5ID2A

Asymmetry in the active site of mycobacterium tuberculosis ahpe upon exposure to mycothiol
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
154
structure length
153
Chain Sequence
VMLNVGATAPDFTLRDQNQQLVTLRGYRGAKNVLLVFFPLAFTGIQGELDQLRDHLPEFENDDSAALAISVGPPPTHKIWATQSGFTFPLLSDFWPHGAVSQAYGVFNEQAGIANRGTFVVDRSGIIRFAEMKQPGEVRDQRLWTDALAALTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Redox chemistry of Mycobacterium tuberculosis alkylhydroperoxide reductase E (AhpE): Structural and mechanistic insight into a mycoredoxin-1 independent reductive pathway of AhpE via mycothiol
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative peroxiredoxin Rv2238c
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis h37rv
total genus 49
structure length 153
sequence length 154
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-02-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5id2A00
4FH8A 5CRWA 2CAIA 2OE1A 1M99A 3ZTLA 2O7KA 20GSA 2HE3A 4POKA 1MTCA 2VCXA 2DJ0A 2F9SA 5G1LA 5HFIA 3H4KA 2M72A 5F07A 6GSYA 3A5WA 2YOIA 3MDKA 1QGVA 3VPTA 2H74A 3DXBA 5IMVA 5G30A 1DUGA 2IJYA 1SENA 3IAS2 2CAQA 3IV4A 4LL1B 7GSSA 2L59A 4K1FA 2IMEA 1ERWA 1TK5B 5HR3A 1GP1A 1ML6A 2CVDA 3VURA 1Y25A 1H4OA 1XW9A 2WS2A 4WETA 4DSSB 1SL0B 3PH9A 4ECBA 1ZOFA 5D9TA 2B5EA 1NHOA 4J57E 3FK8A 1SJZA 3ZL5A 1F9MA 2H6XA 1I5GA 2J23A 2O8VB 3RPPA 4IN0A 3GIXA 2RM5A 4GSNA 1GTBA 2LQOA 5CO3A 4PGTA 4Q5NA 5IMZA 5IOWA 2C0DA 1IYHA 2FY6A 4KGIA 2VIMA 2O85A 2DC5A 5KN0A 2VCZA 3UBKA 4ISDA 4V2MA 1XZOA 1TDIA 5GAND 1FB6A 1PA3A 1YF0A 4MCUA 1MEKA 3HJPA 4RI6A 5G5FA 3IK9A 3P2AA 2LKUA 5J9CA 1JHBA 5ECLB 5ECPB 5C00A 1SYRA 4MH2A 1TXXA 5ECHB 2HRNA 3RHCA 2VCQA 2EIQA 1ABAA 2N5FA 3KH9A 3GN3A 4KCAA 1GL8A 5GZZB 3G7IA 4ZBBA 2YWOA 1GSYA 3TKQA 4IJ3A 4GSTA 2B1LA 4MA9A 1V57A 5EY6A 1OAZA 6GSUA 4PQHA 3CYNA 1X9WB 1K0DA 3TB2A 2CX4A 5D93A 3PINA 3EWLA 3AY8A 1PL1A 4F03A 5ENUA 2FWHA 5IMFA 4K7IA 1T7PB 2IFQB 3LEFA 1DSBA 3ERWA 1VF2A 5KEJA 2VAFA 2C80A 2QC7A 2ES7A 1J08A 5H5SA 2HZFA 1K0AA 3GKKA 2CZ3A 2LTKA 3ZLPA 4MH3A 2HZEA 1HNAA 3Q6OA 1HNBA 3TOUA 1XWBA 5IO0A 1TOFA 2C3QA 4XHMA 1Z7RA 1Q4JA 1M2BA 3KM6A 2R37A 2MBTA 1Z9HA 1BAYA 2B7JA 4PQIA 1JZWA 5ECKB 1FG4A 2VL2C 5FHIA 1SKRB 2C0EA 1AXDA 4OMVA 3PR8A 2R2JA 3UBLA 3DD3A 4I2UA 2K8SA 4K7OA 2GTUA 1EGRA 2WCIA 2V32A 4DSSA 2NTOA 2VLVA 1SKWB 2X99A 5J41A 2TRXA 2LNTA 4F0BA 5F0GA 2CQ9A 2VM1A 2JSZA 4X0XA 4AJ6A 4TXOB 3C73A 1AAZA 2B5XA 1ZMAA 3HA9A 4JBBA 4IKHA 1ZCPA 4MF7A 1O73A 5B7CA 2PWJA 5G5EA 1TI3A 1YZXA 3MWHA 3L9UA 2YN1A 2QKEA 4LLRA 3DMLA 3RAZA 3OR5A 3UIWA 4MMMA 3ZFLA 4JZQA 2X8HA 4HQSA 2AAWA 2PPTA 1Q98A 2HSHA 3HZ8A 1XWKA 3D5JA 1EOHA 2C3NA 1XOBA 2I9HA 1K0OA 3TCOA 3VI7A 1SD8A 2FCHA 1PSQA 3EURA 3L78A 4FYBA 4BVXA 3DGQA 1T00A 1FOVA 4RQXA 1Z6NA 2ON7A 2VUPA 3ZRDA 4Q5RA 3FW2A 2KOKA 3A2WA 2KUCA 5CAXA 2GSTA 2PVQA 2MMOA 1F6MC 4KAEA 4E8EA 2R3XA 1BQ7A 1GNEA 1U3AA 2RM6A 2FWFA 2HI7A 1GUKA 4MABA 2H8LA 3A2XA 2LNSA 4J2FA 2VOCA 4OO4A 5L71A 2IFQA 4V1Ap 2H0HA 5D73A 1K0MA 2IL3A 4PX1A 1SK0A 4EDZA 4WBRD 3ERGA 5EPFA 1M0UA 5COHA 2AYTA 5JCGA 5DJLA 1O81A 4MJEA 3DRNA 4BA7A 4RI7A 3TJGA 4AF2A 2IIYA 4MZWA 4NPBA 1OVNA 2YWIA 4ULXA 2F8AA 4ZIJA 2XBIA 1S3DA 3GRXA 4GQCA 4O5RA 1I9DA 2EIRA 2KP2A 4CDOA 4IW9A 5B8AA 18GSA 3I6AA 4YQVA 4ACSA 1B9YC 1KEBA 2IN3A 5DALB 1AIUA 3GL5A 5FT3A 3GTUB 4WKWA 4PURA 3D4TA 4O7HA 3F6DA 1WWJA 4ZB9A 4V1Ag 5A4WA 4DSQA 1MDIA 2F3MA 5CRGA 1K0NA 1PGTA 2VCTA 6GSTA 3HZ4A 10GSA 2GDRA 2LJRA 2YP6A 6GSVA 2YJ7A 2PN8A 5F06A 2V6OA 4JR4A 4TXOA 3F9UA 4DVCA 3APSA 19GSA 2A2SA 3M3MA 4TOPA 2M46A 3TDGA 4F82A 3DEXA 3ME7A 3APQA 2PVOC 4JRRA 3W8SA 2CVBA 4NXIA 2OADA 4GCIA 1FB0A 4NV5A 4TRXA 1HNCA 2L4CA 2PERA 1PMTA 1QMVA 3ZZXA 4POLA 2RUFA 3QAVA 4EVMA 2GQMA 2L5OA 4K0GA 3ZIVA 3Q74A 4Z7XA 4WR5A 2X64A 3SBCA 5D9WA 5ELAA 3C1SA 1WOUA 4YAPA 2MMNA 4FYUA 1XVQA 3WT2A 5J9BA 5IMCA 1NSWA 4FO5A 4MLYA 3VLNA 2R4VA 4TR3A 2REMA 2VL9A 5C04A 3M0FA 4V2NA 4WR4A 4ZL7A 2K8VA 3V1WA 2B7KA 1XXUA 1K0CA 1A0RP 1B4PA 3ZREA 3O3TA 5JWQB 2GQKA 4KA0A 2YV7A 4XRDA 4KB3A 2CZ2A 4ZL8A 3ZYWA 1WMJA 2DJ3A 2VL3A 3S9FA 1G7EA 2NBSA 2LRNA 2H76A 5A5KA 2HSYA 3BCKA 1UVZA 1YEXA 1LBKA 2PBJA 3TOTA 3QDNA 1VF1A 3LORA 3NOFA 2YJHA 2JL4A 5DCHA 5A4UA 3I43A 5DALA 2MZCA 1A23A 2N5BA 1U88A 2ZNMA 1DE1A 1G6WA 3KP9A 2BJXA 2LV3A 3LJRA 5IMDA 3F4SA 4GTUA 4QL7A 2L4QA 3D0ZA 4MZCA 5HR1A 3ZMKA 3VWVA 3KEBA 4TN8A 4MF5A 4IJIA 3LXZA 1X9MB 2DLXA 4P3YB 4X1UA 3CSIA 3KXOA 5DVBA 4PUAA 4NAXA 1LJRA 4I8BA 2V2GA 2C3TA 2GLRA 5EL8A 3QFAC 3U5RE 4IHUA 3VPQA 1FVJA 3TGZA 5ECQB 3KMOA 5EVOA 3EVIA 5E59A 1XWGA 3LGCA 2H66A 4CW9A 1GRXA 2P0GA 3IRAA 2LEGA 2XHFA 4V2LA 4KNDA 9GSSA 4ECCA 3VWXA 1X5DA 2F51A 3ZFBA 1YKAA 3GX0A 3VK9A 3EU3A 1SKSB 3D22A 1V40A 2LRCA 3FR6A 2LRTA 4EE0A 4MF6A 1EV4A 1SD9A 2LSTA 3CBUA 3KTBA 1GSSA 5H5RA 2NVLA 4KSOA 3LQ7A 1EGOA 1EEMA 1B4QA 5CRDA 1N2AA 2DMMA 5DQSA 3TUEA 2OE3A 3WGXA 4GSSA 5DAKA 4FYCA 3RBTA 4IBPA 4POBA 1VRSD 4WBJA 2CA8A 1J9BA 1X0RA 4ILFA 2C8UA 3IR4A 3FYGA 4LMVA 1A2LA 5CYYA 5AIXA 5JCWA 5CNWA 1TW9A 1M9BA 2HNLA 3N9JA 1BX9A 5B8BA 2CT6A 1K0BA 3EC3A 2D2ZA 5H5QA 3TKSC 2C4JA 3LFLA 3F4TA 1VF4A 4BPYA 3F4RA 5J4UA 3HYPA 3IXRA 1T1VA 3LYKA 2BTOT 3KZQA 2AJQB 2FLSA 2DMLA 3EYTA 4XRAA 2QSIA 1CQHA 2RUEA 4GF0A 4XS4B 3UL3A 3D4MA 4N0ZA 3ZITA 1YKCA 1ZGNA 4JU5A 2JSYA 4OFMA 6GSXA 4HJ2A 1YF1A 4XS6A 4LMWA 1K3LA 17GSA 4I2TA 4QL9A 3W6GA 3P90A 5AGYA 3TKSE 4TR0A 4IGJA 4ZB8A 1SJ6A 3UVTA 1X9SB 1WP0A 5J3RA 1YDKA 3VI5A 4GRFA 1G6YA 2X8GA 1TI1A 5D9VA 4MP4A 3IPZA 5DDLA 4G2EA 1HYUA 1E6BA 3UJ1A 4ECIA 4Q5QA 4XIHA 5LD0A 2FHEA 1O7UA 2H71A 1XBSA 1SJIA 1OC9B 4D73B 2YV9A 3GNJA 2WDUA 4ZBDA 3VWWA 4AJ8A 1TRSA 1OE8A 1EOGA 3KIJA 5J5NA 3BCIA 5G1KA 3EE2A 5GAPD 2GSQA 4K2DA 3CSJA 3RHBA 2XC2A 3DWVA 1EWXA 1GH2A 3US3A 3LSZA 2OBKA 4L8EA 3G7YA 2DJ1A 1GLPA 1YEPA 3WGDA 2JZRA 3C7MA 2L5LA 1OE7A 1MD4A 4PNGA 2V1MA 4HZ2A 4KDYA 1M2AA 1GNWA 2B3SA 1SK1A 2VLTA 3A2VA 1ON4A 3HVVA 2GZYA 3WT1A 3APOA 1F37A 4G19A 3RPNA 3QR6A 3E9JB 3ZIJA 2RIIA 3IE3A 1PKWA 1RW1A 1PX7A 5CP1A 4K9ZA 2YWNA 2L6CA 1Z7PA 4EF0A 4AGSA 4PXOA 2LQQA 2N5AA 3IBHA 4KUNA 4PUFC 3CXGA 1FHEA 1XW6A 2IWTA 2LS5A 3W8JA 1HD2A 1XWAA 2YZHA 4N0VA 2MYGA 2ALBA 5AN1A 2LJKA 1GULA 1EP8A 3GH6A 3TJKA 3GA4A 4TXVA 2OE0A 3CTFA 3GKXA 4HUAA 2JU5A 2OA7A 1V2AA 4ML6A 4L5LA 3EINA 4MPGA 2FWGA 4XS4A 5G31A 8GSSA 2P5QA 3TRQA 3F6FA 2IMFA 5B6MA 1TRUA 1GLQA 3GV1A 4TKYA 1QQ2A 3DIEA 2GZPA 2O89A 2H01A 3L9SA 3DYRA 1BYEA 5FWGA 4WXTA 6GSWA 1USBA 3IA1A 1UN2A 5AISA 1R5PA 5DQYA 1TJDA 3UAPA 1ERVA 2DJKA 3MSZA 3D6IA 2FNOA 1WJKA 3H1NA 3UEMA 2K6VA 1R5AA 3BOAA 1AQXA 3HKRA 3E3EA 4ML1A 2YNXA 1R7HA 3EMXA 3QCPA 2H30A 1ERTA 5IQYA 1YJ6A 3ZVJD 2E7PA 3HCZA 3G9BA 4ECJA 3ME8A 4O92A 3IHQA 2WRTA 4IP6A 5ABRA 1XWCA 1K3YA 3RDWA 3KJYA 5E4WA 4D73A 3VFIA 4H86A 2EC4A 2VLUA 2QGVA 4I5QA 4OCEA 5ECIB 1G7OA 3P7XA 1XCCA 1UA5A 5ID2B 2VO4A 1OKDA 2DSAA 1XIYA 2YCDA 3IDVA 1DE2A 1R26A 22GSA 2GVPA 4E8HA 4HQZA 3GUSA 4KE3A 4LA1A 1GSQA 4MJAA 3BJ5A 1F3AA 4MJBA 3FKFA 4N10A 1MDKA 4FIWA 1TRWA 1GSDA 4JEDA 3L0HA 2FA4A 3ED3A 4KH7A 2V6KA 1ZL9A 2H1DA 4WEYA 3QD9A 3HJOA 2I3YA 4WF5A 1G0TA 4KCEA 3EMPA 2WFCA 2FUG2 4MJCA 4K8MA 4IQAA 1Z6MA 1NW2A 3SWLA 4IQ1A 1C72A 5D9XA 5ECOB 4ID0A 1JZDA 3KTLA 3HDCA 5ECNB 4DEJA 4EXJA 3F8UA 3FZ5A 3UMAA 2K18A 2ZCTA 1N8JA 2GSSA 5DBQA 4YAVA 1O6JA 1WIKA 5JWOB 3UOMA 4TW5A 4N30A 4G10A 11GSA 4GXZA 1GWCA 2P31A 13GSA 4RQRA 3HVSA 5HFGA 2RLIA 2LJAA 2OKAA 3KH7A 4HU9A 3ISOA 2G0FA 1GSUA 2EIOA 4MK3A 2PUKC 2VL2A 3U6VA 4K6XA 2H70A 1B48A 1RK4A 4YQUA 3M9KA 1WE0A 4IELA 3GTUA 2H0GA 3F63A 4EO3A 1ZZYA 4XS1A 3VWUA 2AHEA 2DBCA 5KN1A 4NHZA 1PD21 3LXTA 4GLTA 2IMKA 2O87A 1K3OA 2VM2A 2WGRA 1PN9A 4O32A 4F0CA 4POMA 2HRFA 3TJFA 2CV4A 2H75A 1URMA 3CRUA 3J7Yk 5HR2A 3GSTA 1JFUA 4WF4A 4MZBA 5ECMB 2JZTA 2CX3A 4K0NA 3R2QA 1WPIA 1XPVA 3FR9A 5D8IA 3EU4A 4EKZA 4I6XA 5ID2A 2GT6A 1JZRA 2GS3A 4MDCA 4EUYA 1B8XA 4NV2A 4IVFA 1JZOA 2LUSA 2GQLA 2R5GA 3BD2A 4I97A 4OFNA 3GHAA 1H75A 2YPMA 1A2MA 1O8XA 2NPBA 5LNKe 3FRCA 1GSEA 1R4WA 3P8WA 2GSRA 5IMAA 3K8NA 2I4AA 2MBSA 3C1RA 1ZYQB 3GKMA 3F3RA 2A4VA 4KW6A 1JLWA 5IPHA 2JZSA 2L57A 1GUMA 3O76A 1EEJA 2YANA 3CRTA 4HI7A 4MPFA 4BL7A 1U87A 3L4NA 3KMNA 5GSTA 4TVEA 1FW1A 2B6MA 1A2JA 3FZ4A 1NHYA 3QFBC 5KN2A 1THOA 1M7TA 3FHKA 2H73A 1SYXA 2PMTA 4HDEA 3GH9A 1KBNA 4BWSA 1V98A 2PU9C 4XTSA 1FAAA 4HOJA 1BJXA 4HEA2 4F2IA 1W4VA 1FVKA 4RUVA 1M2DA 4KSMA 3NZNA 3C8EA 3IC4A 4PQ1A 2VCWA 2TRCP 2E2MA 3NIVA 5ECRB 3JCML 1TK0B 1QK8A 3MAKA 3IAM2 2MMAA 5ECSA 1AW9A 3O6TA 3HY2A 1X5CA 3IK7A 1THXA 2R6KA 5HFKA 2FGXA 4JR6A 2XPEA 1TTZA 4AJ7A 2C0FA 4X43A 3F3QA 2AV4A 3ZVJA 1ERUA 2IMIA 2H1AA 1XOAA 4L5OA 2E0QA 1EV9A 5F05A 4LL4B 1AC1A 1YY7A 4OO5A 4JE1A 2F8FA 2H1BA 1T4ZA 2J9HA 3LWAA 3J7Yb 2L6DA 3GYKA 1GTAA 2B5YA 1ST9A 1QUWA 2AUVA 4HZ4A 4IS0A 1A8YA 1ILOA 5JCUA 3GSSA 1T4YA 1PRXA 5IIZA 5KN3A 3H8QA 4ZBAA 1TU7A 1Z3EA 3Q18A 5CREA 3FZ9A 2P5RA 3HXSA 1BG5A 2X8CA 4KDXA 4OD7A 4K7NA 4N11A 1GUHA 3A3TA 4HJMA 2VCVA 2WULA 1QXHA 2H1GA 4GQFA 1TKDB 16GSA 5A4VA 3IOSA 1EZKA 1M9AA 1TK8B 4NWYA 2HXKA 4OCFA 1RQMA 3FY7A 3M1GA 2I1UA 1XVWA 2Z9SA 2VD0A 1U3IA 2HYXA 3QAGA 1X5EA 1IYIA 3GFKA 1JLVA 2HT9A 5DCGA 1SL2B 3QAWA 1OYJA 3H79A 4ZILA 5AIVA 1QFNA 4HS1A 4OWYA 3CSHA 5F8BA 2XPDA 4EC0A 3PGTA 2DIZA 1T8EB 3ERFA 4ZB6A 1ZYEA 3H93A 4QQ7A 4BWQA 4TR1B 1GTIA 2DJJA 1B9XC 1T3BA 5G2ZA 4F9ZA 6GSSA 3TJJA 3UVHA 1W89A 2VD1A 4HU7A 14GSA 4L0WA 1MD3A 3QOUA 4ZXGA 2ON5A 4PNFA 2C1YA 3WGEA 2OJLA 2H6ZA 4GWRA 3HHVA 4KDUA 2FD3A 1O85A 2YZUA 4ZL9A 2E2GA 3LYPA 1A8LA 1AQWA 2OACA 1DBYA 3DKSA 3TJBA 2CVKA 3WD6A 4L0UA 2JACA 1O8WA 4OFTA 1AUCA 2GGTA 5IO2A 3I69A 5IOXA 1PQNA 2WJUA 1F3BA 3GL3A 3MNGA 3Q19A 1OC8A 2JADA 4J56E 2AB6A 3CTGA 2FWEA 4IP1A 4Q5FA 1EP7A 1TU8A 1KNGA 1AQVA 1WRYA 3TRPA 5INYA 5HQPA 2H0IA 3DVWA 4BVYA 2M80A 3TKPA 1FO5A 5GSSA 4KX4A 3KD0A 1TRVA 1PKZA 1U6TA 2WB9A 3GURA 4DSRA 2FA8A 3QMXA 1CQGA 1PX6A 1OC9A 1OC3A 3GX8A 3GMFA 3F0IA 2HLSA 5DJMA 2IMDA 2IPAA 3WYWA 2B1KA 3G7JA 3KGKA 1UC7A 3D21A 4XCSA 1Z5YE 3TKRA 5D96A 3L9VA 3ZMLA 2I81A 5B6NA 1A24A 1Y6EA 5HR0A 1VF3A 2DJ2A 1PL2A 3M8NA 4NMUA 3HD5A 2ZUPA 2XBQA 5JWRB 3FZAA 1SL1B 1KTEA 1XW5A 1J0FA 5IPGA 1TP9A 3LG6A 1LU4A 3TRXA 3QPMA 1YQ1A 2NDOA 4EDYA 2DIYA 12GSA 5LCZA 3BBYA 4YH2A 1SK2A 1XFLA 2G2QA 1ACVA 3FR3A 2V41A 4NHWA 3I9V2 1F2EA 5CRHA 4TR1A 5DAKB 2BMXA 1E2YA 2A2RA 2KLXA 2HFDA 2KP1A 1SU9A 4G9HA 3GKNA 1V58A 3N5OA 1BEDA 3CMIA 2GT5A 3UARA 3E0UA 2KHPA 3TKSA 1VGLA 2YWMA 1GSFA 1A0FA 1HQOA 1GTUA 2WZ9A 1OKTA 3M9JA 5ELGA 3HJMA 2OBIA 1NM3A 3DVXA 3KCMA 3KP8A 1S3AA 4CHSA 3C71A 2PGTA 1S3CA 2H19A 5IM9A 4YQMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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