4BA7A

Crystal structure of ancestral thioredoxin relative to last bacteria common ancestor (lbca) from the precambrian period
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
SVIEINDENFEEEVLKSDKPVLVDFWAPWCGPCRMIAPIIEELAEEYEGKVKFAKVNVDENPETAAKYGIMSIPTLLLFKNGEVVDKLVGARPKEALKERIEKHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords LBCA THIOREDOXIN
publication title Conservation of Protein Structure Over Four Billion Years
pubmed doi rcsb
source organism Synthetic construct
molecule tags Oxidoreductase
total genus 30
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.7.1.4:
pdb deposition date 2012-09-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ba7A00
1K3LA 1YY7A 1TJDA 2MZCA 4BWQA 4MZWA 4YQUA 1R5PA 2HSYA 3HCZA 2GS3A 5GAPD 4JE1A 3M9KA 2X8HA 4O32A 2C3TA 3ERGA 5CRHA 1BQ7A 2M80A 3M9JA 1PRXA 1YKAA 2PMTA 5AIVA 4DVCA 4JRRA 4EC0A 3FKFA 3GKNA 5J5NA 1B8XA 2GTUA 1M99A 1ACVA 1A8YA 1SYRA 4OFNA 4K0NA 2HZFA 3TKQA 3WYWA 4K8MA 3PGTA 5IOXA 3GV1A 4ECJA 3D21A 2H76A 2OKAA 1SJ6A 1AUCA 3EMXA 2CVKA 2C3QA 2LS5A 3GKXA 5ECNB 4KSOA 3ZTLA 2WCIA 5D93A 5H5SA 1XWCA 1LJRA 4JR4A 3GMFA 1Z6MA 2V41A 4PNGA 2IMDA 2B1KA 1VF4A 4N30A 1B4PA 2I4AA 1V9WA 3H4KA 5LD0A 5IO0A 6GSYA 1CQGA 4KNDA 2KUCA 1X9MB 2E0QA 4HQSA 2CAQA 2K18A 3KTLA 1AIUA 2VL3A 1ML6A 4I6XA 4P3YB 3G7YA 4KGIA 2RM5A 5DAKA 4GF0A 1V57A 2VL2A 4PX1A 4HS1A 1U87A 5D9WA 4G2EA 4H86A 3HZ4A 3LG6A 3F63A 2G2QA 1EGRA 4POBA 3APSA 4IQAA 2YJ7A 3CXGA 1RK4A 4MF6A 2OBKA 3A2WA 5JCGA 2MYGA 3KMOA 2GQKA 5GAND 2GT5A 4ZB8A 3TJKA 2OE0A 5ECRB 4TR4A 4K0GA 2DC5A 1Z9HA 2H73A 3UEMA 18GSA 2GLRA 4XTSA 1JZOA 1T1VA 4MP4A 4IJ3A 3I43A 2CA8A 3DGQA 1GSYA 4K7IA 2P5QA 1TXXA 2F3MA 4IKHA 3UARA 3CYNA 3H93A 3TUEA 2O89A 1M7TA 3KEBA 4O5RA 3KMNA 3O3TA 3ERWA 3PH9A 5HFIA 4K2DA 3I69A 4MJEA 2J23A 1GSEA 5D96A 2MMZA 4PUFC 5IMDA 2XPDA 1MDJA 4WETA 3M1GA 1GLQA 3DMLA 1OKTA 1WMJA 1NHYA 4OO4A 4OCEA 2GZYA 4ML6A 3IV4A 1NSWA 1H75A 4MA9A 5GSSA 4QL9A 1JLVA 4AGSA 3KH7A 2PN8A 4POLA 1VGLA 2Z9SA 1N8JA 3MSZA 4FYCA 5L71A 4HOJA 2FD3A 2IMIA 3E3EA 1MTCA 4PNFA 3D4MA 2DIYA 2RLIA 2ON5A 4TXOB 2JZSA 1HYUA 4K6XA 2VLVA 1XXUA 4MLYA 2CZ3A 4XS6A 3KH9A 8GSSA 4J57E 3EYTA 2H0GA 4GSSA 1MDKA 4HUAA 1DUGA 4PQIA 3G7JA 1SKWB 4KCAA 1QXHA 1EWXA 1TP9A 3CBUA 3KZQA 1G7EA 1QK8A 2IIYA 2WRTA 2X8CA 2FWHA 1R26A 2VL2C 1A0FA 3L9UA 2RIIA 3FR3A 3H8QA 5ECKB 3IXRA 1EV4A 2HZEB 3ZRDA 2TIRA 2H70A 3PINA 3GSSA 5C04A 2RUFA 2JU5A 3J7Yb 1HNAA 4V2LA 5EVOA 3QFAC 2WZ9A 3TRPA 3DVXA 5ABRA 1T3BA 3LYPA 3LYKA 2KP2A 1BAYA 4EDZA 2H72A 4JZQA 3GFKA 1V58A 3ME7A 4I2TA 3C8EA 1HQOA 1Z3EA 5HFGA 2YPMA 3G9BA 4ULXA 4WR4A 4EF0A 4LMWA 1MD3A 1O6JA 1SL2B 5ECLB 2PWJA 3KM6A 2IMEA 1THOA 1G6YA 3UBLA 2GSSA 1PQNA 3CRTA 2JADA 2LKUA 3VURA 1F9MA 4K7NA 2EC4A 1ZYEA 2NVLA 4EDYA 2FA8A 2NDOA 3TB2A 3N5OA 1XOBA 4IVFA 1LU4A 3KP8A 4EO3A 2XC2A 4MABA 3QAGA 2WFCA 2HXKA 3FR9A 3TCOA 2NBSA 1EP7A 5B6NA 1YZXA 2AUVA 2FCHA 2VD1A 2I3YA 1PSQA 1GNEA 3L9VA 5F06A 3ZIJA 4XRDA 2EIOA 1T8EB 1F6MC 3P90A 2V6OA 1TK0B 4NWYA 1X5DA 1QFNA 5KN3A 1O8XA 1O85A 1HNCA 4YQMA 4ID0A 3TGZA 3GN3A 4ZIJA 1PKWA 1XOAA 1F37A 5KEJA 4MK3A 3LJRA 2N5FA 3TKRA 1EOGA 2L6DA 2DJ3A 1XIYA 5EL8A 3UAPA 1XW5A 2C0DA 2H74A 5H5QA 3C1SA 2C4JA 2DJ0A 5ID2B 4HZ4A 4I5QA 5AIXA 2MMAA 4GSTA 4X1UA 1TTZA 5IMZA 4MDCA 1G0TA 1PMTA 4I2UA 1TU8A 1Q4JA 2EIRA 3IC4A 2V6KA 3DEXA 3W6GA 3QFBC 1XW9A 2K9FA 3O76A 3RPNA 1PA3A 3LFLA 4AF2A 2PVQA 4YH2A 4NV2A 2GVPA 1KBNA 5D8IA 4EUYA 1RQMA 2D2ZA 3EURA 4ACSA 2XHFA 3LEFA 3CTFA 2GSQA 2ALBA 3ERFA 1F2EA 4XS4B 2P5RA 4DSRA 5CRDA 3UL3A 2ON7A 5J41A 2F8AA 1EOHA 2WULA 4ZILA 4O7HA 3GTUA 5F07A 1T4ZA 2O7KA 5DCGA 1U88A 2HLSA 5F8BA 4IJIA 2GGTA 1M9AA 3VK9A 1QGVA 4RI7A 4XCSA 1M9BA 4GRFA 3VWUA 4XIHA 4K7OA 4DEJA 4NHZA 5KN2A 4LA1A 2PPTA 4NMUA 3VWWA 1ZMAA 3HY2A 5DQYA 3KTBA 1XFLA 5D73A 4K1FA 3JCML 3ME8A 1KTEA 3GH9A 4FIWA 20GSA 1U3IA 3D6IA 1EZKA 3GKKA 3ED3A 4TKYA 4IHUA 1ILOA 3ZLPA 1MDIA 1PL1A 3UMAA 4FYBA 3QOUA 4WXTA 2J9HA 1O8WA 3DKSA 2CZ2A 2RUEA 2FUG2 1SK2A 1TDIA 2H1DA 2WJUA 1WRYA 4BVYA 1XPVA 5FHIA 3MNGA 3C71A 4TW5A 2GSRA 5AGYA 4ZL9A 4PXOA 4HJ2A 1M2AA 1X0RA 1FW1A 2GDRA 1S3CA 4CHSA 2JZTA 5J4UA 3GIXA 4OCFA 4F2IA 4L0UA 1V98A 1XZOA 1BX9A 2TRCP 2XBQA 4MZCA 1V2AA 4ECCA 3QPMA 4LLRA 2JZRA 14GSA 5CRWA 12GSA 3IA1A 4D73B 5IMFA 4RI6A 4WF5A 3GX0A 2H6YA 1FO5A 1TI3A 2K8VA 2H1GA 10GSA 3TOUA 3I6AA 4EL1A 1WE0A 4WF4A 1JZDA 5G2ZA 4XHMA 3GX8A 4MH2A 2PVOC 5HR0A 2H6ZA 4OFMA 1FVJA 1UC7A 3F4RA 4ZXGA 1WWJA 1XVQA 5LCZA 2H1BA 5G31A 3EVIA 3ZVJD 3BJ5A 1USBA 3L4NA 2CX3A 3TRXA 6GSUA 3VWVA 2YZUA 2BMXA 1X9WB 2JSZA 3HDCA 4MF7A 1QQ2A 2H19A 2R3XA 3A2VA 5ECIB 5JWOB 3KJYA 3F6DA 1A2JA 2I1UA 5ENUA 1GTUA 3FHKA 3DWVA 3IE3A 4GTUA 4IW9A 1FAAA 1M0UA 2FWEA 3WT2A 2YWMA 3ZYWA 1FVKA 2FGXA 3EINA 4L0WA 3DYRA 3M3MA 1AXDA 3GL5A 4YQVA 4HI7A 1SYXA 4LMVA 3HXSA 4I8BA 3DIEA 3OR5A 2R37A 5B8BA 1ERTA 4F9ZA 5A4VA 1TRSA 5ECHB 3IRAA 1ERVA 2KLXA 3GKMA 1BYEA 4K9ZA 4JBBA 1H4OA 1YEXA 3ZIVA 5IMVA 4TR1B 1MEKA 2R5GA 5CP1A 3GURA 3LXZA 2VCWA 4PGTA 3RHCA 6GSSA 4L8EA 2A2SA 2FNOA 5AISA 1GUHA 4AJ8A 4N0VA 1X5EA 2GZZA 4XRAA 5ECMB 3P7XA 5HR1A 4F03A 4HZ2A 1UVZA 2H1AA 2FHEA 2HE3A 1TW9A 2NPBA 2YOIA 2L57A 4X0XA 4GQFA 3FZAA 3P8WA 3HJOA 3H1NA 2I9HA 3BD2A 2DBCA 5D9TA 3E9JB 4GCIA 3FZ4A 1A2LA 4ZB9A 3QDNA 2V32A 1XVWA 2OJLA 3L78A 5G5FA 2VD0A 1IYHA 4KDUA 3C7MA 4BWSA 4KCEA 4EXJA 2DMLA 4TN8A 2IN3A 1A23A 2C80A 2LJAA 4G19A 2XBIA 4QQ7A 2EIQA 4Q5RA 2OACA 5IPHA 2H71A 2F9SA 2H0IA 4RQRA 1T7PB 1WIKA 2L4QA 1T4YA 2YZHA 4TXOA 22GSA 3F0IA 1U3AA 1X9SB 1TRUA 5CRGA 1WP0A 1NM3A 5IIZA 1K3YA 4MMMA 1SL1B 2PGTA 1Q98A 2C0FA 1QUWA 2PUKC 1SU9A 2R6KA 4E8EA 1JHBA 3FY7A 3HYPA 2ZNMA 5ECSA 4FH8A 3UJ1A 2YANA 4BVXA 1UN2A 2DJ2A 2OBIA 4QL7A 5CYYA 1EP8A 3LORA 2CQ9A 5B7CA 2HZEA 3MDKA 2A4VA 4NXIA 2HNLA 3LWAA 6GSXA 2PBJA 2YWIA 3FR6A 4Q5QA 4EKZA 2YNXA 3TKSE 4FO5A 1XWKA 2WS2A 4F0BA 1W89A 3RAZA 3VI7A 1GTIA 2B6MA 4E8HA 4MCUA 3EU4A 1TKDB 1A0RP 1R4WA 2FWGA 3PR8A 3HVSA 4OFTA 3ZITA 1T00A 1SK1A 1ST9A 2WGRA 1Z6NA 2L5LA 1XW6A 4YAPA 2YJHA 3KGKA 3KP9A 4N11A 1I9DA 3HJMA 4BPYA 4MZBA 1B9XC 1YF0A 4MPFA 1UA5A 3Q74A 6GSTA 2OE3A 3CSJA 2DJKA 3Q19A 4V1Ag 2IMFA 2G0FA 4MJBA 5HR3A 5EPFA 1SD9A 4FYUA 2H6XA 3FZ5A 2B7JA 3CRUA 3TJFA 2ZCTA 2B7KA 1I5GA 5CO3A 4RUVA 1V40A 2IWTA 5CREA 2FLSA 3GHAA 5IPGA 1OKDA 3U6VA 1DE2A 4IQ1A 3GYKA 4NV5A 4J56E 3Q6OA 1JZRA 3BCIA 2CT6A 2LV3A 4NPBA 3WT1A 3FEUA 5IMCA 5B6MA 3CSIA 3EC3A 5KN1A 4TR3A 5DQSA 2HI7A 1U6TA 2HSHA 1B48A 1TRVA 3EWLA 4I97A 3KIJA 1GWCA 1OC9B 2YWNA 2L4CA 2V2GA 2V1MA 5DALB 3TJJA 3US3A 1VF2A 2LEGA 1TK8B 2GQLA 3SWLA 3KXOA 1PX6A 4IS0A 4NHWA 2LRTA 1SD8A 3EE2A 1GSFA 1Y25A 2O87A 4Q5FA 3ZFLA 2LQOA 3ZVJA 5HR2A 4ECIA 5KN0A 1HD2A 16GSA 1R5AA 1Z7RA 3DXBA 5ID2A 2DJJA 2IFQB 5IO2A 1Z5YE 4DSSB 3FW2A 2VM2A 4KB3A 4V1Ap 4N0ZA 1FB0A 5G1KA 2PU9C 4OMVA 19GSA 2XPEA 2AYTA 5DJMA 1BG5A 1PD21 5HQPA 3RPPA 2YV7A 3ZZXA 3LSZA 5IM9A 1GUKA 2HT9A 3TRQA 2JACA 4XS1A 3TJGA 1AW9A 3APOA 3F8UA 3KCMA 1J0FA 1EEMA 3Q18A 4IP1A 1ZCPA 4DSSA 4ZB6A 4XS4A 2K8SA 3QD9A 5DBQA 1SJZA 5INYA 1G6WA 4OD7A 1BEDA 3H79A 1TRWA 2H66A 2M72A 3GSTA 1M2DA 1FB6A 5J9CA 3IR4A 2QGVA 3RDWA 1WPIA 3DRNA 3VWXA 4PQHA 4EE0A 3KD0A 1O81A 3K8NA 2FA4A 1XWBA 3FZ9A 2H0HA 6GSVA 1XWAA 3GUSA 3VLNA 1VF3A 3BCKA 3ZMKA 2R2JA 3ZREA 4WBRD 3FK8A 1K0CA 2IL3A 1J08A 1ZGNA 1SJIA 4POKA 3W8SA 4PQ1A 1GNWA 1PL2A 1TU7A 4OWYA 2GT6A 1YQ1A 1VRSD 1GLPA 5D9VA 3MAKA 4HJMA 1A2MA 1AQXA 1GRXA 5HFKA 1GSDA 1KNGA 3EMPA 1ON4A 3C73A 2C8UA 1ZZYA 1OVNA 1SENA 4GSNA 2HFDA 1FHEA 5COHA 5DAKB 1THXA 1VF1A 2CAIA 2LNTA 3HHVA 2P31A 1DBYA 1W4VA 2O85A 2O8VB 5A4WA 3TKSC 4V2MA 5F05A 1K0NA 3N9JA 4KSMA 3NIVA 1SK0A 5FT3A 3BOAA 1YDKA 4GQCA 3UIWA 1HNBA 1XCCA 1K0BA 3QCPA 4IGJA 3GA4A 2GQMA 4L5LA 3TDGA 1JFUA 4D73A 2MBSA 2B3SA 1K3OA 2AHEA 4L5OA 4LL4B 2GZPA 3MWHA 5GZZB 5A5KA 2MBTA 3LGCA 3F3RA 3UVTA 2YN1A 3L0HA 1AQWA 3O6TA 1PN9A 4IP6A 2E7PA 4ISDA 4KW6A 3IK7A 2NTOA 2LUSA 1LBKA 3QR6A 2YWOA 1ERUA 2L5OA 1B4QA 4KDXA 4Z7XA 4HQZA 2F8FA 4MF5A 5J9BA 4JU5A 2VCXA 5DCHA 2VCQA 4CDOA 3HKRA 2OADA 1YJ6A 2FY6A 2WB9A 2DSAA 5GSTA 3C1RA 3I9V2 2BTOT 2C0EA 3EU3A 3GRXA 1AAZA 3CMIA 2BJXA 1DSBA 2VCVA 1PGTA 1GSQA 2DJ1A 4MH3A 2KHPA 3GH6A 3IAM2 4Q5NA 2L6CA 3RBTA 2RM6A 3ZFBA 4KE3A 1YF1A 5E59A 4JEDA 5DVBA 1EEJA 4ECBA 3A5WA 2N5AA 2QSIA 17GSA 4RQXA 2YCDA 5ECOB 5C00A 3IPZA 1E2YA 1E6BA 4TR1A 2LJRA 1S3AA 3WD6A 1M2BA 3F4TA 2F51A 2VCZA 1R7HA 4IELA 1K0DA 1X5CA 4F0CA 4F82A 1QMVA 3R2QA 1URMA 13GSA 3UVHA 4ZBAA 3F9UA 4LL1B 5ECPB 2C0GA 2LNSA 4AJ6A 3J7Yk 3BBYA 2AB6A 4MJAA 4EVMA 1GL8A 4GWRA 1BJXA 1FOVA 1AC1A 3UOMA 3VFIA 1AQVA 3IBHA 4KH7A 5G1LA 2LRNA 3F6FA 2MMNA 1Y6EA 2HRNA 2KP1A 5G5EA 3HVXA 3F4SA 2R4VA 3S9FA 5JCWA 3QMXA 1GP1A 2H8LA 1OE8A 2X99A 4NAXA 4X43A 4IBPA 3NOFA 3LQ7A 4HEA2 3WGEA 1OC3A 4GLTA 5CNWA 2IMKA 4AJ7A 11GSA 2CVDA 4ZL7A 2DMMA 1TOFA 4MPGA 2AV4A 1OYJA 9GSSA 1JLWA 3W8JA 4JR6A 3IAS2 5IMAA 4J2FA 4KX4A 2WDUA 4TRXA 2VLUA 1G7OA 5JWQB 5FWGA 1O73A 3G7IA 3RHBA 2PERA 2VCTA 2VLTA 5EY6A 2VO4A 2DLXA 4BA7A 5JWRB 4KUNA 1YEPA 4G10A 3AY8A 1JZWA 2VL9A 1O7UA 3QAWA 3FRCA 2KOKA 1A8LA 3TOTA 4WEYA 4WKWA 4MJCA 1WOUA 3WGDA 5LNKe 3HJPA 5B8AA 2QKEA 2B5XA 2LTKA 1OC8A 2ZUPA 5DJLA 1K0OA 2TRXA 1C72A 1EV9A 3V1WA 1SL0B 1NHOA 4WR5A 1GULA 4POMA 4YAVA 4ILFA 3HVVA 4G9HA 2LSTA 3VPQA 5CAXA 4ZL8A 1DE1A 4O92A 3TKPA 3FYGA 3IDVA 5E4WA 1XWGA 1NW2A 4DSQA 3DD3A 4OO5A 1ZYQB 3D4TA 5IQYA 2N5BA 2CX4A 5A4UA 3HD5A 4HU7A 1J9BA 4TR0A 1GSUA 1Z7PA 1PX7A 1IYIA 4IN0A 5DDLA 1F3BA 3A3TA 5D9XA 2ES7A 4TXVA 2DIZA 3SBCA 5AN1A 3CSHA 1FG4A 2LJKA 2JSYA 3VPTA 5G30A 2IJYA 2VIMA 3HA9A 1ZL9A 1OE7A 3UBKA 5H5RA 2L59A 1SKRB 3A2XA 4PUAA 2CVBA 5IOWA 1GTBA 1PKZA 3L9SA 3IK9A 2REMA 1K0MA 3WGXA 1RW1A 1CQHA 4HU9A 2GSTA 1ERWA 1K0AA 2H30A 4KA0A 2OE1A 3TKSA 3P2AA 1ZOFA 3IHQA 3E0UA 3GNJA 2B5YA 1GTAA 4TOPA 4N10A 2HYXA 4GXZA 2HRFA 1SKSB 1OC9A 1TK5B 1N2AA 3GTUB 4WBJA 2B5EA 3VI5A 3ISOA 2AJQB 2H01A 1WJKA 5DALA 1XBSA 2H75A 2C3NA 4CW9A 4ML1A 3F3QA 1A24A 3CTGA 4KAEA 2AAWA 2X8GA 2M46A 2VAFA 2I81A 4ZBDA 3ZMLA 3U5RE 2VUPA 2JL4A 1MD4A 4PURA 3APQA 5ELAA 2YV9A 6GSWA 4HDEA 3TJBA 5F0GA 2P0GA 3GL3A 2K6VA 1S3DA 1GSSA 1OAZA 2C1YA 2IFQA 2A2RA 4V2NA 4TVEA 1B9YC 1KEBA 3M0FA 3QAVA 2E2MA 3DVWA 2YP6A 1GH2A 4ZBBA 2E2GA 3NZNA 3ZL5A 5ELGA 5J3RA 2LRCA 2FWFA 5ECQB 4BL7A 2VM1A 4KDYA 1YKCA 7GSSA 2CV4A 2OA7A 3D0ZA 1F3AA 3LXTA 2LQQA 1EGOA 2MMOA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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