2K18A

Solution structure of bb' domains of human protein disulfide isomerase
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
228
structure length
228
Chain Sequence
b'GPLGSPAATTLPDGAAAESLVESSEVAVIGFFKDVESDSAKQFLQAAEAIDDIPFGITSNSDVFSKYQLDKDGVVLFKKFDEGRNNFEGEVTKENLLDFIKHNQLPLVIEFTEQTAPKIFGGEIKTHILLFLPKSVSDYDGKLSNFKTAAESFKGKILFIFIDSDHTDNQRILEFFGLKKEECPAVRLITLEEEMTKYKPESEELTAERITEFCHRFLEGKIKPHLMS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution structure of the bb' domains of human protein disulfide isomerase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Protein disulfide-isomerase
source organism Homo sapiens
molecule tags Isomerase
total genus 47
structure length 228
sequence length 228
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2008-02-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13848 Thioredoxin_6 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2k18A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2k18A01
4KNDA 2H6ZA 1OAZA 4IP6A 2IMEA 2CA8A 2IIYA 1NHYA 5JWRB 4KCEA 1UC7A 3IHQA 1ML6A 1BYEA 3QD9A 3TDGA 3O3TA 3SBCA 3BBYA 5DCGA 3TB2A 3F9UA 3EURA 4LMWA 4OD7A 3D21A 2MBTA 2H1GA 1IYIA 4XRDA 3KTBA 4F82A 1PSQA 3CXGA 2DJKA 1U3AA 4RQRA 5JWOB 1K3YA 2K18A 1TTZA 1S3CA 2PUKC 2DLXA 4K7OA 2BTOT 3QAVA 3MNGA 3TCOA 1NSWA 5JCWA 5IMFA 2A4VA 3GKMA 2LEGA 1V57A 10GSA 3DMLA 2VAFA 6GSUA 4LLRA 4XHMA 3UIWA 3L9UA 3ZZXA 4EKZA 1PRXA 4BVYA 4G19A 2YWIA 2I3YA 5C04A 1GTIA 5IMAA 4MJCA 2IN3A 1H4OA 4ECBA 3KZQA 1OC8A 1BJXA 1J0FA 4FH8A 3A5WA 1F3AA 3NZNA 4MMMA 1FAAA 2REMA 3CTGA 2HE3A 4PUFC 1SK2A 2XPEA 2PERA 3MDKA 1EP8A 4KSMA 1YF0A 3IAS2 3ERWA 1XW5A 3HJPA 1XBSA 20GSA 1PX6A 2QKEA 3F63A 1OE8A 2LSTA 1G0TA 2VCXA 4KDXA 1OKDA 1XIYA 2FWEA 5ELGA 2OBIA 4GTUA 3HXSA 1TRVA 2DJJA 2LS5A 3F6FA 2R3XA 1WWJA 4N10A 5J9BA 4N30A 4AGSA 1F9MA 4KW6A 1GLQA 1O8WA 16GSA 5EPFA 1V2AA 4MJEA 4POKA 2K8SA 5IPHA 1A8YA 1THOA 4O5RA 4NHWA 5HFGA 1TU7A 2YJ7A 5J41A 4V1Ag 4F0BA 4YAVA 1AC1A 6GSSA 3PINA 4HZ4A 1J9BA 1JLVA 2GT6A 4NWYA 2B3SA 3G9BA 2H6YA 3F6DA 4DVCA 1ZGNA 3VWXA 5FT3A 1K0AA 5IOWA 4ZB9A 3U6VA 1HYUA 1A24A 2GZYA 4P3YB 3FK8A 2G2QA 1FG4A 4YQUA 2AHEA 2PMTA 2VM2A 4JU5A 3CSHA 6GSWA 3H4KA 3DKSA 3O76A 4TR4A 1SK1A 3ZLPA 4GRFA 1GNEA 5KN2A 1KBNA 5CRDA 5IMCA 2FLSA 4MCUA 1SKWB 1GTBA 4KGIA 1UN2A 4WETA 3E9JB 3RBTA 2AB6A 3V1WA 3K8NA 4K7NA 4FYCA 4PGTA 5GZZB 1XVQA 2O85A 1YJ6A 2DMLA 2FWHA 3D6IA 2B1KA 3TKPA 3HJMA 2DJ0A 14GSA 3EC3A 2FCHA 3E3EA 1M2DA 1XVWA 4XS6A 2YV9A 2CX4A 5ECHB 4MA9A 2PVQA 3GKKA 5EY6A 2M46A 1ERVA 2C8UA 1GL8A 4I2TA 2E7PA 2XHFA 2HRNA 3H1NA 2MMOA 1GTUA 3A2XA 1E6BA 3FZ9A 3WT1A 1ERWA 1QMVA 1OE7A 4ZB8A 3GYKA 3I69A 1WRYA 4MF7A 2H66A 4MH2A 3MSZA 3VI7A 4I5QA 1YEXA 4MPGA 5D8IA 4EDYA 3Q74A 1FVKA 1ERTA 2TRXA 5LD0A 1VGLA 4DSQA 2H1BA 2M80A 3M8NA 4ECIA 5HR2A 2GSRA 1GULA 1MTCA 4RI7A 4MJAA 3GX0A 1SENA 2H1DA 2GSTA 5AISA 3DIEA 1OC9B 4O92A 4N0ZA 3I6AA 1NM3A 5A4UA 3IR4A 4EO3A 4POMA 3HY2A 5F0GA 5D9VA 2IWTA 3ZYWA 3BOAA 2K6VA 3J7Yk 4H86A 2HXKA 4K6XA 2WRTA 3TRXA 5IIZA 1GSEA 3H93A 5AN1A 3ZL5A 2E0QA 4GSSA 2I9HA 3UL3A 3ME7A 1ZL9A 2FWGA 3TKSC 2WB9A 3EU3A 5DQYA 4NXIA 3E0UA 11GSA 1A23A 1PL1A 3DD3A 1PGTA 4RI6A 1R7HA 3CBUA 1K0MA 5D9WA 4MH3A 1N8JA 1SJIA 3TJKA 1TW9A 3IK7A 4OO4A 2FHEA 1PKZA 4EVMA 3EE2A 2X8CA 3KH7A 3LGCA 1LU4A 1URMA 2F8FA 3LXTA 4EUYA 4XS1A 1GUMA 1TK5B 1CQGA 2MBSA 1F37A 4ZBAA 4WBJA 1EEMA 3APQA 3CSIA 1GTAA 2HFDA 3CYNA 4Q5QA 12GSA 3VWWA 1M9BA 2JSYA 2C80A 1EOHA 5DJMA 5G1LA 3RPPA 5IQYA 2GZPA 3FHKA 5ECIB 2JADA 5ECOB 5IM9A 3DEXA 2L4CA 2O7KA 3F0IA 4BWSA 2LTKA 2VLUA 3UBKA 4BVXA 1WMJA 2X99A 2IMIA 5JCGA 3RAZA 3ZREA 4HEA2 1DE2A 2JACA 2OE1A 3L78A 5A4WA 2HZFA 3EVIA 1YKCA 1X5CA 1ILOA 4K2DA 1MDJA 2V41A 1X5DA 2HI7A 2CZ2A 3D5JA 5H5RA 2OE3A 1WJKA 3HZ8A 1BX9A 4KDUA 5CREA 1ERUA 5ID2B 5ABRA 2GS3A 3GURA 1Q4JA 5F07A 6GSXA 1O73A 2YN1A 2LNTA 2WDUA 3GHAA 2YWOA 2MMZA 4JR6A 2YV7A 1S3AA 1TRUA 4I6XA 3TKQA 4FO5A 5G2ZA 3TOTA 2VLTA 3A3TA 4L8EA 4AF2A 3IRAA 3M9JA 1GRXA 3IE3A 1XXUA 2AYTA 1YEPA 2IJYA 5G5FA 1ZYQB 1FO5A 1B4PA 1FB6A 1A2MA 1XW6A 3HCZA 1GNWA 2CT6A 3C1SA 3AY8A 4XS4A 3GKXA 1TJDA 3HHVA 4OMVA 1I9DA 22GSA 4PQIA 1K0NA 3ZIVA 4TVEA 2VL2A 1HNAA 3D0ZA 2F8AA 3C71A 4TKYA 2RM5A 3CTFA 2CZ3A 5DVBA 2NBSA 5GAPD 4KX4A 2LQQA 2PVOC 1Z6MA 3KP8A 5KN3A 1YQ1A 3P2AA 5FWGA 1F2EA 1GSYA 1V98A 2X8HA 4JBBA 5B6MA 4RQXA 3P90A 3N5OA 4WXTA 4WEYA 3WGEA 2RUEA 4YQVA 2VUPA 1Z7RA 4K0NA 1R26A 1ABAA 1LBKA 4ZBBA 4IVFA 1PKWA 4ECCA 2VD1A 3KIJA 3IDVA 2IFQA 3FYGA 2V32A 1OC3A 1K0CA 2K9FA 2YNXA 3KMOA 3ERFA 1GUKA 4BPYA 4HZ2A 3ZTLA 4IQ1A 4WR4A 4EDZA 2VM1A 1LJRA 1GSFA 2GTUA 3FR9A 3FZ5A 4TXOA 5HFIA 5ECKB 1YKAA 5B7CA 4BWQA 4V2MA 4NMUA 4F0CA 5L71A 5AGYA 5F06A 5EL8A 1EZKA 5GSSA 1PA3A 1UVZA 2F51A 4MF6A 2H0GA 2OJLA 3HDCA 1EGOA 3NIVA 2R37A 4EE0A 5CAXA 3FKFA 1ZMAA 4IGJA 3LSZA 1XWGA 2WGRA 2HZEB 2EC4A 4ZXGA 3PR8A 4JZQA 3UAPA 4XS4B 3MWHA 1B4QA 3RHCA 2ZUPA 4X1UA 3VWVA 2V2GA 2ES7A 2QGVA 2N5BA 4QQ7A 4MP4A 1GWCA 4Z7XA 5CP1A 1EV4A 3F3RA 1T8EB 5ECQB 4OFMA 4WBRD 3IAM2 3FZ4A 5ECRB 1X9SB 5IMVA 1EGRA 2J9HA 1XCCA 4IELA 3H79A 3WD6A 5E59A 1Z9HA 8GSSA 4AJ8A 2B6MA 3JCML 4WF5A 5CRWA 4ZB6A 1SYRA 1EV9A 5KN1A 2CQ9A 5J5NA 5ECLB 2VCWA 1SD9A 2CVBA 5IOXA 3F4SA 2IFQB 2GZZA 4GQCA 5G5EA 1TK0B 1VRSD 2X64A 1AQVA 5DAKA 1TP9A 2A2RA 4TR1A 1XWCA 1ZOFA 5DBQA 4IJIA 3WYWA 1M0UA 2WJUA 4LMVA 4OCFA 2FUG2 2E2GA 4TXOB 2E2MA 3L4NA 3LG6A 1JZOA 4ULXA 1O7UA 1OC9A 2PBJA 3WT2A 4K0GA 3ZMKA 4DSRA 1T3BA 5ECPB 2DJ2A 2Z9SA 3GFKA 2O8VB 2LJKA 4L5OA 4JR4A 1NHOA 1AXDA 1EP7A 2AAWA 2NTOA 4L0UA 5GSTA 2A2SA 2YWNA 2GQKA 3VK9A 4DSSB 2ON5A 4GSNA 4N11A 2LKUA 4GXZA 4ZILA 5CRHA 1CQHA 2VL9A 4HOJA 4O7HA 2R2JA 1U88A 2H73A 4Q5NA 1X9WB 1OYJA 3TJGA 2IMKA 2BMXA 3HA9A 3C1RA 1IYHA 1JLWA 1GLPA 5ECNB 3N9JA 2P5QA 5C00A 2B7JA 3GKNA 2QC7A 2C0DA 6GSTA 4F9ZA 5JWQB 3GH9A 2LJRA 2CAQA 5J4UA 4MZBA 1V58A 9GSSA 1J08A 2KP1A 3LORA 1RK4A 4DEJA 2GQLA 2H76A 1A0FA 1ZZYA 1F6MC 2VL2C 3IC4A 2RIIA 1KNGA 4KE3A 1HNCA 2F3MA 4I2UA 3FEUA 2KLXA 4V2LA 2KP2A 1O85A 5DAKB 2BJXA 5D96A 3APOA 4TR1B 4POLA 1Z5YE 1DBYA 1YY7A 5E4WA 1SJZA 1VF1A 2HNLA 4X43A 3QCPA 4GCIA 2JU5A 4ACSA 2GSSA 1EWXA 5DDLA 3LFLA 3BD2A 1U87A 3TJJA 4NPBA 3DYRA 3D4MA 2JSZA 4KA0A 2VOCA 4Q5FA 1Y6EA 3D4TA 1YZXA 3KGKA 3F4RA 3W6GA 2V1MA 2J23A 4FYUA 4QL9A 2VIMA 4EXJA 6GSYA 4NV5A 3HVXA 4BL7A 4JEDA 5ID2A 2FY6A 5D73A 2DIZA 1GSQA 4GLTA 2P0GA 3IA1A 4ECJA 3A2WA 3GSTA 2HT9A 4K1FA 1V40A 3HVSA 3VFIA 2X8GA 1TDIA 3ED3A 1VF4A 1GP1A 2EIRA 1MD3A 2KHPA 2FA8A 2YWMA 5B6NA 4ISDA 4NV2A 3ERGA 4TOPA 2L6DA 4G10A 4Q5RA 2CX3A 2H0HA 1DE1A 4PQHA 4TRXA 4AJ6A 1GSSA 1FHEA 1R4WA 2YCDA 1K0BA 1SJ6A 3UEMA 3IV4A 4IKHA 1U6TA 4RUVA 3Q18A 2DJ3A 3EMXA 3UARA 2N5FA 3CRTA 1KTEA 4FYBA 5HR1A 1ZYEA 3GH6A 3IXRA 2WFCA 3GA4A 4PNGA 3QAWA 2EIOA 1XOAA 2O87A 1XPVA 2C1YA 1PD21 1TRWA 5B8BA 2LV3A 1PL2A 3J7Yb 4HU9A 5D9XA 3G7JA 3ME8A 4HQZA 3Q6OA 4WKWA 1TXXA 4MDCA 3ZFLA 2NVLA 3L0HA 1QXHA 3KEBA 3KM6A 2KUCA 3EINA 5ECMB 5IMDA 1A8LA 4OO5A 1R5PA 1B9XC 4OFNA 1MEKA 1SKSB 2RUFA 2H30A 2OACA 1FOVA 3HVVA 2EIQA 2WULA 3FZAA 5AIVA 2HYXA 2DIYA 4GWRA 3CRUA 4FIWA 1QUWA 2XBIA 5IO0A 3QFBC 1PQNA 7GSSA 1O6JA 1PN9A 3DXBA 1M2BA 3CMIA 3BCIA 4TXVA 4XCSA 3GRXA 2YOIA 1RQMA 3HZ4A 5G30A 4MF5A 1KEBA 2GVPA 1JZRA 1DUGA 2HZEA 2YANA 5ENUA 5G31A 2CVKA 5LNKe 1TI1A 4MLYA 2XC2A 4EL1A 1TU8A 3BCKA 3UVTA 3LQ7A 4XRAA 2R5GA 2H71A 2L6CA 3QFAC 2H01A 5KEJA 1SD8A 1W4VA 3UVHA 4LA1A 5H5QA 3ZVJD 1HD2A 1Z3EA 2VL3A 5CO3A 3DWVA 3P8WA 2L5OA 4MPFA 4L5LA 4GF0A 4TW5A 4YAPA 2LQOA 1AQWA 3VWUA 3GTUB 5ECSA 4AJ7A 1TRSA 2VCTA 2L5LA 4ZIJA 2IMDA 2HSHA 2CV4A 4WR5A 2GLRA 2V6KA 3P7XA 3NOFA 3PGTA 3TKRA 5HQPA 2IMFA 2C3QA 2RM6A 3U5RE 1SKRB 1MDIA 3ZIJA 3LYKA 4K7IA 1F3BA 2K8VA 3FR6A 4LL1B 2C0EA 4J2FA 1T7PB 5A4VA 3DVWA 3QDNA 3F3QA 4IQAA 4ML6A 4IJ3A 1RW1A 1EOGA 4MABA 2OADA 3GUSA 2JZRA 2LJAA 1GSUA 1A2JA 3G7IA 2B1LA 4XIHA 3TGZA 1R5AA 4IW9A 1HNBA 3LEFA 3G7YA 4QL7A 1XZOA 2WCIA 4YQMA 1ST9A 3RHBA 2YZUA 5J9CA 6GSVA 5CYYA 1AAZA 3TKSA 2DMMA 3KH9A 2GGTA 2AV4A 3I43A 2G0FA 4E8EA 2VCZA 2YZHA 1I5GA 3M3MA 4DSSA 2NPBA 4HJ2A 1THXA 3EYTA 1TOFA 3EMPA 1K0OA 3M1GA 1PMTA 3GL5A 1HQOA 2LRCA 4KUNA 3TOUA 4LL4B 1EEJA 2ON7A 2MZCA 1UA5A 1XWAA 2PN8A 3ZRDA 1K3LA 5DCHA 3QAGA 2ZNMA 1WE0A 3QR6A 1G6WA 3UMAA 2MYGA 3DGQA 1SL2B 1Q98A 5A5KA 2GT5A 4MZCA 2FA4A 2WZ9A 4N0VA 2C3TA 3GL3A 3VPQA 4PQ1A 3EU4A 2C0FA 1M9AA 2N5AA 3ZFBA 2OA7A 1BG5A 3W8SA 4BA7A 4IN0A 2GQMA 3R2QA 5IPGA 3KMNA 2DBCA 4CHSA 19GSA 4KH7A 1H75A 1T00A 4HUAA 1S3DA 5IMZA 4CDOA 2H74A 4TN8A 13GSA 1JZDA 1XWKA 2PU9C 2ZCTA 1K3OA 2B5XA 3TUEA 1WOUA 1B9YC 2TIRA 1T1VA 2LRNA 2PGTA 5CRGA 5ELAA 1GUHA 2JL4A 1QFNA 1M7TA 3GSSA 1X9MB 2CAIA 4JE1A 2R6KA 3UBLA 2I4AA 2HSYA 2GDRA 3LYPA 5D9TA 1SK0A 4HJMA 4ZBDA 1Z6NA 2QSIA 3TKSE 1BQ7A 2XBQA 5H5SA 3M9KA 1N2AA 2VCVA 5D93A 4V1Ap 1WPIA 4PNFA 4PXOA 1SYXA 4L0WA 2C3NA 3GX8A 2PPTA 3VLNA 5JCUA 2M72A 4HS1A 3GIXA 4D73A 4G2EA 1FW1A 4WF4A 2PWJA 2LNSA 4V2NA 2FWFA 4MJBA 4XTSA 1X5EA 1B8XA 3C7MA 4KCAA 5EVOA 1AUCA 2V6OA 1G7OA 2LUSA 3KJYA 2FD3A 3HYPA 3UJ1A 5J3RA 4J56E 2HRFA 2JZTA 1VF3A 4F2IA 1YF1A 1BAYA 2CVDA 4NAXA 5GAND 3OR5A 3BJ5A 3UOMA 1W89A 2MMNA 4OWYA 2H1AA 3H8QA 1K0DA 17GSA 2ALBA 2L59A 2VO4A 1WP0A 1G7EA 2TRCP 3Q19A 1PX7A 4J57E 2DJ1A 4HU7A 3KXOA 1FVJA 2RLIA 4K8MA 4GSTA 2DC5A 3ZVJA 2D2ZA 2H75A 4PURA 3C8EA 1TI3A 3M0FA 1C72A 2LRTA 4GQFA 4ZL9A 2VLVA 4MK3A 4KSOA 2P31A 1G6YA 1JZWA 3HKRA 2F9SA 4JRRA 4ZL8A 3CSJA 2OKAA 1XWBA 3HJOA 2DSAA 1MDKA 2YJHA 1SL0B 1DSBA 4I97A 3FY7A 4X0XA 3F8UA 2H8LA 2HLSA 3LXZA 3TRQA 1M99A 2OBKA 2JZSA 4IBPA 4OCEA 2YP6A 3D22A 1T4ZA 1XOBA 1X0RA 3FR3A 4D73B 2IPAA 3KD0A 4G9HA 4ML1A 3C73A 5DJLA 1QK8A 4KDYA 4PUAA 18GSA 1XW9A 1E2YA 1Y25A 5COHA 2I1UA 3VPTA 5LCZA 1YDKA 4I8BA 4EF0A 1ZCPA 3GNJA 1U3IA 4E8HA 3W8JA 3L9VA 4ZL7A 3I9V2 1QGVA 3GMFA 2AUVA 5DALA 3MAKA 4ILFA 3LWAA 3KP9A 3APSA 1JFUA 1Z7PA 2B7KA 1JHBA 5FHIA 1V9WA 2KOKA 3A2VA 3IOSA 2I81A 4O32A 1ON4A 3KTLA 4OFTA 2C0GA 3GTUA 2L57A 2C4JA 2R4VA 4HQSA 1XFLA 2IL3A 4CW9A 3TJFA 3L9SA 3DVXA 4TR3A 1A0RP 5HR0A 1OKTA 3IPZA 2NDOA 5HFKA 4NHZA 1MD4A 3S9FA 4YH2A 1A2LA 4POBA 3FW2A 2AJQB 2OE0A 4ID0A 1FB0A 1NW2A 2B5EA 2FGXA 1OVNA 1B48A 5F8BA 2B5YA 3O6TA 1VF2A 2FNOA 4K9ZA 2VCQA 4HDEA 3TRPA 4IP1A 2H70A 5INYA 3WGXA 3QOUA 3IBHA 5F05A 1GH2A 5B8AA 5IO2A 2H6XA 1AW9A 3RPNA 3HD5A 1O81A 2L4QA 1WIKA 3GV1A 3VURA 4EC0A 4KAEA 4KB3A 1ACVA 1USBA 1O8XA 4F03A 3FRCA 5KN0A 3WGDA 3GN3A 5CNWA 2YPMA 1AIUA 1QQ2A 1BEDA 1T4YA 3PH9A 4HI7A 2P5RA 4MZWA 2MMAA 1AQXA 5G1KA 3QMXA 5DQSA 1TK8B 5AIXA 2XPDA 3TJBA 4IHUA 1M2AA 2H72A 3ZMLA 3EWLA 3US3A 4PX1A 3IK9A 3RDWA 3KCMA 5DALB 2H19A 3SWLA 2H0IA 4TR0A 2VD0A 3ZITA 3F4TA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite