4Z2TA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase w225y from pseudomonas azelaica
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
581
structure length
559
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYYMFVAALRMIRPWNKWICVWGEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule tags Oxidoreductase
total genus 190
structure length 559
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2tA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2tA01
4RG3A 1NAAA 1ONFA 1YQZA 2WOIA 2WP9A 4Y4MA 2APGA 4A9WA 3ALMA 4IVOB 2XLSA 3CIRA 1IUWA 1ZX9A 1JNZA 4BV6A 2B7SA 2VVMA 2A89A 1CC6A 3BI2A 4UDQA 4Z2RA 3D1CA 3AYIA 4AP3A 4EQSA 2GR1A 1Y56A 5IQ1A 4H2NA 2C72A 3NTAA 4OPIA 3EPTA 4AOXA 3VRDB 2VQ7A 1H82A 3NH3X 3LB8A 3VRAA 1L9DA 4NTCA 1TDFA 5DBJA 1L9CA 3CGDA 4NTEA 4OPCA 3ICSA 3CTYA 1K4QA 2BA9A 3OZ2A 1GOSA 1VQWA 1S3EA 4EMWA 4H4XA 1VDCA 1PXBA 2ZZCA 5CKUA 4DNAA 2B7RA 1H81A 4JNAA 3CNPA 3BI4A 3UOVA 3NN0X 1XDIA 2OLNA 2YQUA 4REKA 1DOCA 4UDPA 2C76A 5KVIA 5U1OA 1RSGA 2E4GA 3AECA 2GF3A 4BK1A 2GVCA 3AYLA 3GDNA 3BNMA 1TYPA 4K5RA 1B5QA 1IJHA 3CGEA 2FJDA 4Z2UA 4J31A 3UOXA 1H84A 1KFYA 1DXLA 4C74A 1JOAA 4U2LA 1F8WA 1O5WA 3C4NA 3V3OA 1PBBA 2VVLA 4WX1A 3VR8A 2VOUA 3NT6A 3VRBA 3NLCA 3GMBA 1E1MA 2XYOA 4C5OA 2B9WA 3C96A 2R46A 4Z2TA 3L1RA 2WU5A 1GV4A 3AEEA 1PBEA 3SGLA 1D7YA 3B6DA 1FEBA 3BNUA 2WPFA 3H4KA 3UKAA 3ZYXA 2JB2A 5FS9A 1JEHA 1LQTA 1YKJA 3K30A 1BGJA 3G5QA 2Q0LA 4O5UA 1LV0A 3VR9A 5LV9A 3T37A 4X9NA 3E1TA 2QAEA 1JRZA 2XCGA 4ZCCA 4A65A 3ADAB 1B8SA 2O9ZA 1IUXA 3HZLA 4Z26A 4LU6A 3C4AA 1IUSA 3DK4A 1OJCA 4K7ZA 1EL5A 4PABA 4U8IA 2GEWA 4H4QA 4A6NB 4EM3A 4FX9A 4GDEA 4USRA 3F8PA 2WU2A 1NDAA 1KSUA 3CNJA 1CJ4A 1GRHA 2GRTA 4M52A 5FS6A 4B64A 2GQWA 4I58A 1NHSA 4BURA 2FBWA 1TDNA 4E0VA 3NRNA 2B9XA 3URHA 1DJQA 1Q1WA 3M13A 2FJBA 4PAAA 4HA6A 4KPRA 5ER0A 1TYTA 5EB4A 1M64A 1DOBA 2ZBWA 4EM4A 1PJ7A 4ZN0A 4DSHA 3DMEA 3GMCA 2BXRA 3CGCA 5IQ4A 2DKIA 2WESA 1F8SA 3GYJA 1KF6A 1KSSA 1O95A 5CQFA 4K5SA 2Q6UA 1CJCA 1Z6LA 3L8KA 2GB0A 2JB3A 4J33A 2VRMA 3CPIG 3ISHA 1XPQA 1PXCA 3AXBA 4RG4A 5JCIA 3QFBA 4OVIA 4H4RA 3GRSA 3P9UA 3Q6JA 1Y0PA 4FK1A 4KX6A 5EBKA 2XFPA 4JNQA 1ZP0A 3AD7B 4AOSA 3V3NA 4DGKA 1PS9A 4UDRA 1JNRA 1MO9A 1NPXA 3LOVA 2YM2A 1DODA 3AD8B 4TM0A 2WBAA 1L9EA 1PBFA 2YG4A 4JQ9A 2ACZA 5J7XA 4C3XA 2WOVA 3QFAA 2QA2A 4Z44A 2BXSA 4H4UA 2X8GA 2YVGA 2WHDA 1GREA 3M0OA 2RGOA 3NG7X 2BC0A 1H86A 3DH9A 4XWZA 3SFDA 3UKKA 2RGJA 1OJTA 3IF9A 2BACA 3SFEA 2C75A 3CPHG 4J36A 1EL8A 1EL7A 1Y56B 3QSMA 3Q9TA 3P4PA 1NHPA 2PYXA 4EIQA 2B9YA 3CGBA 4H4TA 4EQRA 2XLRA 4TM1A 4ADWA 3BHKA 1GPEA 2GMHA 1PDHA 3QVRA 1PN0A 1RYIA 2YG5A 4GDPA 4ICYA 3UCLA 2XDOA 2GH5A 1BGNA 4MJWA 4H2QA 4BK2A 3NTDA 1F6MA 2R45A 2IVDA 2X99A 4YTNA 1RP0A 2J3NA 4GR1A 3AE2A 3UTGA 4H4PA 2CULA 4EMJA 1O94A 1N4UA 4EQXA 4JY2A 1E1KA 1MOKA 4U8OA 2E5VA 1H6VA 3ATQA 2YLTA 1PJ5A 4DSGA 1NENA 3JSKA 1XANA 1TRBA 2HQMA 4U8PA 1CL0A 4UP3A 2R9ZA 3UOZA 1BWCA 1CC2A 2WP5A 2UZZA 3DGZA 2IIDA 5HY5A 3GWFA 3GD4A 3ITJA 4Y4LA 4OPLA 2YAUA 1LJ1A 3IC9A 1D4CA 1M6IA 5HXIA 3H8IA 3P1WA 4CCRA 2X8CA 5KRQA 1ZK7A 1COYA 3F8DA 4CNKA 4GUVA 5FS8A 4CRTA 4A79A 5KVHA 2BK4A 1ZDLA 2Y6QA 1REOA 3D8XA 3DJDA 3DJEA 4I59A 4Y4NA 4A5LA 1QLBA 4AT0A 4B1BA 3IHMA 3LADA 1GTHA 1ZMCA 1GNDA 3NGCX 1XHCA 2TMDA 3AYJA 1GESA 2A87A 1B4VA 2XFQA 2NPXA 2BABA 3ALLA 3ALJA 5GSNA 3B3RA 4B69A 4H7UA 2C3DA 1YQ3A 4AT2A 1K0JA 4XWRA 4YT0A 2V60A 2FJEA 4YSXA 4LIIA 1D5TA 3ICTA 1ZMDA 3G5RA 1DJNA 3FPZA 4CNJA 2WS3A 2OAMA 4YKFA 3K7MX 3F8RA 2GR2A 2H89A 2CVJA 2JB1A 3NYCA 4A7AA 1CC4A 2AAQA 2YVJA 3G5SA 3UTFA 2V6OA 1TDKA 2AR8A 4H2RA 1LTXR 2YR4A 3P4QA 3RP7A 3COXA 3NK0X 5JCMA 4H4YA 4GRTA 3AE1A 3S5WA 2OLOA 1FECA 1D7LA 1CHUA 2C67A 1GT8A 1VG9A 2YLXA 4B66A 5BULA 1PBDA 1Q9IA 4HB9A 4B63A 1QO8A 2X3NA 3ZDNA 2AQJA 3I6DA 4YWOA 3EAOA 1D4EA 4C77A 1W4XA 4CBQA 5KXJA 2CDUA 5BVAA 3DGHA 2WQYA 1D4DA 3AE8A 1DOEA 3LXDA 1F3PA 3QVPA 2Z5XA 4BJYA 4H4SA 4Z43A 3EANA 4U8NA 4U8LA 4YSYA 4CY8A 5TR3A 1EBDA 2BK5A 4U2SA 2V3AA 2X50A 2Z5YA 4USQA 3AD9B 5C3JA 3II4A 2EQ8A 2XVFA 2R0GA 4YTMA 4X9MA 1GXFA 3CNSA 3KPFA 1GRTA 3NNEA 4EMIA 2WDRA 2GR0A 1FEAA 3KD9A 1JU2A 2V5ZA 4OPUA 5FMHA 3NHOX 4BK3A 4TM3A 2BK3A 3PO7A 4H4WA 2E1MA 1FCDA 4N9XA 3GDPA 4O5QA 2XLUA 2BYBA 1NHRA 1FL2A 4H4VA 3UKFA 1KNPA 2XVJA 4RSLA 1IUTA 1QJDA 1GRAA 2C7GA 4U8JA 2ARDA 3UP4A 5M0ZA 2XLPA 2YLWA 3DK9A 4NTDA 1PXAA 1TDOA 1BZLA 1E6EA 3LJPA 3UKHA 1PBCA 1YQ4A 2WDQA 4IVMB 1GEUA 2OA1A 2VVLG 4J2WA 2QCUA 1K0IA 3GYIA 3NYEA 1DNCA 2I0ZA 2Q7VA 2BS3A 5EB5A 2W0HA 3RNMA 2GV8A 2GAGB 1JRXA 2YWLA 2V3BA 4H2PA 4JY3A 2YG6A 3KU9A 4K8DA 1ZY8A 5J60A 1H7WA 2WPEA 2WEUA 2GAHB 2VQBA 3WE0A 2XVHA 3UKPA 4H4ZA 5JCNA 4IV9A 4J56A 5L46A 1AOGA 4JDRA 1ELIA 4J57A 3CN8A 5M10A 2TPRA 4P9SA 1B37A 4WCTA 2RGHA 4YTPA 4K2XA 4EQWA 2R0PA 1ZOYA 1CF3A 1V59A 2EQ7A 3AEDA 4CY6A 4A99A 2EQ9A 1JRYA 3AEAA 4APNA 3OC4A 2YVFA 3AE6A 3IWAA 1OJ9A 1PHHA 4GCMA 1GALA 4GF7A 4EIPA 2YLSA 2XLTA 5U25A 2JBVA 1E1LA 4NZHA 2IVEA 2JKCA 3DJGX 2Q0KA 2C64A 1S2YA 3NIXA 2Y6RA 3EF6A 1E39A 1GSNA 3FIMB 2R0CA 3FMWA 2BCPA 2X8HA 2EQ6A 3AE5A 2BC1A 2YM1A 4U2TA 1ZOVA 4FK1C 1NG3A 1GERA 4NEVA 2GMJA 3UKLA 1H83A 2A8XA 3V76A 5JCKA 2FJAA 1NG4A 2VZ2A 3NKSA 1FOHA 3LZWA 4D03A 1GTEA 2QA1A 5KWFA 3NN6X 1E7PA 3RP8A 3ATRA 3FBSA 2C73A 5EOWA 1N4VA 3UKQA 3NK2X 2CFYA 1N1PA 1MXTA 4U8KA 1GRFA 2NVKX 3AB1A 4YSHA 3KLJA 1BF3A 4IA6A 3UOYA 2DKHA 3UTEA 1LVLA 3QSSA 2XVEA 3IHGA 3AE4A 3P4RA 3BI5A 3REDA 3SQPA 2WDVA 2XFOA 2YG3A 1PJ6A 4JN9A 3VQRA 4B67A 2YR5A 3K7TA 3CNDA 5KOWA 3AEBA 1P2EA 4B68A 1GRBA 4YKGA 1UKVG 3SM8A 2VRLA 4LA1A 2B76A 4FDCB 1X31B 3QSEA 1LQUA 3I3LA 1S2QA 1BKWA 3AEGA 1NEKA 3KKJA 4OPDA 3UTHA 2OALA 1L0VA 2YG7A 2C70A 2H88A 4TLXA 2YLRA 2ZZBA 3ICRA 4XXGA 3AE9A 5KOXA 3H8LA 3GSIA 2WETA 4OPGA 5BUKA 2BS4A 2WP6A 1CBOA 2R4JA 3GRTA 3O0HA 4A6NA 2BCGG 2WPCA 4Z25A 1GRGA 5C2TA 4IA5A 1EL9A 4OPTA 4J34A 4ZCDA 5GRTA 5HHFA 4U8MA 5BRTA 1CJ2A 2ZZ0A 4TLZA 5FS7A 4NEWA 1VG0A 3GWDA 1SEZA 3K7QX 2R4EA 4BJZA 4X4JA 4H50A 2GR3A 2XVIA 3LZXA 3AE3A 1F8RA 3KVEA 3GD3A 1K0LA 1KNRA 2C66A 2F5ZA 2WOWA 1OJAA 3ABVA 3KA7A 3NYFA 3PS9A 1VRQB 3QJ4A 1ZKQA 2JK6A 1OJDA 3UP5A 3AE7A 3DK8A 3DJJA 3RP6A 1CJ3A 4B65A 3BHFA 1IUVA 2YR6A 4CCQA 2JAEA 1HYUA 2PHHA 3NK1X 2YLZA 1LPFA 3RHAA 1S3BA 3S61A 1N4WA 4TM4A 2C3CA 3P4SA 4AP1A 1YY5A 2GQFA 4D04A 1KDGA 1IUUA 1H7XA 1Q1RA 3FG2P 3R9UA 1NHQA 4ECHA 1P2HA 4Z24A 2V61A 4C3YA 4YSZA 3CPJG 5IPYA 3M12A 5JCLA 5U63A 1GETA 3AEFA 4OCGA 2C65A 2XFNA 3CNTA 5HYMA 3PVCA 2BS2A 4K22A 3AWIA 4YXDA 1TDEA 3DA1A 1E1NA 2XFUA 2RABA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KAEA 1GSSA 1SL2B 2YJHA 1NAAA 1A24A 3IDVA 4QL7A 4A9WA 4IVOB 2K8SA 2XLSA 5H5RA 2WB9A 2GLRA 3I69A 2KHPA 1CC6A 2A89A 4Z2RA 1M3IA 2GR1A 4GAPA 4ZIJA 2OBKA 3PINA 1T4ZA 2WJUA 2C72A 3VRDB 2VQ7A 5A5KA 1ST9A 3FRCA 3M0FA 1PRXA 1TDFA 5CP1A 2LTKA 2R5GA 1AQXA 3CGDA 4OPCA 2JZSA 3I9V2 4IJ3A 1S3EA 3PH9A 1VDCA 2ZZCA 5CKUA 4PNFA 2B7RA 5ECIB 2H0IA 4KDYA 3SZ0A 3UOVA 4G9KA 2YN1A 5ECRB 1QFNA 2C76A 1J9BA 2E4GA 4OCFA 2WCIA 2YJ7A 5CRGA 2GVCA 3AYLA 1BX9A 3BNMA 1LBKA 2H1GA 2HRAA 1IJHA 2FJDA 5A4VA 1EOGA 1GNWA 1H84A 4II3A 3UOXA 1JOAA 2YNXA 1O5WA 3V3OA 2VVLA 3L78A 4V2NA 2X49A 1E1MA 2XYOA 4C5OA 1OKTA 5AGYA 2R46A 4Z2TA 1M3JA 1D7YA 3UKAA 2J9HA 2JB2A 1YKJA 4LLRA 4ID0A 2Q0LA 2YOIA 3LYKA 3T37A 3L4NA 4X9NA 1M0UA 5D9TA 4ZCCA 4NNJA 3HZLA 4EC0A 4ECJA 4NV5A 4NAXA 4ML6A 5AIXA 4HJMA 1IUSA 3DK4A 3CMIA 4K8MA 1V58A 3UMAA 4EM3A 2GSQA 4GDEA 4USRA 5ID2A 1NDAA 3EE2A 1PL2A 1NHSA 2VL2C 5CO3A 3FZ4A 4KPRA 5KMPA 5B6MA 2AV4A 4EM4A 5H5SA 5JCGA 1SKWB 4AJ8A 3GMCA 3FZ9A 4BVYB 5IQ4A 3GYJA 16GSA 1O95A 2DJ3A 3GKKA 3GRXA 1CJCA 1Z6LA 5DAKB 3L8KA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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