4XS6A

Salmonella typhimurium ahpc w81f mutant
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAFHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
publication title Salmonella typhimurium AhpC T43S mutant
rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
molecule tags Oxidoreductase
total genus 50
structure length 163
sequence length 163
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2015-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xs6A00
4AJ7A 3VPQA 3P90A 5GSTA 1FVJA 4XS4A 2JZSA 3E0UA 9GSSA 1WPIA 1EGOA 1PRXA 1HD2A 4GTUA 1K0CA 1G0TA 3ZVJD 1MDIA 3ERGA 4O32A 4MJCA 1K0OA 4FH8A 3J7Yk 4NV5A 1QK8A 3F4SA 3FEUA 4NHWA 4OMVA 1K3YA 4TOPA 1PQNA 1PKZA 3R2QA 4XRDA 4O5RA 1EZKA 2V6OA 3BCKA 4PNFA 3RPPA 3M0FA 1M2AA 1R5PA 2X99A 2O87A 3RBTA 2TRCP 3G7IA 3DGQA 4FIWA 3GX0A 4BVYA 1DUGA 1SD8A 2YV9A 1SYRA 2CAIA 2JZTA 2B5YA 3KP9A 5IMZA 3U6VA 1GULA 2IFQB 1DE2A 2X64A 3LJRA 5A4VA 4OFNA 5J41A 4IKHA 2N5FA 3UOMA 1M2DA 3HHVA 3FZAA 3HZ4A 3GSTA 1SK2A 5J9CA 2LJRA 1A8YA 2VCQA 5DVBA 4F2IA 4GCIA 3F63A 1JLVA 1K3OA 2DMLA 2E2MA 5ECRB 4BA7A 1PX6A 5E4WA 3KH7A 3EINA 1A2LA 1TTZA 1GUHA 3MWHA 1VGLA 3TDGA 3UL3A 2LKUA 1W4VA 5GAPD 3QR6A 4MJBA 1GH2A 4N11A 1A2JA 2H0GA 3WT1A 2H6XA 2G2QA 1B9YC 3WGEA 4LMWA 1H75A 3IDVA 3GX8A 3KMNA 5CO3A 2IN3A 3HZ8A 1N8JA 2IMIA 22GSA 4LLRA 1TK0B 4KAEA 2WS2A 3GH9A 4DSSA 2M80A 2OBKA 1ML6A 2N5BA 3IHQA 1QQ2A 1AXDA 1UC7A 1GSFA 2X8HA 1BJXA 2AHEA 3GSSA 1R5AA 1TXXA 3VI5A 2OACA 3C7MA 2MMNA 2H6ZA 2PVOC 5IMAA 1ZCPA 5DQSA 3FR6A 1ZYQB 1XWKA 1X9MB 4RUVA 1XVWA 3PR8A 5HR2A 1YDKA 1GTUA 2VUPA 4G10A 3CMIA 4KDXA 4WXTA 2YN1A 4AJ6A 1Y25A 5AGYA 1T3BA 2V2GA 4WF4A 4BWQA 4CDOA 3TB2A 3HVSA 3I43A 3QAVA 4K8MA 2PN8A 2KHPA 5KN1A 3O6TA 5D93A 1XOBA 1THXA 2MBTA 4I97A 5HR0A 4AGSA 3CTGA 5IMCA 2M72A 1T00A 1EV9A 1XVQA 2YPMA 3S9FA 2CQ9A 1YKCA 3TRPA 2VLTA 3TJBA 3IA1A 2FLSA 1UN2A 3ZITA 1JZDA 4WETA 4KW6A 3TRQA 3PH9A 3W6GA 2I81A 4Q5QA 3G7YA 2VD0A 1V58A 3ZMKA 3ME7A 2VD1A 3U5RE 4F82A 1ACVA 1URMA 1NSWA 3GKXA 3IBHA 3KP8A 3UBKA 4G2EA 3EYTA 3GUSA 3C1RA 1AIUA 1GUMA 1WP0A 2IMDA 4IHUA 2FWEA 1XW6A 3VPTA 2F3MA 2PERA 1TDIA 2YNXA 1F9MA 3FHKA 1FW1A 3M8NA 1TI1A 1V2AA 3RHCA 2RIIA 3QFAC 4MZBA 4YAVA 5DJMA 2GSQA 1TI3A 2R3XA 2H8LA 2VCZA 4L0UA 2L57A 1THOA 1T7PB 5IOXA 3SBCA 2DJ3A 2B5EA 3P7XA 3NOFA 1EEJA 4RI7A 1GP1A 2LNTA 4Q5FA 3APOA 3RDWA 5EPFA 2I4AA 1U3IA 2YP6A 3GKNA 3FZ9A 3KGKA 5C04A 2CX3A 4ZL8A 3LXTA 4WBRD 4N0ZA 4IP6A 3TKQA 1WMJA 3MNGA 3FZ5A 3QPMA 1SK1A 5JWOB 5CRGA 2ZNMA 2VAFA 3ZREA 1K0AA 2DC5A 1I9DA 3W8SA 4ACSA 4MABA 3F4TA 2YV7A 1Y6EA 3Q6OA 1T8EB 1GSSA 1M9AA 4HUAA 3V1WA 5F06A 2OJLA 4KE3A 1NM3A 3DKSA 5IOWA 1AAZA 2FA4A 1GSDA 1ON4A 2H01A 1ERVA 1LBKA 2R5GA 2MMOA 2CA8A 2CVKA 3GTUB 3LWAA 3C73A 4OCEA 4WBJA 1XW9A 3QDNA 3LORA 3H4KA 1HYUA 1B48A 4KA0A 4X43A 1QFNA 5ECNB 2OE1A 3NZNA 3KIJA 1TP9A 12GSA 2GS3A 5E59A 1X5CA 2O89A 13GSA 1Z7RA 4OWYA 1E2YA 1XWCA 1FO5A 3K8NA 3KCMA 1YQ1A 5B6MA 2NTOA 2FY6A 2R4VA 3I6AA 1LJRA 4F0BA 4J57E 2KLXA 4HOJA 2GVPA 2H75A 4GWRA 8GSSA 2H1DA 1QGVA 1EOGA 3ZIVA 3TJGA 1OKDA 3L78A 2H76A 3ERWA 1S3CA 3RPNA 1K0NA 2JSZA 4KB3A 3HKRA 1XW5A 4KNDA 1FG4A 2RUEA 2ZCTA 3TOUA 4NHZA 1TK5B 1EEMA 1C72A 5J4UA 2LUSA 3QOUA 4PQHA 3JCML 2IWTA 2AB6A 1XFLA 1YF1A 1K0BA 3F6DA 3MSZA 5D9WA 4IJIA 3CSHA 2HSYA 1Z9HA 1GTBA 2L4CA 2LRTA 2DJKA 1A2MA 1E6BA 3Q74A 4KSMA 3TUEA 2LJAA 2PUKC 4JEDA 1EGRA 1KEBA 2DSAA 3HA9A 3KZQA 4PXOA 3VWUA 3ZTLA 3F3RA 2HZEB 3CSIA 5COHA 1MTCA 1DSBA 2LQOA 3UBLA 4EL1A 4EC0A 3WGDA 1O73A 2MBSA 1U6TA 2CX4A 5CRHA 4ML6A 1G6WA 2HE3A 4JZQA 2K18A 1YJ6A 2IMEA 2DBCA 3IC4A 4NV2A 4MZCA 2HYXA 1VF3A 2H74A 2YOIA 1YKAA 2P31A 2EIQA 4MH2A 3GKMA 4HS1A 5JCWA 5CNWA 5IO0A 4E8EA 5ECMB 4PQ1A 5KN2A 3QFBC 2LTKA 1A24A 3D4MA 1O81A 3DXBA 3QCPA 1MEKA 4ECCA 3UVTA 5H5SA 3RAZA 2QC7A 4Z7XA 2LJKA 3CTFA 4MK3A 3UIWA 4MCUA 1TRUA 1OC9B 4EDZA 1X9WB 1R26A 3UAPA 1WE0A 7GSSA 4ZBDA 3HJOA 2OKAA 3KH9A 3H79A 4MF5A 1MDJA 17GSA 2KP1A 2XBIA 2ALBA 2C0GA 4FO5A 3F4RA 2GTUA 2R2JA 5INYA 3IV4A 2HRNA 1F3AA 2M46A 3GV1A 2FUG2 1OC9A 2C1YA 3Q18A 2XHFA 2QKEA 19GSA 5IIZA 4HI7A 5DQYA 1SL0B 3FRCA 5DAKB 2XPEA 4GXZA 3IOSA 4L8EA 2JADA 2HT9A 2REMA 2V41A 1Z5YE 4POKA 2DJJA 1PL2A 1T1VA 2GT6A 4HQZA 2JSYA 1GSEA 3IK9A 1HNAA 5A4WA 1R7HA 2A2SA 4MPFA 1GL8A 1GTIA 3HJMA 4IJ3A 4YQMA 1MD4A 1KBNA 5IQYA 4JRRA 4KX4A 5B8BA 5GZZB 3GMFA 2E7PA 2IFQA 2B1LA 4EF0A 5DAKA 1ERTA 1S3DA 3C1SA 4ECBA 4XCSA 1TOFA 2B3SA 5KEJA 3O76A 2YWOA 3ZZXA 2VM2A 4K7OA 5B7CA 2O7KA 3UARA 3E9JB 2H73A 2PPTA 5ECSA 5H5QA 1PA3A 4HJ2A 4MLYA 5FT3A 1WRYA 3LQ7A 2ZUPA 4J56E 5IMDA 1ZMAA 2IL3A 3KD0A 3GN3A 1JZOA 4FYBA 2B6MA 3LSZA 3TJKA 4CW9A 2H1BA 2WB9A 5F07A 4TN8A 4YQUA 1NHOA 4I5QA 5CRDA 3TGZA 3TCOA 2YWMA 1Z6NA 3KTLA 3G7JA 1OAZA 1M99A 2E2GA 2HNLA 2DJ2A 2LEGA 4HQSA 4JU5A 4F03A 2VCVA 4DSRA 1A8LA 2LRCA 2MYGA 14GSA 3H1NA 1GWCA 1GSQA 2VL3A 3IK7A 2C80A 4O92A 2NDOA 2DIZA 4EUYA 1M7TA 1V57A 1T4YA 2NVLA 3ZVJA 1S3AA 5ECQB 1SJIA 3ZRDA 3I9V2 1ERUA 1OVNA 2WCIA 5G2ZA 1O85A 2FWFA 5IPHA 4K2DA 2C0EA 2K9FA 4AJ8A 1EWXA 1YF0A 3DYRA 3IPZA 5AIVA 4G9HA 5KN3A 3A2VA 3RHBA 5DALB 4XIHA 4PNGA 4HDEA 2WULA 2RM5A 4XTSA 1GSUA 4QL7A 5ECIB 2H0HA 2L6CA 4V1Ap 2GQKA 3OR5A 1SD9A 4D73B 3VFIA 2EIRA 2VOCA 5CRWA 6GSSA 2K8VA 5F8BA 2VCTA 3G9BA 1TKDB 3L9UA 1XWBA 2DMMA 3DEXA 5DALA 2XBQA 2YANA 4V1Ag 3P2AA 4ZL9A 1AUCA 4KSOA 1BEDA 4NAXA 4K7NA 1N2AA 4D73A 2MMAA 4EXJA 3C8EA 4LMVA 1IYHA 3I69A 1PKWA 4KDYA 2GDRA 5GSSA 1SU9A 1UVZA 5H5RA 3QD9A 1RW1A 2LS5A 2P0GA 5ID2B 1GNEA 5F0GA 3LGCA 3HXSA 2C3QA 2A2RA 3ZYWA 3N5OA 3ZFBA 4PUFC 4WF5A 2F51A 3CXGA 3M9JA 5DBQA 3IAM2 3FKFA 2G0FA 4H86A 2F9SA 1SK0A 1JHBA 4IN0A 3FW2A 2GSRA 5ID2A 1BX9A 3O3TA 1ERWA 3KJYA 4PURA 1X0RA 4EE0A 2B7KA 1XBSA 3ME8A 2H1AA 6GSYA 1VF4A 2J9HA 2JZRA 1CQGA 2EIOA 4ULXA 5EVOA 1XIYA 3WGXA 5J5NA 2KP2A 2BJXA 1SJZA 3F8UA 2WZ9A 4BVXA 3L4NA 5G31A 1O8WA 2FD3A 4LL4B 2WDUA 2AUVA 2X8GA 4P3YB 1B9XC 4YQVA 4DVCA 1ZL9A 1Q98A 1IYIA 4O7HA 3MDKA 2GZPA 2IMFA 4LL1B 4N0VA 4IBPA 5D73A 5ECLB 1ABAA 5HFKA 3TKSE 3GRXA 4GLTA 2VL2C 5FHIA 4WR4A 4ML1A 1AQVA 1OYJA 3L9SA 1WWJA 2V6KA 1SL1B 4XS1A 1GLPA 2OADA 10GSA 3BBYA 3HVVA 3IRAA 5J9BA 4L5OA 1PSQA 4KCAA 4TR0A 4ZBAA 1Q4JA 1PX7A 2WFCA 5A5KA 4KCEA 1SYXA 4G19A 5JCGA 1X5DA 2YZUA 3FK8A 4GSSA 5LNKe 4POBA 1TRWA 3HVXA 3GTUA 2DIYA 2CVDA 4RQRA 4MA9A 3KM6A 3E3EA 3VLNA 1PN9A 1M0UA 4GQCA 1TJDA 3MAKA 11GSA 2A4VA 2TIRA 1USBA 1JZRA 4K9ZA 1UA5A 3WD6A 3M1GA 4PUAA 3VURA 5ELGA 4KDUA 2D2ZA 2PVQA 2FA8A 4AF2A 2PGTA 2HFDA 1A0RP 4EO3A 5IMFA 2DLXA 3GURA 1SL2B 1LU4A 1BYEA 4HJMA 3GH6A 2OE0A 2GQMA 1B8XA 1V9WA 5ECPB 3TKSC 1U87A 3DWVA 5ABRA 3EE2A 3DVXA 3GKKA 3A2WA 5HFGA 3EVIA 1FAAA 2H66A 2RLIA 1PD21 4KGIA 4GSTA 1FOVA 2K8SA 2OE3A 3D5JA 4MJAA 2X8CA 3VWVA 2E0QA 2BTOT 1DBYA 3EURA 4L5LA 4NPBA 2O8VB 5EY6A 2LNSA 4OFMA 4BL7A 4K7IA 5JCUA 1AQXA 4XRAA 5CAXA 2F8AA 2H30A 2CT6A 1OC3A 4K6XA 1O6JA 1KTEA 4NMUA 5G5EA 2WGRA 1TK8B 1M2BA 5ENUA 1EP8A 1OC8A 5G1LA 3GYKA 1FHEA 5DDLA 5D9XA 5ECHB 1YY7A 4XS4B 5IPGA 2H70A 3APSA 5G5FA 5HR3A 2HZEA 3UEMA 4V2LA 3KTBA 4TXOB 1OE8A 2B7JA 5D9TA 1BG5A 2GZYA 2V1MA 4MPGA 2CVBA 2MMZA 1GTAA 3HD5A 4MJEA 2OBIA 2CV4A 1B4PA 1SKSB 3EU4A 2H0IA 2VLUA 5LD0A 3W8JA 5DCHA 5KN0A 2CZ2A 2RUFA 4OD7A 4ECIA 2BMXA 1K0DA 1FB0A 2ES7A 2K6VA 1VF2A 5EL8A 4L0WA 3D22A 4TXOA 3BOAA 3QMXA 3WYWA 2NBSA 4I8BA 2HLSA 2I1UA 2P5RA 2IJYA 1W89A 2AJQB 2LSTA 5AIXA 3H8QA 5A4UA 1RK4A 3QAGA 4X0XA 3ZL5A 1AC1A 2VIMA 3GL3A 2VCXA 5L71A 5G1KA 5CREA 5F05A 3VWWA 5ELAA 4ID0A 2FNOA 2L6DA 4NXIA 1HNCA 1O7UA 4HZ2A 3F6FA 3DD3A 18GSA 3ERFA 2JL4A 3HJPA 4WKWA 2QGVA 3HYPA 2IMKA 5J3RA 4PGTA 5C00A 3F9UA 4I6XA 1J0FA 1OKTA 1F3BA 3J7Yb 4IP1A 5ECOB 2WJUA 5JWRB 1A0FA 1JFUA 1U88A 4ZL7A 4IVFA 5DCGA 1MD3A 2YCDA 5IO2A 2PBJA 4HU7A 4Q5NA 3IE3A 3N9JA 1NW2A 1PGTA 4MDCA 3EU3A 2LRNA 2AV4A 1K3LA 1F2EA 1ZOFA 5G30A 4DSSB 1Z7PA 1GUKA 3DVWA 2XPDA 1QXHA 1NHYA 1TU8A 3LFLA 4KUNA 4RQXA 1RQMA 1JZWA 1GRXA 5B6NA 3A3TA 1XCCA 2H71A 3ZIJA 2YJ7A 4IS0A 4K0NA 1XZOA 2KUCA 2HI7A 1XPVA 1AW9A 1SKWB 2CZ3A 3SWLA 3TKRA 4POMA 1G6YA 1DE1A 3CRUA 1CQHA 2C3TA 2IIYA 1G7OA 4N30A 2B5XA 2GQLA 1H4OA 5D8IA 1HNBA 1V40A 5HQPA 3A5WA 2PMTA 1EP7A 3VI7A 4GSNA 2FGXA 1BQ7A 4TR3A 2CAQA 2VL9A 4IQAA 2VLVA 2H6YA 1GNWA 2DJ0A 3TOTA 4QQ7A 3FR3A 1VRSD 4ZB9A 4DSQA 20GSA 1FVKA 3BJ5A 3LXZA 3FZ4A 4KH7A 4E8HA 2HSHA 3HY2A 4POLA 1U3AA 4K0GA 1TW9A 3EMPA 4WR5A 6GSWA 2L5OA 2J23A 5HR1A 1SKRB 1YEXA 1SENA 4XS6A 2O85A 1G7EA 4TXVA 1GLQA 4ZB6A 3ISOA 2C4JA 2QSIA 4TKYA 2HRFA 3CBUA 3D4TA 2VCWA 1WOUA 5D96A 2XC2A 4HZ4A 1J9BA 4TRXA 4BPYA 5D9VA 1A23A 2YZHA 1QMVA 1BAYA 1ILOA 1PL1A 4TR4A 4MMMA 3ZLPA 1WIKA 3GNJA 4ZB8A 4WEYA 2HXKA 4YH2A 1PMTA 1YEPA 2GGTA 3Q19A 3F0IA 3GA4A 2PWJA 1TU7A 3EC3A 3GIXA 3TJJA 1AQWA 2C0DA 4Q5RA 6GSUA 2VL2A 4OCFA 2GT5A 4ECJA 6GSTA 3BCIA 3CRTA 2KOKA 4J2FA 3LEFA 4I2TA 2P5QA 1O8XA 1V98A 5IM9A 4FYCA 4MF6A 3ZFLA 3KEBA 1J08A 4IW9A 3L0HA 2MZCA 2N5AA 3D0ZA 4GF0A 2TRXA 2L4QA 1M9BA 1XOAA 3VWXA 3FR9A 1XWGA 2I3YA 4MZWA 4EDYA 3PINA 3LYPA 1HQOA 1SJ6A 3US3A 3EMXA 1YZXA 2B1KA 2L5LA 2NPBA 2L59A 5AN1A 2H1GA 2R6KA 4ZIJA 5AISA 2OA7A 1WJKA 5GAND 4V2NA 4TW5A 4TR1B 3HDCA 1TRSA 3P8WA 2ON5A 3DIEA 1JLWA 4BWSA 5FWGA 3APQA 1K0MA 3D6IA 5CYYA 4MH3A 3TJFA 2Z9SA 4GQFA 3DRNA 16GSA 1VF1A 2GSTA 1QUWA 4QL9A 4TR1A 2YWNA 4NWYA 3IR4A 1R4WA 4V2MA 1X9SB 3FYGA 5CP1A 3TKSA 3TRXA 4ZILA 3BD2A 2HZFA 2IPAA 4ILFA 4I2UA 3ED3A 2LQQA 2JU5A 2YJHA 3EWLA 3FY7A 2YWIA 4K1FA 2R37A 2C3NA 3CSJA 4EKZA 4HU9A 3GHAA 2EC4A 1TRVA 4GRFA 2GLRA 2C0FA 5JWQB 1MDKA 2C8UA 3IAS2 3UVHA 3UJ1A 4F9ZA 1F6MC 4JR6A 5B8AA 3GFKA 3H93A 3A2XA 2F8FA 1XWAA 1ST9A 4JR4A 4XHMA 3AY8A 2FWGA 3TKPA 1KNGA 4PX1A 2RM6A 1I5GA 2WRTA 3PGTA 4IQ1A 2V32A 2AAWA 5LCZA 1EV4A 1ZGNA 1OE7A 2PU9C 3F3QA 3VK9A 1B4QA 2I9HA 3CYNA 4IGJA 4X1UA 1Z3EA 1FB6A 4RI6A 3C71A 1X5EA 2GSSA 4OO5A 4ZBBA 2FHEA 4FYUA 5HFIA 2H72A 4ISDA 3HCZA 3M9KA 4OFTA 3DMLA 4F0CA 1ZYEA 3ZMLA 4TVEA 3M3MA 1EOHA 2GZZA 3LYKA 6GSXA 3NIVA 3WT2A 4MF7A 5DJLA 1XXUA 4N10A 4JE1A 3QAWA 4IELA 3D21A 2VO4A 4LA1A 2VM1A 3GL5A 3KXOA 2DJ1A 1F37A 4ZXGA 6GSVA 2FWHA 3KMOA 3LG6A 2FCHA 5ECKB 4JBBA 4DEJA 2H19A 2AYTA 3IXRA 5IMVA 1T4ZA 1GSYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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