4XS6A

Salmonella typhimurium ahpc w81f mutant
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAFHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
publication title Salmonella typhimurium AhpC T43S mutant
rcsb
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
total genus 50
structure length 163
sequence length 163
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2015-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xs6A00
4GF0A 3I9V2 2WJUA 3F6FA 4TKYA 4JEDA 4DSRA 2LSTA 2YCDA 3F4SA 1YEPA 2ES7A 2YV9A 5IMVA 2C80A 1SL0B 1F37A 1G6WA 2L59A 2EIRA 4OCFA 2CX3A 5EPFA 4EL1A 2JACA 4JZQA 4J57E 2JADA 2R2JA 4N11A 4BVYA 4ECBA 4TR1A 3W6GA 3CSIA 5J5NA 2LUSA 2VCWA 1OAZA 1XW9A 2CVDA 1PX6A 2KP2A 3QCPA 4IJIA 4HI7A 2EIQA 5G1KA 4QL9A 1NHYA 3GKXA 1JZDA 3QFBC 1M2DA 4X1UA 2V2GA 4BVXA 2GSRA 3QOUA 1YJ6A 5HFKA 1SL1B 2VM1A 1BJXA 2WFCA 3WGEA 1GTAA 2GGTA 5B7CA 2FD3A 3N5OA 2VL2C 2AB6A 4YH2A 5DCGA 14GSA 2LNSA 3UBLA 4XS4B 4WETA 4X0XA 2IMKA 1K0CA 2B1KA 5DJLA 3GTUA 2L5OA 4N10A 1GH2A 4MMMA 4TXOB 3CBUA 3RDWA 2GVPA 3WYWA 3BD2A 2H1DA 4KCAA 2H0IA 4L0UA 1FG4A 3RPNA 4WR5A 4I97A 2WGRA 3LYPA 2AUVA 3M9KA 2H75A 4YQMA 2LRTA 1DSBA 1BYEA 1GRXA 3ZVJA 2TRCP 1EOGA 1T1VA 4IN0A 2A4VA 5B8BA 1GULA 2C3TA 4MF7A 1X5DA 2HXKA 4ISDA 2KLXA 2TRXA 3S9FA 5GZZB 4PQIA 2JZTA 5CO3A 2FNOA 4GRFA 2VCQA 4JRRA 1HD2A 1LJRA 2B5EA 4MF6A 1JZOA 4YAPA 1EWXA 6GSWA 5JCUA 5LNKe 4MPGA 6GSUA 1XBSA 2FGXA 4JR6A 1A2MA 1SK0A 3ME8A 3C73A 4POMA 2DJ0A 1SJIA 2YWOA 5ECRB 1MDKA 3GMFA 2I81A 1QGVA 1X5CA 1F3AA 3CRTA 4PUAA 4WF4A 3UOMA 1EEMA 1PKWA 2PGTA 5H5QA 5C04A 5DAKA 2I4AA 2PVOC 3M1GA 5L71A 1OE8A 1Z7PA 3GURA 1SL2B 3TKSA 1DBYA 3GSSA 5AIVA 5A5KA 3M8NA 2LNTA 1HNBA 3PGTA 3W8SA 4ZL8A 2A2RA 4OMVA 4O32A 4FH8A 2YANA 4OFMA 3ZVJD 3GNJA 4K0GA 2XPEA 1FW1A 2PUKC 2K6VA 5EVOA 4PQHA 5G30A 4YQVA 2H0GA 4PGTA 4F0CA 2WULA 4QQ7A 3D0ZA 12GSA 3LSZA 1WE0A 4LA1A 1JFUA 1K3LA 3JCML 3LYKA 3NZNA 4KA0A 2F8FA 4IBPA 4MZWA 4DVCA 4K6XA 2BJXA 3GYKA 1B9XC 5J9BA 1GSFA 1PL1A 5IMAA 16GSA 3BBYA 2R3XA 3PINA 3O6TA 4NWYA 3W8JA 4V1Ag 5JWRB 4KH7A 1SKRB 3GIXA 4GSTA 2PMTA 2REMA 5ECMB 3G9BA 3P8WA 3EC3A 4TXVA 5J3RA 3IHQA 1WMJA 4ID0A 4Q5QA 1O85A 2GQLA 1WWJA 3ED3A 5ECQB 2X8GA 3WGDA 4MH2A 1TRVA 1A8LA 4ZB8A 4Z7XA 4H86A 3C1SA 3J7Yb 3ZL5A 1A0RP 2KP1A 2GSQA 4FYBA 2EC4A 2A2SA 3OR5A 4FYCA 3ZLPA 2HT9A 2IWTA 1Z6MA 2OKAA 4XRAA 5DJMA 2YN1A 2CVBA 4HQZA 5H5RA 3FEUA 1BEDA 1U87A 3R2QA 1PD21 4MZBA 4IQ1A 2LV3A 2YJ7A 3F3RA 1G7OA 2I1UA 5GSSA 1T7PB 2YJHA 1X5EA 2BTOT 1QMVA 1U6TA 1VF3A 4GLTA 3BJ5A 1DE2A 5CRHA 3TRXA 1X9MB 1T4ZA 1EGRA 1GLQA 13GSA 1WPIA 5G1LA 2WCIA 2M72A 1I5GA 1J0FA 1Y6EA 2H1GA 1AXDA 2G0FA 2GZYA 3VK9A 3TJBA 1M99A 1ACVA 3LFLA 3TRQA 18GSA 3QAWA 2HZEB 4HOJA 4FO5A 4BPYA 1MDJA 1G6YA 1GL8A 2GSSA 1MEKA 4WKWA 4NHZA 5E59A 1Z7RA 2MMZA 1LU4A 2AAWA 3ZMLA 4RI7A 5AGYA 4D73A 4AGSA 2XC2A 4I8BA 4ZBDA 4KUNA 4OD7A 2H70A 3HKRA 4IELA 4BWQA 4CDOA 1SD8A 2LQOA 1SK1A 2DJ2A 3L0HA 1TU7A 4XCSA 5ECIB 4L8EA 4ZL9A 2JSYA 1IYHA 3FKFA 5A4UA 1SYRA 3TKQA 3RBTA 2VO4A 2C8UA 2HRFA 3CSHA 3HVSA 4LMVA 3LXTA 1JLWA 5G5EA 2LJAA 2IFQA 4GSSA 4KDYA 1GNEA 2H1AA 2FWEA 2CZ2A 2PBJA 5GAPD 5IMDA 1GSYA 4X43A 1G0TA 4MDCA 4G10A 1ZMAA 1RQMA 3GH9A 4OO5A 5IMFA 1TK5B 1TK8B 4NV2A 8GSSA 3D22A 1Z3EA 3EMPA 2GZPA 4XS1A 2KHPA 2MMNA 1JZRA 1QFNA 1XWAA 5KN1A 3TDGA 1WP0A 1FO5A 3HHVA 3I43A 2L5LA 3UBKA 4EVMA 4TOPA 3ZIJA 3ZIVA 1OC8A 3HA9A 1BX9A 2IMEA 1XXUA 3H4KA 1YEXA 4LLRA 4L5LA 4ZB6A 5ELGA 3I6AA 2H6ZA 4Q5RA 4DEJA 2B1LA 2NPBA 2X64A 3D5JA 5KN3A 1GSQA 5HFIA 2DLXA 4TR1B 1XPVA 1E6BA 1WIKA 2KUCA 3QD9A 2OA7A 4DSSA 3CSJA 2YWNA 1PMTA 2O85A 2GLRA 4TN8A 5CP1A 5CREA 2HRNA 3FZ5A 3BOAA 2MZCA 4IKHA 2YWMA 5CRGA 4WR4A 3HD5A 3GL3A 1YZXA 2QC7A 3Q74A 3RAZA 2E2MA 3VWVA 1FAAA 2B7KA 3DXBA 1Z9HA 3ZREA 2AJQB 5IQYA 3H79A 1SJ6A 5B6MA 4GXZA 2V32A 3F0IA 2YP6A 2IIYA 5A4VA 1B48A 3TB2A 5D9TA 4F0BA 5JWOB 1B9YC 4XTSA 1IYIA 3GTUB 3DD3A 5JWQB 5DVBA 1XW6A 3P90A 1XOAA 3DWVA 3GUSA 4PX1A 5F8BA 4PNGA 1TU8A 3DEXA 3EWLA 1TRWA 2ZCTA 2GT5A 3VI7A 2X8CA 3A5WA 1M9BA 4OWYA 1MTCA 2N5AA 4KW6A 2LRCA 5A4WA 5COHA 2GZZA 1GSDA 5HR1A 2NVLA 4IP1A 4HS1A 1K0NA 4KAEA 4E8EA 1EGOA 2CA8A 3GH6A 1WOUA 1M2BA 3L4NA 1QQ2A 2DJJA 2FWFA 2VCZA 5B8AA 1ZYEA 2LJKA 1M0UA 3QMXA 4ECCA 1X0RA 3ISOA 4K7IA 1AQWA 1YDKA 3APSA 5HQPA 4LMWA 2WB9A 4HEA2 1R5PA 2X99A 2VUPA 1S3CA 1X9SB 3IK9A 2I3YA 1YKCA 2IJYA 3QAVA 4KSMA 1T00A 2DBCA 2P5RA 5DALA 4DSQA 4YQUA 1AW9A 3V1WA 3P7XA 1KTEA 2MBSA 3EVIA 3RHBA 4ECIA 1GTIA 5EY6A 5DAKB 4RQXA 1Z5YE 5HR2A 1PGTA 1TK0B 3IA1A 4RUVA 4CW9A 3TKSC 2IMDA 2QSIA 1WJKA 3UARA 4BA7A 3N9JA 4ILFA 4J56E 4N30A 4EO3A 3F8UA 2RIIA 1UVZA 3PH9A 2V41A 4RQRA 3P2AA 3ZTLA 5CNWA 5F07A 5ECLB 1M9AA 4EDYA 1PX7A 4POLA 4MJAA 4IS0A 4NXIA 2H01A 1NM3A 3UVHA 1ERVA 2VD1A 3DMLA 3TRPA 1ZCPA 1U88A 3KMNA 1T3BA 4EXJA 1ZL9A 2C4JA 3APOA 3HJMA 4CHSA 4GWRA 1K0MA 1OE7A 4Q5FA 3FZ4A 1XW5A 4EDZA 1O81A 4WXTA 3IR4A 2DIZA 3DYRA 2HYXA 1AQXA 3F63A 3H8QA 3IRAA 9GSSA 1X9WB 4XS6A 3KP9A 1GWCA 2LEGA 3FZ9A 3L78A 2YOIA 2B6MA 2BMXA 3UEMA 3DKSA 5KN2A 5C00A 3ERWA 1VF2A 2N5BA 2VCVA 3EE2A 3EURA 5AIXA 5J41A 4O92A 1YQ1A 3VI5A 1V2AA 1H75A 2VLVA 4KCEA 2FLSA 4MCUA 1OC9A 1H4OA 3E3EA 5ECSA 2J23A 1QXHA 3VURA 3K8NA 2F51A 1F9MA 5AN1A 4LL1B 2X8HA 1CQHA 3SBCA 4FYUA 4WF5A 4TR0A 5IPGA 2B5XA 3CMIA 3FR6A 3LEFA 5DDLA 4P3YB 3CTFA 1S3DA 1XIYA 3GV1A 3IAM2 1XZOA 4MPFA 5F0GA 4YAVA 1ON4A 2CT6A 4KSOA 1Q98A 4Q5NA 2LRNA 3Q18A 3HZ8A 2RM6A 3KZQA 4KNDA 3TJGA 2VCXA 3M9JA 3HJOA 2FUG2 1O8XA 2TIRA 4HQSA 5ECHB 2HNLA 2LKUA 1K0AA 5JCWA 1NW2A 2DSAA 1NHOA 2MYGA 3UIWA 1YF0A 1UA5A 3KM6A 1RW1A 2JZSA 1B8XA 4EF0A 2H0HA 1A2JA 3MDKA 3MNGA 4K2DA 3LXZA 1S3AA 3TOUA 1GTUA 3RHCA 1J08A 1URMA 1ZGNA 2P31A 4ACSA 1VRSD 4V1Ap 3KH9A 1XOBA 5CYYA 3KXOA 3L9VA 1KEBA 3GKNA 2CV4A 1TW9A 2H66A 4AF2A 3F4RA 2YZHA 3O3TA 1I9DA 5LD0A 1V9WA 3D4MA 3ZMKA 1PRXA 3QFAC 2VL9A 5ABRA 2R4VA 5D73A 2DJ1A 4K8MA 5EL8A 2HE3A 2H73A 1AAZA 2FWHA 2PERA 4KDUA 3HZ4A 4XRDA 3IE3A 4IP6A 1E2YA 1N8JA 4MH3A 6GSYA 4LL4B 3ZFLA 1O6JA 3A2VA 2FCHA 2E0QA 5INYA 2YWIA 5GSTA 2L6DA 4D73B 2IL3A 4IJ3A 1VGLA 3WT1A 1R26A 4PUFC 3M3MA 4K7NA 4MA9A 5HR0A 1T8EB 4PURA 2VIMA 2IN3A 3U5RE 6GSXA 2OE3A 2XBIA 4GCIA 3QDNA 2R5GA 2GTUA 2JL4A 3IBHA 1OKTA 2H71A 1K0DA 2PPTA 3UJ1A 2RM5A 3KTBA 2R6KA 1QUWA 2DMMA 2G2QA 5CAXA 4HDEA 2DC5A 4TRXA 3MAKA 3VLNA 3J7Yk 3TKRA 2IFQB 3A3TA 1F3BA 3FRCA 4O5RA 4OCEA 2EIOA 3KH7A 5GAND 1PSQA 4WBRD 5ECPB 2GS3A 2RUEA 3LQ7A 2IMIA 1M7TA 1JZWA 3C8EA 1LBKA 3KMOA 3L9UA 3EMXA 1UN2A 3FYGA 4ML6A 5AISA 5KN0A 1K3YA 1A8YA 2VL3A 2K8SA 5IO0A 4GQFA 3AY8A 2PWJA 4L0WA 3KEBA 1V98A 4PQ1A 3U6VA 1SYXA 3NOFA 4POKA 2E7PA 1SJZA 3SWLA 3ERFA 3Q6OA 2VD0A 1HYUA 3FY7A 1A24A 3TOTA 5ENUA 1O8WA 2YZUA 4XIHA 2OE1A 5IM9A 3G7JA 1MDIA 4K0NA 4PNFA 3FZAA 3IDVA 1YKAA 3FK8A 3UL3A 1XFLA 2IMFA 2NDOA 5JCGA 5B6NA 4XHMA 5D96A 4ZIJA 3BCIA 3HCZA 4HUAA 5D9VA 2H8LA 4MJCA 2V1MA 4KX4A 1W89A 2FHEA 3PR8A 3LJRA 1JLVA 3TUEA 4DSSB 4NAXA 2JU5A 4JU5A 4AJ8A 3UAPA 3HVVA 4QL7A 3BCKA 1BQ7A 4IHUA 1GLPA 1K0BA 2M46A 2FWGA 2LTKA 4MJEA 3HXSA 5FT3A 2ZUPA 3LWAA 4FIWA 2OBKA 2OACA 19GSA 1ERUA 3HDCA 3H1NA 1R4WA 3TCOA 5F05A 3F3QA 3GSTA 3VWUA 3QR6A 1F2EA 1Q4JA 1HNCA 3HJPA 4F03A 1V58A 2H6YA 1USBA 2VOCA 1UC7A 2MMAA 2OJLA 5J4UA 2MMOA 1TJDA 3C1RA 3GRXA 2E2GA 4V2NA 2D2ZA 3O76A 2F9SA 2WDUA 1EP7A 5D93A 2L6CA 3E9JB 3HYPA 2C1YA 1XCCA 3IOSA 2GDRA 4XS4A 2VL2A 4TVEA 1HNAA 11GSA 3C71A 1PA3A 2XPDA 5HR3A 1GNWA 2O7KA 2I9HA 1EP8A 1O7UA 2L4CA 1SU9A 4TXOA 5DQYA 22GSA 2YPMA 5G31A 2HLSA 4V2LA 4EC0A 2H76A 5LCZA 1AC1A 2L57A 2H74A 4MP4A 2FY6A 1THOA 2ALBA 4IW9A 1FOVA 1NSWA 4TW5A 3A2XA 3TGZA 2H30A 2O89A 1F6MC 1EV9A 3TKPA 1EOHA 1V40A 4ZBAA 4E8HA 5DALB 1Y25A 5G2ZA 4N0VA 4HJMA 4MK3A 1DUGA 2YV7A 3D6IA 3DGQA 4OO4A 4EKZA 3ZRDA 1TTZA 1EZKA 1BAYA 3QPMA 2C0EA 4RI6A 3ME7A 1FHEA 1PN9A 4KE3A 2HFDA 3EINA 3DRNA 3MWHA 3A2WA 2KOKA 3WGXA 4K9ZA 1ABAA 4IQAA 4AJ6A 4F9ZA 1ST9A 2L4QA 4GSNA 1M2AA 5DBQA 7GSSA 3KD0A 2WS2A 1BG5A 2VLTA 1N2AA 1FVJA 1ZYQB 2HSYA 4ZL7A 3DIEA 2AV4A 1K0OA 2HSHA 3DVXA 2C3QA 4F82A 5CRWA 4TR4A 2AHEA 4NMUA 3TJFA 4ML1A 3EU4A 2H72A 1PL2A 1EEJA 4GQCA 3LORA 3LG6A 3F9UA 2XHFA 1R7HA 4K1FA 1V57A 1Z6NA 4MABA 2CAIA 3TKSE 2O87A 1YY7A 5H5SA 2HI7A 2YNXA 4ZBBA 2Z9SA 1AUCA 2LQQA 2B5YA 4KDXA 4L5OA 1GUMA 2VM2A 4HZ2A 1A0FA 4TR3A 2N5FA 3MSZA 4F2IA 3ZYWA 4HZ4A 1TXXA 4I5QA 1GSUA 2ON7A 2P0GA 2NBSA 1AQVA 1VF4A 1XVWA 1DE1A 2M80A 2O8VB 3APQA 1OC9B 4AJ7A 2FA8A 3EU3A 5DCHA 1TRSA 1U3AA 3US3A 5ECKB 4I2TA 3GKMA 5F06A 1T4YA 4POBA 4OFTA 1PKZA 1CQGA 1U3IA 3KGKA 3H93A 4BL7A 5ELAA 4IGJA 1GP1A 1GUKA 1TRUA 2J9HA 1OYJA 2ON5A 1OC3A 1KNGA 5FWGA 4EUYA 3IV4A 4NV5A 2DMLA 5HFGA 2CVKA 2C0DA 1AIUA 1GSEA 3HY2A 2WZ9A 2B3SA 1VF1A 3NIVA 3VWXA 5IOWA 2CQ9A 4ULXA 6GSSA 2CZ3A 3KP8A 3QAGA 1J9BA 4ZXGA 3VFIA 1EV4A 2VCTA 2HZFA 3GFKA 5ID2B 3G7YA 1SKSB 1XWCA 3FR9A 4HU7A 5ID2A 4HJ2A 5D8IA 3FHKA 3FR3A 1R5AA 4I6XA 4ECJA 3GX8A 2GSTA 4ZILA 3WD6A 3IXRA 3L9SA 5IIZA 2OADA 4N0ZA 1TI3A 4KB3A 2K18A 1XWGA 2GQMA 1KBNA 1ZZYA 4JBBA 3IK7A 2FA4A 3KCMA 4EE0A 3HVXA 3KTLA 2R37A 4GTUA 2NTOA 3GHAA 2VLUA 1B4QA 3VPQA 1SD9A 4HU9A 2IPAA 4J2FA 2K8VA 3IPZA 1ML6A 5KEJA 1OVNA 5G5FA 4MZCA 1C72A 3KJYA 2RUFA 4G19A 2ZNMA 2C0FA 2LJRA 2PU9C 4ZB9A 4K7OA 2WRTA 3E0UA 1SK2A 1THXA 4JR4A 1FB0A 1TP9A 4IVFA 2P5QA 1W4VA 1ILOA 1SENA 5FHIA 1WRYA 4PXOA 4G9HA 3RPPA 3FW2A 2CX4A 2C0GA 1B4PA 1A23A 5D9WA 4MF5A 3GX0A 4O7HA 5ECOB 2F8AA 1XWKA 2C3NA 3IAS2 1GSSA 6GSVA 2V6KA 3GN3A 2DJKA 3VPTA 2RLIA 3ERGA 5J9CA 3LGCA 1MD3A 1K3OA 2XBQA 4JE1A 1ERWA 2HZEA 3ZZXA 3KIJA 4BWSA 1ZOFA 2JSZA 4WEYA 1TI1A 1OKDA 1RK4A 1TKDB 1XVQA 17GSA 2GQKA 3GL5A 2LS5A 5CRDA 1HQOA 3D4TA 3M0FA 3ZITA 3DVWA 5DQSA 2B7JA 3IC4A 10GSA 3Q19A 1FB6A 2PN8A 3TJKA 1ERTA 20GSA 4KGIA 2QKEA 3WT2A 5E4WA 2AYTA 1TDIA 3UVTA 3ZFBA 5IO2A 2K9FA 1YF1A 5IOXA 2DJ3A 2JZRA 2OE0A 1FVKA 1XWBA 2GT6A 3EYTA 1G7EA 3VWWA 1GTBA 2DIYA 2CAQA 4NPBA 4MLYA 4OFNA 1PQNA 2OBIA 3F6DA 5IMCA 3G7IA 4V2MA 3CTGA 1TOFA 5IPHA 5ECNB 4WBJA 3CRUA 3F4TA 4MJBA 4G2EA 1QK8A 1SKWB 3CYNA 2V6OA 2MBTA 3TJJA 3UMAA 4NHWA 1JHBA 4I2UA 3GA4A 3CXGA 3C7MA 3D21A 6GSTA 2PVQA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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