3EURA

Crystal structure of the c-terminal domain of uncharacterized protein from bacteroides fragilis nctc 9343
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
140
structure length
140
Chain Sequence
AKNRLGTKALNFTYTLDSGVKGTLYQFPAEYTLLFINNPGCHACAEMIEGLKASPVINGFTAAKKLKVLSIYPDEELDEWKKHRNDFAKEWTNGYDKELVIKNKNLYDLRAIPTLYLLDKNKTVLLKDATLQKVEQYLAE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the C-terminal domain of uncharacterized protein from Bacteroides fragilis NCTC 9343
rcsb
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Bacteroides fragilis
molecule keywords uncharacterized protein
total genus 44
structure length 140
sequence length 140
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-10-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13905 Thioredoxin_8 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3eurA00
1HD2A 4JEDA 2V32A 19GSA 2DJ1A 4Q5QA 4IP1A 5AGYA 1M0UA 3IAM2 4GWRA 3HXSA 2ES7A 1B48A 2H30A 4EDZA 5EY6A 2C3QA 5GSSA 5B8BA 1FHEA 2CZ3A 3F4TA 4OFNA 2I81A 3F3RA 5ABRA 1Z7RA 1Z3EA 3F6DA 1K0AA 2LSTA 3V1WA 1URMA 2GSQA 3PINA 2PMTA 1SD8A 1DUGA 4AGSA 4HQSA 4N10A 1OE8A 2OKAA 3H93A 4FYBA 2J23A 1H75A 1S3DA 3EWLA 4ECIA 5GSTA 1DBYA 3OR5A 3IK9A 3A2WA 3W8SA 2FA8A 2WDUA 3LSZA 1G0TA 3LXTA 4XIHA 1FG4A 2OADA 3F0IA 3N9JA 2YWNA 2K9FA 4IQAA 1JZDA 2IL3A 2FGXA 1GNWA 2X8CA 3KIJA 3TUEA 2GSSA 2L59A 5D9XA 3FEUA 4ZBBA 4IJIA 3KP9A 5F05A 2B3SA 3ZLPA 3EU3A 2H73A 1ABAA 1QGVA 1Z7PA 1TDIA 1TP9A 3DXBA 2QSIA 4O5RA 3IRAA 3N5OA 1BX9A 4TKYA 1K0NA 5HQPA 1XXUA 4K9ZA 4RUVA 1AAZA 2JADA 5ID2A 2I1UA 3CTFA 5DCHA 3DEXA 2H01A 4ECJA 2HSHA 4FIWA 1GSSA 1B8XA 2OBIA 3NOFA 2AJQB 2FLSA 5H5SA 2LNSA 3QMXA 2E2GA 5J9CA 4MABA 2JZSA 1K3YA 2LQQA 3VWUA 4NWYA 3QFBC 1GSUA 5F07A 3TKSA 4Q5NA 2C80A 2C0GA 3DVWA 5IMCA 3VI5A 3KJYA 1XBSA 1O7UA 4TW5A 3D21A 2YWMA 1K3OA 5IQYA 4F9ZA 1JLWA 4DVCA 2K18A 1K0DA 1ZCPA 5D9VA 5G1LA 2P5RA 1Z6MA 2EIOA 4FYCA 2FWFA 1Z9HA 2ZCTA 3F3QA 4XCSA 2GGTA 3QAGA 3GMFA 1A8LA 5ECSA 2AYTA 5E4WA 3M9KA 2C4JA 2YP6A 4IJ3A 3ZVJA 4JE1A 4OO4A 1TK5B 2EIRA 3HJPA 2FWGA 5ELAA 3LWAA 1LBKA 3ISOA 5KN3A 3FZAA 4V2LA 1THXA 1FB6A 2HZEA 3IV4A 5CO3A 1S3AA 2OE0A 2LUSA 2F8FA 1T4ZA 3LJRA 2IMKA 3QDNA 3FZ5A 3ZREA 2MBTA 3FR9A 1U88A 1YY7A 3KEBA 2R6KA 3DVXA 3GSSA 2ALBA 2CT6A 5GAND 1K3LA 2RIIA 2PVOC 2H71A 2H75A 4BL7A 1K0MA 3TCOA 4KSOA 1K0BA 3IE3A 5CRHA 4I8BA 2JSZA 2CAIA 2L5OA 2IFQA 4HU7A 5G30A 2NVLA 2HRNA 4RI7A 2LRTA 1FW1A 2H74A 2H19A 4MZBA 1XCCA 2H70A 3P8WA 1G6WA 1U87A 2XPDA 3GTUB 4GQFA 4J57E 3DGQA 1MTCA 5IMAA 3GUSA 1YKAA 2GLRA 5A4VA 3C1RA 5D96A 3IHQA 1YJ6A 3TRPA 3RPNA 5IMZA 4PQIA 1EV9A 5DVBA 4PXOA 4EDYA 4KDUA 2VD0A 1PD21 3TJGA 2N5FA 1C72A 4LL1B 2K8SA 3ZIVA 4NMUA 4O7HA 5ELGA 2GVPA 4L5LA 2PN8A 2LS5A 4IS0A 1HNBA 4Z7XA 1GUMA 1T3BA 4DSSB 3MDKA 1RK4A 3C71A 2DJ0A 2H6ZA 3VK9A 2YV7A 1H4OA 1SKSB 2VCQA 4JR4A 5IO2A 2HLSA 3HKRA 1PQNA 5J5NA 1QMVA 5AIVA 2XC2A 1R4WA 4PX1A 2Z9SA 4DSSA 1V58A 3W8JA 22GSA 3KGKA 5DQSA 2NTOA 3TJFA 5IIZA 1XIYA 3RHCA 2H72A 3GN3A 5D73A 1SJZA 2H1GA 1GL8A 2WCIA 3UOMA 2EC4A 4RQRA 2WFCA 4CHSA 2ZUPA 2PWJA 4QL7A 1W89A 2JZTA 1O8XA 1ERVA 1WRYA 5DJMA 5CRWA 2V6OA 2HFDA 3HZ8A 2GZPA 2R2JA 3APQA 1FVKA 4K0GA 4RQXA 2VCZA 3HHVA 3BD2A 3IK7A 3KD0A 3TKSC 1W4VA 2IWTA 1LJRA 5JWOB 2R3XA 1TU7A 3TKSE 4BWQA 2CX4A 2LKUA 2CA8A 3U5RE 4ACSA 4F82A 4HJMA 1TI3A 3CYNA 4HOJA 4PUFC 3FR6A 1CQHA 1XW9A 2YJHA 2DMMA 3GX8A 4V1Ap 1J0FA 1FAAA 2VOCA 1ZOFA 3L4NA 4LMWA 4K7NA 1RW1A 2F9SA 3LXZA 1QFNA 1ERTA 3GV1A 3HVSA 1TRUA 2C0EA 2GT6A 5JCUA 2I9HA 1RQMA 1DE1A 2LJKA 4L8EA 5ECLB 3C8EA 2JZRA 1XW6A 4V2MA 4ULXA 1LU4A 3G7IA 4PUAA 2G2QA 4BWSA 1EOHA 5A5KA 1GUKA 4ID0A 3KCMA 2DSAA 1OC3A 2C3NA 3MAKA 2V6KA 2RUFA 4GTUA 5EVOA 4EF0A 4POKA 2D2ZA 2MMOA 2PU9C 5B7CA 3EE2A 3ZMLA 3UBKA 5CAXA 2YWOA 2WB9A 2YANA 4DSQA 1IYIA 11GSA 3KZQA 1YDKA 3D4TA 4WEYA 2PUKC 4MZWA 2PGTA 3CRTA 2CZ2A 2IJYA 3TKPA 4L5OA 2VLTA 3BOAA 2WULA 4WF4A 4K0NA 3L9UA 4JRRA 4QL9A 1GSEA 2AB6A 1XWKA 1T8EB 5J41A 2HNLA 5AISA 5LD0A 5CRGA 2C0DA 4ECBA 2LNTA 1GWCA 3TJKA 2RM6A 4N0ZA 4K7IA 1I9DA 4N11A 5G5EA 4K2DA 5DDLA 4OWYA 4WF5A 1CQGA 3EC3A 1E6BA 2VCXA 1GTAA 4WXTA 3RHBA 4FYUA 1WWJA 3TJJA 2QKEA 5ECQB 2GZZA 5IMDA 2LTKA 3BBYA 2TIRA 3FZ4A 4ZB9A 6GSXA 1B9XC 3VWXA 1GH2A 4WBJA 2P31A 2FCHA 5B6MA 2G0FA 2O85A 1YEXA 4GSSA 4JBBA 3H4KA 1YZXA 1V57A 2AAWA 3A2VA 1WMJA 4K6XA 4MJAA 4TR4A 3WGDA 16GSA 3GSTA 4MZCA 3M9JA 4ZXGA 4I2UA 5DCGA 5B8AA 2GT5A 4V2NA 3GKKA 3M3MA 1MDJA 1PL2A 4YH2A 4GXZA 1S3CA 5KN0A 4BVXA 1T7PB 1JFUA 1A2JA 2JSYA 2JACA 4G19A 2VCTA 4MLYA 3P7XA 2V2GA 2YZUA 2WRTA 1EGRA 4I97A 3VURA 2L57A 3ZITA 2V1MA 4N30A 2DC5A 2FWHA 2FD3A 3RBTA 3G9BA 7GSSA 4ZBAA 4IN0A 2ZNMA 1ZYQB 3EYTA 2ON5A 1GSDA 1O85A 4TXOB 2HXKA 4HS1A 2YNXA 1YQ1A 3DWVA 4YQVA 2O89A 5IM9A 4NPBA 4TN8A 4K7OA 1V98A 3UJ1A 2H0HA 3C7MA 5JCWA 4LA1A 4NHZA 3GRXA 1XWCA 3Q18A 1AQVA 4MJCA 2OE3A 3KMOA 2L5LA 2DJ2A 1TJDA 4AJ8A 2B5YA 1NHOA 2FWEA 2H66A 4MP4A 4PURA 3E3EA 3BCIA 2IMDA 2B7KA 1ST9A 1TRSA 2NDOA 3CSHA 5AIXA 2IMFA 1AIUA 2EIQA 1B9YC 2L6CA 2WGRA 3I69A 3HCZA 3TDGA 2OJLA 1K0CA 2GQKA 1AW9A 2IN3A 3D6IA 3GFKA 1KEBA 5A4WA 2GQMA 1GLQA 2YN1A 1M9BA 3IR4A 3TKQA 4WETA 3HA9A 4RI6A 2VL3A 1ZMAA 1EGOA 5HR0A 4MDCA 4G2EA 3H1NA 2N5BA 1GTBA 1GNEA 4TOPA 3IA1A 1BEDA 1BYEA 4AJ6A 3QPMA 2JU5A 4MH3A 3QOUA 4OD7A 4WR4A 2X8GA 3H79A 3LGCA 4PQHA 5G2ZA 2M80A 5EL8A 1HYUA 1VRSD 1XVQA 1X0RA 2B5XA 3HZ4A 1UA5A 2DMLA 4IELA 2MMZA 3GYKA 4ML1A 3HVXA 1WJKA 2CV4A 2VM2A 2XBIA 4KDYA 1KNGA 1SJ6A 2E0QA 4EVMA 1XOBA 2F3MA 3JCML 1SK0A 1PGTA 1YF1A 1GSFA 4WR5A 4HU9A 2AHEA 1E2YA 3L9VA 1SL2B 2C8UA 2VO4A 3MWHA 1G6YA 4JR6A 3K8NA 6GSUA 3J7Yk 3NZNA 3ZL5A 5F0GA 4FO5A 2H1AA 4GCIA 1VF2A 2KP1A 5D8IA 3QCPA 1XW5A 3VWWA 2P5QA 3O3TA 3QFAC 3UAPA 1PN9A 4KDXA 5ECHB 4JU5A 3GH6A 3GTUA 1OC8A 4EC0A 5KN2A 2N5AA 3J7Yb 4MF6A 1FB0A 1PX7A 1JHBA 1ERWA 2AV4A 3NIVA 3IBHA 2YZHA 3GL3A 3H8QA 1HQOA 2DIYA 2I3YA 3C73A 2I4AA 2TRCP 1EP7A 4BPYA 3UBLA 3G7JA 4IW9A 4XHMA 4V1Ag 4L0WA 2VAFA 3EURA 3RAZA 2A2SA 3GURA 2DJKA 3G7YA 3P2AA 2WJUA 1PKZA 1F37A 1WP0A 5H5QA 5DAKB 4IHUA 3CBUA 2OA7A 1MEKA 3LYPA 2O7KA 5KEJA 3ERFA 1M7TA 1EWXA 1HNAA 1F3AA 2HRFA 2J9HA 1PMTA 3A2XA 3IDVA 3UEMA 3HJOA 1TXXA 3A3TA 2FNOA 3BJ5A 3KH9A 4F0BA 4HQZA 2BMXA 3GKMA 3LFLA 3L0HA 1GSYA 3UVTA 4MK3A 2LQOA 4MF7A 5LCZA 2H0IA 1M2AA 4WBRD 1SKWB 3O6TA 1ZYEA 1R5AA 3VPQA 2R5GA 4KH7A 6GSSA 4TR0A 2MMNA 3IXRA 1JZRA 4MPGA 4GF0A 4EXJA 1EEMA 4AF2A 4ZBDA 4IQ1A 1EV4A 1TRVA 1FO5A 3QR6A 3DMLA 3ZZXA 5G31A 2PVQA 3M8NA 1F6MC 2RUEA 5FWGA 2WZ9A 1TW9A 3WD6A 2LJAA 2VLUA 2M46A 4F03A 1EZKA 2ON7A 4KX4A 1M2BA 1VF3A 4KNDA 4KB3A 4NAXA 4ISDA 5JCGA 3QAVA 3CTGA 3CXGA 1ON4A 3APSA 3ZYWA 5D93A 5HFIA 4CDOA 1NHYA 4HZ4A 4KUNA 3A5WA 4J56E 2GZYA 5ECNB 1XWGA 1XZOA 4EE0A 5IMVA 5KN1A 3IOSA 3WYWA 3Q19A 4HJ2A 3KM6A 3EMPA 2B6MA 4GRFA 1ZGNA 4MMMA 1IYHA 1R5PA 5ECOB 3WGEA 5C00A 2E2MA 4TXVA 1SYXA 3FKFA 4IP6A 5ECKB 1SL1B 1A2MA 1Y25A 4LLRA 3LORA 4IBPA 4ZL7A 2YJ7A 2OE1A 3ZVJD 1M99A 3LYKA 4TR3A 3TOUA 1PSQA 2CX3A 2LEGA 3ED3A 5C04A 3D0ZA 4WKWA 2XHFA 2H6XA 4TR1B 3GKNA 1YF0A 3KP8A 2A2RA 3PGTA 1AC1A 2M72A 4XRDA 4NV2A 1GTUA 4LMVA 5ECMB 3UIWA 5IOXA 3M0FA 5GAPD 8GSSA 1T00A 2NPBA 1KBNA 2VM1A 2CVKA 2H6YA 5IPGA 1JZWA 2HSYA 1T1VA 1M2DA 1GP1A 6GSVA 1GUHA 5B6NA 1U3IA 1SJIA 4KCAA 4MH2A 4N0VA 4EUYA 1YKCA 2MZCA 1KTEA 3UL3A 3F63A 1FVJA 1BQ7A 3F4RA 3GX0A 2PBJA 2YV9A 3KH7A 2V41A 1Q98A 5F06A 2GS3A 5ENUA 1PX6A 4NXIA 4BVYA 4KAEA 3TJBA 2F8AA 4DEJA 2DJJA 4J2FA 3E0UA 1Q4JA 3APOA 1WE0A 4ML6A 3W6GA 4KCEA 5GZZB 4EKZA 1R26A 1MD4A 3CMIA 2DIZA 3LEFA 2VCWA 3GHAA 4ZB6A 5G5FA 1AUCA 4DSRA 2YCDA 3FY7A 1Z6NA 4XTSA 1JZOA 3O76A 1TI1A 4LL4B 3F6FA 1QK8A 4G9HA 3EMXA 4ZB8A 2YPMA 1XWAA 3AY8A 1G7OA 5L71A 4OFTA 1USBA 3ERWA 4O92A 5J9BA 4PGTA 3LG6A 2HZFA 2DLXA 1TU8A 4BA7A 1WPIA 3ME7A 4IGJA 3Q6OA 2NBSA 4GLTA 2B5EA 1EP8A 2CVDA 2FHEA 1PRXA 4HUAA 4HZ2A 1BG5A 1Z5YE 2PPTA 1BAYA 1A2LA 5HR1A 2VUPA 3R2QA 4O32A 3ZFLA 1V9WA 1UC7A 4POMA 1A8YA 2XBQA 3IAS2 1VF4A 1A24A 2REMA 1A0RP 3FRCA 5ID2B 1F2EA 4HI7A 3KTLA 5A4UA 1F3BA 3TGZA 2H8LA 5E59A 1X5CA 13GSA 3HYPA 4MPFA 2X64A 1G7EA 3FK8A 4CW9A 3UMAA 1PL1A 1XFLA 3CSJA 4AJ7A 3DIEA 2GQLA 4KSMA 4TXOA 5H5RA 1DSBA 5IPHA 5DALB 1N2AA 4Q5RA 1XPVA 3RPPA 5HFKA 2GSTA 4QQ7A 2LRCA 3WGXA 1QQ2A 1ERUA 1YEPA 4P3YB 6GSYA 2XPEA 5CYYA 1ZL9A 4ZL8A 2IMIA 1M9AA 5DALA 1GULA 4YQMA 1V2AA 5D9TA 1MD3A 3US3A 4OFMA 4OO5A 4KA0A 3SBCA 2LV3A 4MCUA 3KXOA 1ZZYA 3FW2A 3HVVA 5HR3A 2IMEA 4PNFA 3IPZA 3TRXA 2C1YA 1ILOA 2L6DA 1GSQA 1A23A 4JZQA 17GSA 1I5GA 3ERGA 4G10A 1SK2A 2R37A 3RDWA 3S9FA 3EVIA 2OBKA 2JL4A 2L4QA 4TVEA 2HZEB 1OYJA 1QUWA 1X9MB 1OC9B 1X5EA 1OKTA 2KOKA 3I9V2 1V40A 5DBQA 1PA3A 3L78A 2VL2A 1AQWA 2X99A 2VCVA 1MDKA 3MNGA 1SENA 1OC9A 14GSA 1SL0B 1XVWA 1JLVA 5CNWA 3ZRDA 1X9SB 2E7PA 3GIXA 3D5JA 3BCKA 3FHKA 2IFQB 1AXDA 1SU9A 1NSWA 3LQ7A 2KHPA 3I6AA 1NW2A 1SKRB 4MJBA 3ZTLA 4I6XA 4X0XA 5DQYA 3MSZA 4OCEA 4ZIJA 1O81A 1A0FA 4POLA 1U3AA 4GSTA 5JWQB 4E8EA 3GA4A 5AN1A 3U6VA 3UVHA 1WOUA 2R4VA 4ZILA 5FT3A 4MF5A 2BJXA 1J9BA 3F9UA 4F0CA 1OE7A 4X43A 1VGLA 2K6VA 1XWBA 4FH8A 3FZ9A 5ECPB 5IOWA 3HD5A 1R7HA 3E9JB 4KGIA 6GSTA 1FOVA 1QXHA 2MYGA 4GQCA 4X1UA 1B4QA 3TB2A 1WIKA 3VFIA 5JWRB 4K1FA 3VPTA 1MDIA 1O73A 2HE3A 3P90A 3D22A 4OCFA 1AQXA 2C0FA 1GLPA 4K8MA 1SK1A 1XOAA 2B1KA 1BJXA 5COHA 2DBCA 2O87A 2KLXA 3HDCA 1GTIA 2VLVA 5DAKA 3TKRA 3TRQA 2GTUA 2BTOT 2CAQA 3VLNA 2LJRA 3C1SA 9GSSA 2GDRA 5J3RA 1DE2A 2F51A 1O6JA 3ZMKA 1SYRA 5IMFA 2VIMA 5ECIB 2H0GA 3GKXA 2PERA 4EO3A 4H86A 4XS1A 1NM3A 2CVBA 3F8UA 4MA9A 2RM5A 3GL5A 4NHWA 5F8BA 5HFGA 1UN2A 2K8VA 2WS2A 1X9WB 4HEA2 2FUG2 4YAVA 5J4UA 2QGVA 3PR8A 10GSA 3FR3A 4ILFA 1OKDA 4IKHA 6GSWA 3DYRA 5G1KA 3PH9A 4YAPA 4F2IA 2HI7A 3KMNA 5ECRB 1THOA 1O8WA 4NV5A 3CRUA 3HJMA 4MJEA 2CQ9A 5CP1A 2IPAA 1TTZA 1TK0B 4POBA 2VL9A 4GSNA 4PQ1A 3QAWA 2MBSA 1HNCA 2C3TA 5HR2A 3DKSA 2OACA 2HT9A 3GH9A 1K0OA 5D9WA 3ZIJA 3SWLA 1EEJA 4D73B 5EPFA 5IO0A 4ZL9A 2IIYA 2H1DA 2B7JA 3Q74A 20GSA 3TOTA 4Q5FA 2FY6A 1T4YA 2VL2C 2X8HA 2LRNA 4I5QA 2L4CA 2AUVA 4D73A 3L9SA 2B1LA 1F9MA 5DJLA 4YQUA 1SD9A 1GRXA 4KW6A 4XRAA 3KTBA 1EOGA 4XS6A 3HY2A 2P0GA 3QD9A 2VD1A 3I43A 3DRNA 1N8JA 2FA4A 3DD3A 3UARA 2H1BA 4PNGA 1B4PA 1OVNA 2H76A 2QC7A 4TR1A 4XS4B 3WT1A 3IC4A 3D4MA 1ACVA 1U6TA 2YOIA 2DJ3A 3EINA 3ZFBA 5FHIA 4TRXA 5CRDA 4L0UA 2KP2A 4E8HA 4KE3A 3WT2A 5LNKe 1TK8B 3CSIA 4EL1A 2TRXA 3FYGA 1Y6EA 4XS4A 2MMAA 3M1GA 1VF1A 3VWVA 4OMVA 2A4VA 1J08A 2O8VB 3ME8A 2YWIA 4I2TA 2GSRA 3F4SA 1TOFA 1TRWA 4ECCA 1OAZA 4IVFA 5CREA 1TKDB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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