2AYTA

The crystal structure of a protein disulfide oxidoreductase from aquifex aeolicus
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
230
structure length
230
Chain Sequence
MLLNLDVRMQLKELAQKEFKEPVSIKLFSQAIGCESCQTAEELLKETVEVIGEAVGQDKIKLDIYSPFTHKEETEKYGVDRVPTIVIEGDKDYGIRYIGLPAGLEFTTLINGIFHVSQRKPQLSEKTLELLQVVDIPIEIWVFVTTSCGYCPSAAVMAWDFALANDYITSKVIDASENQDLAEQFQVVGVPKIVINKGVAEFVGAQPENAFLGYIMAVYEKLKREKEQAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords glutaredoxin-like protein
publication title Insights on a new PDI-like family: structural and functional analysis of a protein disulfide oxidoreductase from the bacterium Aquifex aeolicus
pubmed doi rcsb
source organism Aquifex aeolicus
molecule tags Oxidoreductase
total genus 81
structure length 230
sequence length 230
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-09-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13192 Thioredoxin_3 Thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2aytA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2aytA02
1K3LA 3QAWA 1B9XC 4MJEA 4YQUA 2AYTA 4G19A 4POLA 3RBTA 3M0FA 1RW1A 2HZEB 10GSA 2YZHA 3IV4A 3ZMLA 1TU7A 4N10A 2YANA 3GMFA 3VPTA 3WGDA 2X64A 4NAXA 1I5GA 3VWWA 2M72A 2K9FA 3KZQA 4QQ7A 1J08A 3ME8A 3D21A 5IM9A 4TXVA 3KM6A 4MA9A 1HQOA 4L5OA 3DVXA 2R37A 2ZCTA 1JZDA 5B8AA 3QCPA 4DVCA 4IELA 2HZEA 1CQHA 2VCZA 3HY2A 5ENUA 1GL8A 4IQAA 4KX4A 1WPIA 2FWHA 1THXA 1CQGA 1TU8A 1XWKA 3FZ9A 4PGTA 4CHSA 1G7EA 2L4QA 2OE3A 3WT2A 4MPFA 1R5AA 3C7MA 4OMVA 3AY8A 4L0UA 1Z7PA 1M0UA 3UL3A 2VCXA 4ZL7A 3LYPA 4ILFA 2H0GA 3IA1A 3ERGA 2MBSA 1BJXA 2H75A 1T4ZA 1OE7A 3K8NA 6GSSA 2H74A 4F0CA 3KXOA 2CX3A 2H76A 4NHWA 4TOPA 2J9HA 3EWLA 1O7UA 1MDKA 1U3AA 2WS2A 2WB9A 3UAPA 5AIVA 2V41A 4PXOA 2N5BA 4XS6A 2R6KA 2VUPA 3L9VA 3IRAA 2IMKA 3ZREA 1UVZA 3G7IA 1ST9A 2J23A 1XXUA 2XPDA 3U5RE 4OD7A 1O85A 5DJMA 1EOGA 2DMLA 5CRWA 2WZ9A 4F9ZA 2O8VB 2LQQA 5J3RA 3EMXA 1F9MA 1YEPA 4ECCA 1HD2A 2R5GA 1J0FA 4OO5A 4YAPA 4RQXA 4L8EA 5B8BA 1EP8A 3TB2A 2GQMA 2NBSA 1HNAA 1K3OA 4HU9A 5IOXA 2WJUA 3TRXA 2VO4A 1WRYA 1XVQA 1O8XA 18GSA 4PQIA 4EKZA 4J57E 4HJ2A 4KW6A 5ECIB 4E8EA 3HJOA 4ZL9A 3F6DA 3ZMKA 4POMA 2A4VA 3QAVA 5ABRA 1YF1A 3LWAA 3DGQA 1V40A 2VAFA 1MDJA 1XIYA 3ZFLA 4PURA 4I5QA 4TR0A 2K6VA 2C0DA 5GAPD 2VLUA 2X8GA 1QUWA 1E6BA 3SWLA 1IYHA 2LNSA 4ZIJA 3F6FA 5L71A 1K0OA 2JSYA 1R7HA 2CVKA 4QL9A 4MJBA 1W89A 4XHMA 4KNDA 2P5QA 5D9XA 1R4WA 2OA7A 3QR6A 4TR4A 4MABA 4N11A 1QFNA 4RQRA 5HR0A 1FG4A 2ES7A 2FY6A 2HRNA 1FB0A 2YWMA 4D73A 2OBIA 1X5EA 2DIZA 2LRCA 3P8WA 6GSWA 2YPMA 3EMPA 1WIKA 4I2TA 3TUEA 2F8AA 1AXDA 2VCQA 1TDIA 5F07A 4GLTA 3HDCA 3EVIA 2H0IA 1SL2B 2C0EA 4KDXA 1A2MA 4LMWA 2REMA 1USBA 3TKSE 4EC0A 2YOIA 3UVTA 3FHKA 2LNTA 1KEBA 4Q5RA 4MZWA 4L5LA 1DBYA 5CREA 1RK4A 1VF1A 2GSSA 4RUVA 5DCGA 4O5RA 2JZTA 3FR6A 3GIXA 5D9VA 1PA3A 2IL3A 3DMLA 3KMNA 4MH2A 1OKDA 1F2EA 2KOKA 1SYRA 1OC9B 1XCCA 2B1KA 1F3AA 3SBCA 4XCSA 2HYXA 2BMXA 2AB6A 2O87A 2FCHA 4X1UA 2YWOA 2CT6A 1XOAA 2RUEA 3QFBC 4ZB9A 3GH9A 3UBLA 3HJMA 2YV7A 2IFQB 12GSA 1SENA 3QAGA 2PGTA 5HR3A 1PQNA 2IMDA 3NOFA 5KEJA 3P90A 2VL2C 1Z6MA 2C3TA 4FYUA 5LNKe 5JWRB 4HZ2A 2QC7A 1M2BA 1U6TA 2B1LA 2BTOT 2YV9A 4WBJA 1QXHA 2X99A 4N30A 16GSA 3VFIA 2B7JA 3UEMA 1V98A 4GQFA 1PGTA 2ON5A 5CO3A 3CRTA 2VCWA 1AC1A 1WE0A 2V1MA 5ECNB 2D2ZA 3ZTLA 3F3QA 3GX0A 2DLXA 5J9BA 3GL3A 5IMCA 5D73A 2LSTA 5EVOA 1OC9A 2TRXA 3VI5A 1KTEA 2XPEA 4PUAA 5AN1A 4P3YB 2KP1A 1GUKA 1GLPA 2IFQA 4DSSA 5ID2A 1XWCA 5KN1A 3G7JA 1XFLA 1V9WA 2FWEA 3IBHA 1GSDA 3H8QA 4KSOA 5HFKA 2C0GA 3PR8A 1SKWB 1K3YA 4WETA 3DVWA 2G2QA 5DDLA 1GULA 5G1KA 3IAS2 1A8LA 3KD0A 4TR1A 5IMZA 1YF0A 1F6MC 2JU5A 1ERTA 2XBIA 2C8UA 2H6ZA 4LL1B 4XS4B 5IO0A 2H19A 3D22A 4JRRA 3FR9A 3CSJA 1BEDA 3TCOA 8GSSA 2WCIA 3BOAA 4HJMA 1ERUA 1SK0A 3CTGA 5FHIA 3KTLA 1G6WA 1U3IA 3QMXA 5E59A 2ZUPA 3EC3A 2HSYA 2Z9SA 1VGLA 3Q19A 3RAZA 2DJKA 5J9CA 2L6CA 1ACVA 4ACSA 5COHA 3HVXA 2LRTA 2B7KA 3GSSA 3H4KA 1F37A 3G9BA 2B5XA 2X8CA 3CTFA 4F0BA 4J56E 5ECKB 2QSIA 1EGRA 3G7YA 3ZRDA 3A5WA 2EIRA 4NMUA 5CAXA 4HQZA 4Q5FA 1PX7A 5IMDA 5GSSA 2L5OA 3LQ7A 1MTCA 3DKSA 1RQMA 4XS4A 2H1BA 5EL8A 3CMIA 1T7PB 4MK3A 2IWTA 3C73A 3NZNA 22GSA 3TKRA 1B48A 2GZPA 3KH7A 4IVFA 2F51A 1GRXA 5ECOB 2BJXA 1C72A 3L9UA 1V57A 1OVNA 3M1GA 2WULA 3ZVJD 1SJZA 5AGYA 1XPVA 4X43A 4AJ6A 2ALBA 2PPTA 4NWYA 3GKNA 1T4YA 3LXZA 4MZBA 1OC3A 3D4TA 4ECBA 3LYKA 4DSRA 1U88A 4MH3A 3HA9A 4F82A 4LMVA 3QDNA 1PKWA 4WR4A 3TGZA 4JBBA 3LSZA 4MF6A 1HNCA 1SK1A 4ZBDA 1TRUA 4G9HA 1GLQA 4NV5A 3FZ5A 2GT6A 3CBUA 3RDWA 1SL0B 4LA1A 2GS3A 2CQ9A 5EY6A 1JLWA 1H4OA 4ECJA 5KN2A 2QKEA 1VF2A 2HLSA 3KEBA 3O6TA 2H1DA 2H30A 3APQA 2H70A 1URMA 1TI1A 5IIZA 5JWQB 3WD6A 3O3TA 4XTSA 1TXXA 2RM5A 1GNEA 4EXJA 3L0HA 3TRPA 2FUG2 2HSHA 3BD2A 5G1LA 2PVQA 3GV1A 1YKAA 3ZFBA 5GSTA 4X0XA 5IMVA 5ECLB 3ZLPA 1FVKA 1IYIA 2RUFA 3LXTA 3BCKA 2C3NA 4ZL8A 1OC8A 2VD1A 2F9SA 1JZRA 3L78A 2VL3A 3GL5A 3QD9A 2MBTA 5IO2A 5EPFA 2LUSA 4TKYA 3GTUA 4OFMA 2LJKA 4PX1A 1QQ2A 2HZFA 3EYTA 3HD5A 1FO5A 1GTBA 6GSTA 1YQ1A 3A3TA 2VLVA 4IP1A 4DSQA 2PUKC 5JCGA 2X8HA 3LEFA 4EUYA 3VWXA 2L5LA 3F4SA 2L4CA 3ZYWA 4TW5A 3V1WA 3GA4A 3W6GA 17GSA 2XBQA 3F4TA 3FKFA 3UBKA 3F4RA 3VLNA 3ZIJA 2GSQA 2G0FA 2P0GA 2P5RA 4MP4A 5B6NA 1EWXA 3DD3A 1B8XA 2GVPA 3ZL5A 3I43A 1Q98A 3GX8A 5JWOB 1SD8A 3ERWA 4L0WA 5H5QA 1A0FA 4ULXA 1AQVA 2HI7A 4D73B 1M9BA 5GZZB 2ON7A 3EURA 1X9MB 2GZZA 5LCZA 5ECMB 3MWHA 1Y6EA 1SJIA 4GXZA 1A2JA 1M99A 3Q18A 1EP7A 1TI3A 1S3AA 3HZ8A 1Z6NA 2MZCA 3RPPA 1ABAA 2PMTA 5FWGA 2DJ0A 1Z5YE 3TKSA 2GT5A 4KAEA 4O92A 4GWRA 4WEYA 1K0DA 2JZRA 4ZXGA 4I6XA 3O76A 5ELGA 5FT3A 4NHZA 1EV9A 2YWNA 2I9HA 3D4MA 3IPZA 3KTBA 1KNGA 5D9WA 4KB3A 4EL1A 2YWIA 3LFLA 3HKRA 2VD0A 2GSRA 4GSTA 4ZBAA 2YJHA 4NV2A 2GQKA 3W8SA 1ERVA 1JHBA 2FGXA 2L59A 1K0AA 3LORA 2HRFA 4OCFA 3ME7A 4HUAA 2DJ3A 5DQSA 1UC7A 3DXBA 5HR1A 1V58A 1WP0A 5JCUA 4KCEA 2H1GA 2TIRA 2CVBA 5A5KA 4KUNA 1S3CA 3HJPA 5H5RA 1K0BA 1H75A 2K8VA 2VLTA 2GZYA 2MMOA 1O8WA 3D5JA 2LTKA 4V2MA 4IHUA 1TK0B 4MMMA 2R2JA 2H71A 1WMJA 1PRXA 6GSVA 1BQ7A 1ML6A 1G6YA 4KDYA 2YN1A 4ZB6A 3EE2A 5A4UA 2JL4A 2IPAA 1EZKA 2FLSA 3M9JA 3NIVA 1VF4A 4OWYA 1PD21 1V2AA 4OO4A 4ZBBA 5JCWA 5IOWA 1BX9A 2PWJA 4FYBA 3KJYA 1X5DA 2IIYA 5C00A 1SYXA 4G2EA 3C8EA 4DSSB 5ID2B 3JCML 1PN9A 4ECIA 5J5NA 3QOUA 3GKXA 1GSSA 1F3BA 1XBSA 3CSHA 5DQYA 5H5SA 3IOSA 1ON4A 2RM6A 1M2AA 5F8BA 2IMIA 2C0FA 1QK8A 1TRVA 1LU4A 1MEKA 3KGKA 2YP6A 3TJGA 1ZGNA 2I1UA 1UN2A 2XHFA 3L4NA 1I9DA 2C80A 4K1FA 1GUMA 5J41A 2A2SA 1GTUA 3FRCA 5HFIA 1EGOA 3ZIVA 4FO5A 1BYEA 2AHEA 4TR1B 1YJ6A 4BL7A 1KBNA 4F2IA 2FWGA 2DBCA 4KSMA 4HDEA 2M46A 5IQYA 3HVVA 3APOA 4I2UA 1AQXA 4FH8A 3WGEA 2WDUA 3UMAA 4TRXA 1PMTA 2E2MA 3RHCA 2VL2A 2KHPA 1TKDB 4IBPA 4KCAA 1GSUA 3H1NA 1TJDA 2DJ2A 2F8FA 1HYUA 3F8UA 1T3BA 4K6XA 1U87A 2WRTA 1PSQA 1ZCPA 1JZWA 1YZXA 20GSA 3IR4A 2C4JA 4NXIA 4BVYA 4LLRA 3DRNA 1GWCA 3BBYA 3FW2A 3GUSA 2WFCA 3HHVA 1DE2A 4GF0A 3MAKA 4ZILA 2L57A 1G7OA 3FZAA 3UIWA 1BAYA 1SL1B 2JZSA 5HFGA 1THOA 4OFNA 4V2NA 1WJKA 2MMNA 5E4WA 3EU3A 3FY7A 1GNWA 3GKMA 3TKPA 3A2XA 4N0ZA 1TTZA 4JEDA 3ZZXA 5CRGA 3GYKA 1A8YA 4IW9A 4EDYA 4BWSA 1AIUA 4K0GA 2CAIA 3GRXA 2GGTA 2H6XA 6GSYA 3TDGA 1Q4JA 4GRFA 2HFDA 4V2LA 2C1YA 4JR4A 1K0NA 3KCMA 1VRSD 2YZUA 4AJ7A 4LL4B 4MJCA 5LD0A 5INYA 1O6JA 2FD3A 3KP8A 1XW5A 4EVMA 4PQHA 3VI7A 4V1Ag 4IQ1A 1WWJA 1AW9A 3MNGA 5AIXA 3IC4A 4KH7A 2LS5A 1GUHA 4EO3A 1Y25A 2M80A 1AQWA 2VM1A 2I3YA 4O32A 2V32A 6GSXA 2H72A 1W4VA 1S3DA 2HT9A 3CYNA 1FB6A 3HZ4A 3M9KA 3IK9A 1YY7A 1R5PA 2IN3A 3LG6A 5DJLA 2FA8A 2YNXA 3GN3A 2OBKA 3VWUA 2V6OA 3FR3A 3RHBA 3TOUA 3HVSA 1TRSA 3ZITA 2RLIA 4MF7A 1PKZA 2XC2A 3WGXA 3MDKA 2VOCA 5G30A 3GSTA 4TN8A 1Z3EA 4CDOA 3MSZA 4GCIA 3EINA 2H8LA 5C04A 3I9V2 3U6VA 4ML1A 4KGIA 4MLYA 3VK9A 3UJ1A 5F06A 1TOFA 4Z7XA 4IJ3A 1GP1A 2OKAA 2PBJA 3QPMA 4F03A 4HS1A 2JADA 1EOHA 3DWVA 1FW1A 2CAQA 2GDRA 1NHOA 1SJ6A 2LJAA 2VIMA 2QGVA 2CV4A 2O85A 3TJKA 3GTUB 2LRNA 4YH2A 5HR2A 2AAWA 4IP6A 2EIQA 5A4VA 4WR5A 3H79A 2E2GA 4HU7A 4ZB8A 1M9AA 3LJRA 3Q74A 3F63A 3UARA 5G2ZA 3J7Yb 3WT1A 2FWFA 2O7KA 1J9BA 1K0CA 2CZ3A 5CYYA 2HNLA 1JZOA 1R26A 1X5CA 4WF4A 2OADA 3KP9A 2DC5A 4ML6A 4AJ8A 3HYPA 4Q5QA 1E2YA 1HNBA 4KA0A 5G5EA 5GAND 1Z9HA 5ECSA 2LJRA 1X9SB 4YAVA 3I69A 1GH2A 4XRDA 3LGCA 2PN8A 3E0UA 3ISOA 4IKHA 4KE3A 2H6YA 4TR3A 5DCHA 2CA8A 1UA5A 3L9SA 4WKWA 2WGRA 3CSIA 5IPGA 2A2RA 2PU9C 2JSZA 2GLRA 4K7IA 4K9ZA 4IJIA 1M7TA 1SK2A 2GQLA 4NPBA 4J2FA 4G10A 3W8JA 1M2DA 4ISDA 5J4UA 2IMEA 2VCTA 1N8JA 3PGTA 4I97A 1SU9A 2KP2A 4HOJA 1B9YC 2DMMA 1EEJA 4JZQA 4EF0A 2H01A 4PUFC 3VWVA 4CW9A 3KMOA 1MD3A 2VCVA 3TKSC 1VF3A 1TW9A 2N5FA 4JE1A 5CNWA 1ZZYA 1ILOA 2KLXA 2O89A 1XWGA 4PQ1A 2FA4A 3DEXA 1ERWA 1NM3A 1PX6A 5DVBA 3BJ5A 3DIEA 2B5YA 4O7HA 1ZMAA 4IN0A 1SKRB 2E0QA 1ZYEA 3D6IA 2AUVA 2F3MA 4WBRD 4YQMA 1WOUA 2MMAA 1A24A 13GSA 3N9JA 1B4QA 1NSWA 2K18A 3TJJA 1PL1A 2VL9A 2HE3A 4MDCA 3IXRA 4FIWA 2R3XA 2H0HA 1DSBA 4XRAA 1SKSB 4K7OA 4OFTA 4QL7A 4FYCA 4IS0A 3ZVJA 5ELAA 4Q5NA 3VPQA 2LEGA 4K2DA 5CRDA 5ECQB 4MF5A 1A2LA 1YEXA 5CRHA 3R2QA 3J7Yk 2V6KA 5DALB 2FHEA 3DYRA 3FZ4A 2EC4A 5HQPA 4HQSA 5ECPB 1A23A 3RPNA 1O73A 2PERA 5DAKB 5G5FA 1FAAA 3E9JB 1QGVA 3IK7A 1N2AA 2OACA 1T00A 3TJFA 1YDKA 3VURA 2B6MA 1GSFA 2DSAA 2DIYA 3S9FA 2RIIA 5G31A 1SD9A 3H93A 1GTIA 2CVDA 3FK8A 4GSSA 3ERFA 3ED3A 4POBA 1X0RA 2VM2A 5F05A 4K8MA 3CXGA 3CRUA 14GSA 2NTOA 3HCZA 2H66A 1GSQA 3TKQA 5A4WA 5DBQA 5DALA 4JU5A 1JLVA 1OAZA 3GURA 2JACA 4XS1A 1AAZA 4V1Ap 1LJRA 4EE0A 1XWBA 2LQOA 2OE1A 5DAKA 7GSSA 4IGJA 5D8IA 2DJJA 1XVWA 2EIOA 3TRQA 3BCIA 1GSYA 1TK8B 3F0IA 1OYJA 4TVEA 1GTAA 1FHEA 4E8HA 2CZ2A 2IJYA 4RI7A 2ZNMA 2MYGA 4KDUA 3IHQA 3FEUA 4WXTA 3M8NA 1ZL9A 4H86A 4RI6A 1YKCA 3UOMA 3Q6OA 5D96A 2AJQB 4JR6A 4MZCA 4MJAA 3IAM2 3IE3A 1OKTA 19GSA 2B5EA 1JFUA 4HI7A 5F0GA 3GHAA 5IMFA 2GTUA 4PNFA 2H1AA 4AF2A 4BA7A 1EV4A 6GSUA 5B6MA 3FYGA 4GQCA 3GNJA 3M3MA 1XW9A 3C1SA 3F9UA 2P31A 11GSA 1TP9A 1T8EB 4K7NA 1NW2A 4MCUA 1ZOFA 1B4PA 3C1RA 5IPHA 5KN0A 3E3EA 3QFAC 2CX4A 2PVOC 3UVHA 1DE1A 1OE8A 5ECHB 3I6AA 1LBKA 4I8BA 1DUGA 4N0VA 1A0RP 3PH9A 3APSA 3US3A 1AUCA 1MDIA 1XZOA 4ID0A 3P2AA 2NPBA 5AISA 3GKKA 2OJLA 3F3RA 2OE0A 2YCDA 2GSTA 1MD4A 2V2GA 3A2WA 4DEJA 2NVLA 3A2VA 2K8SA 3TJBA 9GSSA 5B7CA 5CP1A 2I81A 2H73A 4BWQA 4OCEA 2FNOA 4GTUA 4YQVA 1EEMA 1BG5A 1FOVA 5ECRB 2KUCA 1TK5B 1NHYA 3KH9A 2E7PA 4TXOB 1O81A 1T1VA 4GSNA 4MPGA 2AV4A 3HXSA 1PL2A 1Z7RA 3KIJA 2C3QA 2LV3A 1XOBA 4HEA2 4EDZA 2LKUA 3IDVA 4BPYA 2DJ1A 4K0NA 4XIHA 2HXKA 2I4AA 3EU4A 2L6DA 4HZ4A 3N5OA 2MMZA 5D9TA 3D0ZA 1QMVA 4POKA 1G0TA 2NDOA 1X9WB 1TRWA 2R4VA 3GH6A 1GSEA 1FVJA 1ZYQB 5IMAA 1K0MA 1XWAA 2YJ7A 4AGSA 5D93A 2TRCP 3GFKA 2N5AA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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