1WP0 | Genus

Total Genus 47

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	47
sequence length	160
structure length	160
Chain Sequence	GPFSLTTHTGERKTDKDYLGQWLLIYFGFTHCPDVCPEELEKMIQVVDEIDSITTLPDLTPLFISIDPERDTKEAIANYVKEFSPKLVGLTGTREEVDQVARAYRVYYSPGPKDEDEDYIVDHTIIMYLIGPDGEFLDYFGQNKRKGEIAASIATHMRPY

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal Structure of Human SCO1: IMPLICATIONS FOR REDOX SIGNALING BY A MITOCHONDRIAL CYTOCHROME c OXIDASE "ASSEMBLY" PROTEIN pubmed doi rcsb
molecule keywords	SCO1 protein homolog
source organism	Homo sapiens
molecule tags	Chaperone
total genus	47
structure length	160
sequence length	160
chains with identical sequence	B, C
ec nomenclature
pdb deposition date	2004-08-27

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1wp0A00

2H19A 3AY8A 3RPPA 2CVKA 2WS2A 1MDIA 1EGOA 2AUVA 18GSA 1YDKA 1EEJA 2X8HA 5KN3A 1FHEA 2B3SA 3DVXA 4KCEA 1B8XA 1FVKA 3IRAA 1QMVA 1AUCA 3KGKA 4DSSB 4OFNA 4GQCA 3FHKA 3UARA 2XPEA 3FRCA 3ZYWA 2QGVA 2FGXA 1GL8A 1TRSA 4WR5A 3E0UA 2QC7A 2B7KA 3BBYA 4BVXA 5GSTA 1M2AA 5J9BA 2YWIA 2O8VB 3CXGA 2HZEA 1G7EA 3HVSA 3VFIA 6GSYA 2H72A 1NHYA 4K0GA 3BCIA 4F9ZA 5ECKB 4G10A 2YV9A 3A2VA 2X99A 2E2MA 1TI1A 3GKNA 1J08A 5J4UA 4GSTA 3ZVJD 4XRAA 3IHQA 5DJLA 1GTBA 1NM3A 4O7HA 1A0FA 1A0RP 3F8UA 4TR1B 2DMLA 4HEA2 1S3AA 1CQHA 4G2EA 3M9KA 5CREA 2VL2A 2OE1A 3P7XA 5AISA 4FO5A 4NAXA 5EY6A 4O92A 4HUAA 3LYKA 3KIJA 2HZFA 3ED3A 5CAXA 2VM2A 1PA3A 4K7IA 3DEXA 5H5SA 6GSVA 2OBKA 3APSA 3P90A 5DALB 2JSYA 3GTUA 3IXRA 2XBQA 3HZ4A 1U3AA 1EP7A 4GF0A 1K3LA 2YN1A 4MLYA 3I43A 2WGRA 3RDWA 1ERTA 4K7OA 3M3MA 2RIIA 4IELA 2GT6A 5A4UA 1XW5A 2AYTA 3KMOA 4PGTA 1MD3A 3HVXA 2L5LA 5F0GA 2H1GA 2H1DA 2WCIA 1PRXA 2O87A 3QPMA 4MPFA 1V57A 2VLUA 2DJJA 1TU7A 3QOUA 2H75A 5KN0A 1O7UA 4HJ2A 1OE7A 2IFQB 3IAM2 1MEKA 4POKA 2HNLA 1Z7RA 5JWRB 4NHWA 1OAZA 2QSIA 4JU5A 3ZIVA 3RAZA 1GP1A 3CYNA 4PUAA 3UVTA 4LMVA 5G5EA 3C73A 4IN0A 19GSA 3F3RA 3SBCA 3TDGA 3ME8A 4HJMA 2HLSA 3APQA 3EYTA 3UAPA 1QXHA 2IMFA 1ON4A 1T8EB 5ID2B 2F9SA 5IMAA 2H71A 4RQRA 3QAVA 4Z7XA 4AGSA 1SYRA 3ZMKA 2YNXA 1Q4JA 5ECNB 1AAZA 4BPYA 4MZWA 5ELAA 2NBSA 3GMFA 2MZCA 2WB9A 2E0QA 4TR4A 4X1UA 2P5RA 2V6OA 2H73A 3IK9A 1SKRB 5D93A 4RQXA 3EU4A 3F6FA 1X9WB 3KM6A 2VCVA 3C8EA 1AQVA 1X0RA 4F82A 3CBUA 3FYGA 1M99A 3SWLA 1YJ6A 3UVHA 4YAPA 4EL1A 4K8MA 1F3AA 5C04A 3QD9A 4EC0A 1OKDA 3F4TA 3FK8A 1ZZYA 2OKAA 2XBIA 2YP6A 1TK5B 3VI7A 2P31A 3F4RA 3GKXA 1XFLA 2OBIA 1PL1A 1YKCA 2YV7A 4MF6A 1Z7PA 2FUG2 2NPBA 3CSJA 2HRNA 3TJBA 1A2LA 1Y6EA 1XW6A 2IMIA 2H8LA 1GH2A 4K7NA 4OMVA 3A5WA 1ZYEA 1ERUA 2CZ3A 1WP0A 2L57A 3A3TA 3UBLA 4TXOB 5HR3A 4HU7A 1SL2B 3H93A 2PGTA 2V32A 2K6VA 3CMIA 3IR4A 3GX0A 4L5LA 5COHA 4IP1A 2G2QA 5ECLB 2OJLA 4MDCA 4Q5RA 3N9JA 3QFAC 3TJGA 4IHUA 1PX7A 1M2DA 5ECRB 5KEJA 3Q18A 5JCUA 3TKSC 3KH9A 3KTLA 3F3QA 3V1WA 1YZXA 2JZTA 2WDUA 3L4NA 2KLXA 3PR8A 4POBA 3L9VA 2HYXA 3ZZXA 8GSSA 4IQ1A 3KZQA 5FHIA 6GSTA 5D9WA 2GSQA 4NPBA 5E59A 5D9XA 4TXVA 1PMTA 1PX6A 2C3NA 4D73B 4LA1A 2F8AA 3FR3A 3PINA 4IQAA 1TW9A 2R4VA 2AHEA 1CQGA 5G5FA 2C0DA 1VF2A 3VWVA 2VD0A 4L8EA 2LJRA 3TRPA 1WOUA 3VK9A 4Q5FA 1GRXA 1TDIA 4J56E 1U3IA 2LSTA 5A5KA 2JADA 4HS1A 4BWQA 5L71A 2ON5A 2MMAA 3M9JA 5DBQA 2GZZA 4KB3A 2MMNA 4EF0A 4GRFA 1JZRA 3IPZA 3WYWA 2YWMA 5E4WA 5B6NA 1X5DA 5G31A 1T3BA 3RHBA 2IWTA 4MF5A 4JEDA 2PVOC 3KP9A 1PN9A 2PMTA 1VRSD 5D9TA 5A4VA 4TR3A 2PUKC 4QQ7A 3GHAA 4HU9A 1K0BA 2LRNA 1O73A 1TRVA 4QL9A 5DAKA 22GSA 4AJ7A 3TCOA 5CRDA 1BG5A 2R2JA 5H5QA 1K0MA 1QGVA 3FZAA 4XHMA 3RBTA 4HI7A 3DWVA 5DQYA 3KD0A 1NW2A 1ILOA 4ZBBA 4WXTA 1V58A 4KA0A 1TK0B 1WMJA 1TXXA 4L5OA 4O5RA 2DSAA 5ELGA 1W4VA 4ZB6A 5JWQB 5CRHA 3GV1A 3E9JB 4IKHA 4IVFA 1QQ2A 3US3A 1ERVA 3ISOA 4XS4B 3EMPA 5JWOB 1SKSB 2ZCTA 4N30A 3GURA 2GT5A 2LUSA 3UIWA 3U5RE 3QFBC 1SL1B 4EKZA 2IIYA 5D9VA 3W8SA 2H30A 2PWJA 20GSA 1M2BA 4EO3A 1DBYA 2DIYA 3C71A 2ON7A 4IJIA 3WGEA 1WWJA 3DYRA 3D4TA 3HD5A 2VL9A 3C1RA 4CDOA 1U87A 3HZ8A 4QL7A 2GSTA 4OO4A 2E7PA 1H4OA 2LTKA 4FIWA 3DIEA 1T4YA 1N2AA 5IPGA 1HNAA 3EURA 4PX1A 4ISDA 1GWCA 2DJ2A 1XVWA 2GSRA 1C72A 3IA1A 4K1FA 3G7IA 3NZNA 1G6YA 4EXJA 1ST9A 3LG6A 2A4VA 1Z6MA 1JFUA 3L9UA 2WFCA 3FZ4A 1B9XC 2EC4A 2M80A 1QK8A 1ZOFA 2MBSA 2B7JA 3CRUA 4YQVA 1GSUA 3LSZA 4MJBA 1SK2A 3ERWA 5ECMB 3LQ7A 2GZYA 1YF1A 4WF4A 3S9FA 1M7TA 1LJRA 1TRUA 1B4QA 1OC8A 1YY7A 1GSQA 2FNOA 2TRXA 2JZSA 3NIVA 1EEMA 3MSZA 3H4KA 5IQYA 2MBTA 2IMDA 3M0FA 2JL4A 3LGCA 2DJKA 3EVIA 2CVBA 1SKWB 3NOFA 5B6MA 1XWCA 2DBCA 1V2AA 4F03A 1R5PA 1W89A 3ZL5A 2BTOT 4HZ2A 5EPFA 1WJKA 2HE3A 6GSXA 4ZIJA 2H6ZA 5HR0A 3MDKA 2L6CA 5DCGA 1ZGNA 4ZL7A 1OYJA 1IYHA 1PD21 3DVWA 3TUEA 3UOMA 2LV3A 1Q98A 4E8EA 1A2MA 3ZITA 3DXBA 4GSNA 1YKAA 2DLXA 1TJDA 2LS5A 1XPVA 1GNEA 2C80A 5G30A 4F0BA 3KCMA 4KNDA 2GQMA 4KCAA 2VLTA 1B9YC 3TOUA 3EE2A 4MMMA 5JCWA 4OO5A 3D4MA 3L0HA 3QDNA 2A2RA 1XVQA 1UC7A 1N8JA 4KGIA 1EOGA 3UBKA 4V2NA 3KEBA 3E3EA 1XWKA 3TKSE 1OC9A 2H76A 1K0OA 4IBPA 1FB0A 3LXZA 3KP8A 2YCDA 1HNCA 3ZTLA 1T1VA 3GNJA 3LORA 1WE0A 1XW9A 2CAIA 13GSA 1EGRA 2L6DA 4EVMA 2H6YA 1GTIA 1HNBA 3CTGA 5FWGA 4TOPA 3TB2A 3GL5A 2B6MA 2TIRA 1UA5A 2H0IA 4I97A 2D2ZA 1ACVA 3O76A 3G7YA 2HZEB 6GSUA 3PGTA 1GLQA 4X0XA 5DCHA 3TKQA 1SD9A 3ZVJA 1VGLA 1BX9A 1TTZA 4NHZA 3ZLPA 1DE2A 4TN8A 4ECJA 1X5CA 3RPNA 2H70A 2YJ7A 4ZB8A 2LNSA 4PQ1A 3DGQA 4PQIA 2FWHA 6GSWA 2REMA 3GFKA 1MDJA 1EZKA 2P5QA 1TI3A 2WJUA 2TRCP 3QMXA 4KE3A 4YQUA 1XWGA 2XHFA 2H1AA 3L9SA 2H66A 2FWEA 5IO2A 1O8WA 3GRXA 3U6VA 3TGZA 4DEJA 3VI5A 1XOAA 2R3XA 4GWRA 2AJQB 1T4ZA 4MCUA 4EUYA 3VWUA 4I5QA 4E8HA 2YWNA 2HT9A 1OVNA 1JHBA 3F6DA 1V98A 4ZBDA 3GTUB 2X64A 5CYYA 3G9BA 1PGTA 4YQMA 3CSHA 5INYA 2EIRA 5D73A 4G19A 2LRTA 4MK3A 3KMNA 2DJ0A 2IPAA 2CQ9A 1Y25A 1X9MB 5IIZA 1FOVA 2LEGA 1JLVA 2C0GA 4PQHA 4H86A 3W6GA 5IPHA 1GULA 1GSDA 2H1BA 4GCIA 1PQNA 1ZYQB 2MMZA 2C4JA 5ECOB 1O85A 4V2LA 2FCHA 2B5YA 1R4WA 2EIQA 2DIZA 2K8VA 5LD0A 3FR9A 3TKSA 1BQ7A 4XCSA 2LQOA 3IE3A 2V6KA 1EV9A 1XBSA 4TW5A 3VWXA 1X9SB 4RUVA 4EE0A 3Q19A 1G6WA 5GZZB 3J7Yb 3LFLA 2A2SA 3EMXA 4OCFA 4KX4A 1Z5YE 2L4CA 3M8NA 5JCGA 2KOKA 2BJXA 2HSYA 4LMWA 4V1Ap 2FD3A 4YAVA 4FH8A 4MH3A 1TK8B 2H0HA 2IJYA 3HJMA 5B8AA 3HVVA 1ERWA 14GSA 3BD2A 3TKPA 2PBJA 1GNWA 4POMA 4DSRA 5AGYA 2DMMA 3BCKA 4GTUA 3C1SA 2FY6A 2X8GA 3FEUA 2YPMA 2K9FA 1E2YA 3P8WA 7GSSA 2YWOA 4ILFA 3GA4A 1M9BA 2VD1A 5F05A 3GN3A 4LLRA 2PN8A 3F0IA 2AB6A 4Q5QA 2H74A 3ERGA 4KDXA 5ECPB 1XZOA 1O6JA 2BMXA 2PERA 4ZL9A 1AQXA 1F6MC 1E6BA 11GSA 4KSMA 1THXA 5D96A 1SL0B 3RHCA 1MD4A 5DVBA 2OA7A 4MZCA 2HXKA 1O81A 1TRWA 3D22A 4DSSA 2CA8A 3UMAA 5LNKe 4JR6A 4TKYA 4BVYA 1GSFA 1QUWA 4HQZA 1SENA 5ECIB 4KSOA 3GL3A 1M0UA 2FHEA 4WKWA 1AC1A 1VF4A 1OC3A 2R5GA 3I6AA 2FWFA 5KN2A 2O7KA 4Q5NA 2KP2A 4IS0A 4GLTA 2I81A 5ABRA 1SJZA 2RM6A 3Q74A 2V1MA 1V40A 4O32A 1BJXA 4TR1A 3FY7A 3I69A 3TJFA 3VLNA 2K18A 4CW9A 1Z3EA 1MDKA 3A2WA 3MAKA 5H5RA 1F37A 3KTBA 3QR6A 5EL8A 2GTUA 5IOXA 3IDVA 1OKTA 4TRXA 1U88A 4ID0A 1BYEA 2L4QA 1JZDA 3FW2A 1ZMAA 3OR5A 1G0TA 1FW1A 5CRGA 4HZ4A 4OD7A 5DALA 4OWYA 2YANA 16GSA 5HR2A 3FR6A 3HXSA 4K9ZA 3M1GA 3O6TA 1B48A 2DC5A 3APOA 4ZB9A 2JACA 4JR4A 4WEYA 4EDYA 1YQ1A 4F0CA 1YF0A 4XRDA 2N5AA 5IOWA 5C00A 4OFMA 3D0ZA 2VUPA 1GLPA 2RM5A 3EINA 2MYGA 4N0VA 1J9BA 1SJIA 1VF1A 2AV4A 3WD6A 1M9AA 3WGXA 2I4AA 1PSQA 2M46A 2I9HA 3C7MA 2P0GA 5GSSA 2GVPA 2IFQA 3DMLA 3GX8A 2OE3A 3J7Yk 4FYCA 5DJMA 2HSHA 5D8IA 2KHPA 3CSIA 3LXTA 3Q6OA 2VLVA 2HFDA 2O85A 2JSZA 3ZFLA 2C0FA 4PXOA 5F06A 2CX3A 1B4PA 3F63A 2GQKA 5ID2A 1R5AA 4JE1A 2VO4A 4XIHA 3EU3A 4GSSA 4MJCA 1XIYA 3D5JA 5HFKA 12GSA 1S3DA 3O3TA 2B1KA 2G0FA 17GSA 1LBKA 5J9CA 4WBRD 5F07A 2WRTA 2YJHA 3BJ5A 2FWGA 3WT1A 1FO5A 1T7PB 1HYUA 5DAKB 3ZIJA 2FA4A 3QAGA 2YOIA 2GGTA 1BEDA 2LQQA 2CT6A 3H1NA 1SD8A 4TR0A 2GQLA 2Z9SA 3VPQA 3ZREA 3LYPA 3GKMA 4FYUA 2PU9C 4KAEA 2VCQA 4L0UA 1YEXA 2WULA 4NV5A 4YH2A 3TKRA 5ECQB 1ML6A 3GUSA 2RUFA 2KP1A 3KXOA 4WR4A 2VL2C 5IMCA 2N5BA 2F8FA 1RK4A 1SK1A 2L5OA 3CTFA 1F3BA 2I3YA 4GQFA 4WBJA 4IJ3A 1A8LA 3TRQA 5LCZA 2R6KA 2C8UA 1F2EA 4HOJA 2B1LA 4KUNA 3ZFBA 3GH6A 4ZXGA 2F3MA 1A8YA 1WRYA 3KJYA 1XXUA 2NTOA 3FZ9A 3HJPA 1QFNA 5IMDA 4HDEA 1MTCA 1AIUA 3GKKA 1GUMA 2C1YA 3CRTA 4N0ZA 4TXOA 1XWAA 4V2MA 4P3YB 3LEFA 3WGDA 3TJJA 4ECCA 2GS3A 3IC4A 3W8JA 2ALBA 4HQSA 4NXIA 1R26A 3TOTA 1THOA 1XCCA 1GSEA 3GSSA 3WT2A 4ML6A 1UVZA 4ML1A 4JZQA 4LL4B 1GTUA 5CP1A 2N5FA 2H01A 1SJ6A 4KH7A 3HYPA 2H0GA 5AIXA 2I1UA 3VPTA 1IYIA 3IV4A 3FZ5A 2VL3A 3F4SA 3KH7A 3GIXA 2XC2A 2ZUPA 9GSSA 5G2ZA 3L78A 5CRWA 4ACSA 4LL1B 2HI7A 2M72A 1WIKA 4DVCA 5CNWA 1HD2A 5IMVA 1K3OA 4I2UA 2CZ2A 2VCZA 4K6XA 2PVQA 1GSYA 4KDYA 4L0WA 4D73A 2R37A 4K2DA 2QKEA 3LWAA 2C3QA 2HRFA 2B5XA 1YEPA 1SK0A 3HHVA 2VIMA 3I9V2 4KDUA 5G1KA 2PPTA 4FYBA 1AQWA 1TU8A 1GTAA 1Z9HA 2LKUA 5KN1A 2KUCA 2O89A 3D6IA 3G7JA 1K3YA 4PUFC 5G1LA 1WPIA 3UJ1A 2OE0A 1DE1A 1FAAA 4MP4A 2ES7A 3QAWA 3VURA 4X43A 1T00A 2GSSA 1F9MA 3IBHA 4MZBA 4ZL8A 4I8BA 1A2JA 1Z6NA 1ZL9A 1BAYA 2WZ9A 3ME7A 3DRNA 1FVJA 5AN1A 2YZUA 1TP9A 4IP6A 4MA9A 4MH2A 1AW9A 1PKZA 1V9WA 4IGJA 1RW1A 4CHSA 1XWBA 3EWLA 4EDZA 10GSA 4ECBA 1FB6A 5IM9A 5IO0A 2K8SA 2VOCA 3MNGA 1J0FA 2NVLA 2NDOA 2LRCA 3HDCA 3ZMLA 3VWWA 1URMA 4MJEA 1OC9B 4AJ8A 3H8QA 1U6TA 4POLA 2F51A 1RQMA 5HQPA 3QCPA 1EP8A 2LNTA 4MPGA 2ZNMA 4RI7A 1NSWA 3UEMA 3H79A 1JLWA 1HQOA 4ULXA 4IW9A 5B8BA 3HCZA 2L59A 1PKWA 2JZRA 3A2XA 4I6XA 3F9UA 4JRRA 2MMOA 4MJAA 4ECIA 1DSBA 4BL7A 6GSSA 2VCWA 3FKFA 4WETA 1G7OA 1UN2A 1GUKA 5DQSA 2VCXA 5ENUA 2X8CA 4XS4A 4BA7A 4TVEA 5AIVA 1X5EA 5F8BA 5HR1A 3HKRA 1O8XA 1XOBA 1KBNA 2IMKA 5GAPD 4PNGA 1I5GA 1USBA 1JZOA 3TRXA 1NHOA 5DDLA 1OE8A 3UL3A 5J41A 1EOHA 4N10A 3R2QA 2GLRA 4OFTA 3D21A 2JU5A 2AAWA 2DJ1A 5ECHB 3HY2A 1KNGA 3IAS2 4PNFA 1H75A 2XPDA 4V1Ag 2OACA 4KW6A 4PURA 5IMFA 3P2AA 3JCML 1I9DA 2GZPA 5J5NA 2H6XA 1LU4A 1ZCPA 5HFIA 1JZWA 5GAND 3GH9A 1K0AA 2LJKA 4OCEA 3GYKA 1KTEA 2B5EA 4AF2A 3DKSA 4RI6A 1R7HA 1TKDB 4XTSA 4ZILA 5FT3A 4JBBA 4ZBAA 1FG4A 5A4WA 2RUEA 3TJKA 1SU9A 5B7CA 5HFGA 3BOAA 2V2GA 1EV4A 4J2FA 4BWSA 2E2GA 5CO3A 5J3RA 2CAQA 2LJAA 4I2TA 2IN3A 2J9HA 1GUHA 4GXZA 1DUGA 1KEBA 1VF3A 2IMEA 4XS6A 4AJ6A 1K0DA 3IK7A 2DJ3A 2RLIA 1GSSA 1K0CA 2VAFA 4F2IA 4N11A 2V41A 2CV4A 2FLSA 3N5OA 1A24A 2YZHA 4NV2A 2C0EA 1ABAA 1AXDA 1TOFA 3ERFA 3ZRDA 4NMUA 4MABA 5EVOA 4NWYA 3HA9A 2EIOA 3K8NA 1A23A 4K0NA 2GDRA 3LJRA 3PH9A 2J23A 1EWXA 2FA8A 3MWHA 2CVDA 1PL2A 1SYXA 4G9HA 2VM1A 2IL3A 2VCTA 3DD3A 3GSTA 5ECSA 2OADA 5IMZA 4XS1A 4WF5A 4J57E 2CX4A 1K0NA 1S3CA 3EC3A 3HJOA 4DSQA 2C3TA 3IOSA 4MF7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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Chain Sequence

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