2FWFA

High resolution crystal structure of the c-terminal domain of the electron transfer catalyst dsbd (reduced form)
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
123
structure length
123
Chain Sequence
HLNFTQIKTVDELNQALVEAKGKPVMLDLYADWCVACKEFEKYTFSDPQVQKALADTVLLQANVTANDAQDVALLKHLNVLGLPTILFFDGQGQEHPQARVTGFMDAETFSAHLRDRQPHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein dsbD
publication title High-resolution structures of Escherichia coli cDsbD in different redox states: A combined crystallographic, biochemical and computational study
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Oxidoreductase
total genus 45
structure length 123
sequence length 123
ec nomenclature ec 1.8.1.8: Protein-disulfide reductase.
pdb deposition date 2006-02-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13899 Thioredoxin_7 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2fwfA00
4AF2A 2IMIA 1XFLA 1HYUA 2E2MA 4J56E 5B8AA 1S3AA 3GURA 1GLQA 2LRTA 1T4ZA 4OFTA 3P2AA 3DGQA 3LORA 2YWIA 4EVMA 5C04A 2OA7A 4GQFA 3QDNA 5D9WA 1F9MA 4XTSA 4GSSA 1TKDB 3HVSA 3HVXA 2DC5A 3F0IA 1EV4A 4L5OA 3MSZA 2A4VA 5CREA 3HJMA 2J23A 2HRFA 4EC0A 4DSQA 2L6DA 1Y25A 4F03A 1TK0B 2XHFA 1DSBA 1GSQA 5D9TA 4MF5A 1J08A 1XW9A 2N5BA 2X64A 3KMNA 5FHIA 3FRCA 1B4PA 2CQ9A 3TB2A 3J7Yk 1MD3A 2H73A 1UN2A 4WXTA 2L5LA 3A5WA 3C1RA 4HDEA 1ERWA 5G5FA 1A23A 3FKFA 2YANA 3QR6A 3QFBC 2YZHA 2C4JA 3DVXA 4YQMA 2CZ3A 3GTUA 2H71A 4TR1A 3KH7A 1GH2A 1TRSA 1O7UA 2L4QA 1SL2B 1M2DA 3GKMA 1GULA 3GKNA 4F9ZA 4IS0A 3IK9A 1JZWA 3W8JA 2ZNMA 2WZ9A 2EIRA 3DYRA 8GSSA 2FWGA 3KEBA 2H70A 4I97A 5KEJA 4IJIA 5A4WA 3ME7A 2OACA 5INYA 4IP6A 1GSFA 5DAKB 4MZCA 2OE1A 1G7EA 1GTBA 3CSIA 3EU4A 2DJ3A 3KMOA 2C3TA 3KIJA 1GSYA 2X8GA 5IOXA 1ZOFA 3GX0A 3TRQA 4MABA 1XWBA 4L0UA 5ECIB 2TIRA 3GKKA 4K6XA 7GSSA 2B3SA 2PU9C 4RI6A 2P5RA 3GSTA 2LQQA 1TP9A 2VD1A 3RAZA 5DALB 1FB6A 2KUCA 2HI7A 3BBYA 4ECCA 4YAVA 5L71A 1GTAA 5E59A 3GUSA 2DMMA 2H1GA 5J4UA 3QAWA 1ZZYA 3F8UA 4MJEA 3IXRA 1M7TA 4HS1A 2VIMA 4MJBA 1XBSA 4MPFA 1I9DA 3KP8A 4RQRA 4WF4A 2DIYA 5ECQB 2F9SA 4E8EA 4NWYA 1DUGA 2VCQA 2GSSA 2E0QA 4ECBA 3O3TA 2HRNA 2TRXA 3C1SA 1XVWA 2B5YA 4KW6A 4BWQA 2DJ0A 3APOA 2C3NA 1MDJA 4KGIA 1K0MA 1TU7A 4EDYA 1R5AA 3WGDA 3L4NA 4NAXA 1XW5A 1WE0A 2R4VA 4V1Ap 1Z9HA 2H01A 3PR8A 3M9KA 4ZL7A 2JZSA 2YJ7A 1OE7A 2WS2A 1OC9B 2H0IA 3ZZXA 5IPHA 16GSA 4WR4A 1FG4A 4NV5A 1YZXA 1A2JA 3QAVA 3HJOA 3HZ8A 2HZFA 5FT3A 3GH9A 1FHEA 2FD3A 3GL5A 1EGOA 4K1FA 1TRUA 2VD0A 1S3DA 1FB0A 5EL8A 4GLTA 1U88A 3U6VA 2PPTA 1SK0A 4KUNA 2K9FA 2R37A 3L78A 1X9SB 1R5PA 1F3BA 2B7KA 1E6BA 3ME8A 4GCIA 3IOSA 1ZCPA 1NM3A 2VCWA 4V1Ag 1PGTA 1SKSB 2DJ1A 1M0UA 3Q19A 4EKZA 5FWGA 3LFLA 4KSMA 1DBYA 4TR4A 5ECKB 2H76A 5A4UA 1SU9A 4F2IA 4YQVA 5KN2A 4HQZA 3VWXA 5F06A 4RQXA 4EF0A 5G1KA 1BJXA 2VM1A 5JCGA 2IN3A 1GUMA 1YF1A 2HNLA 2OADA 5DDLA 5G31A 2V6OA 2X99A 4EL1A 5ABRA 2WRTA 3EWLA 1GUKA 1M2BA 3QD9A 4IQAA 4XHMA 3UVHA 4MZWA 1O8WA 4JBBA 2DMLA 3D4MA 1FOVA 3IAM2 3RPPA 2RUFA 3TKRA 5AN1A 1G6YA 1G6WA 2RM6A 3D5JA 3F4SA 3BD2A 14GSA 1PL2A 3LSZA 4PUAA 4TOPA 1OC3A 1FO5A 3RDWA 2HE3A 1V9WA 1Z6MA 3KCMA 4MPGA 1M99A 4N11A 19GSA 1U3AA 2YJHA 1WMJA 5H5SA 3HA9A 4FIWA 3MDKA 4KDYA 2V32A 4XRDA 2C3QA 5KN0A 1Z3EA 5DAKA 5AGYA 3DXBA 4L8EA 2YZUA 4G2EA 2FY6A 2VO4A 1ZGNA 4JRRA 1AQVA 4NHWA 3TCOA 4N30A 3HXSA 1MDIA 1CQGA 1ZYQB 1Z6NA 5J9CA 3M0FA 2ZUPA 3CMIA 3P90A 2FNOA 1H75A 2L6CA 5IMAA 5HFIA 2C1YA 5DALA 2DBCA 3ZMKA 5IMVA 2H66A 1O81A 3EYTA 3P7XA 4H86A 2L5OA 4ZB9A 5IMFA 2MMAA 4I8BA 5J5NA 18GSA 4ML1A 4QL7A 4Q5RA 1AAZA 2R6KA 3TRPA 3VWWA 1XPVA 1HNAA 2JZRA 4K2DA 4MH3A 4POLA 1EWXA 4AJ7A 2H75A 4IGJA 4POMA 1PL1A 1GWCA 3HJPA 4K7NA 5JWOB 4FYCA 4KX4A 1OKTA 3O6TA 1YY7A 5DCGA 5GZZB 3GN3A 3S9FA 1NHOA 1GLPA 2MBTA 2GVPA 4ZB8A 1T7PB 4N10A 3E3EA 4TR3A 2JZTA 1KEBA 2G2QA 1BEDA 3G7JA 4GSNA 3VWVA 1TW9A 2YPMA 4KH7A 3ZFBA 1OC9A 1K3LA 1F2EA 2OKAA 4HUAA 6GSWA 3QMXA 3EURA 4OO4A 3W8SA 4Q5QA 2JSYA 1J0FA 4O92A 1AQWA 3EU3A 4KCAA 2PWJA 3TJBA 4KAEA 1TDIA 4EXJA 2PUKC 3AY8A 4NXIA 4X1UA 2GT6A 2YP6A 2FUG2 4IQ1A 2PVOC 2WCIA 4ZXGA 3VLNA 4HI7A 4JR6A 3GRXA 1T3BA 1TI1A 1USBA 1GTUA 2O85A 3UBLA 3LWAA 2RIIA 3BCIA 1BQ7A 2PBJA 1C72A 1X5EA 4K8MA 2O89A 1GRXA 3HY2A 3RHCA 2M72A 2LQOA 3QPMA 4F82A 1A24A 3MAKA 3DKSA 1ZMAA 3FY7A 2VOCA 5F0GA 1VRSD 5CRGA 3ZVJA 4ML6A 3D6IA 3UJ1A 5HR2A 2YN1A 3EMPA 3CTGA 11GSA 2VL9A 3LXZA 2J9HA 4AJ8A 3N9JA 2CAIA 2IWTA 2LNTA 3ED3A 1B48A 4DSRA 3GX8A 4TW5A 2XPDA 5GAND 20GSA 3UMAA 1PKWA 3UBKA 1TK5B 1YKAA 5DQYA 2FWHA 3N5OA 3F6DA 3TKQA 3GH6A 1U87A 2GQMA 1M9BA 3CBUA 2VAFA 5LNKe 1Q98A 3EC3A 4Q5FA 1A8YA 1NHYA 1T4YA 3OR5A 3ZL5A 2GSQA 1T8EB 4MF6A 1B8XA 1VF3A 1V2AA 4G19A 4ECIA 4TXVA 3QAGA 5JCWA 2MZCA 1GSDA 5B6NA 4QL9A 4IELA 5B7CA 5G30A 2F51A 4MA9A 4Q5NA 1SJIA 3F9UA 2IMEA 5G5EA 1HQOA 2PERA 17GSA 1O8XA 1SL0B 1GUHA 2XC2A 9GSSA 3KZQA 5HR1A 1DE2A 2MBSA 4CHSA 2FHEA 2N5FA 2L57A 3APQA 2A2SA 3HD5A 2FA8A 3IBHA 1WRYA 1OYJA 2R2JA 2YOIA 3KTBA 3E9JB 6GSTA 1FVKA 2YV7A 3L9VA 1EZKA 3EINA 1SD9A 4KCEA 1IYIA 1G0TA 2NVLA 1VF4A 1SYXA 2WDUA 2GQKA 1K0AA 5GSTA 3D4TA 5DQSA 2V41A 5AIXA 3BCKA 5D9VA 3GNJA 3VK9A 1BG5A 3WD6A 4MK3A 5IPGA 5ENUA 4I5QA 3IA1A 4KA0A 4LMWA 1X0RA 5F05A 4PNGA 2K8SA 4MCUA 4KDXA 4DSSB 2LUSA 3PINA 1ABAA 4OMVA 5AIVA 2L4CA 3LEFA 4IVFA 2H72A 3KD0A 6GSYA 1LBKA 4EE0A 2NDOA 2IFQB 1QFNA 1YJ6A 2XBIA 2V6KA 3LQ7A 5LD0A 1PX7A 3D21A 2E2GA 3FZ9A 5J3RA 4CDOA 3H4KA 2HYXA 4XS4A 1UVZA 2AB6A 3ZVJD 4TN8A 1TRWA 3I6AA 5G1LA 4ZL8A 1AIUA 3IC4A 3ERGA 4GF0A 4PQIA 2YNXA 3RHBA 1VF1A 2VL3A 3F3QA 1T1VA 2H0GA 1ERTA 5ECHB 5EY6A 1KNGA 3UAPA 3CSJA 3GHAA 1RQMA 1EP8A 4QQ7A 3HVVA 3M1GA 1FVJA 2HSYA 1XWAA 2OBKA 3D22A 5HFGA 5CO3A 4IN0A 3JCML 2F8FA 2O87A 6GSSA 5HR0A 1PKZA 10GSA 1JLWA 2LJKA 3DWVA 3ISOA 4V2LA 3FR3A 2B7JA 2I81A 1K0CA 1K3OA 5GSSA 4ZB6A 4EDZA 1TTZA 2VUPA 5F07A 4MZBA 1ZYEA 1GNWA 1PRXA 3Q6OA 3CRUA 2AYTA 2GT5A 3TJKA 2VLVA 3SWLA 3FZAA 1X9MB 4MJCA 4KB3A 1XWKA 3VURA 2DJKA 1THOA 1EEJA 2H0HA 2LJAA 2M46A 3FYGA 3IHQA 5DVBA 2I4AA 2LSTA 3HCZA 4IJ3A 5E4WA 2V2GA 3WYWA 1UC7A 2CX3A 2WFCA 1E2YA 1JZOA 1PD21 3CRTA 4ILFA 6GSUA 3F4RA 1T00A 1V40A 2PMTA 1EOHA 1A2MA 3MWHA 5IMDA 4XS1A 3VPQA 2C0FA 1QUWA 4POKA 5IO2A 4X43A 2JL4A 3GA4A 4J2FA 2VCXA 1YKCA 3APSA 2GZYA 3ERWA 3C71A 2B5XA 2RLIA 2IL3A 1V98A 3LG6A 5IIZA 5ELGA 4BVXA 3GYKA 1EV9A 3M9JA 4MJAA 4O7HA 3IV4A 3DRNA 3I9V2 1M9AA 1X5DA 4JR4A 3A2VA 2CZ2A 1X9WB 3G7YA 3H79A 3US3A 2LKUA 2R5GA 4F0BA 1QXHA 1JZRA 3ZYWA 4AGSA 1PMTA 4TXOB 5ELAA 2YWNA 3IRAA 4O32A 3C7MA 1DE1A 1JHBA 5ECNB 1RK4A 2O8VB 5IOWA 4PUFC 1HNBA 5ECMB 2GDRA 2IMKA 1OVNA 2HXKA 2F8AA 2AV4A 2PVQA 1S3CA 3ZITA 2I9HA 1GSEA 4IW9A 3O76A 3HZ4A 5D9XA 2GGTA 3TKPA 1SKRB 2KP1A 1VF2A 1A0RP 2D2ZA 3EMXA 4ZBAA 5JCUA 3H1NA 1MD4A 2ALBA 2VLTA 2WB9A 3ZREA 2L59A 1MEKA 3D0ZA 2P31A 2H1DA 5A4VA 1WPIA 3TRXA 3ZMLA 1HD2A 4DSSA 4I2UA 3UVTA 1N2AA 2IPAA 1R4WA 3VPTA 3LJRA 2CVBA 3VWUA 4BPYA 2IJYA 1FW1A 2AUVA 2GSTA 3EE2A 2IFQA 3IK7A 4GQCA 3DVWA 2OJLA 2HT9A 5COHA 1K0NA 3RBTA 2IMDA 4PXOA 2CVKA 4V2MA 4ISDA 3DIEA 5ECOB 3UOMA 4PNFA 1JZDA 1ACVA 3QCPA 5LCZA 5F8BA 4POBA 1W89A 1B9YC 5KN1A 4G10A 2AJQB 3ERFA 3V1WA 1SD8A 2LEGA 4K0NA 2CVDA 4TRXA 2TRCP 2WULA 1WJKA 4XCSA 3KH9A 1NSWA 2OE0A 3E0UA 2G0FA 4HZ4A 1K0OA 2X8CA 4OFMA 5H5RA 1NW2A 2HFDA 1J9BA 1XOBA 4FYBA 3CYNA 2LNSA 1VGLA 5G2ZA 4LLRA 1PX6A 3ZIJA 5IM9A 2HZEB 4HQSA 5D73A 5DJLA 3H93A 4BL7A 2ON5A 1Z7RA 1EGRA 2QKEA 3RPNA 3BJ5A 4WBRD 1CQHA 2B5EA 1QMVA 3FK8A 2EC4A 3CSHA 4L5LA 2WGRA 3VI7A 1F37A 4KE3A 4OWYA 2LS5A 3HKRA 3TJFA 3VI5A 3C73A 1SJZA 4MF7A 1XWCA 4Z7XA 1V58A 5IO0A 22GSA 3A2XA 1TXXA 3GL3A 2EIOA 2R3XA 4WKWA 4TKYA 3FW2A 5ECSA 2VL2C 4HJ2A 3QFAC 4MLYA 4BWSA 4BA7A 2HLSA 5CRWA 1B9XC 5GAPD 4FO5A 1O6JA 3TGZA 3NZNA 4OFNA 5HR3A 4YQUA 3F4TA 2VM2A 2FA4A 2A2RA 3IAS2 1WWJA 1BX9A 3UARA 4WR5A 2XBQA 3L9UA 2NTOA 3LGCA 3WT2A 1G7OA 2PN8A 2GZPA 4NPBA 3DEXA 3KXOA 4I6XA 3LXTA 1ERUA 4TR0A 2LRNA 3G9BA 2BMXA 1XW6A 5AISA 2OE3A 2I1UA 4PQHA 3LYKA 1A2LA 2NBSA 3UEMA 3IPZA 1W4VA 2H30A 3U5RE 2XPEA 3L9SA 1WOUA 4ECJA 2H6ZA 4FH8A 5JWRB 2I3YA 2K6VA 1B4QA 3ZFLA 3ZTLA 3TJJA 1M2AA 4TXOA 2HSHA 2CV4A 4IBPA 3DD3A 3NIVA 5CP1A 1BAYA 1XCCA 5EPFA 1V57A 1XXUA 4MH2A 1LU4A 1HNCA 1U6TA 3FR6A 1N8JA 4ID0A 4DVCA 4OO5A 1MTCA 2LRCA 1O73A 4L0WA 5ECRB 3IE3A 1KBNA 4GRFA 4ZBDA 1TJDA 3K8NA 1WIKA 3CTFA 2FLSA 4HJMA 1SKWB 4KNDA 1EOGA 2YV9A 5J9BA 4GXZA 1TI3A 5DBQA 1FAAA 5ID2B 2P5QA 2GTUA 4HEA2 4P3YB 4GTUA 3ZRDA 2WJUA 2KLXA 5IMCA 1TU8A 2DSAA 2FCHA 2QGVA 2IMFA 3TKSE 2C0GA 4NHZA 3KJYA 2O7KA 2KHPA 1PA3A 3IR4A 1K0BA 3L0HA 1LJRA 2AHEA 3CXGA 4WEYA 4MDCA 2FGXA 3TDGA 3QOUA 2PGTA 6GSVA 5HQPA 2JSZA 2CAQA 1O85A 3I69A 3LYPA 1YF0A 4O5RA 1YEPA 5CNWA 2YWMA 3GIXA 1JLVA 3TKSC 2ES7A 5CAXA 4XIHA 2EIQA 2VLUA 4PX1A 2C80A 4J57E 4LL4B 4N0VA 1IYHA 3C8EA 2AAWA 1XWGA 1RW1A 4LA1A 4E8HA 2HZEA 4ZBBA 3TOUA 12GSA 2VCVA 3A3TA 3FR9A 3GV1A 2H19A 2H74A 4LMVA 4BVYA 4D73B 2MMZA 1AUCA 4XS6A 2B1LA 2X8HA 3H8QA 3GKXA 2LJRA 4K7IA 4KSOA 1K3YA 1Z5YE 4IHUA 4WF5A 3PH9A 1BYEA 5D8IA 2V1MA 2H1AA 4JEDA 2C0DA 2M80A 1AQXA 2DJ2A 1TRVA 5B8BA 4MMMA 2Z9SA 2ZCTA 3ZIVA 5ECPB 1URMA 3J7Yb 2JACA 2CX4A 1F6MC 4ZL9A 2LTKA 3MNGA 2ON7A 1Q4JA 3KP9A 3FEUA 5EVOA 3ZLPA 2OBIA 4EUYA 4G9HA 5J41A 3GFKA 5DJMA 1AW9A 13GSA 1OC8A 2H6XA 1QGVA 1AC1A 2GSRA 1PQNA 2DJJA 4HU7A 2C0EA 1XVQA 2MMNA 1A8LA 2NPBA 5DCHA 6GSXA 5H5QA 3TJGA 4KDUA 2F3MA 1AXDA 2H6YA 1Y6EA 3KM6A 1R7HA 5D96A 1ML6A 3Q18A 4ACSA 4ZIJA 2CT6A 2VL2A 4FYUA 4GWRA 4DEJA 2IIYA 3UL3A 1SENA 3FZ4A 4EO3A 2N5AA 3KTLA 1X5CA 3WGXA 3EVIA 4RI7A 4XRAA 3Q74A 2QC7A 1KTEA 2GLRA 1Z7PA 3F3RA 3GTUB 2JADA 2MYGA 4TR1B 1GTIA 3F6FA 4K0GA 4K7OA 4V2NA 4HOJA 1U3IA 4LL1B 2QSIA 4PGTA 1SK1A 5IQYA 2BJXA 4JZQA 4I2TA 2P0GA 5B6MA 4ZILA 4RUVA 4HU9A 2MMOA 1SJ6A 1THXA 4OD7A 5ECLB 2FWEA 2RUEA 4ULXA 3FZ5A 1ERVA 1H4OA 1MDKA 4NV2A 2YCDA 1EEMA 1F3AA 2GQLA 5CYYA 1I5GA 4JE1A 2B1KA 5ID2A 4OCFA 3GMFA 1QQ2A 2JU5A 1TOFA 3F63A 4MP4A 2C8UA 2YWOA 4N0ZA 4F0CA 4NMUA 3TUEA 3M8NA 5HFKA 1EP7A 5A5KA 3A2WA 3P8WA 3GSSA 1WP0A 1XOAA 2K8VA 5D93A 1GL8A 4YH2A 1SL1B 2GZZA 4CW9A 3G7IA 3VFIA 2RM5A 4HZ2A 2DIZA 2H8LA 1GNEA 3I43A 2FWFA 3HDCA 3BOAA 3TOTA 4IP1A 1GSUA 2LV3A 3DMLA 1SYRA 2CA8A 1YQ1A 3IDVA 1YEXA 2VCZA 4YAPA 2BTOT 4WBJA 2KOKA 1ST9A 3UIWA 1ILOA 5KN3A 5C00A 4AJ6A 2KP2A 2H1BA 5CRHA 3HHVA 1OKDA 4K9ZA 5CRDA 4PQ1A 2E7PA 4XS4B 1GP1A 4D73A 1TK8B 2B6MA 1SK2A 5IMZA 1JFUA 1R26A 3KGKA 1PN9A 2K18A 1GSSA 3SBCA 1YDKA 1OAZA 1K0DA 2DLXA 1PSQA 4TVEA 3M3MA 3PGTA 4WETA 1UA5A 1A0FA 3TKSA 2VCTA 4GSTA 3WGEA 1ZL9A 3NOFA 4IKHA 3W6GA 1XZOA 2REMA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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