2AYTA

The crystal structure of a protein disulfide oxidoreductase from aquifex aeolicus
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
230
structure length
230
Chain Sequence
MLLNLDVRMQLKELAQKEFKEPVSIKLFSQAIGCESCQTAEELLKETVEVIGEAVGQDKIKLDIYSPFTHKEETEKYGVDRVPTIVIEGDKDYGIRYIGLPAGLEFTTLINGIFHVSQRKPQLSEKTLELLQVVDIPIEIWVFVTTSCGYCPSAAVMAWDFALANDYITSKVIDASENQDLAEQFQVVGVPKIVINKGVAEFVGAQPENAFLGYIMAVYEKLKREKEQAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords glutaredoxin-like protein
publication title Insights on a new PDI-like family: structural and functional analysis of a protein disulfide oxidoreductase from the bacterium Aquifex aeolicus
pubmed doi rcsb
source organism Aquifex aeolicus
molecule tags Oxidoreductase
total genus 81
structure length 230
sequence length 230
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-09-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13192 Thioredoxin_3 Thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2aytA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2aytA02
2LEGA 3HZ8A 2WRTA 1VF3A 2VCTA 3GFKA 3H93A 2CV4A 2NDOA 4POKA 3RBTA 5CYYA 2DJ3A 2PBJA 1XWCA 1F2EA 3APOA 2GLRA 2TRCP 3P8WA 1T1VA 4N10A 1OVNA 1ZCPA 1T8EB 3UBKA 2PVOC 5COHA 4N0ZA 1R5AA 2AHEA 4CDOA 4POMA 3ZVJA 1THOA 1M99A 2VCWA 3ME7A 1SK2A 2OKAA 1ZMAA 2K8SA 1QK8A 3UJ1A 2K6VA 2JL4A 1BEDA 4O7HA 2H71A 1N8JA 2H76A 3L78A 5DALB 1BX9A 1SKRB 1OC9B 2ES7A 4IKHA 5LD0A 1AIUA 3C73A 2RLIA 3UEMA 5IMVA 2LV3A 4GWRA 1SL0B 1K0MA 1W4VA 1DE1A 1WE0A 2VUPA 4YQUA 2C0FA 2ZUPA 5CRDA 2O85A 1M0UA 1GSUA 4KA0A 3VLNA 3UBLA 2GSQA 4V2NA 1PKWA 3ZFBA 2L59A 2WCIA 4K1FA 1SL1B 3O76A 4F0CA 4OCFA 3IE3A 4FO5A 3C71A 3LJRA 1TU8A 4RQXA 3GSTA 1VGLA 3G7YA 3BD2A 1USBA 4ZB6A 1B4QA 5DAKB 2H72A 2WFCA 2IFQA 1YKAA 3TKQA 4IGJA 1O6JA 3KGKA 4GSSA 4WEYA 4HOJA 5JWQB 2WJUA 1QQ2A 1UN2A 3KP9A 1T7PB 3IBHA 3APSA 22GSA 3EURA 3FZ5A 3TKPA 1XXUA 5D9WA 5ID2A 3HXSA 1SJIA 5D73A 1XOBA 3KP8A 4PQHA 4ZILA 1PL1A 4EKZA 3RHBA 3US3A 3RAZA 2HE3A 2AB6A 1EP7A 2L6CA 3ZMKA 1HD2A 4Q5NA 3HA9A 1A8LA 5ECSA 1AQVA 3GTUB 3ME8A 2KP1A 2LRNA 3LXTA 2GSSA 5G2ZA 1FAAA 3GH9A 2PMTA 1WWJA 1A2LA 5EY6A 1EV9A 4ZB9A 1B4PA 2C1YA 2P0GA 1SJZA 3HY2A 2YN1A 2OBIA 2V2GA 3IK9A 4I8BA 4KE3A 3CSHA 3DVXA 3A5WA 4WR5A 2LUSA 1Z7PA 4AJ8A 1F37A 5J9CA 5L71A 1TXXA 3J7Yk 3N5OA 2HZEA 11GSA 2GSTA 2YJHA 4MF7A 2VCZA 1AUCA 3TJBA 3ZLPA 1TTZA 3IV4A 4MH3A 1B9XC 1Q4JA 6GSYA 3EE2A 4MH2A 2X99A 2F9SA 4YQVA 4LL1B 4D73A 1XFLA 1Z9HA 3FR6A 4FH8A 2KUCA 4L0UA 4MJCA 3FYGA 3TOUA 2YJ7A 2O7KA 4ID0A 3GMFA 5KN1A 2F3MA 2B1KA 1DE2A 5G30A 1GTBA 1VF2A 5KN0A 1G6WA 2L57A 4JRRA 5HR3A 3E0UA 2X8CA 1NSWA 1O8WA 3F0IA 4GTUA 5AN1A 1ZL9A 1TW9A 3C1SA 4MJAA 4ZL7A 1GTUA 1A8YA 4I2UA 3WD6A 4AJ7A 3F9UA 3HJMA 3G7IA 1QUWA 4MDCA 3H1NA 3HDCA 4KX4A 4KGIA 1V58A 2PWJA 1MDIA 5DALA 4NHWA 3M8NA 2OADA 1OC9A 1T00A 2XBQA 1RK4A 3LYKA 2FA8A 2I81A 5G1KA 2DJ1A 1DUGA 1F3AA 2V6OA 1ILOA 1Z7RA 5IMDA 2CZ2A 4IQAA 4E8EA 2HRFA 3G7JA 3FY7A 4KH7A 2PU9C 1C72A 4WF4A 4V2MA 1T4YA 1G7EA 3I9V2 1EZKA 3ZITA 1JZDA 2DMMA 1GUHA 3Q18A 5IQYA 17GSA 3DEXA 1JFUA 1ERUA 5D9TA 1SL2B 2H6ZA 2VO4A 3GHAA 4DVCA 2H1DA 1EEJA 1O85A 2XPDA 4F03A 3VWXA 1AQWA 2R4VA 5KN3A 1VF4A 2HI7A 5DAKA 2L5LA 1KBNA 4O5RA 2RM5A 5ENUA 3RPPA 4JZQA 2FUG2 5KN2A 3E9JB 2H6XA 1ERTA 1X9SB 4P3YB 4OFMA 1U3IA 3NZNA 3ZFLA 1X0RA 1K3LA 3KMNA 4I5QA 3TKSE 3HKRA 3VK9A 4ULXA 4BVYA 3CBUA 1O7UA 1URMA 5CRGA 2ZCTA 3A3TA 4ECBA 3M1GA 3L4NA 3IAS2 3H8QA 4KDUA 3BOAA 5HR1A 5ECLB 2CVKA 2I9HA 2YWMA 4QL9A 4EVMA 4BVXA 4F2IA 1XWKA 3ZIJA 3GTUA 3GH6A 1FO5A 2F51A 3PR8A 1V40A 4HDEA 3IDVA 1ZYQB 16GSA 10GSA 3GN3A 2I1UA 5E59A 2DJKA 7GSSA 1F3BA 3RDWA 2A4VA 3VWWA 3GURA 3VWVA 5D9XA 3IXRA 1PN9A 2JACA 1EEMA 4HQZA 2N5AA 3UMAA 1M9AA 3IA1A 4RUVA 5J4UA 2LSTA 2BMXA 1G0TA 1BQ7A 3MAKA 4EC0A 5CRHA 1B8XA 3BCKA 2L4CA 2C0GA 3EYTA 1S3AA 3DVWA 4FYCA 3A2VA 4K7NA 4Q5QA 2XPEA 2HRNA 1NW2A 4BPYA 2FWGA 2DMLA 4IJ3A 2H1GA 3EU4A 2RM6A 4HU7A 2GT6A 4OMVA 4TRXA 2LTKA 4KCAA 3VWUA 1OKDA 12GSA 3UVHA 1X5EA 3DXBA 5J5NA 2B5XA 4MLYA 2AYTA 3EMPA 5IM9A 4DEJA 5D9VA 5ECKB 2LQOA 4AGSA 1PX6A 2JSYA 3FEUA 1SU9A 3A2XA 1ZGNA 3Q19A 1XWGA 4ML6A 4XRDA 1ZZYA 2H1AA 4J2FA 4LA1A 1Z3EA 3BJ5A 2IMKA 2O89A 2MZCA 2WZ9A 5JWOB 1GSFA 1RQMA 3EWLA 1RW1A 5F05A 4IP6A 2GGTA 4IS0A 4IHUA 1SD8A 5GSTA 2YCDA 1XZOA 4IVFA 3ERGA 1EOHA 3CRTA 2FWHA 4ZB8A 1PD21 5HFKA 1VRSD 4TXOA 2E2MA 2R5GA 4IW9A 2V1MA 1LJRA 4XRAA 2DJJA 1MDKA 4OWYA 4TXVA 5B8AA 2R6KA 4WKWA 1GL8A 4IP1A 2RIIA 3P2AA 3Q6OA 5IO0A 2IMIA 1YF1A 1XW9A 3D4TA 2OBKA 2IJYA 5F06A 1TRVA 4WETA 1K3YA 1SYRA 4TR3A 4JR6A 3F4TA 1EWXA 4J56E 3HZ4A 2GQMA 5ECHB 5CAXA 1YKCA 2K9FA 2C80A 1TRUA 2LQQA 1X5CA 3TGZA 1TK8B 4HI7A 2WS2A 3QD9A 2FY6A 3IK7A 3UL3A 5B8BA 4PUFC 1XVWA 2L4QA 3QAVA 1M2DA 1PKZA 4E8HA 3QFBC 1G7OA 4XHMA 3WYWA 3EU3A 3EINA 5D8IA 2OACA 3K8NA 3BBYA 4MMMA 3LSZA 2C0DA 4ZIJA 4KB3A 4TW5A 2IWTA 4EE0A 19GSA 2A2RA 1U6TA 1UVZA 3CSJA 3WGDA 5IMZA 2IL3A 2AJQB 1OE8A 1SJ6A 3GL5A 1N2AA 3GX0A 1GH2A 4MF6A 3S9FA 2C3TA 1WOUA 3C7MA 3TB2A 1HNAA 1U3AA 4G9HA 5J9BA 1GSEA 2VL3A 4NV5A 2E7PA 3I69A 1TOFA 1Q98A 4EL1A 5IO2A 1XIYA 2KP2A 1NHYA 1K3OA 1YZXA 4I6XA 2I4AA 3HHVA 2LS5A 2GS3A 4HJMA 5DJLA 4FYUA 2YZHA 1ERWA 6GSVA 4PGTA 2G2QA 5ECPB 4RI7A 4BL7A 2AUVA 3D21A 1BG5A 1MDJA 3M0FA 5F8BA 2NPBA 1B48A 1UA5A 4YQMA 4HZ2A 2CAIA 2C4JA 5C00A 5IOXA 5D93A 2C0EA 5DCGA 3F4SA 3A2WA 3WT2A 4KCEA 1OAZA 5ECRB 2GZYA 3GL3A 1GNWA 1U87A 3GX8A 4EDYA 1SYXA 2PN8A 4TN8A 5AISA 3GKNA 1AXDA 5HR2A 4I2TA 2XHFA 1VF1A 1PA3A 3L9VA 2CA8A 4O32A 2MMNA 4GCIA 2MMZA 4EO3A 1R26A 1GRXA 3HD5A 1FVJA 3I43A 3W8JA 2C3NA 2X8HA 2F8AA 3M9KA 4GRFA 1A2MA 1FG4A 5GAPD 2B3SA 5ECIB 1EP8A 2JSZA 2QGVA 4GQCA 2H6YA 4TKYA 1Z6MA 5LCZA 4MP4A 1NHOA 2H1BA 5DDLA 4LMWA 4NV2A 2E0QA 4N30A 2H30A 3TDGA 1GTAA 3TUEA 4WBRD 2X8GA 2GQLA 3KTBA 1TRWA 1Z5YE 5DQSA 2LNTA 4OFNA 2N5BA 1YEXA 4KSOA 1AW9A 5JCGA 1R4WA 3QPMA 2DLXA 2C3QA 1MD4A 1SK1A 1A0RP 2ON5A 1J0FA 4PURA 2BTOT 13GSA 3VI7A 1B9YC 4FYBA 1FB0A 1GLQA 1W89A 3TRPA 3GYKA 3VPQA 5EL8A 5EPFA 3FKFA 2IMEA 1EV4A 5ECOB 3O6TA 3M3MA 4WF5A 2VM2A 3KIJA 4Q5RA 2YNXA 3APQA 2M80A 1QXHA 1PMTA 5DQYA 1TRSA 2FCHA 5D96A 1E6BA 4PQ1A 5IOWA 3WT1A 2GZZA 5EVOA 4LMVA 3TOTA 3ERWA 1I9DA 1AQXA 2JZRA 5A4WA 5FWGA 3RPNA 2IN3A 1BAYA 3EMXA 4NAXA 4ECJA 2OA7A 3N9JA 4ZL9A 3I6AA 1K0OA 1M2AA 3HVVA 2X64A 9GSSA 4MCUA 4GQFA 4EF0A 1TK0B 3FK8A 4K8MA 3FR3A 4FIWA 4ZBBA 3DD3A 5B6MA 3NOFA 2FNOA 1Y25A 2RUFA 3QAWA 3MWHA 3F3RA 5IIZA 3DGQA 5JCWA 3BCIA 1M7TA 4ISDA 1YDKA 1WPIA 1V9WA 1GSSA 4MZCA 2GTUA 4WXTA 5LNKe 3DWVA 3GNJA 2FA4A 4MK3A 3F6FA 3TRQA 2BJXA 4PXOA 4ECCA 3TJGA 1A24A 2H0GA 3EVIA 2NBSA 4MPFA 4XIHA 1BYEA 1K0DA 3UARA 1H4OA 4O92A 2DJ0A 3TRXA 1MEKA 3HVSA 2M72A 1YJ6A 2VLVA 3VPTA 3L9SA 3GV1A 2GZPA 4MA9A 4PUAA 4ZXGA 3L9UA 1WIKA 1MTCA 3C1RA 3R2QA 4HQSA 2VD1A 3UVTA 1XBSA 1TJDA 4CW9A 4YH2A 1GP1A 4Q5FA 3U5RE 4F82A 1BJXA 4DSQA 1PX7A 4EDZA 3DRNA 3KTLA 4NHZA 1EGRA 3CRUA 2O87A 5ELGA 1M2BA 4GF0A 3QOUA 4TR1B 4PNFA 2OE1A 3DIEA 2GT5A 2OJLA 4HEA2 4ACSA 1IYIA 1TK5B 3SWLA 2H73A 4V2LA 4CHSA 5AIVA 2CVBA 3F4RA 3LG6A 4J57E 5J3RA 4YAPA 3KEBA 1LU4A 3ED3A 2YZUA 2NTOA 3MDKA 2AV4A 2YANA 2XBIA 4KDXA 1T4ZA 4X43A 3WGXA 3FHKA 1FOVA 2VLTA 3GUSA 2HYXA 2H0IA 2WGRA 1K0BA 1GSDA 5G31A 2CVDA 4XTSA 5ECMB 4NXIA 8GSSA 4ZBAA 1SKSB 3IRAA 1HQOA 3KMOA 3PINA 4IJIA 3WGEA 3IPZA 2H70A 1GTIA 1J08A 3H79A 3KZQA 1O81A 1GUKA 4KUNA 1WMJA 3ZVJD 3FRCA 1TDIA 1IYHA 2JZTA 4ILFA 1OKTA 3W8SA 6GSXA 1S3CA 5B7CA 3LWAA 3F8UA 4HJ2A 3LGCA 3ZL5A 3QAGA 1OYJA 2VM1A 2PUKC 4NWYA 5INYA 4KDYA 4TOPA 4MPGA 5HQPA 1PRXA 1PQNA 1PGTA 4MABA 3LXZA 2P31A 2MMAA 2VL9A 2HNLA 1XVQA 4JBBA 2REMA 4L5LA 3GKKA 5ELAA 3DKSA 4KAEA 4IBPA 3TJKA 2YOIA 3TJFA 2MMOA 5G5EA 1GSYA 2VD0A 5B6NA 2HLSA 4OCEA 5JWRB 4KNDA 3FZ9A 5F0GA 4TVEA 1R7HA 2OE0A 3QCPA 2HT9A 2AAWA 3FR9A 2QKEA 2FLSA 2R3XA 3CYNA 3IR4A 2J9HA 1OC3A 3VI5A 2FWFA 5HR0A 2VL2C 1XW6A 4XS4B 2V6KA 4DSSB 2H19A 4OO5A 3GIXA 1CQGA 2TRXA 1S3DA 2B5EA 4XCSA 1AAZA 3G9BA 1JHBA 5C04A 2B6MA 4PX1A 1QMVA 2V32A 1V2AA 5IPGA 4G2EA 4K2DA 3C8EA 4K6XA 3P7XA 3GKMA 3LORA 1XWBA 2DJ2A 4G10A 2M46A 5G1LA 1X9WB 3IHQA 1EOGA 3LFLA 3F63A 1ABAA 2MBTA 3KCMA 3GKXA 4POBA 2ON7A 18GSA 2PGTA 5HFIA 4QQ7A 4LL4B 5H5RA 3TKSA 2R37A 5CRWA 4N0VA 2D2ZA 1GUMA 2IPAA 4JE1A 4L8EA 1XWAA 2E2GA 2IIYA 3W6GA 2YP6A 1JZRA 4WR4A 1U88A 1V98A 2G0FA 6GSUA 3PGTA 2FHEA 3HCZA 2CAQA 2H0HA 1UC7A 4ECIA 3PH9A 1A2JA 2GVPA 1K0NA 4L5OA 4GSNA 6GSSA 4I97A 1XOAA 1F9MA 5E4WA 4KSMA 4OO4A 2WDUA 5G5FA 3UIWA 14GSA 1JLVA 3QR6A 2PVQA 4KW6A 2LJAA 4F0BA 3V1WA 2H01A 2PPTA 4X1UA 1OC8A 3IOSA 3UOMA 1WP0A 3D6IA 2ALBA 2IMDA 3QFAC 2I3YA 5IMCA 2FD3A 5HFGA 4EUYA 1HNCA 2VCQA 4ML1A 1XPVA 3VURA 2EC4A 2KOKA 5F07A 1V57A 3UAPA 4TR1A 1QFNA 3HJOA 1OE7A 1PSQA 3MNGA 1SK0A 4V1Ag 1SENA 3FW2A 1ML6A 1GLPA 1ON4A 2PERA 1WRYA 2B5YA 2K18A 4DSRA 3TKRA 2QC7A 1XW5A 4PQIA 1CQHA 1TKDB 2C8UA 4H86A 4JU5A 2IMFA 3ISOA 1G6YA 4F9ZA 3ZMLA 4IN0A 4X0XA 3KXOA 3ZZXA 2YPMA 1GSQA 2GQKA 4MJBA 3RHCA 3KD0A 5DVBA 2A2SA 4POLA 1YF0A 4HS1A 6GSTA 1JZOA 4BA7A 3ZREA 2KLXA 1K0CA 3D4MA 1XCCA 4YAVA 2VL2A 3HVXA 2LNSA 2TIRA 3P90A 2YWOA 2J23A 2HFDA 1TU7A 2CZ3A 4N11A 5CREA 4EXJA 4V1Ap 1FHEA 2MBSA 2GSRA 1GWCA 1F6MC 5A4UA 2LJRA 1KNGA 3LYPA 5A4VA 1Z6NA 1KTEA 2B7KA 4Z7XA 4K7IA 1THXA 2H75A 1A0FA 5CP1A 5H5QA 3GRXA 3VFIA 4L0WA 1QGVA 2VLUA 2L6DA 1X9MB 3HYPA 4TXOB 1ST9A 1O8XA 1YY7A 4BWQA 4QL7A 1K0AA 3HJPA 2MYGA 3KH9A 6GSWA 2WB9A 5GZZB 4ZBDA 2O8VB 3QMXA 1ZOFA 1KEBA 4K9ZA 5ECQB 3CTGA 1T3BA 3DMLA 1SKWB 4XS4A 3FZAA 4DSSA 2LRTA 4IELA 2B7JA 5DCHA 3E3EA 5ABRA 2ZNMA 4TR4A 3MSZA 1ZYEA 3D22A 5KEJA 4K7OA 3LQ7A 4K0NA 4ZL8A 3NIVA 2RUEA 2P5RA 5DJMA 4BWSA 2DIZA 5AIXA 5J41A 2DIYA 3FZ4A 3LEFA 2XC2A 2LJKA 4NPBA 3QDNA 4XS6A 2GDRA 1J9BA 1A23A 2HSYA 4JR4A 1PL2A 1GNEA 3GA4A 2B1LA 5A5KA 2DBCA 1M9BA 5FHIA 1Y6EA 2YV9A 1DBYA 2VAFA 4IQ1A 4GXZA 1TI1A 2IFQB 3KJYA 1EGOA 5IMFA 1JZWA 5AGYA 2YWIA 3TCOA 3OR5A 2JU5A 1FVKA 4GLTA 4XS1A 2YWNA 1R5PA 5IPHA 2HSHA 5CO3A 3DYRA 1HYUA 2Z9SA 2L5OA 5JCUA 4RI6A 5ID2B 2CT6A 3D0ZA 3KH7A 2JADA 2JZSA 1JLWA 3EC3A 4NMUA 2F8FA 2HZFA 2P5QA 2NVLA 3JCML 2H74A 1O73A 2CX3A 3M9JA 1AC1A 5IMAA 5GAND 3SBCA 2R2JA 2KHPA 4OFTA 1YQ1A 1ERVA 4AJ6A 4HZ4A 3AY8A 3ERFA 2LKUA 4LLRA 5ECNB 2QSIA 1SD9A 5GSSA 3CXGA 5CNWA 1FB6A 4JEDA 5FT3A 3H4KA 3TKSC 2HXKA 2EIOA 1TP9A 1GULA 1DSBA 4G19A 2H8LA 1ACVA 1H75A 1FW1A 4RQRA 2FWEA 1HNBA 4WBJA 3IAM2 2N5FA 1I5GA 2V41A 3CTFA 2OE3A 4OD7A 2K8VA 5DBQA 2YV7A 3D5JA 4K0GA 2HZEB 3GSSA 3J7Yb 1X5DA 2DSAA 2WULA 4HUAA 3ZYWA 3L0HA 4MZBA 2EIQA 2VCXA 20GSA 3O3TA 2DC5A 1WJKA 3IC4A 3CMIA 2VIMA 3ZRDA 1NM3A 2CX4A 3CSIA 3KM6A 4PNGA 1TI3A 1YEPA 3Q74A 2FGXA 2CQ9A 4GSTA 3ZIVA 3TJJA 4MJEA 2LRCA 5H5SA 4MF5A 3U6VA 3F6DA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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