4Z2TA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase w225y from pseudomonas azelaica
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
581
structure length
559
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYYMFVAALRMIRPWNKWICVWGEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 190
structure length 559
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2tA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2tA01
5L46A 3O0HA 1KDGA 3GRTA 1L0VA 3FBSA 3KA7A 4H4TA 4JQ9A 3VRAA 2V61A 1B37A 1CBOA 1H86A 4U2TA 3UKFA 4XXGA 2YLXA 2NVKX 2R9ZA 1TDKA 5FS9A 4HB9A 2VQBA 1GALA 2VQ7A 3BI5A 4U2LA 1TDNA 4YSYA 1Z6LA 3AE9A 4X4JA 4DGKA 2TMDA 1LV0A 5HHFA 3C4NA 1NAAA 3ALJA 1ONFA 4IA6A 1X31B 4BK2A 2YM2A 2F5ZA 1IUUA 2XVHA 3NLCA 3DA1A 3D1CA 4OPDA 2VOUA 1N1PA 1ELIA 2B9XA 2CDUA 1PBDA 4Z26A 2YVGA 4E0VA 1VG0A 1YKJA 2WDVA 3NNEA 2XVEA 1KFYA 1CJ2A 5JCLA 1D5TA 3GYIA 2YR6A 3ISHA 3RNMA 1FEBA 2R0GA 4CY6A 2YWLA 3NN6X 4NTDA 2Q7VA 2Z5YA 1PJ7A 1P2EA 3UOVA 4ICYA 1D4CA 3F8PA 3M0OA 2OALA 1IUXA 2A89A 2GF3A 1JRXA 4A7AA 1PXCA 4ZCCA 2C70A 2XDOA 3F8DA 3BHFA 1K0LA 5KVHA 1KNRA 1L9EA 2ZZCA 3C96A 5BUKA 2WPEA 3Q6JA 2YG6A 1PBBA 3BNMA 1XPQA 4IVMB 1JRYA 3HZLA 4C3YA 1EL7A 1YQ4A 1TDEA 1Y56A 4EMIA 4JY2A 4J2WA 3ITJA 5FS7A 3LXDA 3VRDB 2QAEA 2FJDA 3CNPA 1OJ9A 4J31A 1GETA 2GQWA 4B67A 4YXDA 2C65A 4H50A 2NPXA 3KU9A 1LPFA 1B8SA 4REKA 3QFAA 1JNZA 3LZXA 2XLSA 4ZN0A 2GB0A 2GMJA 2DKHA 3NGCX 3RHAA 1D7LA 3QVRA 2OA1A 3ADAB 1YQ3A 2WETA 4H4QA 1LVLA 3DJJA 3AE3A 1DOCA 1BGJA 3AE5A 1CHUA 2VVLG 2ZBWA 4RG4A 4WCTA 4CNJA 2BK5A 3UKQA 1FOHA 2WPCA 2C72A 3ZYXA 4GF7A 3QVPA 3UOZA 4H4ZA 1GNDA 1ZOYA 2WDRA 3DGHA 4FK1A 1GPEA 4RSLA 4U8NA 2C66A 3S5WA 3QFBA 4YSXA 5EBKA 4EM4A 3II4A 2C75A 1N4UA 2GR0A 3AE7A 3FPZA 4OPLA 3VR8A 1N4WA 3AE1A 2YLRA 5JCMA 3DK9A 1KNPA 1Q1WA 4PABA 4GDPA 2IVEA 1W4XA 1GXFA 2IIDA 3IWAA 3AD7B 3DGZA 4B66A 3NRNA 2AQJA 1TYPA 4Z2UA 3ATQA 4CNKA 2BYBA 1F8WA 1VRQB 1XDIA 2A87A 2JKCA 3QSMA 3EANA 4U8LA 4LA1A 4K5SA 1K0IA 4I58A 5U25A 1KSUA 2YLWA 4C3XA 2ARDA 1JEHA 4K22A 4UP3A 4X9NA 3KKJA 1EL5A 3AD8B 3F8RA 2WU2A 2XCGA 2WOIA 4FDCB 1Y56B 2FBWA 1E1KA 4YTPA 5HXIA 5M10A 2B9WA 3DJGX 4B69A 3VQRA 4IV9A 5ER0A 1ZOVA 4OPIA 4BV6A 3WE0A 3IHGA 3IC9A 1H82A 3NK2X 2GR2A 3NIXA 3RP7A 4N9XA 4A65A 3LADA 4BJYA 3UP5A 1M6IA 1L9CA 4ECHA 1IJHA 3KD9A 1PBFA 1NPXA 4FK1C 4Y4NA 1PXBA 4B64A 3FIMB 2R0CA 3CNTA 5U63A 3UKHA 3AEGA 1H6VA 3G5SA 2BACA 5HY5A 2WDQA 1ZX9A 4OPTA 2W0HA 2GVCA 4JN9A 4BK1A 4NEWA 4UDPA 2VVLA 3DH9A 2APGA 2EQ7A 2VRMA 3AE2A 1V59A 1CJ3A 1TDOA 2A8XA 4H4VA 4YWOA 3DJEA 2OAMA 1ZY8A 3REDA 3NYEA 1N4VA 4EQSA 4AOXA 4NZHA 2WHDA 1DOEA 1TRBA 4YSZA 3M12A 3L1RA 4H4XA 3QSEA 2XLPA 3QJ4A 4ADWA 3KLJA 4B65A 2XVJA 3Q9TA 1CF3A 2PHHA 4CCRA 3BNUA 3K7MX 3NTDA 4K8DA 2V3BA 2YG3A 1NDAA 4GR1A 4CCQA 1P2HA 5KOWA 2YM1A 1CJ4A 1ZKQA 2J3NA 1NENA 3UTHA 1PS9A 2YLTA 3GWDA 1LJ1A 2QCUA 2X8HA 1F8SA 3AEEA 2B7SA 2JBVA 4TLXA 2PYXA 1JNRA 4RG3A 1B5QA 1NEKA 3CPHG 3PO7A 2ACZA 4DSHA 4C5OA 1VG9A 2GRTA 1ZDLA 2HQMA 3RP8A 1REOA 5TR3A 2C67A 2YG5A 1S3BA 4AT2A 3CNJA 1BGNA 3P4RA 2BK3A 3K30A 2JB2A 2AAQA 2XFOA 2WOVA 3P9UA 2WESA 1B4VA 2VRLA 1RP0A 1NHQA 3AE4A 1COYA 2WP5A 2Q0KA 1GRFA 1IUTA 4EQRA 4Y4MA 4UDQA 3DMEA 3EAOA 2C73A 2BS3A 3JSKA 1S2QA 4H4UA 5M0ZA 3UTFA 1NHPA 1CC4A 1YQZA 2RABA 4GDEA 4JDRA 1XANA 3D8XA 4TM4A 4USQA 4A6NA 1DNCA 1L9DA 4NEVA 4U8KA 1RYIA 4U8MA 3BI2A 1GRBA 3OC4A 1DOBA 3AYJA 3CPJG 3I6DA 2R45A 4YTMA 1DJNA 3UTEA 5KXJA 1NG4A 2CULA 4HA6A 1H84A 2C7GA 4EMJA 1F6MA 1NHRA 4Z24A 3GDNA 2Y6RA 4OPUA 1S2YA 2JAEA 2X50A 4USRA 3C4AA 4U8IA 4AP1A 4UDRA 3ICSA 3UKLA 2Z5XA 4PAAA 3AE6A 3SQPA 5FMHA 1IUSA 1H81A 3CGBA 3AECA 5IQ4A 1ZP0A 1FL2A 4H2QA 2VZ2A 3NH3X 5J7XA 4KPRA 3ICTA 2CVJA 2YR5A 3KVEA 1JU2A 1YY5A 2C3DA 4J36A 1D4EA 1Q9IA 2C76A 2WU5A 1GT8A 3CGEA 3FMWA 3GDPA 5EB5A 3RP6A 2EQ9A 1GERA 1GSNA 3GYJA 2XFUA 2XLUA 3DJDA 4H4RA 5FS6A 1FECA 5JCIA 2X99A 1PBCA 1FEAA 4JNAA 3ALLA 5C3JA 1GOSA 1E1MA 4YKFA 3CNDA 3P4QA 4YKGA 2FJBA 1O5WA 2AR8A 1E1NA 2BS2A 3NTAA 4U8JA 3VRBA 4GUVA 3CTYA 3UCLA 4Z2RA 5BRTA 3NT6A 1AOGA 2DKIA 1MXTA 2O9ZA 3UKPA 1OJTA 5EOWA 1F8RA 4H4SA 3T37A 4LIIA 2EQ8A 2IVDA 4CBQA 3UOYA 1IUVA 2RGOA 2BCPA 1UKVG 1ZMCA 3GD3A 4EIPA 1Y0PA 3NYCA 4A6NB 5U1OA 5C2TA 3K7TA 1M64A 2XYOA 1EL9A 4EM3A 1ZK7A 5DBJA 3GWFA 4NTCA 3AB1A 2VVMA 5HYMA 1HYUA 3AEAA 2ZZBA 5KVIA 1E6EA 3GMBA 3PVCA 1PHHA 2WBAA 4BJZA 4H7UA 2BC1A 4BK3A 4J57A 4Y4LA 5JCKA 2JB1A 1BKWA 4WX1A 1NG3A 1E1LA 3AYLA 2GR3A 2E1MA 2QA2A 3CN8A 4H4PA 3E1TA 2Q6UA 3G5RA 3UP4A 3IHMA 1E39A 1MO9A 2V5ZA 4O5UA 3AEBA 2WEUA 2EQ6A 3SGLA 2XFQA 2C3CA 3CIRA 4M52A 3ATRA 5J60A 4OPCA 2GAGB 2FJAA 1FCDA 1GRGA 3V3NA 3GD4A 2RGHA 2YAUA 3LB8A 4IVOB 1BWCA 4CY8A 1LQTA 2BC0A 2V3AA 2YVJA 3BHKA 3H4KA 1LQUA 4IA5A 1OJCA 5IQ1A 4DNAA 2XLTA 2XVIA 1CC2A 4DSGA 4H2NA 2XVFA 1CC6A 1QJDA 5EB4A 4H2RA 1XHCA 2C64A 1JOAA 4A99A 2B76A 4OPGA 3LZWA 2H88A 4JY3A 4Z44A 2BABA 2BCGG 4J34A 1NHSA 3AEDA 4A79A 1D4DA 1OJAA 3AD9B 2RGJA 3DK8A 2E4GA 4K5RA 1K0JA 2BK4A 2YQUA 3BI4A 4BURA 3AEFA 5FS8A 3I3LA 3ZDNA 4C77A 4YSHA 2GR1A 4A5LA 1QO8A 2WQYA 4APNA 2JK6A 1PN0A 5JCNA 3NKSA 2WP9A 3UOXA 2BXSA 4I59A 4X9MA 3GMCA 4P9SA 4TM3A 2GH5A 3DK4A 3URHA 1GREA 4YT0A 3NHOX 4MJWA 3UTGA 5CKUA 4KX6A 1H7XA 1ZMDA 1IUWA 1GESA 2OLNA 4D03A 1CJCA 2YG7A 4TLZA 3QSSA 4A9WA 3AWIA 4Z25A 1K4QA 1RSGA 4GRTA 4LU6A 3P4PA 3H8IA 1PBEA 3B3RA 1DXLA 1GEUA 4U8PA 2OLOA 1OJDA 4OCGA 2GV8A 2X8GA 2E5VA 2Q0LA 2X3NA 2QA1A 3NK0X 4Z43A 2V60A 3NYFA 1F3PA 4OVIA 2BS4A 3NN0X 4B63A 4AOSA 1E7PA 2YVFA 4EQWA 1O95A 4K2XA 1Q1RA 4EMWA 1S3EA 1BZLA 2WS3A 3KPFA 3B6DA 3S61A 5KOXA 1BF3A 3CGCA 3SFEA 2XFPA 4XWRA 1LTXR 3EF6A 1H83A 2UZZA 4GCMA 2R46A 4U8OA 5CQFA 3G5QA 1GV4A 3EPTA 2YG4A 3H8LA 1TYTA 4Z2TA 4CRTA 2R4EA 3FG2P 2YLZA 1GTEA 3V3OA 1EBDA 2GAHB 3OZ2A 2GQFA 4JNQA 4O5QA 1KSSA 4B1BA 2WPFA 3IF9A 1EL8A 4H2PA 2CFYA 5LV9A 2R4JA 3CPIG 1VQWA 4U2SA 1O94A 3VR9A 1TDFA 4AP3A 3ALMA 3PS9A 2ZZ0A 4TM0A 1PJ6A 3CGDA 1MOKA 2YR4A 2WP6A 3UKKA 2GMHA 1PDHA 1VDCA 4FX9A 1PJ5A 4J33A 1GRAA 4B68A 4NTEA 2TPRA 2H89A 4D04A 3AYIA 4H4YA 1GRTA 1SEZA 3LJPA 4AT0A 4TM1A 5KWFA 2GEWA 1CL0A 3P1WA 3P4SA 1JRZA 4XWZA 3NG7X 3COXA 4K7ZA 3ABVA 4ZCDA 4C74A 2JB3A 2YLSA 3SM8A 1DODA 4J56A 3GRSA 3LOVA 1GTHA 2BXRA 2Y6QA 3SFDA 1PXAA 3V76A 5KRQA 4H4WA 2WOWA 1H7WA 1KF6A 3L8KA 2XFNA 4EIQA 1DJQA 3M13A 3R9UA 5GRTA 3AE8A 2I0ZA 3K7QX 3UKAA 1GRHA 2B9YA 3CNSA 5GSNA 2XLRA 5BVAA 5IPYA 2BA9A 2R0PA 4EQXA 2B7RA 3ICRA 5BULA 1QLBA 3NK1X 4YTNA 2FJEA 3AXBA 1D7YA 2X8CA 2V6OA 3GSIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ILFA 5L46A 3O0HA 1KDGA 3NZNA 1L0VA 2HRKA 1JZRA 5G5FA 5G5EA 3RPPA 4Q5NA 1H86A 1GNWA 2F8FA 1GSQA 5GSSA 2YLXA 2NVKX 2GQLA 1GALA 2DMLA 4U2LA 4X4JA 1QK8A 2TMDA 3QAGA 1LV0A 3C4NA 3UBLA 1T1VA 2YM2A 5E4WA 5KN2A 2DSAA 3TJKA 2YJHA 3DKSA 5AN1A 1ELIA 2B9XA 2H6ZA 1PBDA 2I1UA 3KZQA 2XPEA 3BBYA 2DJJA 3SX6A 1BQ7A 2XVEA 4XS4B 1MTCA 2YR6A 2R0GA 4NHZA 4I2TA 2Z5YA 4GRFA 4EVMA 4ICYA 2OALA 3W8SA 2A89A 1JRXA 4A7AA 3O6TA 4PUAA 4KE3A 5HR0A 3FR3A 3QPMA 1KNRA 1PSQA 2WPEA 1PBBA 2VL2A 1TDEA 1K3LA 4J2WA 3LQ7A 3MAKA 3IDVA 2QAEA 2LRCA 4BL7B 1OJ9A 4J31A 2YWNA 1THXA 4KH7A 2I3YA 3A3TA 1B9YC 2NPXA 3KU9A 1I9DA 5DVBA 4REKA 3N9JA 5KNLA 1NM3A 1JNZA 5KMQA 1XPVA 3LGCA 4ZN0A 3QVRA 4J57E 5HQPA 3IHQA 2C4CA 1LVLA 3DJJA 4WCTA 2BK5A 2C72A 4GF7A 3QVPA 1XW9A 4FK1A 3DGHA 1GPEA 4KDUA 4V2MA 3QFBA 5CRWA 4YSXA 5JWRB 1K0OA 2NPBA 4EL1A 3II4A 3DK9A 1W4XA 3IV4A 1TYPA 1CQHA 3ATQA 2JZRA 4GTUA 3BOAA 1Z9HA 4U8LA 4I58A 4C3XA 3ISOA 2YLWA 1JEHA 1W4VA 2FWEA 3KKJA 2KHPA 1OYJA 3AD8B 3UARA 3F8RA 2FHEA 4O92A 2FBWA 2ES7A 2GTUA 3M3MA 6GSSA 2RUEA 3HD5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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