1XBSA

Crystal structure of human dim2: a dim1-like protein
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
137
structure length
137
Chain Sequence
b'MSFLLPKLTSKKEVDQAIKSTAEKVLVLRFGRDEDPVCLQLDDILSKTSSDLSKMAAIYLVDVDQTAVYTQYFDISYIPSTVFFFNGQHMKVDYGSPDHTKFVGSFKTKQDFIDLIEVIYRGAMRGKLIVQSPIDPK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Biochemical Characterization and Crystal Structure of a Dim1 Family Associated Protein: Dim2
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dim1-like protein
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription, cell cycle
total genus 40
structure length 137
sequence length 137
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-08-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02966 DIM1 Mitosis protein DIM1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1xbsA00
2MMOA 1M2DA 4F9ZA 2LKUA 2R3XA 5IMZA 1GUHA 1AQWA 3KXOA 3DMLA 2H70A 3FZ9A 3EMPA 2LQOA 1TRVA 5IMDA 4MP4A 3GX0A 3C1SA 3TUEA 2HI7A 1ZOFA 3F3QA 2H6ZA 3KM6A 3APSA 1U6TA 1TDIA 2H1AA 1EP7A 4ZBAA 5D73A 2GTUA 4QL9A 1F37A 1SKWB 1TK0B 4TXVA 4X0XA 4LLRA 3GKKA 1A2LA 2I81A 4EDZA 4AJ6A 2L4CA 5IPHA 4HU7A 2N5BA 1TI1A 3QAWA 3UAPA 3M9JA 1OE8A 3CTGA 4CHSA 3FY7A 3LWAA 3QAGA 4V1Ap 2MBSA 4BA7A 3HKRA 3CTFA 4HZ2A 5ECRB 5E59A 1Z9HA 4IBPA 4BL7A 2WDUA 1GP1A 1PKWA 4FH8A 1OC9B 3A3TA 2E2GA 3ME7A 3HY2A 2QGVA 2FWGA 3KJYA 1JZOA 1X5CA 1NHOA 4KAEA 1R5AA 1T00A 3RBTA 2B3SA 2MZCA 4HI7A 1KNGA 4TKYA 5DALB 1FO5A 2GZPA 1BAYA 2A4VA 1AUCA 1SU9A 5ID2A 2B7JA 4MF7A 1TOFA 2WS2A 2YN1A 2A2SA 4WR4A 2YJ7A 2DC5A 3TKRA 4ILFA 4XS6A 2I3YA 3WGDA 3GNJA 4I8BA 5H5RA 2CQ9A 1G6WA 3KH9A 1FVKA 4G10A 4EDYA 4PQIA 4I5QA 4NHWA 4KB3A 3RAZA 1X0RA 2DJ1A 1M9BA 1K3LA 2YP6A 4DSRA 1GNEA 3FR6A 1BJXA 2YZUA 1R5PA 2DMLA 2LJAA 3CRUA 5KN1A 1ERWA 4ML1A 2XBQA 1BYEA 5COHA 2GT6A 3LGCA 1SKSB 2YWIA 3VWVA 3O6TA 4XIHA 4GCIA 2CAIA 3UIWA 1OE7A 1TP9A 2V32A 4F0BA 2H75A 3UMAA 13GSA 1TU7A 4IQ1A 3UEMA 1XZOA 3C1RA 1MEKA 2O87A 3GL5A 3ERGA 1EEJA 4JE1A 2JSZA 3ZLPA 1PQNA 4MPFA 5KN3A 2J23A 3FZ4A 4F0CA 5FHIA 1ILOA 1GSQA 1GULA 2VCTA 2DIZA 5A4WA 4EF0A 2FNOA 2VL2A 1XW6A 3Q19A 4MCUA 3GIXA 3IV4A 1G6YA 2LJRA 2JADA 3C7MA 5IM9A 5G30A 5E4WA 1DSBA 1XWGA 1GWCA 2WZ9A 4NMUA 1SJZA 2L6CA 4TOPA 3F6FA 3MDKA 3GH6A 1BEDA 2H73A 4BWSA 6GSTA 4GQFA 2FWEA 5HR1A 1W4VA 3TGZA 3MWHA 18GSA 1XW5A 2HFDA 2C80A 1GSDA 3TJJA 3KZQA 1ST9A 4Q5QA 1R4WA 3VFIA 2AAWA 2B5XA 1QXHA 4FIWA 4O5RA 4N0VA 1EV4A 4JEDA 3IPZA 3H4KA 2H71A 3NOFA 3A2WA 2RLIA 2MMNA 1TI3A 2REMA 1PRXA 1TK8B 1YQ1A 3CRTA 1AC1A 1OVNA 6GSVA 4D73A 5KEJA 3TKSE 5AISA 1YZXA 3ZL5A 3D21A 1XOAA 2OKAA 5AGYA 3L9UA 3BJ5A 2CVBA 1THOA 3ZMKA 1G0TA 1SD8A 2HT9A 3WGXA 1SK2A 4QL7A 5EPFA 4K6XA 1J0FA 2HZFA 2MMZA 3TCOA 2RIIA 1B48A 3F3RA 1HQOA 1UVZA 2B1KA 3PR8A 4KDXA 1AXDA 2VCXA 5J9CA 4BWQA 1XW9A 5DQSA 4EE0A 3I69A 1NHYA 2LEGA 2GS3A 2N5AA 4MH2A 2IPAA 2B5YA 2HSHA 4TR3A 2JACA 1K0CA 3ZMLA 3KCMA 3HVVA 1PKZA 4KGIA 4BPYA 2VIMA 4XHMA 4ZL9A 5A5KA 3WGEA 2FGXA 5F06A 2YCDA 2AB6A 3EC3A 1SK0A 3PH9A 1GL8A 3GKNA 2KP2A 10GSA 4V2MA 3DRNA 5JWQB 2B6MA 2ES7A 3IOSA 1WE0A 3LXTA 2C8UA 3F9UA 4OO4A 2GSRA 3LORA 1FG4A 1N2AA 3GSTA 3TOTA 5G1LA 1HNAA 2IL3A 2X8HA 2IJYA 4PNGA 2C0GA 5FWGA 4LL4B 1PSQA 2QKEA 3GA4A 3ZTLA 3Q74A 4OFNA 5CO3A 1WIKA 5J4UA 2DBCA 1EOHA 1MDIA 2HLSA 2H76A 2VD1A 1O73A 1F9MA 5GSSA 1ON4A 2GSQA 4GSSA 4IS0A 1M7TA 3ZVJA 3TJKA 2FCHA 1WOUA 22GSA 4NPBA 4OD7A 1GTUA 3DGQA 3H93A 3VPQA 2D2ZA 4AJ7A 3APOA 4IP6A 4PURA 1T3BA 1IYHA 5DDLA 3PGTA 5ECPB 5J5NA 1G7EA 2GQKA 5EVOA 3SWLA 4HS1A 1X9SB 2AV4A 2C3TA 2VL3A 2RM6A 4E8EA 4RI6A 4NAXA 1YJ6A 3IA1A 1UN2A 3TRQA 1OKTA 1FW1A 2O7KA 3GN3A 1XVWA 3LEFA 2DSAA 1IYIA 1KEBA 1U3AA 1C72A 2MYGA 2JU5A 3IXRA 3GX8A 2YPMA 2CZ3A 2DJKA 5JWRB 5IMFA 11GSA 2VO4A 1O6JA 2GVPA 1R26A 1Q4JA 3UBLA 4MZCA 2EIRA 2LRCA 2OACA 1TRWA 3GRXA 1USBA 4PNFA 2TRCP 1UA5A 2ALBA 2IIYA 1PMTA 1EV9A 2IN3A 1PX6A 2I9HA 1TRUA 2G2QA 2H72A 1F6MC 1XVQA 4TR1A 2BTOT 5DAKB 3HVSA 3M3MA 2TRXA 5D96A 5EL8A 5HFIA 3FZAA 4Q5FA 5J3RA 2IMEA 5CRGA 2IFQB 4ZB6A 1ERVA 1SENA 3TDGA 4NV5A 3ERWA 3EYTA 2WGRA 1PL2A 3GFKA 2H8LA 2BJXA 2NBSA 2PWJA 1OAZA 4ML6A 1O7UA 4IGJA 3APQA 2FLSA 5C04A 4GLTA 2VLVA 2GSSA 3VWWA 1G7OA 1K0AA 1XWAA 2H01A 5IPGA 5DJMA 2VL2C 3D4TA 5D93A 1K0NA 2C3QA 3UARA 2H0GA 3FW2A 2PVQA 3VI5A 3M9KA 1EZKA 4NXIA 3DD3A 4GSNA 5GAND 2VLUA 1ZL9A 1GSSA 2H1DA 3KMNA 4MF6A 4MABA 3DVXA 3J7Yb 4I6XA 2VCZA 5EY6A 2DJ3A 2YJHA 6GSSA 4MF5A 2H0IA 4MK3A 3KP8A 4OFMA 1SJIA 5G1KA 4AGSA 3IR4A 4HJMA 5ENUA 5ECKB 1JZWA 1MDKA 1T8EB 2H6XA 4G9HA 1EEMA 5ECOB 3F63A 3GH9A 1WMJA 4G19A 1I9DA 1YY7A 4MDCA 1WRYA 1THXA 2YANA 1BQ7A 2PVOC 9GSSA 1AW9A 2VCWA 3O76A 4K7OA 3E3EA 1PD21 3EU3A 3C71A 4ZL8A 3VWUA 4KCAA 2YWNA 2LJKA 3VI7A 2M72A 4F2IA 4MJEA 3CSIA 3ZVJD 4EO3A 2EIQA 2FHEA 1M9AA 2NPBA 1VGLA 5ECNB 2L4QA 2F3MA 3ZIJA 2ON7A 6GSYA 2F51A 3E0UA 2HRNA 3NZNA 4K0GA 5A4VA 2E7PA 5ECSA 3R2QA 2GLRA 2K9FA 3N9JA 3G7IA 2ZCTA 2R6KA 2VLTA 2X64A 5G5FA 4PGTA 3F4RA 1AIUA 3FR9A 1LU4A 3FYGA 4EKZA 1A23A 3P2AA 2OE3A 4RUVA 3V1WA 3US3A 3VPTA 3F4TA 3CSHA 5D9TA 1U87A 2HE3A 4ULXA 1XWCA 5H5SA 2R2JA 4PX1A 4L5OA 5J9BA 3HDCA 2H19A 4NWYA 3EURA 1URMA 1HYUA 2C3NA 4ZB8A 3HHVA 2AUVA 5J41A 2IMDA 1MDJA 3F4SA 4HQSA 1ZYQB 1CQHA 1T4YA 3IHQA 3QDNA 4WEYA 4KA0A 1OC3A 2R5GA 3P90A 4ZXGA 3GV1A 1SD9A 3IAS2 4N30A 4HZ4A 3MNGA 3LFLA 3TOUA 3QCPA 2VCVA 1XBSA 1R7HA 2V6OA 1EGRA 2FY6A 2HNLA 4LMWA 2ZNMA 4O32A 5LCZA 3L78A 5ID2B 2VCQA 3D4MA 4WXTA 1A0RP 5IIZA 2X8CA 5AN1A 3TB2A 5JCWA 4N0ZA 3VLNA 4MJBA 2YV9A 3GHAA 4ECBA 3ZITA 1WWJA 1S3AA 2DJJA 5GSTA 3KIJA 5CRHA 2P0GA 3W8JA 3LG6A 2LS5A 4PUFC 4Z7XA 4TXOA 3ED3A 3FEUA 3LYPA 1FAAA 5DCGA 2PPTA 5B7CA 1ERUA 4HU9A 1GSYA 5C00A 5D8IA 1T4ZA 4KH7A 1Z3EA 4L0WA 3TJFA 4JU5A 1E6BA 2IWTA 1ZYEA 5HQPA 2K8VA 1SK1A 2R37A 4Q5RA 2LRNA 2GZZA 4IJIA 2E0QA 2VOCA 1B9YC 1V40A 4JR4A 5ABRA 2AJQB 1CQGA 4MH3A 4POBA 3UL3A 4HDEA 4GTUA 2GZYA 1EOGA 5JCGA 3LXZA 3CSJA 3HZ8A 3ZZXA 4CW9A 4KSOA 4CDOA 20GSA 4V2NA 3TKQA 5IO2A 1EGOA 3BCIA 2CVDA 2C0EA 3M8NA 3L0HA 4HUAA 3UOMA 4ZB9A 4YQVA 2OBKA 4XS4A 2PMTA 1FVJA 2LNSA 4POLA 4POMA 2RUEA 1RW1A 2GSTA 4RQXA 1HNCA 1O85A 1B8XA 1N8JA 1Z7RA 2VAFA 4HEA2 1F3AA 4K2DA 1A24A 1GTAA 3EINA 3IBHA 3M1GA 2CA8A 3IAM2 2F8AA 4IELA 1K3YA 1H4OA 1JFUA 4ZBDA 3DWVA 2PU9C 3EVIA 3A2XA 1OYJA 2G0FA 2HZEA 2JL4A 4TW5A 2C4JA 3FR3A 4D73B 2MMAA 3LQ7A 2EIOA 4K0NA 3LYKA 2KOKA 3HJMA 4EVMA 1SL1B 4F03A 1F3BA 2O89A 4WR5A 3GTUA 1SL0B 4K1FA 4TR4A 2PERA 1XWBA 4IP1A 4MA9A 5DJLA 2RUFA 1TTZA 4PUAA 1PL1A 4X43A 1VF3A 4O7HA 1M2AA 14GSA 2R4VA 2VM2A 5G31A 1EWXA 2P5RA 3W6GA 2CAQA 2PN8A 4IKHA 2F9SA 4DEJA 4GQCA 3TRXA 5KN0A 2XHFA 1Q98A 3UVHA 3JCML 6GSUA 2GQLA 1J9BA 4JZQA 1ZMAA 1ACVA 2V6KA 2MBTA 4V1Ag 2X99A 1A2MA 5CAXA 3Q18A 3EMXA 2GT5A 1DE2A 6GSXA 4KX4A 5ECMB 3FK8A 2KP1A 3ZYWA 2N5FA 4F82A 2H30A 2P31A 4NHZA 3D22A 4JRRA 5ECIB 4WBJA 1Z6MA 1U88A 3C8EA 1VF2A 3KH7A 4OWYA 1A2JA 4HOJA 1ZCPA 4IW9A 2HYXA 1QUWA 5HR2A 5B6NA 2H66A 3QAVA 5HR3A 5G5EA 5B6MA 2YOIA 5ECLB 3PINA 1A0FA 1PA3A 3A5WA 4KSMA 1SKRB 1V2AA 8GSSA 3IK7A 1OKDA 4IQAA 4IJ3A 1PX7A 4TRXA 1HNBA 1MD4A 2OE1A 4MLYA 1OC8A 3Q6OA 1NSWA 5IOXA 3MAKA 3HA9A 3O3TA 2CV4A 1VRSD 3TKSC 2YWOA 1SL2B 4WETA 3TRPA 2AYTA 2KHPA 4MJCA 2GQMA 1XXUA 1K0OA 1NM3A 2PGTA 1B4QA 4POKA 3J7Yk 3G9BA 3S9FA 4FYUA 1GH2A 5G2ZA 19GSA 4ZL7A 4IVFA 3QMXA 3TKPA 4K7IA 1O8WA 5IMAA 5F07A 4KW6A 1TU8A 1OC9A 2KUCA 3L9VA 4RQRA 2IMIA 5DCHA 1JZDA 1O81A 2VM1A 3U6VA 2A2RA 4ZILA 1S3DA 1GUMA 2LRTA 5DALA 2TIRA 1K0BA 5GZZB 1LBKA 2JZRA 2YZHA 1KTEA 2CZ2A 3DKSA 3CMIA 1XFLA 5LNKe 1WJKA 4YAPA 2NVLA 1X9MB 1HD2A 3D6IA 3H1NA 3LJRA 1XIYA 1M99A 4KE3A 4OFTA 4FYBA 2AHEA 3GYKA 3KD0A 3E9JB 1YKAA 3MSZA 4TR1B 3F6DA 1Z6NA 1FOVA 1K3OA 1AAZA 2DJ2A 1B4PA 3I6AA 1XOBA 1RQMA 3SBCA 4OMVA 4JBBA 3BD2A 3IDVA 4XRDA 2OADA 2YV7A 2WJUA 3HVXA 1VF1A 3DEXA 1GTIA 4EUYA 3QD9A 3EE2A 2VUPA 2I1UA 3UVTA 2H1GA 4J2FA 1GUKA 1V58A 4PQHA 1GRXA 2YNXA 4GSTA 2WB9A 2L5LA 2OBIA 3BCKA 1BG5A 4OO5A 2GGTA 1BX9A 4NV2A 5AIVA 1YEXA 1X9WB 3C73A 3I43A 4K7NA 1W89A 2M46A 1GSEA 3W8SA 1K0DA 5D9VA 1H75A 1QK8A 4OCFA 1U3IA 1M2BA 4XCSA 4LMVA 3G7YA 5L71A 2J9HA 2DIYA 2L6DA 3DXBA 1GNWA 4L5LA 3CXGA 4YAVA 3WD6A 1YEPA 3I9V2 2QC7A 3UJ1A 3ZREA 4BVXA 2H6YA 5HR0A 1J08A 5ELAA 1SYXA 1WP0A 1NW2A 1DUGA 1S3CA 3G7JA 4MPGA 5D9WA 2KLXA 1QGVA 3TKSA 1XPVA 4MZBA 2LUSA 4PQ1A 1ML6A 1QFNA 2NTOA 2EC4A 2OE0A 4TVEA 1K0MA 1ABAA 3FZ5A 5AIXA 5IMCA 5B8AA 1ZZYA 2H1BA 4BVYA 4WF4A 4I97A 5A4UA 1LJRA 1I5GA 1AQVA 1TK5B 1EP8A 4WBRD 2E2MA 2FWHA 2PUKC 3BBYA 2BMXA 2V41A 3TJGA 2HRFA 1XWKA 3KMOA 1M0UA 4ECCA 2P5QA 4YQUA 3OR5A 2XPDA 2HXKA 2B5EA 2IMFA 5IOWA 4PXOA 4GXZA 4XRAA 3HJPA 1YF0A 2LTKA 1TRSA 3KGKA 4KDUA 4RI7A 5DBQA 1ZGNA 5KN2A 2WRTA 4MJAA 1DE1A 2VD0A 1QMVA 2IMKA 3IK9A 3RHCA 3GUSA 2DJ0A 2NDOA 5JCUA 2L57A 3ZFBA 2FA4A 1MTCA 3GMFA 3ME8A 3HYPA 4WKWA 1X5DA 2K18A 3KTBA 4XTSA 3U5RE 2FD3A 4ID0A 4V2LA 17GSA 4EXJA 2PBJA 3L9SA 7GSSA 4G2EA 1GLQA 1YF1A 1Z5YE 4GF0A 2Z9SA 2QSIA 4LL1B 4Q5NA 2C0DA 3AY8A 2RM5A 2L59A 3IC4A 2I4AA 3H79A 4HJ2A 1F2EA 1MD3A 2DMMA 1Y6EA 2CVKA 4XS1A 4ZIJA 2LQQA 4OCEA 4DSSA 4L0UA 4WF5A 1KBNA 2C1YA 2YWMA 3GURA 3CBUA 4QQ7A 4X1UA 3EU4A 1JLWA 2JZTA 4N11A 5FT3A 1FB0A 3ISOA 3K8NA 3L4NA 1UC7A 3P7XA 3QR6A 5HFGA 3FKFA 3LSZA 5CP1A 4DVCA 5CNWA 4J57E 1ERTA 2LV3A 4KCEA 1E2YA 5F8BA 4FO5A 3VK9A 4K8MA 2WFCA 5DVBA 3UBKA 3VWXA 5CREA 4DSQA 2O85A 3D5JA 2FWFA 4GRFA 4TXOB 3QOUA 3P8WA 1O8XA 2FA8A 3BOAA 4TR0A 1JZRA 3QPMA 3TJBA 4K9ZA 2M80A 2F8FA 4MMMA 2H0HA 4IN0A 4YH2A 4YQMA 3HCZA 3NIVA 5CYYA 3HXSA 2LNTA 2V1MA 3WYWA 1FHEA 2HSYA 4ZBBA 2XPEA 3A2VA 2XC2A 2JSYA 6GSWA 1XCCA 3N5OA 1T7PB 3KP9A 5ECQB 5D9XA 3HZ4A 2V2GA 4DSSB 1V9WA 4I2TA 5JWOB 1TW9A 5ECHB 5F05A 1VF4A 3M0FA 5DAKA 4MZWA 1GSUA 4EL1A 1A8YA 3GSSA 5IMVA 1TJDA 4ECIA 1AQXA 3RDWA 2L5OA 4ISDA 1QQ2A 4H86A 3D0ZA 4AJ8A 3QFAC 4FYCA 4P3YB 4ACSA 2IFQA 1JHBA 4XS4B 3ZRDA 3DYRA 1WPIA 2OA7A 2K6VA 3QFBC 3F0IA 2CT6A 5F0GA 4LA1A 1V98A 1X5EA 5B8BA 2LSTA 3GKXA 5CRDA 3ZFLA 3ERFA 2DLXA 4EC0A 3H8QA 1YKCA 2O8VB 3DVWA 1JLVA 1DBYA 3HJOA 1SYRA 3IRAA 2WCIA 4JR6A 3FRCA 12GSA 2HZEB 3RPPA 5H5QA 3RPNA 3DIEA 1GSFA 4L8EA 4IHUA 3HD5A 4GWRA 2FUG2 1TXXA 1YDKA 3RHBA 5INYA 2B7KA 4E8HA 3GTUB 1TKDB 5CRWA 1V57A 2XBIA 3VURA 5HFKA 1Z7PA 5LD0A 2WULA 4HQZA 4AF2A 5ELGA 1PN9A 3WT1A 2C0FA 3GL3A 1Y25A 1PGTA 1SJ6A 4N10A 3WT2A 1GTBA 1GLPA 3GKMA 4O92A 1FB6A 3CYNA 4TN8A 4J56E 5DQYA 4KUNA 2H74A 3KEBA 3ZIVA 3IE3A 2X8GA 5IQYA 3EWLA 2GDRA 3KTLA 4ECJA 1RK4A 4I2UA 2ON5A 2CX4A 3FHKA 3F8UA 5GAPD 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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