4HU9A

E. coli thioredoxin variant with (4s)-fluoropro76 as single proline residue
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
108
structure length
107
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGACKMIAAILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNAGTAAKYGIRGITLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Thioredoxin-1
publication title (4R)- and (4S)-Fluoroproline in the Conserved cis-Prolyl Peptide Bond of the Thioredoxin Fold: Tertiary Structure Context Dictates Ring Puckering.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 31
structure length 107
sequence length 108
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4hu9A00
2KLXA 3O6TA 2N5AA 4MDCA 4BA7A 3HVXA 3ZMKA 2ON7A 4HEA2 4TR1A 3TKQA 1BJXA 3F4SA 2VOCA 1EEMA 4GSSA 2C8UA 2YV7A 3KJYA 1QXHA 1R5AA 4NWYA 2AJQB 4KAEA 5ELGA 1X9SB 1GSQA 1PX7A 2JZSA 3VLNA 3LYKA 3RPPA 4HU9A 2GT5A 3TKSE 2FCHA 3N5OA 1GSSA 2JSYA 1YDKA 3VI7A 1ZGNA 1WPIA 2F8FA 5F07A 3HJMA 1Z7RA 1F3BA 1FAAA 1HQOA 5DAKB 1JFUA 1M99A 1XBSA 4HQZA 4P3YB 4GQCA 1XCCA 1GSFA 2NPBA 3ZMLA 1U88A 5HR1A 1SK2A 2QC7A 1GSYA 1HNAA 5JCWA 1IYHA 5DVBA 5ID2A 2DC5A 2OKAA 4WXTA 4ZXGA 5ECKB 1PQNA 3G7JA 2I9HA 4XRDA 3HKRA 1GNWA 1G6WA 2VCTA 4EDYA 4O7HA 5B6MA 1V57A 2OE1A 5KN1A 1K0CA 3TDGA 3KMOA 5CYYA 1Q4JA 4KSOA 3GTUA 1SENA 4MK3A 1THOA 2FWHA 2L6DA 1GSEA 5IPGA 2RLIA 5D73A 5D9WA 3UMAA 4K0GA 5L71A 2VCZA 1X9MB 4I6XA 1ZYEA 5DQSA 2DMLA 2WJUA 4J56E 1K0OA 1H75A 1R7HA 3IBHA 2LRCA 3H79A 3SBCA 2CQ9A 5AIXA 3F6DA 1DE2A 2L6CA 1GSUA 1FVKA 1U6TA 2A2SA 3CTFA 1EP7A 2PPTA 3FZ9A 4QL9A 2TRCP 1UC7A 2GDRA 4KUNA 3HD5A 3QR6A 4MJBA 1YF0A 4AJ8A 4PURA 3W8SA 5B6NA 2X99A 2YWMA 1K0MA 3J7Yk 2IFQB 4V2LA 1U87A 1WOUA 1GULA 2MMOA 2EIRA 1SU9A 2J9HA 4HJ2A 2LKUA 2DSAA 1O8XA 4POLA 1B9XC 1GUKA 3UIWA 1T4ZA 2YN1A 2H73A 3W8JA 1O73A 2ALBA 1XWBA 2H01A 3IE3A 4K7NA 4JE1A 2EC4A 3EMPA 2MZCA 4IHUA 2H0GA 4FYCA 4GSTA 3QOUA 1YJ6A 3L4NA 3GL3A 2K18A 2WRTA 1PL2A 4HZ4A 9GSSA 4G9HA 1TW9A 3FZ4A 2GQMA 2DIYA 3LYPA 1B4QA 3ED3A 2BJXA 3ME8A 3UBLA 1A23A 5DCHA 5IPHA 1S3DA 1T3BA 5F06A 2RUEA 1ILOA 3WGDA 2NBSA 1TRUA 1CQHA 2GQKA 4MCUA 4WBRD 5IM9A 3TKSC 1RW1A 5F0GA 4ZB9A 1J9BA 1PL1A 1KEBA 3WGEA 1XZOA 1MEKA 1PKWA 1OE7A 2WB9A 1SJZA 1MD3A 3GNJA 2C80A 2DJ2A 2PUKC 2CVKA 3ERFA 3TKRA 2F9SA 2YNXA 2CZ2A 2C3QA 4K0NA 3EINA 1YEXA 3L0HA 1YKAA 4O32A 3UEMA 3QFAC 3F0IA 4QL7A 1THXA 3CMIA 3GV1A 2R5GA 5ECRB 4LL1B 2CZ3A 4HJMA 1YEPA 2GTUA 4ZB6A 1OAZA 4XS4B 2R3XA 1JZWA 3FRCA 1UVZA 4OO5A 1TOFA 4KGIA 3GYKA 3APQA 2VL2A 3KD0A 4TVEA 4DVCA 5JWOB 2M46A 3EC3A 3DRNA 1ERWA 3KCMA 2MMZA 2K6VA 2VCXA 3QFBC 4EC0A 2IMDA 4BWQA 2IPAA 1B48A 1OKTA 2C0DA 2V6OA 4DSQA 3IRAA 3HZ8A 1MTCA 3HVVA 2FHEA 4PGTA 1EGRA 1AUCA 3ZFBA 5FHIA 2IFQA 3TJFA 5DBQA 3VWXA 4F82A 3JCML 3MAKA 1HNCA 1OC9B 1ZMAA 3ZYWA 2VCVA 1O6JA 2HSHA 1AQWA 4IN0A 3PGTA 1R4WA 3I69A 3KP9A 4TR4A 5JCUA 3GX0A 1A0RP 4TR1B 4K7OA 4POBA 4ILFA 5D93A 3DIEA 3GMFA 1FG4A 3ZIJA 4ACSA 2HXKA 4LLRA 1KNGA 3APSA 5HFGA 3SWLA 2OA7A 1A2MA 1Z5YE 3E3EA 2VLVA 4LA1A 4X1UA 1B4PA 3J7Yb 2A2RA 2NVLA 3LORA 4G2EA 4YQVA 4ZBDA 2PVQA 3P2AA 2HRNA 4K2DA 13GSA 5IMAA 17GSA 2K8VA 4IQ1A 2LS5A 2CX3A 2B1LA 5EL8A 1EWXA 1XVQA 2IJYA 3P90A 3VURA 5ECNB 2H6XA 2PU9C 3RHBA 2YP6A 3FW2A 3KZQA 2H1DA 5GZZB 4IJIA 1V9WA 4JR6A 4O92A 3CRUA 4N10A 2DJJA 1PRXA 4TOPA 3C73A 5ID2B 2YJHA 2WZ9A 4MZCA 1PMTA 1GLQA 4PX1A 1A0FA 2V32A 1ST9A 2H72A 2MYGA 5A5KA 4XS4A 3GTUB 2LV3A 4G10A 5ECSA 1YF1A 2RIIA 2C3TA 1Q98A 4HI7A 1X5CA 2AUVA 3GN3A 3DVWA 3TJKA 3M0FA 3Q19A 3ZL5A 4DSRA 3TRPA 1K0DA 2CAIA 1OE8A 2LRNA 1SD9A 4ML1A 2QSIA 2GLRA 1S3AA 5G5FA 3LWAA 4NHWA 1TU8A 1TRSA 1K0NA 3LXZA 3FKFA 16GSA 2IWTA 4NV5A 2V41A 3MWHA 3L9SA 1RK4A 4V1Ag 4HZ2A 2H74A 3QCPA 2WFCA 1FOVA 3FR9A 2H30A 1VF2A 3IAM2 5JWRB 3I43A 5IMVA 5EVOA 4EXJA 1EOHA 3D6IA 3H4KA 4K1FA 4HUAA 1SK1A 4TXVA 2GVPA 2GGTA 4L0WA 2ON5A 4XHMA 3LQ7A 3EU4A 2ES7A 2H1GA 4NV2A 1SKRB 2YZHA 3EVIA 4MABA 3F4TA 3F6FA 1W89A 2L5LA 1JLVA 2XBQA 4L5LA 4MH3A 5DQYA 1KBNA 1ACVA 5D9VA 4I2UA 2B7KA 5B8BA 2GSTA 5KN2A 5IOXA 3P8WA 2CX4A 1KTEA 2G0FA 2LUSA 5J41A 4BVXA 1V40A 3TKPA 2L4CA 2FA4A 4EDZA 2XPEA 3L9VA 3FK8A 3QAGA 2I4AA 1GTIA 3M3MA 3EWLA 6GSTA 2LQOA 4Q5FA 5HR0A 4OFMA 1ML6A 4K9ZA 2O8VB 3VI5A 1A24A 3KXOA 3TJGA 3DEXA 2IMEA 2GT6A 2PWJA 1XW9A 4PNFA 2K8SA 3D5JA 3IC4A 1QGVA 1TK0B 2YWNA 4NAXA 1XXUA 1G7EA 1DUGA 1GL8A 1M9AA 2CT6A 2B5XA 2H0HA 1J08A 6GSXA 3UARA 3DD3A 1TKDB 4BWSA 5IO2A 4ZBBA 1TRVA 4WEYA 2PN8A 1JLWA 1S3CA 3HDCA 2GSSA 1AC1A 1SD8A 3VPQA 4HDEA 4IKHA 3TJJA 2VIMA 1YQ1A 5A4WA 2F8AA 1GLPA 2FY6A 2M72A 1TP9A 5CO3A 1MDIA 2PMTA 1PD21 3NZNA 1MD4A 2IN3A 1LBKA 1C72A 3GFKA 1VRSD 1WMJA 5DCGA 3A2VA 2X8CA 4DEJA 2LQQA 1TDIA 5CRHA 1LU4A 5IQYA 2BMXA 4IGJA 3PINA 4IQAA 4F03A 1Z6MA 2GSRA 3BOAA 4YQMA 1FHEA 2LNTA 5IIZA 5G30A 3TGZA 4KX4A 5E4WA 4KSMA 3IA1A 3HYPA 3CBUA 1XOAA 3KP8A 1USBA 2PERA 2XC2A 5A4VA 2L57A 1JZRA 2VD1A 5JWQB 1AXDA 1NW2A 4F0BA 5LCZA 2KUCA 2IMKA 3W6GA 2VCQA 2L4QA 4KCEA 2P5QA 2B5EA 2OJLA 4X0XA 2QGVA 2HE3A 2LRTA 4MJEA 1K0BA 1TU7A 4ULXA 1M2BA 2K9FA 2XPDA 1U3AA 3MNGA 1QFNA 2VAFA 2H6ZA 4MF6A 1Z6NA 3FEUA 3HHVA 5A4UA 3QDNA 2TRXA 3TOTA 5CAXA 3EU3A 2VLUA 4KDXA 1YY7A 2FWFA 3ZVJA 3ERGA 4IP1A 1XWAA 1YZXA 5CNWA 1FB6A 1TK8B 5AN1A 5ELAA 2R37A 5LNKe 4CHSA 2MMNA 1I9DA 4WKWA 2R4VA 1XPVA 4ZL8A 4DSSA 1M2AA 2M80A 1ZL9A 1T1VA 4MMMA 4MZBA 4OFTA 5J3RA 3R2QA 3UVHA 2H8LA 1N8JA 1K3LA 3LEFA 2N5BA 1B9YC 2FLSA 5CRGA 3A2WA 2HI7A 2P5RA 2DMMA 4XIHA 2QKEA 4E8HA 1SYXA 2Z9SA 2KP2A 1M9BA 3ZZXA 1WE0A 1M7TA 2DIZA 1NHYA 3U5RE 7GSSA 4F2IA 4FYBA 1A2JA 1WWJA 4EF0A 3IOSA 1V2AA 5CRWA 4BPYA 2LJAA 3GSSA 1TJDA 3G9BA 1I5GA 3PR8A 3HVSA 1A8LA 4PQ1A 3HXSA 2B6MA 2I3YA 1H4OA 1EP8A 4MPGA 3TKSA 1A2LA 1XIYA 4EE0A 1M2DA 5AGYA 4TRXA 2L5OA 1E6BA 3GKXA 1EV9A 2VO4A 1WP0A 3EE2A 1F9MA 4OWYA 2JACA 1SJ6A 6GSVA 1SJIA 1GTUA 12GSA 2WGRA 1LJRA 3E9JB 5H5SA 3UOMA 1G6YA 2NTOA 1TI3A 4EVMA 5EPFA 3ISOA 4H86A 2JZRA 3F63A 3CRTA 2KOKA 1XW5A 4MA9A 2HFDA 1VF3A 3A2XA 1G7OA 3KM6A 2V1MA 2CAQA 4NHZA 4IW9A 4L8EA 1V98A 3IK9A 2A4VA 1SK0A 5CREA 2IL3A 3IV4A 5IMFA 1W4VA 3ZRDA 3D0ZA 4E8EA 2AB6A 4OD7A 2HYXA 1PA3A 3C8EA 1F37A 2V2GA 1CQGA 1Z3EA 1TK5B 2VL3A 2DLXA 3D21A 2DJKA 4KA0A 1O81A 1PN9A 3C1SA 3ZITA 5H5QA 4KCAA 5GSSA 4KNDA 4F0CA 4FH8A 4ZB8A 4ZL9A 1X5DA 1RQMA 1O85A 4JU5A 5DJMA 2R6KA 1TTZA 2VM1A 19GSA 3H1NA 1B8XA 3UBKA 2LJKA 2YZUA 4OCFA 3KTBA 3QAVA 3UAPA 2VCWA 2NDOA 3DYRA 2OBKA 5GAPD 3CYNA 2XHFA 3APOA 2XBIA 2O87A 3AY8A 4FIWA 2VD0A 3HJOA 6GSWA 2YV9A 5CRDA 4GF0A 5D9TA 3LGCA 1GSDA 2YWOA 3IK7A 3NIVA 3KH9A 1EV4A 3ZFLA 3DVXA 3QPMA 4GSNA 1BX9A 3U6VA 2OE0A 1JZOA 2IMIA 1K3YA 3IAS2 4MJCA 2JU5A 2P0GA 1PKZA 2I1UA 4I97A 2FWEA 2H19A 3LXTA 4IVFA 3TOUA 3GUSA 3S9FA 5F8BA 3VPTA 4ML6A 2AHEA 1WJKA 2YWIA 1MDJA 1DBYA 3KIJA 4TR3A 1GUMA 5KN3A 1SYRA 5G1LA 2DBCA 3TUEA 4AF2A 4PQIA 4TXOA 5J4UA 4GCIA 3GX8A 2G2QA 1V58A 3BCKA 4MJAA 4CW9A 4EO3A 2GS3A 2DJ3A 2YJ7A 2MBSA 5GAND 4HU7A 1SKWB 14GSA 1T8EB 4N11A 6GSUA 2C0FA 2B5YA 1ZZYA 5IOWA 1M0UA 4TKYA 2X8HA 3V1WA 4NMUA 2H76A 1AW9A 3KEBA 1A8YA 2C0GA 2N5FA 2OE3A 3Q74A 2B7JA 4MF7A 3WT2A 5B7CA 2H71A 4L5OA 1BEDA 2VLTA 3WGXA 2C1YA 3M9JA 1EEJA 2OADA 2F51A 3FR3A 5ENUA 1O7UA 2H70A 3F4RA 5F05A 3N9JA 4N30A 4GLTA 5HR3A 1MDKA 2X64A 2AV4A 1Z9HA 5DALA 5J9BA 1ERTA 2P31A 2LNSA 3GURA 5B8AA 2E2MA 4D73A 4XCSA 4OFNA 4V2MA 6GSYA 2B1KA 4WETA 5HQPA 5G1KA 3GKKA 1PSQA 4Z7XA 3F3RA 1UA5A 3HY2A 1PGTA 1TXXA 4DSSB 2HSYA 3GH9A 3E0UA 3KH7A 2I81A 2LSTA 3G7YA 1HD2A 1OKDA 5HFIA 2E2GA 4WR4A 1ZYQB 3FZ5A 1GTAA 5C04A 3BJ5A 3KGKA 1X9WB 1EOGA 1GTBA 2JADA 1HYUA 4BL7A 2F3MA 1GH2A 2REMA 3IDVA 4V1Ap 2HZEA 3RPNA 4Q5NA 3Q18A 4IELA 4XS6A 5COHA 1X0RA 1XWKA 5IMZA 1SL1B 3CXGA 2MMAA 1WRYA 4IP6A 1O8WA 3O76A 3VWUA 3VFIA 3OR5A 1XW6A 1SKSB 5DJLA 4F9ZA 2IIYA 4HQSA 4YH2A 2CVBA 2FWGA 1NSWA 3EYTA 4K8MA 3I9V2 1X5EA 2C0EA 4EL1A 3M9KA 2KP1A 1FVJA 4LMVA 3RBTA 5ECQB 1BAYA 4KE3A 1OYJA 2H66A 2HLSA 5EY6A 4X43A 2AAWA 4HOJA 1DE1A 2H0IA 1ERUA 5IO0A 3RAZA 1VF4A 3C1RA 4JZQA 4POKA 1F3AA 3HZ4A 5G31A 2WCIA 4POMA 2PGTA 3PH9A 5D8IA 2YOIA 2YANA 5DDLA 3GA4A 4FYUA 5JCGA 4MP4A 4L0UA 1U3IA 2WDUA 3CSJA 3IPZA 1IYIA 3KMNA 3QD9A 2GZZA 4WF5A 3GKNA 4ECIA 3M8NA 1T4YA 3LFLA 3G7IA 3DKSA 4LL4B 5ECIB 2FGXA 3DXBA 2ZUPA 3GRXA 3VK9A 2VL2C 3HA9A 3O3TA 4AJ7A 4AGSA 2HZFA 2B3SA 2D2ZA 5C00A 4ZIJA 1URMA 2LJRA 4I2TA 2LEGA 4OMVA 3VWVA 4J2FA 3ME7A 1QQ2A 1TI1A 3TJBA 3ZVJD 1T7PB 3CTGA 1Z7PA 2O85A 3ZREA 22GSA 4N0ZA 1N2AA 5DAKA 3DGQA 3HJPA 3TRXA 3A5WA 1K3OA 5LD0A 3TB2A 2DJ1A 6GSSA 1R5PA 4GRFA 4XTSA 3Q6OA 2CVDA 3C7MA 2VM2A 4JRRA 2YCDA 4MF5A 1ERVA 4J57E 2IMFA 4RQRA 4ECCA 4OCEA 4PXOA 5J9CA 2EIOA 1VGLA 3IR4A 4GTUA 4RI6A 4XS1A 5INYA 4I5QA 5KEJA 2GSQA 2O89A 2X8GA 1QUWA 3D4MA 4WBJA 2JZTA 4CDOA 4K6XA 4Q5QA 1EGOA 1JZDA 3DMLA 1DSBA 2E7PA 4V2NA 4WR5A 5J5NA 2JL4A 4ISDA 2L59A 1OC8A 4GWRA 3LJRA 4NXIA 2GZPA 3GL5A 4RQXA 3P7XA 3KTLA 1J0FA 1SL2B 2AYTA 2OACA 3I6AA 4YAPA 3IXRA 4RUVA 4IS0A 1GP1A 5ECHB 2RUFA 2JSZA 4HS1A 2KHPA 4JBBA 5HR2A 3CSHA 4K7IA 4LMWA 4JEDA 1OVNA 2H1BA 2VUPA 1GRXA 2PVOC 4NPBA 4MH2A 4FO5A 2WULA 3MSZA 4TN8A 4KDYA 3TCOA 1Y25A 3HCZA 3WD6A 3D22A 2C4JA 3D4TA 1AQVA 4TXOB 4XRAA 1VF1A 1XWCA 4EUYA 1XVWA 5FT3A 2BTOT 1R26A 1AAZA 1EZKA 4ZILA 5CP1A 4BVYA 5FWGA 2ZCTA 1BQ7A 5GSTA 4IBPA 3VWWA 2DJ0A 5HFKA 5E59A 1K0AA 4O5RA 2FUG2 2E0QA 4PNGA 3GKMA 3FHKA 3UVTA 1JHBA 10GSA 2EIQA 3F9UA 5ECOB 1G0TA 4PUFC 1OC3A 2GQLA 3F3QA 8GSSA 3H8QA 3GIXA 3IHQA 3BBYA 1PX6A 3MDKA 2FA8A 1E2YA 2WS2A 5AISA 4EKZA 3DWVA 1Y6EA 3NOFA 1GWCA 4AJ6A 2MBTA 2OBIA 2C3NA 3A3TA 2RM6A 1QMVA 3F8UA 2J23A 5D96A 1NM3A 4KB3A 5DALB 2YPMA 5H5RA 2R2JA 1ZCPA 4GQFA 3FR6A 1HNBA 4D73B 1YKCA 1NHOA 2H75A 5IMDA 3US3A 3H93A 3EMXA 3GH6A 1XWGA 3FYGA 5G5EA 1AQXA 2ZNMA 3FZAA 3RHCA 11GSA 4PQHA 4KH7A 2H1AA 2O7KA 3BD2A 4MZWA 3CSIA 1AIUA 3UL3A 18GSA 3WT1A 1F6MC 3QAWA 3K8NA 3QMXA 4MPFA 1BG5A 1ZOFA 1F2EA 2HZEB 4IJ3A 4Q5RA 3RDWA 1WIKA 4ZBAA 5G2ZA 4OO4A 4KW6A 2RM5A 3ZTLA 2HNLA 1UN2A 20GSA 4ID0A 4TR0A 1FB0A 5ECPB 4KDUA 3ZIVA 3L78A 3LSZA 4JR4A 2LTKA 5IMCA 2PBJA 4GXZA 2HRFA 4YAVA 2FNOA 1BYEA 2V6KA 1FW1A 4YQUA 3L9UA 1TRWA 4ECJA 2H6YA 1SL0B 2GZYA 1XOBA 4QQ7A 5ABRA 4TW5A 5ECMB 1ON4A 1FO5A 3BCIA 3EURA 4RI7A 2CV4A 1XFLA 3LG6A 2TIRA 3TRQA 2FD3A 1ABAA 3UJ1A 4I8BA 3C71A 5D9XA 2VL9A 4N0VA 3M1GA 1GUHA 4PUAA 4MLYA 1T00A 2HT9A 4WF4A 4ECBA 3GHAA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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