4IHUA

Reduced form of disulfide bond oxdioreductase (dsbg) from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
201
structure length
201
Chain Sequence
GPGDAVRVTSSKLVTQPGTSNPKAVVSFYEDFLCPACGIFERGFGPTVSKLVDIGAVAADYTMVAILDSASNQHYSSRAAAAAYCVADESIEAFRRFHAALFSKDIQPAELGKDFPDNARLIELAREAGVVGKVPDCINSGKYIEKVDGLAAAVNVHATPTVRVNGTEYEWSTPAALVAKIKEIVGDVPGIDSAAATATSA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Isomerase DsbG
publication title Structural and biochemical characterization of the essential DsbA-like disulfide bond forming protein from Mycobacterium tuberculosis.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 65
structure length 201
sequence length 201
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13462 Thioredoxin_4 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ihuA00
2YCDA 19GSA 5G2ZA 3UBKA 4PURA 1F6MC 2L4QA 2FWFA 1ABAA 2FA8A 4IBPA 2PVOC 1ST9A 3GL5A 5AIVA 4ZL7A 2VCVA 2YV7A 4HZ2A 5IM9A 1TI1A 5CYYA 2RM5A 1OE8A 4F82A 3IRAA 2YANA 1XWKA 1XWGA 5CNWA 4AJ8A 5J9BA 4TR3A 1IYHA 3L9VA 5IMCA 2XHFA 4EDYA 4GLTA 2LKUA 3L0HA 5HR1A 3LYPA 3EMPA 1VGLA 3H8QA 4MF5A 3U5RE 3O3TA 3JCML 2TRCP 2X99A 4LA1A 4IW9A 1YKCA 3VI7A 1BJXA 4WR5A 1R7HA 3A3TA 1BAYA 4TN8A 1FHEA 1TK5B 2DJJA 4J2FA 3Q18A 1K0NA 2WZ9A 3F6DA 4ZILA 4MCUA 3UMAA 3VWWA 4D73A 3GSSA 5JWOB 3UBLA 2H6ZA 4WXTA 3W8SA 3FKFA 1Y6EA 1T4ZA 1S3DA 3DWVA 2ON5A 3ZLPA 3K8NA 2F8AA 4IQ1A 2DSAA 1T4YA 3ME8A 3QDNA 3KXOA 4KCAA 4V2NA 5H5QA 5ELAA 3HHVA 5ECLB 2C0GA 4ECJA 3DMLA 4PNFA 5IOWA 4IGJA 1A24A 5HR2A 1HYUA 4XRDA 2GLRA 4PX1A 2YWIA 4IN0A 4EKZA 4NHWA 4PQHA 3V1WA 4F0BA 1WOUA 4JU5A 2OBIA 5CAXA 2YOIA 2YWNA 4JRRA 2WS2A 2VUPA 3DVWA 4YQMA 1SD8A 4OCFA 3ISOA 2YN1A 3TRPA 2BJXA 2H8LA 4NHZA 3EYTA 3HDCA 2IFQB 5J5NA 5D9XA 2R37A 4ECIA 4FO5A 3A2VA 3VPTA 4IP6A 4IHUA 1KEBA 1AC1A 1QMVA 1FG4A 2VM1A 5DALA 5B7CA 3DXBA 1BG5A 5A4UA 1TKDB 5F07A 2IMEA 2A4VA 4YH2A 2YZUA 1F3AA 4OO5A 5EVOA 1OC8A 3VFIA 3TJBA 2LQOA 3UIWA 1DSBA 2PGTA 3GN3A 3IBHA 1OAZA 1FAAA 4MK3A 1GTBA 2H73A 5G31A 3MSZA 3US3A 2HT9A 4HOJA 1K0OA 2L6DA 1WP0A 3WGEA 2GSRA 3ED3A 2JL4A 3CSJA 4O32A 3KMNA 4MJEA 3FK8A 4MH2A 3KTBA 6GSSA 1EOGA 4XCSA 1TXXA 1JZWA 1PQNA 1X0RA 1CQHA 2F9SA 4TR1A 1AUCA 4MLYA 2YPMA 2I3YA 3ZFBA 1W4VA 1LU4A 1SENA 2O85A 3ZL5A 1U3AA 4XS6A 3GH6A 5IMZA 3TRQA 1JLWA 1R5AA 2IMDA 1Q4JA 2RLIA 2WGRA 5IO2A 1TTZA 2VL9A 3QFBC 2H1AA 1FB6A 3GRXA 1TW9A 1ACVA 3I6AA 3UARA 3GTUA 3ZTLA 4RI7A 5DCGA 1SD9A 2PBJA 1Q98A 2MMOA 2VIMA 4Q5FA 4ID0A 5CP1A 2QSIA 3CSHA 5DVBA 1J08A 2RM6A 3GKXA 2XPEA 3GKKA 4N0ZA 1MD4A 4WR4A 4L0WA 1XXUA 2CAQA 1GSUA 4MF7A 3VWXA 4LL1B 2VL2A 2JACA 5D9WA 4GQFA 4L5OA 3L4NA 3MDKA 5G1LA 1JFUA 2FA4A 9GSSA 3LXTA 1XOAA 2WRTA 2XPDA 4F03A 5D73A 3TJFA 3UL3A 4EE0A 4P3YB 4PGTA 2MBSA 3HVSA 1USBA 1HNCA 2KP2A 5KN0A 3BJ5A 4V2MA 1V98A 5JCWA 3KMOA 4NPBA 2H1BA 2B3SA 3BD2A 1GSQA 2PERA 2RUEA 3RBTA 2LJAA 2E2MA 5D9VA 1JZDA 1GWCA 3APSA 4LLRA 1DBYA 2OADA 2K18A 1ERTA 4G2EA 4DSSA 4CW9A 2FY6A 1B4QA 4WKWA 4BA7A 3IV4A 3TJKA 1TRWA 4CHSA 4F9ZA 1Z6NA 3LGCA 1JHBA 5CRHA 2A2SA 4MJAA 2XC2A 4AJ6A 5DJMA 4NMUA 5KN1A 5FHIA 2AUVA 3KIJA 1ZYEA 3WYWA 2YZHA 1FB0A 3F6FA 4K1FA 1ZYQB 20GSA 1GTAA 4DSSB 1YDKA 3FR3A 1V9WA 2KOKA 4EVMA 3DIEA 3HVVA 10GSA 1A8YA 1TDIA 2YP6A 3GKNA 2NPBA 7GSSA 1O85A 2H0IA 3IK7A 2C0EA 2ZCTA 1A0FA 3LWAA 4EC0A 1R4WA 2VLTA 2C3TA 5ECNB 2R4VA 4MPGA 5E59A 5AGYA 2H66A 3FZ5A 5ECRB 2GDRA 3HCZA 2DJ1A 5ECOB 2F3MA 3C8EA 2J9HA 4TXOA 2LV3A 5G30A 2OE3A 4TOPA 5C04A 2OJLA 3IA1A 4HEA2 5J9CA 1SK1A 3M9JA 3P90A 3IPZA 2KHPA 2MYGA 4XS4B 1UC7A 5COHA 1FW1A 2CX4A 1W89A 5FWGA 1XBSA 3RHBA 5CRGA 3CRUA 5C00A 1O73A 1Z7PA 2L5LA 5DJLA 3HA9A 2O87A 5B6NA 1G6YA 1XFLA 5AISA 3TGZA 2DJKA 1GLPA 2R5GA 4HZ4A 5KN2A 4HDEA 4BWQA 4YAPA 1GSEA 3FR9A 2XBQA 3HZ8A 2C4JA 2GZYA 3GMFA 4I2TA 1X9SB 1XVQA 4RQRA 1OKTA 4GF0A 3CTGA 4HS1A 1TK0B 1XVWA 5ECHB 4KNDA 4AF2A 4QL9A 1NHYA 3ZIVA 5HR0A 3CSIA 1YJ6A 3E9JB 1LBKA 3O76A 2C1YA 4NAXA 2JZRA 1I5GA 3L9SA 1O8XA 1B9XC 4ECBA 1JLVA 2JU5A 3KH7A 2E2GA 1MTCA 4GCIA 1Z3EA 4PNGA 3KP8A 2BTOT 1JZRA 3BBYA 2FCHA 3D22A 4MZBA 5GAND 4ZB8A 2B6MA 3QD9A 3VPQA 2GTUA 2HRNA 2M72A 3QPMA 1GSDA 2OE1A 4DSRA 2X8HA 2TRXA 5L71A 4K7OA 2HSYA 1GNWA 3TB2A 3F4SA 3KCMA 3HVXA 5LD0A 1QK8A 1MDIA 3PGTA 2VLUA 3DKSA 3KP9A 2WDUA 1FOVA 1NSWA 4QQ7A 1MD3A 4EO3A 8GSSA 1QUWA 1R5PA 2DJ0A 4TR4A 1YEXA 2C3NA 1SL2B 3EURA 4TVEA 3UJ1A 3HJOA 3WGXA 3QFAC 4AGSA 2EIQA 1X9MB 5IPGA 2CZ3A 2GZZA 2QKEA 3LG6A 2FWHA 4QL7A 4JR6A 2AAWA 2VO4A 1F2EA 3FYGA 2H74A 2R2JA 4OFMA 3IAS2 1A8LA 3GNJA 2H0HA 2P31A 1B48A 4KA0A 5A4VA 3PH9A 2B7KA 5ELGA 4ISDA 3LFLA 2QGVA 3TJGA 2CQ9A 3FZAA 3D21A 2B1LA 1GL8A 2IFQA 3H1NA 1F9MA 3FW2A 4WETA 3SWLA 3F3RA 5EPFA 3P7XA 1XZOA 5FT3A 4MJCA 1TK8B 3ZMLA 4E8HA 3QAGA 3TKSC 4HJMA 2OKAA 1S3CA 1SK0A 1WPIA 4ZBBA 1GUKA 3P8WA 4KDXA 2JZTA 1PX6A 2OE0A 1VF4A 3G9BA 5ECMB 2MMZA 1EGOA 1VRSD 3W8JA 3LORA 1O81A 1GH2A 4HI7A 4PUAA 3FZ4A 1PL2A 2LNTA 4FYCA 1EOHA 5IO0A 3CBUA 2WB9A 3KGKA 1GNEA 2LSTA 3D0ZA 4KDUA 1EZKA 1MEKA 1ZOFA 2IWTA 3HJPA 3MWHA 3RHCA 1DUGA 4O92A 2FWEA 3GH9A 1V57A 2H0GA 3QOUA 4PQIA 4ZB6A 4EF0A 4I97A 1M7TA 1NHOA 3AY8A 2V32A 4TXVA 3IOSA 2B5XA 5IIZA 2DJ2A 12GSA 2O8VB 1WRYA 4MABA 5EY6A 3H79A 4YQUA 1TU7A 2LRCA 4X0XA 4NV5A 5LCZA 5J3RA 1GSFA 1G6WA 2MBTA 1NM3A 1UVZA 2DBCA 1N8JA 2EC4A 4IQAA 2E7PA 1PX7A 4MF6A 4X1UA 3F4RA 5HFGA 1OC3A 1HNBA 2ES7A 3FR6A 2VM2A 2WFCA 3GFKA 4K2DA 1SYXA 1NW2A 2LNSA 3HZ4A 3CRTA 2IMIA 3G7YA 4RI6A 1CQGA 1ILOA 1V58A 1XW5A 2H71A 2HE3A 2AYTA 3QMXA 3TKSE 2GQKA 2J23A 3BCIA 1PRXA 3HD5A 1M0UA 2DJ3A 3ZIJA 4JBBA 2YWOA 3MAKA 3OR5A 3HXSA 2DLXA 3VK9A 4FYUA 4OWYA 2CX3A 4IELA 6GSVA 4MJBA 4K7NA 1PL1A 3IK9A 1B4PA 3R2QA 1HQOA 4AJ7A 4MH3A 4HUAA 1M9AA 1YQ1A 3APQA 3D6IA 4ZL8A 5IMVA 17GSA 2H19A 1ERUA 2CVBA 2GVPA 2HZEA 3BOAA 5DQSA 2H75A 1JZOA 3UAPA 3J7Yb 1SU9A 1VF1A 5ID2A 5D93A 1B8XA 1SYRA 2LS5A 6GSYA 3LSZA 2K6VA 3PINA 1GSYA 2KLXA 3PR8A 4ZXGA 1THOA 1PN9A 2LJRA 3IE3A 4LMVA 4XTSA 1SKWB 3GIXA 2NVLA 3TDGA 2DC5A 3TCOA 2TIRA 2LEGA 1PGTA 4GQCA 3ERFA 5F8BA 3DEXA 3Q6OA 2HZEB 2VCQA 4L8EA 1QXHA 3TKQA 2DIYA 4K8MA 1SKRB 5ID2B 3F8UA 1WMJA 4OD7A 1MDJA 1J9BA 2HLSA 1YF0A 3RPPA 1PSQA 2FGXA 3Q74A 4EDZA 2ON7A 4BVYA 1Z6MA 3W6GA 2IL3A 3C71A 2L6CA 1OC9B 2IN3A 4I2UA 4NWYA 1I9DA 2H6XA 3VURA 5JWQB 4IP1A 4E8EA 2IMFA 1OKDA 2O89A 4K0NA 2JSYA 2V6OA 4I5QA 3E0UA 4WF4A 4POMA 3A2WA 3BCKA 2OBKA 4Z7XA 3I9V2 2B7JA 2LJKA 4ILFA 4CDOA 2CA8A 4I8BA 1T1VA 4Q5NA 1GTIA 5F05A 4DEJA 1DE1A 1E2YA 4ACSA 2FUG2 1TI3A 2PN8A 2PU9C 4XS4A 1O6JA 3EC3A 3KH9A 1TOFA 1SL1B 3D5JA 2FLSA 2BMXA 5AN1A 5IMAA 3EU3A 3G7IA 2IMKA 1XIYA 1WWJA 2ZUPA 4IJ3A 1A2LA 4MZCA 2X64A 4JR4A 5HFKA 5G5EA 1KTEA 1K3LA 3F0IA 2N5BA 3F63A 1TRSA 2O7KA 3M3MA 2H70A 3C1RA 2CV4A 4ZIJA 5F0GA 2L59A 3EU4A 4KCEA 4ECCA 2R6KA 4DVCA 3GV1A 1PA3A 1U88A 3QAWA 2B5YA 2YJHA 1TRUA 2AHEA 4POKA 3APOA 5JWRB 1M2AA 1EEJA 3CTFA 2IIYA 4F2IA 1QQ2A 2IPAA 2I4AA 2JSZA 1TRVA 2D2ZA 2I81A 2VCTA 6GSUA 1AW9A 1K0DA 3KJYA 3A2XA 1Y25A 1K0MA 3F3QA 4N0VA 1UN2A 3DGQA 1PKZA 4G19A 5CRDA 4BVXA 1G7OA 4LMWA 4RUVA 3GKMA 2PUKC 4POLA 3FHKA 1B9YC 1AQWA 1X5CA 1H75A 2WCIA 4JEDA 4GSTA 2ALBA 2H6YA 1MDKA 4N11A 3VI5A 5H5RA 2CVKA 2N5FA 5ECKB 3KEBA 1A2MA 1HNAA 2HSHA 5LNKe 1PD21 3DVXA 3TKSA 2JADA 2VAFA 4O7HA 1EP7A 3FEUA 4IKHA 2YWMA 1A0RP 4GTUA 5ENUA 4XHMA 2EIOA 5ABRA 3J7Yk 3VLNA 5JCUA 4K9ZA 1YEPA 5GSSA 1YY7A 3ZREA 1M99A 2GZPA 3GURA 3SBCA 4L5LA 2IJYA 1DE2A 3M0FA 1V2AA 2XBIA 13GSA 3LJRA 2HXKA 3C73A 5CRWA 2C80A 2X8CA 2VD0A 3WT2A 3DYRA 2GT6A 4YQVA 1AQXA 3ZYWA 1SKSB 1XPVA 4IVFA 3ZVJA 3VWVA 3O6TA 4EXJA 1OE7A 4J57E 3IR4A 4L0UA 1GP1A 2M80A 5DBQA 1K0CA 2FHEA 1R26A 2RIIA 2L5OA 2P0GA 1G7EA 4N10A 3LEFA 2NTOA 3WT1A 4KB3A 1GRXA 1AAZA 3L78A 2QC7A 3ZZXA 4WBRD 4PXOA 1A23A 2LRNA 4IJIA 3P2AA 4GXZA 1YZXA 1C72A 2PWJA 1QFNA 1U3IA 2CAIA 4KAEA 2DIZA 3GYKA 4H86A 4XRAA 4ZB9A 3DRNA 5CO3A 1GLQA 4KUNA 1SJIA 4LL4B 3HKRA 1Z5YE 3IAM2 16GSA 4ML1A 3NZNA 4HQZA 3EE2A 5A5KA 4K6XA 2E0QA 1X9WB 2GSSA 5ECQB 2HFDA 4MP4A 1G0TA 4D73B 1EV4A 4MMMA 3ERGA 5J4UA 1WJKA 1K0AA 1X5EA 4KX4A 1M9BA 3HJMA 1XW6A 3UOMA 4ZBAA 1AXDA 2FNOA 3IC4A 5INYA 3UVHA 2V41A 2HYXA 4G10A 6GSTA 1BYEA 4N30A 5DAKA 5D96A 2H1DA 3I43A 3KM6A 2M46A 2Z9SA 4FIWA 4ZL9A 4KGIA 1GUHA 3EWLA 1TP9A 1ZGNA 3H93A 4KDYA 4KE3A 2PVQA 1SL0B 1K0BA 4K7IA 1TU8A 1ZZYA 4NV2A 4IS0A 4POBA 4V2LA 5IMDA 2DMMA 2GSTA 2B5EA 2JZSA 2VCWA 1VF3A 5GSTA 5DAKB 1YF1A 3HY2A 5IQYA 1EV9A 4MDCA 1FVKA 4WEYA 3EMXA 3WGDA 1RK4A 4TW5A 1ERVA 3GX8A 5DALB 1ML6A 1GULA 1M2DA 2H1GA 3A5WA 4RQXA 5CREA 4V1Ag 2A2RA 1RW1A 3KZQA 4G9HA 2YJ7A 3M8NA 4MZWA 1XW9A 3EVIA 1A2JA 1OYJA 3TRXA 1X5DA 4OO4A 3G7JA 5F06A 2AJQB 2LUSA 5KN3A 3UEMA 3NOFA 4TRXA 4GSNA 3M9KA 3IXRA 4Q5RA 2FD3A 1AIUA 3WD6A 1THXA 5J41A 3C7MA 1QGVA 3I69A 1GSSA 1ERWA 4OCEA 5A4WA 2FWGA 2P5RA 3RPNA 3ZMKA 2GS3A 4GWRA 3GL3A 1VF2A 1SJ6A 1N2AA 2WULA 2OACA 4TR1B 1XWAA 4MPFA 4PUFC 3N9JA 3ZRDA 1BEDA 4FYBA 1KBNA 2P5QA 4V1Ap 4OMVA 14GSA 3ZITA 2R3XA 1J0FA 3RAZA 1WE0A 1SJZA 3ZFLA 3LYKA 5G5FA 3M1GA 2VD1A 4HU7A 5IOXA 2HZFA 5KEJA 2NDOA 2PPTA 1F37A 3GTUB 5B6MA 1OC9A 2EIRA 4EUYA 1XWCA 3GA4A 2OA7A 1RQMA 4OFNA 5HQPA 3CMIA 2V1MA 3LXZA 1XWBA 5ECIB 4ML6A 3U6VA 5H5SA 2CZ2A 5B8AA 4KSMA 1H4OA 4J56E 5IPHA 3KTLA 1BQ7A 2LRTA 3HYPA 3GUSA 3QR6A 1ZCPA 1ON4A 1EP8A 11GSA 2NBSA 2K9FA 4HJ2A 3TKRA 3FZ9A 1O8WA 5JCGA 2G0FA 1TJDA 3ERWA 4WBJA 4OFTA 6GSXA 1PMTA 1V40A 2F8FA 1XCCA 1LJRA 1K3YA 2CT6A 2C0FA 2DMLA 4KH7A 2YV9A 3E3EA 2L57A 1ZMAA 1FVJA 3D4MA 4I6XA 3D4TA 2H76A 1XOBA 3L9UA 1ZL9A 2GQMA 2F51A 2N5AA 2GGTA 4FH8A 4TKYA 3CYNA 2AB6A 2HI7A 2MZCA 5IMFA 3F4TA 1Z7RA 5DCHA 1T8EB 3TUEA 3IDVA 3EINA 1T3BA 3NIVA 4MA9A 1OVNA 3RDWA 4XIHA 4YAVA 4ULXA 3DD3A 2PMTA 3VWUA 4K0GA 2VL3A 1UA5A 3TOUA 2G2QA 2V6KA 2VCXA 4GRFA 2WJUA 4HQSA 3ZVJD 1U6TA 1M2BA 2REMA 1EEMA 4GSSA 2VL2C 3QAVA 3N5OA 4XS1A 5D9TA 18GSA 2ZNMA 1T7PB 2LQQA 3CXGA 1GUMA 3UVTA 5GAPD 2X8GA 2V2GA 2MMAA 1IYIA 2VLVA 2VCZA 2KUCA 1WIKA 3LQ7A 4BWSA 6GSWA 1EWXA 2HRFA 2K8VA 5HFIA 2KP1A 2B1KA 2HNLA 4EL1A 5HR3A 1YKAA 4O5RA 4DSQA 2H30A 2I9HA 4TXOB 2MMNA 1T00A 22GSA 3GHAA 4BPYA 1AQVA 2AV4A 4JZQA 3TOTA 5ECPB 2GSQA 2I1UA 2VOCA 4F0CA 4ZBDA 5AIXA 1FO5A 2H01A 4TR0A 3Q19A 4KW6A 1U87A 3IHQA 2GT5A 3GSTA 1S3AA 3KD0A 5GZZB 1Z9HA 4PQ1A 1O7UA 3F9UA 5D8IA 5DQYA 3FY7A 2H72A 1E6BA 3FRCA 1BX9A 3TJJA 1F3BA 3TKPA 2CVDA 3ME7A 1K3OA 5G1KA 2LTKA 5E4WA 1URMA 3QCPA 2L4CA 5DDLA 2YNXA 3C1SA 2C0DA 1KNGA 5EL8A 1HD2A 1SK2A 4JE1A 4Q5QA 4WF5A 4HU9A 2C3QA 2GQLA 5ECSA 5B8BA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
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