2AYTA

The crystal structure of a protein disulfide oxidoreductase from aquifex aeolicus
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
230
structure length
230
Chain Sequence
MLLNLDVRMQLKELAQKEFKEPVSIKLFSQAIGCESCQTAEELLKETVEVIGEAVGQDKIKLDIYSPFTHKEETEKYGVDRVPTIVIEGDKDYGIRYIGLPAGLEFTTLINGIFHVSQRKPQLSEKTLELLQVVDIPIEIWVFVTTSCGYCPSAAVMAWDFALANDYITSKVIDASENQDLAEQFQVVGVPKIVINKGVAEFVGAQPENAFLGYIMAVYEKLKREKEQAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords glutaredoxin-like protein
publication title Insights on a new PDI-like family: structural and functional analysis of a protein disulfide oxidoreductase from the bacterium Aquifex aeolicus
pubmed doi rcsb
source organism Aquifex aeolicus
total genus 81
structure length 230
sequence length 230
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-09-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13192 Thioredoxin_3 Thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2aytA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2aytA02
1BJXA 1PKWA 4OCFA 1USBA 4K0NA 2VCZA 5DALA 5CP1A 1XWAA 4D73B 1SL0B 1QQ2A 5IOWA 1A0FA 3IAS2 1IYIA 2LRCA 2DMLA 4X1UA 1K0OA 2HSYA 3IA1A 3UVTA 5GSSA 1B9YC 4POBA 1Z3EA 4XTSA 4OFNA 3WGDA 3D5JA 3RHBA 2PVOC 3MWHA 3OR5A 3E0UA 2F8FA 1R7HA 2FLSA 3LXTA 2FA4A 2HLSA 7GSSA 3VWVA 4DEJA 2YWIA 2RUFA 1GTIA 3FK8A 2LJAA 3WT2A 1UN2A 2AJQB 4GQFA 4CW9A 2DC5A 3HCZA 3UIWA 2FWFA 1U88A 1RK4A 1SU9A 2M46A 2K8SA 5CRDA 8GSSA 4IQAA 1CQGA 2R5GA 1TI3A 3ERFA 1WE0A 5KEJA 1XCCA 1DE1A 1HNCA 3FKFA 3KXOA 1WIKA 4TXVA 2MZCA 3ZTLA 1YZXA 1OKTA 3WT1A 3RPNA 2VL3A 2YN1A 3KD0A 2IWTA 1QUWA 4MPFA 2MBSA 1XXUA 4OFTA 2GZPA 4ECIA 2B1KA 2YWNA 1G6WA 1G7OA 2MMZA 2H6XA 1QGVA 2GQKA 1AXDA 2L57A 4WR5A 3QFBC 5GAND 5IMFA 2ALBA 2FWGA 1PA3A 3ZFBA 2GSTA 4JR4A 3GIXA 1J9BA 5IMDA 2GZYA 5ECRB 5IPHA 1X0RA 5G2ZA 3KP8A 5IIZA 5KN3A 2H01A 2AB6A 4PNFA 3KIJA 3N9JA 3G7IA 1EGRA 4ZXGA 3HJOA 4LL4B 1OC3A 3A2XA 2IMIA 5E59A 2VCVA 2CX4A 2HNLA 2V32A 2IFQB 2B1LA 3TKSE 4DVCA 5INYA 2GSQA 3US3A 4Z7XA 1TW9A 2LNTA 2PU9C 3LSZA 3EC3A 1T4YA 2AUVA 2E7PA 3LYPA 1XIYA 4DSSA 2IL3A 3VURA 4LLRA 1BQ7A 2LV3A 1M7TA 1JZOA 1MEKA 3DVWA 1YQ1A 1F2EA 5HR3A 5J9CA 2DIYA 10GSA 3FW2A 1HQOA 1K3YA 1YEXA 3EVIA 2Z9SA 4TW5A 3FHKA 1ZCPA 3APSA 3HXSA 2AHEA 2CVKA 2H72A 4NV2A 2CX3A 2I9HA 4MH3A 5ECIB 1XWBA 3CSHA 3A2VA 1E6BA 1AQWA 1O7UA 1N8JA 2HE3A 4Q5RA 3MAKA 3ZYWA 1ACVA 1B4PA 2E0QA 2VL2C 4KUNA 6GSWA 2X8CA 1HNBA 3J7Yk 2YWMA 1HD2A 1OAZA 4EKZA 4I97A 2XBIA 1ERUA 4MCUA 3F4SA 5A4UA 3TKPA 3DWVA 3EU3A 1UVZA 3FZAA 2YZUA 1Z9HA 2C0GA 2PN8A 1RQMA 1XWKA 3VPQA 3ERWA 2JZRA 4F0CA 11GSA 3GN3A 17GSA 5LD0A 5HR2A 3TKSA 2B5XA 4O7HA 4K9ZA 2OBKA 1YY7A 3CRTA 2FUG2 1WWJA 2V1MA 4F2IA 5DQSA 2HT9A 2WGRA 1KTEA 2LSTA 3TB2A 4XRAA 1TP9A 3GRXA 3RPPA 2IMDA 1K0MA 2CZ3A 4MA9A 3TOTA 5KN2A 1ZYQB 1JLWA 1GUHA 2XC2A 2VL2A 1A24A 2FY6A 4EXJA 2OE1A 5JWOB 4G10A 1DSBA 3J7Yb 4MZBA 4I2UA 5IMAA 1M2AA 1PSQA 3QCPA 4ZL9A 2QSIA 1SYRA 2YPMA 4V2LA 1FVKA 2CV4A 4BVYA 4HEA2 3GFKA 4P3YB 1GUMA 2TIRA 4XS1A 3W6GA 4PQ1A 2NDOA 14GSA 3VWUA 1OYJA 4MLYA 2ON5A 2H1AA 4O92A 4JR6A 1F37A 3CMIA 3EWLA 2H76A 6GSYA 1K0BA 2FWEA 1Z6NA 1WMJA 2MYGA 2O87A 3QD9A 1GUKA 5ECLB 3KGKA 2HSHA 1X5DA 4GWRA 5ECOB 1EEJA 3APOA 1K3OA 4MJEA 5L71A 2IMFA 3GKNA 2CA8A 3O3TA 5HR1A 2JL4A 5LCZA 3GSTA 1FOVA 3TJGA 3BJ5A 3IK9A 4TN8A 1ZZYA 4IVFA 3F8UA 2IJYA 5IOXA 4FO5A 4EVMA 2NPBA 3E9JB 4WR4A 4POLA 2HFDA 2R37A 2P0GA 3CTFA 3G9BA 3TJJA 2I4AA 4ZB9A 2DJ2A 2VUPA 4IQ1A 4IJIA 2VCXA 4G19A 5G5FA 4I8BA 5B7CA 5ELAA 3QPMA 3IR4A 2OJLA 2LTKA 2JSYA 3L9SA 4YQMA 2CVDA 4KE3A 1B4QA 2P5RA 4HI7A 1J0FA 2M80A 1WOUA 1GSEA 1BAYA 3O6TA 4ECCA 1N2AA 3KM6A 2I3YA 1OE8A 3DIEA 4JZQA 1MDJA 2O8VB 6GSUA 3WGEA 2OBIA 4TXOB 1TOFA 5CNWA 2MMAA 1S3CA 4HZ4A 4AGSA 1SK0A 5DALB 3FZ5A 5J5NA 3KEBA 3IXRA 5ECMB 1V98A 1Y6EA 4WXTA 4HDEA 4KCEA 4Q5QA 4BWSA 2KOKA 5F0GA 3PR8A 4K0GA 5AIXA 4TVEA 4KCAA 3L9UA 4QL9A 3GV1A 1A2LA 3Q74A 1EGOA 2VCWA 1H75A 3VLNA 4HU9A 1M9BA 4PQHA 1VF3A 5ID2A 2V6OA 3QAVA 2K9FA 1ZOFA 4PXOA 5ECPB 2R3XA 5D9TA 4N0ZA 4AJ6A 2RM6A 2PPTA 5HFGA 3GKKA 1B48A 3P7XA 4OWYA 3O76A 5H5RA 3C73A 1HYUA 1EP8A 3EURA 2WULA 3QDNA 3F63A 5J9BA 2CAIA 1K0AA 4AJ8A 2WRTA 2X99A 4WBRD 4LMVA 2DIZA 1TU7A 4EO3A 3RBTA 3CRUA 1A8YA 4AF2A 2XHFA 1M0UA 4MDCA 3TJBA 2C1YA 5E4WA 1GH2A 3DEXA 3P90A 9GSSA 1Y25A 2N5BA 4CHSA 5HR0A 1FB0A 5CRHA 4IS0A 1K0CA 4NV5A 2PUKC 1V9WA 3IC4A 5D8IA 2GQLA 5C04A 4ZIJA 3IBHA 3GMFA 1XW9A 2JSZA 2O89A 3C1SA 4QL7A 4FH8A 2VIMA 3KH7A 1FO5A 2VD1A 2K6VA 1OC8A 1GTUA 2HRNA 4KW6A 4MK3A 4F9ZA 5D9XA 1R5AA 4EC0A 3Q19A 3Q18A 4KSMA 3QAWA 3HJPA 4GXZA 4PUAA 1WRYA 1F3BA 1R5PA 4N10A 4RI7A 5G1LA 2V41A 1XZOA 5DJLA 1U3AA 4WETA 2WCIA 2R2JA 2EIOA 1DBYA 4ULXA 3RDWA 4ECBA 5D93A 4GRFA 3QR6A 2LRTA 3ZMLA 4DSSB 2LQOA 3NOFA 3D4TA 3GA4A 5IO0A 4BVXA 5DCGA 1GSUA 4MZWA 1V40A 1ILOA 22GSA 2GS3A 4YQVA 3P2AA 3DVXA 3DKSA 1GL8A 3H1NA 3UL3A 5CYYA 1XW6A 4WBJA 3ZREA 4ZBDA 3ZIVA 4XS6A 4ML1A 5AIVA 2NBSA 3FZ9A 4BA7A 5ECSA 6GSSA 4TR3A 2XPDA 3HZ4A 4ZBBA 4L0WA 4GCIA 4PQIA 2C0DA 4J56E 4ZBAA 5IMVA 2C3TA 2KP2A 2C8UA 4NHWA 2HZEB 4TOPA 1SKWB 1EV9A 1ZMAA 3W8JA 1EV4A 4XS4A 1HNAA 3R2QA 4POKA 1O81A 3U5RE 1FB6A 2BMXA 4K7IA 3FR9A 4IN0A 1TTZA 3HVVA 3TKSC 1DE2A 2J23A 3K8NA 1WP0A 3ZIJA 1SD9A 2N5FA 1JZRA 2L5OA 1ZL9A 3CBUA 3LORA 2I1UA 4EDYA 3TJKA 1SK1A 2LUSA 3GTUA 5GZZB 3GX0A 3HYPA 3GKMA 2P5QA 2X8HA 3F3RA 2A2RA 2YV9A 1SJZA 2OACA 4OCEA 2GGTA 1XBSA 1VGLA 3TDGA 3GSSA 4K7OA 1BG5A 4MP4A 4HJMA 5H5SA 2WFCA 4V1Ag 1GSYA 2YV7A 3GNJA 5CRWA 3FEUA 1MD3A 2YWOA 2BTOT 4MJAA 4V1Ap 4K8MA 4V2NA 1GLQA 3LGCA 4DSQA 3HVXA 1TRSA 5JCGA 2YANA 3CSIA 4KDUA 1CQHA 5D73A 5D96A 1U87A 3PH9A 3RHCA 2H70A 2RLIA 4N30A 1T1VA 2AV4A 2A2SA 4RQXA 3A5WA 3VWXA 1GNEA 3V1WA 2A4VA 1V2AA 2MMOA 2F3MA 5F05A 1BEDA 4V2MA 4TR1A 1AW9A 4ZILA 3TRXA 3GX8A 3RAZA 5F06A 2H66A 3QAGA 4PNGA 1A0RP 3TKQA 4K1FA 5JCUA 1AQVA 2F8AA 1SJ6A 3FR6A 1ERWA 1BX9A 4KNDA 19GSA 3ZVJA 5F07A 1M9AA 1SKSB 2D2ZA 2JZSA 3HHVA 1FAAA 3MSZA 3F4RA 2QC7A 4ISDA 4TR4A 5EVOA 4HUAA 1QFNA 1M2DA 1PL2A 3M9KA 1TI1A 1OC9A 5COHA 4Q5NA 5G30A 1V57A 3SWLA 5ECHB 3QMXA 2DSAA 2TRCP 1AC1A 2JZTA 4GQCA 4WF4A 2LJKA 1PD21 4CDOA 2CQ9A 1EOGA 2FD3A 4L5OA 2WJUA 5D9VA 2YZHA 1JLVA 1NM3A 2DJKA 2IMKA 1SD8A 2OKAA 1XOBA 3EMPA 1T00A 1V58A 1W89A 2KHPA 4HS1A 3EYTA 1KBNA 2CZ2A 4LA1A 1H4OA 2B5EA 3TJFA 2KLXA 4WKWA 1K0NA 4MJCA 2RM5A 2H0IA 2PWJA 2GT6A 3KTBA 2DJ3A 3WYWA 4ZL8A 4L5LA 2GSRA 1OVNA 1O8WA 2VL9A 4MPGA 5DAKA 2GQMA 3DGQA 2IMEA 1U3IA 2WDUA 5ENUA 4NHZA 4BL7A 4EL1A 5EY6A 3F0IA 2KP1A 3IRAA 3DXBA 2LRNA 4WEYA 5AISA 3TCOA 12GSA 3I69A 1EZKA 4IP6A 1TU8A 3ME8A 4K6XA 2H73A 3GKXA 1YKAA 3H93A 4F82A 1I9DA 2HI7A 2WZ9A 2VLTA 3HJMA 3A3TA 4KB3A 1AIUA 1EP7A 3GH6A 3NIVA 1GSQA 1A2JA 1RW1A 4GSSA 3FRCA 3MNGA 3C71A 3G7JA 3IOSA 3IHQA 3H4KA 2QKEA 5ID2B 3ZITA 3EINA 5IM9A 4JE1A 3TKRA 5B6MA 3IAM2 2B7KA 4K7NA 5EL8A 2BJXA 3EU4A 3IDVA 3IK7A 1GTAA 2R6KA 2FGXA 5F8BA 1ZYEA 2ON7A 2R4VA 4GSNA 3HKRA 3GUSA 1GSDA 1ZGNA 2IPAA 4LL1B 1KEBA 4H86A 5DDLA 2FNOA 3LWAA 4MJBA 1XVWA 1X9WB 1OKDA 3HVSA 2H74A 4LMWA 2DBCA 2C4JA 1ML6A 3GH9A 2PGTA 3F3QA 3M0FA 4KX4A 2DLXA 2HZFA 3UOMA 1KNGA 4ECJA 2RUEA 4J57E 5DVBA 2CT6A 2RIIA 2WB9A 4IW9A 4GF0A 2GVPA 1TK0B 4TRXA 2GZZA 5JWRB 2G2QA 2B6MA 1VF2A 3BD2A 3KMOA 2C3QA 3AY8A 1QXHA 1B9XC 2PVQA 1LBKA 3BOAA 4EF0A 13GSA 2B3SA 1VF4A 2H6YA 2F51A 3GURA 3C1RA 3I6AA 4F0BA 1NHOA 4GTUA 3GYKA 4I2TA 4NWYA 1WJKA 2VM1A 1T7PB 2L5LA 4ZL7A 4HOJA 1Q98A 1PGTA 1EEMA 2VM2A 3ED3A 4DSRA 2O7KA 1AAZA 1SJIA 4I6XA 1TDIA 4N0VA 3TUEA 1X9SB 1Q4JA 2MBTA 2WS2A 3VFIA 3UAPA 3NZNA 1GTBA 3FZ4A 1PQNA 1SL2B 5DQYA 4JBBA 2OA7A 1F9MA 1XWGA 2VCQA 5C00A 2GDRA 2ZCTA 4XRDA 3HD5A 1M2BA 1O73A 3VWWA 2E2MA 1XFLA 1F6MC 1TK5B 1O6JA 1Z7RA 4YH2A 2L4CA 2N5AA 5G5EA 1K3LA 3WGXA 2FA8A 3F9UA 2JADA 2H0GA 1ABAA 1FVJA 4RUVA 2YCDA 3FR3A 1E2YA 4YAVA 6GSXA 3M3MA 3M1GA 2GSSA 5J3RA 1YEPA 5GSTA 3ZL5A 4NXIA 3ERGA 2H1GA 1X5EA 5A4WA 2H71A 1YDKA 5CREA 16GSA 4IELA 4KSOA 3GL5A 2H30A 1AUCA 3ME7A 1C72A 3P8WA 4FIWA 4XS4B 3L0HA 4D73A 2H0HA 2L4QA 3FY7A 5B6NA 3CTGA 5KN0A 2H19A 1JHBA 3TRPA 2J9HA 3UEMA 4PGTA 3LQ7A 3UBKA 3ZZXA 1VF1A 1GSSA 1O8XA 3M9JA 3M8NA 3GTUB 2OE3A 1IYHA 4XCSA 4E8HA 3SBCA 1PRXA 4ILFA 5A5KA 4G2EA 2YOIA 4PUFC 2MMNA 4RI6A 3C8EA 2EC4A 1YF0A 2ZUPA 4MH2A 2H8LA 2CAQA 2L6DA 1SL1B 2H1DA 5HQPA 1ERVA 2V2GA 1B8XA 2C3NA 2XBQA 4EUYA 1JZWA 2M72A 5GAPD 4WF5A 4PX1A 3EMXA 3FYGA 1UC7A 4MMMA 2GTUA 5ECNB 4E8EA 1PX6A 3LXZA 3KZQA 1TKDB 3QFAC 4XIHA 1A23A 5IO2A 2GLRA 2YNXA 1TRUA 2F9SA 4IP1A 1Z5YE 3F6DA 2X8GA 3EE2A 1JZDA 1PL1A 1YKCA 4KDYA 4TR0A 1GLPA 1TJDA 2NVLA 1T3BA 2LNSA 5CRGA 4GSTA 1T4ZA 3D21A 1THOA 3CSJA 5H5QA 4TR1B 4MZCA 2XPEA 3PINA 2JU5A 3APQA 5JCWA 1TRWA 1MDKA 3G7YA 6GSVA 1NW2A 1XPVA 4HQZA 5ECQB 1LJRA 3L78A 4OD7A 2K18A 4JRRA 3LEFA 1MDIA 3WD6A 2C0FA 4N11A 4KAEA 3Q6OA 4HU7A 5B8BA 5G1KA 4JU5A 1YJ6A 2C0EA 1FW1A 4XHMA 4EE0A 2CVBA 2EIRA 2IFQA 3KH9A 3UBLA 1SK2A 2DJ1A 2L6CA 3KCMA 3HA9A 2HZEA 2NTOA 4ZB8A 3N5OA 1OC9B 2QGVA 3CXGA 1F3AA 1PN9A 2JACA 4FYBA 2H1BA 1THXA 3CYNA 3KTLA 4ACSA 3KP9A 4GLTA 4JEDA 1FG4A 3A2WA 2VAFA 1Z7PA 20GSA 3GHAA 1MD4A 4F03A 4FYCA 5ABRA 2IIYA 4OO5A 2I81A 4O32A 1AQXA 3TRQA 1G0TA 5IQYA 5FT3A 3KMNA 2YJ7A 4NPBA 5HFIA 2DMMA 3UARA 1M99A 5CAXA 1XW5A 2K8VA 4OFMA 4HZ2A 2G0FA 4OO4A 3D0ZA 5DAKB 4BPYA 1WPIA 2LEGA 1URMA 4HQSA 1GP1A 4MF7A 5D9WA 3I9V2 1G7EA 4YQUA 3DRNA 1XVQA 2LJRA 2KUCA 3HDCA 4QQ7A 1QMVA 4AJ7A 5FHIA 1J08A 5J41A 5B8AA 3HY2A 4KH7A 3D6IA 4RQRA 4K2DA 2LS5A 1ST9A 1VRSD 5ELGA 1X9MB 18GSA 2E2GA 3ISOA 1XWCA 2C80A 5A4VA 1T8EB 1NSWA 3D4MA 3DD3A 2B5YA 4KGIA 1EWXA 2PBJA 3VPTA 1U6TA 5FWGA 2DJ0A 1ERTA 3KJYA 3LFLA 4NMUA 1TXXA 2VLUA 2ZNMA 3VK9A 3ZRDA 1O85A 3UVHA 2H6ZA 3LG6A 5JWQB 3I43A 2IN3A 4EDZA 5DCHA 3HZ8A 1OE7A 1GULA 5EPFA 3TOUA 2FCHA 2LQQA 3MDKA 6GSTA 4IHUA 1I5GA 5G31A 5IPGA 2X64A 2AYTA 4L8EA 2VOCA 1MTCA 2TRXA 2VO4A 5IMCA 3ZVJD 3F4TA 3ZFLA 3UJ1A 1S3DA 4PURA 1LU4A 2ES7A 3BCKA 1W4VA 5KN1A 1PX7A 2VCTA 4ML6A 4ZB6A 1SYXA 4O5RA 5HFKA 3UMAA 5CO3A 3IV4A 3H79A 2DJJA 1G6YA 3VI5A 3LJRA 3BCIA 1EOHA 3F6FA 2LKUA 4BWQA 2HXKA 5AGYA 3H8QA 4IKHA 2OE0A 2O85A 2VLVA 3E3EA 3QOUA 3S9FA 1SKRB 2HRFA 3L9VA 1GNWA 4MABA 3VI7A 3IE3A 2VD0A 5IMZA 2GT5A 2L59A 1DUGA 2H75A 4POMA 3LYKA 2V6KA 4KA0A 1TK8B 1UA5A 3IPZA 2PMTA 1JFUA 1TRVA 5ECKB 4MF6A 1R26A 4X43A 3D22A 1PMTA 5AN1A 1YF1A 3W8SA 1A2MA 2FWHA 4G9HA 3U6VA 3JCML 2P31A 4FYUA 3TGZA 1NHYA 3L4NA 1R4WA 4L0UA 1FHEA 1GSFA 4MF5A 2HYXA 4X0XA 4J2FA 4TKYA 3C7MA 1Z6MA 1QK8A 3ZMKA 4NAXA 2AAWA 1S3AA 2OADA 2YJHA 4Q5FA 1A8LA 2EIQA 1PKZA 4ID0A 4HJ2A 4IGJA 2FHEA 1XOAA 2PERA 1X5CA 5J4UA 1GWCA 3BBYA 3PGTA 3DYRA 3DMLA 5DJMA 5LNKe 4YAPA 1SENA 1K0DA 4OMVA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
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