5HR2A

Crystal structure of thioredoxin l94a mutant
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGAASKGQLKEFLDANL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
publication title Structural variability of E. coli thioredoxin captured in the crystal structures of single-point mutants.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
total genus 30
structure length 107
sequence length 107
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-01-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5hr2A00
3ZYWA 1A23A 2K18A 3TJGA 1WIKA 1O8XA 4E8EA 2YPMA 3VK9A 2GDRA 3EMPA 1ZYQB 1VRSD 4AJ8A 3GSTA 5ID2B 5HQPA 3WD6A 1PD21 2P31A 4PX1A 3GURA 5G31A 3IR4A 3F0IA 4ILFA 5ELGA 5H5QA 4TR4A 4RUVA 3ZTLA 2H30A 1GUHA 4KSOA 3U5RE 4O5RA 1ML6A 4F0BA 3BCKA 2IPAA 1K0AA 1T00A 5KN1A 4KA0A 2FCHA 3VURA 1TRWA 1WE0A 2X8CA 4LMVA 4NV2A 4BL7A 1FB0A 4HU9A 3CSJA 1M2AA 2C0EA 1WP0A 5CRDA 4EUYA 1Q4JA 4WR4A 3VWUA 5A4UA 2HE3A 2M80A 3HVXA 1GWCA 2GGTA 3WYWA 1UN2A 5CP1A 1UVZA 4V2MA 1AUCA 1WPIA 1JZDA 1OKDA 5D9TA 3C7MA 2KP1A 1FOVA 1ERWA 4G9HA 2YN1A 3D5JA 3UJ1A 1TDIA 2YWNA 4TR0A 2AUVA 5JWQB 3VI5A 4X1UA 1GNWA 3IHQA 5KEJA 1B9XC 5D8IA 4ACSA 4FYUA 1MTCA 3GX8A 1U3AA 2VUPA 1SK2A 1GRXA 4XHMA 3O76A 2MBSA 1J0FA 2A2SA 1A0FA 1THOA 1BG5A 1XFLA 2FUG2 4HU7A 1EOGA 1GSYA 3P8WA 1R7HA 1XW5A 3E9JB 3TCOA 2YANA 1U88A 2JZSA 7GSSA 2IFQB 3PINA 4POMA 4MLYA 1AQVA 4LL4B 4KW6A 2R4VA 4ECJA 3UVHA 4LLRA 1TK0B 2O87A 3HJMA 1GL8A 1SL0B 1XOBA 1USBA 2PN8A 3CBUA 4MPFA 1GSFA 2C3QA 4NMUA 2KUCA 16GSA 3FKFA 1EGRA 3VPTA 1TI3A 1SD9A 1K0OA 1A8LA 4ZXGA 2ON7A 1V40A 1OC9A 5J9BA 4HEA2 2GSRA 3I69A 2AJQB 2H73A 4XS6A 1GLQA 3HJOA 4TOPA 4AJ7A 4V2LA 1BEDA 4OFNA 5CAXA 2DLXA 3D22A 4X43A 2D2ZA 1O85A 3CTFA 2H74A 2VD0A 2FY6A 3GKXA 4H86A 11GSA 3GYKA 3HVSA 5HR1A 2DC5A 4DVCA 1E2YA 5IOXA 3VWVA 1GLPA 4XIHA 1ACVA 3GKKA 4MH3A 3HVVA 1PKZA 4I2UA 5JCGA 4K0GA 5DJMA 1VF3A 3M1GA 2WFCA 3QPMA 2GLRA 3GH6A 2LJAA 2VM2A 2FWHA 4Q5RA 3RBTA 5DVBA 2CX3A 6GSTA 4Q5QA 3LGCA 4I6XA 3ZL5A 2EIQA 4HS1A 1XW6A 4IJ3A 3GV1A 4KGIA 1URMA 1MDKA 2O8VB 1GTAA 4YAVA 3F8UA 1F3BA 2PVOC 2F8AA 3G9BA 5EPFA 3FY7A 4JZQA 3P90A 2P0GA 2QKEA 5A4VA 1A2JA 4IBPA 1M9AA 4JBBA 1AAZA 3A2WA 5JCWA 3EURA 2WRTA 1AQWA 2N5BA 1CQHA 2C3NA 1G6WA 3SBCA 2DIYA 3ZMKA 9GSSA 4G19A 2DJJA 1TU7A 4PUAA 2LKUA 5EVOA 4EO3A 1IYHA 2GQKA 2L5LA 1T1VA 2A2RA 3LYPA 3K8NA 3ZVJD 2J9HA 2ALBA 1VF1A 3G7JA 2G0FA 1M2BA 4ZL8A 3MDKA 2MMOA 2TRXA 4IELA 4OD7A 3H79A 4IN0A 3O6TA 4RQRA 3TDGA 4PNFA 4HZ2A 2I81A 1MD4A 5IMDA 3IOSA 5F05A 4FYBA 1X0RA 1A8YA 4POBA 4GCIA 3VPQA 2H70A 5CO3A 2L4CA 5E4WA 2BJXA 3C1RA 1XXUA 3ZFLA 2FWGA 2VL2C 5AN1A 1OYJA 5C00A 3TKSE 3GMFA 3ZZXA 5DQYA 2YZUA 4WBJA 1V98A 1F9MA 4MA9A 1G7OA 4MABA 2FWEA 2XBIA 3BD2A 4HJ2A 1CQGA 3S9FA 2WZ9A 3APSA 2A4VA 3I43A 2V41A 1ZMAA 3MAKA 3R2QA 3CSHA 2XPDA 2OACA 2H8LA 5FT3A 4K7OA 3V1WA 1HYUA 4MJEA 5GSSA 1YKCA 5IMZA 2C4JA 2X8GA 3CRUA 19GSA 4IHUA 1GP1A 1GSUA 2AAWA 2KLXA 3HA9A 4KE3A 1OC3A 1Z5YE 4ZBDA 2KP2A 1SYXA 1PL1A 4F9ZA 4WF4A 3NZNA 5J4UA 2RUFA 1YDKA 3WT1A 1M0UA 5J3RA 1WJKA 3KEBA 1OE8A 3GTUA 2JU5A 5INYA 5ECIB 1MDJA 1FB6A 4PQHA 3TUEA 4TR3A 2H75A 4K7NA 1EP8A 5ECMB 1Z6NA 2H1GA 1PX6A 3EVIA 3LEFA 1WMJA 4HQSA 5IMCA 2LRCA 1ZCPA 3KD0A 3WGEA 3QD9A 4WR5A 4HDEA 2QGVA 5H5SA 2FD3A 4MPGA 5FWGA 4N0ZA 3TJJA 1YQ1A 3FEUA 1T8EB 1F6MC 4EC0A 2HSHA 1DBYA 4L5OA 4V2NA 3QAVA 1K0NA 2R6KA 3HDCA 1B8XA 4EXJA 17GSA 1TKDB 1XZOA 3L4NA 1B9YC 2VLTA 2JZTA 3N9JA 4XS4B 2LQQA 3F4RA 5D96A 2YWMA 4KDUA 1E6BA 13GSA 1EP7A 4TKYA 3ZMLA 3D6IA 5B6NA 5J5NA 1XWCA 4PGTA 2HRNA 4D73A 2WDUA 1RW1A 2DJ1A 2F51A 3WGDA 2LSTA 1MEKA 3GNJA 5DCHA 3UL3A 3EU3A 1FAAA 1VGLA 2CZ2A 1U87A 4TR1B 4K9ZA 3PH9A 2KOKA 2V6KA 5A4WA 1K3LA 2DBCA 2CVKA 4JRRA 3TJFA 3UVTA 3UOMA 1I5GA 1BX9A 2AYTA 2L59A 4V1Ag 1OKTA 2IMFA 2LRNA 1THXA 2GS3A 1DUGA 2PPTA 4IKHA 4ECIA 1ZL9A 3TRQA 2AV4A 2FNOA 4NV5A 1N2AA 3TOTA 1AW9A 1K0MA 1T3BA 4TR1A 1QMVA 3F3RA 3CRTA 5G1KA 4MCUA 2WCIA 4PUFC 5D9VA 4EVMA 2OBIA 1A2LA 3KM6A 1EZKA 2CVBA 4BWSA 5F8BA 1TW9A 1KEBA 2DMLA 4ML1A 3BJ5A 4N30A 3E3EA 2C0FA 4FIWA 1EWXA 2PMTA 2X8HA 4GTUA 5CYYA 4OCEA 3M9JA 2GT6A 4GF0A 3MSZA 1DE1A 4PURA 5IOWA 2IN3A 1KNGA 5DALA 2CV4A 2H1BA 1JZWA 2N5AA 5B8BA 4XRDA 3ZIVA 4MZWA 1AIUA 2VL3A 1HNAA 3NOFA 1KBNA 4WBRD 2PBJA 2N5FA 3TKQA 3LFLA 3UEMA 1M2DA 4AF2A 4PQIA 5A5KA 12GSA 5C04A 3H1NA 4LL1B 5CREA 2VCQA 3DD3A 8GSSA 2IMDA 3TB2A 4YQMA 2I3YA 4P3YB 2WJUA 1A24A 3F6FA 3F3QA 3WT2A 1AQXA 3CSIA 2VCZA 4BPYA 4AJ6A 4MF5A 2CX4A 1UC7A 3FHKA 1R26A 4NHWA 1PQNA 2H66A 3OR5A 3IPZA 5ENUA 2X64A 2H6XA 2P5RA 3J7Yb 2OE0A 2HRFA 2MMNA 3D21A 2GSQA 2M46A 1ERTA 1YJ6A 3KH7A 3C73A 2IMIA 2FHEA 3IXRA 4F03A 2DJ0A 2YCDA 4K0NA 4YAPA 4MF6A 1W89A 2B1LA 5ELAA 1G6YA 3IRAA 4N11A 1XOAA 3LORA 3C8EA 3QFBC 3DYRA 3HHVA 2LNTA 3LJRA 4AGSA 1VF4A 1NHYA 2K6VA 1EV9A 3M9KA 2LRTA 3FZ9A 3TKSA 3APOA 1MD3A 4PNGA 3UBLA 1SL2B 4ZILA 3NIVA 3KP8A 2MYGA 5IMFA 1OC9B 1G7EA 4NHZA 4EL1A 2CAIA 1EGOA 4XRAA 2FA4A 1EV4A 2BTOT 2VM1A 1UA5A 1BQ7A 4ZB6A 2IWTA 2VCVA 2BMXA 2L57A 4K6XA 4EDZA 1M7TA 3ISOA 2V6OA 1W4VA 2PVQA 1I9DA 4JE1A 2I1UA 4F82A 1YY7A 5KN0A 4HZ4A 3KXOA 1S3DA 1O6JA 4TRXA 4PXOA 3JCML 2CAQA 3N5OA 3DVWA 2PGTA 1KTEA 3VLNA 1H75A 1PGTA 4IS0A 3A3TA 3M0FA 4EF0A 5L71A 4O7HA 2NDOA 2P5QA 1GSSA 1O81A 4GQCA 4WKWA 4RI7A 4ZBAA 1NW2A 5KN2A 1XVWA 1ZYEA 4I5QA 5ECHB 3D0ZA 1QXHA 5ECQB 4CDOA 6GSUA 5JCUA 2NVLA 4JU5A 3DEXA 3FZ4A 5LD0A 3D4MA 3C71A 3FR9A 1S3AA 1R5PA 1B4QA 1ZGNA 5IQYA 2TRCP 4JR6A 1OE7A 1XPVA 2FWFA 1GH2A 1TRVA 3CYNA 1T4YA 4YH2A 4L8EA 3TKPA 1TRUA 2NTOA 3QFAC 3I6AA 1TK8B 1WWJA 2VD1A 2LS5A 1TJDA 1TU8A 5IIZA 1R4WA 5ABRA 3LQ7A 1JZRA 2ZNMA 3RHBA 2M72A 18GSA 5AIVA 1ABAA 4IW9A 4IQAA 1TXXA 2EIOA 2JSZA 2K8SA 4ZB8A 4DSQA 4TXOA 4KDYA 2B7JA 5DQSA 2G2QA 1SKWB 1V58A 2WB9A 4MJAA 3FZAA 2H6ZA 2OADA 4X0XA 4QL7A 1TOFA 2HT9A 3L9SA 2ON5A 1Q98A 5GSTA 5EL8A 2H6YA 5IO0A 1FW1A 3UMAA 2YV7A 2EC4A 3O3TA 4HOJA 4ZL7A 4XTSA 4GLTA 4MJCA 4K2DA 3DKSA 1Z9HA 2H72A 2VLUA 4YQUA 2CQ9A 1K0DA 2LUSA 4MF7A 2YNXA 3W6GA 2TIRA 3TJKA 3US3A 3BBYA 3H93A 1GTIA 1TRSA 2RIIA 1FVJA 2GZYA 1SK0A 3GTUB 5D9XA 1YKAA 5LCZA 5CRGA 3IAS2 3EC3A 2ZUPA 6GSXA 3VFIA 1XWAA 10GSA 3QR6A 4GWRA 5DCGA 5D9WA 3F6DA 1G0TA 3Q18A 3KTLA 4KX4A 6GSSA 4OO4A 4V1Ap 2PWJA 1XWGA 1SJ6A 1X9MB 3TRPA 1AXDA 3IAM2 5DAKA 1RQMA 2XBQA 1XW9A 2OBKA 3KH9A 1YF1A 1T7PB 3HD5A 3IDVA 3IV4A 3FYGA 3KP9A 1F37A 3GUSA 5H5RA 2H19A 2DIZA 3EWLA 3PR8A 1S3CA 4EKZA 2YWIA 3HYPA 3UIWA 4IP6A 2F3MA 4ML6A 1Z6MA 1SJZA 2JZRA 4G10A 3UAPA 2MBTA 4NPBA 4D73B 3G7YA 1SK1A 2E7PA 2B3SA 1AC1A 2K8VA 3HXSA 3IK9A 1M9BA 4O92A 4WETA 3EYTA 3P7XA 4POLA 3F9UA 4NWYA 2C3TA 5E59A 3DIEA 2DJ3A 3L78A 4Q5NA 1QFNA 2J23A 3LXZA 5LNKe 1LU4A 2LNSA 5G5EA 2HLSA 5JWRB 1PRXA 1X5DA 20GSA 3LSZA 2I9HA 1VF2A 1JFUA 2LQOA 3EINA 1SYRA 2H0HA 4JR4A 2GTUA 2F9SA 2PERA 2HXKA 2GVPA 4KB3A 3F4SA 3TJBA 4IVFA 3GKMA 1DSBA 2ZCTA 1HNBA 1V57A 2MMZA 1FO5A 4BVYA 3VWXA 3TKSC 2B6MA 3W8JA 4MDCA 3QAGA 1TP9A 1XIYA 2H0IA 3KZQA 2C0DA 3ERFA 5DALB 3APQA 5HR0A 4KH7A 1ZOFA 3KIJA 22GSA 5COHA 1PX7A 3GH9A 4J57E 5ECOB 3QMXA 1M99A 3FK8A 4JEDA 2HZFA 2PUKC 2JL4A 2GSSA 3LYKA 3CXGA 1OC8A 3AY8A 3PGTA 2OE3A 4MK3A 5IPHA 4I8BA 2R3XA 2V2GA 5HFGA 1EEJA 3GL5A 3QCPA 4OFMA 1WOUA 1U3IA 1WRYA 2CT6A 5ID2A 4FH8A 1F2EA 2FA8A 4ZB9A 3KCMA 4YQVA 2ES7A 4KCEA 5IMAA 1FVKA 3GRXA 2NBSA 3DRNA 2E2GA 2HFDA 3MNGA 1X5EA 3HZ4A 2L5OA 1K3YA 1ST9A 3ZITA 3H8QA 3GKNA 5B6MA 4TXVA 4L0UA 4IQ1A 3RDWA 5DDLA 2OE1A 5G2ZA 4OCFA 2R37A 4EE0A 1N8JA 2X99A 2B5YA 4N10A 3FRCA 4FO5A 5ECRB 3GIXA 1JZOA 2KHPA 4RI6A 4MZBA 2OJLA 3L9VA 4KAEA 4O32A 2F8FA 2GQMA 1K3OA 2Z9SA 2CVDA 1PMTA 3LXTA 1J08A 4DEJA 3KJYA 1XWBA 3DWVA 4Q5FA 6GSYA 1Y25A 1Z7PA 3EU4A 5AGYA 2C0GA 2VL9A 3FR6A 1IYIA 1B4PA 1LBKA 3IE3A 3L0HA 4XCSA 3ZRDA 2DJ2A 2YP6A 5ECLB 1A0RP 3UBKA 1NSWA 3GX0A 1GSEA 1U6TA 2IMEA 2HZEB 2IIYA 1TK5B 4HJMA 1Z3EA 3GSSA 5AISA 1X5CA 5DBQA 2WS2A 2HYXA 2CZ3A 2LJRA 2QC7A 2YWOA 2O85A 2YZHA 3M8NA 1YF0A 1EOHA 3SWLA 4WEYA 4DSRA 3RPPA 2C8UA 2IFQA 2REMA 2HZEA 3I9V2 5D93A 4Z7XA 1PN9A 1GTBA 2GZZA 2R5GA 1JLWA 1B48A 2XHFA 5FHIA 1FG4A 3IBHA 3QOUA 1GSDA 5G30A 4ECCA 3DGQA 4CW9A 5DJLA 2DJKA 4HUAA 1GUKA 1NHOA 4RQXA 3GL3A 3Q74A 2IL3A 4KSMA 2WULA 4ZIJA 4LA1A 2HI7A 4MP4A 2H1AA 4TN8A 4KNDA 1YEXA 3KMNA 1ERVA 4GSNA 1EEMA 3ME8A 1BAYA 2XPEA 2YOIA 5J41A 3LWAA 1SKSB 3EE2A 4ISDA 3BOAA 2XC2A 3UARA 1ILOA 2H71A 3KGKA 2LJKA 5ECPB 3LG6A 4POKA 2YJHA 3CMIA 1F3AA 5B8AA 1Z7RA 3TGZA 4TXOB 3VI7A 4BVXA 1QQ2A 4IP1A 2DMMA 2YV9A 3MWHA 3G7IA 2AHEA 4GQFA 2B7KA 1C72A 1HNCA 2V32A 4HQZA 5F07A 2C80A 1QUWA 2JADA 3DVXA 1GSQA 3RHCA 3TRXA 2GT5A 1OVNA 2H0GA 1MDIA 1GUMA 2QSIA 5JWOB 1GTUA 2NPBA 3VWWA 1SENA 2LEGA 3IA1A 2VAFA 2VCXA 3A2XA 2B5XA 4OO5A 5ECNB 3DXBA 2GZPA 1JHBA 1ERUA 2OKAA 5KN3A 5GAND 3FW2A 1TI1A 2VIMA 2K9FA 3HJPA 4K1FA 5IMVA 5G5FA 3RPNA 1SL1B 4QL9A 1O7UA 3A2VA 5HFIA 4GRFA 2RM6A 2YJ7A 2VLVA 3F63A 4MJBA 1RK4A 4K7IA 3ZFBA 1A2MA 3HKRA 3TKRA 1QGVA 1QK8A 2H76A 2I4AA 5IO2A 3A5WA 2B5EA 1PSQA 1Y6EA 2JACA 3ME7A 1O8WA 2B1KA 4IGJA 4QQ7A 5ECKB 1H4OA 4HI7A 5AIXA 4WXTA 1JLVA 5HR2A 5EY6A 3QAWA 4KUNA 1ZZYA 3E0UA 1BJXA 4TW5A 1NM3A 4GSTA 4TVEA 2L6DA 1X9SB 4ZBBA 1X9WB 5DAKB 1TTZA 1SU9A 2MMAA 3F4TA 4PQ1A 1YZXA 2JSYA 2MZCA 2RLIA 4OWYA 4I2TA 4MMMA 1K0BA 2R2JA 5B7CA 1PL2A 1SJIA 4WF5A 5D73A 3BCIA 3ZVJA 1BYEA 5HR3A 1V9WA 4OFTA 2VO4A 5F06A 2VCWA 2HSYA 14GSA 4OMVA 4N0VA 2LV3A 1XCCA 4NXIA 1YEPA 2E0QA 5J9CA 5CRHA 2EIRA 3FR3A 3L9UA 4FYCA 3HY2A 3WGXA 1J9BA 3RAZA 1XBSA 5CRWA 2H1DA 3D4TA 4I97A 3ERGA 2H01A 2RM5A 4ZL9A 1DE2A 1LJRA 2E2MA 2C1YA 5ECSA 4NAXA 2O7KA 2L4QA 1XVQA 3ZIJA 2WGRA 3U6VA 5IM9A 2L6CA 4IJIA 3GFKA 2RUEA 4EDYA 2AB6A 3IK7A 4J2FA 4F0CA 1SD8A 1K0CA 2GQLA 5IPGA 2O89A 4BA7A 4GSSA 2VCTA 3ZLPA 4K8MA 3ED3A 5F0GA 4F2IA 3J7Yk 3EMXA 5G1LA 4LMWA 5GAPD 4GXZA 1GNEA 1T4ZA 3GA4A 1V2AA 4L0WA 4ULXA 1PA3A 2PU9C 1SKRB 6GSVA 2HNLA 4MZCA 2VL2A 3QDNA 4KDXA 4DSSB 2GSTA 3TOUA 1XWKA 4KCAA 3HCZA 3H4KA 1O73A 2FGXA 2OA7A 3FZ5A 4ID0A 2IMKA 2IJYA 4XS4A 5GZZB 1GULA 3M3MA 4DSSA 3W8SA 5HFKA 4XS1A 3GHAA 4BWQA 4G2EA 5CNWA 3Q6OA 2FLSA 3KMOA 3DMLA 3HZ8A 3GN3A 1R5AA 2DSAA 3KTBA 3IC4A 1HD2A 4J56E 6GSWA 4L5LA 3P2AA 1OAZA 4MH2A 2V1MA 1ON4A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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