1E2YA

Tryparedoxin peroxidase from crithidia fasciculata
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
GAAKLNHPAPEFDDMALMPNGTFKKVSLSSYKGKYVVLFFYPMDFTFVCPTEIIQFSDDAKRFAEINTEVISCSCDSEYSHLQWTSVDRKKGGLGPMAIPMLADKTKAIARAYGVLDEDSGVAYRGVFIIDPNGKLRQIIINDMPIGRNVEEVIRLVEALQFVEEHG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Structure of Reduced Tryparedoxin Peroxidase Reveals a Decamer and Insight Into Reactivity of 2Cys-Peroxiredoxins
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPAREDOXIN PEROXIDASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Crithidia fasciculata
total genus 46
structure length 167
sequence length 167
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1e2yA00
2PUKC 4OWYA 1FB0A 2EIRA 4BPYA 1UN2A 3F0IA 3US3A 2C3TA 2HXKA 4KB3A 2DJKA 2MBTA 3A2XA 4FH8A 1DE2A 1SL1B 1YKCA 1ST9A 2HNLA 3GMFA 5INYA 2IFQB 4GSSA 4EUYA 4IVFA 3FW2A 1PMTA 14GSA 1YJ6A 1HD2A 1ZGNA 2R3XA 2GQMA 3L9UA 5DALA 3BBYA 4YQUA 4P3YB 1B8XA 4IP1A 4MJBA 5B6NA 2E0QA 4WF5A 5D9VA 1M2BA 1WP0A 3GUSA 3QFAC 2GS3A 2C1YA 4Q5QA 4XIHA 4PXOA 4I5QA 2X99A 2PN8A 3EMPA 3TKSA 2N5AA 4GTUA 2DLXA 2G2QA 2YN1A 4IQAA 4IJIA 4V1Ag 3LQ7A 5CRGA 3DIEA 2VD0A 3ISOA 4NV5A 3F6FA 3C73A 3UVTA 2WRTA 2LNTA 3FKFA 1Z7RA 1PX6A 4J2FA 2IMIA 3IXRA 2KLXA 2HZEA 4K9ZA 1ZL9A 3GA4A 2WZ9A 1O85A 4F03A 1B48A 1X5EA 1M2AA 2H72A 2FWEA 3KMNA 1GSDA 4WKWA 2I81A 2YPMA 3HDCA 4K6XA 4POMA 3BD2A 1G7OA 3LXTA 2C4JA 2ON7A 5L71A 3ZIJA 1WOUA 2FLSA 3KCMA 2OBIA 1FB6A 4K2DA 4OFTA 1XPVA 2IMEA 1EP7A 4HQZA 2CT6A 4WR4A 1DUGA 4ID0A 4IKHA 3UOMA 2LKUA 4ML6A 5EY6A 1SKSB 3HA9A 4QL7A 1B4PA 4HJMA 2NBSA 4X0XA 1A23A 4O32A 2TRCP 1OE8A 2X64A 3VI5A 2H6ZA 1PL2A 2FWGA 3CRUA 5B8BA 4G2EA 3VWUA 4OO5A 1GNEA 3ZLPA 4OMVA 1GNWA 5ECPB 4EDYA 3TCOA 1VGLA 3ZVJA 2H6XA 3S9FA 2X8GA 4KDYA 1H75A 2FUG2 5KN3A 3ZFLA 3LWAA 2V41A 3VLNA 1UA5A 2OKAA 1KNGA 3M9KA 5IMAA 4ZB6A 1GTAA 3QFBC 3FZAA 4GRFA 3W8JA 2V2GA 3KTBA 2MYGA 4EXJA 3I9V2 2FWFA 4POBA 1Z5YE 4RI6A 2IMFA 3G7YA 1AC1A 4HZ2A 2L5OA 3QCPA 1WRYA 4LL4B 4X43A 2E2GA 3LJRA 4WBJA 1SYXA 2A4VA 1DBYA 1XOBA 3DXBA 6GSWA 1EP8A 5IOXA 4H86A 4BA7A 4L5LA 1PSQA 5KN1A 4EF0A 1BQ7A 1TXXA 3GN3A 5G31A 4HDEA 1MTCA 2FHEA 5D93A 3DRNA 3TJKA 5A4VA 4HS1A 1YY7A 2FD3A 1O7UA 5LNKe 1JLWA 2X8CA 1ERUA 3UBLA 2DC5A 4LL1B 4F9ZA 3D4TA 4IHUA 2IMDA 4WR5A 3C1SA 4Q5RA 1Z6NA 2K8SA 3IAS2 5IIZA 2PERA 2HYXA 5F8BA 3TB2A 3APSA 1C72A 1YEPA 2C80A 5D9TA 3TJJA 1T7PB 1WJKA 1ZZYA 2XBQA 4XCSA 4LA1A 3UARA 4ISDA 2Z9SA 3DMLA 3ZFBA 1Y25A 5ECKB 3UBKA 1OVNA 5AIXA 1HNAA 4IJ3A 2IPAA 1M7TA 1YF0A 2RLIA 3V1WA 2H0IA 1GP1A 4V2MA 2V6OA 5DBQA 2H76A 3KGKA 1A2MA 5JCWA 4MLYA 4OCFA 3WD6A 1V9WA 2LTKA 3APOA 3PR8A 4K7OA 1WIKA 2CX4A 1YDKA 1OC3A 2IN3A 4N30A 3K8NA 1X5DA 19GSA 1H4OA 3GH6A 1J0FA 2MMZA 2OADA 2O7KA 5D9WA 4BL7A 1G7EA 5G1KA 2F8FA 5IMFA 4EE0A 1XOAA 2LRTA 5J9CA 3KIJA 2PU9C 1EEMA 5IMCA 1SENA 1PGTA 4JU5A 1F3BA 1Y6EA 1O8WA 3FR6A 5B8AA 1VF4A 2YZHA 5A4WA 2YJHA 1Z6MA 1M9BA 4NAXA 2DJ1A 2VLUA 3EINA 2D2ZA 4FYCA 6GSXA 3KH9A 5G5FA 1KTEA 1XFLA 3WT2A 4ZL9A 3H1NA 1TP9A 3LG6A 3GKMA 2WB9A 5CRDA 4IN0A 2H73A 3IV4A 1ZYEA 10GSA 2RUEA 5GAPD 1V2AA 3GNJA 3KP8A 3QAGA 4FO5A 2YWOA 1K0NA 3IHQA 17GSA 2HI7A 3TGZA 5G2ZA 2XHFA 2B5EA 3WT1A 8GSSA 3APQA 4K0GA 3D5JA 2RIIA 5IQYA 1SU9A 2LRCA 1FOVA 3KM6A 5A4UA 4DSSA 1DE1A 2JZTA 4OFNA 2DMMA 1XIYA 4WXTA 2HT9A 2DBCA 1JZOA 1K0OA 2H19A 4KA0A 3DKSA 1YZXA 1A8YA 22GSA 5G1LA 1T4YA 3A2VA 3FZ5A 1OC9A 1U87A 4XRDA 4KCEA 1ML6A 2JACA 2R4VA 1JHBA 4CDOA 3HKRA 2OE3A 1EEJA 3FYGA 4NV2A 3J7Yk 4HUAA 4MF6A 4KDXA 3IPZA 2V32A 3R2QA 2QKEA 1WPIA 1A0RP 2VLTA 1TKDB 1F3AA 1E6BA 3LXZA 4HQSA 2VL2A 2YWNA 4OO4A 2VL9A 1TRVA 1TK8B 1K0DA 4PQHA 4MZCA 1PD21 3A2WA 2KHPA 1W4VA 1NHYA 1Q98A 4I8BA 3GHAA 1XVQA 4KH7A 1SL0B 1X9SB 1PA3A 4TR0A 5F07A 1AAZA 1XCCA 4KNDA 1SYRA 5IPHA 2JADA 2OE1A 3FZ9A 1FAAA 1GL8A 2VCVA 3GL3A 5EL8A 1UVZA 4AF2A 4XTSA 3CSJA 1EGOA 5IMDA 3HY2A 2VCXA 2O85A 3GTUA 3MNGA 3QAVA 1BX9A 5DAKA 1MDKA 2P5RA 5ECHB 1CQGA 5HFIA 1LBKA 2LJAA 3D4MA 2VUPA 1N8JA 1ON4A 4OCEA 4PGTA 1GLQA 2LJKA 5CP1A 2B7JA 5B6MA 3H8QA 3HYPA 5ID2B 2AB6A 4I6XA 3TKSC 4ECJA 3P7XA 5DCHA 1M2DA 3D6IA 4ZB8A 1MD4A 2N5BA 1AQXA 2KP2A 5G30A 4MZWA 3TKRA 3IE3A 4PNFA 2I9HA 4LMWA 3CMIA 4IQ1A 2R2JA 2VD1A 5F0GA 2VCTA 3I69A 4O5RA 2WS2A 1U3IA 3ZITA 4IGJA 2VIMA 1GUKA 3KJYA 5ID2A 1WMJA 5FWGA 2B7KA 6GSSA 4HJ2A 4ECIA 2I3YA 3D22A 4NWYA 1T4ZA 3FR9A 4J56E 4MF7A 4ECCA 2AYTA 2HZEB 2H71A 3D21A 2L6CA 3UAPA 3TKSE 3IR4A 2HFDA 2REMA 1GTIA 4AJ7A 1BAYA 2L57A 2ZNMA 1SJZA 1B9XC 4N0ZA 3BJ5A 4MCUA 1GH2A 3PH9A 4TR1B 3PGTA 5HR0A 5D8IA 2IL3A 3G7IA 2CZ3A 4GCIA 2FCHA 3TKQA 1OAZA 1VF2A 4RI7A 3DVXA 5JWRB 3IBHA 5DVBA 5JWOB 4JR6A 2B1KA 1KBNA 5F06A 2L4CA 3KXOA 5GAND 2AHEA 4Q5NA 4DSQA 3DWVA 3HZ4A 5ELGA 5H5RA 1A0FA 3SBCA 1GRXA 4E8EA 3EE2A 1U88A 3O76A 4TR1A 2J9HA 2VL3A 18GSA 2DJ2A 2R37A 4EO3A 5KEJA 4LMVA 4BWSA 1SJIA 3CTFA 9GSSA 1V58A 2V6KA 4L8EA 2PGTA 5FT3A 3RPNA 2TIRA 1T1VA 4XRAA 5J9BA 2YJ7A 1R26A 1O8XA 3F3QA 1W89A 3HD5A 4YAVA 2MZCA 5H5SA 3LSZA 3U6VA 3MSZA 4WEYA 3CRTA 3BOAA 3M0FA 1U3AA 3H4KA 4N10A 4DEJA 1XBSA 1ABAA 4MP4A 4O7HA 3QAWA 4MJAA 1RK4A 4HEA2 1T00A 1QQ2A 2YP6A 2EIOA 4TVEA 3BCIA 1TRUA 3GX0A 4IP6A 1RQMA 1ERWA 1FO5A 3F4SA 5DDLA 5JCUA 4J57E 2QC7A 4JEDA 2H75A 1I9DA 4D73B 3UMAA 4F82A 4BVYA 5CAXA 5ABRA 2C8UA 3O3TA 3GFKA 4HI7A 3M9JA 5GZZB 1BEDA 2ZUPA 2NDOA 1XWKA 5D96A 2WDUA 5CYYA 5DCGA 1G0TA 2K18A 4GSNA 1YF1A 3QOUA 2KP1A 4ZBAA 2RM6A 4TXVA 1UC7A 4XS6A 1ZCPA 1VRSD 2LUSA 2TRXA 4D73A 4RQXA 1ZOFA 3LYKA 1A24A 1GTBA 1GWCA 4PX1A 3ERFA 3HJMA 4ZIJA 3KTLA 4F2IA 5IMZA 1BYEA 2F51A 3F4RA 2L59A 1XW9A 3FR3A 2O89A 5IO2A 1ZYQB 1SL2B 3BCKA 1O81A 2PWJA 2LSTA 2JSZA 2I4AA 5IPGA 4G10A 4I97A 4DVCA 1EZKA 1PN9A 1O6JA 4JBBA 5F05A 4GQFA 4CHSA 2B3SA 3KEBA 20GSA 4MJEA 5E59A 4GQCA 2CVDA 2P31A 3LGCA 3JCML 1X9WB 5AISA 2RM5A 2JZSA 2GZYA 4IW9A 4ZXGA 2B1LA 1TTZA 1TK5B 2ES7A 1S3CA 1LJRA 4TOPA 2OE0A 3VURA 3MDKA 2VM1A 1PX7A 3GKKA 1YKAA 5GSSA 1TI1A 2BTOT 3NOFA 1YQ1A 5D9XA 1V98A 2IMKA 4WF4A 2ON5A 1QFNA 1FW1A 2F9SA 2M46A 3GURA 5HR2A 3EVIA 1K3OA 3ZRDA 1F37A 1JZRA 1SK2A 3N9JA 2RUFA 5COHA 4MPGA 5ECNB 5ENUA 4ULXA 2R5GA 3EWLA 2GZZA 2ZCTA 1TRSA 2AUVA 1LU4A 1G6YA 1JFUA 4DSSB 2NVLA 3W8SA 5HR1A 1XWGA 5JCGA 3VI7A 4K7IA 1FHEA 1KEBA 3MAKA 3SWLA 3C1RA 4RQRA 3AY8A 3UL3A 3ZVJD 4ACSA 3KMOA 4TR4A 5EVOA 1ACVA 1OC9B 2JU5A 3Q18A 7GSSA 2DJ0A 2VL2C 4MABA 3IOSA 2YV9A 3M1GA 2C0FA 2H66A 2DSAA 1G6WA 5ECRB 3TUEA 5AN1A 5C00A 3ME8A 4K0NA 4TRXA 2HE3A 1GTUA 4ILFA 2GQLA 2GSQA 1VF3A 2GT5A 1B9YC 3L0HA 3GYKA 1QXHA 2I1UA 2GT6A 4EL1A 1TDIA 1TW9A 3A5WA 2K8VA 4KX4A 4MH3A 2GVPA 3F3RA 1HNBA 1M9AA 3ED3A 4IELA 2VLVA 2FWHA 1QMVA 4OD7A 3QR6A 1XW6A 5IMVA 2FA4A 1FVJA 3IK7A 5J4UA 3GTUB 4AJ8A 4XS1A 5DAKB 1VF1A 3C71A 2WCIA 3EU3A 2CAQA 3CBUA 4KE3A 4EKZA 3NZNA 4F0BA 2BJXA 3QMXA 2C0DA 1GSYA 1K0MA 2H8LA 3HVSA 4L0WA 3ERGA 2X8HA 5CRHA 3RAZA 2CQ9A 5J3RA 2YOIA 3TRPA 4PNGA 4XS4B 4YAPA 1GSUA 4PQ1A 1SJ6A 4MPFA 4ZBBA 2N5FA 4KAEA 1TK0B 2AV4A 3TJBA 1E2YA 1I5GA 3O6TA 3VPQA 4EVMA 4FYUA 5ECSA 2DMLA 3H93A 2CA8A 2E2MA 3F4TA 1NHOA 2E7PA 1K3YA 3C8EA 1M99A 5DJMA 3EURA 2H1DA 4XS4A 3LORA 3D0ZA 4HZ4A 3VWVA 2NTOA 1JLVA 4MA9A 2AJQB 4K8MA 2HZFA 2ALBA 4OFMA 1AQWA 1TRWA 2P5QA 4I2TA 2YCDA 4N0VA 1XZOA 4MK3A 1GUHA 4N11A 4NHWA 1SKRB 1K0AA 3VWWA 2HLSA 2VCQA 2GDRA 2QGVA 1URMA 3DGQA 2L4QA 4JE1A 4GLTA 2XPDA 2C0EA 2OBKA 1Z9HA 4XHMA 1XXUA 3TOTA 3UEMA 3CXGA 3HVVA 3IC4A 3G7JA 1M0UA 3RHBA 3ZMLA 3EYTA 4POLA 1XWBA 1USBA 2HRFA 4L5OA 1HQOA 3Q19A 4TKYA 5ECQB 1XWAA 3TKPA 1AIUA 2VM2A 3G9BA 1R5PA 2VAFA 2LV3A 3LFLA 5ELAA 1AQVA 4AJ6A 2IFQA 3I6AA 4ZL7A 3ERWA 2A2SA 1X0RA 5JWQB 4KCAA 3HJOA 1T3BA 2FA8A 3E3EA 5DQYA 1ERVA 4V2NA 4ZB9A 2OA7A 1NSWA 3CSHA 1XW5A 3E9JB 5C04A 2H6YA 5AIVA 4TR3A 16GSA 1OE7A 3EC3A 3QPMA 2GLRA 3WGXA 2O8VB 2P0GA 3CTGA 2HSHA 2XC2A 3L4NA 3IA1A 3GRXA 3IK9A 3KZQA 1THXA 2JL4A 1GUMA 1THOA 1F9MA 2GTUA 1HNCA 1OYJA 4GWRA 1K0BA 3HVXA 2DJJA 1X9MB 2LQOA 1PL1A 3RDWA 1BJXA 1GSQA 6GSTA 4I2UA 3ZZXA 4JRRA 4RUVA 3CSIA 1BG5A 1ILOA 5HR3A 2VOCA 3F63A 3UIWA 3NIVA 2PVQA 1Q4JA 1MEKA 4FIWA 1X5CA 2GGTA 3VK9A 4HU7A 4G9HA 3TJGA 3GSTA 2PMTA 1SK0A 4AGSA 1EOGA 5J41A 1GSEA 1JZDA 3W6GA 3FEUA 2HSYA 3TRQA 2YWIA 2H30A 3GKNA 2CV4A 3ZREA 1TU8A 4Z7XA 2YANA 1A2JA 4KUNA 3P8WA 3IAM2 2YNXA 2CZ2A 2M72A 1A8LA 2MMAA 3FHKA 3UVHA 2FGXA 2YZUA 1PQNA 1EV9A 3F8UA 4EDZA 3Q74A 1OKTA 2PBJA 3RBTA 1GSSA 1EWXA 4V2LA 4X1UA 5IM9A 4MF5A 4K1FA 1XVWA 5DQSA 3L9SA 2NPBA 2R6KA 1NW2A 3HCZA 4ZILA 1FVKA 2DIZA 3FY7A 5ECLB 1JZWA 3IRAA 2YV7A 2H1GA 5ECIB 5IO0A 3GSSA 1MDJA 3F6DA 2MBSA 2GZPA 2MMNA 2B5YA 2IWTA 12GSA 1EGRA 1AW9A 2L6DA 2H0HA 1GULA 5HQPA 5CREA 4GXZA 4JR4A 3HHVA 3M3MA 1OC8A 3VFIA 2LRNA 3LEFA 4WBRD 2PVOC 3U5RE 2MMOA 4WETA 2M80A 3DEXA 2H70A 2XPEA 5H5QA 4ML1A 1A2LA 3C7MA 3QDNA 3OR5A 5ECMB 4KW6A 4PQIA 1ZMAA 1HYUA 3EMXA 4K7NA 2FY6A 1GLPA 4FYBA 1PRXA 2XBIA 3E0UA 4NPBA 3WGDA 3GX8A 3A3TA 1CQHA 1SD9A 1MDIA 2VCWA 3GIXA 3N5OA 2LEGA 2KOKA 3ZL5A 5CNWA 2H1BA 4MDCA 4MH2A 3RPPA 2CVKA 5AGYA 1R4WA 2LQQA 1O73A 6GSYA 1OKDA 1Z3EA 2DIYA 3MWHA 1TOFA 3P90A 1K0CA 1RW1A 1N2AA 3ZIVA 2JZRA 4F0CA 6GSUA 3TRXA 1WE0A 4HU9A 1PKWA 3ZTLA 2K6VA 3QD9A 5CO3A 4V1Ap 1NM3A 1J9BA 2LJRA 4KSMA 2F8AA 3GH9A 5LD0A 3VPTA 2GSRA 2BMXA 2C3QA 4ECBA 4IBPA 5KN0A 5KN2A 2IJYA 5D73A 1T8EB 3RHCA 2AAWA 2L5LA 1WWJA 1QGVA 2HRNA 3KP9A 4ZBDA 4Q5FA 3ME7A 4NHZA 5GSTA 3WGEA 4NMUA 4YQMA 1PKZA 2B6MA 4PUAA 1MD3A 3KH7A 13GSA 3DYRA 4CW9A 3DD3A 3IDVA 3HJPA 1F6MC 5DJLA 1QK8A 3M8NA 4NXIA 2WGRA 1SKWB 5CRWA 2YWMA 4MMMA 3PINA 3EU4A 1R7HA 4TW5A 1ERTA 1Z7PA 6GSVA 4DSRA 3P2AA 3HZ8A 4GF0A 4QL9A 4G19A 4KGIA 1U6TA 2GSSA 4IS0A 2EC4A 3Q6OA 1R5AA 4KDUA 4PURA 1IYIA 2H1AA 2VCZA 1SD8A 2O87A 1K3LA 3TDGA 1FG4A 4KSOA 3GL5A 1TU7A 4BVXA 1V40A 3ZYWA 2C3NA 2WJUA 3ZMKA 4PUFC 1SK1A 3LYPA 2IIYA 2OACA 5IOWA 3J7Yb 2OJLA 3GKXA 1V57A 5EPFA 3WYWA 2H0GA 2FNOA 2CAIA 3L9VA 5HFGA 2F3MA 4L0UA 1XWCA 2G0FA 5LCZA 5HFKA 3TOUA 5FHIA 3H79A 3FZ4A 2QSIA 2EIQA 3FRCA 1EV4A 2CX3A 4TXOB 3KD0A 1GSFA 4O92A 2CVBA 2J23A 3L78A 1J08A 2DJ3A 3HXSA 2GQKA 4JZQA 2B5XA 2WFCA 1DSBA 3UJ1A 1AXDA 3F9UA 5B7CA 1YEXA 3GV1A 4GSTA 2KUCA 5J5NA 4YQVA 2K9FA 3FK8A 2A2RA 5A5KA 1F2EA 4YH2A 11GSA 4TXOA 1S3AA 3VWXA 1IYHA 4LLRA 1B4QA 2GSTA 3DVWA 5ECOB 4ZL8A 2VO4A 2LS5A 4QQ7A 4E8HA 1QUWA 4POKA 2JSYA 1S3DA 1AUCA 2C0GA 5E4WA 1TJDA 3TJFA 1TI3A 3I43A 4MZBA 3CYNA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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