4Z2TA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase w225y from pseudomonas azelaica
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
581
structure length
559
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYYMFVAALRMIRPWNKWICVWGEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
total genus 190
structure length 559
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2tA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2tA01
1BZLA 2XLUA 5IQ4A 4K7ZA 3UOYA 1XPQA 2ZZCA 4YSZA 4J2WA 4U8JA 3UP4A 1PBCA 1GTHA 4PABA 2QCUA 4XXGA 3DK4A 3UKFA 4E0VA 1H82A 2V6OA 4U2SA 2R4EA 2YAUA 1ZDLA 4AP1A 3VRBA 1DODA 3F8PA 3EAOA 3AE8A 1GPEA 2BK4A 4H4YA 2VRMA 3SQPA 4J34A 1GXFA 4EQWA 1ZX9A 2WBAA 4D03A 3FIMB 4USRA 5M10A 1IUWA 1F8RA 3CGEA 1D5TA 1F6MA 2VOUA 4GDPA 2BK5A 3P4PA 4IA5A 1ONFA 2YVFA 3AD8B 2R0PA 4NTDA 1CJ2A 1PJ7A 5J7XA 4GDEA 3DJGX 1S3EA 3ZYXA 1JOAA 3NTAA 3GD4A 3IC9A 1L9EA 1O5WA 4H2QA 4YXDA 1IUUA 3UOXA 4OVIA 4C3XA 1CHUA 2JB2A 3P1WA 3AEBA 2WS3A 3VRAA 3LOVA 1O94A 1F8SA 2WU2A 3AEEA 3UKHA 1GRTA 4J56A 2WEUA 3NH3X 4U8MA 1YKJA 1JNRA 2C72A 1N4WA 2XVHA 3GMBA 3QVPA 3SM8A 4FDCB 1ZK7A 1K0IA 5EB5A 2BS3A 2YQUA 1ZOVA 5FMHA 3DK9A 3GSIA 5HYMA 4OPTA 5JCIA 4NEVA 1GTEA 2ARDA 2GQFA 2GF3A 4JN9A 3CPJG 3ICSA 3UP5A 4H4RA 3C96A 2V3BA 1IUXA 2YLZA 2YG5A 3UTGA 4A65A 1GEUA 5KXJA 3DK8A 5CKUA 4K5RA 4JQ9A 5BVAA 1GREA 2GR3A 1CF3A 3DA1A 3BI5A 4YKFA 4YKGA 4YTPA 4IVOB 1EL5A 4GCMA 1PBBA 3BNMA 2BABA 3P4SA 4IVMB 4JNAA 4CCRA 2WU5A 1Y0PA 3PVCA 4C74A 2GMJA 3NRNA 4UDQA 1TDKA 2FJAA 4A5LA 2R4JA 2XYOA 4EM3A 1NPXA 4XWRA 1LQUA 3QJ4A 4D04A 2OA1A 2Q0KA 4RG4A 4H4QA 4A99A 1EBDA 1H81A 1GRAA 4NTCA 2Q6UA 3HZLA 4LU6A 2ZZBA 4H4ZA 1GOSA 4FX9A 4B63A 4DNAA 3GMCA 2PHHA 3UTFA 2EQ9A 4H4UA 2CULA 1CBOA 1REOA 3K7MX 3AXBA 3AE3A 2XVIA 2YLSA 4OPDA 2OAMA 1S3BA 5KOWA 4CCQA 1X31B 1CJ3A 1PBEA 1NEKA 2WDQA 3NYCA 1D4CA 1QO8A 3AE9A 1K4QA 4H2RA 4H4WA 4IV9A 3UKAA 3RP6A 2GR1A 2ACZA 1AOGA 4REKA 4X4JA 1S2QA 4I59A 1OJCA 4YSXA 4YTMA 1GETA 1MO9A 1B37A 3COXA 2JKCA 5EBKA 4OCGA 3GWDA 1ZOYA 3BHFA 4Z26A 4CNJA 2GH5A 2WESA 1KSUA 3SGLA 3JSKA 1Q9IA 3CPHG 2DKIA 3VRDB 3PO7A 1QJDA 4Z24A 3DJEA 4EIPA 2XFUA 1IJHA 1Y56B 1JRZA 3ATRA 2EQ6A 1COYA 2PYXA 2WOWA 3ALJA 4CBQA 2BA9A 4BURA 3NYFA 3Q6JA 1CL0A 1Y56A 1ZMDA 1XANA 1L9CA 2B7RA 2H89A 2TMDA 4CY8A 4OPLA 3GDPA 3FG2P 4PAAA 2CVJA 5JCNA 2V60A 2VVLG 5JCKA 1D4DA 4EMIA 1FCDA 2B9YA 3L8KA 3EPTA 4U8IA 3ALLA 3I3LA 2JK6A 3CNTA 1RYIA 3CNPA 1Z6LA 2F5ZA 1V59A 2WQYA 2AAQA 5CQFA 1TRBA 2XCGA 4TM4A 5C2TA 3NK1X 3V76A 1MOKA 5U25A 1L9DA 2YLXA 1CJCA 2H88A 1PBFA 1DJNA 1HYUA 3M12A 4B68A 5KVHA 1NG3A 1BGNA 5U63A 1LVLA 2GRTA 4HA6A 4XWZA 1DOCA 2GMHA 3QSSA 2WHDA 1JU2A 2RABA 4YT0A 4OPCA 3AE5A 3LZXA 4BK2A 1GSNA 1VQWA 4GR1A 2UZZA 3ADAB 2X8GA 4X9MA 4U8KA 1ZY8A 2FJDA 2XFQA 4BJYA 1KDGA 4H4TA 1NHPA 2E4GA 2YG7A 4B64A 4K2XA 1DOEA 3NK0X 4A9WA 2VRLA 4RSLA 2C76A 3H4KA 3H8IA 2Z5XA 2VQ7A 4U8PA 1YQ4A 2XLSA 4Z44A 1BWCA 5GRTA 1LV0A 5BRTA 2WOIA 4J57A 5TR3A 4FK1A 1N4UA 4H2PA 4ZN0A 5BULA 1VDCA 2C7GA 4GRTA 3WE0A 2Z5YA 2NVKX 3BI2A 3O0HA 3UKKA 4AP3A 4WCTA 3DGHA 2WPEA 3VQRA 5FS8A 1NHSA 4A6NB 1DXLA 1JRXA 3EF6A 4B67A 2QA2A 4CNKA 2XVFA 3SFEA 4BV6A 2YG3A 3CNDA 4USQA 3QVRA 1XHCA 1H86A 2A8XA 2AQJA 2BCGG 4A6NA 2I0ZA 2W0HA 1OJAA 1TDNA 1GALA 3GYJA 5L46A 3GDNA 1YY5A 2YG4A 4UDRA 1Q1RA 4TLXA 2WPFA 1PXAA 2YM1A 2YVGA 4TM3A 3K7TA 4H4VA 3ATQA 4BK1A 2DKHA 3K30A 4TM1A 2X8CA 2R45A 1FECA 2R0CA 3AE2A 2WPCA 3AE1A 3AD7B 5GSNA 3AYJA 2E1MA 2Q7VA 3UKQA 2GR0A 4H4PA 1JRYA 2C67A 1F3PA 4EQXA 1FEAA 2OLNA 1RSGA 1FEBA 4U8OA 2GQWA 4Y4LA 1PBDA 2Y6RA 1IUVA 3KD9A 1TDOA 1D4EA 5KWFA 4Z43A 3FBSA 3GYIA 4EMJA 4B65A 1QLBA 2B7SA 2XFNA 2XVJA 5J60A 2B76A 2V5ZA 3DGZA 1NENA 2C64A 3ISHA 1N4VA 2JB1A 3IF9A 1PS9A 1RP0A 2XVEA 3LXDA 4Z2TA 3NLCA 3AB1A 2C65A 1O95A 4H4XA 3F8DA 4WX1A 1GESA 2EQ7A 3SFDA 2JB3A 2GVCA 1LTXR 2GAHB 2XDOA 3P4RA 2BC1A 3M0OA 3CGDA 1NHRA 3BI4A 5EB4A 3S61A 1BKWA 4B69A 2X8HA 1NDAA 4Z2RA 2IIDA 4LIIA 4H4SA 3B6DA 3D8XA 3UTHA 1B8SA 1MXTA 1GRFA 1TYPA 3CGCA 3C4NA 1E1NA 3P9UA 5FS9A 4YWOA 4YSYA 3V3NA 1TDFA 2GR2A 2TPRA 2BXSA 3RP7A 1GRGA 1ZP0A 1K0JA 4LA1A 4DSGA 3ALMA 4K22A 1E1KA 4DGKA 4YTNA 1EL8A 4AOSA 1VG9A 4U2TA 2C70A 4JDRA 4DSHA 4O5QA 2OLOA 3D1CA 3UOVA 2BCPA 1EL7A 3H8LA 3I6DA 2IVDA 3NNEA 1LJ1A 4AOXA 2FBWA 2V61A 2A89A 2C3DA 2JAEA 3AYLA 3NN6X 4JY2A 4JY3A 3UKPA 3NN0X 4B1BA 2AR8A 4H7UA 4ICYA 3NKSA 4GUVA 2FJBA 2GV8A 2A87A 2CFYA 3AEGA 3KU9A 4EMWA 5BUKA 3II4A 1DOBA 2QAEA 5IQ1A 4APNA 4P9SA 2E5VA 3CIRA 2YLTA 2NPXA 1S2YA 2WOVA 2GEWA 4TLZA 2BS2A 1BGJA 3B3RA 3RNMA 3QSEA 3PS9A 4U2LA 1TYTA 2VVMA 3IHMA 3LJPA 1GNDA 2FJEA 1H83A 1Q1WA 1F8WA 3F8RA 4C5OA 5JCLA 3CNSA 5KVIA 3AYIA 1SEZA 3UTEA 3AEFA 1P2HA 4Z25A 3GD3A 4M52A 4YSHA 5FS7A 4J36A 5DBJA 4UP3A 2HQMA 1E1LA 2WDRA 2ZBWA 2YR5A 4BK3A 1PN0A 1PXBA 2YLRA 4AT2A 1KNPA 4J33A 5KOXA 1JEHA 3UKLA 3OZ2A 5HXIA 3GWFA 1PJ5A 1IUSA 1DJQA 2BK3A 1PDHA 1D7LA 3ZDNA 2RGOA 3URHA 1KF6A 4JNQA 2WP9A 1E39A 2X3NA 1LPFA 1VRQB 2JBVA 2XLRA 1E1MA 3KVEA 3NT6A 2BXRA 1XDIA 3BNUA 1FOHA 5IPYA 1CC6A 2YR6A 4U8NA 1GT8A 4Y4MA 2R9ZA 3CN8A 3S5WA 1H7WA 2Q0LA 4EQSA 2X50A 1M6IA 2YM2A 3NGCX 3E1TA 2WP5A 4IA6A 1YQ3A 1TDEA 1W4XA 2B9WA 1H7XA 2CDUA 3G5QA 1OJDA 4H2NA 1NAAA 4EQRA 5JCMA 4C3YA 3R9UA 1ELIA 4OPUA 2BS4A 3Q9TA 3IWAA 2IVEA 3AWIA 3QSMA 4K5SA 5LV9A 2QA1A 3AECA 3NHOX 3FPZA 5HHFA 5U1OA 3DMEA 4HB9A 1P2EA 3CPIG 2BYBA 3FMWA 1VG0A 2OALA 1PJ6A 3T37A 2VZ2A 3UCLA 3DJDA 4ECHA 4Y4NA 3QFAA 1B5QA 2APGA 3VR9A 4H50A 4CY6A 2C75A 2EQ8A 3NIXA 1PHHA 1H6VA 4MJWA 5HY5A 4ZCCA 3AD9B 5EOWA 1KFYA 1GRBA 1M64A 4OPIA 3V3OA 4BJZA 2B9XA 1L0VA 1IUTA 3AEDA 3G5SA 3QFBA 3KA7A 1OJ9A 3K7QX 2V3AA 4A7AA 1E6EA 3LADA 2R0GA 1EL9A 1FL2A 2YWLA 1CJ4A 1PXCA 3EANA 3LZWA 4ADWA 4CRTA 1D7YA 3GRTA 3L1RA 3GRSA 3AE7A 3CGBA 4X9NA 5FS6A 2XLPA 2WETA 3ITJA 3AEAA 2XFOA 3NK2X 2VVLA 2J3NA 2YVJA 4K8DA 4ZCDA 3ICRA 1LQTA 2ZZ0A 4EIQA 1YQZA 2VQBA 3ABVA 5KRQA 3NYEA 5C3JA 2WP6A 3BHKA 2RGHA 4J31A 4GF7A 2YR4A 2WDVA 4O5UA 1CC4A 3IHGA 1KNRA 1OJTA 3NTDA 3UOZA 3KKJA 4U8LA 1BF3A 1GRHA 2R46A 2YLWA 3CNJA 1NG4A 2GB0A 2GAGB 4OPGA 1KSSA 2BC0A 3KLJA 4TM0A 1NHQA 3G5RA 3RP8A 1DNCA 4UDPA 2YG6A 3M13A 3CTYA 3DJJA 3C4AA 4Z2UA 4NEWA 1K0LA 3LB8A 1CC2A 3AE4A 5M0ZA 2C3CA 4A79A 1ZMCA 4NTEA 1GV4A 4AT0A 2BACA 1E7PA 1ZKQA 2O9ZA 1UKVG 2RGJA 1JNZA 3P4QA 4KX6A 1H84A 1B4VA 4C77A 2XFPA 4N9XA 4RG3A 4I58A 3VR8A 1N1PA 1GERA 4KPRA 3OC4A 4FK1C 2XLTA 2C66A 5ER0A 2Y6QA 4B66A 3AE6A 3NG7X 3REDA 3RHAA 2X99A 2C73A 3ICTA 3KPFA 4NZHA 4EM4A 3DH9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BZLA 3LQ7A 2IL3A 4K7ZA 2H6ZA 3Q6OA 1XPQA 3NZNA 3DK4A 2FY6A 3UKFA 3ZFBA 4AP1A 4I2TA 3HYXA 3VRBA 4PUFC 1GLQA 4TOPA 3SQPA 5IQYA 5JCUA 1EV9A 4DSSB 1ZX9A 4D03A 3FIMB 1Q4JA 3GSSA 1GSFA 4GDPA 3QAGA 3P4PA 2VCQA 2QKEA 3LYKA 2R0PA 3AD8B 4AJ8A 3C1SA 4GDEA 1O7UA 5G30A 1PKWA 4NPBA 1L9EA 4IGJA 4H2QA 4OVIA 4C3XA 3AEBA 2NPBA 1F8SA 1K0DA 4L0UA 4ISDA 3KGKA 4G0IA 2C72A 3QVPA 2H6YA 3TRPA 1FB6A 4FDCB 1K0IA 5EB5A 1GSDA 2BS3A 4V1Ap 2LS5A 1R7HA 2JZSA 4ZB6A 4XHMA 1TDIA 2YV7A 3UP5A 2DC5A 5DCGA 2V3BA 2P0GA 1YKAA 2QC7A 6GSVA 4K5RA 2OACA 4MPFA 5BVAA 3PGTA 2GR3A 1CF3A 2DJ0A 3P4SA 3MIXA 3SX6A 2WU5A 3KZQA 1TW9A 3NRNA 4ZILA 4A5LA 5H5SA 3BJ5A 2YCDA 3LXZA 4D73B 3QJ4A 4D04A 3CXGA 4H4QA 1GRAA 3HZLA 1KTEA 4LU6A 1DE2A 3TDGA 3ERFA 3GMCA 2PHHA 2HRKA 3TRQA 5GAPD 2HZEA 4H4UA 2LNSA 1REOA 2YWMA 4AGSA 2IPAA 3RPPA 2OAMA 4POLA 2H1GA 1CJ3A 2LSTA 2F51A 1K3LA 4H2RA 6GSUA 4BL7A 3VPQA 3UAPA 3GH9A 4TRXA 5JCGA 1X9WB 2LQOA 1AOGA 2E0QA 3AY8A 4I59A 2PN8A 1K3OA 1NM3A 1ZOYA 2WESA 3GMFA 1DBYA 3D5JA 2MMZA 2IMKA 3DJEA 3TCOA 2HSMA 1KNGA 2JACA 1T4ZA 2EQ6A 1FVKA 2PYXA 2WOWA 5JWOB 1EOHA 4CBQA 3EINA 2BA9A 3NYFA 1A8LA 4G6GA 2O87A 1Y56A 1PX6A 4ZBDA 4ZL8A 2G0FA 4DEJA 4CY8A 2K8VA 1MTCA 5IMZA 4AJ6A 5JCNA 2V60A 1FCDA 5DAKB 2JK6A 1RYIA 2HRAA 1Z6LA 2WQYA 1TRBA 3KTBA 1MEKA 1L9DA 2AAWA 1CJCA 5CRGA 3A2XA 4PURA 2VL3A 1G7EA 1BGNA 2DJ1A 2TIRA 3GX8A 1NG3A 2GRTA 4XWZA 1DOCA 4BVXB 4KDXA 4N0VA 1A2MA 4F82A 3LZXA 1VQWA 3ZLPA 1OKDA 2ON7A 2MBSA 2X8GA 3G7YA 1KDGA 2E4GA 2GVPA 3ERWA 3IAM2 3QR6A 4WETA 3GL5A 2WDUA 1DOEA 1LU4A 2VM1A 1UVZA 4HOJA 4HZ4A 2DMMA 3H8IA 1SKSB 1X5EA 5GSSA 2L6CA 5GRTA 2L6DA 4BIKA 1TRVA 2WOIA 2ES7A 1AAZA 2YP6A 2Z5YA 3BI2A 3UKKA 2VOCA 4MF6A 5FS8A 4G0KA 1DXLA 4B67A 4CNKA 3SYIA 4BV6A 2H8LA 4GSTA 4HUAA 3CMIA 2A8XA 2AQJA 4A6NA 4G6HA 2R6KA 2PWJA 3M1GA 3GYJA 1YY5A 3DMLA 4TLXA 3Q74A 4TM3A 2YVGA 3PPUA 3GTUB 3KMNA 2L4QA 3AE2A 2WPCA 4KGIA 14GSA 3AD7B 3AYJA 2E1MA 1QFNA 1FAAA 4ILFA 1BJXA 1FEAA 2OLNA 1FEBA 1USBA 2XPDA 1TDOA 3TJJA 4XRAA 4GRFA 2XFNA 2GT5A 3GSTA 5J9BA 3DGZA 1NENA 2KHPA 1N4VA 2JB1A 4GWRA 1RP0A 4Z2TA 1XVWA 5KN1A 3SFDA 1LTXR 1PL1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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