4Z2TA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase w225y from pseudomonas azelaica
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
581
structure length
559
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYYMFVAALRMIRPWNKWICVWGEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
total genus 190
structure length 559
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2tA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2tA01
1H82A 3PO7A 1PBBA 4KX6A 1RP0A 1IUTA 4X9MA 5CKUA 1PXCA 1H84A 2FBWA 2GEWA 2WPEA 3KPFA 4NEVA 4H2PA 1LV0A 2GVCA 2OALA 2XLPA 3DK4A 4OPGA 3CPJG 3VRAA 2YLRA 4USQA 1O95A 3UOZA 4J31A 2FJDA 1M6IA 3VRBA 4HB9A 4AT2A 2IVDA 1ZKQA 4FX9A 2Y6QA 1TDFA 3SGLA 1P2HA 4DNAA 3II4A 4C77A 3UTGA 1ZOYA 2WOVA 4B67A 4DGKA 5JCIA 1S3EA 2NPXA 3P4RA 5J7XA 2OLNA 4C3XA 1JU2A 1S3BA 2GRTA 4Z2TA 2JKCA 2V3BA 1TDOA 4H4PA 2TMDA 1HYUA 2E4GA 2XYOA 1QJDA 4YTPA 2ZZCA 2EQ6A 1GRTA 2GR1A 4O5QA 3V76A 1YKJA 3D1CA 3P1WA 3ALMA 3AE4A 4E0VA 1VDCA 1H86A 2B9XA 2C72A 1K0LA 2UZZA 3K30A 2JB1A 2O9ZA 5FS7A 4CCQA 3DJJA 1IUUA 2C70A 2PYXA 1AOGA 2WS3A 2A89A 1EBDA 2C67A 1IUVA 5M0ZA 1N1PA 3CNDA 3GRSA 3ICTA 4H4UA 1BWCA 2FJAA 5EB5A 3KA7A 3SFDA 2B7SA 3CPIG 3V3NA 3IHGA 4A7AA 2GMJA 4EMIA 3F8RA 2BXSA 4B69A 4B68A 1NHRA 1GEUA 1TYPA 2GH5A 3QVRA 3AECA 5KVIA 5BVAA 4H2RA 1K0JA 3QJ4A 2YR6A 1VQWA 3AE6A 2BS2A 1F3PA 2CVJA 2Z5XA 1CC4A 2EQ9A 3DK8A 5U25A 2FJEA 3AEEA 1L9CA 4NTEA 1GRAA 2WDQA 4OPUA 4XWRA 5JCLA 3UKPA 2YG6A 4CNKA 2A87A 4UP3A 4JDRA 1H6VA 2APGA 1GSNA 3COXA 2YG7A 4C74A 2R45A 3CNTA 1KNRA 1LQUA 2JB2A 3NK2X 3ZDNA 4REKA 3FPZA 1W4XA 2H89A 1GRHA 3NKSA 1ZDLA 2C65A 4P9SA 2XFPA 2BS3A 2EQ8A 2X8HA 4H4ZA 2R0GA 2YLWA 4ICYA 3AE8A 2CFYA 4K5RA 2WQYA 5KOXA 4X9NA 4YSZA 1FEAA 2WHDA 1CJ3A 2WOIA 4D04A 5HXIA 1GREA 3AD9B 3O0HA 1TDNA 3AEBA 1CL0A 1PBCA 4FK1A 4B66A 1OJ9A 2AQJA 3REDA 3UKLA 4APNA 5BRTA 1LTXR 1XHCA 1ZY8A 2BS4A 3CNSA 1TYTA 3KU9A 3NYFA 4CRTA 2RGOA 1E39A 1VG9A 1IUXA 4J34A 4Z2UA 1YQ4A 4X4JA 1ZMCA 3AD7B 3LOVA 2XCGA 2YWLA 4CY8A 4JY2A 5JCMA 3DMEA 4Z25A 2YG4A 2XLSA 2Q7VA 5C2TA 1Q9IA 2YLSA 3UKFA 3M12A 3DGZA 3ITJA 2XFOA 1KF6A 1REOA 2WBAA 1Y56B 4EIPA 2F5ZA 2IVEA 3DA1A 4A9WA 1H83A 2W0HA 4I59A 4DSHA 4EM4A 5C3JA 4Z2RA 3IC9A 1E1KA 4NTDA 4B65A 5IPYA 1JEHA 3VR8A 4Y4LA 2XVFA 1VG0A 5KVHA 3RP8A 1N4VA 2NVKX 3DK9A 2ACZA 2OA1A 4J36A 2R4JA 5HY5A 1COYA 2C73A 2WEUA 1DXLA 3CGBA 2WESA 3OZ2A 2GV8A 2Q6UA 1KFYA 3UTHA 1GOSA 2R46A 3H4KA 3P4SA 1ONFA 3NIXA 1F6MA 4RSLA 5FS9A 3ABVA 4YXDA 3ICRA 5EOWA 3GYJA 1MO9A 1CJ2A 2VQBA 5EBKA 5JCKA 2X99A 4EQSA 3KKJA 5FMHA 3QFBA 3QSSA 5DBJA 1CHUA 1F8SA 4H4QA 2V61A 3NH3X 2R0CA 2FJBA 3G5SA 4CNJA 3DJGX 3V3OA 3GWFA 4USRA 3F8DA 3H8LA 3T37A 4K22A 1KDGA 1D4CA 1FECA 2HQMA 2Z5YA 4ADWA 2JK6A 1DOBA 4MJWA 3JSKA 3ISHA 2AR8A 1X31B 2XVEA 3F8PA 2XFQA 1IJHA 4U2LA 3FIMB 3NK0X 5L46A 1FEBA 2GMHA 4TLXA 2BYBA 1PS9A 4U8OA 4XXGA 3CNPA 2YVFA 3VQRA 3VRDB 5LV9A 1K0IA 2ZZBA 1CJCA 3UTEA 1MXTA 2I0ZA 1MOKA 4UDQA 1BKWA 1CC6A 3BI4A 2C76A 2YLXA 2WP6A 3GRTA 4U2SA 3RP7A 1YQ3A 2BCGG 4YTNA 2GR3A 4YKFA 3ADAB 2BC1A 4BK1A 2GB0A 2RABA 4H4VA 5ER0A 5FS6A 3CPHG 3GYIA 1Q1RA 3DJDA 4YWOA 1GT8A 2J3NA 1H81A 2DKIA 3NYCA 4BV6A 2WU2A 4C5OA 2YM2A 4IA5A 4FDCB 1E1MA 4Z24A 2OAMA 3ATQA 4LU6A 4N9XA 1B37A 3UKHA 1PN0A 2WPCA 1L9DA 4U2TA 1GERA 2JB3A 4JQ9A 1JRXA 1Y56A 1D4DA 3CIRA 3ZYXA 1EL9A 2YLZA 2R0PA 3GWDA 2ZBWA 3Q6JA 2VQ7A 2XVIA 3C4NA 2CULA 3C96A 1JRZA 1IUSA 2JBVA 1F8WA 3UKAA 4U8JA 1LPFA 1NENA 4GR1A 2E1MA 2XVHA 1PBEA 2Y6RA 3LXDA 4K7ZA 1PXBA 2BA9A 4A6NB 3GD3A 3LJPA 3NGCX 1PJ7A 1TDEA 3NN6X 4ZN0A 4GDPA 1KNPA 1XDIA 2V3AA 1BF3A 4AOXA 2QAEA 3M13A 1E7PA 4EQRA 3NK1X 2YR5A 2RGJA 4U8KA 1ELIA 2VOUA 3FMWA 2CDUA 4CCRA 3UOYA 4Y4NA 4U8MA 4U8NA 3EPTA 4A6NA 4DSGA 2GQWA 4IV9A 1PJ6A 2B76A 2QCUA 3NYEA 2BABA 5BUKA 3AYJA 1GRGA 2R9ZA 3IHMA 1YY5A 3WE0A 3KLJA 3ALJA 1FL2A 2VVLA 4TLZA 2C64A 1EL8A 3G5RA 4WX1A 1M64A 2VRLA 4TM1A 3CGCA 1FCDA 1JRYA 2GAHB 3S5WA 1OJCA 2YLTA 3K7QX 4GUVA 1GALA 3FBSA 1Y0PA 2BC0A 2ZZ0A 1GTEA 1B5QA 3GDPA 4U8LA 3DJEA 3AD8B 2V5ZA 1Z6LA 4Z26A 3I3LA 3UP5A 1F8RA 1E6EA 3B6DA 4J56A 4YT0A 4OPTA 2WETA 3UCLA 2BK4A 4YTMA 4Y4MA 4JNAA 4JN9A 3NTDA 4A5LA 4BJYA 3K7MX 2JAEA 3P4QA 2H88A 4EIQA 1JOAA 2BACA 2EQ7A 3L8KA 2X3NA 3P9UA 4RG3A 3RP6A 2XDOA 4AP1A 1GETA 2YVGA 3CGDA 2XFUA 5U63A 1DJQA 3CTYA 1FOHA 1DOCA 2XVJA 1O5WA 3B3RA 3NHOX 1NHSA 4H2NA 2YG3A 1N4UA 4K8DA 3QVPA 4IVMB 1GPEA 2IIDA 4GF7A 5EB4A 1OJAA 4GRTA 3ALLA 3AE2A 1ZP0A 2WP9A 1B4VA 4OPDA 4BURA 5JCNA 4KPRA 3VR9A 1NAAA 4A65A 4LA1A 1K4QA 3QFAA 1E1LA 3I6DA 4K5SA 4I58A 4H50A 1BZLA 4H7UA 4Z44A 4B64A 3D8XA 3AE1A 2X50A 3AE9A 3AB1A 3AXBA 3CGEA 1GNDA 4TM4A 3UKQA 3AE5A 1NHPA 4AT0A 1PHHA 2B9WA 3BI2A 4H4TA 1BGJA 3DGHA 3M0OA 3EAOA 1GTHA 1RYIA 3OC4A 1QLBA 5KOWA 2RGHA 3AEFA 3RNMA 3GSIA 3GMBA 4YSXA 4YSHA 1NPXA 4Z43A 4GCMA 1H7XA 3CN8A 1PJ5A 3SM8A 4WCTA 3NLCA 4BJZA 1KSUA 3BHFA 5IQ4A 1S2YA 4NZHA 5U1OA 1IUWA 3GD4A 4ECHA 3PVCA 3R9UA 2C3DA 2YR4A 4LIIA 3SQPA 4AOSA 1O94A 1H7WA 4H4WA 1SEZA 4CBQA 1S2QA 2GAGB 3KVEA 3NT6A 4JY3A 1TDKA 2C75A 5TR3A 1E1NA 1Q1WA 2XLRA 3E1TA 1L0VA 4B63A 3AE3A 1DODA 2VVMA 2E5VA 2WDVA 2B7RA 4EMWA 4J57A 2X8GA 3UKKA 4ZCDA 1TRBA 4H4YA 3UOVA 1OJTA 1JNZA 4NTCA 4YSYA 2YAUA 1D7YA 3IWAA 4PAAA 5FS8A 3QSEA 2BXRA 1LJ1A 1VRQB 2Q0LA 3AE7A 1OJDA 3AEDA 1UKVG 4EM3A 1CC2A 3DH9A 4NEWA 1PBFA 4J33A 3RHAA 2XLUA 5IQ1A 4BK2A 3L1RA 4K2XA 3HZLA 3IF9A 3NN0X 3BI5A 2YVJA 4OPIA 4RG4A 3AEGA 3NG7X 4ZCCA 5J60A 2ARDA 3AYIA 5GRTA 2OLOA 2WPFA 1NG4A 2BCPA 3SFEA 1EL5A 4UDPA 1PBDA 4TM3A 2QA1A 2C3CA 3LB8A 4B1BA 4AP3A 1CBOA 5HHFA 2V6OA 2XLTA 1GESA 4JNQA 1BGNA 4OCGA 3ICSA 4H4RA 3GDNA 3URHA 5GSNA 3UP4A 1V59A 4OPCA 1L9EA 1PXAA 2VRMA 2GQFA 3BNUA 4O5UA 3AYLA 4IVOB 4FK1C 1EL7A 3BHKA 3NTAA 4A79A 2A8XA 2VVLG 1PDHA 1ZX9A 2TPRA 1GRFA 1D5TA 3EF6A 1XPQA 3Q9TA 2GR0A 4OPLA 1LVLA 3G5QA 4OVIA 2X8CA 3FG2P 1QO8A 2WOWA 2C7GA 2B9YA 3GMCA 3PS9A 1CF3A 4XWZA 3H8IA 1D4EA 1NDAA 4PABA 4EQXA 1GRBA 2WDRA 4UDRA 2QA2A 2R4EA 4EMJA 3ATRA 4EQWA 1KSSA 2XFNA 5HYMA 3LADA 5KRQA 4TM0A 3KD9A 4IA6A 1N4WA 4J2WA 3UOXA 1P2EA 5CQFA 2PHHA 3AWIA 3QSMA 2WP5A 1RSGA 2DKHA 3CNJA 2BK5A 3K7TA 3UTFA 3NRNA 1ZOVA 4GDEA 1JNRA 1CJ4A 3NNEA 1XANA 2VZ2A 4H2QA 4H4SA 1D7LA 1NG3A 2GF3A 1GV4A 2GR2A 1DNCA 4M52A 4A99A 3P4PA 4C3YA 2YM1A 1NHQA 3AEAA 4BK3A 4D03A 3LZWA 5KXJA 5BULA 4CY6A 2YQUA 4U8IA 5KWFA 4U8PA 1YQZA 2WU5A 3S61A 1GXFA 4H4XA 4HA6A 3LZXA 1ZK7A 2Q0KA 1DJNA 1LQTA 2BK3A 1B8SA 3BNMA 1DOEA 1NEKA 3EANA 4YKGA 2V60A 2AAQA 1ZMDA 5M10A 3C4AA 2C66A 2YG5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NPBA 1RP0A 2GDRA 2CQ9A 5CKUA 1H84A 3R3EA 2WPEA 4F03A 3KPFA 4OD7A 4NEVA 2TRCP 1ACVA 2OALA 1M2AA 2C3TA 3VRAA 4KSMA 4USQA 2JSZA 1O95A 3VRBA 2H1BA 4HB9A 4AT2A 2IVDA 4AF2A 3SGLA 1P2HA 3VPQA 3LQ7A 5D96A 4DGKA 1EEJA 5JCIA 2V2GA 1S3EA 3P4RA 1AIUA 2JKCA 1FB6A 4H4PA 1A8YA 2DIYA 2XYOA 1QJDA 3UBLA 3KTLA 1A24A 2EQ6A 3V76A 4MH2A 1YKJA 3ALMA 1H86A 2C72A 2I3YA 1YEPA 3K30A 2O9ZA 4PNGA 3LYPA 3DJJA 3ZIJA 6GSSA 4OO4A 3KXOA 1ZYPA 1ABAA 5CRDA 1WMJA 1ERUA 3GRSA 1XOBA 1BWCA 3H93A 5EB5A 3SFDA 2B7SA 2HZEA 3CPIG 5H5QA 3O3TA 4EMIA 1GH2A 3QVRA 4H2RA 4AJ6A 4D73A 3I69A 2BMXA 2AV4A 3WGEA 5FWGA 3IK9A 1FAAA 2I81A 3DWVA 2B5EA 2Z5XA 3DK8A 1TK8B 1IYHA 3F4TA 1GRAA 3LWAA 4OFTA 2YG6A 2REMA 3FR6A 2A87A 5KNLA 1H6VA 1WPIA 3QD9A 4L5LA 3VWXA 3COXA 3CNTA 3HA9A 1KNRA 1N2AA 3FPZA 1O85A 1W4XA 2KHPA 1B4QA 4O5RA 5D8IA 2H0IA 2X8HA 2WB9A 2DBCA 4K5RA 3D0ZA 1GSUA 1CJ3A 2LJRA 2FD3A 1CL0A 4NNJA 3H79A 2AQJA 4APNA 1XHCA 5JWRB 4FH8A 2YN1A 1URMA 2XCGA 2H30A 4KW6A 1Q9IA 2KP1A 3M12A 2AB6A 2F5ZA 2DSAA 1H83A 5C3JA 4HJMA 2YCDA 2AAWA 2XHFA 4Z2RA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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