1URM | Genus

Total Genus 49

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	49
sequence length	162
structure length	162
Chain Sequence	SAPIKVGDAIPAVEVFEGEPGNKVNLAELFKGKKGVLFGVPGAFTPGSSKTHLPGFVEQAEALKAKGVQVVACLSVNDAFVTGEWGRAHKAEGKVRLLADPTGAFGKETDLLLDDSLVSIFGNRRLKRFSMVVQDGIVKALNVEPDGTGLTCSLAPNIISQL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Antioxidant enzyme
source organism	Homo sapiens
publication title	Crystal Structure of the C47S Mutant of Human Peroxiredoxin 5 doi rcsb
molecule keywords	PEROXIREDOXIN 5
total genus	49
structure length	162
sequence length	162
ec nomenclature	ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date	2003-10-31

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF08534	Redoxin	Redoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1urmA00

3ZREA 3KGKA 2LQQA 2WULA 5H5RA 1GTIA 1F6MC 4PX1A 3F3RA 4LMWA 5J5NA 3G9BA 3DWVA 5E59A 3APSA 4IKHA 4ZBBA 1ACVA 2PGTA 1TRSA 3HKRA 3EMXA 2V2GA 1U6TA 2P31A 3I6AA 4YH2A 3CXGA 5DBQA 1MDIA 3G7JA 2EIQA 4IJ3A 2B1LA 14GSA 2VOCA 1WP0A 3RHBA 1Q4JA 3QCPA 2M80A 1PKWA 3RBTA 1TW9A 2BJXA 3KIJA 4ZL7A 2YP6A 1ERWA 1GUKA 3VLNA 1IYHA 2H1AA 4I5QA 4MZBA 4PNFA 1OC3A 3GH9A 1ZMAA 3TKSC 1AXDA 1U87A 4ULXA 4I2UA 2L6CA 1XIYA 5A4WA 3EURA 4HEA2 2X8GA 4NHZA 5B6NA 1K3YA 1SD8A 1XOAA 3GFKA 2VCWA 1XW6A 1TRWA 5CNWA 1SKSB 3UJ1A 3QFAC 3QPMA 3KTLA 3CBUA 2B3SA 1O73A 4F0BA 5ECNB 4TVEA 2B7KA 2CAIA 3GX0A 5FHIA 2YJ7A 4O92A 4IQ1A 3TKPA 2NDOA 5JWOB 3RAZA 4RI7A 1MEKA 4K7NA 2CQ9A 3ZMLA 2HYXA 4QL9A 3KP9A 3CMIA 5ID2A 3C8EA 1WE0A 3FZ5A 6GSXA 2I4AA 2QSIA 2H1BA 1B48A 1VRSD 4OO4A 5CRDA 2I3YA 2LRTA 3ERGA 3QAVA 4O32A 4ZBAA 3UAPA 1XPVA 1S3AA 4GWRA 2VCQA 2IMKA 4TW5A 3H1NA 2X8HA 3N9JA 1XWGA 4F03A 2RM5A 1ZYEA 3FZ9A 5LCZA 5IOWA 3M9JA 1SENA 1FW1A 2NBSA 3QFBC 3EYTA 1JLVA 3EC3A 4CHSA 2E2MA 4K6XA 1QGVA 1UC7A 1JHBA 1YEXA 2F9SA 2VAFA 1EEJA 4HZ4A 3L0HA 4ZILA 2LNSA 2MMZA 3ZITA 2WGRA 3MAKA 3MWHA 3MNGA 3HVXA 4H86A 4ZIJA 2H76A 3GKKA 1OVNA 4HI7A 4DVCA 1SL1B 2YCDA 1KNGA 5D9XA 4XCSA 1NSWA 1W4VA 4DEJA 3TB2A 3WT2A 1MDKA 3E3EA 2PWJA 1A24A 2PPTA 3I9V2 1ST9A 3VI5A 5IMZA 2WRTA 3WT1A 1CQHA 1FG4A 3RDWA 4TN8A 3TRXA 3VURA 3EU4A 4NMUA 1FVJA 4MJEA 1BEDA 1HNAA 3IV4A 4IGJA 4KDXA 4NPBA 1ERVA 1PGTA 2JU5A 4ECCA 1K0DA 1N2AA 5GAND 5JCUA 1AQWA 4GLTA 5ECMB 4FIWA 2A2SA 2O89A 2C3NA 1OE7A 3EWLA 3L9SA 1EP8A 4K2DA 19GSA 4YQVA 2C8UA 3O6TA 1G6WA 5KN0A 4KW6A 4IQAA 2N5AA 3DKSA 1NW2A 3H93A 3PH9A 3IHQA 4ID0A 1GSDA 3GYKA 1FVKA 1TOFA 2YWNA 3DRNA 1GH2A 3FR3A 2YPMA 5A4UA 4MZCA 3ZYWA 1XCCA 5ID2B 1VF4A 1R5AA 2LUSA 1NHOA 1WOUA 2CX4A 2E2GA 3P2AA 1GULA 4JZQA 4PQIA 2DJ2A 3SBCA 2N5BA 3BD2A 5HR2A 1OE8A 2GQLA 3IC4A 3IK7A 1I9DA 1GTAA 2XPDA 3P90A 2HLSA 3APOA 5HFKA 1EP7A 1EOHA 5EVOA 5EY6A 5HFGA 3US3A 2FWGA 4DSRA 4TR3A 4X1UA 4XS6A 4KNDA 4GQFA 3GIXA 4MLYA 4HUAA 3ZL5A 17GSA 1N8JA 5JCWA 3IR4A 1SK1A 1AQVA 2H0GA 4HJ2A 1EGRA 4WBJA 1O85A 1M9BA 2JSZA 1JZDA 2R37A 12GSA 4Q5QA 2DBCA 10GSA 1H4OA 4PURA 3WYWA 1XXUA 3PINA 1OAZA 4KUNA 5F0GA 1LJRA 3EMPA 3ME7A 3GX8A 2HT9A 1JZOA 5J9CA 1ON4A 1W89A 5IMFA 4IBPA 2CZ3A 4BVXA 5HR3A 4ML6A 2H73A 3Q19A 1PL1A 2VO4A 3D5JA 2GTUA 2H6YA 4ZXGA 1K0AA 1SYXA 1XVQA 4ACSA 1V9WA 1JFUA 2WJUA 4J57E 5GAPD 4QQ7A 1GSSA 5ENUA 2CX3A 2L4CA 1U3AA 3HHVA 3FZ4A 2H1GA 3HA9A 2WDUA 1GTBA 1HD2A 1PA3A 5EPFA 4KCAA 1Z5YE 2C3TA 1EOGA 3IXRA 3EVIA 4FH8A 1S3CA 4RQRA 2O7KA 5DQYA 3SWLA 2FY6A 4OWYA 3G7YA 4ECBA 1O81A 5C04A 4GSNA 5DJLA 5ECSA 4IHUA 5IMDA 1B8XA 4KE3A 4ML1A 4D73B 1O8XA 3UIWA 1URMA 2VLVA 3U6VA 1S3DA 3TRPA 22GSA 3H79A 2NPBA 1TP9A 1GWCA 1HNBA 5C00A 3R2QA 4HU7A 1G0TA 1TK5B 1MDJA 2H01A 2JZTA 2YZUA 3L9VA 2GT5A 5CREA 5INYA 1NHYA 2YV7A 5D96A 1FO5A 2WCIA 1Z7RA 1R26A 1G7EA 3CRUA 5KN3A 1AUCA 1TU8A 1DBYA 4ECIA 3ZVJD 1DE2A 1YF0A 4K1FA 3C1RA 1TKDB 3D21A 3VPQA 4GSTA 3FW2A 4K0GA 1TDIA 6GSVA 2LNTA 2REMA 2N5FA 5IPHA 4FO5A 1JZWA 4K9ZA 1JLWA 1K0CA 3W8SA 2ALBA 2PBJA 4XRAA 3A5WA 1EZKA 5JWQB 1RQMA 3L4NA 3QAWA 1LU4A 3KZQA 4N0VA 1AC1A 2L57A 2YWMA 2F3MA 3K8NA 3N5OA 4FYUA 5EL8A 3ERWA 3HCZA 1U88A 2R2JA 4GQCA 4LL1B 2PVQA 2VCTA 2MYGA 1SJIA 3Q6OA 4MABA 6GSWA 2ON5A 1SD9A 4N0ZA 3IE3A 3LG6A 1SKRB 2IIYA 4MDCA 3KMNA 1YZXA 3UVTA 3WGDA 4ZB9A 2VL2A 2VLTA 3VWWA 3IBHA 1YF1A 1A2JA 6GSSA 3RPNA 3J7Yk 3VK9A 2H0IA 4JR6A 4ISDA 2EIRA 4OO5A 4GCIA 2VUPA 1J0FA 1XZOA 2VL3A 2ZNMA 2XBIA 4GXZA 3GKMA 1ZCPA 5GZZB 2GVPA 3Q18A 5IMAA 18GSA 4YAVA 1EV4A 2CV4A 4V2NA 2HFDA 4BA7A 5ABRA 5CAXA 2VM1A 4FYBA 1PRXA 2IMEA 3D4TA 3TKSE 3C73A 3TJGA 4OFTA 1T1VA 4TR1A 4WF4A 4MH2A 5ELGA 1EEMA 1HYUA 3F0IA 2FWFA 3M0FA 1VF1A 4JE1A 4MP4A 1TK0B 4RQXA 2VIMA 2CT6A 4Q5FA 1TXXA 1TI1A 2EIOA 4WR5A 3TDGA 2LS5A 2AHEA 2FWHA 2CVBA 3A2VA 2FNOA 3GL5A 4TXOA 1OC8A 2DIYA 2JZSA 1TI3A 1C72A 2K6VA 4I8BA 4JRRA 2YZHA 4DSSA 4XHMA 1F37A 2FHEA 3VPTA 1EGOA 1BAYA 5D8IA 1PQNA 3F4TA 3ZFLA 4EO3A 5G30A 1GSUA 3ZRDA 5ELAA 3F8UA 4MPGA 4MJBA 1SK0A 1O8WA 2E0QA 1IYIA 2FD3A 3GN3A 3HZ4A 2MMAA 1YJ6A 2A2RA 2IL3A 4WBRD 3JCML 1PL2A 4G19A 1PMTA 2TRCP 5G2ZA 5DJMA 5ECHB 2GZZA 4KCEA 3E9JB 5AGYA 3LQ7A 4P3YB 4HZ2A 4NV5A 2RLIA 5IO0A 1Y25A 1GP1A 2HSYA 1SYRA 4MJCA 5CP1A 5F05A 3U5RE 4XS4A 1MD4A 3GA4A 4OFMA 2FWEA 4Q5NA 2XBQA 4HQSA 2A4VA 1FHEA 1OYJA 5DALA 5DAKA 2YNXA 4BL7A 3KD0A 4PQHA 3I69A 2L5LA 2VCZA 1T4YA 2GQKA 1X5DA 4LL4B 5AISA 2R3XA 1GSEA 2LKUA 3CRTA 5ECKB 1PD21 5E4WA 3UBKA 1X9MB 4E8HA 1BG5A 5HQPA 4OCEA 2LSTA 2CAQA 1X0RA 3HVVA 1YKCA 3DVXA 2HXKA 3L9UA 5JCGA 2I9HA 2R5GA 5H5QA 1QMVA 1VF3A 2VD0A 1TJDA 3QR6A 3KCMA 2P5QA 4XIHA 4AJ8A 2FUG2 2LV3A 2K8VA 5G31A 2FLSA 4MF7A 4IW9A 4MF5A 1M0UA 4AJ7A 2K9FA 1VGLA 3VWVA 3DGQA 4G10A 3ZZXA 3HY2A 4TR1B 4HU9A 2KOKA 5LD0A 1M2DA 2DMMA 1EWXA 3VI7A 1YKAA 2FGXA 4PXOA 1ZYQB 2EC4A 4HQZA 2O85A 4V1Ap 1ERTA 1K3OA 1XWKA 1YQ1A 2H72A 4X0XA 4NV2A 5D9VA 1PX7A 5FWGA 2KUCA 2YOIA 4D73A 2R6KA 2PMTA 2C1YA 4XS1A 2C0FA 2AV4A 4TXOB 1UVZA 3EU3A 2JZRA 5IOXA 4PUFC 4JBBA 1WRYA 2NTOA 4NAXA 4BVYA 3WD6A 2OE0A 2GSRA 4DSSB 3D4MA 2R4VA 2K18A 3BCKA 6GSUA 1M2AA 2XPEA 1RW1A 3LEFA 3FZAA 5F07A 5AIVA 1PN9A 3M1GA 2PU9C 5B7CA 3F6FA 2C80A 2B5YA 3QD9A 3IOSA 1HQOA 1XFLA 2OADA 1F2EA 3UARA 5KN1A 3FHKA 1GNWA 4OFNA 4TXVA 2O8VB 4JR4A 2IMDA 3DIEA 1G6YA 4TR0A 1XWCA 5GSTA 2M46A 3TCOA 1XWBA 1PSQA 3CTFA 4KDYA 2ZCTA 4GRFA 4XS4B 2J23A 1F3AA 2LJKA 2XC2A 1FOVA 2DJ3A 5DALB 5L71A 2MZCA 5DAKB 3QOUA 2H8LA 5A5KA 4K0NA 1M99A 2HI7A 1QQ2A 2GSSA 2CVDA 13GSA 1ABAA 5DCHA 4CW9A 1TK8B 3CSHA 2KHPA 3IAS2 1K0BA 3ISOA 3IDVA 4N30A 3WGEA 3D0ZA 1WMJA 3KH7A 2H19A 2WFCA 3V1WA 1OC9A 4WKWA 5DDLA 1F9MA 1V58A 5ECRB 2H1DA 3TRQA 1X9SB 4AJ6A 4BWSA 3DVWA 3ERFA 5H5SA 9GSSA 2OA7A 1PKZA 5ECQB 2X99A 3LSZA 3BBYA 3HD5A 4ECJA 1AAZA 2KP2A 3GTUB 3BOAA 4L0WA 4WXTA 2ES7A 2LJAA 1THOA 2LEGA 1QXHA 3FKFA 3GHAA 3IPZA 5CRWA 3IK9A 1GLQA 3TJJA 2YJHA 1XVWA 4KGIA 4ZL8A 1B9YC 2AYTA 5LNKe 2O87A 2PN8A 4KDUA 1SKWB 2VL2C 3FY7A 5DVBA 2DJKA 3GKXA 4PQ1A 2IFQA 3HJOA 3UBLA 3AY8A 3LJRA 1ZZYA 1I5GA 4LA1A 1USBA 5F06A 4HDEA 2DJ1A 1FB6A 3GMFA 2K8SA 4Q5RA 4I6XA 2CA8A 2H0HA 3E0UA 3LWAA 2D2ZA 3UEMA 3C7MA 1R5PA 2VM2A 2KLXA 4EVMA 3F4SA 4EXJA 2MBTA 3HZ8A 4EL1A 1F3BA 1XWAA 3FRCA 1T4ZA 3MSZA 4IELA 1MD3A 1A2MA 3D6IA 5ECPB 4BWQA 4TOPA 2RIIA 4WF5A 2C4JA 4KH7A 2C0GA 2H6ZA 2OBIA 4POLA 3TOUA 3CSJA 2AUVA 11GSA 2WZ9A 3ZMKA 4TRXA 1WWJA 2VCVA 3HVSA 2PVOC 3GSSA 2KP1A 5HR0A 5FT3A 5D9TA 2DMLA 2Z9SA 2G0FA 4MCUA 3W8JA 4GF0A 1FAAA 1Z7PA 2J9HA 1TRUA 3HYPA 4RI6A 4WR4A 2L6DA 3LFLA 1AQXA 5J4UA 2YN1A 3UOMA 1X5CA 3DD3A 2YANA 2ZUPA 3FK8A 4TR4A 5IPGA 2P0GA 3FEUA 2HRNA 5HR1A 2F8AA 4IJIA 2F8FA 1OC9B 2LQOA 3I43A 3FR9A 1T3BA 3APQA 3S9FA 3NIVA 3F3QA 2MBSA 2OE3A 1SL0B 3G7IA 1BX9A 1Z9HA 3IRAA 4O5RA 1B9XC 2TRXA 4V2LA 3LORA 4POKA 1GSYA 1AW9A 1V57A 4L5OA 3VWUA 4HS1A 1X9WB 3GURA 3P7XA 2CVKA 2HZEA 4PNGA 4EDZA 3KM6A 4POMA 5AIXA 1TU7A 4IVFA 1GUHA 5D9WA 3KXOA 1DSBA 2H66A 1ZL9A 3M8NA 5HFIA 2GSQA 5B6MA 2H75A 4KSMA 2DJ0A 1K0OA 1A0FA 2B7JA 4I2TA 1WPIA 2B1KA 2ON7A 2IFQB 3KEBA 1XOBA 2H30A 4IN0A 1VF2A 1K3LA 3RPPA 4EKZA 3O3TA 3QMXA 5IM9A 2HZFA 1V2AA 3TKRA 4CDOA 1J08A 2IMIA 2JADA 3WGXA 2OKAA 5CRHA 2V41A 2AAWA 2WS2A 2IN3A 2YWOA 5IMVA 1ERUA 2JSYA 3KP8A 4XTSA 2DC5A 2WB9A 2V6OA 4N10A 1UN2A 1EV9A 3GV1A 3H4KA 3GRXA 1HNCA 4J2FA 3BJ5A 2QKEA 5COHA 1ZGNA 2TIRA 1T7PB 1OKDA 4X43A 1SL2B 3GL3A 3ED3A 1QUWA 3C71A 1R7HA 4JEDA 4F0CA 1GSQA 5KEJA 2CZ2A 1A8YA 3DYRA 3ZIJA 2P5RA 4DSQA 3VWXA 4MK3A 4ZB8A 2VLUA 4MZWA 3TUEA 4K7OA 3A3TA 1Q98A 3TKSA 4HOJA 4ZB6A 16GSA 1AIUA 1Z6MA 1GUMA 3GNJA 3OR5A 3F9UA 4L8EA 1GTUA 3HDCA 1RK4A 3ME8A 2RUFA 4EC0A 3KJYA 1TRVA 4QL7A 4L0UA 2G2QA 3MDKA 4OD7A 1GRXA 5B8AA 1YDKA 2H71A 2C3QA 2H74A 4K7IA 3KH9A 2AJQB 4HJMA 1QFNA 4MH3A 1B4QA 3ZIVA 2DJJA 4O7HA 4NWYA 2NVLA 1TTZA 1U3IA 5A4VA 4YAPA 4G9HA 3FR6A 4L5LA 1JZRA 3PR8A 4TKYA 1SK2A 2FA8A 4F2IA 1GSFA 1ZOFA 1BJXA 4IS0A 3Q74A 1A2LA 2HZEB 4OMVA 4KB3A 2AB6A 4YQUA 3GH6A 5AN1A 1KTEA 1R4WA 5ECIB 2RM6A 1O6JA 2C0EA 4Z7XA 3GTUA 5G5EA 2X64A 4F9ZA 3UVHA 1ILOA 2GLRA 1E2YA 1GL8A 1K0NA 4MMMA 4V1Ag 2LRCA 3HJMA 2IPAA 5IIZA 2GGTA 3ZVJA 2BMXA 2GT6A 3DEXA 2PUKC 3H8QA 3KTBA 4K8MA 1T00A 4JU5A 1DUGA 2JACA 1V40A 3CTGA 1V98A 5GSSA 1QK8A 1X5EA 2X8CA 1UA5A 3UL3A 2MMNA 1KEBA 3EE2A 2GZPA 2H6XA 1OKTA 1SU9A 3TJFA 5D73A 2HNLA 3VFIA 5JWRB 3J7Yb 6GSTA 1A23A 2IJYA 1M9AA 5DCGA 1SJ6A 4NXIA 2IWTA 1MTCA 2VCXA 5IO2A 1XW5A 5CO3A 1FB0A 5CYYA 1LBKA 1M2BA 4POBA 3F6DA 2GSTA 1THXA 3C1SA 4LMVA 4LLRA 2M72A 1PX6A 3KMOA 2BTOT 1YEPA 2DLXA 4KX4A 4EUYA 5G1KA 4N11A 2IMFA 2I1UA 3EINA 3TKQA 3RHCA 3UMAA 5G1LA 2LRNA 4KAEA 5F8BA 2MMOA 2GS3A 1WJKA 20GSA 2FA4A 2B6MA 2B5XA 4IP1A 3DMLA 3NZNA 2V1MA 2GDRA 4G2EA 4AF2A 2V32A 5IQYA 3LGCA 2OJLA 3CSIA 4V2MA 2VL9A 5DQSA 3TJKA 4NHWA 2F51A 2RUEA 1T8EB 2GQMA 1Z6NA 5ECLB 3BCIA 3GUSA 3LYPA 4XRDA 2YWIA 5B8BA 1A8LA 4MJAA 2LTKA 3PGTA 3GSTA 4PUAA 1Z3EA 3M3MA 3HXSA 1ML6A 4EDYA 5J41A 3O76A 3DXBA 3A2WA 3TOTA 4WEYA 2LJRA 3HJPA 4FYCA 1B4PA 4GSSA 1GLPA 2H70A 2YV9A 1Y6EA 1YY7A 3CYNA 2L4QA 1H75A 3LXTA 3P8WA 1DE1A 4MPFA 3TGZA 2E7PA 2OBKA 6GSYA 1GNEA 3ZFBA 4EF0A 2L59A 3L78A 1K0MA 1SJZA 2C0DA 4WETA 1CQGA 2XHFA 2HE3A 4PGTA 3M9KA 5J9BA 1M7TA 2OE1A 1BQ7A 3A2XA 4ILFA 2HSHA 4GTUA 4OCFA 5IMCA 2QGVA 4EE0A 2HRFA 1E6BA 7GSSA 2VD1A 4IP6A 5D93A 3FYGA 8GSSA 3QAGA 2V6KA 2PERA 3LXZA 5ECOB 3ZTLA 2DSAA 3F4RA 5CRGA 4YQMA 3F63A 3IA1A 1XBSA 4KA0A 4RUVA 4AGSA 4MF6A 1KBNA 3GKNA 4ZL9A 4KSOA 4E8EA 4I97A 3QDNA 2QC7A 2FCHA 3LYKA 3IAM2 1G7OA 1XW9A 3ZLPA 3W6GA 2GZYA 2I81A 4J56E 2L5OA 2B5EA 3NOFA 2JL4A 5KN2A 4F82A 1BYEA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1URMA

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