1R26A

Crystal structure of thioredoxin from trypanosoma brucei brucei
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
113
structure length
113
Chain Sequence
IRMRARYPSVVDVYSVEQFRNIMSEDILTVAWFTAVWCGPCKTIERPMEKIAYEFPTVKFAKVDADNNSEIVSKCRVLQLPTFIIARSGKMLGHVIGANPGMLRQKLRDIIKD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Thioredoxin
publication title Structure of thioredoxin from Trypanosoma brucei brucei
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma
molecule tags Electron transport
total genus 32
structure length 113
sequence length 113
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1r26A00
1UN2A 2C3NA 1SL2B 5J41A 3VPQA 2PBJA 2ES7A 5H5RA 5HR1A 3MSZA 3EC3A 3E9JB 6GSTA 2H6ZA 4K7OA 5EY6A 2C0EA 4IBPA 1SJZA 1OE8A 2GZPA 5E59A 3WT2A 3I69A 1EEJA 5D9TA 1DE2A 3HJPA 3LEFA 2DBCA 2L5OA 1W4VA 3QOUA 1ABAA 2H72A 1FW1A 2C0GA 3L9UA 2FD3A 1B4QA 4J56E 1PX7A 1FG4A 5IOWA 3N9JA 1JZOA 4POMA 4YQUA 4K0GA 2H0HA 2CA8A 2LUSA 2ZNMA 5F07A 2LQOA 2C8UA 4HJMA 4HEA2 4MJCA 2H66A 2LSTA 4LL4B 4TXOB 3VLNA 2IWTA 2GSQA 4FYUA 2BJXA 2FA8A 2QC7A 3ERWA 2H6YA 4KDXA 2MYGA 2ALBA 4G19A 3DD3A 2P31A 2C4JA 3WD6A 3ZVJA 2C0FA 1YKAA 2ZCTA 3CTFA 5JWOB 4KGIA 3O76A 5F06A 4OD7A 3IRAA 3SBCA 1PX6A 2CX3A 4QL9A 3F8UA 5IQYA 4D73B 5IMAA 1ON4A 5DALA 2REMA 2M46A 4KCEA 1XW9A 2IPAA 4FIWA 3LQ7A 5DQYA 5B7CA 1FB0A 3QAGA 3ZYWA 4Q5FA 3E3EA 4FO5A 4ZB8A 2G0FA 3K8NA 3APQA 1WJKA 1S3AA 4G2EA 2LNTA 4V2NA 3RBTA 1GTBA 1GNWA 2IJYA 2A2RA 1SKWB 2YN1A 2LTKA 3VURA 1QK8A 1THXA 4H86A 3TJFA 5G5FA 5IMDA 1AAZA 2H1AA 3G9BA 3C1SA 5DJMA 1N2AA 2YJ7A 5HR3A 2VM1A 1YQ1A 1XBSA 4AF2A 1MDJA 4KUNA 4F03A 3KGKA 1U6TA 1OC8A 4WF4A 1V2AA 2CT6A 11GSA 2LJAA 4WF5A 2RUFA 2GT6A 1X5EA 1JZDA 5CRDA 3W6GA 2OACA 4L5OA 3QR6A 4EXJA 2OA7A 4MZCA 2H6XA 1K0BA 1VRSD 4PQ1A 3F4SA 3GURA 1VF4A 1BAYA 1F3AA 3UVTA 4IKHA 3UOMA 2B7JA 4X0XA 3HKRA 5G1KA 4IS0A 4XHMA 3IAM2 3APSA 3IDVA 1A0FA 1PL1A 1SJIA 3VK9A 2N5FA 3LGCA 1K3LA 1M2DA 1E6BA 1EV9A 3GKNA 4RUVA 3V1WA 5ECNB 3F4RA 3TKQA 1MDKA 2IN3A 5CNWA 5B8BA 6GSVA 4IELA 2R6KA 2MZCA 5HFKA 2C80A 4JZQA 1V98A 5FT3A 5J5NA 4ML6A 3LYKA 5L71A 2CVKA 3EMPA 5DVBA 2HI7A 2JZTA 4LMVA 1ERUA 1OC9A 2PVOC 4HOJA 1N8JA 2X64A 3HZ4A 1HQOA 4V1Ap 2M80A 2DSAA 2L4CA 5A5KA 1XZOA 2AB6A 4PUAA 3P8WA 2WS2A 4CHSA 1SL1B 3EMXA 1AUCA 2YV7A 1F2EA 1S3CA 1J0FA 2DMLA 6GSUA 6GSSA 1YF1A 3A3TA 3ZL5A 9GSSA 5IMZA 2F3MA 4WR5A 3KH9A 2DJ0A 3RHCA 5GSSA 3L0HA 1GULA 2JSYA 2MBTA 3VPTA 2WFCA 1WE0A 3KCMA 4ZXGA 1OYJA 1X9WB 4PNGA 1J08A 4RI7A 2C3TA 4IP6A 3APOA 3C73A 4TN8A 3TKRA 2PPTA 2HRFA 5ECKB 2P5QA 1EWXA 4GSNA 5ECPB 3SWLA 1A0RP 1PKWA 1TU7A 4KCAA 4N30A 1MEKA 3FK8A 3MAKA 4K1FA 3HY2A 3FR3A 2I3YA 3FKFA 4MP4A 1XVQA 1EGOA 3H93A 3DMLA 2GZYA 2CVBA 1TRVA 2J23A 3U6VA 2K8VA 5ABRA 4BL7A 3HJOA 4ECBA 2C0DA 2LRTA 3TOTA 5B8AA 1M2AA 3RAZA 4XS4B 3FRCA 3TOUA 2IFQB 1H4OA 4XS6A 2GQKA 1YY7A 1MD3A 1G0TA 4F0BA 1K0OA 1ZGNA 4X43A 1EGRA 1X9SB 4NWYA 5DCGA 3FZ5A 5D9VA 4DSSB 4WBRD 2HLSA 4IVFA 5D8IA 4DVCA 2WGRA 2Z9SA 5AIVA 3EURA 1GUKA 2E7PA 2NVLA 1M99A 5H5QA 5INYA 2YCDA 2I4AA 1SYXA 4FYBA 4POLA 2KLXA 5A4VA 2GGTA 1PD21 1B48A 4F9ZA 3ED3A 3RPNA 4KX4A 3VI5A 3JCML 3J7Yb 1O6JA 1T4YA 4L0UA 4V2MA 3KMNA 3IR4A 5G5EA 2K6VA 1TRSA 1K0AA 2VO4A 4EO3A 3RHBA 4KAEA 5GAPD 4MH3A 4JR4A 2LQQA 2R2JA 4GQFA 4POKA 2EIRA 3ZTLA 1SKSB 2JSZA 4P3YB 8GSSA 1XWCA 2OBIA 5IMFA 4GSTA 2L6DA 4AJ6A 1PL2A 5IO2A 3FYGA 1BG5A 2OE3A 3A2VA 2F8AA 3GFKA 2L6CA 4MJAA 2KP1A 2JACA 1R5AA 3FR9A 1HNBA 2MMOA 3IBHA 1DBYA 3ZIVA 4ECIA 4TR1A 4MZWA 1PN9A 3GKXA 3TGZA 4CDOA 2H71A 4ZIJA 2LRNA 2H1GA 3I9V2 3HDCA 3UL3A 4ECJA 2VLVA 2E0QA 5FWGA 5ECIB 3LSZA 4JU5A 2H1DA 4TW5A 1RQMA 1GL8A 3BCIA 4YAVA 3CSJA 3IOSA 5J4UA 2H1BA 2WULA 2WDUA 1XWBA 4ECCA 4N0ZA 4X1UA 1HNAA 1ZMAA 4ZBDA 3M0FA 2DJ2A 3GL3A 1T7PB 4J2FA 1NHYA 2ZUPA 1X5CA 4GLTA 3TRXA 2GQMA 4WETA 5LCZA 1U3AA 4KW6A 4AGSA 4WBJA 1QUWA 1O7UA 2X8CA 1EOHA 3KP9A 1NW2A 2B6MA 1S3DA 3D22A 2D2ZA 3F63A 1EZKA 3H1NA 4MABA 1RK4A 4ILFA 1TTZA 5KEJA 1WOUA 3QAWA 2K8SA 2OE0A 1M9AA 1GSFA 2ON5A 2PU9C 1GTIA 1KEBA 5DBQA 1QMVA 4JE1A 2YZUA 3M8NA 1RW1A 1A2LA 2DJ3A 1DUGA 5F0GA 1YDKA 3AY8A 3FY7A 5ECMB 1T8EB 4I97A 3KH7A 2V6KA 3LYPA 3R2QA 2N5AA 3F9UA 4CW9A 1YJ6A 1TKDB 1M0UA 1F37A 1BEDA 4EL1A 1TDIA 2VL3A 4IQ1A 4XRDA 1XWKA 1SL0B 2M72A 1TOFA 2AUVA 4OFTA 5CRWA 5D73A 3TB2A 4XRAA 1R4WA 3VWXA 5AGYA 4WR4A 1XOAA 4YQVA 4GCIA 5CRGA 2BMXA 1AQWA 3HA9A 2NDOA 5KN2A 1YEPA 2K18A 2YOIA 1DE1A 10GSA 2H73A 2L5LA 4AJ8A 3EVIA 3GSSA 3BJ5A 3C71A 1AC1A 2LJKA 1AW9A 3ERGA 4F0CA 2EIQA 4N11A 2OBKA 5ECRB 4HU9A 6GSXA 3A2WA 3GV1A 3GIXA 1R26A 2KUCA 4NV5A 3TJBA 2L57A 2VCTA 5AIXA 2PMTA 3WGEA 2L4QA 2MBSA 3EYTA 1ACVA 5CAXA 3TDGA 2KHPA 2WB9A 3H8QA 3HJMA 1Z7PA 5AISA 3OR5A 3QCPA 5ECHB 3PGTA 2OE1A 5KN0A 4YH2A 4WXTA 5CYYA 4BPYA 1JHBA 1JZWA 4FH8A 3HYPA 3GUSA 1K0MA 1M7TA 3CXGA 1KNGA 3ERFA 1BX9A 5ECQB 5IMCA 1GTUA 2ON7A 1A2JA 3CYNA 3A5WA 1JZRA 1TRWA 5DAKA 4TRXA 2XPEA 1OE7A 4Z7XA 1G7OA 3CMIA 1A8YA 3WGDA 17GSA 4K9ZA 1B8XA 1A8LA 5F8BA 1BJXA 3DKSA 1AXDA 1ZL9A 2DC5A 2YWMA 1AQVA 2DJKA 2DMMA 4GRFA 4OCFA 1PGTA 3TKSC 2DLXA 4MCUA 4TXOA 5B6NA 3IE3A 2LS5A 4ZL7A 3TJJA 2YPMA 3M9JA 3HD5A 4ZB6A 5IPHA 1DSBA 4KSOA 1Z5YE 4E8HA 1WPIA 5JWRB 3QAVA 3BD2A 3CRUA 5ECLB 3UVHA 5ID2A 1B9YC 3KTLA 2XPDA 3VI7A 2WRTA 5JCWA 20GSA 5HR2A 2HXKA 3IXRA 3VFIA 1R5PA 4IW9A 2LKUA 2CX4A 4QQ7A 4IP1A 2B3SA 1R7HA 3EE2A 3TJGA 1WIKA 1SK1A 4QL7A 4BWSA 3LXZA 2WCIA 2F51A 3KZQA 2FLSA 3TCOA 1V58A 2PN8A 2QSIA 1GSUA 1ST9A 1BQ7A 2I1UA 4F2IA 2B5YA 3F4TA 4I8BA 3KMOA 3M1GA 1A24A 4OFNA 3GX8A 5IPGA 2L59A 1PMTA 1U87A 3VWVA 4EUYA 3QMXA 4E8EA 5IIZA 3QD9A 1JLWA 5H5SA 3C8EA 2PGTA 2AAWA 2PWJA 4OWYA 3ZIJA 2MMAA 4JR6A 4MK3A 2TIRA 1YZXA 2XC2A 1VF1A 4G10A 3P90A 2GSRA 5G1LA 2KOKA 2WZ9A 4NV2A 3LJRA 2IIYA 1Z3EA 5KN1A 4BA7A 3WGXA 2FWFA 5LNKe 1ERVA 3GTUA 4LMWA 4PX1A 1ZYQB 2HT9A 3GKMA 1TK5B 4HJ2A 3L9VA 2N5BA 1G7EA 5G31A 2IMIA 4TR0A 5EL8A 2DJ1A 3L9SA 1PRXA 4OMVA 1GUHA 2JADA 4ZL8A 2HSHA 2H0IA 1KBNA 3DEXA 1VF3A 5HFIA 4PGTA 4WKWA 2RLIA 3S9FA 1TK0B 1GSQA 1T4ZA 4EKZA 1I9DA 2GT5A 4EF0A 1SD9A 3ISOA 3CTGA 2R3XA 2DJJA 3BBYA 3F3RA 2VL2C 3E0UA 3Q19A 3DRNA 1H75A 1YKCA 4HUAA 4K2DA 2TRXA 3M9KA 2YANA 1HD2A 1XIYA 3RDWA 1EV4A 2H19A 1SK2A 2EC4A 1SJ6A 3TJKA 4KNDA 1SD8A 3LFLA 2H8LA 3HXSA 3KJYA 5D93A 1K0CA 1XWAA 2AV4A 2LNSA 3TRPA 4GTUA 4TR3A 3F3QA 5A4UA 1T00A 2VD0A 3FZ4A 1ILOA 2GZZA 4PQHA 2DIZA 5DJLA 1T1VA 1UC7A 1TJDA 3H4KA 3KM6A 1PQNA 1FVKA 2HYXA 1BYEA 2HE3A 4MMMA 1SK0A 3DGQA 4EDZA 5HFGA 2HZEA 3W8SA 2VAFA 3GN3A 1XOBA 4MF5A 3UAPA 5DALB 4JRRA 4N10A 3Q18A 2HSYA 1F6MC 2FNOA 3ZLPA 3A2XA 2NTOA 2YJHA 4ZBBA 4I5QA 3DYRA 2B7KA 3DVXA 7GSSA 1THOA 4MPFA 3IAS2 4RI6A 4HI7A 3PR8A 5DDLA 1PA3A 2A2SA 2CZ3A 6GSYA 2O7KA 2RUEA 4K7NA 4HZ4A 22GSA 2V41A 3MWHA 4LA1A 2IFQA 2CZ2A 2QKEA 5ELGA 1K3OA 3ZMLA 4XTSA 3Q6OA 3RPPA 3O6TA 1FO5A 4BWQA 5JCUA 2E2MA 2VLUA 2GSSA 3I43A 2C3QA 4BVYA 2YP6A 3KTBA 3ZITA 2GVPA 4MF7A 1Z7RA 4DSRA 2CV4A 4DSSA 2I81A 4AJ7A 2VCQA 3GSTA 2XBIA 2X99A 3UARA 1M9BA 1QGVA 2H0GA 3QPMA 4IJ3A 2H01A 1Z9HA 5HQPA 2E2GA 2RIIA 3GA4A 5J9BA 3GHAA 3BCKA 1PKZA 4RQRA 2LEGA 1TU8A 1V57A 1WRYA 3VWWA 3MNGA 5J9CA 2XHFA 3G7JA 3HZ8A 3IC4A 4XCSA 4ZL9A 3KD0A 3F0IA 3C7MA 1SU9A 5DAKB 1NSWA 4LL1B 3FHKA 19GSA 12GSA 4GF0A 4OFMA 13GSA 1PSQA 5D9WA 3VWUA 1QXHA 2FHEA 2C1YA 6GSWA 2X8HA 4BVXA 1O85A 1GNEA 2VUPA 3ZZXA 1ZCPA 2FA4A 3KP8A 1MDIA 4L8EA 1WP0A 3NZNA 4EVMA 4KE3A 1SKRB 1TK8B 1GLQA 2RM6A 2YWIA 3FZ9A 5C04A 5IM9A 5F05A 2JL4A 1LJRA 1VF2A 4JEDA 2HFDA 1OC9B 3CBUA 4ZB9A 1GUMA 1UA5A 3IPZA 1A23A 3WYWA 2GQLA 1EP8A 1TXXA 2GS3A 1E2YA 2H74A 5ID2B 2O8VB 3BOAA 1G6YA 2R5GA 2GTUA 3QFAC 1FHEA 4MPGA 2V2GA 1EP7A 5G30A 5EPFA 1U3IA 2CQ9A 1A2MA 4KSMA 4HZ2A 1V9WA 4I2UA 3G7IA 2O85A 4IQAA 1X9MB 2X8GA 3GMFA 3PINA 3IK7A 3UBLA 5CREA 4XIHA 3I6AA 4OO4A 2VIMA 4N0VA 2VCZA 4O32A 3D21A 3GKKA 3UJ1A 4ML1A 2NBSA 1WMJA 1F9MA 1Q98A 4TOPA 1KTEA 3FZAA 2OJLA 1TRUA 2B5EA 4G9HA 2MMNA 4ID0A 4JBBA 2OKAA 4DSQA 3J7Yk 4GSSA 5HR0A 4PQIA 3GYKA 2B5XA 3EU3A 4L0WA 3UEMA 4GWRA 1NM3A 1ERTA 1J9BA 2HZFA 4K6XA 3ME8A 1WWJA 3UIWA 3DWVA 1GSEA 3ME7A 2VCXA 4MDCA 4MLYA 3CSIA 5C00A 1SENA 5ECSA 3ZREA 4ISDA 1USBA 2H76A 1EEMA 2PVQA 3DXBA 1AIUA 1FOVA 3IA1A 3ZMKA 2LJRA 4MH2A 1X5DA 3GH9A 3W8JA 3GTUB 1Z6NA 3F6FA 2KP2A 2YV9A 4WEYA 2FWGA 2CVDA 1GLPA 5A4WA 3KEBA 2QGVA 3DVWA 4TR4A 4NMUA 2DIYA 3D5JA 3GL5A 3KXOA 2WJUA 3EU4A 1FB6A 3M3MA 5GAND 2TRCP 2GDRA 1Q4JA 4KDYA 3U5RE 5D9XA 1VGLA 2IMFA 2AJQB 3DIEA 3UBKA 2CAIA 1O8XA 1GWCA 3HVVA 2A4VA 5DQSA 1F3BA 4MA9A 4MJEA 2VD1A 2I9HA 5IOXA 4ZILA 2VL9A 2J9HA 4EC0A 4D73A 2FWEA 1ML6A 2IMKA 2YWOA 3TKPA 1YF0A 1QFNA 5JCGA 3LORA 4O7HA 4YQMA 1JLVA 3D4TA 3US3A 2GLRA 2O87A 3HVSA 2OADA 4TVEA 5CP1A 4PUFC 2R4VA 4PNFA 16GSA 2P0GA 1MTCA 4OO5A 4NAXA 3CRTA 5CO3A 5B6MA 1TP9A 4F82A 2JZSA 2F9SA 2GSTA 4TR1B 3HVXA 3UMAA 1W89A 1GP1A 1TI3A 3TKSA 3F6DA 1K0NA 2LV3A 3ZRDA 3N5OA 3HCZA 3WT1A 1K0DA 3KIJA 5GZZB 1IYIA 2LRCA 2HZEB 1TI1A 4EDYA 3D4MA 1OAZA 3EWLA 2P5RA 4ULXA 3ZFBA 4KDUA 1Y6EA 3H79A 3FR6A 1UVZA 3G7YA 2AYTA 4HQSA 4V2LA 4HDEA 3GNJA 4POBA 4IGJA 2FGXA 4NXIA 1XCCA 4IHUA 1JFUA 4ZBAA 4GXZA 1LU4A 3L78A 3FEUA 3EINA 2FWHA 3LWAA 2B1LA 1O8WA 3C1RA 2VOCA 4Q5NA 4TKYA 2FUG2 2AHEA 4L5LA 4NPBA 5FHIA 4K8MA 1GRXA 3QFBC 2JU5A 1XW5A 3QDNA 1CQGA 1URMA 1XXUA 1G6WA 1K3YA 1XWGA 2XBQA 2V6OA 3D0ZA 3P7XA 2HRNA 3TUEA 2MMZA 4NHWA 1Z6MA 3ZFLA 1EOGA 4HQZA 3LXTA 4KB3A 4YAPA 2YWNA 4O5RA 3TKSE 1TW9A 2RM5A 4MJBA 2NPBA 1GH2A 1GSSA 1OKTA 4FYCA 5ENUA 3IHQA 1B9XC 2IL3A 3NOFA 4DEJA 1XW6A 1U88A 2G2QA 2YNXA 2VCWA 1LBKA 2B1KA 4ACSA 2VM2A 3HHVA 3IV4A 1XFLA 4O92A 3D6IA 4IJIA 1SYRA 1ZZYA 1X0RA 2PERA 3ZVJD 4I2TA 1OC3A 4K0NA 1QQ2A 1IYHA 5G2ZA 1NHOA 1O73A 1HYUA 1XPVA 2FY6A 1AQXA 4HS1A 3GX0A 4TXVA 1XVWA 4IN0A 2PUKC 4K7IA 2YZHA 4V1Ag 4NHZA 1GSYA 2H75A 4XS1A 3Q74A 5IMVA 5E4WA 5D96A 3GH6A 5COHA 1CQHA 5EVOA 4J57E 4EE0A 5ELAA 1I5GA 2VLTA 2IMEA 3PH9A 3IK9A 4KA0A 4LLRA 2V32A 1HNCA 1OKDA 5ECOB 2F8FA 4I6XA 5J3RA 5IO0A 4Q5RA 2JZRA 1GTAA 1ZYEA 4OCEA 1B4PA 2IMDA 4Q5QA 2VL2A 3L4NA 14GSA 3FW2A 2H70A 4PXOA 5CRHA 2R37A 1FVJA 5LD0A 4PURA 4XS4A 2O89A 1FAAA 18GSA 1ERWA 1O81A 2K9FA 2VCVA 3CSHA 3NIVA 2H30A 2V1MA 1MD4A 3TRQA 3P2AA 1OVNA 1V40A 5JWQB 2HNLA 1C72A 4MZBA 5DCHA 1GSDA 3LG6A 2FCHA 5KN3A 2EIOA 1ZOFA 2BTOT 4MF6A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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