1OAZA

Ige fv spe7 complexed with a recombinant thioredoxin
Total Genus 12
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
12
sequence length
122
structure length
115
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPIEESDDRRYDLVGPCKMIAPILDEILTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Immune system
source organism Escherichia coli
publication title Antibody Multispecificity Mediated by Conformational Diversity
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN 1
total genus 12
structure length 115
sequence length 122
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1oazA00
5LCZA 1TRSA 2NVLA 2C3QA 2CA8A 1S3AA 1QK8A 4RUVA 3A3TA 1PL2A 1SL2B 3KIJA 3TJJA 1TOFA 3UARA 2DC5A 3TRQA 4GSSA 2H70A 2FLSA 3ED3A 3IBHA 12GSA 1M9AA 2XC2A 3CTGA 3F9UA 3DRNA 2QGVA 1PSQA 1XW6A 3KZQA 4G2EA 4I97A 3GFKA 3CSJA 3H1NA 4AJ7A 1T8EB 2REMA 3IE3A 4IJ3A 1EEMA 1Z3EA 2LQQA 3APQA 4TR1A 1O81A 2H73A 4YAVA 6GSTA 1GTIA 2RM5A 4MDCA 4PUFC 4V2MA 2LV3A 4TR1B 4CHSA 1J08A 3FHKA 2YN1A 1OKTA 1Y25A 3IAS2 3C7MA 2VLTA 3I6AA 4ZL9A 2R4VA 1B9XC 1GSUA 3HZ4A 4HUAA 4I6XA 4LMWA 3QAGA 4MA9A 4IN0A 4BWSA 1A0RP 2MBSA 3PGTA 4ZILA 3M9JA 2DSAA 2GGTA 4ISDA 1R26A 3KD0A 5ABRA 3US3A 4MZCA 2L4CA 2JL4A 2MMZA 5DALA 22GSA 4GF0A 2HSHA 2PBJA 2DMLA 1SL1B 1AAZA 2L5LA 2K9FA 2TRCP 3U5RE 3TRPA 20GSA 4I2UA 3EE2A 3EU3A 4AF2A 1YF0A 3IA1A 1M9BA 3H93A 4KE3A 1TP9A 4KB3A 3IK9A 3CXGA 2JZRA 1FAAA 2KHPA 2H19A 1VRSD 3F4SA 3DVXA 4ZXGA 2CV4A 2FHEA 4GSTA 4K6XA 5B6NA 3TCOA 3TB2A 5DJLA 1PGTA 3QR6A 1VF1A 5IPGA 1EV9A 4GQCA 1VF3A 5IMZA 2IMKA 3TKRA 1S3CA 2GZZA 4IHUA 2FGXA 4TW5A 3TJBA 3ERFA 1A2MA 3U6VA 4ZIJA 2FD3A 4HZ4A 4POKA 1PN9A 1M0UA 4RI6A 2VCXA 4K8MA 3TJGA 1B4QA 1B9YC 2R6KA 2P31A 2KOKA 4OD7A 4O7HA 1FW1A 4WXTA 1GLQA 2CAIA 2M46A 2R5GA 3GX0A 5FWGA 3KP8A 1TJDA 1RQMA 4IJIA 3HYPA 4ZB6A 4PURA 3VWVA 5ECNB 5HR1A 1JZDA 1BEDA 1I9DA 1G7OA 2I4AA 2I81A 2X8GA 5F05A 2L6CA 1PKZA 4DSRA 1KTEA 3VI5A 1YDKA 2X8HA 3CBUA 5ECRB 1GUHA 3ZREA 4TR4A 1XFLA 3NOFA 1GULA 5DJMA 2YJ7A 5ECIB 1F6MC 3CYNA 1EP7A 4HU9A 4MF6A 5IO2A 3FZ5A 3BD2A 1QXHA 3GMFA 4POBA 3G7IA 4E8HA 4MABA 1GRXA 1U3AA 2JADA 2H0GA 1SKWB 2DJ1A 3LJRA 4DVCA 2HE3A 1N2AA 5AGYA 2LTKA 3VPTA 3RDWA 1LBKA 1OC9A 1ACVA 2FWFA 4MF7A 4Z7XA 10GSA 2DMMA 3N5OA 2LJRA 4E8EA 1OC9B 3S9FA 1AQWA 2VL2C 4J57E 1ST9A 2VM2A 3GV1A 4OO4A 2J9HA 2EIQA 2IMEA 5CRHA 4HZ2A 4XHMA 4WETA 3IHQA 4EDYA 3MDKA 3F0IA 2K18A 3UOMA 2GZPA 2B5YA 3AY8A 6GSVA 3DWVA 5C04A 3CSHA 1AC1A 4D73A 4Q5QA 1XCCA 1TK0B 3C71A 2PVOC 1ZL9A 2HI7A 2H8LA 2VCQA 2L57A 1PMTA 3DGQA 4OCEA 4NHWA 4PGTA 3QFBC 1ERUA 2ALBA 1ZYEA 2OE1A 2MYGA 11GSA 1JFUA 3BJ5A 4K0NA 1RW1A 8GSSA 3FW2A 1OYJA 19GSA 4MPGA 1FOVA 3L9SA 2F8FA 1EZKA 1GUMA 1GUKA 3A2VA 5KEJA 3TOUA 2GZYA 1OC3A 3DKSA 3VPQA 4TXOA 4IVFA 1A2LA 1M2AA 1IYIA 1K0DA 5IOWA 3E9JB 1V57A 1GSYA 1MD3A 3QFAC 5D9TA 1YZXA 4G9HA 4OFNA 2PWJA 4FH8A 4GQFA 1CQGA 5J4UA 1USBA 1T4YA 5IMFA 5F0GA 1TRVA 2LJAA 5HFIA 3IDVA 5H5RA 2DJJA 5HR3A 2H0HA 2YWOA 9GSSA 2ZUPA 1UA5A 4ECIA 4PX1A 2IN3A 3EMXA 3UEMA 1DE2A 2GVPA 2H74A 2H01A 4BL7A 1ERWA 1R4WA 4KSOA 5ELGA 3WD6A 4KCAA 3CTFA 4ZBDA 4KDUA 3G9BA 2H72A 2L5OA 5CRGA 1ABAA 2C0FA 3Q19A 2C0GA 1JZWA 2I9HA 1GNEA 1XVWA 2FUG2 4KDYA 2A2RA 16GSA 2V6OA 4K7IA 1PA3A 4EL1A 2B7JA 5F07A 2O87A 5JWOB 2XBQA 3APOA 3A2XA 3RAZA 5HFKA 5F06A 5CP1A 1JLWA 2FA4A 1XWBA 5G1KA 2VAFA 5JCUA 5J5NA 3ISOA 3I43A 3M1GA 3K8NA 1RK4A 3VWWA 1QMVA 3ERWA 3GSTA 3ZZXA 4CW9A 4N0VA 2X8CA 1NHYA 5F8BA 3VFIA 3F6DA 4YH2A 2IWTA 3TKQA 1JLVA 5KN3A 1YF1A 1GSEA 4LMVA 2RM6A 5FHIA 4ZL7A 3EWLA 5D93A 5KN2A 2IFQB 2K6VA 3LYPA 3EVIA 2WCIA 5B6MA 1ZMAA 3FY7A 1SJIA 4IS0A 2V2GA 2XPDA 1XPVA 1WOUA 3D6IA 3QAVA 3J7Yb 4JR6A 2HLSA 1BX9A 5DCGA 4EKZA 3WGDA 4JZQA 3VLNA 4O32A 1SJ6A 5DQYA 1GWCA 2F51A 3F3RA 5JCWA 1PRXA 14GSA 1G6WA 1X9WB 2O7KA 1X9MB 3GNJA 4MLYA 2V6KA 2OJLA 5CREA 2BJXA 1XW5A 2HFDA 3KM6A 2EIOA 1Z7RA 2HZFA 5KN1A 4POMA 4IGJA 1TU7A 4KUNA 1S3DA 4HQZA 4N10A 3LXZA 1XOAA 1Y6EA 1U87A 3P8WA 5CAXA 3DYRA 1U3IA 5JWQB 3E0UA 4O92A 1JHBA 5DBQA 3ZLPA 5IOXA 2H6ZA 1EOHA 1AQVA 5ECOB 1TXXA 1MEKA 1ILOA 1JZOA 5CO3A 5DVBA 3HVXA 1M2BA 5EPFA 3GKKA 1ERVA 4KSMA 2VL9A 2VL3A 2AUVA 1V58A 5AIXA 3GH6A 3G7YA 2DJ0A 5DALB 2WZ9A 4ECCA 4XS1A 1O8WA 1X5CA 4GRFA 4F82A 1SENA 4MF5A 2FWEA 5D96A 4F9ZA 3WGEA 3EC3A 1M2DA 1F37A 3LSZA 3ZIVA 2XPEA 2PERA 4N30A 1TI3A 3ZMKA 1WPIA 3UIWA 3L0HA 2ZNMA 3H4KA 1Z5YE 1TI1A 4F0BA 2YCDA 2XBIA 4YQVA 2H1DA 2WJUA 3GTUA 1X5EA 3HXSA 2I1UA 1M7TA 3FR6A 5INYA 4V2LA 3KEBA 3RPNA 2GSTA 1YKAA 2LNTA 2L4QA 1TTZA 2GQLA 2VOCA 4DEJA 3RHCA 3UVHA 5FT3A 4EC0A 2FNOA 3P90A 1ZOFA 4QL7A 4NAXA 5J9BA 2VCVA 4ZL8A 2IMFA 4LA1A 1SKSB 3PR8A 1URMA 4N0ZA 1YKCA 1T7PB 3FYGA 3PINA 5D9WA 1ML6A 5ENUA 2AV4A 3F3QA 2RUEA 4MJCA 5HR2A 5KN0A 4TR3A 1HD2A 2MMAA 2K8SA 2VCWA 2KUCA 2OE3A 4I2TA 4MP4A 4Q5FA 1A0FA 4L0WA 3QOUA 1XVQA 2GSRA 1R7HA 2PUKC 2JU5A 5EY6A 2V1MA 3RBTA 3WT2A 2CX4A 4EF0A 4I5QA 4MPFA 2V32A 4ML6A 4KCEA 2LJKA 2OE0A 4F2IA 1T1VA 2VD0A 2CAQA 4EDZA 4G10A 2B3SA 3WGXA 3HY2A 4HJ2A 3L9UA 1AQXA 4V1Ap 3QMXA 1J0FA 2PU9C 2YOIA 3GL5A 3GX8A 3E3EA 3VK9A 4XRAA 1Z7PA 5G5EA 3DD3A 1SD8A 3W6GA 2FY6A 4OO5A 1JZRA 3LFLA 4PNGA 3BOAA 1ERTA 3ZRDA 1THXA 2R2JA 2DBCA 1XWAA 2YZUA 2BMXA 3BCKA 1ZZYA 1F2EA 1OE7A 1IYHA 1B48A 1PL1A 2FCHA 3FKFA 1A24A 2VD1A 3P2AA 5GZZB 2C0DA 4ECBA 2QC7A 2EIRA 2WRTA 2HZEA 2HSYA 3GN3A 5D9VA 3APSA 2V41A 4XCSA 2HZEB 1GSSA 4ECJA 4PQ1A 2VO4A 2TIRA 1BJXA 4IP6A 2N5BA 4F0CA 3UBKA 1I5GA 5CRWA 5A5KA 4HU7A 2JSZA 5AIVA 4XIHA 3IR4A 4CDOA 4AJ6A 5ECMB 1HNCA 4HI7A 4K7OA 2DIZA 2Z9SA 1U6TA 4OMVA 2R3XA 3IPZA 3ME7A 2GSSA 2HRFA 4ULXA 4TXVA 1XXUA 2VL2A 2LSTA 2N5AA 3F63A 4D73B 4MH2A 5E4WA 3F4RA 1B8XA 3WYWA 4EO3A 1A23A 3LYKA 3CRUA 2H1GA 3TUEA 1OVNA 1X9SB 1K3LA 3R2QA 2IJYA 3W8SA 1O73A 3DVWA 4L5OA 4XS4A 1CQHA 1BAYA 5HR0A 2XHFA 3GSSA 1GSDA 5G30A 1B4PA 3LWAA 4XS4B 1V9WA 3A5WA 3NZNA 2GLRA 4L8EA 4BPYA 3GKXA 4WEYA 4KNDA 3LQ7A 5IMCA 1HNAA 4MCUA 2CX3A 1FO5A 4HOJA 2ON7A 4TXOB 3V1WA 2B6MA 5AN1A 4KAEA 2CVKA 5IM9A 1ZYQB 3M3MA 5ECKB 3TKSC 5E59A 4ACSA 3ZITA 3KCMA 4NV5A 3KJYA 4ID0A 1TRWA 2LEGA 2R37A 4JE1A 1SU9A 3GHAA 2YV9A 5C00A 4K1FA 4WF5A 1EGOA 4BVXA 2DJKA 4GTUA 4LLRA 3MAKA 2X64A 2YWMA 1WRYA 2A4VA 1SL0B 3GH9A 4TOPA 3TKSA 3HCZA 3IOSA 2JSYA 7GSSA 3IAM2 5DAKA 5ELAA 2PMTA 2QKEA 4KH7A 3UJ1A 4WF4A 5ID2A 4ZB9A 2DIYA 5DAKB 4X0XA 4MH3A 3RHBA 3L9VA 1SD9A 3KXOA 5ID2B 3ZTLA 3O3TA 3MSZA 1F3BA 3C73A 2HRNA 3MNGA 1TDIA 4PNFA 2VIMA 3DMLA 4J2FA 5ECPB 3IC4A 1YEXA 1WP0A 4F03A 1DUGA 1R5PA 3C1SA 3EYTA 5ECLB 1GNWA 1UC7A 5IMAA 1EV4A 4GWRA 6GSXA 2GS3A 1VF4A 4YAPA 4AGSA 1KBNA 1WMJA 1H4OA 1FB0A 2P0GA 2C0EA 3F4TA 3N9JA 3TRXA 1OKDA 1GSQA 3HJOA 2H1BA 5ECHB 3GKNA 2CQ9A 4GLTA 1F3AA 2E2GA 3D22A 5G31A 2F8AA 2C1YA 3TDGA 1LJRA 3DXBA 4BWQA 2LKUA 1UVZA 2AB6A 3F8UA 4PQIA 4QQ7A 2LUSA 5IMDA 2B5EA 3HHVA 1YJ6A 2LRTA 3KMNA 3I9V2 1A2JA 3GA4A 2B5XA 3HVVA 1Q98A 2YWIA 4GSNA 3FZ9A 2VCTA 3IRAA 2E2MA 3HA9A 3IV4A 4NXIA 1W89A 5GSTA 2J23A 4XTSA 4XS6A 1HYUA 4TVEA 5EVOA 1K0CA 1ON4A 2L59A 3FZAA 2YV7A 1QFNA 1BQ7A 3LEFA 3NIVA 4IW9A 1OE8A 13GSA 1R5AA 2GTUA 2BTOT 4FYBA 1QUWA 1X0RA 1HQOA 1O7UA 4QL9A 3GL3A 1GTAA 4O5RA 1FVJA 2VLVA 2P5RA 3F6FA 4JRRA 2H66A 2VUPA 4RQRA 5J3RA 4J56E 2GT6A 2C80A 2HYXA 6GSSA 1T00A 2EC4A 2M72A 4EVMA 3M0FA 1TKDB 3TKPA 2LRCA 3VI7A 1T3BA 3G7JA 1K0MA 5AISA 4MZBA 2VCZA 4MJEA 2CVDA 5JWRB 5GAPD 4BVYA 1XIYA 3LORA 3VWXA 5EL8A 2H6YA 3KP9A 3EMPA 4K2DA 1XWGA 4IELA 2M80A 2GQMA 1SK2A 2JZTA 1PQNA 2OACA 4KX4A 4FIWA 4K7NA 1DBYA 3KTLA 2NPBA 4HJMA 4POLA 2RIIA 2YZHA 2P5QA 1K3OA 5D73A 1K0NA 2OA7A 2FA8A 3O6TA 1G6YA 5H5QA 2HXKA 5CYYA 3HJMA 4MZWA 2MZCA 4HEA2 1E6BA 1K0OA 2H76A 3FK8A 2TRXA 3GRXA 3IK7A 2WFCA 3HDCA 2DJ3A 2LNSA 4GCIA 2WS2A 2JACA 3ZVJA 3KH9A 1TRUA 3TGZA 4ZBBA 1XW9A 3GTUB 5G2ZA 2ZCTA 1M99A 1F9MA 6GSWA 5J9CA 1VF2A 3UVTA 4AJ8A 4G19A 2C3NA 1FB6A 1SK0A 5ECQB 4OFMA 1THOA 3SBCA 2LQOA 3ZFBA 2HNLA 5IO0A 2IPAA 1HNBA 2NDOA 5A4VA 2G2QA 3C8EA 1OAZA 3LXTA 3CMIA 3IXRA 2LS5A 3I69A 1ZCPA 5LD0A 3RPPA 4HDEA 4WKWA 3BBYA 4TKYA 2OBKA 4ILFA 3TJKA 2GSQA 1TK5B 2D2ZA 1MDJA 1K0AA 4XRDA 4X1UA 2DLXA 4PXOA 1PD21 4GXZA 3M8NA 17GSA 2MMOA 1AXDA 4IP1A 5IIZA 2JZSA 1XZOA 2C8UA 1YEPA 3J7Yk 2YPMA 1GH2A 4TR0A 1X5DA 1GLPA 2O89A 1AUCA 3HKRA 4JEDA 3CSIA 3D0ZA 3Q6OA 1EP8A 4NMUA 5D8IA 4V2NA 2GQKA 2H1AA 5DDLA 3M9KA 1K0BA 3GURA 4JU5A 5JCGA 3TJFA 3GUSA 4YQMA 2FWGA 5LNKe 2ES7A 2YNXA 18GSA 4BA7A 1G7EA 1K3YA 4NV2A 5H5SA 3GYKA 1NSWA 3O76A 4KA0A 4ML1A 5B8BA 1O85A 1XBSA 1Z6MA 2IMIA 4WBRD 5G1LA 3QPMA 1XWCA 2B7KA 3D4TA 4TN8A 5IPHA 1YY7A 2H71A 1NHOA 2IMDA 3A2WA 3L78A 3DEXA 4K9ZA 4Q5RA 4TRXA 4DSSA 5J41A 2IL3A 2H75A 1PX6A 3KGKA 2O85A 2NTOA 2L6DA 4DSSB 4YQUA 1QQ2A 1DSBA 2CZ3A 2E0QA 2ON5A 3ERGA 1GP1A 2DJ2A 4ZBAA 2GDRA 1GSFA 3DIEA 3ZL5A 2HT9A 1TU8A 4HS1A 3TOTA 2KLXA 5L71A 3W8JA 2PGTA 4WR4A 2NBSA 2H0IA 2RUFA 2YP6A 3KH7A 2OKAA 3ME8A 2X99A 3KMOA 1WIKA 3UAPA 1T4ZA 1KNGA 1MDKA 3SWLA 2H6XA 5D9XA 3EINA 1C72A 3FR3A 2F9SA 1GTUA 5DCHA 1H75A 2YANA 3WT1A 2PN8A 4EXJA 1TW9A 3HJPA 2MBTA 3HZ8A 1EOGA 5GSSA 1SJZA 2KP2A 4NWYA 4FYCA 1YQ1A 1XOBA 2QSIA 1Z9HA 3LGCA 3HVSA 2CVBA 4P3YB 4EE0A 4PQHA 4IQ1A 1E2YA 1VGLA 1U88A 4MJAA 2WDUA 4KW6A 2LRNA 1GL8A 4L0UA 3UL3A 1A8YA 2VLUA 2AYTA 3FRCA 3ZFLA 4NPBA 4IBPA 1N8JA 2WULA 2WB9A 2PVQA 1J9BA 1V2AA 4K0GA 4IQAA 3VWUA 4X43A 2VM1A 3H8QA 4OFTA 3FEUA 1V98A 1XWKA 2MMNA 1EEJA 1NW2A 1V40A 4KGIA 3Q74A 4L5LA 5G5FA 1AW9A 2RLIA 1TK8B 4H86A 3L4NA 2AJQB 1EGRA 3VURA 4MJBA 4LL1B 3BCIA 2B1LA 1FG4A 2A2SA 4MK3A 4JBBA 2OBIA 2N5FA 3PH9A 4Q5NA 3ZMLA 4NHZA 4RI7A 1GTBA 3Q18A 3OR5A 2OADA 1SK1A 1A8LA 2C3TA 1ZGNA 1MTCA 4HQSA 5CNWA 2KP1A 3QD9A 4OWYA 4WR5A 3FZ4A 4FYUA 3UMAA 1O6JA 1FVKA 1OC8A 3D4MA 3GIXA 5IMVA 1QGVA 1WWJA 2K8VA 1AIUA 4MMMA 1O8XA 4IKHA 2I3YA 1DE1A 3EURA 4PUAA 2F3MA 3ZYWA 2G0FA 3ZVJD 1Z6NA 4V1Ag 5ECSA 1MDIA 3EU4A 1PKWA 2FWHA 4KDXA 4I8BA 2YWNA 5IQYA 3JCML 4DSQA 3CRTA 4ZB8A 3GKMA 3HD5A 2PPTA 4FO5A 3QDNA 4EUYA 5B8AA 1UN2A 5HQPA 5CRDA 3FR9A 2YJHA 3UBLA 1SYXA 5A4WA 2IIYA 5B7CA 1MD4A 1W4VA 4WBJA 2AHEA 5HFGA 5A4UA 1LU4A 1WJKA 3D5JA 3H79A 1SYRA 1G0TA 5GAND 1EWXA 5DQSA 3C1RA 2AAWA 1BYEA 1BG5A 4JR4A 4OCFA 3D21A 2CT6A 3QCPA 1FHEA 1WE0A 3LG6A 2CZ2A 3KTBA 4LL4B 1Q4JA 3ZIJA 2IFQA 2WGRA 2E7PA 2O8VB 3P7XA 4N11A 1NM3A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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