08A 4G0KA 4RSLA 5A5KA 1V98A 4II3A 1S3AA 3TGZA 2X4AA 3AXBA 2HNLA 3LSZA 3MDKA 4KNDA 2BYBA 3CPHG 2VCQA 1OJDA 4IVFA 5TR3A 1D7YA 2X64A 2IMFA 2YZUA 3ZFBA 2OA7A 5DJMA 4USSA 1XWGA 3BOAA 5KVIA 3RP7A 3QVPA 3MSZA 4I2TA 4EVMA 2C80A 3DVWA 1THOA 3GKKA 4PQ1A 1XWCA 1X31B 1D4DA 2E48A 2C3DA 2YWOA 2EIOA 4H4TA 3WT1A 4H86A 4H2PA 3M0OA 2XLTA 1JZDA 1S3CA 2V41A 4CBQA 3L4NA 3UBKA 3W8SA 1XWBA 4OPGA 3HYPA 2E2GA 1H6VA 4K2XA 4B63A 1YKCA 3D6IA 4L0UA 1GTEA 4HU9A 3T2ZA 3APQA 2XLSA 3K30A 1SU9A 3RHCA 5GRTA 1RW1A 2DJ2A 4NTDA 1U6TA 2FCHA 3FG2P 3IC8A 1A8YA 1IYIA 1BGJA 4MMMA 1EEMA 2A4HA 3FHKA 3BJ5A 3SZFA 4PQIA 3DXBA 2YP6A 2IMKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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