5ID2A

Asymmetry in the active site of mycobacterium tuberculosis ahpe upon exposure to mycothiol
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
154
structure length
153
Chain Sequence
VMLNVGATAPDFTLRDQNQQLVTLRGYRGAKNVLLVFFPLAFTGIQGELDQLRDHLPEFENDDSAALAISVGPPPTHKIWATQSGFTFPLLSDFWPHGAVSQAYGVFNEQAGIANRGTFVVDRSGIIRFAEMKQPGEVRDQRLWTDALAALTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Redox chemistry of Mycobacterium tuberculosis alkylhydroperoxide reductase E (AhpE): Structural and mechanistic insight into a mycoredoxin-1 independent reductive pathway of AhpE via mycothiol
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis h37rv
molecule keywords Putative peroxiredoxin Rv2238c
total genus 49
structure length 153
sequence length 154
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-02-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5id2A00
3QD9A 1BYEA 2EIQA 3WD6A 1HQOA 2YJ7A 5F07A 3G7YA 2ZUPA 2CQ9A 2YJHA 2BTOT 4FH8A 3GV1A 1EZKA 2KP2A 3FZAA 2CAIA 1ZMAA 2WB9A 3D0ZA 3ERFA 2LNSA 5ELAA 2FWGA 1NW2A 3TRPA 1Z3EA 1PSQA 3HCZA 2YV7A 4WF5A 1V58A 3ERWA 1TDIA 3CRTA 4WBJA 3CTFA 5HFIA 2GSTA 3GSSA 2F9SA 3C1SA 4ZIJA 3BD2A 5DCGA 1Z9HA 4ZXGA 9GSSA 2HE3A 2PVOC 1PN9A 3LYPA 3FRCA 4ZB8A 3IRAA 1PA3A 2I1UA 4WR5A 3KTBA 3ZZXA 5IMDA 5IOXA 1XZOA 1ZZYA 2DBCA 5H5SA 5ID2B 4ECIA 1AIUA 4PQIA 1R5AA 4KGIA 3GSTA 5CO3A 3L9UA 17GSA 3DD3A 1LU4A 2YOIA 1YEPA 2IFQB 2L4CA 4WF4A 4K7OA 2IN3A 2H6ZA 1K0AA 4K7IA 4MPGA 1JFUA 1OAZA 1O8WA 1Y6EA 1G0TA 4XTSA 5DAKB 1QQ2A 1BQ7A 6GSSA 3DRNA 1R4WA 2PERA 1YF0A 1M99A 4NPBA 4MLYA 2O8VB 3QFAC 1TJDA 4V2LA 3ZLPA 1QK8A 1THOA 2IFQA 4CHSA 2H72A 4JBBA 1DSBA 5CRHA 3F6DA 4LLRA 2ES7A 3F3RA 3IAS2 4F82A 7GSSA 4PQ1A 5HFGA 1XVQA 3GH6A 1VF1A 2JL4A 5HR1A 2L57A 1XOBA 3CXGA 2VO4A 4HS1A 1DBYA 3GMFA 4ID0A 3C7MA 1GSYA 2I3YA 4HQSA 4YAPA 3WGEA 2CAQA 3HVSA 2R2JA 5JWOB 3HDCA 2OBIA 4N11A 1Z6MA 4F03A 5DJMA 4QL9A 1Q4JA 4POBA 4MJBA 4OFNA 2B5YA 2B7JA 2CVBA 2B6MA 4KW6A 4Z7XA 2OE0A 5DALA 1A23A 4LL4B 3Q19A 1CQHA 3P2AA 2PN8A 3MWHA 1YQ1A 1TTZA 1YKAA 2OADA 2TRCP 2IIYA 3PH9A 3I6AA 3QOUA 1O8XA 2E2MA 4NV5A 4V1Ag 2FA8A 2V1MA 1ZCPA 5D9VA 3U5RE 5GSSA 1VGLA 1G6YA 4LA1A 1QXHA 3OR5A 5GSTA 1XFLA 5HFKA 5JWRB 3H8QA 1GSEA 4PXOA 3WGXA 3CYNA 4Q5QA 4K1FA 2LJRA 5D9TA 1GLPA 1SJ6A 4I97A 4EDZA 1FVJA 3QDNA 4EF0A 1LJRA 3GX8A 3GL3A 4L0WA 5D73A 1ACVA 4OWYA 5JCGA 2M72A 1QGVA 1SKWB 1YF1A 3VPTA 5CREA 4J2FA 3DGQA 3IAM2 3UL3A 5HR2A 1ERWA 1SENA 1O6JA 1MEKA 2I9HA 2YP6A 3I43A 2GSSA 2O87A 2GZZA 2LS5A 4YQUA 1V9WA 3JCML 5B7CA 4ZL7A 1FAAA 3C1RA 4WKWA 4ISDA 5ECNB 2HNLA 2N5FA 3ZVJD 2H30A 3TCOA 2YCDA 3WGDA 2N5AA 2C80A 2NTOA 1G6WA 4KUNA 4OD7A 2GZPA 3G7IA 4HUAA 5F06A 1TRSA 1V57A 4G9HA 4KCEA 3UVHA 5IMZA 2GDRA 2IPAA 4ZILA 2JADA 3TOTA 1OC8A 5IM9A 4K0GA 1X5CA 2J23A 4JR4A 2XBQA 2RUFA 2A2RA 3GH9A 1WJKA 1XWKA 1YZXA 1TU7A 5ECLB 1E2YA 2MBSA 2CV4A 2QGVA 2H19A 3DYRA 5GAPD 4MPFA 1EV9A 1OVNA 2B3SA 4KX4A 1VF4A 3LJRA 1G7OA 3RPPA 2PUKC 4QL7A 5DCHA 2TIRA 4MF5A 2EIRA 3EVIA 4FO5A 4ULXA 3DVXA 4KSMA 2IMIA 3LGCA 1NM3A 3H4KA 1XIYA 3IPZA 2R3XA 4KSOA 3FR9A 3FW2A 3FKFA 4DSRA 5ECRB 3IR4A 3ZRDA 5A4VA 4EXJA 2VL3A 1WWJA 2VL9A 2H71A 1OC3A 1TK8B 2LRNA 4F0CA 4TR4A 3A3TA 4LL1B 3LSZA 4KDXA 1O81A 5EPFA 2FUG2 1IYHA 2F3MA 3N5OA 1TW9A 2QSIA 4TOPA 3ERGA 1B9YC 2KP1A 2I81A 4ML6A 2DLXA 4RQXA 2WFCA 3Q74A 5CNWA 3KP8A 3RDWA 1R7HA 2C3NA 4H86A 2LTKA 4ML1A 2WGRA 3EWLA 4J56E 3DMLA 3VWXA 4OO5A 4RI6A 2HLSA 2WCIA 2RIIA 3LQ7A 2DJ0A 5IMAA 4GQCA 1VF2A 3UOMA 3TKPA 3GTUB 4NAXA 2F8FA 4MJCA 3D4TA 3E9JB 4ECBA 3ZIVA 2F51A 19GSA 1H4OA 3WT2A 2O7KA 5AN1A 4Q5FA 3GN3A 1S3AA 1MDKA 1U3IA 2PPTA 2YZHA 3FZ5A 2LRCA 2WZ9A 4BWSA 2V41A 4DSQA 1K0BA 3F6FA 2MMOA 2HT9A 5EVOA 4MJEA 4POKA 1S3CA 2B7KA 3TOUA 2C3QA 3GTUA 2CX3A 3EMXA 3LXTA 4WXTA 3VK9A 1MDJA 3TKRA 1EWXA 3QAVA 2WRTA 3TRXA 3LG6A 1SK2A 3DIEA 4EVMA 4WBRD 2MMNA 4FIWA 3ZFBA 3C73A 3ZREA 4LMVA 4LMWA 3KM6A 1DUGA 4V2NA 4O7HA 2VM2A 4MF6A 1SL0B 1I5GA 4GTUA 3VFIA 1XW6A 1OYJA 4IP1A 2MYGA 4EKZA 3HJPA 3IK9A 5CP1A 2OACA 3PR8A 2DJKA 2NPBA 4O5RA 1OE7A 2C4JA 3F0IA 2DC5A 1UVZA 2CZ3A 4K6XA 1XVWA 3RAZA 2B1LA 3GURA 3TKQA 2IMEA 1XBSA 2Z9SA 4TXOA 1KBNA 1JZWA 1SD9A 1ERTA 2FD3A 4EO3A 3P90A 3KEBA 1EV4A 1I9DA 4CW9A 2NDOA 3O6TA 1XXUA 5LNKe 1J0FA 2R37A 3IE3A 2OE3A 2LRTA 3KMNA 4XS4A 2HRFA 4NMUA 4XRAA 3M9KA 4AJ7A 3DKSA 5H5QA 4XHMA 3M0FA 5J9CA 5CYYA 2H75A 1ERUA 3FK8A 5EY6A 2NVLA 1XWBA 5ABRA 3FR3A 5IPHA 2K8SA 1BJXA 4RQRA 2IMFA 2HYXA 4GRFA 5B6NA 1A0RP 3LORA 4I6XA 2AUVA 3FYGA 3GIXA 3RHCA 4GSTA 1ZYEA 3FEUA 4G2EA 2KOKA 2EIOA 3QCPA 3VWVA 3IC4A 2ON5A 4IKHA 2HRNA 3EURA 3GYKA 3KXOA 3C71A 5CRWA 3BCIA 3DXBA 2K9FA 3I9V2 5LD0A 3HZ8A 6GSVA 4PX1A 2VCXA 3DWVA 1K3YA 1T3BA 2P5RA 4X1UA 1K0CA 4I8BA 5ECMB 2LQOA 1QUWA 3QAGA 1F37A 5ECHB 4MJAA 3ZIJA 2H66A 2ON7A 2PVQA 5IO0A 2I4AA 4IGJA 3P7XA 4BWQA 5DALB 3H79A 3WYWA 5IMFA 3LXZA 1GSSA 5AGYA 5GZZB 1SKRB 3TRQA 5H5RA 1GNWA 3E3EA 1W89A 1JZDA 1GSDA 4GLTA 1PL1A 1OC9B 1GULA 2C0EA 1EP8A 1M2DA 4IS0A 3US3A 2DSAA 2MBTA 2L6CA 4JU5A 3ZFLA 1V98A 1VF3A 4AJ6A 2MMAA 5HR3A 1M0UA 4IP6A 1WIKA 4EUYA 2C0DA 3QR6A 5B6MA 1EP7A 1YY7A 2DJ1A 2JZSA 2YNXA 1OC9A 4IQAA 4KAEA 5ECPB 1T8EB 4POLA 2E0QA 2LQQA 2D2ZA 5DQSA 5ECIB 3HYPA 1JZRA 2DMLA 5JCWA 4K2DA 1GNEA 3DEXA 2FGXA 2H0IA 2H8LA 1DE1A 4NHZA 1FB0A 1AC1A 4N0ZA 4XIHA 5COHA 2GQMA 3H1NA 5INYA 3EMPA 1UA5A 4GF0A 14GSA 1PX6A 1TI3A 2AHEA 3HVXA 2IMKA 1GTIA 4RUVA 2ZNMA 1WMJA 1DE2A 3M3MA 3G7JA 1F3AA 4FYCA 5D96A 4E8EA 4TR1A 5IMCA 2V32A 3F63A 16GSA 1T00A 5LCZA 2H6YA 5G31A 2GT5A 4F2IA 2O85A 2VLUA 4GQFA 2X64A 2IJYA 3TJJA 4P3YB 2FWEA 3L0HA 2VCVA 4K0NA 2HZEA 3BJ5A 2AYTA 1T1VA 3F3QA 2YWNA 3ME7A 3K8NA 1TXXA 2OKAA 3F9UA 2AV4A 3F4SA 2GLRA 4HQZA 4O92A 3D22A 2MMZA 1PQNA 5ENUA 2HZFA 1GUHA 3GUSA 3FZ9A 4I5QA 1G7EA 4GXZA 2GSQA 4F0BA 3VURA 1FO5A 2H70A 2REMA 1QFNA 5FT3A 2H0GA 6GSTA 3HKRA 1GTBA 2H1BA 4TW5A 4N10A 2R5GA 10GSA 2V6OA 3ED3A 1FHEA 3IOSA 4DSSB 1RQMA 3C8EA 4V2MA 5IPGA 3FZ4A 4MABA 5C04A 4MF7A 4HZ4A 4MK3A 1N2AA 4AJ8A 1JHBA 3VLNA 1A2JA 2ZCTA 1S3DA 3KTLA 2FLSA 2B5EA 4KDYA 3F4TA 2AJQB 2X8HA 3TJFA 2LEGA 4OCEA 4NXIA 2HI7A 4GSNA 3HXSA 4DSSA 3GKMA 3A2WA 2A2SA 1AQVA 3VI7A 2VAFA 2PU9C 3IBHA 2GZYA 4YAVA 1JLVA 3GFKA 2L5LA 2RLIA 3F4RA 3CTGA 2K8VA 1SK1A 1ZGNA 3TKSA 1RK4A 3I69A 4IW9A 1Y25A 4EE0A 3Q6OA 5B8BA 3KIJA 2X8GA 1LBKA 1V2AA 1TK0B 2KHPA 2VIMA 4X43A 4F9ZA 20GSA 2PMTA 1HYUA 5CAXA 1HNBA 3GX0A 1SJIA 3D21A 1GSFA 3L4NA 1Z7RA 4K7NA 5KN0A 1BX9A 2CX4A 5JWQB 3GRXA 2QKEA 3LFLA 3ZMLA 4ECCA 5IO2A 3VPQA 1J9BA 4HI7A 4HJ2A 3M1GA 3A2VA 3UBLA 1BAYA 1ERVA 4WR4A 3IHQA 4D73A 4NWYA 4POMA 1OKDA 5B8AA 3HZ4A 2XPDA 1EGOA 3U6VA 2JSYA 3D5JA 2X8CA 2XHFA 3M8NA 3ZTLA 1SU9A 3TJKA 4HJMA 4MCUA 1GLQA 1A0FA 1PX7A 1HD2A 3RHBA 3EU3A 1EOHA 2HSHA 2VL2C 2FWHA 3UMAA 4AF2A 2BMXA 2LNTA 4EDYA 4YH2A 3CSJA 2LJAA 3UVTA 1AAZA 5F8BA 4TVEA 5KN3A 2B5XA 4TN8A 3UEMA 3L9SA 4TXOB 5IQYA 4BPYA 1K3LA 22GSA 1FB6A 3O76A 1WE0A 5J9BA 4YQMA 1F6MC 1ON4A 2VL2A 1OKTA 4ZB6A 1B4PA 2HXKA 1BG5A 1X0RA 4KDUA 4XS4B 2RM5A 4BA7A 3QMXA 3HD5A 3IXRA 4XRDA 1MD4A 3APSA 4IHUA 3F8UA 3LWAA 1XWCA 3KH7A 4PURA 1SKSB 4PNGA 1PMTA 4HEA2 2XBIA 3APOA 2FCHA 4JE1A 4PNFA 4L5OA 2YZUA 2RUEA 3QAWA 3HHVA 2AAWA 3EU4A 4IBPA 1T4ZA 3IK7A 3FY7A 6GSYA 3CSHA 1H75A 3WT1A 3TGZA 1SJZA 1T7PB 2DIYA 1X9WB 3SWLA 2VLTA 2IMDA 3ZVJA 1W4VA 3HY2A 4DEJA 3IV4A 3D6IA 2L5OA 1J08A 3J7Yk 2DJ3A 1M9AA 2R6KA 4PQHA 1O73A 3ZITA 2M46A 2VLVA 2WDUA 5JCUA 1K0NA 3M9JA 4IQ1A 1ZL9A 5G2ZA 5GAND 2AB6A 5KN1A 2DMMA 3KMOA 4N30A 3H93A 2V2GA 1Z7PA 3UIWA 3MAKA 1GWCA 1AW9A 1B4QA 1THXA 4FYUA 4V1Ap 3V1WA 2RM6A 4MZCA 1FVKA 3PINA 1CQGA 2OE1A 2JU5A 3NZNA 4G19A 1NHYA 3NOFA 2H76A 4GCIA 2TRXA 4HU9A 1FOVA 2HSYA 2WS2A 3P8WA 1USBA 3TKSE 3G9BA 3GNJA 3QFBC 1TKDB 2PBJA 4OCFA 4MDCA 3GKXA 1NHOA 4ECJA 5D9WA 2B1KA 1A8YA 5KEJA 1WRYA 1PL2A 1GRXA 4ZBAA 5ECSA 4KCAA 4EC0A 4Q5RA 5F05A 2YN1A 1BEDA 4BVXA 1PGTA 2FWFA 1N8JA 1M7TA 5ID2A 1KEBA 2PWJA 5ECQB 5ECKB 1GP1A 4I2TA 1GH2A 3RPNA 4OFTA 4HU7A 3KJYA 2ALBA 5DQYA 2JACA 4JZQA 3BBYA 5D8IA 5L71A 2KUCA 4WETA 3E0UA 4G10A 4ILFA 2H73A 4N0VA 4JRRA 4AGSA 18GSA 3CBUA 5DAKA 4KE3A 4XS1A 1ML6A 2YWMA 1XWGA 2H01A 1K0MA 2DJ2A 4O32A 1PKWA 4RI7A 5DBQA 2VOCA 1WP0A 5DJLA 1R26A 1SYXA 3EE2A 4KH7A 2GGTA 2XC2A 1ZOFA 1TK5B 1E6BA 4K8MA 3UBKA 1X9SB 4ZBBA 5CRDA 6GSXA 1SL2B 5A4UA 2CVDA 3RBTA 2C3TA 2VD0A 1A8LA 3GA4A 3R2QA 4MP4A 4TR0A 1TRWA 1HNCA 1JLWA 2K18A 4XCSA 5C00A 1WOUA 1OE8A 3TDGA 3VI5A 1MD3A 5A5KA 1WPIA 4TR1B 3MSZA 3CSIA 2H74A 3UAPA 1EOGA 5DDLA 5J4UA 1A2MA 2H6XA 1B48A 4IVFA 2VUPA 4GWRA 1YKCA 3TB2A 1GUKA 1X5DA 1YEXA 3KGKA 3LYKA 4BVYA 5HR0A 5AIXA 4QQ7A 2H1GA 4MZWA 5IIZA 1AQWA 1C72A 2HZEB 1KTEA 2XPEA 1SD8A 4KNDA 3EYTA 3CRUA 5E4WA 2JZTA 8GSSA 1X5EA 1TRUA 5G30A 4PGTA 1YJ6A 3SBCA 1TRVA 4JR6A 2YANA 4ACSA 1AQXA 2VM1A 1SL1B 1B8XA 4BL7A 5J3RA 2IWTA 3LEFA 11GSA 3PGTA 3GKKA 1GSUA 4NHWA 1GTUA 1UC7A 2M80A 4J57E 4Q5NA 5G5EA 1URMA 1XOAA 2C0FA 2LKUA 4IELA 2N5BA 5ELGA 5KN2A 1GTAA 2E2GA 4YQVA 1HNAA 2HFDA 5D9XA 4TXVA 4HDEA 4WEYA 2LV3A 5HQPA 4TR3A 2CA8A 3HA9A 1EEJA 12GSA 4EL1A 1R5PA 2EC4A 4MA9A 1XW5A 4OMVA 1F3BA 2FHEA 1EGRA 3UJ1A 3GHAA 2VCWA 1F2EA 2L4QA 4CDOA 3IA1A 2GSRA 5AIVA 3TUEA 1PD21 2LSTA 3W8JA 2FY6A 2VCQA 2C1YA 2CVKA 5IOWA 2JSZA 3AY8A 2MZCA 3EC3A 6GSWA 4TKYA 3L78A 4L0UA 1U3AA 1O7UA 3L9VA 1AUCA 2NBSA 5J41A 4MH2A 5A4WA 4ZBDA 2YV9A 5FWGA 1TI1A 2LJKA 3A5WA 5DVBA 3ISOA 2G2QA 1SYRA 3HJOA 4K9ZA 1XCCA 2H1AA 2G0FA 2YWIA 4OO4A 4L8EA 3VWUA 1GL8A 2GVPA 1SK0A 3A2XA 3KP9A 4KB3A 2F8AA 3TKSC 4L5LA 2DIZA 3BOAA 1A2LA 3N9JA 5G1LA 1FW1A 2GQLA 3ZMKA 2X99A 1M2AA 1VRSD 2C8UA 2VD1A 3CMIA 4E8HA 1M2BA 1ZYQB 2CT6A 1F9MA 4PUAA 3MDKA 2L59A 1MTCA 2GTUA 5J5NA 3KH9A 1V40A 2DJJA 3J7Yb 2GQKA 4OFMA 5CRGA 3QPMA 5G1KA 2OBKA 5ECOB 3KCMA 1XPVA 5FHIA 4D73B 2KLXA 3GL5A 2VCZA 5EL8A 1TU8A 1A24A 3MNGA 2OA7A 5F0GA 3ZYWA 1K0DA 4TRXA 1PRXA 1T4YA 1FG4A 4PUFC 2P5QA 3BCKA 2OJLA 1YDKA 1EEMA 4FYBA 4ZL9A 3HVVA 1UN2A 2A4VA 2JZRA 13GSA 1GSQA 2GT6A 2H0HA 3IDVA 3UARA 6GSUA 1Z5YE 4ZL8A 1IYIA 1PKZA 3D4MA 1TOFA 3W8SA 3O3TA 4MZBA 2L6DA 1AXDA 1JZOA 1QMVA 3GKNA 2O89A 5D93A 1TP9A 2P0GA 1O85A 5G5FA 1MDIA 1ABAA 2WJUA 5IMVA 2WULA 1KNGA 1RW1A 1XW9A 4I2UA 1Q98A 1K3OA 1GUMA 1U87A 1ST9A 2QC7A 2YWOA 3FR6A 4IN0A 3DVWA 1U6TA 1Z6NA 1B9XC 2CZ2A 2E7PA 4NV2A 3KD0A 2R4VA 5AISA 3VWWA 3APQA 2H1DA 5E59A 1X9MB 3EINA 3TJGA 2LUSA 2IL3A 2FNOA 1K0OA 4MMMA 3KZQA 3ME8A 4JEDA 2C0GA 2FA4A 4IJ3A 1NSWA 4XS6A 1U88A 3NIVA 4MH3A 3W6GA 4IJIA 4GSSA 4X0XA 2PGTA 3FHKA 2J9HA 3HJMA 2K6VA 4ZB9A 1ILOA 4KA0A 3TJBA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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