4Z2TA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase w225y from pseudomonas azelaica
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
581
structure length
559
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYYMFVAALRMIRPWNKWICVWGEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule tags Oxidoreductase
total genus 190
structure length 559
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2tA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2tA01
2EQ7A 3NYCA 2BABA 4AP1A 1D4EA 4I58A 2C3DA 3UTFA 1GETA 4EMWA 3GWDA 3DK8A 1GRTA 3CPJG 3V3OA 3D8XA 4AOSA 4LU6A 4FK1A 2GF3A 4OVIA 1NHPA 4GF7A 3C4NA 3G5RA 3WE0A 4CCQA 4B1BA 4A6NB 5KRQA 1GTHA 4NZHA 4EQSA 1E1KA 3F8PA 2GVCA 5JCIA 2B9WA 3VQRA 4ECHA 4Z24A 3AE7A 5IQ1A 4C3YA 4NTDA 1DJNA 4U8JA 4O5QA 5J7XA 4BURA 2WOVA 2GR2A 2QAEA 1S3EA 1SEZA 3ATRA 4H2PA 1KNPA 3GMBA 4J57A 3AEBA 3VRBA 4H2NA 1BZLA 1NPXA 5IPYA 1F8WA 1ZDLA 2YM1A 5BRTA 2APGA 2BXSA 4OPLA 1S2QA 2CULA 4AP3A 4AT0A 1S2YA 2R45A 1CC2A 4AT2A 1F3PA 1LQUA 1GXFA 1OJAA 2FBWA 4TM3A 1P2HA 3IHMA 4WCTA 2VRLA 4XWRA 4DGKA 2JK6A 1VG9A 1ZY8A 3LXDA 2Z5YA 5GRTA 4J36A 1PBEA 4RG3A 1IUWA 2QCUA 1X31B 2YVGA 4KX6A 3P9UA 4EM4A 4I59A 4A79A 4DNAA 2X8GA 3NYFA 3ALLA 1CJCA 2BC0A 1JU2A 3AXBA 5CQFA 1K0IA 1BKWA 2B9YA 4LIIA 3GRSA 3REDA 3ZDNA 2VRMA 5J60A 2IIDA 1GRGA 1JNZA 1N4VA 1PBDA 4C77A 2RABA 3CGDA 1FEAA 4YT0A 4YTMA 4OPTA 4YKGA 4J56A 1PN0A 3NNEA 2EQ6A 2WOWA 2GH5A 4TM4A 5U1OA 3L1RA 4UDRA 3V3NA 4YSXA 4Z44A 2FJAA 4NTCA 2YLZA 2B7RA 1H7WA 1E39A 1OJDA 4H4WA 5FMHA 3SQPA 4B69A 1H83A 3AE6A 3CPIG 1JRYA 1HYUA 5HYMA 1N4UA 2RGOA 2GRTA 2YLTA 2GV8A 1Y0PA 3SFEA 1ZX9A 2R4EA 2VVMA 4X9NA 2ZZCA 1DNCA 1E1NA 4EQXA 2XLUA 5U63A 2EQ8A 2CDUA 3GD4A 4JDRA 2GEWA 2B76A 3FPZA 4N9XA 3AE5A 5C2TA 2GR3A 2YLSA 2R0CA 1KDGA 4IV9A 2UZZA 2Q6UA 2E1MA 3BI5A 4APNA 4Y4LA 1O5WA 1Y56A 1L0VA 1S3BA 2C67A 2WP9A 2BK4A 2V61A 2YR5A 2WOIA 3QVRA 1L9DA 1PXCA 4OCGA 3H8IA 3H4KA 3NGCX 1NHSA 4J2WA 2R46A 4YSZA 3ICSA 3AEDA 4B66A 1IJHA 1H84A 2OALA 4EMJA 1D4CA 2XFNA 3DJJA 1TRBA 3BHFA 2YLRA 3NLCA 3AE1A 1TYPA 2CFYA 3GSIA 1DJQA 3Q6JA 2V60A 1NG4A 1XPQA 2Z5XA 3NK2X 2J3NA 3OC4A 3UKAA 3UTGA 3UOZA 4E0VA 3AE8A 3P4SA 4D03A 5JCLA 3P4RA 4K5SA 2XCGA 4CBQA 3RHAA 2F5ZA 4B64A 3ICRA 1JRXA 3AE3A 1D5TA 4CCRA 1H6VA 4H4UA 2W0HA 3H8LA 5GSNA 3IF9A 4A6NA 1YQZA 3LOVA 3Q9TA 1TDNA 3GWFA 4JNAA 2YM2A 3UTEA 2RGJA 4H4XA 1LJ1A 4EM3A 2V3BA 2JB1A 1CJ2A 2ACZA 4D04A 2E5VA 4H4QA 3ALJA 3KLJA 2QA1A 2AQJA 2QA2A 1IUSA 3E1TA 4REKA 5KVIA 3AEAA 2Y6QA 3GRTA 1NHQA 2JKCA 1ELIA 3QSEA 4HA6A 5JCNA 2JB2A 2XLPA 4OPIA 5HY5A 3AE2A 3RP8A 1GT8A 1XHCA 1N1PA 3LZWA 3NN6X 1N4WA 2BYBA 4B63A 4HB9A 4J34A 3GYJA 4FK1C 1IUUA 2X99A 5HXIA 1GSNA 3AEEA 3QSMA 3UP4A 3FG2P 1EL7A 1VG0A 4IVOB 1CJ4A 1TDFA 2BXRA 2GAHB 2TPRA 3AD9B 5KOXA 4K2XA 4OPDA 2TMDA 4RG4A 1ONFA 3UKPA 2GR0A 1NHRA 4Z2TA 3CGBA 1RYIA 4WX1A 3GD3A 4JY3A 1ZMCA 3M0OA 2C65A 4H4YA 4ZCDA 5M10A 4OPUA 5FS9A 5JCMA 4EIQA 3DGZA 3PVCA 1CBOA 1GESA 2B9XA 2WHDA 2YG5A 3F8RA 4H4TA 4TM1A 1KNRA 1PXBA 1VRQB 2YG4A 2WETA 1L9EA 1LV0A 1E1MA 2H88A 1F8RA 1NENA 3AD7B 3ZYXA 1UKVG 1XANA 3K7MX 4U8OA 4YSYA 2WESA 4DSGA 1NDAA 3P4QA 3AE9A 2YR4A 3QFAA 3S61A 5DBJA 2NPXA 2WPCA 2I0ZA 4P9SA 3G5SA 4BJZA 1FOHA 2WU2A 3NIXA 3DJDA 4EQRA 1PDHA 3GDNA 3GYIA 3CNTA 4J33A 2C66A 5EB5A 2C3CA 2R0GA 2GQFA 5BULA 1IUTA 2RGHA 3KA7A 1H86A 3EF6A 1TDKA 2ZBWA 4PABA 1F8SA 1PJ5A 1EL9A 1CL0A 1GRFA 1LVLA 2WPFA 2O9ZA 3LZXA 1DXLA 1PHHA 4YXDA 1ZOYA 4Y4MA 1PJ7A 1B37A 2FJEA 2BS4A 4O5UA 5FS7A 1O94A 3D1CA 4J31A 1B8SA 2V6OA 2WDRA 3JSKA 3ICTA 2R4JA 3K30A 4U8NA 1ZKQA 1W4XA 1B4VA 3CIRA 3IC9A 4H4RA 4Z43A 4H2QA 3ITJA 1Q1RA 4GR1A 3DH9A 4H7UA 3AYLA 2OLNA 3KKJA 4H50A 3II4A 3CGCA 3VR9A 5M0ZA 2C70A 2YG3A 2OA1A 2ZZ0A 2VVLA 5C3JA 2C72A 2R0PA 3CNDA 3ADAB 2XDOA 4YWOA 1BWCA 3DK4A 3LADA 4CY8A 4TM0A 5FS8A 2C73A 1K0JA 5FS6A 4EIPA 3DK9A 4U8IA 2GR1A 4BK2A 2OAMA 2IVDA 2YVFA 5TR3A 4MJWA 2JAEA 4OPCA 4XWZA 3VR8A 2Y6RA 1EBDA 5IQ4A 2CVJA 1RP0A 1TYTA 3CN8A 4IA5A 4JY2A 1ZP0A 1L9CA 3T37A 3KD9A 1KSUA 2BACA 3NRNA 1DOEA 3FBSA 3S5WA 2H89A 3DMEA 2XFPA 4XXGA 3CNPA 3BI4A 2YG7A 4U2SA 4Z25A 1Q1WA 3PS9A 1JRZA 4U8MA 4TLZA 2PYXA 1ZK7A 2AAQA 4K5RA 3DJEA 1V59A 3SGLA 1YY5A 2YR6A 3EPTA 4GUVA 1FEBA 1O95A 1XDIA 2WDQA 4JNQA 1FL2A 1PBFA 4BJYA 2A8XA 3NTDA 3VRAA 4FX9A 4BK3A 1PJ6A 5JCKA 1GV4A 2V5ZA 1F6MA 3RP6A 2BS3A 4JN9A 2DKIA 2XFUA 4U8PA 2V3AA 4CRTA 5EB4A 1D7YA 3NT6A 5CKUA 1FECA 2WU5A 4H4VA 3IWAA 3BNUA 1REOA 1H82A 1KF6A 4X9MA 1OJ9A 4B65A 1JNRA 1GRBA 3CNJA 2WEUA 3KPFA 1NAAA 1CHUA 3AEFA 2BCGG 1YQ4A 4CY6A 2XVEA 3LJPA 1MXTA 1GERA 3B3RA 3UCLA 1OJTA 2Q7VA 3OZ2A 2XLRA 4ICYA 2GAGB 2AR8A 2X3NA 2XVFA 2YG6A 3VRDB 1VDCA 4LA1A 3NN0X 4TLXA 1DOBA 3P4PA 4Z2UA 4UDPA 3AYIA 5EBKA 2BC1A 2XFOA 4BK1A 5KXJA 3UOXA 2BS2A 1GOSA 4H4PA 1CC4A 3DA1A 1CC6A 4USRA 4C5OA 3UKHA 1BF3A 1GRAA 5KWFA 1H7XA 4A99A 4X4JA 1GEUA 3CGEA 1Z6LA 5BUKA 4GCMA 4H4SA 3UKFA 4B67A 3DGHA 4Z26A 1LQTA 3KU9A 3AYJA 1COYA 3NKSA 3NK1X 2XVJA 2VOUA 3P1WA 4RSLA 4ADWA 4GDEA 1RSGA 2R9ZA 3EAOA 2XYOA 1CF3A 4EQWA 3UKQA 1H81A 3R9UA 1LTXR 5ER0A 3K7TA 3BNMA 3QVPA 1ZMDA 2HQMA 3FMWA 1QLBA 1P2EA 1IUXA 2E4GA 1BGNA 4BV6A 3C96A 4NTEA 1KFYA 1GPEA 3AWIA 3NH3X 2YWLA 4GRTA 1YQ3A 1JOAA 4K7ZA 4Y4NA 2BA9A 4A5LA 1QO8A 2YVJA 3UP5A 2DKHA 1KSSA 2YLWA 1E1LA 1MO9A 4CNJA 3AEGA 3URHA 1DOCA 1OJCA 3LB8A 2X50A 4U8LA 1GREA 2GQWA 2YLXA 4IA6A 5KOWA 4USQA 1YKJA 3AECA 2VQBA 2YQUA 3DJGX 2FJDA 1NG3A 1K0LA 3QFBA 3EANA 3V76A 3C4AA 4IVMB 5U25A 2Q0LA 3G5QA 3KVEA 3UTHA 2VZ2A 2XLTA 3FIMB 3NTAA 4FDCB 3UKKA 1EL5A 2C7GA 2XVHA 2JB3A 2YAUA 3M13A 4U2TA 2WS3A 1B5QA 2Q0KA 3HZLA 4U2LA 1PBBA 1GNDA 2BK3A 2WPEA 3ISHA 3IHGA 4M52A 2ARDA 4YTNA 2XLSA 3O0HA 4C3XA 3RNMA 4PAAA 3NG7X 4H2RA 2WDVA 1TDOA 2EQ9A 1M64A 4EMIA 2GMJA 3BI2A 5BVAA 5L46A 3K7QX 3SFDA 3CNSA 5KVHA 2VQ7A 3NYEA 3UOVA 1M6IA 3F8DA 3I3LA 3AE4A 1AOGA 3UKLA 2A89A 3GDPA 1IUVA 4ZN0A 2C76A 3UOYA 3NHOX 3AD8B 2FJBA 1PBCA 1E6EA 2BK5A 4A9WA 4Z2RA 2WP6A 3ABVA 4NEWA 4ZCCA 4YKFA 4K22A 1BGJA 1JEHA 3QJ4A 2C64A 3SM8A 1Q9IA 4A65A 3CPHG 4C74A 3I6DA 2B7SA 1GALA 3COXA 1VQWA 4AOXA 4UP3A 3ALMA 2JBVA 1QJDA 3NK0X 3M12A 4YTPA 2A87A 1CJ3A 2ZZBA 4U8KA 1PS9A 2GMHA 3L8KA 1K4QA 1ZOVA 2XFQA 2XVIA 3QSSA 2IVEA 4GDPA 4H4ZA 5LV9A 4UDQA 1Y56B 3AB1A 3RP7A 1FCDA 2C75A 3BHKA 1MOKA 1GTEA 4NEVA 2PHHA 3B6DA 1E7PA 4JQ9A 4A7AA 5HHFA 4CNKA 2VVLG 4B68A 1D7LA 3GMCA 1GRHA 2WP5A 1EL8A 2X8HA 4KPRA 1D4DA 5EOWA 2NVKX 1TDEA 1NEKA 1LPFA 2WQYA 2OLOA 2X8CA 3CTYA 3PO7A 3ATQA 2GB0A 4YSHA 2BCPA 1PXAA 4OPGA 2WBAA 4DSHA 1DODA 4K8DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5GSTA 3SY4A 4H86A 2K8SA 1D4EA 1J9BA 1Z7PA 5DCHA 4TXOB 3TKSC 3MIXA 3VFIA 3CPJG 3CMIA 3EWLA 4LU6A 2M80A 3KXOA 4GF7A 2PMTA 4B1BA 3CSHA 3O6TA 3MSZA 4NZHA 1B9YC 2GVCA 2V32A 3Q19A 1A2LA 4ECHA 2FGXA 1M0UA 2H0IA 3CBUA 2GLRA 2QAEA 3ATRA 1SEZA 4H2PA 4J57A 1KNPA 3VRBA 1B4QA 1TI1A 1M7TA 5EY6A 3TB2A 4ML6A 3KP8A 2ON7A 1S2QA 2CULA 1CC2A 1GXFA 5CRWA 2VRLA 4O32A 4DGKA 1XWAA 4K7OA 1ZY8A 3LXDA 2L5LA 1PBEA 3HJOA 4HU7A 2C4JA 3P9UA 2MBSA 3NYFA 2YWMA 1ZYQB 4K0GA 2B9YA 4OD7A 3ZDNA 4AJ8A 2VRMA 5J60A 1JNZA 1PBDA 4YT0A 4C77A 2R6KA 1GULA 3FR3A 2XBQA 4J56A 1PN0A 3VWWA 3ZZXA 3M1GA 1E6BA 5U1OA 1SU9A 1RW1A 3L1RA 3V3NA 4TOPA 4EKZA 2B7RA 2IPAA 1E39A 4H4WA 3LGCA 2JSYA 1XIYA 3TJGA 2JZTA 4BPYA 1JRYA 2GRTA 1XFLA 4IELA 2GV8A 2F3MA 1ZX9A 4X9NA 3HYVA 4EQXA 4MH2A 3QDNA 3UBLA 2XLUA 5JWRB 3TUEA 4BVXA 3L0HA 1Y6EA 4RQRA 1A0RP 2EIOA 2GR3A 3F6DA 13GSA 2K18A 2E1MA 4APNA 1EEMA 4Y4LA 1O5WA 5AIXA 5G5FA 1L0VA 2C67A 2YR5A 3NOFA 4OCGA 5CAXA 1Z3EA 20GSA 4QL9A 2WB9A 2XFNA 2PVQA 5IMDA 1M3JA 5EL8A 1TYPA 1WP0A 3GSIA 1DJQA 1ACVA 5ECIB 3NK2X 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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