3V1WA

Molecular basis for multiple ligand binding of calsequestrin and potential inhibition by caffeine and gallocatecin
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
349
structure length
349
Chain Sequence
EGLDFPEYDGVDRVINVNAKNYKNVFKKYEVLALLYHEPPEDDKASQRQFEMEELILELAAQVLEDKGVGFGLVDSEKDAAVAKKLGLTEEDSIYVFKEDEVIEYDGEFSADTLVEFLLDVLEDPVELIEGERELQAFENIEDEIKLIGYFKNKDSEHYKAFKEAAEEFHPYIPFFATFDSKVAKKLTLKLNEIDFYEAFMEEPVTIPDKPNSEEEIVNFVEEHRRSTLRKLKPESMYETWEDDMDGIHIVAFAEEADPDGYEFLEILKSVAQDNTDNPDLSIIWIDPDDFPLLVPYWEKTFDIDLSAPQIGVVNVTDADSVWMEMDDEEDLPSAEELEDWLEDVLEGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Calcium binding protein
publication title Molecular Basis for Multiple Ligand Binding of Calsequestrin and Potential Inhibition by Caffeine and Gallocatecin
rcsb
molecule keywords Calsequestrin-1
total genus 104
structure length 349
sequence length 349
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3v1wA03
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3v1wA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3v1wA02
2O7KA 3FHKA 1WRYA 4JEDA 3P2AA 5AGYA 2K8VA 1M2BA 4PQHA 2N5AA 4Q5QA 3V1WA 2VL2A 4NXIA 1PKWA 4FO5A 5B6MA 4QQ7A 1O6JA 4V1Ap 5D9WA 4BPYA 4HZ4A 1QXHA 1ERTA 4HJ2A 2PUKC 5D93A 5DCGA 3ZREA 2CAQA 2CV4A 2F3MA 2DJ3A 3FRCA 2HFDA 1AW9A 2TRCP 1BJXA 1MD3A 3IBHA 2WGRA 3MDKA 2DJ2A 5FWGA 4IP1A 1BG5A 3QFAC 4XIHA 2E2MA 5JCUA 5CRGA 1I5GA 4TR1B 2HLSA 1AQXA 4PURA 4AJ6A 2LNSA 5G5FA 4V2LA 3IK9A 4IHUA 1IYIA 4MJBA 1V58A 4HZ2A 1LJRA 4YAVA 6GSUA 5A4VA 1KBNA 5ECIB 4WR5A 2MMOA 1FB0A 2MMZA 2PU9C 2VO4A 4K1FA 2GS3A 2LSTA 3IHQA 1XVWA 1GUKA 2HZFA 3EWLA 4GCIA 1O8WA 4ZB9A 1YEPA 1DE1A 5AIVA 3CSHA 2FNOA 1A23A 2DBCA 2DJ1A 1K0OA 20GSA 1TP9A 4NHWA 2H66A 3ZZXA 2DJ0A 1GSQA 1U88A 3FZAA 5DQYA 1T4ZA 2VL3A 3MSZA 5HR1A 3HKRA 2YWNA 5ECMB 5B7CA 3CRUA 4L8EA 3VURA 2LUSA 1R7HA 1OC3A 1ZYEA 1DSBA 1S3DA 3QDNA 3WGEA 2I81A 3QCPA 2K9FA 2YOIA 2CX3A 5ECLB 1T1VA 2CX4A 4KCEA 2L4CA 4MPFA 2HNLA 5G30A 3GKKA 2A2RA 4MLYA 3KEBA 1MDJA 2I4AA 2I9HA 2IMFA 5GAND 1F3AA 1XZOA 2GSSA 4D73A 3F4SA 4I97A 2H6ZA 1F2EA 3C8EA 2LQOA 5G31A 2L6CA 4KDXA 3F63A 4MMMA 5HQPA 1DE2A 2HXKA 3J7Yb 4J57E 3HY2A 2CZ2A 4ZILA 1NW2A 1WPIA 1Z7PA 1S3AA 2O89A 3HJOA 3GIXA 3O76A 2H8LA 2NTOA 1FO5A 1HNAA 1GUHA 3RBTA 2FUG2 1A8LA 4MCUA 4MZWA 5EL8A 1A2JA 4PNGA 3UBKA 5CP1A 3E0UA 4GWRA 4FIWA 2LTKA 1JZDA 2AAWA 4MF7A 2KLXA 2FWEA 5FHIA 3VI5A 2IN3A 2F9SA 1XCCA 2GZPA 5IO2A 2YJ7A 4LMVA 1Q98A 1N8JA 4NV2A 1OYJA 4HI7A 4JBBA 4DEJA 4L0WA 3VK9A 2H76A 3GMFA 4BVYA 1SL2B 4F2IA 5G1KA 3EMPA 5DCHA 11GSA 1M0UA 2GLRA 4MZBA 3VI7A 5DQSA 2HYXA 4IELA 3CBUA 2XBQA 1YY7A 4ZL8A 4WR4A 2DSAA 2WCIA 2WDUA 4POKA 8GSSA 4TVEA 5DALA 3BOAA 2LEGA 3DGQA 1HNBA 1OKTA 2X8CA 1GP1A 3VPQA 3F3QA 5J9BA 3H93A 3TKSC 1FOVA 5JWQB 3EYTA 2JZTA 4POBA 3ZL5A 4K7OA 19GSA 1Q4JA 3IOSA 2ON5A 3ME7A 4N0ZA 3TDGA 3D5JA 4OWYA 1PN9A 2GZZA 3TOTA 2L6DA 4J56E 3L0HA 4PQIA 1TTZA 2V41A 4MJEA 1TRWA 5D96A 4EVMA 4YQMA 1XIYA 3IC4A 3ERGA 2YWMA 2OE1A 2RLIA 3E9JB 1NSWA 3E3EA 3TKPA 3EC3A 3GNJA 1XWKA 4OD7A 2C0GA 2IMEA 4L0UA 2OE3A 3UL3A 2AYTA 4HJMA 1OKDA 5H5RA 5J3RA 1X5DA 2FD3A 4OFMA 3ZMLA 3D6IA 2OACA 1Z6NA 3TKSA 2E7PA 4MP4A 3GYKA 2JSYA 1YKCA 2QC7A 3G7YA 2J23A 1RW1A 1SENA 3FZ4A 3VPTA 4KSMA 10GSA 2H30A 3LQ7A 2VM2A 3EU3A 5DDLA 2M72A 1O73A 3IDVA 2LJKA 1ZCPA 4TOPA 3UJ1A 2H1BA 1Z3EA 3GFKA 3RPNA 1V2AA 1ERWA 1TK5B 2ES7A 3GUSA 2YPMA 3M3MA 1M2DA 2JZRA 4CHSA 1BEDA 3TKRA 3ED3A 3ZVJA 2KOKA 5CRHA 3F4RA 1AQWA 2MZCA 3ERFA 5EPFA 1SJIA 1PD21 1G7OA 2GSTA 4KE3A 1ZGNA 3TJJA 4FYCA 1TRSA 3HVVA 4H86A 5D73A 5IQYA 1T3BA 3NOFA 1J08A 5H5SA 2JZSA 1JHBA 3M0FA 3QPMA 2RUFA 5H5QA 3APQA 1SD9A 2XBIA 3R2QA 2GSQA 5A4WA 1M9BA 2CVBA 1PKZA 1YZXA 4KNDA 4WEYA 3LSZA 2OKAA 1B4PA 3ZFLA 1Z7RA 6GSTA 1X0RA 4F82A 2C3TA 2OBIA 3L9UA 4LLRA 4BA7A 2LV3A 2ZUPA 2VD0A 1OAZA 5EVOA 1HQOA 1ZZYA 4EKZA 4XS4B 2C3QA 4DSRA 1KEBA 1QQ2A 3BJ5A 2TIRA 4WKWA 1OC9A 3CMIA 4GQCA 1W89A 2AUVA 2NVLA 3GA4A 2GVPA 4FYUA 1GRXA 2LQQA 4IVFA 4ML1A 1M99A 1JLVA 3BD2A 3KTBA 3W8SA 2B6MA 4MABA 2GT5A 3VWXA 4ZB6A 1VF4A 1VRSD 3GSTA 2G0FA 1AIUA 2G2QA 2H1AA 1XOBA 3L78A 1MD4A 2LS5A 4LA1A 4TKYA 1TOFA 4WF5A 3KMNA 2PPTA 3TOUA 1KNGA 4QL7A 4V2NA 5F05A 3Q74A 1EV4A 4G19A 2RIIA 3LXZA 3FK8A 1SJ6A 2VUPA 3QAGA 1GSYA 1SYRA 1JZWA 2RM5A 1ABAA 1R5PA 2H0GA 2PMTA 1X9MB 4N30A 4WBJA 4GRFA 4J2FA 2I3YA 1T4YA 2FA8A 2HZEB 1TI1A 1ZYQB 4OMVA 2GQKA 3DEXA 1YJ6A 4EDYA 3CXGA 4PUAA 2N5FA 2P31A 2I1UA 1GLPA 3Q19A 4ZB8A 2YANA 1FG4A 1TU7A 2P5QA 4EXJA 4EO3A 4AGSA 4OFTA 2XC2A 4D73B 3KJYA 5IMDA 2V6OA 5KN1A 2GSRA 1MDIA 4X43A 4GSTA 5CRDA 5IIZA 4ZBBA 2QKEA 2WFCA 4NAXA 4IJIA 4L5OA 1EGRA 3UEMA 3LGCA 2YJHA 4HUAA 6GSSA 2OE0A 2H72A 5JWRB 2YV9A 2YWIA 4RQRA 4RI7A 3KP8A 3CRTA 2FGXA 1I9DA 2O8VB 3IPZA 3GKXA 2DIYA 4KB3A 4MA9A 3VWUA 2HRFA 4F03A 4DSSA 3BCKA 1NM3A 5LD0A 1THXA 2B5EA 4K9ZA 5B8BA 4DSQA 1EGOA 1TJDA 5CYYA 3ZIJA 1A0FA 4JU5A 4HU7A 2WJUA 5A4UA 3A5WA 4YAPA 13GSA 2IIYA 5GZZB 1ML6A 2FWFA 3BCIA 1B48A 1PX7A 2PVOC 4PGTA 2V1MA 1MTCA 1WP0A 2L5LA 1B9YC 4XHMA 4MF5A 5DALB 4TN8A 3FR9A 3UVTA 4MH2A 3LJRA 3LFLA 1YEXA 3VWWA 2YWOA 3FZ5A 1K0BA 1G7EA 2JSZA 3RDWA 1U6TA 3HYPA 2H0IA 4X1UA 3F6DA 3A2XA 1FB6A 3DVXA 4ZL9A 1SL0B 1Z5YE 1NHOA 3S9FA 3DD3A 2WRTA 1K0CA 3U5RE 1A2LA 4OFNA 4QL9A 2CT6A 1E6BA 4IGJA 2GQMA 3UIWA 2XHFA 1EEJA 1N2AA 1UC7A 1QUWA 3KMOA 3TJBA 3I43A 5IPHA 1SK0A 3CSIA 4E8HA 3GURA 1X9SB 1BQ7A 2F8FA 1OC8A 1TW9A 1OE8A 2F51A 3IA1A 3HCZA 5ENUA 3AY8A 4FH8A 1GSEA 3LG6A 1SK1A 2R4VA 5HFKA 3C1RA 1RQMA 1DBYA 1XWBA 1QK8A 1XWCA 4K7NA 2MMNA 2HI7A 5GSTA 22GSA 2H0HA 1SYXA 5ID2B 2PVQA 4HEA2 4NHZA 4F0CA 4POLA 2H71A 4EE0A 5DAKA 1K0AA 5CREA 1X5CA 2QGVA 2YZHA 1EP8A 2M46A 4YQUA 3GH9A 2IFQA 2LNTA 2V6KA 3PINA 2P5RA 5IOXA 3DVWA 5IMFA 2JL4A 3HHVA 4LL4B 3G7IA 5G2ZA 1USBA 2IMDA 3KTLA 3TKQA 1OVNA 3EVIA 2C0FA 4YH2A 2L4QA 1PRXA 5J9CA 5IMCA 1TDIA 1SJZA 4OO4A 1TU8A 4IQ1A 3UOMA 1PA3A 1YF0A 3VWVA 4AJ8A 1S3CA 2VCTA 4DVCA 4IN0A 2V2GA 1WJKA 4RQXA 5COHA 1F37A 5ECOB 3ZTLA 3HA9A 5F06A 17GSA 3MNGA 4ZL7A 3TJGA 2GT6A 2NPBA 5AN1A 2JU5A 1GULA 2GDRA 5IO0A 3WT1A 5FT3A 3UAPA 1GLQA 4EF0A 4MJCA 4O32A 3TCOA 3SWLA 3PGTA 4KCAA 3A3TA 4NPBA 5INYA 3WGXA 2L57A 2LJRA 4WETA 4I6XA 4KDUA 4PNFA 2R6KA 4GQFA 2DLXA 2GGTA 1Z6MA 2EIOA 5GSSA 2R2JA 2IPAA 5KN2A 5D9VA 3IAM2 3J7Yk 1X9WB 5G5EA 4IJ3A 4Q5RA 3UMAA 5HFIA 3M9JA 3EMXA 3F4TA 3HVSA 2FWHA 1V98A 2DJJA 1OC9B 1ACVA 1H4OA 4I2UA 2DC5A 3ZFBA 3WD6A 3ZITA 4NWYA 4BVXA 4ISDA 1ILOA 1SKRB 2CVKA 2FCHA 2H6YA 1GH2A 2H19A 2H01A 4CW9A 1AXDA 2VCQA 4WXTA 4ECCA 2IMKA 1V9WA 1VGLA 3EE2A 4IS0A 2PWJA 3KZQA 3HZ8A 1G6WA 1GWCA 3FW2A 2E0QA 4PQ1A 4XTSA 3GX8A 3IRAA 4JR6A 3GX0A 2J9HA 1PL2A 4OCEA 4TXOA 3RPPA 3CTGA 3RHBA 5CRWA 3BBYA 3IAS2 2TRXA 1M2AA 3L9VA 1EP7A 1GTBA 1YKAA 5F8BA 2ZNMA 9GSSA 3U6VA 2MMAA 5CNWA 1TXXA 2VLUA 5F07A 3DKSA 4F0BA 2OBKA 3KH9A 2YZUA 4O92A 1K3OA 1URMA 2OADA 1FVJA 4ZBAA 4NMUA 4PX1A 1THOA 1WMJA 5ECHB 2IMIA 3GL5A 3L9SA 1CQGA 2LRCA 3EU4A 5DJLA 3QAVA 5KEJA 2VD1A 4O7HA 1YQ1A 2RM6A 2PERA 2A4VA 3GTUA 4ZBDA 4Q5FA 1AQVA 3LYPA 5IM9A 1Z9HA 1GTAA 3KIJA 1DUGA 2L59A 1TK8B 3PH9A 4MDCA 2E2GA 3EINA 3D21A 4TR0A 2WS2A 4MF6A 1GL8A 2AHEA 2R5GA 1AAZA 4BWQA 3F8UA 3H79A 3LEFA 4GSNA 1GNWA 3I9V2 3M9KA 3Q6OA 4OO5A 4GTUA 3HJPA 2KUCA 3F0IA 4IBPA 2VCWA 5J41A 1K0MA 2ALBA 3WGDA 1X5EA 14GSA 3IR4A 1XFLA 2B7KA 2BJXA 2C3NA 3LORA 3GV1A 2YNXA 4HOJA 4PXOA 4V2MA 2H75A 3CTFA 1UVZA 3RAZA 4EL1A 1K3LA 1W4VA 2NBSA 2F8AA 4DSSB 5CO3A 2M80A 3G7JA 1F9MA 2VLVA 4AF2A 1R5AA 5HFGA 3TJKA 4YQVA 1PGTA 2PBJA 3D4MA 4POMA 1GSDA 2EIRA 3A2WA 3LYKA 5ECQB 1BYEA 4IW9A 3C1SA 2LRNA 2JADA 3IXRA 3D0ZA 4IP6A 2CZ3A 4Z7XA 4MZCA 3K8NA 4FYBA 3EURA 2VOCA 6GSXA 3N9JA 3KGKA 1O8XA 2B7JA 3QOUA 2LJAA 2H74A 2P0GA 3TRPA 3GH6A 1O85A 1M7TA 5EY6A 4GLTA 3UBLA 2KHPA 2N5BA 6GSVA 3H8QA 3APOA 2QSIA 2FWGA 4O5RA 4F9ZA 3APSA 5KN3A 2JACA 1WIKA 3DWVA 3HXSA 3TKSE 3GSSA 1YDKA 1V57A 4LL1B 2DMMA 5F0GA 4L5LA 1K0NA 2R3XA 2H73A 3TGZA 3MWHA 1SKWB 4HU9A 4K0NA 3ZYWA 1SD8A 3KM6A 3F9UA 4ML6A 5CAXA 2L5OA 5AISA 4E8EA 3HZ4A 4XS4A 1HYUA 4NV5A 1VF1A 3TRQA 4EDZA 3O6TA 1U87A 2VAFA 4PUFC 1EEMA 4XCSA 5ECPB 3WYWA 3UVHA 2KP2A 1ON4A 2XPEA 1QMVA 2VCXA 1PQNA 5C00A 1F6MC 2AV4A 4K6XA 2CQ9A 3M8NA 4TRXA 4GF0A 3VFIA 5DAKB 4XRDA 1PX6A 5ELGA 2NDOA 3MAKA 3FEUA 5LNKe 5B8AA 1LU4A 1EOHA 1OE7A 2Z9SA 2C8UA 2FA4A 2EC4A 4MPGA 4KA0A 2IFQB 2YV7A 3D22A 1YF1A 1E2YA 3M1GA 1JZRA 3ZRDA 4G2EA 1XXUA 4EUYA 3FY7A 1SL1B 1HNCA 1G6YA 2PGTA 3D4TA 5A5KA 3QAWA 1CQHA 2CVDA 2FY6A 5L71A 6GSWA 3DXBA 1GTUA 3IK7A 1TK0B 1KTEA 2HZEA 4WF4A 1AUCA 5C04A 4GXZA 2D2ZA 5LCZA 1T7PB 2C80A 4N11A 5E59A 1XW5A 4IKHA 3ISOA 4N0VA 18GSA 1K3YA 1VF3A 2BTOT 2HT9A 3SBCA 3C71A 4K8MA 3KXOA 1XW6A 1RK4A 4RUVA 1MDKA 4MK3A 4EC0A 1EZKA 1SK2A 1A8YA 2WULA 2B5YA 5ECNB 3H4KA 4XRAA 2CA8A 5B6NA 2BMXA 1J9BA 3TB2A 1TRUA 3FZ9A 1V40A 2PN8A 5DJMA 1U3AA 3G9BA 2C0EA 1B8XA 4TR1A 1XBSA 2V32A 1TI3A 5DVBA 4BL7A 3GN3A 4HQSA 5IMAA 1C72A 2H70A 1J0FA 1EV9A 5JCGA 2VLTA 2LKUA 3DMLA 1PMTA 1B4QA 1JLWA 5HR2A 2EIQA 2H1DA 3HJMA 5GAPD 1FW1A 2R37A 1O7UA 4P3YB 2ON7A 3P90A 5IPGA 1VF2A 5HR0A 1G0TA 2IWTA 4GSSA 2X64A 3CSJA 2OJLA 4ZIJA 5IMZA 4KSOA 2IL3A 4TXOB 2VL9A 2X8HA 4JE1A 3TJFA 3Q18A 2CAIA 1SU9A 1NHYA 1ZOFA 1FVKA 3RHCA 2MYGA 2H6XA 2C1YA 2VIMA 5ABRA 3N5OA 3ZMKA 2K6VA 3KH7A 4WBRD 1EOGA 1ZL9A 1JZOA 7GSSA 3VLNA 2X8GA 3ME8A 1K0DA 5IOWA 5IMVA 1Y25A 1ST9A 4HQZA 4HDEA 1TKDB 1H75A 4I2TA 3DYRA 1WWJA 3GTUB 1XWGA 4KAEA 4LMWA 3HD5A 1GSFA 1IYHA 5ELAA 3ERWA 4ULXA 2IJYA 4K7IA 2WZ9A 1PL1A 3O3TA 4JZQA 3LWAA 4KGIA 4TW5A 1GNEA 4TR4A 3W8JA 4X0XA 5DBQA 3NIVA 1GUMA 1ZMAA 4ACSA 2HRNA 5ECRB 3A2VA 2HSHA 3TUEA 4KDYA 1XWAA 4KW6A 2XPDA 5ID2A 2K18A 2O87A 4RI6A 2GQLA 5G1LA 4V1Ag 4JRRA 5J5NA 1T8EB 2YCDA 4ZXGA 3PR8A 1R4WA 4Q5NA 2K8SA 1QFNA 3F6FA 4N10A 3UARA 3IV4A 3NZNA 4TR3A 3ZVJD 3I6AA 1R26A 5D8IA 2YN1A 3GKMA 4KX4A 1T00A 1XVQA 1Y6EA 5D9TA 4MH3A 2AB6A 3WT2A 4XS6A 3JCML 4KUNA 1FAAA 3KP9A 4JR4A 1MEKA 4ECIA 2FLSA 5D9XA 4XS1A 2HSYA 5JWOB 2VCVA 2MBTA 4K2DA 3FR3A 4TXVA 1M9AA 4IQAA 4BWSA 2RUEA 3ZIVA 3FR6A 3F3RA 1WE0A 2HE3A 1SKSB 1BAYA 3TRXA 3GKNA 3P7XA 1WOUA 1GSSA 3C73A 1ERUA 1GSUA 3QD9A 1ERVA 2LRTA 3FYGA 1EWXA 2C0DA 3L4NA 3QFBC 2VCZA 2VM1A 1LBKA 1B9XC 2FHEA 2YP6A 5JCWA 4G9HA 3GL3A 4ILFA 2DIZA 1HD2A 4I8BA 4MJAA 2H1GA 5E4WA 3DIEA 3I69A 1U3IA 2DMLA 2ZCTA 2B1LA 5HR3A 2C4JA 1AC1A 3KD0A 3LXTA 4K0GA 1PSQA 2KP1A 16GSA 2DJKA 1F3BA 3OR5A 2WB9A 3FKFA 1UA5A 3ZLPA 4KH7A 2O85A 12GSA 1TRVA 3QMXA 3KCMA 1O81A 2OA7A 1A24A 4ECBA 3DRNA 5KN0A 3HVXA 1JFUA 3P8WA 2VL2C 4CDOA 3H1NA 4ECJA 2B5XA 1GTIA 3W6GA 5ECSA 3IE3A 4ID0A 1XOAA 3C7MA 3CYNA 3US3A 5AIXA 2B1KA 1A2MA 2GTUA 1XPVA 1XW9A 5J4UA 1QGVA 2REMA 4G10A 5ECKB 4HS1A 3GHAA 2B3SA 2AJQB 2X99A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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