4HU9A

E. coli thioredoxin variant with (4s)-fluoropro76 as single proline residue
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
108
structure length
107
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGACKMIAAILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNAGTAAKYGIRGITLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title (4R)- and (4S)-Fluoroproline in the Conserved cis-Prolyl Peptide Bond of the Thioredoxin Fold: Tertiary Structure Context Dictates Ring Puckering.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
molecule keywords Thioredoxin-1
total genus 31
structure length 107
sequence length 108
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4hu9A00
4PUFC 2MMNA 2DJKA 2MMAA 2YANA 2F51A 1KBNA 2TIRA 1Z3EA 3LWAA 2PVQA 4J56E 2OA7A 1XW5A 4EO3A 1DE1A 3U5RE 1ZOFA 4POLA 1TU8A 2X64A 2EC4A 3N5OA 1T8EB 5C00A 1SJ6A 3HKRA 5IM9A 1TK5B 3GMFA 2B5EA 4DVCA 1MDJA 1N8JA 2FUG2 1OKDA 1HD2A 4KE3A 4I2TA 6GSUA 2NVLA 4K9ZA 3DIEA 1YKAA 1XOAA 3HYPA 3GHAA 2OE1A 3F3QA 2FLSA 1ZYQB 2LRNA 2JSYA 5LCZA 1Y25A 2WFCA 2H76A 2V32A 5IO0A 4EF0A 5DJLA 3H79A 3FY7A 1UN2A 3BBYA 1E6BA 3ZMKA 1JZDA 3A2VA 4TXOA 1JFUA 3GN3A 4HZ2A 4IJIA 4MP4A 5FWGA 2RM6A 3HZ4A 4V2LA 3LEFA 4QL9A 2RIIA 3ME7A 2AV4A 3ZYWA 3QFAC 4JR4A 2G0FA 14GSA 5F8BA 10GSA 4JBBA 3EE2A 2CA8A 3HA9A 3FHKA 2F8FA 1FB0A 3VWXA 1OC8A 4GSNA 3D4MA 1TTZA 4N0VA 2ALBA 3CTFA 4EVMA 1GL8A 4TXVA 4FH8A 1KNGA 2IWTA 1NHOA 1M2DA 4MMMA 2HZEB 17GSA 4WKWA 1GUMA 3DXBA 2WS2A 3IAM2 1XXUA 4Q5RA 4KSOA 1K0CA 1AUCA 1ZYEA 2CQ9A 5B7CA 1SYXA 5LNKe 1X9SB 2OKAA 1X5DA 3US3A 5A4VA 1JZOA 5HQPA 4Q5FA 3F4RA 2H0GA 5JWQB 4OWYA 3SWLA 5AN1A 2C0EA 3GX0A 5ECMB 2VOCA 1BAYA 4MA9A 3QD9A 4XCSA 2YWIA 4I2UA 2I9HA 4KB3A 1QQ2A 16GSA 3I6AA 2FCHA 5E4WA 2YWMA 5DJMA 2VO4A 5F06A 1J0FA 3EU3A 4E8HA 4XIHA 4CDOA 3KD0A 4G9HA 5CRWA 1T7PB 1GWCA 5INYA 3C8EA 2VCVA 4GCIA 1AW9A 5ID2B 2LEGA 2ON5A 4TOPA 4QQ7A 1THOA 3APQA 4IHUA 2EIQA 3D21A 4MZBA 4EDYA 2JSZA 3C1SA 4LMWA 3IK7A 2HXKA 5EVOA 2LTKA 1ERTA 1BYEA 4MCUA 2VCXA 5ECKB 4Q5QA 1GULA 4GF0A 5ABRA 5DCHA 5IMAA 2OBIA 2LRTA 4ULXA 3M8NA 3NOFA 2N5AA 4GSTA 4XS1A 2H6ZA 3BD2A 4K7OA 3IA1A 3DEXA 4DSQA 1YQ1A 1WRYA 4KDUA 2WDUA 4FYBA 2GQMA 1BQ7A 1K0NA 2VIMA 2K9FA 2PU9C 1B4QA 3FZAA 4K0GA 3QMXA 2VL9A 3WYWA 2VL2A 3KJYA 4KA0A 3L4NA 3DD3A 2C8UA 2GQKA 2IFQB 3TDGA 5B8AA 1B48A 5IPHA 1GUKA 1FB6A 4ACSA 2HRNA 3KH9A 6GSYA 2BJXA 2H74A 2OE3A 5FT3A 2P0GA 4POBA 4KAEA 1OE8A 1XPVA 1ZZYA 3LG6A 2AJQB 4EC0A 5D96A 8GSSA 4YAPA 3LFLA 1S3AA 2B1LA 1F2EA 2H1GA 1MDIA 4ZBDA 1U3IA 4HEA2 3KIJA 4TN8A 4AF2A 2H6XA 1Z6MA 5D9VA 1V57A 4PURA 1YF1A 4ZB8A 3RAZA 1JHBA 3VI5A 4N10A 5DVBA 1GTBA 2DJ3A 4GXZA 1JLWA 4XS4A 2X99A 4O5RA 1S3CA 2H6YA 1GSYA 3KH7A 4NV5A 5F05A 1SJZA 3HVSA 1PKZA 1OVNA 3PR8A 3IK9A 1XIYA 2R2JA 3KXOA 2GSTA 4TKYA 4POKA 4V1Ag 2JL4A 2PGTA 4ZBAA 3I69A 3WGEA 5E59A 5CNWA 1PA3A 3CSIA 1M9AA 4F0BA 5KN0A 1A24A 5CAXA 2IPAA 3M0FA 2MBTA 2A2SA 5CP1A 4WR5A 2HI7A 2YJHA 4RQXA 1TJDA 4D73B 4N30A 1I9DA 1U6TA 3NZNA 3PINA 3KEBA 4HU9A 1TW9A 1N2AA 4K0NA 2L59A 1FVKA 4L0WA 4ZB6A 1XFLA 4GRFA 3M3MA 2REMA 1I5GA 1GSDA 3VWVA 1GSSA 5KN2A 3A2XA 3ZIJA 2HNLA 2OBKA 2VM1A 3IR4A 1XW6A 3CXGA 4ZB9A 5D73A 1GSEA 1TDIA 5ECPB 5A5KA 1FOVA 2B7JA 1MEKA 2JZRA 2V41A 3CSJA 3ZIVA 5IMZA 3CBUA 1TOFA 3HJMA 2HRFA 5G1LA 1M9BA 3JCML 3TRXA 2KHPA 3TCOA 1A0RP 2LQOA 2PWJA 2RUEA 3GKNA 4J2FA 4IP6A 4WEYA 5DAKA 2J9HA 1T4ZA 1VF3A 3GL5A 1YEXA 3RPPA 1MD4A 3UBLA 4OCEA 4TRXA 4K7IA 4MPFA 2B3SA 4GWRA 1VGLA 3H8QA 1PMTA 5EL8A 2K18A 1WJKA 5CYYA 2MMOA 3TUEA 4MLYA 3TKPA 4IGJA 1WP0A 2NDOA 2H1AA 2FD3A 3EWLA 1J9BA 2Z9SA 3UOMA 1AQXA 3TKSE 3C73A 4K1FA 4CHSA 2C3QA 3CYNA 1HNAA 2PERA 4DSSA 3KP9A 1X9WB 3Q18A 1WWJA 1ZL9A 5EPFA 2H72A 2EIOA 3FR6A 3GA4A 1A2JA 2O87A 1BG5A 4IP1A 6GSTA 2YWOA 5DQYA 4MZWA 2R5GA 4G2EA 2NPBA 3D0ZA 3F63A 1EOGA 3GFKA 1O85A 2WCIA 1FG4A 2PUKC 20GSA 2C0GA 1ERVA 4K7NA 5DALA 1XVQA 3F3RA 4AGSA 2JU5A 5F07A 3M1GA 3UVTA 2C0DA 2P5RA 2BTOT 1NM3A 3GH9A 2H01A 3RDWA 2FWEA 3QAVA 3GRXA 3KCMA 4NHWA 3E0UA 3F4SA 3BOAA 2YCDA 3ZTLA 2MMZA 1XWAA 2CZ2A 1SL0B 3LGCA 5B6MA 1XWBA 3W8JA 2KP1A 1ON4A 3GYKA 5FHIA 1GTAA 3GV1A 4CW9A 1C72A 4NV2A 2R6KA 2LV3A 4IN0A 1LU4A 2F9SA 2B5XA 5J3RA 2M46A 3IE3A 2K8SA 1T00A 3LXTA 2TRXA 2JZSA 2VUPA 2H70A 3TRPA 3VPQA 3QAGA 3QDNA 2AHEA 2L6DA 3HZ8A 4V2MA 3UARA 1G6YA 3J7Yb 1GSUA 3KP8A 3UMAA 2H73A 1TI1A 2LJRA 2LKUA 1MDKA 3GSTA 3UIWA 1WMJA 1F3BA 3V1WA 1QXHA 4TVEA 4OD7A 3FRCA 1K0OA 2GLRA 2I4AA 3HJPA 4WETA 3LSZA 4ZL8A 3IC4A 4KW6A 5G30A 3F6FA 4YQMA 3GTUA 3IV4A 1NW2A 5J9BA 2GDRA 2GSRA 3Q19A 2C80A 3UVHA 4OMVA 2WZ9A 2H1BA 3P7XA 1PQNA 1K0DA 4IKHA 1K0MA 5ECHB 3KGKA 3HVVA 2OJLA 3DMLA 2ZCTA 4TXOB 1HNBA 3WGDA 1TRVA 2R3XA 4FYUA 1JZWA 2LUSA 4WBJA 2FHEA 3ZZXA 1F9MA 1G7OA 3DVWA 2ZUPA 1F6MC 4I5QA 1O8XA 3OR5A 4PQIA 2QC7A 2O89A 3EYTA 2VL3A 2IIYA 4DEJA 1NSWA 3H4KA 2H30A 3SBCA 1CQGA 2OADA 2XBIA 1ZMAA 4MJAA 3ZL5A 3PGTA 4KH7A 1GNEA 1K0BA 1GNWA 2P5QA 2YN1A 4G10A 3M9JA 4EXJA 11GSA 1BX9A 3FW2A 2CVBA 1DSBA 1GUHA 3HDCA 1SJIA 2ES7A 1EGRA 1BJXA 3RPNA 1EGOA 3D6IA 3UL3A 1EV9A 5DCGA 2F3MA 6GSXA 4YQUA 2FWFA 2KOKA 2B6MA 2DJ1A 2IMDA 2R37A 1GSFA 4IS0A 2V6OA 2VCQA 1MTCA 1EOHA 3WT2A 3L0HA 1M2BA 1U87A 1PSQA 1V40A 2E7PA 2JADA 5GAPD 1GRXA 5J5NA 1W89A 1MD3A 1ZCPA 3QPMA 3VLNA 1YF0A 4BWQA 1EV4A 3ZLPA 5HR0A 2CT6A 3WD6A 5HFGA 1X5EA 4JEDA 5G2ZA 4O7HA 3TKRA 4F03A 5IPGA 1E2YA 1B9YC 2L5OA 4ML6A 1IYHA 1VF1A 1QMVA 6GSVA 2RM5A 1EWXA 2M80A 2FWHA 2QKEA 2O8VB 4ILFA 1PD21 4Z7XA 5KN3A 1GLPA 4OFTA 2CAIA 5AIXA 1AIUA 1SKRB 3Q6OA 3WT1A 4WXTA 2HZFA 4O92A 1EZKA 2H0IA 3CTGA 2OACA 3GSSA 4NMUA 1PRXA 2L4QA 1OC3A 4TR0A 1OC9A 2YNXA 5IOWA 3H93A 2VCZA 19GSA 4WF5A 1UA5A 3F6DA 4G19A 1GLQA 4YAVA 3EINA 2KP2A 2H8LA 1B8XA 5L71A 3TJGA 4MPGA 3DVXA 4E8EA 4MJCA 1Z5YE 3K8NA 3CRUA 2KLXA 4K8MA 3L9UA 13GSA 4EL1A 4DSRA 4L0UA 3UEMA 3H1NA 2V6KA 1PX7A 4LLRA 3RHCA 4NPBA 1BEDA 2IL3A 1T3BA 4POMA 1OAZA 2DBCA 2N5FA 5D8IA 1USBA 3GNJA 5IMVA 2NTOA 3O3TA 1Z7RA 4KSMA 5J4UA 3LORA 1V9WA 3VFIA 1AQWA 18GSA 3GKXA 2L57A 2K8VA 3LQ7A 2L5LA 2RUFA 4IW9A 1FAAA 4PNFA 3GX8A 4J57E 2CZ3A 1ML6A 3O6TA 5IMCA 1YY7A 4HDEA 2GGTA 4OCFA 4OFNA 3TJFA 1SU9A 1GTUA 3APSA 1CQHA 2DIYA 5ECOB 5JWOB 1QUWA 1K0AA 1ACVA 2B7KA 3APOA 4ECIA 5KN1A 2KUCA 2IN3A 4HS1A 4XS4B 3KMOA 5DDLA 4JU5A 4TR3A 1G6WA 1TU7A 1JZRA 4MZCA 3HJOA 5JCWA 3HHVA 1A23A 2FY6A 2C0FA 2HSHA 3DWVA 1Z9HA 9GSSA 1G0TA 3KZQA 3EMPA 4PGTA 4GLTA 2H75A 2LS5A 2PMTA 1A2MA 1XOBA 4IVFA 2H71A 3J7Yk 1T4YA 2B5YA 3MNGA 3A2WA 3TKSA 4QL7A 3FKFA 1ST9A 3TJKA 1AC1A 5HR2A 5DBQA 2YJ7A 4TR1A 3C71A 2YWNA 2TRCP 1S3DA 2X8HA 3BCKA 2VD1A 1SD8A 4RUVA 3GH6A 2DJ0A 2K6VA 3F4TA 4XS6A 3L9VA 1TXXA 2DMLA 4RI7A 4P3YB 1H75A 5HR3A 1M7TA 1O6JA 5JCGA 5IQYA 1XBSA 4YQVA 6GSWA 2AAWA 2I1UA 2YV7A 1DBYA 3FZ4A 2F8AA 4MH2A 3UJ1A 4XRAA 2LNSA 1URMA 3GUSA 3FEUA 2O7KA 3VPTA 4HU7A 3ZVJD 4TW5A 4LL4B 2G2QA 2PVOC 2ON7A 1THXA 1XWCA 4NHZA 4ECJA 2I81A 1EP7A 3MAKA 2R4VA 1GH2A 4HOJA 3FR3A 5H5RA 2GZZA 2XHFA 2PPTA 2GZPA 5EY6A 3VWUA 4L8EA 1KTEA 4N11A 1T1VA 2XPEA 1V98A 1UC7A 3DGQA 3F9UA 5DAKB 4HI7A 5D93A 5J41A 3ZMLA 4ECBA 3LXZA 4X43A 5IO2A 4H86A 1ILOA 1Y6EA 2DMMA 1A8LA 4PX1A 5COHA 4XHMA 5D9TA 1PN9A 5ELGA 1WE0A 4WF4A 1B4PA 3AY8A 5ECNB 1F3AA 3A5WA 3GKMA 3EURA 3IOSA 2HSYA 3D22A 4DSSB 3IAS2 2BMXA 2CV4A 1ERUA 1TP9A 3KTLA 2LRCA 3VI7A 2HZEA 3ERGA 2DC5A 2FA4A 1K3OA 2O85A 3WGXA 3IDVA 5IOXA 1V2AA 4OFMA 2QGVA 3BJ5A 3CMIA 5DALB 2JZTA 3O76A 1O8WA 2DIZA 3TJJA 2H19A 1RQMA 5IMDA 4MF5A 1EEJA 4GQFA 4XTSA 1TRUA 5IIZA 3LYKA 2FGXA 3G7YA 2N5BA 1R5AA 1AQVA 4MF7A 3ZVJA 1LJRA 2DJJA 2V2GA 3C1RA 4RI6A 4BA7A 4NAXA 3ZRDA 1A0FA 4L5LA 1O81A 2C4JA 3QCPA 5ECLB 3DYRA 4ID0A 2E0QA 1Q4JA 1UVZA 4N0ZA 2H0HA 1Z7PA 5ECSA 2CX3A 2FWGA 1QFNA 1Q98A 4Q5NA 5ID2A 3E3EA 1O73A 3ERFA 3HY2A 1OYJA 4JRRA 4BVYA 3U6VA 4KGIA 1PKWA 2VL2C 5HR1A 1Z6NA 4XRDA 2XBQA 1YKCA 2GTUA 2P31A 4IQ1A 4MJEA 1GSQA 4NXIA 2E2GA 2J23A 3R2QA 1ABAA 3GIXA 4HZ4A 5G1KA 3L9SA 1OE7A 3ME8A 2VCWA 3NIVA 3ZREA 3UAPA 1SK0A 2WGRA 1R5PA 1K3YA 5JCUA 3CSHA 4PQHA 4KCAA 5CRHA 3KM6A 1WPIA 4JR6A 2CX4A 2M72A 5GSTA 4LL1B 3IXRA 3P8WA 1ERWA 2YZUA 5H5QA 2L6CA 5IMFA 4LA1A 5HFKA 2PN8A 1B9XC 2CVKA 1HQOA 4PXOA 3HCZA 3KMNA 1XW9A 4GQCA 2H1DA 2DJ2A 2A4VA 3F0IA 5F0GA 3TB2A 1RW1A 2X8CA 2VLTA 2B1KA 3GTUB 2MZCA 4IJ3A 4ZXGA 2AYTA 1WOUA 1GTIA 1H4OA 2HYXA 2VD0A 4YH2A 3FYGA 4LMVA 2IFQA 3TJBA 4F9ZA 1R26A 1XZOA 7GSSA 4MJBA 1R4WA 1HNCA 4MK3A 1W4VA 4KNDA 4MDCA 2DSAA 5GAND 3C7MA 2VLUA 5KEJA 2ZNMA 4IQAA 3LYPA 4ML1A 22GSA 5GZZB 3G7JA 1V58A 2IMKA 2HFDA 3IRAA 2QSIA 4GTUA 2E2MA 2GVPA 5ECQB 1YZXA 4GSSA 1J08A 3E9JB 4V2NA 1A2LA 2GSSA 5D9XA 4ECCA 3ZFLA 1HYUA 4AJ6A 1SL1B 2WRTA 2XC2A 3HD5A 3IPZA 4PNGA 4ZL9A 2L4CA 5G5EA 5G31A 2AUVA 2XPDA 1K3LA 2VLVA 3MWHA 3Q74A 1OKTA 4V1Ap 1AAZA 4F0CA 2MYGA 1IYIA 3I9V2 1GP1A 4EKZA 5A4WA 4HQZA 5C04A 2RLIA 1YJ6A 4RQRA 1JLVA 3QFBC 4O32A 1SENA 5AISA 4HQSA 4L5OA 1QGVA 4AJ7A 3VK9A 1PGTA 4BVXA 4EE0A 2A2RA 1M99A 3RBTA 4IBPA 2NBSA 2PBJA 3UBKA 1U3AA 4KDYA 2GSQA 3EMXA 1O7UA 4HUAA 3FZ9A 1SL2B 2YPMA 1PX6A 4D73A 3S9FA 1TK8B 1X9MB 3CRTA 2FA8A 3EC3A 3A3TA 3D4TA 3QAWA 1XWGA 3GURA 4KCEA 4F82A 3TGZA 2GQLA 1R7HA 2GZYA 4I8BA 3TKSC 5AGYA 1PL1A 5A4UA 4I6XA 2OE0A 2GS3A 1X5CA 3HXSA 3W6GA 1RK4A 4MF6A 2WULA 1TRWA 1YDKA 12GSA 2C3NA 1X0RA 2GT6A 1KEBA 5AIVA 4ZIJA 4X1UA 1SK2A 4ISDA 3N9JA 3W8SA 4WBRD 1TI3A 4OO4A 4X0XA 5J9CA 1EP8A 4HJ2A 1FO5A 3I43A 1FHEA 2YOIA 1OC9B 3F8UA 3G7IA 5ELAA 5GSSA 4BWSA 4EDZA 4KX4A 3LJRA 2JACA 3M9KA 1PL2A 1FVJA 2LSTA 4EUYA 5D9WA 3ZITA 2I3YA 1DUGA 1LBKA 3G9BA 4BL7A 3FR9A 2CVDA 2HT9A 2LJKA 2C1YA 4I97A 1TKDB 2GT5A 1TK0B 3IBHA 1AXDA 4JZQA 3RHBA 4AJ8A 2IMFA 1XWKA 1EEMA 1SD9A 5ECIB 2LQQA 4OO5A 2WB9A 2LJAA 2IMEA 3DRNA 5CO3A 5LD0A 5B8BA 3VWWA 3ZFBA 1XCCA 3MDKA 3ED3A 2YP6A 4KUNA 2LNTA 2DLXA 4K2DA 5H5SA 1QK8A 3TOUA 3TKQA 4WR4A 2WJUA 1SYRA 4MH3A 4IELA 4BPYA 3GL3A 2EIRA 3ERWA 3BCIA 1VRSD 3TOTA 3EVIA 3VURA 4NWYA 2X8GA 1XVWA 2HLSA 3KTBA 4TR4A 2FNOA 3L78A 1A8YA 2D2ZA 1DE2A 3DKSA 4FYCA 1NHYA 2AB6A 4F2IA 4ZL7A 2H66A 2MBSA 3TRQA 4KDXA 2C3TA 3FK8A 3HVXA 6GSSA 2CAQA 1VF4A 1SKSB 1YEPA 2VM2A 3P2AA 3GKKA 2IJYA 3EU4A 1WIKA 3D5JA 3PH9A 1SKWB 5G5FA 3ISOA 3P90A 2V1MA 4PUAA 1TRSA 3FZ5A 3IHQA 3QR6A 1M0UA 1U88A 2VAFA 5CREA 2VCTA 1VF2A 5ECRB 4FO5A 5ENUA 4TR1B 5DQSA 2YZHA 4HJMA 1M2AA 5HFIA 1F37A 5CRDA 3QOUA 4FIWA 1ZGNA 1G7EA 4K6XA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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