5G31A

Crystallographic structure of mutant c73s of thioredoxin from litopenaeus vannamei
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVYQVKDQEDFTKQLNEAGNKLVVIDFYATWCGPCKMIAPKLEELSQSMSDVVFLKVDVDECEDIAQDNQIASMPTFLFMKNGQKLDSLSGANYDKLLELVEKNK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Litopenaeus vannamei
publication title Is dimerization a common feature in thioredoxins? The case of thioredoxin from Litopenaeus vannamei.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
total genus 34
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature ec 1.8.1.9: Thioredoxin-disulfide reductase.
pdb deposition date 2016-04-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5g31A00
1T8EB 1NM3A 3GHAA 3ERFA 3LEFA 4MPGA 1GSYA 3GSTA 1TK8B 2GQLA 1PMTA 4OMVA 3I69A 3M8NA 3DVWA 4GSSA 2YJHA 3EMPA 3ERGA 3EE2A 4HJ2A 3ISOA 3QMXA 4F2IA 4JEDA 2H6YA 2B7KA 1O73A 3LWAA 3ME7A 3ZVJD 2NPBA 1M2BA 3TJGA 3J7Yb 2XPDA 1VF4A 3HVXA 5F05A 2H0GA 2DBCA 5B8BA 3OR5A 2VM1A 2TRXA 3LXTA 4F9ZA 1GTIA 1GSFA 4K7IA 3HJOA 1FHEA 4KSOA 1BQ7A 4MDCA 2LNSA 4PURA 2VLTA 5DJLA 3TJKA 1F37A 3TOUA 4JZQA 4DSSA 3UIWA 2LNTA 1WMJA 3KD0A 5H5RA 2NTOA 5ECPB 2G0FA 1U3IA 4YAPA 3TUEA 2I4AA 1XW9A 2G2QA 4PXOA 2HZEB 3P90A 1GLQA 4ZL9A 4CDOA 3QR6A 4MPFA 1OE7A 3BCIA 3TB2A 1CQGA 4XCSA 3LSZA 2B5YA 2K9FA 4IELA 2VLVA 5HFGA 4Q5NA 3MWHA 2GGTA 3GSSA 4NPBA 3IOSA 2DJJA 6GSSA 2N5FA 1M99A 2A2SA 2WZ9A 2VLUA 1YZXA 4AJ6A 1USBA 2B5XA 4G9HA 4LL1B 3PGTA 3L78A 1M7TA 1TP9A 4HU7A 3RPPA 3C1RA 1O7UA 12GSA 1SJ6A 1SKSB 5J41A 1F9MA 3H1NA 1B8XA 2FWHA 1QUWA 5DQYA 5G2ZA 5IMCA 6GSXA 1O8XA 1R5AA 10GSA 2TIRA 4L8EA 3VPQA 2HSHA 1XW6A 4OD7A 2H72A 1EOGA 2MMOA 4KDUA 4I2TA 3IAS2 4ZIJA 11GSA 1OC9B 1S3AA 3FEUA 4ID0A 4EDYA 1WRYA 5J9BA 4N0VA 1WPIA 3VPTA 2MZCA 2K8VA 2L5LA 2V32A 1EEMA 2ZCTA 3U5RE 3F8UA 4LMVA 1PX7A 2RM5A 2FWEA 3A2XA 1B4PA 2AAWA 4KE3A 2R6KA 2ES7A 2LKUA 3LGCA 7GSSA 1GLPA 2O87A 3ZRDA 3EU4A 4JE1A 1ON4A 5G5EA 3W8JA 3ZIJA 3VFIA 4J2FA 2LRTA 1WE0A 2DMLA 4N10A 2WULA 3W6GA 3CRUA 3D5JA 2DC5A 2CVDA 3RDWA 1MDKA 3IBHA 4FYBA 5ECOB 3O76A 2F9SA 3RHBA 1K0AA 1DUGA 6GSVA 2QKEA 3F6FA 4N11A 2H71A 2FA8A 3UARA 3US3A 2NVLA 3H8QA 3N9JA 1EWXA 1JZOA 2N5AA 4ZILA 5G1KA 1M2AA 5CAXA 2WJUA 3TRQA 3RHCA 3UAPA 1FOVA 1T7PB 2VD0A 4EVMA 2O7KA 3IC4A 1U87A 5D73A 2YCDA 2MMNA 2IJYA 4HI7A 2GSSA 3DGQA 2VCQA 3AY8A 4L0UA 2GT6A 5ID2A 1O85A 2WGRA 1S3DA 5INYA 2RIIA 1DE1A 3GL5A 3L9UA 3A2WA 4ML1A 1BX9A 4FIWA 5ECLB 6GSUA 3HY2A 3HDCA 2A2RA 1JFUA 3HHVA 2IMEA 2BMXA 4V2MA 4KX4A 5DALA 5DBQA 2I81A 3WT2A 2VCXA 1GUMA 3WT1A 3RAZA 3K8NA 1E2YA 5CRGA 3FKFA 1SJZA 2GZZA 4AJ7A 1GH2A 1SKWB 1I9DA 3GN3A 4K7OA 5G1LA 2X99A 3F9UA 2YZUA 3QAWA 4IGJA 2V2GA 4IP6A 4MLYA 1PL1A 1GUHA 4O5RA 4Q5FA 17GSA 2AYTA 4ZBDA 3KTBA 4DEJA 1PA3A 2YN1A 3ZVJA 3GTUA 1XIYA 4NXIA 5JWRB 4GSTA 5ECIB 5ID2B 2H6ZA 3H79A 1YKCA 1TK0B 3F3QA 6GSWA 5EPFA 3UBKA 1R5PA 3GYKA 1Z9HA 2L4QA 1XOAA 4PQHA 3IA1A 4ZB9A 4PNGA 1A2JA 4MZWA 4KA0A 2DJKA 2H1DA 2IFQB 2LSTA 2X8HA 3UJ1A 3W8SA 5LNKe 1ERUA 2F8FA 1TKDB 2B1LA 2PPTA 3WGEA 4D73A 1G0TA 2OACA 5C00A 2YOIA 5ENUA 4ZBAA 1TI1A 2I9HA 4BA7A 3G7IA 4WBJA 3D0ZA 1XFLA 1PGTA 2OE0A 5IMVA 2GT5A 2H01A 3IPZA 4IQ1A 3DEXA 1XBSA 3VURA 4QL9A 3R2QA 5J3RA 4L0WA 1CQHA 3QFAC 3HVSA 4OCEA 1G6WA 2GTUA 5D9VA 4YAVA 5F8BA 1XVQA 2BJXA 1XXUA 4WF5A 1SL2B 4PQIA 3E3EA 5IOWA 4K6XA 1RK4A 4OFMA 5B6NA 3ZYWA 1TRWA 2GQKA 2HZFA 4TOPA 3TKRA 2LRCA 2RUEA 2PVOC 2IN3A 5CRHA 2H1BA 2HRFA 3CTGA 5HR3A 2C3TA 2HNLA 1JZDA 1RW1A 4OFNA 4IQAA 1ILOA 4JBBA 4F82A 4G2EA 3F4TA 4IKHA 4JRRA 2M80A 4IBPA 4PNFA 19GSA 2R4VA 1X5DA 3GMFA 4BVYA 1EGRA 3P2AA 3D21A 4XHMA 2DIZA 5ECMB 5CRDA 1QFNA 1MDIA 3TRPA 4EE0A 4TR0A 4WF4A 1ZCPA 3APSA 4HQSA 1ZYQB 1FB6A 3WGDA 3TKQA 4NWYA 1T1VA 1U3AA 1JLWA 1T3BA 4OFTA 1A23A 1O6JA 1EGOA 1PRXA 3BJ5A 3ZREA 1OKDA 20GSA 1Z5YE 4AJ8A 2IMFA 4WXTA 1NW2A 1V58A 4HEA2 4K2DA 2HZEA 4O92A 1GRXA 4JR6A 2X8GA 4K1FA 4MJBA 5D9XA 3L9VA 1ERTA 1K0NA 3I43A 3MAKA 1H75A 2LJKA 2ZUPA 2C80A 4Q5QA 3WD6A 4ILFA 3E0UA 1AW9A 3LORA 1SD8A 4O7HA 4MZCA 2YV9A 1Z6NA 2MMZA 2AUVA 1VF3A 2GS3A 2BTOT 4GLTA 4K7NA 4V2LA 1PKZA 4MF7A 3G7YA 4DSQA 1RQMA 1EZKA 2H76A 5AGYA 4AF2A 1XZOA 1AXDA 1X0RA 1F6MC 1YKAA 2OE3A 3O6TA 1K3YA 4PQ1A 3FY7A 2CA8A 5IIZA 4XIHA 2B6MA 5KEJA 2GZYA 3HJPA 4TKYA 2CAQA 2C8UA 3C1SA 3KEBA 3PH9A 4EXJA 2L59A 1X9WB 1OVNA 2H66A 1WIKA 1OC8A 2WRTA 5ELAA 1KTEA 3DYRA 4H86A 1TRVA 4GWRA 4XRAA 2DMMA 2RM6A 3ZTLA 2VL9A 1KEBA 1Q4JA 1OC9A 3ZMKA 3GX0A 3Q18A 1W4VA 3IK9A 5GSSA 1G6YA 2OBIA 2VCZA 6GSTA 4YQMA 1AIUA 2AJQB 2FCHA 2VOCA 3CSJA 16GSA 3TJJA 8GSSA 3VWVA 3FR9A 3DKSA 3HYPA 4K8MA 4ISDA 2C0GA 4FYUA 1LBKA 1ST9A 2GSQA 2ON7A 1TU7A 4K0NA 2V6OA 4IVFA 3TRXA 1TW9A 5DCGA 1HNAA 2OKAA 3VWWA 1A0FA 1YEXA 2R3XA 3HCZA 2GQMA 3GA4A 4BWSA 4LA1A 2R2JA 1X9SB 1TOFA 1GSQA 2FNOA 1QXHA 5G31A 4QL7A 4EC0A 2ALBA 5J4UA 3P8WA 4IW9A 1N8JA 4F0BA 3TGZA 1A2MA 1EOHA 2M46A 4KDYA 2QGVA 4KNDA 5ECQB 1PSQA 4V1Ap 5D93A 1Q98A 1AQWA 4EO3A 2IPAA 1GNEA 3FZ4A 2H0HA 5DQSA 1TTZA 4CW9A 1U88A 4MJEA 2RLIA 5D9WA 4WBRD 4GSNA 4EKZA 2DJ3A 5KN0A 1MEKA 3VWUA 2H73A 1O81A 5HR0A 3HVVA 3GH9A 4HZ2A 4YH2A 5AIVA 2VUPA 5IOXA 1SD9A 4Z7XA 2YWNA 4HDEA 3WGXA 5J5NA 3EWLA 3FZ9A 2CZ2A 3LYPA 1U6TA 5DVBA 4KUNA 1FG4A 3O3TA 3H93A 4OCFA 1ZYEA 2J23A 2RUFA 1B48A 3L4NA 2E2MA 1BYEA 4G10A 1A8LA 2D2ZA 1GP1A 3IK7A 3GFKA 5LD0A 2LJAA 1NSWA 2EIOA 4MK3A 3DIEA 1GNWA 2CX3A 4TXVA 2X64A 2VL3A 2AB6A 1V40A 1V98A 4PUAA 2CV4A 2IL3A 1GTUA 3UL3A 2LQQA 5DDLA 4LMWA 4BL7A 1DE2A 3KP8A 1TRSA 1YY7A 2DJ1A 2YWIA 4DSRA 2GSTA 4OO4A 3Q6OA 4MCUA 2JSYA 3QAVA 5ECRB 1OE8A 2OE1A 1SL1B 3QOUA 3CYNA 4IN0A 1FVKA 1J08A 1G7OA 2H74A 1TU8A 4MH3A 3FHKA 3UVHA 4NHZA 1FW1A 3ZFLA 2B7JA 4X0XA 3MSZA 3Q74A 3JCML 1SYRA 2XBIA 5CYYA 3GURA 2JZRA 2FD3A 3CSHA 2AV4A 3IR4A 1UN2A 2N5BA 5B7CA 1ERWA 2IFQA 3Q19A 4GRFA 2H70A 2HT9A 4LLRA 1MD3A 2VCTA 5E4WA 5H5SA 2X8CA 2HYXA 5L71A 2VO4A 1F3AA 4ECJA 1TXXA 1WWJA 2C1YA 4POLA 9GSSA 4POKA 4POMA 1MDJA 2H75A 1BEDA 1OAZA 5ECKB 2WB9A 4XS6A 5IMZA 5IQYA 2KOKA 3IHQA 1NHOA 1VRSD 5GAPD 4HZ4A 5ECNB 1YJ6A 3ZIVA 4ECCA 2VM2A 2WCIA 2PBJA 1HD2A 3UEMA 1ACVA 4MA9A 1R4WA 5CP1A 3V1WA 4XRDA 2K18A 4IHUA 2IMDA 3VLNA 4HQZA 5FHIA 3TKSE 5GSTA 1M0UA 3IAM2 3EYTA 5GZZB 1ZL9A 4QQ7A 3EURA 2LV3A 5HQPA 1IYHA 1X9MB 5FWGA 5KN2A 2FWFA 4ZB8A 3EINA 1OKTA 1BJXA 4DVCA 5IPHA 1SKRB 4LL4B 1F3BA 1VGLA 3HA9A 2V6KA 4NAXA 2IIYA 4RQXA 4TR4A 2LJRA 3F63A 2NBSA 1IYIA 1XWGA 2LQOA 1UVZA 4L5LA 1GSEA 1PD21 4NHWA 1V57A 1XOBA 3IV4A 2WS2A 4HS1A 2H1GA 3M0FA 2KP1A 4MMMA 5CRWA 3F4RA 4X1UA 1MD4A 4EDZA 1UA5A 1EV4A 4TN8A 5ECHB 1HQOA 2GSRA 4ZL7A 2XHFA 1PL2A 1R26A 4G19A 1EV9A 2XBQA 1ZOFA 1UC7A 1A2LA 4GTUA 2MMAA 3CXGA 3QCPA 3GKKA 3DXBA 2KP2A 5F0GA 4PUFC 3KMOA 3L0HA 1KNGA 3HZ8A 4TW5A 1ML6A 4KAEA 2EIQA 2I3YA 3EMXA 2P31A 2VL2A 1T4ZA 4POBA 5JCGA 3M9KA 3N5OA 5FT3A 1ZMAA 22GSA 2HFDA 5J9CA 2Z9SA 1GSDA 4HJMA 3UVTA 3BBYA 1FB0A 4CHSA 5H5QA 1VF1A 1V2AA 2L57A 2YJ7A 3GRXA 3BCKA 3FZAA 2HI7A 4F03A 2B1KA 2HRNA 2YZHA 3GX8A 5CNWA 5CO3A 1XWAA 4ECIA 2L6CA 5ELGA 1N2AA 2OJLA 1AAZA 5IPGA 4MH2A 3C73A 4KCEA 1XWKA 2IMKA 3F4SA 2FGXA 3ZZXA 2E7PA 3UOMA 5HR2A 3CSIA 1GWCA 4J56E 3FZ5A 1GTAA 3F3RA 3KIJA 4FYCA 18GSA 4WR4A 1TRUA 4GCIA 2KUCA 1SK1A 2OBKA 4TXOB 1EP7A 2YWMA 1FAAA 4TR1B 4V1Ag 2VCVA 3DD3A 2C0FA 4MABA 3HKRA 4WETA 5D96A 2DLXA 2L5OA 3QPMA 2DJ0A 3GNJA 5E59A 4ZBBA 3VWXA 2CVBA 2ON5A 3VK9A 2QSIA 2P5RA 3CBUA 1ZGNA 2PWJA 1Y6EA 2FWGA 3KMNA 2H30A 3M3MA 3RPNA 2A4VA 2L6DA 1FO5A 2C3NA 4YQUA 5KN1A 2XC2A 1GUKA 2CAIA 3TDGA 4AGSA 1J0FA 2VCWA 5HR1A 3LYKA 1X5CA 1PN9A 3FR6A 5C04A 1WJKA 4BWQA 3KZQA 5B6MA 2HE3A 2PERA 1O8WA 3G9BA 3FRCA 5GAND 6GSYA 2WDUA 5IMFA 3SBCA 2MYGA 2GVPA 5A4VA 3D4TA 3KTLA 4ACSA 2LTKA 3A2VA 5IMDA 5AIXA 1HYUA 3IDVA 5EVOA 2TRCP 3UMAA 3TJBA 3ZL5A 2PN8A 4KH7A 3ME8A 3CMIA 4TVEA 4WR5A 4I2UA 1QQ2A 1AC1A 3KH7A 4I5QA 5D8IA 3TKSA 2NDOA 4V2NA 5EY6A 3C8EA 2C3QA 5F06A 2ZNMA 2LS5A 5EL8A 2R5GA 2V1MA 3RBTA 3S9FA 1K0DA 2WFCA 4YQVA 2K6VA 4Q5RA 3BOAA 3A3TA 3U6VA 1URMA 2FUG2 3KXOA 2MBSA 4DSSB 1QK8A 5COHA 4IS0A 4E8HA 4OWYA 4RI7A 3UBLA 5KN3A 1YF1A 3EU3A 3KGKA 2C0DA 3ERWA 4O32A 1SL0B 2PMTA 5F07A 2GLRA 1HNBA 4ML6A 4J57E 3PR8A 1H4OA 3I9V2 4F0CA 1HNCA 1K3OA 3F0IA 2LEGA 3SWLA 4KCAA 2PU9C 3GKXA 5DCHA 1GULA 3FK8A 3VI5A 4GQFA 4WKWA 3BD2A 2FA4A 4MJAA 5JWOB 3M1GA 1E6BA 5IO0A 2XPEA 1W89A 4BPYA 2YWOA 1TI3A 2H6XA 2OADA 2R37A 1SJIA 2C0EA 1DSBA 1GTBA 1YF0A 3LG6A 2EC4A 2EIRA 3MNGA 4I97A 5A5KA 4RUVA 1JZRA 2VAFA 3GKMA 1Z6MA 3GH6A 3FW2A 2O89A 4XS4A 2JSZA 5A4WA 1KBNA 3G7JA 4PGTA 3PINA 1SK2A 2JU5A 4IJ3A 5HFIA 1T4YA 4ECBA 2F8AA 4EUYA 4L5OA 4N0ZA 1XWCA 5IO2A 2KLXA 4IJIA 3GV1A 3DMLA 1AQXA 2O8VB 1M2DA 1R7HA 4ZXGA 3QAGA 1M9BA 3CTFA 1VF2A 1SK0A 1Z3EA 3QD9A 1T00A 4MP4A 1Z7PA 2FLSA 5D9TA 1XVWA 3IE3A 5B8AA 2H8LA 4XTSA 2P5QA 3L9SA 1PQNA 3DRNA 1C72A 2KHPA 4E8EA 2HLSA 4NV2A 4OO5A 1THXA 1JHBA 3HXSA 3VI7A 1QMVA 4P3YB 2VIMA 3M9JA 1F2EA 4KGIA 2H0IA 5HFKA 2M72A 4RQRA 5IM9A 1TK5B 4XS4B 1GSUA 1WP0A 1WOUA 2J9HA 3J7Yk 3FR3A 1LJRA 1K0CA 2VL2C 1A8YA 3TJFA 3D4MA 5JCUA 3APOA 1I5GA 1PX6A 4RI6A 1YEPA 4KDXA 5ABRA 2LUSA 2GZPA 3DWVA 2HXKA 2CX4A 3TCOA 2K8SA 2CQ9A 4GQCA 1EEJA 4GXZA 2P0GA 4GF0A 2MBTA 4K0GA 1X5EA 1XCCA 1JLVA 1FVJA 1DBYA 2DIYA 1Y25A 2DSAA 3E9JB 2E0QA 4XS1A 3LXZA 3NIVA 4ULXA 1A24A 2PVQA 3I6AA 2L4CA 3LFLA 3MDKA 1GL8A 4MJCA 3IRAA 1EP8A 5G5FA 1K0MA 1ZZYA 3KP9A 3NOFA 4MF5A 2AHEA 4N30A 4TR3A 1QGVA 3TOTA 5JWQB 1B9YC 2YANA 2F51A 3D6IA 2E2GA 5DALB 5DAKA 1J9BA 2H1AA 3IXRA 1AUCA 1JZWA 1SENA 4EF0A 1OC3A 3NZNA 1A0RP 1G7EA 3KM6A 14GSA 13GSA 3D22A 2CVKA 2HSYA 3F6DA 2CZ3A 1NHYA 2YV7A 3TKPA 4I8BA 5CREA 4EL1A 4PX1A 3EVIA 3WYWA 2I1UA 5IMAA 1SYXA 5A4UA 2CT6A 3QFBC 1ERVA 3GTUB 4FH8A 1XPVA 5AN1A 2FY6A 2V41A 3HJMA 2H19A 4HUAA 2OA7A 1SU9A 4K9ZA 2DJ2A 2YNXA 3KH9A 3ZMLA 2PUKC 3ZITA 2JL4A 2FHEA 5ECSA 3KCMA 4MZBA 3LJRA 3ZLPA 3DVXA 1K0OA 4HOJA 1K0BA 1B9XC 3ED3A 5DAKB 1GSSA 1AQVA 3KJYA 1OYJA 2IWTA 2F3MA 3H4KA 1LU4A 3HD5A 1XW5A 2LRNA 2C4JA 1S3CA 4I6XA 4FO5A 3ZFBA 4MF6A 4TXOA 3QDNA 1YDKA 4D73B 4TR1A 2B3SA 3GUSA 2JACA 5JCWA 3TKSC 5LCZA 4BVXA 4JR4A 1K3LA 2JZTA 3GIXA 4NMUA 4IP1A 3APQA 1B4QA 5AISA 4HU9A 1TJDA 3C71A 1MTCA 5DJMA 4KB3A 1BG5A 2GDRA 3CRTA 2JZSA 5G30A 1BAYA 2JADA 1THOA 4ZB6A 3GKNA 1XWBA 3HZ4A 4KSMA 4TRXA 4JU5A 3C7MA 2QC7A 2IMIA 4NV5A 1TDIA 2REMA 2YPMA 1V9WA 3P7XA 2B5EA 4WEYA 3EC3A 4KW6A 1YQ1A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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