4Z2TA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase w225y from pseudomonas azelaica
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
581
structure length
559
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYYMFVAALRMIRPWNKWICVWGEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 190
structure length 559
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2tA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2tA01
3AD9B 1F8RA 2C66A 1E7PA 1D5TA 2GF3A 2H89A 2VRMA 2VQBA 2W0HA 2WPEA 2YLSA 3C4NA 3L1RA 4C3XA 3OC4A 3R9UA 1NHRA 3GYIA 4M52A 5JCNA 2YG7A 1NG4A 4B63A 1CJ4A 1MOKA 2VVLG 3KVEA 2X8GA 3I6DA 4H4PA 4OPDA 2WDRA 4UDQA 1Y56A 1H86A 1O94A 5EOWA 2X8HA 3VRAA 1BGNA 1PXBA 4H4UA 4ADWA 4EM4A 1Y0PA 2E4GA 2WOWA 4RG3A 5J7XA 3M12A 4XWZA 2APGA 2C65A 3RNMA 3BNMA 2GR3A 2Q0LA 2C7GA 1EBDA 1ZMDA 3AE8A 4A5LA 3G5RA 3UKKA 1P2EA 1Y56B 3ITJA 4D04A 3I3LA 2B76A 5CQFA 2CULA 2EQ8A 4FK1C 3P4QA 4CY6A 1PXCA 2YG6A 1LTXR 3AYIA 1DOBA 1GERA 1GTEA 1GRFA 1ZK7A 1QJDA 4YTPA 3K7QX 3S5WA 3RP8A 4JQ9A 1ONFA 4BURA 2VRLA 4BJYA 1FEBA 1ZX9A 1VDCA 2BK5A 2YG5A 3BHFA 2RABA 2XFQA 3KA7A 3NK0X 1EL9A 1KNPA 1IUWA 1XPQA 2BCGG 3AE6A 3QFAA 3DMEA 3NTAA 4ECHA 4H4QA 2WS3A 3AWIA 2GB0A 3DK8A 3UKQA 3ICRA 3P1WA 2AR8A 4FK1A 3H4KA 4UDPA 4TM0A 1EL7A 3NYFA 5BVAA 4CNKA 2C72A 3LB8A 2BS4A 4CY8A 3AE7A 4CCRA 1P2HA 1BKWA 4K8DA 4B64A 5IQ4A 2YWLA 1F8SA 2QA1A 4X4JA 1LJ1A 4HA6A 3GRTA 4WCTA 5LV9A 1D7LA 1M6IA 2VZ2A 3GDNA 4K5RA 1CHUA 4JDRA 4LA1A 4NTCA 4APNA 1KSSA 4DSHA 4J56A 5CKUA 2GQFA 4H4RA 1VRQB 3CTYA 4U8MA 1L9CA 1H7XA 2ACZA 2YLZA 1OJAA 2CDUA 3VRDB 4GRTA 4KPRA 2AQJA 2GV8A 4K22A 2RGJA 1E6EA 3AD7B 3NYCA 1EL8A 3AEBA 1QLBA 3ATQA 4IVMB 4TM3A 3KLJA 3SM8A 2BK4A 3UCLA 2PHHA 1RSGA 4DSGA 5DBJA 3IC9A 1LPFA 4RSLA 1TDKA 3AEFA 4K5SA 1Z6LA 3GYJA 4JY3A 5M0ZA 3NK1X 3IHGA 3QSMA 3GD3A 4TLZA 5GRTA 4D03A 1D4CA 1KF6A 2GH5A 1TDEA 1K0LA 1IUSA 2XFPA 4H4VA 3VR9A 2V5ZA 2WPCA 2JBVA 4A7AA 1TYPA 2Q6UA 2XVIA 3NG7X 3CGEA 4IA5A 4N9XA 4JN9A 2B7SA 5BULA 4GF7A 3DJGX 1F6MA 3BHKA 3PO7A 3V76A 4WX1A 2YAUA 3UTFA 1BZLA 4EM3A 1MXTA 5KWFA 2WOVA 3V3NA 3DGHA 3FPZA 4H4ZA 5EB5A 4Z2TA 1Q1RA 3F8RA 2XLRA 4A79A 1ELIA 2JKCA 3DK9A 5EBKA 3AE9A 1YKJA 3ATRA 3CNTA 2NVKX 2BXSA 3D1CA 3UOVA 3ADAB 2OALA 2JB3A 1JRZA 4Z26A 4NZHA 1S3EA 1B37A 2X50A 2XCGA 2FJAA 4EQWA 3QVPA 1DXLA 1PBEA 2JK6A 1B8SA 1OJTA 3C4AA 2B9WA 5HHFA 4C5OA 1S3BA 5KVHA 2B9XA 2FJBA 2WP6A 1CBOA 2IIDA 4NTEA 1PHHA 2EQ7A 3CPJG 4X9NA 4Z44A 5KXJA 2WU5A 1GT8A 4IVOB 2X99A 4NEWA 4A65A 2V61A 2TMDA 5FS6A 3UTGA 3CGCA 4NEVA 4YSHA 3AE3A 3RP7A 2H88A 3K30A 3UKFA 2E1MA 3OZ2A 1D7YA 3AEDA 3ICTA 4J34A 4A99A 2EQ9A 4HB9A 3M13A 4YTMA 3UTHA 4Z2RA 2B7RA 2YQUA 4ZCCA 2TPRA 3VR8A 4YSYA 2VVMA 1B4VA 2FJDA 1FOHA 3DJEA 5JCLA 1EL5A 2C73A 2R4EA 5GSNA 1ZKQA 5U25A 4Y4LA 1COYA 1KNRA 1E1KA 4U2LA 3LZXA 1YQZA 4YKGA 3GRSA 3DA1A 1H7WA 4H2RA 4J57A 4XXGA 1FL2A 1CJ3A 2WDQA 3KKJA 4U2TA 3P4RA 2CFYA 4GR1A 3ZYXA 3VQRA 4J2WA 1GPEA 3NIXA 3QJ4A 2Y6QA 1M64A 1PXAA 3Q6JA 3GDPA 3FMWA 2IVEA 2PYXA 5FMHA 3UOYA 4DGKA 4EMWA 4EMIA 4OPCA 4J36A 1UKVG 2GAGB 4I58A 2R9ZA 2YVFA 4H4XA 2J3NA 3GWDA 3LADA 1DODA 1REOA 3BNUA 3DGZA 4H4SA 2WOIA 4JNQA 1TRBA 1GALA 1N1PA 2B9YA 1GTHA 2BS3A 4EIPA 3AEGA 3KU9A 4O5QA 1D4DA 2ZZBA 3S61A 3IF9A 4YTNA 4Z24A 1VG9A 3AE5A 3ALMA 3P9UA 1NHPA 4DNAA 1GRTA 3FBSA 3UKAA 1OJDA 4AP3A 1GEUA 1PBDA 1Q9IA 2GRTA 3CIRA 3FG2P 4OPUA 4ZN0A 1N4VA 4B66A 1TDOA 4BJZA 1KSUA 2GAHB 3BI5A 2EQ6A 4CRTA 2XYOA 1DOCA 2YG3A 4U8NA 2WESA 4ICYA 3LOVA 2YLTA 2V3BA 2BXRA 1FCDA 3NN6X 4GDPA 4H2NA 4P9SA 2A89A 3GSIA 3ICSA 1JRYA 3GWFA 4XWRA 3REDA 3CPIG 1PBFA 2XVJA 2AAQA 2BA9A 3FIMB 3CNDA 4KX6A 1JNRA 3NLCA 4MJWA 1L9DA 1ZMCA 3UOZA 4Y4NA 4LU6A 4GCMA 2WBAA 4U8LA 4YWOA 5IQ1A 3NRNA 2HQMA 1CJCA 4LIIA 4U8IA 2C3CA 2V6OA 3VRBA 1GRBA 2JB2A 1YQ3A 3GMBA 3CGDA 3QSEA 1KDGA 2OAMA 2GMJA 1CC4A 2I0ZA 1AOGA 4UDRA 1JEHA 2Q0KA 3JSKA 2DKHA 5U1OA 3AE4A 4B1BA 3RHAA 1PS9A 1JU2A 2FJEA 5TR3A 1LVLA 4Z25A 5FS9A 4Z2UA 3PVCA 3SFEA 3AXBA 3BI4A 4YSXA 4JNAA 4U8JA 1CF3A 3LZWA 3HZLA 4YT0A 1TDFA 4U8OA 4U8PA 2WEUA 4IV9A 1H84A 3CNSA 4AP1A 1X31B 2GEWA 1OJ9A 2R4JA 3ISHA 3URHA 1ZOYA 4Z43A 3CPHG 2BACA 4B65A 2YM2A 3DJJA 3AE2A 1ZDLA 3SGLA 5EB4A 3AYJA 1IJHA 1NEKA 2WDVA 4IA6A 1PJ5A 1NHQA 1NPXA 1XANA 1XHCA 2C75A 1IUXA 1IUTA 1W4XA 2BC0A 3EAOA 2YVJA 2RGOA 5KRQA 3H8IA 2GVCA 4C77A 5FS7A 2YLXA 1JNZA 4U2SA 5JCIA 3B6DA 2Z5XA 1GNDA 4NTDA 1ZOVA 4JY2A 3B3RA 2C64A 4J31A 1XDIA 3F8PA 4AT2A 2OLNA 3UKPA 3CGBA 2X8CA 3H8LA 4OPTA 2V3AA 2GMHA 2XLUA 3UKHA 2Z5YA 4EMJA 1D4EA 2RGHA 3NKSA 1TDNA 3SQPA 5KVIA 3NN0X 1GXFA 1E1LA 4U8KA 2IVDA 2WHDA 5JCMA 1N4WA 3O0HA 3EPTA 4FX9A 2R0CA 1PBCA 1H81A 3IWAA 2R45A 1IUUA 1PJ7A 3BI2A 2YVGA 1OJCA 4H4YA 4OPGA 3P4PA 3ZDNA 4A6NA 1K0IA 4CBQA 3P4SA 3UP5A 3NK2X 1PJ6A 1TYTA 1ZY8A 3G5QA 3AB1A 2C3DA 2R0PA 2R0GA 1YY5A 2XDOA 4OPLA 4GUVA 2XVFA 3UP4A 1HYUA 1KFYA 3NNEA 1SEZA 2GQWA 1BWCA 1L0VA 2XVEA 1DJNA 5U63A 3SFDA 2WPFA 2XFUA 1NG3A 4EQSA 2NPXA 5C3JA 4H7UA 1LQTA 2E5VA 2OA1A 5KOWA 1E1MA 1DOEA 3C96A 5BUKA 2BK3A 3G5SA 1GREA 5L46A 2F5ZA 2YR5A 3COXA 1E39A 2Q7VA 2WETA 2XFNA 3NH3X 3NHOX 3NGCX 1IUVA 4A6NB 2XFOA 4H50A 2YLRA 1H82A 1NAAA 4X9MA 2C67A 2YR4A 1V59A 5IPYA 2ZBWA 2QAEA 4C3YA 3M0OA 1GETA 2XVHA 1K0JA 2R46A 4AT0A 4H2PA 2GR2A 4REKA 5JCKA 1F3PA 1S2QA 2ZZCA 2XLPA 4H4WA 3ABVA 4AOSA 2XLSA 3T37A 1GRAA 2O9ZA 1GSNA 2YM1A 2Y6RA 1CJ2A 1CC6A 4OVIA 3CNJA 2C70A 4CCQA 4K7ZA 4EIQA 1FEAA 3KD9A 1FECA 1RYIA 2JB1A 4TM1A 2CVJA 1LV0A 3V3OA 5KOXA 4A9WA 2WP9A 2ARDA 3AEEA 4E0VA 1LQUA 2GR0A 4EQRA 5FS8A 4ZCDA 3AECA 3NYEA 2YG4A 4YKFA 3D8XA 3QVRA 1ZP0A 4BK3A 4YXDA 4AOXA 4B67A 2A87A 4BV6A 3GMCA 4YSZA 3WE0A 1GESA 4USRA 3AYLA 3E1TA 3QSSA 3F8DA 1Q1WA 1DNCA 2WQYA 1BGJA 1O5WA 2WU2A 3ALJA 2OLOA 4PAAA 3UTEA 4TLXA 4B68A 1GOSA 4C74A 4EQXA 1N4UA 4PABA 1CC2A 2ZZ0A 3ALLA 4BK1A 1NENA 4OPIA 3CNPA 5BRTA 3NT6A 3QFBA 4H4TA 2QA2A 4Y4MA 1JRXA 1B5QA 2YR6A 2GR1A 3LXDA 3L8KA 2JAEA 4RG4A 4UP3A 5J60A 2UZZA 1VQWA 3NTDA 1QO8A 3CN8A 4H2QA 4FDCB 2BYBA 1VG0A 3DH9A 2FBWA 3IHMA 1NDAA 1E1NA 3PS9A 4TM4A 2BS2A 1PDHA 1O95A 1BF3A 2A8XA 1PBBA 3AEAA 5M10A 3DJDA 2QCUA 2BC1A 2C76A 2BABA 5HYMA 1S2YA 4USQA 1NHSA 2VQ7A 4O5UA 3DK4A 5C2TA 3Q9TA 1GV4A 1JOAA 3UKLA 1GRGA 3AD8B 3EF6A 4BK2A 1L9EA 5HY5A 2V60A 4CNJA 3KPFA 2YLWA 4GDEA 5HXIA 2XLTA 2VOUA 2VVLA 3K7MX 1MO9A 2X3NA 1YQ4A 4B69A 3II4A 1RP0A 3LJPA 4I59A 1H6VA 5ER0A 4K2XA 2WP5A 1F8WA 4OCGA 3RP6A 1H83A 1K4QA 2DKIA 1PN0A 3AE1A 3GD4A 3EANA 1DJQA 4J33A 3UOXA 3K7TA 1GRHA 1CL0A 2BCPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2C66A 2YLSA 2VQBA 3OC4A 3GYIA 4JR6A 2LJAA 1CJ4A 1MOKA 2VLVA 3E3EA 1WP0A 2IFQA 4K2DA 1FOVA 4OPDA 3MDKA 2A2SA 3RDWA 1TI1A 1H86A 2X8HA 3IK7A 5CREA 4IS0A 4H4UA 2HT9A 4Z7XA 1Y0PA 4POLA 1TOFA 1TDIA 5LD0A 3LFLA 4NV2A 5DBQA 1S3RA 3RNMA 1SYRA 5ECLB 3UKKA 2L4CA 4ULXA 4QQ7A 1SYXA 3P4QA 1QMVA 4CY6A 3AYIA 2JZRA 2MZCA 1EOGA 4EDYA 2ZCTA 1SKRB 1ZX9A 2BK5A 3BHFA 2XFQA 3KA7A 1WJKA 1WWJA 2BCGG 2V41A 3QFAA 2A2RA 2JL4A 2IL3A 4ECHA 1Z6MA 2L4QA 5ELGA 4TM0A 2XC2A 2F8AA 4K8DA 1JZWA 2B7KA 4EE0A 2YWOA 3O3TA 5IQ4A 2QA1A 1PX7A 1FVKA 2XPEA 2YANA 3KM6A 4NTCA 2EIOA 1N8JA 4J56A 1QQ2A 2FA8A 3CTYA 1SK0A 4U8MA 2B5XA 3ZVJA 4YH2A 2X64A 3SWLA 5CAXA 4GRTA 3LXZA 3CSJA 1E6EA 3KH7A 1QLBA 4TM3A 1YJ6A 2M80A 1G6WA 4DSGA 5KMRA 5DBJA 1UC7A 3WGEA 1NW2A 1TDKA 3AEFA 2HRKA 4NHZA 1Z6LA 1DBYA 3GYJA 3GSTA 3GKKA 4TLZA 4YQVA 3SZWA 3ZFLA 1TDEA 4KNDA 2XFPA 3RPNA 3QMXA 2JBVA 1EV9A 3D0ZA 3TGZA 5IMDA 4ECBA 2M46A 2X49A 4PXOA 1E6BA 1OVNA 3RHCA 3F4SA 2H71A 3HHVA 4H4ZA 1ERVA 4JU5A 1Q1RA 4A79A 2HSYA 2JKCA 3DK9A 3ATRA 3CNTA 5D9WA 2NVKX 2WB9A 3QAVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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