4Z2TA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase w225y from pseudomonas azelaica
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
581
structure length
559
Chain Sequence
b'AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYYMFVAALRMIRPWNKWICVWGEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule tags Oxidoreductase
total genus 190
structure length 559
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2tA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2tA01
4TM4A 4APNA 5KXJA 1Z6LA 1ELIA 2IIDA 2Q7VA 2XVJA 3FG2P 4B69A 3UTEA 2VQ7A 3G5SA 1HYUA 3ADAB 1KDGA 4NZHA 3UTFA 3P1WA 1L9DA 3EANA 1B37A 4K5SA 3NN0X 1GTEA 1S2QA 4H4RA 3CGEA 3UKKA 1KNRA 2X50A 5FS9A 2GV8A 4EM3A 3P9UA 2B9WA 3AD7B 2BS4A 4EQXA 2QCUA 4EMJA 2I0ZA 4NTEA 4B63A 1VG0A 5EB4A 4XWZA 1H84A 1D7LA 1H6VA 2C70A 3AWIA 4YSZA 4B1BA 4YTMA 1XPQA 1DOEA 4C77A 4B67A 5EOWA 3BI5A 4ZN0A 3JSKA 2JB3A 3UKPA 1EL9A 4UDQA 3GWDA 4CY8A 5KVHA 2WS3A 2CULA 2XLSA 2YR5A 3SM8A 2Z5YA 1VDCA 3BI4A 2IVEA 3H8IA 5LV9A 1NHSA 2BYBA 2XLUA 3K7MX 4H2PA 3LB8A 5BVAA 2BC1A 5BRTA 4OPGA 1IJHA 1JOAA 3C96A 4CY6A 3QFBA 2CDUA 4A79A 4U8JA 2UZZA 4E0VA 5IQ1A 2GAHB 4U2SA 4H4YA 1GTHA 1KF6A 1SEZA 2Y6RA 2B9XA 1ZOVA 4EQRA 1V59A 1DJQA 1GXFA 2WOWA 4C5OA 5JCMA 3CNSA 3ITJA 3P4RA 4K7ZA 3UTHA 1CC6A 2Y6QA 1CC4A 2GMJA 4U8LA 2C73A 2E1MA 1ZK7A 3L1RA 3NKSA 2E5VA 1S2YA 3AD9B 5GSNA 3NT6A 2VVLA 3CPHG 4JN9A 1E7PA 2C3DA 4Z2UA 1GESA 1K0LA 2PYXA 1FCDA 3FIMB 3L8KA 4K2XA 1GERA 2RABA 3EAOA 3LOVA 5GRTA 3ABVA 3UKFA 2H89A 1EL7A 2BC0A 3Q6JA 4ICYA 1LVLA 2GR3A 3AEDA 2WU2A 2R0PA 3CGCA 4FK1A 1IUXA 1H7WA 4GUVA 1M6IA 3DMEA 2TMDA 1LQUA 4XWRA 1VRQB 3DJJA 5IQ4A 2BK4A 4GDEA 1JEHA 1W4XA 1DOBA 1GSNA 4Z25A 4OPTA 4A99A 3UP4A 1KSSA 3KKJA 2WHDA 3S5WA 4AOXA 4YXDA 4H4TA 3S61A 2YLRA 1RP0A 3DGZA 2DKIA 2Z5XA 1TYTA 4LIIA 2QA1A 2WEUA 3R9UA 1KNPA 2XDOA 3C4AA 4HA6A 4IA6A 1N1PA 4ECHA 3G5RA 1B8SA 2A89A 4X4JA 2WBAA 3D1CA 1F8WA 2B7RA 3AE5A 3KVEA 1LPFA 4I58A 3LZWA 1NPXA 2YR6A 4GDPA 3UKQA 2BCPA 5J60A 3VRBA 1IUSA 2IVDA 4ZCDA 2C65A 3UP5A 3GYJA 3RP7A 3V76A 5TR3A 4B65A 4BK2A 5JCKA 3P4SA 1KSUA 2EQ6A 2XVIA 3NK0X 3V3OA 1P2EA 1ZY8A 2C3CA 1B4VA 2EQ8A 4H4XA 5FS6A 3DK8A 3BNUA 1O95A 4YTNA 4RG3A 5M10A 4A6NB 1CHUA 3PS9A 3CN8A 3DK9A 2OLOA 1GV4A 2C75A 2YLSA 1Q1WA 2X8CA 1L9CA 3NTAA 2YLZA 3PO7A 2GRTA 3UOYA 1EL8A 1F8SA 2GQWA 4M52A 2GMHA 2JBVA 4Z43A 2V60A 4H2QA 1Y56B 3RP6A 3VRAA 4EQSA 2FBWA 4A9WA 3NG7X 3AE7A 3ICSA 4H4UA 1D7YA 3FPZA 4X9MA 3AE4A 4U8PA 5KOWA 3UOZA 2WDVA 1LV0A 1VG9A 5CKUA 5FMHA 4H7UA 3CNJA 1FECA 2WQYA 4B66A 2FJAA 3ALMA 4C74A 3LADA 4CNKA 1E39A 2YG3A 1PJ6A 1GT8A 2RGJA 1LJ1A 2C66A 2WU5A 4RG4A 3VR9A 2BA9A 4ADWA 3SFEA 4J2WA 4USRA 3P4PA 3RHAA 3G5QA 2OLNA 1S3EA 3DJDA 3K7QX 4H4WA 3ZYXA 4DGKA 1YKJA 4EM4A 2WESA 4YT0A 4U8MA 1EBDA 3REDA 3CIRA 4Y4MA 1CJCA 3OZ2A 4J36A 5JCLA 4Y4LA 1CC2A 3BI2A 4CRTA 4CNJA 1NENA 3AB1A 3DH9A 5ER0A 3UCLA 2YQUA 1IUVA 2WETA 3AEAA 1TDFA 5KWFA 4YTPA 1GRFA 2XCGA 1PXAA 5BUKA 4FX9A 1N4VA 1ONFA 3IHMA 1X31B 3CGBA 2VZ2A 2ZZ0A 1YY5A 4K22A 3B3RA 4EMIA 2WOIA 3NLCA 4YSHA 2H88A 4CBQA 5HXIA 1IUTA 4AT0A 1CJ3A 1Q1RA 2BACA 4TLXA 1JNZA 3ICRA 1DNCA 2V6OA 3NIXA 4A6NA 1S3BA 1CJ4A 4U8OA 1ZMDA 1LQTA 1N4WA 3O0HA 2YLWA 3GSIA 1D4CA 5JCIA 3QFAA 1PXCA 3B6DA 4JNQA 4TM0A 2J3NA 2VRLA 1GRHA 3M12A 3NYEA 4NEWA 1E6EA 2XFUA 1NEKA 1PHHA 1Y56A 4TM3A 2R45A 2XYOA 4H2RA 1LTXR 1GRAA 4J56A 3KPFA 4U8KA 4B68A 4Z44A 4DSGA 3QVRA 2XVHA 4GCMA 3SQPA 1ZMCA 2R4EA 3GMBA 1TYPA 4LA1A 1GRGA 2VVMA 1NG3A 1L0VA 3NNEA 3URHA 3NYCA 4FDCB 2AQJA 4N9XA 5U1OA 3T37A 2FJEA 3NGCX 1GALA 4Z2TA 1BGNA 2JK6A 3RP8A 1BZLA 3EF6A 1AOGA 5HHFA 1ZOYA 1H81A 5U25A 1PBCA 2GAGB 2X99A 1PBBA 2XLRA 4OPDA 4BJZA 2QA2A 3IHGA 2X8GA 1NHQA 1IUWA 1NAAA 2C7GA 4BV6A 1DXLA 1TDEA 2VRMA 4UDRA 3ATRA 4D04A 4H4SA 2XFQA 3UKHA 3K7TA 1NHRA 1REOA 3CNTA 4D03A 4CCQA 3GWFA 1JNRA 1COYA 2CVJA 1M64A 2FJDA 5DBJA 4C3YA 1XHCA 1CJ2A 2YLTA 1BGJA 4JY2A 2ZZCA 1O94A 1JRYA 3CTYA 1K0IA 2RGOA 3IF9A 4GRTA 1BWCA 3F8PA 4MJWA 1PJ7A 3COXA 4ZCCA 5J7XA 4H2NA 1FL2A 1JU2A 1NDAA 1TDOA 2YWLA 1YQ3A 3GD4A 5JCNA 2APGA 4BURA 1BKWA 1FOHA 1Q9IA 1B5QA 2GF3A 2XFNA 4BK1A 4IVMB 5C2TA 3RNMA 2XLTA 2NPXA 3GDNA 1OJAA 3Q9TA 2E4GA 3AE2A 1E1LA 3NN6X 4Z2RA 3E1TA 3HZLA 3QJ4A 4OPCA 4UDPA 4AT2A 1PJ5A 1MXTA 2C64A 2WDQA 5KRQA 2XVFA 4XXGA 1XANA 4H4PA 3SGLA 4C3XA 1TRBA 2OAMA 1ZKQA 1F3PA 4YSXA 4AOSA 5KOXA 4HB9A 2EQ9A 2XLPA 2YVGA 4GR1A 3D8XA 2C67A 4DNAA 3NK2X 3VR8A 4YWOA 3KLJA 2PHHA 2XVEA 4RSLA 3NTDA 3AEBA 1H86A 3AE3A 3KD9A 2JAEA 2C76A 2YAUA 4NEVA 3PVCA 1MO9A 3FBSA 2WP9A 4JNAA 1NHPA 4USQA 1H83A 4Y4NA 2WPEA 3VQRA 2BS2A 2VVLG 2WPCA 2YLXA 5EBKA 2BXRA 1Y0PA 2GR0A 2YM1A 2GVCA 4A7AA 1CF3A 4J34A 1IUUA 1GETA 3DA1A 2HQMA 1H7XA 1OJTA 3ALLA 1DOCA 3AEGA 4YKFA 4H4VA 3GRTA 2YR4A 4EQWA 1PBDA 2BCGG 4FK1C 1OJ9A 1DODA 2A87A 4O5QA 2RGHA 1NG4A 4KPRA 1ZDLA 1GNDA 2V5ZA 2BS3A 2R0CA 4U2TA 2R46A 2CFYA 4TM1A 1H82A 2JB2A 3NH3X 5HYMA 2YG6A 1D5TA 4A65A 4LU6A 4OPLA 1BF3A 4TLZA 4Z26A 3LJPA 5HY5A 4NTDA 3BHFA 2XFOA 4U8IA 1D4DA 3AEEA 2AR8A 1F8RA 1GEUA 1EL5A 1GREA 3AE9A 2O9ZA 3IWAA 1MOKA 4OPIA 3I3LA 3UTGA 4CCRA 3QSMA 1DJNA 1PXBA 2GQFA 1E1KA 2BK3A 3KU9A 3DJEA 4H50A 5EB5A 3AE1A 4UP3A 3GMCA 2DKHA 3AEFA 4GF7A 3BNMA 2WP6A 3NRNA 1GRTA 3BHKA 2EQ7A 4KX6A 2YG5A 2C72A 2YVJA 3OC4A 3NYFA 4O5UA 3V3NA 1N4UA 1XDIA 3F8RA 3GYIA 3AXBA 3QVPA 3CNPA 3DGHA 3CNDA 2B76A 1ZP0A 1TDNA 3ZDNA 3H4KA 1CBOA 2BK5A 2WDRA 4K8DA 1K4QA 2X3NA 3AE8A 2A8XA 4J31A 3K30A 1PN0A 1RYIA 1OJCA 2ARDA 1YQZA 2GR1A 2X8HA 4EIQA 4OCGA 4JQ9A 1O5WA 1GOSA 1TDKA 2GB0A 2ZBWA 3UKLA 3UOVA 1OJDA 3EPTA 4YSYA 2AAQA 2FJBA 1JRXA 2YM2A 1PBEA 2QAEA 4BJYA 1L9EA 5U63A 2R0GA 4K5RA 1JRZA 2GEWA 2R4JA 2XFPA 4REKA 2Q6UA 4U2LA 2F5ZA 1VQWA 2B9YA 5FS8A 4P9SA 4PAAA 3KA7A 3CGDA 2GH5A 3II4A 2Q0KA 1FEBA 4AP1A 4NTCA 5C3JA 2VOUA 2V3AA 1QLBA 1F6MA 2Q0LA 3CPIG 3VRDB 3WE0A 4A5LA 2GR2A 3CPJG 3M0OA 4IVOB 2TPRA 2B7SA 5L46A 1UKVG 1E1NA 4BK3A 2W0HA 3GD3A 4EMWA 1KFYA 1P2HA 5M0ZA 2R9ZA 4IA5A 4YKGA 2WPFA 4IV9A 3ALJA 3AECA 2VQBA 2YVFA 3M13A 3QSSA 4OVIA 4WX1A 4AP3A 1K0JA 4U8NA 4JDRA 3UKAA 2V61A 2YG7A 3F8DA 4WCTA 2BABA 1YQ4A 3FMWA 1CL0A 1QJDA 3UOXA 1E1MA 1ZX9A 1PS9A 2V3BA 3AYIA 3ATQA 4OPUA 4JY3A 3GRSA 4B64A 2WOVA 3P4QA 3I6DA 2NVKX 1GRBA 2YG4A 2ACZA 3NK1X 2OALA 5IPYA 3LXDA 3GDPA 4X9NA 3QSEA 1FEAA 1RSGA 1QO8A 3H8LA 4J33A 5BULA 3LZXA 3SFDA 4H4ZA 2ZZBA 3ICTA 3NHOX 3DK4A 3IC9A 4Z24A 5KVIA 4PABA 3AYLA 4H4QA 4EIPA 4DSHA 1PBFA 4J57A 3AYJA 3C4NA 3AD8B 1D4EA 2BXSA 1PDHA 5FS7A 3DJGX 4I59A 2JB1A 3AE6A 2WP5A 2JKCA 1GPEA 2OA1A 3ISHA 5CQFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LYPA 4NWYA 4PQHA 4TR1B 5KXJA 1Z6LA 2IMDA 3GL5A 3FG2P 4TR0A 1KDGA 3P1WA 2WCIA 2FY6A 3NN0X 5ECMB 1FAAA 1GTEA 4JZQA 3UKKA 1KNRA 6GSTA 4JE1A 3MIXA 2GV8A 4EM3A 2B9WA 3PGTA 3AD7B 2QCUA 3QPMA 2A4VA 4EMJA 3SZCA 3GX8A 4B63A 4XWZA 1GUKA 1WE0A 1D7LA 3K8NA 2C70A 3ZMKA 1E6BA 4YSZA 4B1BA 3HZ8A 4KSOA 1XPQA 1DOEA 3GYXA 4C77A 4B67A 1FHEA 3P7XA 3GIXA 4UDQA 2MBSA 3GWDA 2YR5A 2Z5YA 3BI4A 4ML1A 3K7MX 4I97A 4F82A 3C73A 1GL8A 2JSYA 2HZFA 2CDUA 4A79A 1SEZA 2B9XA 1ZOVA 1M3IA 4F03A 1N2AA 2P31A 2C4JA 4H86A 5DQYA 3HCZA 5KMRA 2DMLA 3EYTA 4K7ZA 8GSSA 1TI3A 2C73A 3L1RA 4AJ7A 2E5VA 3NT6A 1JZRA 3CPHG 4JN9A 1E7PA 3FIMB 3PH9A 1GERA 5D9VA 2YJHA 1GULA 2BMXA 2BC0A 2HSYA 4HU7A 1LVLA 3AEDA 3KGKA 4HZ2A 2WU2A 2R0PA 3QOUA 3DMEA 4TOPA 2B1LA 4XWRA 5KMQA 4YAPA 5ECNB 1TI1A 3BD2A 2YLRA 1WPIA 3VWXA 4LMWA 5HR2A 1XWCA 2HI7A 3G5RA 1B8SA 3GV1A 1GTBA 1BQ7A 1JZOA 3EU4A 1F9MA 3TJJA 4V2MA 5ECLB 1YEXA 3U5RE 3LGCA 5INYA 4BK2A 2WGRA 2XVIA 3F4TA 3SY4A 4MH2A 4EXJA 1ZY8A 2C3CA 3CTGA 1T4ZA 1B4VA 3LFLA 2EQ8A 4H4XA 2YANA 3CYNA 2NDOA 5M10A 3ERFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 3LYP A;  4NWY A;  4PQH A;  4TR1 B;  5KXJ A;  1Z6L A;  2IMD A;  3GL5 A;  3FG2 P;  4TR0 A;  1KDG A;  3P1W A;  2WCI A;  2FY6 A;  3NN0 X;  5ECM B;  1FAA A;  1GTE A;  4JZQ A;  3UKK A;  1KNR A;  6GST A;  4JE1 A;  3MIX A;  2GV8 A;  4EM3 A;  2B9W A;  3PGT A;  3AD7 B;  2QCU A;  3QPM A;  2A4V A;  4EMJ A;  3SZC A;  3GX8 A;  4B63 A;  4XWZ A;  1GUK A;  1WE0 A;  1D7L A;  3K8N A;  2C70 A;  3ZMK A;  1E6B A;  4YSZ A;  4B1B A;  3HZ8 A;  4KSO A;  1XPQ A;  1DOE A;  3GYX A;  4C77 A;  4B67 A;  1FHE A;  3P7X A;  3GIX A;  4UDQ A;  2MBS A;  3GWD A;  2YR5 A;  2Z5Y A;  3BI4 A;  4ML1 A;  3K7M X;  4I97 A;  4F82 A;  3C73 A;  1GL8 A;  2JSY A;  2HZF A;  2CDU A;  4A79 A;  1SEZ A;  2B9X A;  1ZOV A;  4F03 A;  1N2A A;  2P31 A;  2C4J A;  4H86 A;  5DQY A;  3HCZ A;  5KMR A;  2DML A;  3EYT A;  4K7Z A;  8GSS A;  1TI3 A;  2C73 A;  3L1R A;  4AJ7 A;  2E5V A;  3NT6 A;  1JZR A;  3CPH G;  4JN9 A;  1E7P A;  3FIM B;  3PH9 A;  1GER A;  5D9V A;  2YJH A;  1GUL A;  2BMX A;  2BC0 A;  2HSY A;  4HU7 A;  1LVL A;  3AED A;  3KGK A;  4HZ2 A;  2WU2 A; 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