5G31A

Crystallographic structure of mutant c73s of thioredoxin from litopenaeus vannamei
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVYQVKDQEDFTKQLNEAGNKLVVIDFYATWCGPCKMIAPKLEELSQSMSDVVFLKVDVDECEDIAQDNQIASMPTFLFMKNGQKLDSLSGANYDKLLELVEKNK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords THIOREDOXIN
publication title Is dimerization a common feature in thioredoxins? The case of thioredoxin from Litopenaeus vannamei.
pubmed doi rcsb
source organism Litopenaeus vannamei
molecule tags Oxidoreductase
total genus 34
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature ec 1.8.1.9: Thioredoxin-disulfide reductase.
pdb deposition date 2016-04-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5g31A00
1G7EA 2M72A 3TJFA 4TXVA 3CRTA 2LNSA 1ZZYA 3KD0A 4YQMA 4JRRA 3GMFA 2EIRA 3WD6A 2NVLA 4K7IA 1PQNA 3GX8A 1A23A 1F6MC 2QSIA 1K0CA 3QR6A 3U5RE 1JLVA 3G9BA 3DGQA 2GDRA 4KE3A 3GYKA 5G30A 4XS4B 1GP1A 2YOIA 4K1FA 3FR3A 14GSA 3F0IA 3KEBA 1GH2A 4N30A 2TRCP 4FIWA 4GTUA 4IJIA 2R4VA 4PQHA 3WT2A 4WEYA 1V98A 5IOXA 2EC4A 2IIYA 2QC7A 5ECOB 2I3YA 2I1UA 1RK4A 3HYPA 2ALBA 1LBKA 2CA8A 3GHAA 2V32A 1K3OA 4AGSA 3NIVA 2F8AA 3VWWA 1C72A 1H4OA 2HT9A 3TKQA 2V1MA 4MABA 4LA1A 1JZOA 4K0NA 3JCML 1OKDA 1GSDA 3CMIA 3LORA 3VLNA 1XPVA 2GTUA 1QK8A 3DYRA 3F4RA 5DALB 1WMJA 4OMVA 3MAKA 4E8EA 1TKDB 22GSA 4IGJA 3C1SA 3QFAC 2FA4A 3A2XA 4POMA 4V2NA 3VWUA 3BBYA 4DSQA 4XS4A 2F3MA 4KW6A 3IR4A 1BJXA 2HLSA 4QL9A 1XVWA 2C0DA 3LFLA 4POLA 1ERWA 3WGDA 3IC4A 2BMXA 2JSZA 4DSSB 3GKMA 3F63A 3LEFA 4IP1A 2NPBA 1U6TA 5HFKA 4ZL9A 6GSTA 1G0TA 2C4JA 3HJOA 4O32A 5B6MA 3P8WA 1BX9A 2HE3A 3NOFA 2P0GA 4POBA 1XOAA 1URMA 1XBSA 5AISA 3R2QA 6GSVA 1OAZA 3TDGA 4MJEA 2VL9A 1X5DA 2XPEA 3D0ZA 2WB9A 5ID2B 2XBIA 4MMMA 2CZ3A 5KN2A 1G7OA 5HR2A 2DJ3A 1V57A 1VF2A 1SKSB 2WRTA 1K0BA 2WGRA 2FWFA 5DALA 3RHCA 4ISDA 2C80A 2NTOA 2GSSA 3ZIVA 4EKZA 1XZOA 2DIYA 1O73A 5DAKB 2P31A 2FWHA 2EIOA 4K7OA 1EWXA 4V1Ap 5A4UA 5ELGA 4EC0A 3WGEA 2I9HA 4ZL7A 3HVXA 1R7HA 1GTBA 5EL8A 1PKZA 3LJRA 4PQIA 3EU3A 1UA5A 2FUG2 1HNBA 4IVFA 3I9V2 2GSTA 1AXDA 1JHBA 3DMLA 1T3BA 1FB6A 5IPHA 2KHPA 3KZQA 4H86A 3SWLA 4ECIA 4BA7A 2H75A 3GSTA 4YQVA 3LWAA 2VM2A 2O7KA 4L5OA 3M1GA 1JLWA 2HXKA 3O76A 2VCQA 3FYGA 3L4NA 1JZRA 4GF0A 2A4VA 4FYUA 5F06A 2RUFA 1TJDA 3ZITA 1KTEA 3UVHA 1BAYA 4HS1A 2HZEB 2HNLA 1OC3A 2X8HA 4HUAA 3HJMA 1ZOFA 4I2UA 5DAKA 1YZXA 1GTUA 3GH9A 1SJIA 2KLXA 5DJLA 1F3AA 1TRSA 4EL1A 5IM9A 2H01A 3GIXA 2MMOA 1HD2A 5ELAA 3DWVA 1O85A 3IXRA 4WBJA 3TJKA 1QGVA 4EUYA 1B4PA 4ECCA 5ECQB 3FHKA 3FY7A 2YWOA 4MJCA 4MPGA 2H71A 2V2GA 5F05A 5B6NA 3GKKA 3BOAA 5DCGA 3IPZA 4POKA 2IWTA 2D2ZA 3TKSC 4OO5A 1XVQA 3L78A 4ULXA 5EPFA 1PA3A 5C00A 1GULA 4FYBA 4OFMA 1N8JA 3P90A 1EV4A 2YWIA 1QFNA 2HZFA 2PN8A 3UBLA 3F6DA 2L5OA 1MD4A 4PX1A 3E0UA 20GSA 1A2LA 3OR5A 5EVOA 4NV2A 1OKTA 4K9ZA 3A5WA 2FNOA 1A8YA 1FG4A 2A2SA 2B7KA 3UMAA 5JWRB 5KN3A 2O85A 1YQ1A 1ZGNA 3PR8A 1Z7RA 2C3TA 1XWCA 3KMNA 1ON4A 1E2YA 2VL3A 5IMDA 3BCIA 4IP6A 1SK2A 4XRDA 4WR5A 4XS1A 4ID0A 1X5CA 4LMWA 3UBKA 1Z5YE 4GSNA 1OC9B 2CT6A 3ZZXA 4TOPA 3N5OA 4HU9A 4G19A 3UEMA 4KDYA 4DSRA 4IJ3A 4PUFC 2JZRA 4BPYA 2C0GA 3LXZA 2LJRA 5CYYA 2HFDA 3QAGA 4G10A 4I97A 2C1YA 4BWSA 5D8IA 2C3QA 4NXIA 3FZ4A 4ZB9A 3VWVA 2GT5A 1EP8A 1SL1B 3CBUA 2DMLA 3K8NA 1M9AA 2OADA 1PRXA 12GSA 4IHUA 1O7UA 2LRCA 3RDWA 3KP8A 2YZHA 1FOVA 5E59A 2RLIA 3GL5A 1FW1A 4WR4A 2REMA 1U3IA 6GSWA 1VGLA 4QQ7A 3TRPA 3VPTA 1EOHA 5D9XA 4MP4A 1HQOA 1KBNA 1GUHA 4O5RA 1O81A 2TRXA 3IRAA 1EGRA 1GSSA 1OC9A 2GQMA 2H19A 2E7PA 1F37A 3C8EA 4D73A 3HDCA 4MZCA 4NPBA 4TR1B 1SJZA 5CRWA 1DE2A 1ZMAA 3VWXA 4F9ZA 2CVKA 1OE7A 3KIJA 3KMOA 1O6JA 3GX0A 3FK8A 1KEBA 3A2WA 5H5QA 1VF4A 1QMVA 4HJ2A 3FZAA 1N2AA 2J9HA 1QUWA 4N11A 5KEJA 1T4ZA 1OYJA 1AIUA 1MDJA 5ECSA 4MCUA 1G6WA 2VM1A 2L57A 4TR0A 5HFGA 1AUCA 1Q4JA 1Y25A 1OE8A 1TXXA 4HZ4A 3Q74A 1KNGA 3HHVA 4JR6A 3EE2A 1AAZA 3ZIJA 4Q5RA 2FGXA 1M2AA 3QDNA 3G7JA 2K18A 5L71A 5IO0A 2LNTA 4KSMA 4L0UA 3TJGA 4GCIA 3D4TA 4N10A 3WT1A 5HR1A 4KDUA 4MH2A 1GUKA 2VD1A 2H1GA 2DJ0A 5ENUA 4LL1B 2ZNMA 3IDVA 4MF7A 1B9YC 2B1KA 3D6IA 2MBTA 3ERWA 3A2VA 4OCFA 2IPAA 2VL2A 4TN8A 4MJBA 2IJYA 3ZMLA 2R2JA 3UVTA 7GSSA 3ZYWA 2VO4A 5ECHB 1EEJA 3CRUA 2IL3A 1PX6A 1EV9A 3QOUA 3F4TA 2QGVA 5CAXA 1GSEA 2LQQA 3ZLPA 3M9KA 4QL7A 2H73A 2PGTA 2H76A 4GRFA 1K0OA 5IMFA 2F9SA 4PGTA 5G1LA 2EIQA 10GSA 3D4MA 1B8XA 1T4YA 1YY7A 2KP2A 2A2RA 5ECKB 1M99A 5HR0A 1S3CA 2DLXA 4DEJA 3UL3A 2YWMA 1J9BA 1XWAA 2MMNA 1OC8A 4WXTA 1SKRB 4OD7A 2VLUA 5LNKe 3CSHA 1X9WB 1JZDA 2CAIA 3EU4A 1DSBA 1R5PA 3LYPA 4GWRA 2KP1A 2OA7A 3IE3A 2RIIA 1F2EA 2DC5A 1VRSD 2WJUA 4NMUA 2L6CA 2B1LA 1TW9A 3LXTA 5B8BA 1FO5A 3GURA 3M0FA 3D22A 4KCAA 3RPPA 5AIXA 5HFIA 4ZB6A 1TRVA 2ZCTA 1NW2A 4IELA 2K8VA 1XWGA 6GSXA 3TKPA 2KOKA 2IFQA 2YJHA 3DVWA 4MZBA 2CX3A 1MDIA 1SK1A 4I8BA 4BWQA 4F2IA 4HZ2A 1EEMA 4Z7XA 3U6VA 4CHSA 2O8VB 2QKEA 4PXOA 2NBSA 5D9WA 1XIYA 2H30A 3S9FA 4XCSA 2GLRA 3IV4A 4MDCA 2PWJA 3FRCA 4TR4A 3C7MA 2B5YA 2BJXA 1WE0A 4MPFA 2DJ2A 2LRNA 5AN1A 4KCEA 2H8LA 4ML1A 4LMVA 5INYA 1IYIA 3APSA 3KGKA 5GAND 1SU9A 5HR3A 2H1AA 3N9JA 1IYHA 4RQRA 1GTIA 2FY6A 2CV4A 2HSYA 2LEGA 3HD5A 2L4QA 3FKFA 4ECBA 2L59A 2IMFA 5D9TA 5D9VA 2XBQA 4XRAA 3KP9A 4ILFA 1V9WA 1WPIA 4JBBA 1B48A 4ZB8A 2H70A 1MTCA 3CTGA 3ZREA 1S3AA 1UN2A 4FH8A 1EGOA 3IOSA 5IMZA 2XC2A 1A2MA 2HRNA 2JSYA 3F3RA 3GUSA 4K2DA 1Z9HA 2E0QA 4EDYA 4PUAA 4V2LA 5LD0A 3CSIA 5FWGA 2IMKA 5J3RA 3UAPA 4V1Ag 2Z9SA 4HOJA 2H0IA 4NHWA 1UC7A 1K0AA 2ON5A 2CQ9A 3ERFA 3L9SA 3CTFA 2OE0A 4KX4A 1K0NA 2N5BA 4JR4A 5KN1A 1CQHA 2AUVA 4K6XA 1U88A 1PKWA 4HQSA 4BVYA 5C04A 1Q98A 4MH3A 3A3TA 2JACA 3EWLA 1SL2B 3PGTA 5JCWA 3IAS2 2YANA 1PGTA 4GLTA 5A5KA 3GNJA 5IMVA 4EE0A 2L4CA 3Q19A 3PINA 4YQUA 4J57E 1AQVA 2FA8A 4HI7A 1K3LA 4I6XA 1XW6A 4TRXA 2V6OA 3M8NA 1BYEA 3M3MA 3EC3A 4NWYA 2H6YA 1ACVA 4JZQA 2PVQA 3VPQA 1TI3A 4JE1A 3TCOA 3QMXA 3M9JA 5H5SA 1AQXA 3CYNA 3O3TA 3D5JA 5ECNB 5G1KA 2MMAA 3F3QA 2L5LA 5AGYA 5CRGA 1EP7A 5IQYA 1YDKA 2CX4A 2PMTA 3W6GA 1SYRA 6GSYA 2C0EA 3IA1A 2JL4A 4MF6A 4LL4B 3G7YA 1DE1A 3Q18A 4ZBBA 4L0WA 4KA0A 3ZTLA 4V2MA 4ML6A 1FVJA 13GSA 2GGTA 2VCZA 3HZ8A 2WFCA 2OBIA 3DRNA 5E4WA 5B7CA 2DJJA 5H5RA 4RUVA 2WS2A 4ZILA 1RW1A 2R3XA 4WETA 2DJ1A 3UJ1A 2MMZA 1A0FA 3GH6A 3H8QA 2K9FA 2OJLA 2VCVA 1XFLA 4D73B 5ECLB 1TDIA 5LCZA 1X9SB 3ZFBA 2G0FA 3L9UA 5FHIA 2GT6A 4G2EA 1XCCA 1MEKA 5F07A 2CAQA 3C73A 3V1WA 1AC1A 4KGIA 4OO4A 4TXOA 4JU5A 2DBCA 5G5EA 3TRQA 1GNWA 3CSJA 1WOUA 1GSYA 3APOA 1MD3A 4KUNA 3KTLA 4TR3A 1W4VA 2H0GA 2FCHA 1T1VA 2B3SA 3NZNA 3SBCA 1HNCA 4F03A 3I6AA 3RAZA 5J5NA 3ISOA 2PVOC 1AQWA 4IS0A 4G9HA 1M9BA 2GQLA 4F82A 4PURA 2H1DA 3HZ4A 1V2AA 2ZUPA 4RI6A 4WKWA 1J08A 5IOWA 3ZVJA 3G7IA 3BCKA 1USBA 1V58A 2GZPA 2JADA 4ZBDA 3TJJA 4RQXA 1XW9A 1SKWB 1A8LA 2R5GA 2PUKC 4XHMA 1V40A 3F9UA 2O89A 2PU9C 2F51A 3ZL5A 3QPMA 3F8UA 3KM6A 5DQSA 2DSAA 2CZ2A 1HNAA 4GSSA 11GSA 2IMIA 3MNGA 2P5RA 4GSTA 4GQFA 1TOFA 2AB6A 3LSZA 3EMXA 3W8SA 3GN3A 1PL1A 2WZ9A 1THOA 1YEPA 3FZ5A 4ECJA 1BG5A 2E2GA 1YEXA 3RHBA 1GL8A 4HDEA 2HI7A 2MYGA 1T8EB 4OFTA 4AF2A 16GSA 5J41A 3C1RA 3GRXA 1TRUA 1MDKA 1GRXA 4IQ1A 3H1NA 2G2QA 5CO3A 2FWEA 3ME8A 3VI5A 3APQA 1B9XC 3F4SA 2AV4A 2RM6A 1QQ2A 1PL2A 3MDKA 2YNXA 3KJYA 1GSUA 4WF5A 4Q5QA 2B5XA 3HJPA 4X1UA 1M2BA 1ZL9A 1VF1A 4IQAA 3C71A 5KN0A 2C8UA 3E3EA 3UIWA 4XIHA 2HYXA 3QD9A 1R26A 5J9CA 3CXGA 1PN9A 5D73A 4MK3A 4FO5A 5JWQB 3WGXA 1F3BA 2VCXA 2IFQB 1Y6EA 1PX7A 3QAVA 2PERA 2VD0A 4ZIJA 1DUGA 2IMEA 3LYKA 1I5GA 5F0GA 1XWKA 3BJ5A 1O8XA 2CVBA 3ZVJD 6GSSA 2OE1A 2LKUA 1ILOA 2GZYA 3VI7A 2X8GA 4AJ8A 2B6MA 6GSUA 4J56E 1TK5B 2YV9A 5DBQA 4KB3A 3RBTA 1M2DA 4OCEA 4IW9A 3ZFLA 4NV5A 5EY6A 3TOTA 4O7HA 1NSWA 1SD8A 3P7XA 2YV7A 2GZZA 1NHYA 1TI1A 2XHFA 1JFUA 2LSTA 2RM5A 8GSSA 4KSOA 2B7JA 3GTUB 5B8AA 4HQZA 1XWBA 2OE3A 2IMDA 1T7PB 5G2ZA 1U87A 4X43A 1X5EA 2N5FA 3US3A 5G5FA 2H74A 4IN0A 3I69A 3GSSA 3EINA 1TK0B 5D96A 2YPMA 3HVVA 1ML6A 5JCUA 2AYTA 1PMTA 2IN3A 4XS6A 2WCIA 1YF0A 2LJKA 5GZZB 1X9MB 4KNDA 2X64A 4RI7A 4O92A 5CRHA 4HJMA 1XW5A 4WBRD 1FAAA 4ZL8A 1NHOA 4MZWA 4OFNA 18GSA 1T00A 2O87A 1SK0A 3Q6OA 2J23A 1J0FA 5CNWA 2AJQB 2DIZA 3EYTA 3TOUA 1ERUA 2VLTA 3GA4A 3HCZA 3W8JA 2VOCA 3FW2A 3TUEA 1BEDA 2HSHA 3MWHA 2GQKA 1RQMA 3DVXA 2C3NA 2GSRA 3GTUA 5DJMA 5IO2A 1SD9A 1G6YA 4EXJA 4EO3A 3IHQA 3QFBC 1R5AA 1SJ6A 4JEDA 4GXZA 3RPNA 3VFIA 5AIVA 2WULA 4TKYA 3L0HA 4CDOA 4Q5FA 1AW9A 4MLYA 3FEUA 3D21A 2HRFA 4NAXA 1A24A 1QXHA 5J9BA 2VIMA 1GTAA 2JZSA 2X8CA 2H0HA 2VAFA 2I4AA 2VUPA 3ME7A 2PBJA 2LJAA 4P3YB 2H1BA 4K7NA 5DVBA 1GUMA 1ST9A 5GSSA 3KXOA 2LUSA 17GSA 4DSSA 3HVSA 1TU7A 3HA9A 3DIEA 1ERVA 4MA9A 1GSQA 4N0ZA 1WWJA 4NHZA 4KAEA 3TB2A 3GKNA 4LLRA 4YH2A 5GAPD 3DKSA 2VCTA 3H93A 5ID2A 1THXA 4GQCA 3ZMKA 2V41A 4MF5A 3AY8A 2M46A 2JZTA 1GWCA 1Z6MA 2LS5A 5HQPA 2WDUA 3KTBA 3H79A 4ZXGA 3J7Yb 1F9MA 5CRDA 2F8FA 1S3DA 1JZWA 2YCDA 2L6DA 2LRTA 5CP1A 4IBPA 5G31A 1M7TA 2K6VA 4CW9A 1EOGA 1W89A 3DD3A 4FYCA 4L5LA 3GKXA 1PSQA 2FLSA 2ES7A 1UVZA 1BQ7A 5FT3A 3ED3A 1I9DA 1TP9A 3HKRA 19GSA 4TXOB 1FVKA 3GL3A 4EDZA 2DJKA 1YKCA 4K0GA 1CQGA 3F6FA 4BL7A 4TW5A 3P2AA 1TU8A 2LV3A 1A2JA 2P5QA 1LJRA 1ZCPA 4MJAA 3FR9A 3LG6A 4I5QA 4EF0A 1YKAA 1GLPA 3GV1A 4HU7A 3UOMA 4DVCA 5ABRA 4YAPA 1TRWA 2HZEA 4KH7A 2OACA 3FZ9A 3TKRA 2XPDA 2V6KA 1ZYEA 3IK7A 2K8SA 3TGZA 1O8WA 3VURA 5IMAA 1K0MA 5ECIB 3LQ7A 2E2MA 3GFKA 5D93A 2CVDA 5COHA 1VF3A 3EMPA 4EVMA 4PNGA 5A4WA 3DXBA 2AAWA 1YJ6A 1XXUA 2ON7A 5ECRB 2DMMA 1ABAA 3MSZA 2GVPA 2X99A 2I81A 3I43A 2H6XA 5IPGA 3QAWA 1LU4A 3LGCA 2JU5A 4L8EA 3H4KA 1K3YA 5A4VA 3O6TA 4BVXA 1H75A 3ZRDA 1E6BA 2OKAA 1WJKA 3BD2A 3HY2A 2YZUA 2MZCA 2FD3A 4I2TA 4OWYA 3TKSA 5DQYA 4Q5NA 1FHEA 2H6ZA 3TKSE 2R37A 3QCPA 4XTSA 1B4QA 3KCMA 1XOBA 4PQ1A 5CREA 1K0DA 2KUCA 3UARA 1ERTA 1GLQA 1WP0A 3ERGA 1SYXA 2VL2C 2LTKA 3J7Yk 1SENA 1DBYA 3L9VA 3IK9A 1PD21 5DDLA 3DEXA 4HEA2 5ECMB 4E8HA 3IBHA 3PH9A 2AHEA 2YN1A 2PPTA 4F0BA 4AJ7A 1TTZA 3KH7A 1HYUA 4X0XA 2N5AA 1EZKA 2GS3A 4TVEA 5ECPB 1X0RA 3IAM2 1Z7PA 1TK8B 4ACSA 1WRYA 2LQOA 1Z3EA 3EURA 5J4UA 5F8BA 3VK9A 2M80A 4F0CA 4WF4A 2FWGA 5DCHA 3TJBA 4YAVA 1SL0B 4AJ6A 4ZBAA 2VCWA 1WIKA 2BTOT 5JCGA 5JWOB 2TIRA 3TRXA 1YF1A 1Z6NA 3KH9A 1M0UA 4IKHA 1A0RP 1GSFA 5IMCA 2H72A 1FB0A 2YWNA 1GNEA 2NDOA 4N0VA 3EVIA 3WYWA 1OVNA 2B5EA 2FHEA 3FR6A 4KDXA 3HXSA 2C0FA 4PNFA 2GSQA 2YP6A 4TR1A 2MBSA 2OBKA 2YJ7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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