1R26A

Crystal structure of thioredoxin from trypanosoma brucei brucei
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
113
structure length
113
Chain Sequence
IRMRARYPSVVDVYSVEQFRNIMSEDILTVAWFTAVWCGPCKTIERPMEKIAYEFPTVKFAKVDADNNSEIVSKCRVLQLPTFIIARSGKMLGHVIGANPGMLRQKLRDIIKD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of thioredoxin from Trypanosoma brucei brucei
pubmed doi rcsb
molecule tags Electron transport
source organism Trypanosoma
molecule keywords Thioredoxin
total genus 32
structure length 113
sequence length 113
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1r26A00
2M46A 1NSWA 4J57E 1SKSB 5FHIA 4X0XA 1B48A 1LJRA 2XHFA 2I3YA 4POMA 2QC7A 5CRGA 1LU4A 4D73B 5J41A 1A8LA 4IN0A 1ERTA 2V1MA 3VLNA 1XPVA 1GLQA 4N0ZA 5AIVA 1VGLA 2GTUA 2LTKA 2XBIA 2LUSA 1ZOFA 3G7IA 3KH9A 3MAKA 2HE3A 4Q5RA 2AB6A 5DVBA 2GS3A 4IGJA 4WEYA 1AQXA 2HI7A 1EOGA 4PNGA 1M2DA 3E3EA 2DIYA 2B5YA 5G5EA 3IR4A 1CQGA 3VPQA 3DXBA 3C1SA 3C7MA 1VF2A 1H4OA 5C00A 3UBKA 3LEFA 4IJIA 2H8LA 1ZMAA 2ZNMA 3FRCA 5KN2A 18GSA 3BOAA 4IELA 2K18A 3D4MA 3TRQA 1OE8A 3BD2A 1ERUA 2RUFA 4ZIJA 2JZSA 4FH8A 4KDXA 2C0EA 4RUVA 2PWJA 4AJ7A 2YWOA 5DQYA 3DEXA 2IIYA 3GKKA 4HEA2 4POBA 3DVWA 1IYIA 4ZL8A 1GSUA 1ZYEA 4PX1A 4LL4B 2OJLA 4V1Ag 2FWGA 1GP1A 4TR3A 2H6ZA 3FZ5A 5G1KA 4K0NA 3CTFA 1URMA 1TK5B 4WBRD 4IW9A 1WE0A 1XBSA 4IP1A 1GNEA 4MJAA 3H4KA 3I43A 2YJ7A 5A4UA 4Z7XA 4HUAA 4YAVA 4DSSB 3GMFA 1K0OA 3M3MA 6GSSA 3KP9A 1GUHA 4IBPA 4OCFA 4LA1A 2H70A 2GZYA 5IO2A 2V6OA 4EC0A 2HZFA 1WOUA 2VOCA 3QD9A 3TOUA 3NOFA 3TKRA 2WFCA 4PQHA 1YJ6A 3TRPA 2OBIA 3DWVA 4JU5A 1Z7RA 3IV4A 4TXOB 1T1VA 1K0MA 2HRFA 1V40A 3TDGA 5GSTA 4ZB6A 4HU7A 2DIZA 3UARA 2DMLA 3Q18A 2VO4A 5D9VA 1NM3A 3F6DA 1SYXA 3C71A 5IPGA 2HZEB 1A2JA 1ERVA 3FHKA 4KA0A 2YWNA 1R5PA 3W6GA 2A4VA 3FEUA 4ML6A 2B7KA 2YPMA 2OKAA 3CRTA 1T4ZA 4XTSA 1ST9A 2MZCA 1J0FA 2DLXA 1DUGA 1SK1A 1V98A 5IOXA 2K6VA 2DJ0A 5G30A 2H19A 1T8EB 1HNCA 4XS6A 4G9HA 1K0CA 1PRXA 2VCTA 3VWUA 1B4PA 2M72A 1ERWA 4E8HA 1K3LA 1NHOA 1S3DA 3A2VA 3I69A 4LL1B 4J56E 4QL9A 2GDRA 4XIHA 2VAFA 1FVJA 2WDUA 1ZGNA 4MK3A 3R2QA 2H1DA 4JRRA 3FZAA 4D73A 2IMFA 2H6XA 3D6IA 5IMDA 1Y6EA 3CBUA 3ZZXA 4CHSA 1X0RA 2VCQA 1TRVA 4LMWA 1ON4A 3IA1A 4GSSA 5J3RA 2H66A 2WB9A 5JWRB 4KGIA 2P0GA 1GTIA 4L0WA 3TB2A 1YY7A 5ECKB 4JEDA 1WMJA 1RK4A 3DD3A 3UBLA 4DEJA 1SD9A 3M1GA 1PN9A 2CVBA 5J4UA 4IHUA 5HFIA 2FGXA 1TU8A 4ID0A 2VD0A 1Q98A 1KBNA 1A0FA 3GYKA 4K8MA 2R6KA 2DMMA 2VIMA 3UVHA 5JCUA 4ISDA 1B4QA 2HFDA 3UJ1A 5CNWA 3TKQA 4NAXA 4NPBA 2V6KA 1X5CA 2YN1A 1W4VA 2AJQB 2ON5A 3E9JB 3M9KA 4OWYA 1GLPA 1JLWA 4L5LA 2JACA 1BJXA 3KGKA 1KTEA 3ME8A 3F4SA 4NV2A 1V57A 1A24A 1TDIA 14GSA 2H1AA 3WYWA 1WIKA 2WJUA 3TRXA 3MSZA 2LRTA 3ZTLA 1FHEA 3GHAA 2LEGA 3GX0A 2I1UA 2V41A 3S9FA 1THOA 1PGTA 1YKCA 1XWAA 3UEMA 3D21A 4V1Ap 1F6MC 2MMZA 1Z7PA 2LQOA 1O8WA 5D8IA 5J5NA 5JWQB 2YZHA 3LG6A 1AQWA 4MF7A 4WR5A 4BVXA 4HZ2A 4QL7A 5D73A 3EU3A 2IMDA 2RLIA 1JLVA 3CYNA 3TCOA 2PBJA 4DSSA 2J23A 1OE7A 3WGXA 1SD8A 1R7HA 5GSSA 6GSXA 4KNDA 2GLRA 20GSA 2WGRA 5DDLA 3HVXA 2GQMA 4IKHA 3TKPA 3GKNA 1FB6A 4HJMA 2H6YA 2QKEA 1SKWB 3KXOA 3F63A 4HU9A 2GSQA 2JSZA 1E2YA 3KMOA 4TXOA 3FW2A 3HY2A 3PH9A 1NW2A 2KHPA 4TR1B 4GTUA 4X43A 2KLXA 4ZXGA 3ERGA 4AJ6A 5DALB 2G0FA 2LRNA 4OO4A 3DKSA 3O6TA 2AUVA 2XPEA 2LJRA 1JZDA 2VL2A 3KP8A 1GSEA 4FO5A 2CVDA 2E7PA 2HZEA 5CO3A 2CA8A 2IMEA 2VCWA 2L6DA 4V2LA 5IMCA 2B7JA 4NHWA 1B9YC 3GL3A 4JR4A 2DJ2A 3F3QA 4RI7A 1AAZA 4TVEA 3UMAA 1TK0B 1DE1A 3FY7A 1TRSA 4DSQA 1BG5A 2X8HA 6GSWA 1MTCA 1GNWA 1M9AA 3I6AA 5IMFA 5B8BA 2C0FA 2LSTA 4MJBA 1A2LA 4FYBA 1EP8A 5KN3A 1FG4A 1A8YA 1TW9A 4K0GA 2HNLA 3F8UA 3N9JA 3VK9A 1M0UA 1VRSD 1TI3A 2ES7A 3KD0A 4N0VA 1QGVA 1HNAA 1K0DA 1GSYA 3ZMKA 3RBTA 2VCZA 2BMXA 3HCZA 3L78A 1THXA 5H5RA 1OYJA 1XWCA 2TRXA 3EINA 3DVXA 1N2AA 5INYA 5F07A 2I9HA 2VLTA 4P3YB 5DJLA 4KCEA 4TN8A 1GTUA 4KE3A 3GIXA 1OC3A 19GSA 4OD7A 1DBYA 2H73A 2TRCP 3ZMLA 3KTLA 1EV4A 1EWXA 2MMAA 1F37A 1R4WA 1W89A 1F3AA 3K8NA 5G2ZA 4BWQA 4EKZA 5J9BA 2C1YA 5C04A 2R2JA 3LYPA 3UOMA 1WP0A 5CYYA 1DE2A 2DJKA 3CSJA 2YZUA 3GNJA 3GUSA 1SJZA 2IL3A 1SJ6A 2YCDA 4ULXA 6GSUA 5KN0A 3WT1A 4XS4B 2E2GA 3UL3A 1TU7A 4ZILA 1G7EA 5HFGA 3OR5A 3HJPA 4RQXA 2R37A 5ELGA 1Z5YE 2PN8A 2CX3A 3P8WA 4L0UA 2C80A 4I97A 4KSOA 4WBJA 2QSIA 1ZL9A 3TJFA 3EVIA 1GL8A 1ZCPA 4IQAA 1PL1A 4PXOA 2H76A 5FWGA 4GQFA 1EP7A 5KEJA 4TOPA 4JZQA 2ALBA 2I81A 4HDEA 5ECSA 3KM6A 3ZREA 5ENUA 2DSAA 3L9UA 4OMVA 3TKSE 1U3AA 4I6XA 3ZL5A 3DGQA 1PSQA 3GKMA 5COHA 1YDKA 2PVQA 4GF0A 4MJEA 3V1WA 3HVVA 5EVOA 3F6FA 5HR3A 5AIXA 2H0GA 3DYRA 4EL1A 4TR1A 4MDCA 4YQMA 1MDIA 2FA4A 3QOUA 1TTZA 3E0UA 3WGDA 4IQ1A 5AISA 1T3BA 3GURA 1AQVA 5HR0A 3TJJA 3F4RA 3FK8A 2NVLA 3FKFA 4GLTA 3QAWA 4MZBA 4E8EA 1HD2A 1XWGA 3GN3A 5ECPB 4DVCA 2X8GA 2PU9C 1EGRA 4XRAA 4PGTA 2B1LA 1UA5A 3ZFLA 2PGTA 1QUWA 2P5QA 1X9WB 3QPMA 2FY6A 3SWLA 3O3TA 3W8SA 3HKRA 1KNGA 3ZLPA 1HYUA 2H75A 1PX6A 1XXUA 1GUKA 3GH9A 1XVQA 4TXVA 1TRUA 2P5RA 1ACVA 3CMIA 2NPBA 1AIUA 3HA9A 1M99A 2DJ1A 3RHBA 1PKWA 3LXTA 4PQIA 5ECNB 3KZQA 1VF4A 1XWBA 4HQZA 3RPNA 4GSTA 6GSTA 3ZITA 2HRNA 2B5EA 1O7UA 5F05A 4EUYA 5E59A 3ZVJA 3HZ4A 4N11A 2LNTA 3A5WA 1AXDA 3W8JA 1U3IA 2HYXA 5F8BA 1SL0B 4JE1A 2GSTA 4BVYA 4I5QA 2JSYA 4ZL7A 1Z6NA 5F0GA 1J08A 1J9BA 2WZ9A 3G7YA 5HQPA 1WRYA 2F9SA 1BYEA 1GSDA 1GWCA 2VLUA 4PUAA 3TKSA 2L5LA 3MDKA 1ZZYA 5B6MA 1ILOA 4F03A 1HQOA 3G7JA 2FWEA 4NWYA 1O81A 4OCEA 1R26A 1E6BA 5IO0A 2WCIA 4JBBA 4ZBAA 1MDKA 2OACA 4N10A 4EO3A 4FYCA 2E2MA 5DBQA 3ZRDA 2ZCTA 2EIOA 2LJAA 2B3SA 1EOHA 4G2EA 1M7TA 2H30A 5G1LA 5LCZA 4WF4A 1EGOA 1S3AA 3HYPA 2CV4A 3TUEA 5B6NA 3TOTA 3WD6A 5D96A 4YQUA 1OVNA 2FWFA 3IOSA 5EL8A 1O6JA 3TJBA 4MF5A 2PPTA 3TJGA 4Q5NA 2E0QA 1FAAA 2B6MA 5E4WA 2OBKA 3FR6A 4XS4A 3KJYA 3GSSA 2H71A 5GZZB 1PKZA 4ZBBA 2YANA 3GX8A 3EURA 1XW9A 4KUNA 3LSZA 3PGTA 8GSSA 1Z9HA 3IXRA 2L6CA 3VI5A 3GV1A 3UAPA 2O85A 3GTUB 4IP6A 13GSA 1K3YA 2HXKA 1WWJA 2EIQA 2FCHA 17GSA 4AJ8A 4MABA 1T00A 1X5DA 3HXSA 1SJIA 3DIEA 1YF0A 2KUCA 1TJDA 3N5OA 1QK8A 2LRCA 1OAZA 6GSVA 3F0IA 1G7OA 3AY8A 1Z3EA 2YOIA 3LXZA 22GSA 6GSYA 4MZCA 4K1FA 1SL1B 3CSHA 2OA7A 3RAZA 2C3NA 1A23A 5HFKA 2L4QA 3IHQA 3I9V2 2H74A 3A2XA 2AHEA 4WXTA 3IAS2 1WJKA 4ECBA 1XCCA 2EC4A 2CQ9A 4WR4A 3EMPA 2YJHA 5LNKe 1EEMA 4NV5A 4FIWA 3C8EA 3F3RA 2F8FA 1GSSA 1ZYQB 4K6XA 4KX4A 3RHCA 2LS5A 2MYGA 3C73A 1FOVA 4F2IA 2GT5A 3ZFBA 5AGYA 4EF0A 4ZB8A 4POKA 2HT9A 2GZPA 4GRFA 1WPIA 1YEPA 3KH7A 4CW9A 3LJRA 2H0IA 5L71A 1M2AA 3D5JA 2FA8A 2GQKA 1USBA 1OC8A 3GSTA 3ZIJA 5CRDA 3BCIA 1FO5A 4ECIA 2R4VA 1U87A 3QAGA 1TP9A 3GFKA 4NMUA 2VM1A 5IIZA 1QFNA 3LGCA 1FVKA 1O85A 4BPYA 3WGEA 4BA7A 4ACSA 4LLRA 4F9ZA 2H1BA 4MPGA 2JZRA 3VPTA 2YWIA 1JHBA 5G31A 4ZBDA 4MPFA 3BCKA 3D22A 5ECQB 1MEKA 2FNOA 3EE2A 1T7PB 3ZYWA 2AYTA 3APQA 1U88A 4IJ3A 1MDJA 3P90A 1V2AA 2P31A 4GCIA 2DJ3A 2JU5A 1TRWA 2CAQA 2JZTA 1GSFA 3L4NA 1T4YA 1UVZA 2KOKA 4XCSA 1ABAA 2KP2A 1F3BA 4HI7A 2ON7A 3GRXA 5D9WA 4GQCA 1M2BA 1M9BA 2A2RA 5B7CA 2CVKA 4MMMA 2NBSA 3LYKA 2BTOT 2IPAA 5J9CA 5DJMA 4NHZA 3J7Yb 2O87A 3M8NA 9GSSA 1JZRA 2X64A 2C0DA 2OADA 5JCWA 3ZVJD 1XIYA 3ISOA 3H79A 5IMAA 1S3CA 5H5QA 3PR8A 1BX9A 4OFMA 4YH2A 1ML6A 1XFLA 1QXHA 4FYUA 4MJCA 2FWHA 2VL3A 2PMTA 4K7IA 5A4WA 4MF6A 4OFTA 1K3OA 4ZL9A 4MH3A 3GTUA 4V2NA 1PQNA 4I2TA 2GT6A 2N5FA 2R3XA 4K9ZA 2LNSA 1EV9A 2VCVA 3NIVA 1PD21 1TI1A 3EMXA 2RM6A 3EYTA 1PX7A 4WETA 4AF2A 3F9UA 2XPDA 2VD1A 2CT6A 2QGVA 3ERWA 4ML1A 4O32A 5GAND 2VL2C 3FZ4A 2MMNA 4RQRA 2OE1A 2RM5A 5IMZA 2YV9A 1GH2A 3TJKA 4L5OA 2H0HA 3H8QA 4BWSA 4TR4A 1B8XA 3CTGA 3GL5A 4XHMA 2HLSA 4GWRA 3C1RA 3A3TA 2RIIA 5EY6A 3U6VA 1HNBA 1XW5A 4O5RA 2C8UA 2H72A 4PNFA 1O8XA 3US3A 2VM2A 2F8AA 7GSSA 3WT2A 3L0HA 3GH6A 3FR9A 1Q4JA 3QDNA 1GULA 2FHEA 3D4TA 3Q6OA 4F0CA 5ID2B 1PA3A 3HZ8A 3UVTA 3D0ZA 1JZWA 3BJ5A 4GXZA 5DALA 4EDZA 5EPFA 1N8JA 2B5XA 3APOA 1NHYA 2AAWA 5IMVA 1O73A 5FT3A 3FZ9A 5ELAA 1EEJA 3QMXA 3PINA 5DAKB 2A2SA 3Q74A 1AW9A 1YKAA 3GA4A 5IM9A 5F06A 5IQYA 2PUKC 5ECOB 4I8BA 2IJYA 2C3QA 2EIRA 3MNGA 4TRXA 4KB3A 3VI7A 5JCGA 16GSA 2FUG2 1MD3A 1A0RP 2REMA 1OKDA 1OC9B 2DBCA 1XW6A 2NDOA 1XOAA 4KSMA 3NZNA 4NXIA 2N5BA 1RQMA 3CXGA 4JR6A 2WULA 1AC1A 2V2GA 3P2AA 1OKTA 4OFNA 4K7NA 3CSIA 1G0TA 1B9XC 4PUFC 5B8AA 5KN1A 1SENA 5AN1A 2GVPA 1QQ2A 2H1GA 2C3TA 4ECCA 1K0NA 1RW1A 4HOJA 4IS0A 2H01A 4KAEA 2V32A 3EC3A 1EZKA 1FW1A 1MD4A 3ME7A 1I5GA 3HJMA 4F0BA 4O7HA 4RI6A 2O7KA 4K7OA 5DCHA 2MBTA 5ECRB 2MBSA 4HS1A 4G19A 3M0FA 1QMVA 2L59A 4Q5QA 3KTBA 3DMLA 1XWKA 4TW5A 1SK0A 3VURA 3UIWA 4YQVA 3A2WA 2CZ2A 4QQ7A 1H75A 4L8EA 5ECMB 5A5KA 2X8CA 1Y25A 1JFUA 2IMIA 3QR6A 3H1NA 1TKDB 2B1KA 1UN2A 4I2UA 4EXJA 4TKYA 3RDWA 3JCML 1A2MA 4WKWA 1GTBA 1VF3A 2KP1A 4MZWA 1CQHA 5IOWA 3G9BA 5JWOB 2VUPA 3P7XA 1GUMA 2YNXA 5D93A 1BAYA 3HVSA 2IFQB 3RPPA 3VWWA 5ECHB 12GSA 4Q5FA 4J2FA 4POLA 1XOBA 2DJJA 2K8SA 4KCAA 2F51A 3KEBA 2FD3A 2LKUA 4MLYA 2XBQA 1PMTA 1SK2A 4EE0A 2YP6A 2GSSA 2DC5A 4X1UA 2JL4A 1TOFA 1LBKA 3L9SA 4ILFA 2YV7A 1DSBA 2AV4A 2M80A 2IWTA 2FLSA 2JADA 1SU9A 3TGZA 3LORA 2O89A 5ABRA 5D9TA 2GSRA 4K2DA 5HR1A 4AGSA 3KIJA 2MMOA 2PVOC 3IAM2 2K8VA 4HZ4A 2WRTA 4MCUA 3HHVA 2BJXA 2LV3A 2D2ZA 3APSA 4N30A 4EDYA 1BEDA 2G2QA 2XC2A 3VWXA 11GSA 3IPZA 3MWHA 1I9DA 1SYRA 4MH2A 1SKRB 2IN3A 5CRWA 3FR3A 2ZUPA 3CRUA 4O92A 5ID2A 1YQ1A 4TR0A 2L57A 4MA9A 1SL2B 2Z9SA 5LD0A 2CZ3A 3Q19A 3HJOA 1XZOA 4IVFA 4BL7A 3U5RE 4PQ1A 5ECIB 3VFIA 3QFBC 4EVMA 2PERA 1FB0A 4LMVA 1V9WA 1K0AA 2NTOA 5DCGA 1G6WA 5DAKA 2GQLA 5CP1A 5CREA 2VLVA 2F3MA 1YF1A 2C0GA 1K0BA 2O8VB 3L9VA 3H93A 1UC7A 2R5GA 1U6TA 3TKSC 3QFAC 1JZOA 4ZB9A 3IC4A 1R5AA 1V58A 1OC9A 2CX4A 3ED3A 2K9FA 3J7Yk 4KDUA 3HD5A 5ECLB 4DSRA 2L5OA 5GAPD 4KH7A 4GSNA 3F4TA 3KCMA 3HDCA 2I4AA 4HQSA 4HJ2A 1F9MA 4V2MA 1KEBA 3DRNA 3EU4A 3IK7A 2TIRA 2GGTA 3BBYA 4OO5A 2CAIA 1F2EA 2RUEA 1BQ7A 5IPHA 1C72A 3FYGA 2LJKA 3QCPA 5D9XA 1X9MB 2HSHA 2VCXA 3LFLA 4WF5A 1YZXA 4XS1A 3KMNA 1GRXA 5HR2A 3SBCA 1GTAA 1X9SB 4KW6A 3M9JA 1GSQA 5CAXA 2LQQA 3LQ7A 2GZZA 2C4JA 2VL9A 1XVWA 4XRDA 2OE3A 1YEXA 2J9HA 3ERFA 4H86A 5CRHA 4CDOA 1X5EA 3LWAA 4MP4A 3IRAA 2IMKA 2WS2A 3EWLA 2OE0A 3IE3A 3IK9A 4G10A 4KDYA 3ZIVA 4PURA 1G6YA 2X99A 3IBHA 5A4VA 1AUCA 4F82A 2YWMA 2L4CA 3GKXA 1TXXA 1IYHA 1Z6MA 10GSA 1VF1A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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