2K18A

Solution structure of bb' domains of human protein disulfide isomerase
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
228
structure length
228
Chain Sequence
GPLGSPAATTLPDGAAAESLVESSEVAVIGFFKDVESDSAKQFLQAAEAIDDIPFGITSNSDVFSKYQLDKDGVVLFKKFDEGRNNFEGEVTKENLLDFIKHNQLPLVIEFTEQTAPKIFGGEIKTHILLFLPKSVSDYDGKLSNFKTAAESFKGKILFIFIDSDHTDNQRILEFFGLKKEECPAVRLITLEEEMTKYKPESEELTAERITEFCHRFLEGKIKPHLMS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Protein disulfide-isomerase
publication title Solution structure of the bb' domains of human protein disulfide isomerase.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 47
structure length 228
sequence length 228
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2008-02-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13848 Thioredoxin_6 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2k18A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2k18A01
3CTFA 4ID0A 2BJXA 2V6OA 4PURA 3PGTA 2L5LA 1X5DA 4ISDA 5CRDA 2H71A 2B5EA 1TJDA 1WOUA 1Z3EA 3IK9A 2C1YA 3BD2A 2B1LA 2H1DA 2FWGA 2J9HA 2PVOC 2YZHA 1K0MA 2O87A 4EO3A 5JCGA 5ECNB 4CHSA 1XCCA 2HSYA 2VD1A 1I5GA 4DVCA 5IM9A 3D0ZA 1EEJA 2HYXA 3J7Yb 4LA1A 1GNEA 3HD5A 1XPVA 2HLSA 4YAVA 4ZB6A 3VPQA 5G2ZA 3TJJA 4EF0A 3TKRA 1DUGA 2HXKA 2EIRA 3C71A 4POKA 2DLXA 2YWNA 3F4TA 1T8EB 3GL3A 1YY7A 2C0FA 2E2MA 2FCHA 2AJQB 4D73B 3FY7A 2DIYA 4WR4A 5CO3A 4KCAA 4NHZA 3FZAA 4OWYA 4WEYA 1QUWA 1XOBA 4MZCA 3PINA 1WMJA 1U3AA 2K9FA 2RLIA 1AXDA 4X43A 4I97A 5JWQB 3M9KA 2XBIA 1SKSB 1SU9A 3HJPA 2YWMA 3UEMA 1C72A 3EYTA 4RI7A 4RI6A 1S3AA 4F0CA 4KE3A 1BAYA 3QOUA 3ZZXA 4XS6A 1BG5A 3E9JB 5G1LA 2MZCA 2LQOA 1S3DA 3CYNA 4MPGA 3H93A 2O7KA 4KDYA 4PUFC 1PQNA 3TRQA 2LRNA 4NMUA 1RW1A 4ZL9A 2MMAA 1OAZA 7GSSA 2XHFA 4V1Ag 1GSYA 1XBSA 2LRCA 1XIYA 4PQIA 3WYWA 1PL1A 2KP2A 5A4WA 4ZL8A 3IA1A 1B9YC 5H5SA 3DD3A 1SL0B 3RHBA 5JWOB 2P0GA 4KDXA 1ZZYA 2H6YA 4RQXA 2YP6A 3LWAA 5ENUA 1SENA 1ERTA 4TOPA 2B5XA 2GSTA 3HA9A 5F0GA 2R5GA 2ES7A 3HHVA 3BJ5A 1VF3A 2DC5A 2RUFA 3H4KA 4MZWA 2YOIA 1ILOA 1AQXA 1ZOFA 5E59A 5F05A 1SL2B 1B4QA 4MZBA 2L57A 2VAFA 4KB3A 3ZITA 3P90A 5AN1A 3VLNA 5KN3A 1H4OA 4WR5A 3GKKA 4PXOA 1U6TA 2CQ9A 5B8BA 3F9UA 3DEXA 5ECMB 2DJ3A 5DCGA 2GGTA 1M99A 2VL9A 3Q6OA 1YF0A 4FYBA 2LV3A 2IMKA 4Z7XA 3EMPA 1X9MB 1AQWA 1T4YA 5DJLA 5H5QA 3TJFA 3WGXA 5ECHB 2L4CA 2IL3A 3N9JA 5IPGA 3WT1A 4MH2A 4G10A 2WCIA 2XC2A 3GX0A 5GSTA 4KW6A 2LS5A 5D9VA 1RK4A 5B8AA 2IMDA 4EXJA 1CQHA 1G6WA 3NOFA 4Q5NA 4ZIJA 1MEKA 1BX9A 2NTOA 4OMVA 3MNGA 4KX4A 4IJIA 5IMVA 4K9ZA 2VL2A 3H79A 1TRSA 3QAWA 1R5AA 3H1NA 2NBSA 5DDLA 3FR3A 3L0HA 5D73A 1WPIA 2LRTA 2AYTA 2GSRA 4K7NA 1GSQA 1TRVA 3F3RA 3QCPA 3ZVJA 1XWKA 3TGZA 3Q19A 3KIJA 2VOCA 4Q5RA 1ERWA 5ECLB 5DQSA 3AY8A 4XIHA 3TDGA 4K0NA 4H86A 3GURA 4MF7A 4YQUA 3BOAA 2RM5A 5G30A 8GSSA 1F9MA 1FB0A 3KJYA 1JZWA 3IAS2 5CRGA 2L6CA 1SKWB 2A2SA 2ON5A 4POMA 1AIUA 3KTLA 2C0GA 3D6IA 3IK7A 2CAIA 4KCEA 5HFGA 1GRXA 2LJAA 5F07A 3ZMKA 3UARA 4OFTA 3VURA 3IDVA 5DQYA 3TCOA 5LCZA 3CTGA 4PNGA 1GSEA 4I5QA 4PNFA 4QL9A 2YN1A 1G0TA 2IIYA 1M9BA 4BVXA 4NXIA 5GAND 3GHAA 4G2EA 3APSA 3LXZA 5CRWA 1X0RA 1HQOA 1T3BA 3GL5A 1TP9A 2OKAA 5FT3A 1EZKA 1F2EA 1WJKA 5DBQA 1SYXA 5AIXA 1WIKA 2TRCP 3KMNA 4X0XA 2ALBA 3TKSC 2H1BA 3LEFA 1UA5A 2Z9SA 2MBSA 4MMMA 4XTSA 4MK3A 5EL8A 2H19A 4PGTA 2YZUA 4MPFA 4YH2A 2JSZA 3P2AA 1ZL9A 2GSSA 4NV5A 1TK8B 5KN1A 4JE1A 1SJ6A 4HDEA 4MJAA 1EEMA 3TB2A 1GP1A 3Q74A 3BCKA 3IHQA 2H70A 1ZYQB 1AQVA 1O81A 2VCWA 1UVZA 4F9ZA 4WETA 3IRAA 4E8EA 2JACA 2X64A 3NZNA 1LJRA 1MD4A 1NHOA 4TVEA 3CSHA 4ZB9A 2KLXA 2PVQA 5CREA 2A2RA 1A23A 2LKUA 2O85A 2P5RA 2IMIA 4I2UA 4IP1A 6GSSA 1O7UA 2ON7A 1OC8A 2XPDA 1GTIA 3M8NA 3HVVA 1GUHA 2PUKC 2A4VA 2G0FA 3U6VA 4DSSA 2C3TA 1T7PB 1THOA 3ZIVA 4KA0A 3G7IA 3IOSA 2QKEA 2DSAA 1LBKA 1V2AA 2MYGA 3UMAA 2FY6A 5J3RA 1URMA 3TKPA 2XPEA 4O92A 4L5LA 1K0CA 3GA4A 1NW2A 4KDUA 14GSA 5A5KA 2ZUPA 2HI7A 1UC7A 5ID2A 3ERFA 4L0UA 4OCFA 3ZFLA 2X8GA 2GTUA 5CYYA 3ISOA 4XRDA 5J4UA 4YAPA 1W89A 3A2XA 1PKWA 2HRFA 5ECQB 3M9JA 5D9TA 1A2JA 4N0VA 1SK0A 3HVXA 2IWTA 3MSZA 1A8YA 1K0DA 2H30A 3QMXA 3ZVJD 4HQSA 3QR6A 4FYUA 5D9XA 2GT5A 2DJ1A 2JZSA 3DXBA 1XWCA 1EOHA 4TW5A 4IHUA 4IQ1A 3UIWA 5ID2B 4JBBA 4N0ZA 1SJIA 2GLRA 1ML6A 3VPTA 2X8HA 3D5JA 5IOXA 1FOVA 3E3EA 2DJ0A 5EPFA 4HJMA 5ECOB 2OA7A 2D2ZA 2LTKA 2H74A 2H76A 1TI3A 1XWAA 12GSA 3FR6A 5GSSA 3L9VA 2HZFA 2EC4A 2K8VA 5KN0A 1YEPA 4GF0A 1M2AA 2B7KA 3L9UA 4ML6A 2H01A 4MP4A 3Q18A 3GFKA 5IMFA 1FHEA 2ZNMA 3CMIA 2MMNA 1TOFA 1PD21 1F37A 4OO4A 3IR4A 4D73A 4KSMA 4ECCA 2L6DA 1JZOA 4K7OA 1USBA 3GMFA 2PBJA 5HR1A 2F8FA 2GQLA 2WDUA 3GV1A 2XBQA 2CVKA 4JRRA 2VIMA 2FWFA 2AUVA 1YF1A 2YWIA 4WF4A 3C7MA 2LUSA 2E2GA 3LJRA 3DVWA 2IPAA 2F51A 2LNTA 2O89A 3DRNA 2LNSA 5J41A 1BEDA 2CZ3A 3CRUA 3NIVA 3L4NA 4JEDA 4MH3A 2REMA 5AISA 3EINA 4IGJA 4KSOA 4XS4A 2C0EA 5HR2A 2VLUA 1MDIA 2AHEA 4DSRA 3V1WA 2TRXA 4HI7A 5A4VA 4MLYA 1Z5YE 2R4VA 3EVIA 3QAVA 3FR9A 3O3TA 5IMAA 1TTZA 4N10A 1KTEA 2IN3A 1M9AA 1K0NA 1EP8A 5D8IA 1PKZA 1Z9HA 4QL7A 4TR3A 2VCZA 4XS4B 4I2TA 3FYGA 3FZ4A 2L4QA 4ZL7A 4ECIA 5HR3A 1VRSD 3HYPA 3KP9A 1Y6EA 4IP6A 4PX1A 4AGSA 4F03A 3VI7A 3LXTA 1LU4A 3PH9A 4FO5A 1XFLA 1B8XA 2F9SA 1S3CA 2VCQA 4GSTA 1F3AA 4HUAA 3CSJA 1Z7PA 4BWSA 1OYJA 2R2JA 1A2LA 1ST9A 1YKAA 1X5EA 2M46A 2OE1A 3UOMA 1HNAA 3IPZA 1G7OA 2CAQA 1TKDB 1NHYA 3RHCA 1FW1A 3ME7A 1OE7A 3ZMLA 1T00A 3GTUB 3RPPA 3CXGA 3GKNA 1SD8A 3HDCA 4F82A 3DIEA 2HSHA 2H73A 3LYPA 1E6BA 2V41A 5ECKB 5IMDA 5C00A 4FH8A 4MJBA 1O6JA 2H6ZA 2LEGA 3D4TA 1MD3A 3WT2A 2EIOA 5ELGA 1O73A 1J08A 5CAXA 4ULXA 1PRXA 3HZ8A 2GDRA 3VWVA 1XWBA 4AJ7A 2JL4A 3GYKA 3TJGA 1B48A 3VFIA 2VM2A 2EIQA 4ZB8A 2OBIA 3KD0A 1K0BA 4WKWA 1QK8A 1GH2A 3ZREA 2O8VB 2FNOA 1DBYA 3IE3A 2GQMA 2GZPA 5H5RA 2OE3A 4MDCA 3K8NA 1WWJA 2H6XA 1JLWA 3GX8A 5GZZB 4MJCA 2OACA 2P31A 4MCUA 1XW6A 3FK8A 2M80A 1U3IA 5ECRB 2H0GA 4FYCA 1JHBA 3I69A 4GCIA 4J56E 3TKSA 4HEA2 3VWUA 1KEBA 2V6KA 4RUVA 4GXZA 2C3QA 1XVWA 3UBKA 13GSA 3APOA 3FW2A 3PR8A 5L71A 3KP8A 1AW9A 5F8BA 5DJMA 3F8UA 1TK0B 1K3LA 2GT6A 4NV2A 5FHIA 3ED3A 2GSQA 4IBPA 4HZ2A 3TJKA 1XVQA 2FUG2 2OBKA 5AIVA 4IS0A 2QSIA 3C1SA 3ERWA 2FA4A 3ME8A 2YCDA 4TRXA 4ML1A 4XS1A 2PPTA 3HKRA 3QPMA 1ON4A 20GSA 3QFAC 1OE8A 3P8WA 5B6MA 1OC3A 3M0FA 3D21A 2WS2A 1GNWA 1WE0A 3LSZA 3HCZA 2B1KA 2HE3A 4DSQA 1EV9A 5D9WA 1SYRA 3GSSA 4YQVA 3WGEA 4QQ7A 2GQKA 3QD9A 2RM6A 5ABRA 1U87A 3MAKA 3W6GA 4HZ4A 2DJ2A 4KAEA 2H1GA 1JLVA 4L8EA 4NAXA 2K6VA 5C04A 5AGYA 4Q5QA 4BA7A 2LQQA 2JZTA 5KN2A 4V2MA 2FWEA 4GSSA 4LMWA 3F4SA 3CBUA 2VL2C 3A3TA 1GUMA 4GLTA 1TRUA 2DJKA 3W8SA 1YDKA 1R7HA 4MF5A 3KH7A 1UN2A 5G31A 2IJYA 1YZXA 2V32A 4ZXGA 3KEBA 4NWYA 5IO0A 2G2QA 1WRYA 2RIIA 2H0HA 4V2NA 1M2DA 3IV4A 3FHKA 2HZEB 1SJZA 3R2QA 4GWRA 1PN9A 1YKCA 2KHPA 2YJHA 5IO2A 5LNKe 4XRAA 2VL3A 5CP1A 2FA8A 2K8SA 3C8EA 5IIZA 2GZYA 3GNJA 1FG4A 1BQ7A 4G9HA 1H75A 3LORA 3BCIA 1GSSA 4IJ3A 4V2LA 3VWXA 2YWOA 1YEXA 1XZOA 3IXRA 3UJ1A 9GSSA 2HT9A 3EWLA 2RUEA 2IMEA 3QDNA 4TR1A 3W8JA 1X5CA 1QFNA 19GSA 2FD3A 1O8XA 2PN8A 3F3QA 3ZIJA 1W4VA 4GSNA 4P3YB 1XXUA 2J23A 2QC7A 2I4AA 3DMLA 4E8HA 4K1FA 4BL7A 2L5OA 3O76A 3S9FA 1V98A 3US3A 1RQMA 3LFLA 4HQZA 3UVHA 16GSA 2OE0A 2VD0A 1ERVA 2QGVA 5ECPB 3ZFBA 1NSWA 1GTAA 2M72A 4TR1B 3GUSA 4ECBA 5J9BA 3ZLPA 2I81A 1N2AA 2YJ7A 4TR0A 2YANA 1O85A 2FHEA 3A2WA 4PUAA 1QQ2A 4ECJA 5GAPD 4K2DA 3GN3A 2LJKA 2IFQB 2DBCA 4J2FA 3ERGA 5E4WA 3KZQA 4NHWA 5G5EA 4EDYA 2V1MA 2VLTA 5G1KA 1JFUA 2JSYA 4O5RA 4IQAA 4O7HA 2MMZA 2WJUA 3F0IA 17GSA 5JWRB 4YQMA 3F63A 3TRPA 11GSA 2HNLA 2CVDA 1GLQA 1ERUA 2X99A 1GTBA 1NM3A 4HOJA 1FAAA 4IW9A 3JCML 6GSWA 1SK1A 1TU7A 3H8QA 4AJ6A 1VF1A 2F8AA 1X9WB 3VWWA 4K6XA 4KNDA 3ZYWA 1F6MC 4V1Ap 1F3BA 1ZGNA 2CT6A 4DEJA 1O8WA 5J9CA 2MBTA 2GS3A 1OKDA 4ZBAA 2KUCA 3IC4A 1MDKA 4EDZA 3C73A 3RBTA 3APQA 1DE1A 4IN0A 2FGXA 5COHA 1A24A 1EOGA 4EE0A 4LL4B 1GUKA 5G5FA 2DJJA 2R3XA 1TDIA 4L5OA 3KCMA 1SKRB 4IKHA 5EVOA 1A2MA 2NVLA 4J57E 1FO5A 22GSA 3DKSA 2WZ9A 2B3SA 5DAKA 2CV4A 1PX7A 3P7XA 1I9DA 4Q5FA 1THXA 5HQPA 4GQCA 4HU7A 1TXXA 3KTBA 5J5NA 5IQYA 2N5AA 1J0FA 3HJMA 1K3OA 2H0IA 4BWQA 2FLSA 2E0QA 4EC0A 2VM1A 2B5YA 3TKSE 2GZZA 2AB6A 1MTCA 1IYIA 3FKFA 1VF2A 4TXOA 5IPHA 1R26A 1MDJA 1PMTA 3EU3A 5D96A 5DAKB 2LSTA 3FZ9A 2C80A 3GTUA 3HJOA 5DVBA 2WRTA 4G19A 1EWXA 2KOKA 2CVBA 4JU5A 4K7IA 2VCVA 4N11A 2B6MA 3F6DA 5ECSA 4AF2A 1HD2A 2I3YA 1XOAA 4TXOB 3EE2A 4XHMA 3EMXA 2WULA 3CRTA 1GSFA 5B7CA 3I6AA 3D22A 3A5WA 1IYHA 3GH6A 2YPMA 3FZ5A 3UAPA 4OFNA 1Z6MA 1ABAA 2CZ2A 2CX3A 5ELAA 5JCWA 5CNWA 2H75A 2C4JA 2C8UA 3OR5A 2C0DA 5FWGA 3HVSA 1Q98A 2VUPA 3U5RE 1V58A 1DE2A 6GSTA 1WP0A 3UL3A 5DCHA 2I9HA 4WXTA 2MMOA 1QGVA 3G9BA 4L0WA 3TKQA 3WD6A 1ZMAA 2TIRA 4MABA 4TKYA 2NDOA 3UVTA 3I9V2 3N5OA 1Z7RA 1KBNA 3HY2A 1B4PA 2R37A 3VI5A 1JZDA 3D4MA 2PGTA 2YV7A 5JCUA 3ZRDA 1BYEA 3E0UA 1EGRA 4GQFA 1A0RP 1M0UA 2VCXA 1Y25A 2PMTA 3L9SA 3A2VA 2R6KA 4EKZA 1HYUA 3DYRA 10GSA 2YV9A 1GULA 1AC1A 1G6YA 5EY6A 1VGLA 4POBA 4BVYA 5HFKA 1GLPA 4MA9A 4TR4A 1AAZA 4KUNA 4X1UA 1B9XC 5IOWA 6GSXA 3GSTA 1GSUA 6GSYA 2CA8A 3SWLA 1PX6A 3MWHA 1J9BA 3GRXA 2H1AA 2LJRA 4ZILA 3HXSA 2DMLA 3SBCA 3I43A 2F3MA 3WGDA 1GTUA 4HS1A 4F2IA 4ILFA 1ZYEA 4RQRA 5IMZA 1PGTA 4OO5A 3HZ4A 1K0OA 1SL1B 5D93A 1X9SB 3J7Yk 1A0FA 3VK9A 1PSQA 3DGQA 5HFIA 2YNXA 2PERA 2ZCTA 4NPBA 1N8JA 3FRCA 5IMCA 4CDOA 5CRHA 4OCEA 2N5BA 4WBJA 1KNGA 4ZBDA 1XW9A 3GIXA 2P5QA 1SK2A 3UBLA 4HJ2A 2K18A 18GSA 3GKMA 6GSUA 1YQ1A 1M7TA 4PQ1A 1GSDA 2JZRA 3EC3A 4K8MA 3CSIA 1FVKA 3DVXA 4K0GA 1T4ZA 1BJXA 2B7JA 2HZEA 4I8BA 4LLRA 4TN8A 3RAZA 2VO4A 3EU4A 6GSVA 1K3YA 4IVFA 4OD7A 1VF4A 1Z6NA 2H72A 1V40A 4JZQA 3RPNA 4ZBBA 5F06A 3TOUA 2WB9A 5A4UA 2C3NA 3KGKA 1GWCA 3TRXA 4JR6A 3M3MA 2I1UA 1V57A 4POLA 1XW5A 5B6NA 3QAGA 1EGOA 1PA3A 2DIZA 1QXHA 4EL1A 2KP1A 1ACVA 4WBRD 2AV4A 1FVJA 1G7EA 4LL1B 1ZCPA 1K0AA 1YJ6A 1DSBA 4EUYA 4WF5A 3BBYA 3QFBC 1T1VA 2DMMA 2H8LA 2WFCA 2N5FA 4O32A 2FWHA 4OFMA 2JU5A 2AAWA 4LMVA 3LQ7A 1E2YA 2OJLA 1QMVA 4EVMA 2PU9C 3TUEA 2BTOT 3TJBA 2NPBA 3KH9A 2BMXA 1TK5B 1TW9A 4CW9A 3TOTA 1OC9A 2H66A 4BPYA 1OKTA 3O6TA 1JZRA 3KM6A 1U88A 1TI1A 5LD0A 3LG6A 3IAM2 3KMOA 5KEJA 3MDKA 4GRFA 3RDWA 1A8LA 3L78A 1EP7A 3ZL5A 3F6FA 2CX4A 5INYA 4N30A 3ZTLA 3C1RA 2VCTA 1M2BA 4PQHA 1PL2A 2IFQA 3GKXA 3F4RA 1R4WA 2HFDA 4XCSA 1OC9B 1AUCA 1R5PA 3FEUA 2VLVA 2E7PA 4FIWA 5DALA 1XWGA 1HNBA 4JR4A 1CQGA 3G7JA 4MJEA 3KXOA 1OVNA 5HR0A 1SD9A 2L59A 1Q4JA 4KGIA 4I6XA 4DSSB 1TRWA 2X8CA 1HNCA 3EURA 3LGCA 1FB6A 4TXVA 2WGRA 4ACSA 5ECIB 2JADA 3G7YA 2HRNA 2OADA 4HU9A 3M1GA 3GH9A 5DALB 4F0BA 2IMFA 2V2GA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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