4Z2TA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase w225y from pseudomonas azelaica
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
581
structure length
559
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYYMFVAALRMIRPWNKWICVWGEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 190
structure length 559
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2tA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2tA01
3UOXA 2Q7VA 4ZCCA 3QFBA 1PBBA 3H8LA 4K22A 2EQ9A 3BHFA 4GUVA 4H4ZA 1B8SA 1GESA 3QVPA 2IVEA 2GAHB 3GD3A 3P4PA 4Y4NA 4USRA 1FEAA 4OPUA 3AYIA 3UTEA 2V6OA 1N4UA 2XDOA 3ATQA 3C4NA 3V3NA 3NH3X 2R9ZA 4CNJA 4YSXA 2QCUA 1L9EA 2XFUA 3AECA 1CHUA 4JDRA 2JB1A 2XLSA 5M10A 2VVLA 4J33A 2YM2A 4A9WA 3NN6X 1OJCA 3SFEA 1JRXA 1CF3A 3BI4A 3AE5A 4IVMB 2WU2A 2CVJA 3KU9A 1GALA 1Y0PA 1GTEA 3RP8A 3G5QA 4Z2TA 3II4A 1CC4A 3UCLA 2C66A 4I58A 4JNQA 4TM3A 4Z2RA 2B76A 2WPCA 3IC9A 1OJTA 2RABA 2BK3A 3I6DA 1ZX9A 3ALJA 2B9WA 1ZOYA 1LQUA 2BYBA 2CFYA 3CPHG 3BI2A 3QFAA 1D4EA 1Q1RA 1L0VA 3GDNA 1GREA 3RNMA 3UKHA 2RGOA 1PS9A 3C96A 3VR9A 3KVEA 4CRTA 1IJHA 1BGJA 4APNA 4EM3A 1PXBA 4H50A 2BC0A 2AQJA 4J2WA 1NG3A 4YSYA 3AEEA 3GWDA 4H4XA 4H4UA 3DGHA 3DK9A 5KWFA 4H4PA 1YY5A 2C7GA 3IWAA 1N1PA 3CNJA 3DK8A 2CULA 4IVOB 2JKCA 1D7YA 2FJBA 1LV0A 2AAQA 2YLRA 3Q9TA 4JQ9A 3IHGA 3FMWA 4OPLA 4EQRA 1P2HA 3AE7A 1KSUA 1CC2A 2XCGA 3LOVA 3UP4A 4CBQA 5GSNA 2VQ7A 4B66A 2YG3A 4EMJA 1FCDA 1CJCA 1NDAA 1EL7A 1CJ3A 1ZMDA 2WOWA 2YVJA 3IHMA 5FS7A 4GDEA 3AE3A 4IV9A 1JEHA 2YM1A 1DOCA 1VDCA 2Q0LA 4YWOA 3EF6A 5L46A 5M0ZA 4BK3A 3CIRA 4WCTA 5KXJA 5IQ4A 1GRBA 3ISHA 5HHFA 4ICYA 3QJ4A 1GV4A 3AWIA 1E1MA 1LJ1A 5KOWA 2C3DA 1EL8A 3GRSA 3EPTA 5KVIA 4H4QA 3RP7A 4O5QA 1PDHA 5FS6A 3CNPA 3SGLA 1V59A 2WP6A 3UKLA 1H7WA 1JRZA 3GD4A 3SM8A 2BS3A 4B69A 4TLZA 1IUVA 4D03A 4NZHA 3OC4A 2R0GA 4LIIA 4EQXA 2CDUA 1S2YA 2XYOA 4K7ZA 4X4JA 1NG4A 5JCNA 2JB3A 1XHCA 1ZKQA 4C3YA 2WOIA 3NLCA 3M12A 2E4GA 1H86A 3GYJA 4U8JA 2WPEA 4NTEA 4BJYA 2BXSA 5EB4A 2XLPA 4CCQA 1Y56B 4BURA 1COYA 4RSLA 1DJQA 2WESA 5FMHA 3UOYA 3UP5A 3AE2A 2FJAA 3B6DA 4DSGA 3UKPA 4Z25A 4KPRA 1QLBA 1VG0A 4Z43A 3GDPA 2F5ZA 3NT6A 1KNRA 3K7QX 4U2SA 2A8XA 3GMBA 2GMJA 3NK1X 3UTHA 2TMDA 5CQFA 2A87A 4YTPA 3HZLA 4JY3A 5FS9A 3BNUA 4B1BA 4ECHA 1DXLA 2GF3A 4XXGA 3LJPA 2C64A 3F8RA 2QAEA 1QJDA 1AOGA 2V5ZA 3AB1A 3OZ2A 1E39A 3K30A 3UOZA 3NN0X 4H4RA 4EQWA 2EQ7A 2J3NA 1BKWA 1HYUA 3D1CA 3DJJA 3FBSA 1OJAA 2APGA 3NYFA 4YSZA 1ZMCA 2C75A 4U2LA 3QVRA 2R46A 1NHPA 4FK1A 4P9SA 1E1KA 2OLOA 2YG7A 3LZXA 3AE6A 4H2NA 3ITJA 1ELIA 2GQWA 3NNEA 2IVDA 2GQFA 4TM1A 3ADAB 4NTCA 4A6NA 1PJ5A 1B4VA 4I59A 4KX6A 4C77A 4TM0A 1ZY8A 2V60A 2OALA 1GRTA 4U8NA 3REDA 4C74A 2XLTA 2VVLG 2WDQA 5JCMA 3KPFA 2Y6RA 2VRLA 2B9YA 4Y4MA 1ZK7A 3ZYXA 5JCIA 1JRYA 4K8DA 3VRAA 3PO7A 3CGEA 1PBFA 4DGKA 4FDCB 5J7XA 2DKHA 1F6MA 2B7SA 1LVLA 2BA9A 3M0OA 1IUWA 4AOSA 1KNPA 3EAOA 2GR0A 2WP5A 2ZZBA 3NHOX 4DNAA 5C3JA 1JNRA 1PN0A 3CNDA 4YKFA 3VR8A 2FJEA 3H4KA 2A89A 2XFQA 4EMWA 1BWCA 1YKJA 1TDNA 4OPCA 4TM4A 1BGNA 1CC6A 1NENA 2GB0A 2BXRA 3CNTA 2GMHA 1GERA 5TR3A 1K0LA 1ZOVA 4K5SA 3O0HA 2ZZ0A 1DODA 4X9MA 3UKFA 4UDQA 3ZDNA 4LU6A 1NHQA 3AXBA 3GSIA 3NK2X 2H88A 1DOBA 1SEZA 3G5SA 3V3OA 2B7RA 4YTMA 3BNMA 4CNKA 1E7PA 1ZP0A 3NKSA 4ADWA 3AYLA 4JNAA 2C67A 3ABVA 4YKGA 2EQ8A 1ONFA 1F8SA 1Z6LA 4IA6A 4C3XA 1TDFA 2XVFA 4M52A 4EQSA 2JAEA 3NTDA 4U8LA 5EOWA 2AR8A 1RSGA 2BCGG 2V3AA 4B65A 1CL0A 3DK4A 1H81A 2YG4A 1MOKA 3NTAA 2H89A 1GRGA 1UKVG 3CTYA 3IF9A 4JY2A 4AP1A 2IIDA 5BRTA 4U8IA 4FK1C 4BK2A 2X50A 1YQZA 1LTXR 2C65A 2ARDA 3CPJG 2YAUA 1OJDA 4NEWA 2OA1A 5J60A 3DJDA 3AE9A 1K0IA 4RG4A 3GRTA 1PBCA 4Y4LA 1FEBA 1OJ9A 2XVIA 1XANA 3B3RA 2XFPA 2WPFA 1F3PA 4ZCDA 2BABA 4XWRA 1NEKA 2R4EA 3C4AA 3SFDA 2YWLA 1KF6A 4H7UA 1NHRA 1YQ3A 2X3NA 4OPTA 1F8WA 2BC1A 3DH9A 3RP6A 1BZLA 2EQ6A 3CGCA 4AT0A 4OPIA 2ZBWA 4H4SA 2X99A 2X8GA 3AE1A 1LQTA 4U8KA 4YSHA 3P1WA 2XVEA 4X9NA 3QSMA 3UKAA 3AD8B 2XLUA 1DJNA 1E1LA 2O9ZA 3ICSA 4GF7A 5KVHA 4A5LA 3LB8A 1ZDLA 1GPEA 3NYEA 4YTNA 4UDPA 2GR2A 3AEAA 2Z5YA 1JNZA 2C76A 3K7TA 3AYJA 4ZN0A 2YQUA 4NTDA 1VG9A 3PS9A 5CKUA 1H6VA 2JBVA 1S3BA 2FBWA 4EIQA 3CGBA 4HA6A 1CJ4A 1PXCA 3T37A 1EBDA 2WOVA 1IUUA 4K5RA 4GRTA 4O5UA 1GT8A 2BS4A 3H8IA 1L9CA 1BF3A 1TRBA 2WDVA 3GYIA 2BACA 1D7LA 1M64A 2Q6UA 1YQ4A 3DGZA 2YR6A 3BI5A 1GEUA 2TPRA 5GRTA 4A6NB 2C73A 2PHHA 4H4TA 5U63A 5LV9A 3AEFA 2I0ZA 3G5RA 4H2QA 2JK6A 3I3LA 1EL5A 1DOEA 4B63A 5HXIA 3CN8A 3ATRA 2OAMA 2YLSA 2WS3A 1W4XA 1XDIA 1GSNA 1TDOA 3VRBA 4EIPA 1S3EA 2NPXA 2R0CA 3KA7A 4A99A 1O95A 2GR3A 2X8HA 3AEBA 2YG5A 4UDRA 3VQRA 3FPZA 2WHDA 1E6EA 5U25A 3COXA 4J34A 2ACZA 1GTHA 3M13A 2V61A 3NYCA 1D4DA 1B5QA 2XLRA 2WP9A 2C72A 1GRFA 1PXAA 1GRAA 4REKA 2WQYA 2RGHA 4MJWA 1KFYA 3UKQA 4FX9A 3QSEA 5BUKA 4AT2A 3DJEA 4Z24A 1JOAA 2WBAA 3JSKA 4B64A 3P4SA 3LZWA 5ER0A 3QSSA 1P2EA 3V76A 4GDPA 3ICRA 4PABA 3L1RA 5U1OA 4B68A 1FECA 2Y6QA 3ICTA 2VOUA 4Z44A 2YVGA 2HQMA 3GWFA 3NRNA 4XWZA 3AEDA 4EM4A 1PHHA 4WX1A 1RYIA 2BCPA 4U2TA 2BK4A 2WEUA 3AEGA 3BHKA 3KLJA 1F8RA 4C5OA 1MXTA 5HYMA 3UOVA 1L9DA 4EMIA 1RP0A 3CGDA 1TDEA 4H4YA 2YR4A 4USQA 2YLTA 2QA2A 2PYXA 4AP3A 3S5WA 3ALLA 1PBDA 1D4CA 1GNDA 2BS2A 2XVHA 2C70A 4J31A 4JN9A 5JCLA 5HY5A 3L8KA 2YVFA 4H4VA 4PAAA 2WDRA 5EB5A 3P9UA 3AD9B 2QA1A 3CPIG 1O94A 2XFOA 2VQBA 1B37A 1X31B 1H83A 1NAAA 1NPXA 5C2TA 1Q1WA 1PJ7A 1QO8A 2YLWA 3F8DA 2BK5A 5IPYA 1TDKA 1K4QA 4J36A 4OPDA 1DNCA 2GVCA 1Q9IA 1VRQB 3DMEA 5DBJA 2VVMA 2GRTA 2GH5A 3P4QA 5JCKA 2W0HA 2GR1A 4GR1A 4H2RA 1GRHA 1CBOA 1JU2A 4RG3A 4UP3A 1GETA 4H4WA 3CNSA 1N4VA 4TLXA 5FS8A 4A7AA 4OVIA 3NG7X 3FIMB 3UTFA 3F8PA 3UKKA 1H7XA 1GOSA 2NVKX 3D8XA 2YG6A 1FL2A 4IA5A 3Q6JA 3VRDB 1H82A 4NEVA 4U8OA 2OLNA 1NHSA 3SQPA 2R4JA 2R45A 1VQWA 4U8PA 2FJDA 3NK0X 5EBKA 1IUSA 1D5TA 2R0PA 2VZ2A 2RGJA 1O5WA 3PVCA 2XVJA 5BULA 1E1NA 1IUXA 1PBEA 4BK1A 2ZZCA 1PJ6A 3KD9A 1MO9A 4OCGA 2E1MA 2Q0KA 2B9XA 1KSSA 1K0JA 4CY8A 4BV6A 4CY6A 5BVAA 3S61A 5KRQA 2C3CA 4YXDA 1H84A 4AOXA 2GEWA 1N4WA 4J57A 2GV8A 4K2XA 4OPGA 2YLZA 1LPFA 2Z5XA 2WU5A 3AD7B 3URHA 4HB9A 1M6IA 4GCMA 3EANA 1KDGA 3NGCX 4B67A 2JB2A 2WETA 3AE4A 2YR5A 2E5VA 1TYPA 5KOXA 1CJ2A 4BJZA 3R9UA 4E0VA 3GMCA 2UZZA 4Z26A 5IQ1A 4DSHA 4A65A 4U8MA 2X8CA 2DKIA 4A79A 4Z2UA 1TYTA 2VRMA 1XPQA 3P4RA 3LADA 1REOA 1FOHA 2GAGB 3DA1A 3LXDA 4H2PA 3RHAA 3DJGX 4CCRA 4YT0A 2V3BA 3K7MX 1S2QA 1Y56A 3E1TA 3AE8A 4N9XA 1IUTA 2YLXA 4J56A 4D04A 3KKJA 1EL9A 3FG2P 3NIXA 1GXFA 2XFNA 3ALMA 4LA1A 3WE0A 3UTGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1T8EB 3BHFA 4GUVA 1NHYA 2A2RA 4H4ZA 1AQWA 2KUCA 4NNJA 1S3AA 1F2EA 1T00A 4OPUA 1N4UA 3ATQA 3IE3A 2R9ZA 1BX9A 1FB6A 2L57A 1YEXA 1B9XC 4JDRA 3BBYA 2VVLA 1OE7A 4A9WA 2M46A 1ZYPA 1WWJA 1JRXA 4YQUA 4HI7A 1GALA 1Y0PA 3P90A 4WF5A 4XS4A 4ZL9A 3IRAA 3ME8A 4IJ3A 4WBJA 3UCLA 1A2LA 4TM3A 4POBA 4N30A 1SYXA 2RABA 4EVMA 2BK3A 3I6DA 4PUFC 2B9WA 3O3TA 1LQUA 4N10A 3CPHG 3BI2A 1D4EA 3GKKA 1GREA 3RNMA 1PS9A 2P31A 4IP6A 1TK8B 3VR9A 3KVEA 2WS2A 4CRTA 1IJHA 5IMCA 1B8XA 1PXBA 4J2WA 1OC9B 3HDCA 3GWDA 4H4XA 3DK9A 1SL1B 5KWFA 2QC7A 2WULA 3GRXA 3H93A 3DK8A 4IVOB 2JKCA 2AAQA 4EQRA 3AY8A 3HVSA 3A5WA 3BD2A 1FCDA 1EL7A 5ABRA 2WOWA 3ZLPA 2YVJA 3ZIVA 3AE3A 3H79A 2Q0LA 4YWOA 3EF6A 5L46A 1UVZA 4BK3A 3CIRA 4HOJA 5KXJA 1GRBA 5HHFA 2F51A 1E1MA 3HJMA 4K6XA 1IYIA 2MMNA 4HU7A 2LUSA 2R4VA 3HYWA 5D96A 2WP6A 3UKLA 1QMVA 3TJBA 3HA9A 1JRZA 1X5EA 1ERTA 4B69A 5KMSA 2YWNA 3FZ5A 3L0HA 4F0BA 4LIIA 4EQXA 5CNWA 2VD1A 4MCUA 1S2YA 1NG4A 5D93A 1TU7A 1XHCA 2PVOC 4OD7A 4OFTA 3NLCA 4C3YA 1U88A 2KP2A 3DVXA 1A8LA 1PQNA 2E4GA 1K0BA 4BJYA 1V98A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1T8E B;  3BHF A;  4GUV A;  1NHY A;  2A2R A;  4H4Z A;  1AQW A;  2KUC A;  4NNJ A;  1S3A A;  1F2E A;  1T00 A;  4OPU A;  1N4U A;  3ATQ A;  3IE3 A;  2R9Z A;  1BX9 A;  1FB6 A;  2L57 A;  1YEX A;  1B9X C;  4JDR A;  3BBY A;  2VVL A;  1OE7 A;  4A9W A;  2M46 A;  1ZYP A;  1WWJ A;  1JRX A;  4YQU A;  4HI7 A;  1GAL A;  1Y0P A;  3P90 A;  4WF5 A;  4XS4 A;  4ZL9 A;  3IRA A;  3ME8 A;  4IJ3 A;  4WBJ A;  3UCL A;  1A2L A;  4TM3 A;  4POB A;  4N30 A;  1SYX A;  2RAB A;  4EVM A;  2BK3 A;  3I6D A;  4PUF C;  2B9W A;  3O3T A;  1LQU A;  4N10 A;  3CPH G;  3BI2 A;  1D4E A;  3GKK A;  1GRE A;  3RNM A;  1PS9 A;  2P31 A;  4IP6 A;  1TK8 B;  3VR9 A;  3KVE A;  2WS2 A;  4CRT A;  1IJH A;  5IMC A;  1B8X A;  1PXB A;  4J2W A;  1OC9 B;  3HDC A;  3GWD A;  4H4X A;  3DK9 A;  1SL1 B;  5KWF A;  2QC7 A;  2WUL A;  3GRX A;  3H93 A;  3DK8 A;  4IVO B;  2JKC A;  2AAQ A;  4EQR A;  3AY8 A;  3HVS A;  3A5W A;  3BD2 A;  1FCD A;  1EL7 A;  5ABR A;  2WOW A;  3ZLP A;  2YVJ A;  3ZIV A;  3AE3 A;  3H79 A;  2Q0L A;  4YWO A;  3EF6 A;  5L46 A;  1UVZ A;  4BK3 A; 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