4Z2TA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase w225y from pseudomonas azelaica
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
581
structure length
559
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYYMFVAALRMIRPWNKWICVWGEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
total genus 190
structure length 559
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2tA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2tA01
3BI5A 5IPYA 2R45A 3NYCA 1P2EA 1BGJA 1KSSA 1HYUA 1ONFA 4B68A 1F8WA 1EL7A 3NH3X 3QFBA 3QFAA 4U8IA 3CPJG 4K5SA 1D7LA 3F8DA 3QSEA 2AAQA 4B1BA 1XPQA 3AXBA 4HB9A 3DK9A 4X9MA 3CN8A 1ZMCA 1E1KA 4J57A 5HHFA 2APGA 1F6MA 4OPUA 2X50A 3GRSA 2XCGA 2QCUA 5JCMA 2E5VA 1PDHA 5KVHA 2YQUA 3P9UA 2BCPA 5IQ4A 1N1PA 2C3CA 4U8OA 1TDFA 3KLJA 2CFYA 2C7GA 3AE5A 3Q6JA 1OJDA 4A5LA 2YG5A 4EMIA 1S2QA 1GRGA 4OPTA 1JRXA 2WPEA 2GVCA 2YVJA 1PS9A 1B5QA 2BACA 2JKCA 1DXLA 3VR9A 3EANA 3ITJA 1NHPA 2C70A 4TM1A 4H4VA 1K0JA 2YLXA 4IVOB 4O5UA 1GRFA 4GDEA 2GH5A 1JEHA 3C4AA 2PHHA 4CCRA 4FX9A 4UDRA 1DJQA 2JBVA 3UCLA 2X8HA 1L9EA 3IF9A 3UKAA 4APNA 1JU2A 3LOVA 5FS8A 1DODA 4IVMB 3V3NA 3B3RA 1K0LA 2JAEA 4C3XA 1VRQB 2E1MA 1FECA 3FBSA 4U2SA 1N4UA 1MOKA 1E39A 1IUSA 1IJHA 1CC2A 2WU5A 3GD3A 4XXGA 3ZDNA 2WS3A 3C4NA 4EM3A 3VRDB 4K8DA 1F8RA 2F5ZA 4D04A 1GT8A 4PAAA 1YQZA 2Q7VA 4Y4NA 2A8XA 5HY5A 1PBEA 4YSXA 3NT6A 2GRTA 2YR5A 1ZMDA 4OVIA 1NG3A 2X3NA 1W4XA 1VQWA 4GDPA 3UKLA 3K7MX 2X8CA 1Q9IA 4YTPA 4K7ZA 3KU9A 4EMWA 4KX6A 4YWOA 4U8KA 1YQ4A 1PBBA 3GMBA 1N4VA 2WOWA 4LA1A 2WESA 1LQTA 2YR4A 3AE6A 1H86A 2JK6A 5BRTA 1PN0A 4ZN0A 3ATQA 4ICYA 3CPHG 3GYIA 3ICRA 4YKFA 1GERA 2GF3A 3NK1X 5M10A 3ABVA 3GD4A 4B66A 3UKQA 1GOSA 3QSMA 2JB2A 4Y4LA 4AT0A 3EPTA 2C65A 4IA6A 4BV6A 4A6NB 1D4CA 4EMJA 4ECHA 1NDAA 3QSSA 4M52A 3O0HA 3VRBA 2IVEA 3NYEA 1NAAA 2R0PA 1CC4A 2W0HA 3AEEA 4XWZA 4CY6A 4Y4MA 1GTHA 1PBDA 4KPRA 2FBWA 3AD9B 1JRZA 3SFDA 3KVEA 2Y6RA 5LV9A 1RP0A 4TLXA 1PJ7A 3S61A 1Y0PA 1EL9A 1JRYA 3B6DA 3CNPA 3EF6A 2XLUA 3QJ4A 1GETA 1NPXA 4CRTA 1NHRA 1XHCA 2YLZA 3CTYA 3I6DA 4EQSA 2EQ8A 1D4DA 1FEBA 4H2RA 4J34A 1D5TA 2ZBWA 1GREA 4FK1A 1GALA 2C72A 2BXSA 2V3BA 3PS9A 4H2QA 4USQA 4JY3A 3WE0A 3AE1A 2WQYA 1IUUA 4B64A 1LV0A 3AB1A 3GYJA 2B9XA 4PABA 2ZZBA 2YR6A 4YSZA 2BC1A 2YVFA 2WU2A 4B69A 4J56A 4BJYA 3T37A 2QA1A 1PXCA 1TDKA 4TM4A 1ELIA 4JN9A 1VDCA 1ZOYA 4JY2A 5C3JA 2GR0A 2YG3A 3LADA 3UTGA 1MO9A 4U2TA 2WP6A 1CL0A 2BA9A 2FJEA 1LPFA 3SFEA 1M6IA 3NKSA 2V6OA 2I0ZA 5EB5A 2WPCA 2YLTA 4H4TA 2EQ9A 2VRLA 2YVGA 4MJWA 3AE2A 1LJ1A 2XFUA 3FMWA 2OLNA 4U8PA 4H2PA 3ALMA 3ICSA 4OCGA 1IUWA 3D8XA 3GWDA 3FG2P 3CNJA 3NG7X 4XWRA 2XFOA 3UOVA 2Q0LA 5KWFA 2BXRA 3NNEA 3AE8A 4IA5A 2CULA 2A87A 3NN6X 3RP6A 4BURA 1MXTA 4H4SA 3REDA 4P9SA 3AYIA 3ADAB 2WOVA 1NG4A 4IV9A 3AEGA 1ZY8A 3AD7B 4FK1C 1BKWA 1KSUA 4Z43A 1PJ5A 2RGJA 3DMEA 2C73A 2R0CA 2RABA 4H50A 1O94A 3LJPA 1E1NA 4JNQA 3BI2A 5BULA 2ZZCA 1GNDA 1GTEA 2WDRA 2GR2A 5KXJA 3CNTA 1F8SA 3RP8A 4DSGA 1CC6A 1EBDA 1E1LA 1S2YA 5J60A 1O95A 3AE3A 3KPFA 4OPIA 4CY8A 4BK1A 1PBFA 2YM2A 1B37A 2ACZA 2Y6QA 3LXDA 1L9CA 2Z5XA 2JB3A 1NEKA 2BCGG 3DH9A 3DGZA 3Q9TA 2C64A 1SEZA 3L8KA 4OPDA 4EQXA 4USRA 1S3BA 4AP1A 3H8IA 4H2NA 3RP7A 3NRNA 5U25A 4K22A 1H7XA 3DK8A 4GCMA 4Z44A 3UTFA 5JCLA 2FJBA 1PXAA 4RG4A 4RSLA 4DNAA 1OJTA 1YQ3A 3II4A 3PVCA 2WPFA 5U63A 4H4ZA 2BYBA 3RHAA 2JB1A 1KF6A 2VQBA 4EM4A 2E4GA 2GAHB 3AYLA 5FS7A 2UZZA 1YY5A 2GQWA 2Z5YA 5J7XA 3IHMA 3K7TA 3CGCA 3FIMB 3CNSA 4YSYA 3VRAA 4K5RA 3ICTA 2PYXA 5U1OA 1LVLA 2XVJA 2XFNA 5KOXA 1CBOA 1CJ4A 4J2WA 2V60A 4EIQA 1ZDLA 2GV8A 1REOA 4AOXA 2C75A 2YLSA 2EQ7A 1ZK7A 2J3NA 2XVEA 3ALJA 4AP3A 2NVKX 1ZOVA 1TYTA 1V59A 2YWLA 1B4VA 4LU6A 1IUVA 4K2XA 2ZZ0A 4TM0A 1GRAA 4H4PA 4YKGA 3H4KA 3DJJA 1UKVG 2YAUA 5FMHA 3DA1A 3UKPA 1H82A 1VG0A 3G5SA 3GDPA 4A7AA 4H4UA 1GRHA 1M64A 1L9DA 3D1CA 4U8MA 2XDOA 4WCTA 1CJ2A 2WP5A 1LQUA 1S3EA 1Z6LA 1ZX9A 2OALA 2WDQA 4A99A 4OPCA 4TM3A 2BS2A 1CJCA 3ATRA 4YTMA 5IQ1A 1TYPA 3NK0X 2OAMA 4H4RA 3UKKA 4CNJA 1TDEA 3UP5A 2TMDA 2WBAA 2B9YA 4REKA 2YG7A 1CF3A 3KD9A 4U8LA 2BS3A 2R0GA 2XFQA 4BK2A 4C5OA 2BS4A 3NYFA 4RG3A 1DOCA 3K30A 5JCNA 4A6NA 4J36A 1BF3A 2GR1A 2XVIA 3COXA 1QO8A 2O9ZA 4Z2UA 4H4QA 2BK3A 1E7PA 3NK2X 4WX1A 2BC0A 3AD8B 1D4EA 3P4RA 4C3YA 5BVAA 4CCQA 2YM1A 3NIXA 1PHHA 3DJEA 1NENA 1RYIA 3BI4A 3F8RA 2QA2A 4Z24A 1KFYA 2OA1A 2H88A 4YT0A 2HQMA 1IUXA 3AYJA 3BHFA 4X9NA 4Z2RA 2ARDA 3UOYA 2GMJA 1O5WA 4J31A 3DJDA 1YKJA 5GRTA 2YLRA 4NEVA 1DOBA 1E1MA 1GEUA 2WDVA 3AWIA 1ZP0A 3CNDA 4JNAA 5TR3A 4FDCB 2RGHA 2GEWA 4BK3A 1FOHA 5ER0A 2QAEA 1GRBA 3LZXA 2GR3A 3LB8A 3QVRA 2C67A 4B63A 2XLPA 3GSIA 3UKFA 1JNZA 1XDIA 4UP3A 1K0IA 4NTDA 4GF7A 2XYOA 5M0ZA 5EB4A 1KNPA 2C76A 4J33A 3IWAA 4I59A 4BJZA 1ZKQA 4JQ9A 2FJDA 2R9ZA 2OLOA 3R9UA 4GR1A 4D03A 2TPRA 2A89A 4E0VA 1H81A 2R46A 4EQWA 3AEAA 3NN0X 1IUTA 4YSHA 5JCIA 1Q1WA 2WHDA 2BABA 4ZCDA 1DNCA 4C77A 1AOGA 1NHSA 1QLBA 4CBQA 1L0VA 3DJGX 1B8SA 2VVMA 2FJAA 3ALLA 2X99A 2XVHA 1FEAA 2IIDA 3BHKA 1K4QA 1KNRA 3CGBA 3ZYXA 1H83A 2RGOA 4U8JA 4AOSA 5FS6A 3M12A 4B65A 2Q6UA 3C96A 3KA7A 4H4WA 2WEUA 3JSKA 4LIIA 3FPZA 3OC4A 2EQ6A 2YG6A 3V76A 1X31B 4ZCCA 3PO7A 3DK4A 3GDNA 5DBJA 2NPXA 1H84A 4N9XA 3AE4A 3P4SA 4AT2A 2VVLG 3SM8A 5BUKA 4H4YA 3CIRA 3H8LA 1OJCA 2B76A 2GMHA 3S5WA 3SGLA 1CJ3A 4C74A 3P4PA 3AEFA 4NTEA 1Y56B 1GV4A 3UTHA 3IC9A 1TDOA 4OPLA 1COYA 2B7RA 2C66A 2AR8A 1OJ9A 1EL5A 3URHA 4O5QA 2R4EA 2GQFA 1XANA 2WP9A 2CVJA 3K7QX 3M0OA 4TLZA 3V3OA 1GSNA 4Z26A 1FL2A 3E1TA 1E6EA 2GB0A 1DOEA 4ADWA 1GRTA 4A9WA 4GRTA 4HA6A 1JNRA 3VQRA 2WOIA 3RNMA 3I3LA 4U2LA 5GSNA 4NZHA 3P1WA 2VOUA 1KDGA 3AECA 2V5ZA 3P4QA 5KOWA 2V3AA 2X8GA 2Q0KA 2XLRA 3CGDA 3DGHA 4YTNA 1JOAA 3M13A 4DGKA 2DKIA 4Z2TA 4YXDA 1TRBA 5CKUA 3AE7A 3UKHA 1GXFA 4DSHA 2YG4A 1BGNA 1PXBA 3CPIG 2B9WA 2YLWA 5KVIA 2IVDA 2WETA 2B7SA 3IHGA 1EL8A 5EBKA 2XFPA 4A65A 3ISHA 2XLSA 3NLCA 2DKHA 3EAOA 2C3DA 3OZ2A 4A79A 3BNUA 3GRTA 3VR8A 1Y56A 5HYMA 1LTXR 3UP4A 3L1RA 1TDNA 4H4XA 3AEDA 4NTCA 4UDPA 5JCKA 3AEBA 3KKJA 3UOZA 5FS9A 1N4WA 5KRQA 4EIPA 1GESA 4GUVA 3CGEA 3GMCA 4H7UA 5C2TA 4CNKA 2GAGB 1FCDA 3AE9A 2BK5A 2R4JA 2XLTA 1RSGA 3NHOX 1DJNA 1Q1RA 2CDUA 5EOWA 5HXIA 3SQPA 1CHUA 2V61A 4NEWA 1OJAA 1H7WA 1PJ6A 5CQFA 2VRMA 3UTEA 4EQRA 3UOXA 1D7YA 3G5RA 3G5QA 4B67A 2VQ7A 4UDQA 1BZLA 2BK4A 4X4JA 3QVPA 3GWFA 1VG9A 4OPGA 3BNMA 4U8NA 3LZWA 4I58A 3NTAA 1BWCA 1GPEA 3F8PA 3NTDA 1PBCA 2H89A 3NGCX 1H6VA 1NHQA 2XVFA 5L46A 1F3PA 1P2HA 2VZ2A 3HZLA 4JDRA 1QJDA 2VVLA 2AQJA 4Z25A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5IPYA 3NYCA 1P2EA 1EL7A 4U8IA 4LLRA 1D7LA 1XPQA 3WGEA 5GSSA 3HD5A 4X9MA 3CN8A 1ZMCA 4IW9A 2APGA 3CRTA 1F6MA 2X50A 2I3YA 3GRSA 2YPMA 1YF0A 5GSTA 4ML6A 2GSTA 2YQUA 3GKKA 5IQ4A 5IIZA 4U8OA 1TDFA 2CFYA 3Q6JA 3TJKA 4ZB8A 1OJDA 2YG5A 2TIRA 2VIMA 3SBCA 2GVCA 1B5QA 4II2A 2EIQA 3LORA 1B4QA 1NHPA 2C70A 3A3TA 4TM1A 3IAM2 2YLXA 1K3LA 4I2TA 5BMUA 3FYGA 3IR4A 4KSMA 4FX9A 4UDRA 4KDXA 19GSA 3UCLA 4L8EA 6GSSA 3DXBA 5FS8A 3SZCA 2L6DA 4GAVA 4ZBDA 1MOKA 1IUSA 3ZDNA 4XXGA 2WS3A 3C4NA 4K8DA 5A4WA 5DCGA 1IYHA 4KDUA 5DJMA 1XWCA 5HY5A 3F0IA 3T2KA 3NT6A 4OVIA 2X3NA 4GDPA 4WKWA 3UKLA 1Z9HA 4L5LA 4XS4A 3UBLA 4YTPA 1G7OA 3NIVA 4GSSA 2LKUA 1M99A 4YWOA 4BVXB 4U8KA 2AYTA 3EWLA 3GMBA 3TRXA 1Y6EA 1AQWA 2WOWA 3RAZA 1LQTA 2OADA 1G7EA 4JZQA 3AE6A 3ICRA 2GF3A 3BCKA 1AW9A 1B9YC 2DJ3A 4A6NB 2E2GA 3EMXA 4O5RA 3QSSA 2R0PA 1JZDA 2W0HA 4CY6A 2YP6A 2YNXA 1ZYEA 1PBDA 1MDJA 5ELAA 4KUNA 3O6TA 3PR8A 1RP0A 3S61A 1JRYA 4CRTA 2XLUA 1NPXA 4EQSA 4DSRA 5ID2B 2EQ8A 1D5TA 1M9AA 2ZBWA 2IFQA 2UZ8A 2R37A 1AAZA 2C72A 2ZNMA 3PS9A 4H2QA 3WE0A 4F0BA 4WBJA 5J4UA 1LV0A 5KNLA 4GTUA 2ZZBA 4YSZA 2WU2A 3EU4A 4I97A 2ON5A 3T37A 1PXCA 4TM4A 2IPAA 1ELIA 1ZOYA 1X5CA 3EC3A 4ECCA 1AC1A 5CRHA 2WFCA 2DJJA 4X1UA 1M6IA 1TRSA 4CDOA 2WPCA 3UIWA 3GTUB 3FMWA 1XWAA 3ICSA 4OCGA 4K0NA 2XFOA 3WD6A 2IMFA 4V1Ag 2CULA 3F8UA 3NN6X 1URMA 3DGQA 2YCDA 4G0IA 3HVSA 4ZB9A 1QQ2A 1DE1A 3E9JB 4ECJA 4FK1C 3LFLA 3M1GA 5KN0A 3DMEA 2R0CA 4JNQA 4YQUA 4POBA 1E1NA 1FB6A 3KM6A 1GTEA 1EP7A 2DIZA 4YQVA 4DSGA 2YZHA 5GAND 3HZ4A 1WP0A 3HJPA 1B37A 1FOVA 3L9UA 2H0HA 3LQ7A 2JB3A 2KUCA 1GSSA 1HD2A 5H5SA 5D9WA 4OPDA 2YWNA 5A5KA 8GSSA 4AP1A 2DJ1A 1M7TA 2MMAA 4KNDA 4H2NA 3RP7A 3NRNA 6GSWA 3QPMA 5U25A 4K22A 3LYKA 1H7XA 3DK8A 4GCMA 2XHFA 1SJIA 5JCLA 1M2AA 4DNAA 1BAYA 4KCAA 4KA0A 1RW1A 2CA8A 1ZGNA 4OCEA 1PGTA 3RHAA 2JB1A 4EM4A 2GAHB 3AYLA 4ZL8A 2Z5YA 3D4TA 1B4PA 3FIMB 3CNSA 2X49A 2N5AA 1ZOFA 6GSVA 2LRCA 3GV1A 1LVLA 2XVJA 1CBOA 3J7Yk 1CJ4A 2V60A 2GV8A 1REOA 2EQ7A 3H1NA 2YWLA 4LU6A 1V59A 4IHUA 2KLXA 4E8HA 1PFOA 4H4PA 3H4KA 2IJYA 1OE8A 3HVNA 1V40A 3A2WA 3GX0A 3UKPA 1VG0A 2MMNA 3R2QA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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