1U6TA

Crystal structure of the human sh3 binding glutamic-rich protein like
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
VIRVYIASSSGSTAIKKKQQDVLGFLEANKIGFEEKDIAANEENRKWMRENVPENSRPATGYPLPPQIFNESQYRGDYDAFFEARENNAVYAFLGLTAPPGSKEAEVQAKQQALEHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of human SH3BGRL protein: the first structure of the human SH3BGR family representing a novel class of thioredoxin fold proteins
pubmed doi rcsb
molecule tags Protein binding, signaling protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein
total genus 39
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-08-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1u6tA00
4NAXA 4F03A 5JWRB 4V2MA 3IAM2 4PQIA 1Z5YE 3ZMKA 1GSQA 2YWOA 1O8XA 2R5GA 1THOA 3ISOA 4LA1A 4HU7A 1BX9A 3HY2A 2VUPA 2PPTA 3F3RA 3CYNA 2DIYA 3GKNA 5CYYA 5IPGA 3ZMLA 1OAZA 4HZ2A 4OCFA 5DBQA 1SK1A 2LJAA 3C7MA 3HA9A 1A24A 5HR2A 1T7PB 4JRRA 5IMZA 5ELAA 3DMLA 1MTCA 4ZB6A 3M3MA 3PINA 2X99A 1EV4A 1SU9A 1F3BA 4L8EA 4TW5A 1FVKA 1JZDA 2R6KA 1XOBA 2KUCA 1Z7PA 3L9VA 1R7HA 4G9HA 3LXZA 3CRTA 1SK2A 4G10A 1QFNA 2EIOA 2FCHA 4I8BA 1SENA 2EIQA 1DSBA 2VM2A 2BJXA 4AGSA 4EVMA 5ECNB 3TUEA 3TOUA 5IO2A 3SBCA 4EUYA 3U5RE 2X8CA 2H19A 5JWOB 3F3QA 4KDYA 3F4RA 2LRCA 4O92A 5FT3A 4KX4A 3GH9A 3CTFA 3ZRDA 5B6NA 1OKDA 1YEPA 1GTIA 3UMAA 2GDRA 4FYBA 3GMFA 5DAKA 2JSZA 3VWVA 1E2YA 4KSMA 5AGYA 2F3MA 3KZQA 2V32A 3GTUA 1GTAA 4IJIA 2AB6A 1GNWA 3DWVA 2REMA 3WD6A 5B6MA 2J9HA 4K9ZA 3VK9A 1N8JA 4TR1A 4PX1A 5DALB 2L4CA 2CVBA 4JR4A 4MP4A 3M1GA 1T00A 1TXXA 3M9JA 1AUCA 2WFCA 2JZSA 5FWGA 4BWSA 17GSA 5IOXA 2GZYA 1FO5A 4L0WA 1K0BA 3ERGA 3WT2A 1TKDB 5LD0A 1GTBA 2H1AA 3TCOA 2MMOA 2V41A 1EV9A 5HQPA 2CA8A 2C3TA 3VWWA 3DVXA 3HHVA 2VCWA 1MDJA 4RI6A 3QAGA 5C04A 1BQ7A 5AIVA 2XBIA 1K0DA 2RLIA 2H1GA 1IYHA 4X43A 2KLXA 1XWAA 3FEUA 1THXA 1J08A 4NHWA 5IOWA 1GSSA 1YDKA 1ERUA 4F0CA 3LGCA 3J7Yb 8GSSA 2YANA 2H01A 3IOSA 1EZKA 1I5GA 3RHCA 5CREA 4TR0A 5J41A 2LS5A 4OFTA 5HR1A 4QL7A 2YZUA 1GUKA 10GSA 3F6FA 4YQVA 2DJ1A 3IDVA 2PERA 5F06A 5KN3A 2OACA 1M9BA 4BVYA 2TIRA 5DJLA 2ZCTA 4EF0A 3NIVA 5EPFA 1TI3A 1M2BA 4GSTA 1SYRA 5G1KA 5C00A 3D4TA 5AISA 4ML1A 4EO3A 1XW5A 2DIZA 4H86A 3HDCA 1TDIA 3I69A 4IKHA 1JZWA 3GA4A 3L78A 4KE3A 4XRAA 2HLSA 2H0IA 1XW9A 2H6YA 4WR5A 1XWKA 4GCIA 4ZL8A 2M72A 2H76A 2AHEA 5ABRA 3IV4A 2LQOA 1SYXA 3TB2A 1JZRA 1AW9A 4FH8A 2I4AA 1AIUA 1MEKA 2IFQB 4WF5A 2V6OA 4FYUA 4OO4A 3GSTA 1FAAA 3VFIA 2ON7A 4TXOB 2L57A 3ZL5A 4ZBBA 5E59A 2DBCA 1GRXA 1K0OA 4GWRA 2V6KA 3HJMA 5LCZA 3P90A 4YAPA 2AYTA 3LJRA 3QFBC 2C80A 2GS3A 2NVLA 5GAPD 1WE0A 3WYWA 3H93A 5HFIA 19GSA 4NV5A 1ERWA 2PGTA 4I97A 5IMVA 2FA8A 4XHMA 3CSJA 1ZYQB 5F07A 2O89A 3GTUB 22GSA 3PGTA 5DVBA 1HNCA 2C0GA 3EE2A 2L5OA 4F82A 2GQKA 5D73A 2CZ3A 3SWLA 3O6TA 4N10A 3KCMA 1ZCPA 1XVQA 2H1BA 3EMPA 2A4VA 4JR6A 14GSA 2P5QA 3IPZA 3CMIA 3HD5A 3H1NA 5ELGA 1BYEA 3V1WA 3GURA 4AJ7A 3FKFA 5GZZB 2GZPA 1YF0A 1GL8A 3GFKA 4RQRA 2H30A 2FUG2 3F4SA 4EDYA 1HD2A 2H73A 3MAKA 3ZITA 2JACA 2YWMA 1GSUA 3VURA 1XW6A 2YJ7A 4MJAA 3R2QA 1USBA 2OBKA 2MZCA 3DEXA 4ECCA 1FG4A 3N5OA 2IMFA 1ZOFA 4IS0A 2VL9A 3CXGA 1GUHA 2VL3A 2PWJA 2DJKA 3GV1A 4DSRA 4MK3A 2AAWA 1C72A 5JWQB 2F8AA 5IIZA 5ECRB 5KN2A 4WETA 3L0HA 1ZZYA 1KEBA 5L71A 1F3AA 4WF4A 1V9WA 1PX7A 1X5DA 2E2MA 4OWYA 3LEFA 2H75A 3M0FA 2DJ3A 4RQXA 4AJ6A 4DSSB 1GSEA 3WGDA 4K1FA 3DVWA 1V40A 5DQYA 2GT5A 4DEJA 3D6IA 2B5YA 3QCPA 1HYUA 3FK8A 2LSTA 1FW1A 2R4VA 1TRUA 1SKRB 5DALA 5G30A 1YF1A 4V2LA 1SL2B 1A2LA 3TGZA 4KUNA 2G0FA 3WGXA 3TKSE 3Q19A 3C73A 3APOA 1XVWA 2VLVA 1VGLA 4V2NA 3A2XA 1A0RP 4GQCA 4HZ4A 2HZFA 1F37A 3GSSA 4O32A 1OC9B 1J0FA 2G2QA 1YQ1A 2LNTA 3QPMA 2LRTA 4N30A 3G7IA 1AAZA 1FVJA 2FWEA 1H75A 1XOAA 1TK0B 2RM6A 1CQGA 4G19A 1QMVA 3LSZA 2HYXA 2DMLA 2EIRA 4HQZA 3GHAA 3D22A 3BCKA 2YNXA 2ZUPA 2OE3A 5D9WA 2HRFA 4ZB8A 4ZBDA 2LJRA 3KTLA 2H70A 1ERVA 2KP1A 3GYKA 1ERTA 3FR9A 3ZIJA 3EURA 4LMWA 6GSVA 7GSSA 4I5QA 3L4NA 3MDKA 1F2EA 4KSOA 2YPMA 4KNDA 2CVKA 2YZHA 4KH7A 5ECPB 5IMAA 2CX3A 2IIYA 1TJDA 1R4WA 4N0ZA 1BJXA 4HQSA 1XZOA 2XPEA 4D73B 2R2JA 4MZWA 1B4PA 5HR0A 4FIWA 2NDOA 1EP7A 1WMJA 2N5BA 4F2IA 2JZRA 2MBTA 2PVQA 2XBQA 3P7XA 4HJMA 2P0GA 5H5QA 1ZMAA 3KJYA 6GSXA 4DVCA 3FY7A 3KTBA 4I2UA 4TXVA 1PKWA 4OCEA 5IQYA 1CQHA 3IE3A 2OA7A 2I3YA 2WULA 2I81A 1G0TA 4K0GA 5B8AA 2H72A 5B7CA 4MH2A 3TRPA 1JLVA 5ECSA 3US3A 3PH9A 5B8BA 4RUVA 3IBHA 1SKSB 2KOKA 2IFQA 1DBYA 4TRXA 2C0FA 3KGKA 3VWXA 1TK5B 4TXOA 4MMMA 3TKSC 4N0VA 5ENUA 1X9MB 5GSTA 3D0ZA 5D93A 3HJPA 2HSYA 4E8HA 1J9BA 2VCTA 2YV7A 3FR6A 2YN1A 4XS4B 3D4MA 4TR4A 1VF1A 5IMCA 3RPNA 1EGOA 2FWFA 3TJFA 2DJJA 1T3BA 3ERFA 1M2AA 3LQ7A 1ST9A 3GKKA 5ECQB 1YY7A 1ILOA 4MJCA 2F8FA 4KB3A 1GH2A 3W8SA 2FA4A 2JU5A 2L6CA 4TR3A 4EE0A 1GNEA 4PGTA 3VPQA 1IYIA 2VCXA 1WJKA 2C1YA 5D96A 3ZREA 2IMIA 4IQ1A 5J5NA 4ULXA 2HNLA 1PL2A 4YQMA 3FYGA 2QSIA 1TU8A 1X5CA 2P31A 2PMTA 3IXRA 2DC5A 3ED3A 2N5FA 1PGTA 3CBUA 4V1Ap 4ZB9A 5CO3A 4K8MA 1TRSA 2JSYA 1RW1A 2E7PA 3VPTA 3E0UA 1TRVA 1QGVA 2K8SA 2WZ9A 1U88A 4WEYA 1T8EB 1URMA 2IMDA 4KGIA 3HVVA 1EEMA 4IJ3A 1Z7RA 3DKSA 3M8NA 3CSIA 3FR3A 9GSSA 5E4WA 3GH6A 20GSA 1FB0A 1K3YA 1G7EA 2IMEA 2GSTA 3IK9A 4RI7A 5F8BA 3RPPA 2AUVA 5G5EA 2L59A 2VOCA 1Q98A 2RUEA 3H4KA 4ECBA 2LNSA 3JCML 1XPVA 4EL1A 1OVNA 1G7OA 4IP6A 5HFKA 3FZ5A 2E0QA 5DDLA 2DLXA 1GWCA 1M7TA 5DJMA 2MMNA 3ZVJA 3TKQA 1PMTA 4O7HA 4X0XA 2YOIA 2HE3A 2OBIA 3C71A 3F8UA 1TP9A 4DSSA 2IJYA 1UN2A 1M2DA 1R26A 4Q5RA 2LKUA 3UEMA 1YKAA 2CQ9A 2YP6A 3E9JB 1EEJA 2AJQB 5FHIA 2CZ2A 6GSYA 2HRNA 3MWHA 4PQ1A 1MD4A 1B9XC 3G9BA 3IR4A 1GSDA 5IO0A 4WXTA 4ML6A 2O87A 3HVXA 2YWIA 5HFGA 3KP8A 1VRSD 4L0UA 3GRXA 3KH9A 3HJOA 4K0NA 2ON5A 3BD2A 5HR3A 3IAS2 1TRWA 4V1Ag 1OC9A 3Q18A 4TOPA 4EDZA 4ZL9A 4EXJA 3GL3A 1Z3EA 4E8EA 2CT6A 2HT9A 3UBLA 2HXKA 3E3EA 3P2AA 5ECLB 1GLPA 4HU9A 1TOFA 4MCUA 2VAFA 4XIHA 1TW9A 1GUMA 2B7KA 2HZEB 2PBJA 3G7YA 3UJ1A 2PN8A 2FY6A 2KHPA 1M0UA 5DCHA 2VCZA 4XS6A 2XC2A 1HNAA 2B5XA 2I1UA 4AJ8A 2GVPA 1S3AA 3IRAA 2IPAA 3QDNA 1GP1A 3UVTA 4CDOA 4GQFA 5IMFA 1S3DA 3I6AA 4K7NA 4XRDA 3FZ4A 1OC3A 3D5JA 3W8JA 1N2AA 4KCAA 2WCIA 2X8HA 3RDWA 3WGEA 2MBSA 3NZNA 1LBKA 3F63A 3FRCA 2CVDA 1EWXA 2BMXA 2VL2C 4ZBAA 4D73A 1A23A 3L9UA 2H8LA 2NTOA 5G1LA 3KP9A 3C8EA 3EMXA 3VI7A 4LMVA 2C3NA 4LL1B 1LJRA 3ZIVA 4NMUA 1V2AA 2JZTA 4IQAA 6GSTA 2WB9A 2MMAA 5CP1A 1YKCA 2H0GA 3HYPA 4BA7A 3KD0A 1WP0A 5AN1A 4K7IA 5J3RA 2CX4A 12GSA 1AC1A 1UA5A 4IVFA 1B9YC 2LV3A 4TVEA 5CRHA 1NHOA 3G7JA 1T1VA 4MA9A 5F05A 4HUAA 2YV9A 1PN9A 5COHA 3HVSA 2WGRA 4WKWA 4XS4A 4O5RA 3F0IA 4POMA 2K9FA 2B7JA 2V1MA 4ACSA 4CW9A 3O3TA 4G2EA 1DE1A 5GAND 2B1LA 3Q74A 2H6ZA 4PUAA 1A0FA 2RUFA 1RQMA 1O7UA 5INYA 4MZCA 3H8QA 2GSSA 3CTGA 3TKSA 1WPIA 3KEBA 4KA0A 2F9SA 4MJBA 2O7KA 2CAQA 1V98A 1PRXA 1X0RA 5A5KA 1BG5A 2MYGA 6GSWA 2WJUA 3DD3A 1KNGA 4JEDA 4BVXA 1YEXA 3KMOA 1PL1A 3I43A 3O76A 3M9KA 4Q5FA 2C8UA 1AXDA 2DMMA 3ME8A 4ID0A 3QMXA 4XCSA 1WIKA 3IK7A 3GIXA 4CHSA 4HDEA 2I9HA 2ALBA 4PQHA 1S3CA 1GLQA 1U3AA 4J57E 4POLA 2D2ZA 3HCZA 4OO5A 3QOUA 3IHQA 4WBRD 4MF5A 1V57A 4KW6A 1XXUA 1V58A 4NWYA 3KXOA 6GSUA 1TU7A 11GSA 2LQQA 3LWAA 2WS2A 1B48A 2QGVA 2VCQA 1Y6EA 1O85A 1SL1B 3BJ5A 4TKYA 1TK8B 4QL9A 1MD3A 5IM9A 1PD21 1W89A 1FOVA 1Z6MA 5ECMB 3MNGA 1XBSA 2B3SA 4BWQA 3S9FA 1XIYA 3GX8A 4IBPA 1SJIA 1MDIA 2V2GA 1A8YA 4ECJA 1GTUA 3WT1A 1R5AA 3P8WA 3LFLA 1M9AA 4L5OA 5G2ZA 2ZNMA 2GSRA 1QK8A 5ECHB 5CAXA 4IN0A 4MDCA 4NV2A 3I9V2 3N9JA 3TJBA 1U6TA 1ML6A 3TKRA 4FO5A 2JL4A 1I9DA 2RIIA 2CV4A 2B1KA 4Z7XA 5D9VA 1X9WB 2LEGA 2XHFA 4X1UA 4F0BA 2GGTA 3GNJA 1F9MA 2IMKA 3TJKA 3UVHA 3C1SA 4YQUA 3KM6A 2TRCP 1H4OA 1ON4A 3LYKA 5A4VA 3A5WA 5EL8A 2H1DA 4QQ7A 4OFMA 2P5RA 3QAWA 2PUKC 3ZLPA 1BEDA 5CRDA 1M99A 3AY8A 1K0MA 4HEA2 4TN8A 1O73A 2HZEA 5CNWA 2NBSA 4N11A 2GLRA 1X5EA 3KH7A 4MABA 3UAPA 2LJKA 1AQWA 4JE1A 2Z9SA 3QAVA 2GQMA 1ABAA 4P3YB 1K0CA 2VM1A 3HZ4A 1EOHA 5H5RA 2HFDA 3UL3A 4ZL7A 2IWTA 3EWLA 4Q5QA 4BL7A 3ZTLA 2VCVA 1ZGNA 4NHZA 2C0DA 2EC4A 5CRGA 1OE7A 1UVZA 1ACVA 1E6BA 5DQSA 3LG6A 4OMVA 3W6GA 3BOAA 3H79A 16GSA 2M80A 1A2MA 2JADA 3KIJA 4MPFA 3ZFLA 2GSQA 2PU9C 1SJ6A 3BCIA 5ID2B 4GF0A 2ES7A 5JCUA 4I6XA 4JBBA 2FGXA 4HOJA 2QKEA 2YWNA 4GXZA 2MMZA 2VL2A 1GSYA 3GUSA 1VF2A 3ERWA 3EINA 1ZL9A 5GSSA 4POKA 2OJLA 4MLYA 4HI7A 2FNOA 3TOTA 2GTUA 1U3IA 2HI7A 1PX6A 4IP1A 4PUFC 3NOFA 3HZ8A 4MZBA 4JZQA 1XWCA 2H0HA 4MPGA 2M46A 3APQA 13GSA 4ECIA 1T4YA 4PNGA 2C0EA 2B6MA 1A2JA 1YZXA 1G6YA 1EGRA 5F0GA 1VF4A 3RBTA 4ZXGA 3A3TA 4IGJA 4KDXA 2QC7A 5KN0A 1NSWA 4IELA 4MH3A 2FWHA 1U87A 2O8VB 2VLTA 4Q5NA 2O85A 1EP8A 3APSA 4XTSA 3F9UA 1AQXA 1B8XA 2K8VA 2L4QA 4WBJA 1AQVA 1R5PA 4L5LA 3RHBA 3FHKA 4ZILA 2C3QA 2OKAA 5KEJA 2YCDA 1SKWB 1K0NA 3GKXA 5G5FA 2A2RA 2WRTA 1Z6NA 4YAVA 1XWBA 1DUGA 5D8IA 4GSNA 2TRXA 1PQNA 2VLUA 3CRUA 2IL3A 5J9CA 4WR4A 1OC8A 4OFNA 3ZZXA 2A2SA 4XS1A 2F51A 4K6XA 3LYPA 1VF3A 2E2GA 3LORA 4ISDA 3IA1A 4NPBA 4POBA 3GKMA 3L9SA 4HS1A 2J23A 2R37A 1XWGA 3FZAA 2VD0A 2GZZA 4PXOA 4MJEA 3BBYA 5ECKB 5IPHA 3GN3A 3QR6A 1BAYA 2WDUA 2RM5A 6GSSA 4NXIA 3ZFBA 4ZIJA 1KTEA 3VI5A 4BPYA 1QQ2A 2R3XA 1SK0A 1DE2A 1SL0B 3LXTA 3DRNA 3U6VA 1TI1A 1O6JA 4OD7A 1JFUA 3EC3A 1SD9A 3DXBA 2BTOT 5A4UA 5AIXA 5DAKB 2L6DA 4ILFA 1WWJA 3QD9A 1Z9HA 4YH2A 3J7Yk 3ME7A 2OE1A 2NPBA 4MF7A 3F6DA 4PURA 1XFLA 1QUWA 4KDUA 5A4WA 2K18A 4KCEA 1UC7A 3IC4A 4FYCA 4LLRA 3MSZA 5EVOA 3DYRA 4PNFA 5J4UA 4TR1B 2VO4A 3F4TA 4IW9A 3UARA 3VWUA 1OYJA 2DJ0A 5JCGA 1KBNA 2LRNA 1PSQA 2GQLA 2KP2A 3EU3A 3GX0A 2FD3A 3TDGA 1JZOA 1O81A 1TTZA 4J56E 4K2DA 1JHBA 1OKTA 1XCCA 2LUSA 4DSQA 2OADA 4AF2A 4LL4B 1EOGA 3DIEA 1YJ6A 4GSSA 1OE8A 1FB6A 1NM3A 5EY6A 2GT6A 4F9ZA 5JCWA 3GL5A 1PKZA 5ECOB 1HQOA 2H74A 3TJJA 3KMNA 2DJ2A 3CSHA 1JLWA 3K8NA 3QFAC 4I2TA 3OR5A 3A2WA 2VIMA 3FZ9A 5D9TA 4GLTA 1K3LA 3TRQA 1NHYA 4JU5A 5D9XA 1ZYEA 1GSFA 18GSA 3A2VA 2VD1A 1HNBA 1Q4JA 1T4ZA 2C4JA 1F6MC 2FHEA 1PA3A 1G6WA 4J2FA 1K3OA 3HKRA 3Q6OA 1SJZA 2YJHA 3D21A 1FHEA 1LU4A 1A8LA 2IN3A 5ID2A 1O8WA 3EU4A 1QXHA 5J9BA 4IHUA 5KN1A 1K0AA 2PVOC 2FLSA 2CAIA 1RK4A 1W4VA 2HSHA 5G31A 5CRWA 2K6VA 2FWGA 1GULA 5DCGA 1NW2A 2X8GA 4HJ2A 3ZYWA 2H6XA 2L5LA 2H66A 2OE0A 3C1RA 5ECIB 1WOUA 2H71A 4GRFA 2X64A 2DSAA 1SD8A 4KAEA 1B4QA 1MDKA 3TKPA 4MF6A 3UBKA 4K7OA 5IMDA 3PR8A 3TRXA 4EC0A 5LNKe 1Y25A 3UIWA 1X9SB 3ZVJD 3RAZA 3FW2A 2B5EA 3EVIA 5H5SA 2AV4A 3TJGA 2XPDA 2LTKA 4GTUA 3VLNA 1WRYA 3HXSA 3DGQA 3EYTA 4EKZA 3UOMA 2N5AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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