1XBSA

Crystal structure of human dim2: a dim1-like protein
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
137
structure length
137
Chain Sequence
MSFLLPKLTSKKEVDQAIKSTAEKVLVLRFGRDEDPVCLQLDDILSKTSSDLSKMAAIYLVDVDQTAVYTQYFDISYIPSTVFFFNGQHMKVDYGSPDHTKFVGSFKTKQDFIDLIEVIYRGAMRGKLIVQSPIDPK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transcription, cell cycle
source organism Homo sapiens
publication title Biochemical Characterization and Crystal Structure of a Dim1 Family Associated Protein: Dim2
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dim1-like protein
total genus 40
structure length 137
sequence length 137
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-08-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02966 DIM1 Mitosis protein DIM1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1xbsA00
4OFMA 5B6NA 4N30A 2RM5A 3N9JA 1J9BA 3LWAA 2OE1A 4O5RA 1GH2A 3C71A 2HXKA 5DALA 4GTUA 2OE3A 4MJAA 2IMEA 4GWRA 5ECOB 3GX8A 1FW1A 1K0AA 1WJKA 1YQ1A 1B4PA 1GSSA 1XWCA 2F9SA 2LNTA 2YCDA 1KTEA 4KGIA 2FLSA 3QAVA 3KGKA 2FY6A 3PGTA 3HJPA 3DXBA 1LBKA 5A4VA 4K1FA 3QAGA 2FWHA 4ML6A 5D96A 3IRAA 3I6AA 2DJKA 4XCSA 1K0MA 4V2MA 3HCZA 2AV4A 3D5JA 3ZITA 2CAIA 4HQSA 3TGZA 1H4OA 2OBKA 3U6VA 3ZTLA 4WR4A 3ZIVA 5F8BA 3PR8A 1BAYA 5IMDA 3UOMA 4ID0A 2GZPA 3RPPA 4KA0A 3IHQA 1XVQA 4IS0A 20GSA 1V58A 1SL1B 3KM6A 3UBLA 4MLYA 5KN3A 1U87A 6GSXA 1OC3A 2IL3A 3F4SA 4HJ2A 4E8HA 2H8LA 3TKSA 4I8BA 3C7MA 2LJKA 2VL2C 3WGXA 4MJCA 3GV1A 2F8AA 4LLRA 4RI7A 5HFIA 4L0WA 4N0VA 2GSSA 4IJ3A 4JBBA 2GQKA 5CRHA 3FKFA 2OKAA 1VF4A 2NDOA 4KDUA 2A2RA 5B6MA 2CZ2A 2RIIA 3L9UA 1B48A 1V98A 4KCEA 4AF2A 3ED3A 2I4AA 4HQZA 1XWAA 3IAS2 2DMLA 4N11A 4DSSB 2G0FA 3ZL5A 3EMXA 4X0XA 3TJGA 4QL9A 4EE0A 1S3CA 3KXOA 5JCUA 1TK0B 2L5LA 1DBYA 3UVTA 2IN3A 2VL3A 4FYUA 5B7CA 2QC7A 2MMOA 2HZEB 2H1DA 3GRXA 5CREA 1G7OA 2VCTA 4O7HA 2E0QA 4XRAA 4JR4A 2D2ZA 4K7IA 6GSVA 1PL2A 3NZNA 5KN1A 2O7KA 3C1RA 4HJMA 3UBKA 2M46A 2EIQA 3HYPA 5CYYA 1GP1A 3IXRA 2DIYA 2KP1A 3GSTA 5D9WA 4IQ1A 1IYIA 3FRCA 4ECIA 2LS5A 2JADA 2JL4A 3KP8A 3CMIA 2HLSA 3HHVA 1XW6A 4GQFA 2C0GA 4GSNA 2H70A 1A2JA 1C72A 2N5BA 3VFIA 5JWQB 1AC1A 5HR3A 4AJ6A 3BJ5A 5ECIB 3FZ9A 3KIJA 4J56E 3D4MA 4XHMA 5IPHA 4HEA2 1RQMA 2C4JA 2JZTA 5EL8A 3A3TA 2ES7A 2O87A 2BTOT 4O32A 2IFQB 2QSIA 5FHIA 2NVLA 1Z5YE 1F3AA 4IKHA 2DMMA 2CZ3A 4OCFA 4HI7A 1LU4A 2DLXA 3ZLPA 3FEUA 2H30A 1YEPA 1GTBA 2N5FA 1MEKA 4YQUA 4BWQA 4KE3A 5J4UA 4IJIA 1FO5A 1WRYA 1XZOA 5HR0A 3HJOA 1Z7RA 1XOAA 5HFKA 1A2MA 1ML6A 4MMMA 4RUVA 4OCEA 2ALBA 4KAEA 4OFTA 4JZQA 4O92A 5F0GA 2PGTA 1TU8A 5ABRA 4KB3A 2QGVA 3GA4A 2H6YA 3TJBA 5C04A 2V1MA 3QDNA 2X99A 2F8FA 3P8WA 1TXXA 2B3SA 2J23A 1F37A 3TKPA 2LKUA 4G10A 1NSWA 4LA1A 1RW1A 3A2XA 2WFCA 5DJMA 4MF7A 2RUFA 1U3AA 3GL5A 4JRRA 4PQ1A 2AHEA 3LGCA 1YF0A 2PUKC 5IMFA 3ME8A 4WF4A 4TR1B 4HUAA 2FNOA 3MDKA 1M9BA 3VI5A 2L5OA 5DAKA 2GLRA 1URMA 4POBA 3TRXA 2VM1A 1S3DA 1DUGA 2F3MA 3MWHA 2B6MA 3HZ8A 3IAM2 3HVXA 4DEJA 4IBPA 3WGEA 1XWBA 1WIKA 1N8JA 1OC8A 5J5NA 3I43A 2FHEA 3GIXA 1S3AA 2VLUA 2R3XA 5G30A 1O8XA 3GTUA 2O89A 1JFUA 2ZCTA 2GVPA 3G7YA 1YEXA 2ZNMA 5IO0A 2IMIA 4F82A 1O81A 4G9HA 3K8NA 4X1UA 1ZZYA 3CTGA 4CW9A 4P3YB 1FOVA 3ZYWA 3CTFA 1QMVA 3GKNA 1X5CA 5ECHB 1AQVA 1W89A 1TRVA 3O3TA 5ECLB 4KCAA 2GSQA 1Y6EA 3G9BA 2R6KA 1ZMAA 1GSQA 1QGVA 1SJZA 1XOBA 1B4QA 3I69A 1F6MC 3CBUA 1K0BA 3QOUA 1BQ7A 3Q6OA 14GSA 2VLVA 3QCPA 2KUCA 3EMPA 1TRWA 2WJUA 4ZIJA 2C3NA 3US3A 1M7TA 1XIYA 3LSZA 2IMDA 1FB0A 3ERFA 3APSA 3ZFBA 2HRNA 2WULA 4MZCA 5HR1A 2HE3A 1TP9A 2AUVA 5DALB 1V2AA 2PBJA 1CQGA 4ZBDA 2FWEA 3TUEA 1TKDB 2RLIA 2MYGA 3ZZXA 1GLQA 2L59A 5AISA 4JE1A 2I1UA 3P90A 1A8YA 4QL7A 4MZBA 1LJRA 1QUWA 3ISOA 4K7OA 3ZREA 2V32A 5D73A 1OKTA 2DJJA 1FVKA 5G31A 2CA8A 2E2MA 2FA4A 1NM3A 5D9TA 2HFDA 1KBNA 2CVBA 4MA9A 1EOGA 1HNCA 4DSQA 3ZVJD 1B9XC 1R26A 5C00A 1XVWA 4KH7A 2FUG2 3TJJA 5DJLA 3VPQA 4LMVA 1SKRB 1PD21 1SYXA 1SL0B 4K8MA 1TU7A 1SK2A 4V2LA 4MABA 2K8SA 2MMNA 3IV4A 1X9MB 4BWSA 1XWGA 4XS6A 2XC2A 1EEMA 4GSSA 2YV7A 3D21A 4ZB8A 5DVBA 2LJAA 4MDCA 2VLTA 4PXOA 5DQYA 4IQAA 3GHAA 4TW5A 7GSSA 5FT3A 5IPGA 3CSIA 3KH9A 3KH7A 1B9YC 5DBQA 1FG4A 3GURA 2EIOA 4XS4A 4FO5A 4V1Ag 3NIVA 4F9ZA 2K9FA 1XW5A 2M72A 4TXVA 3KMOA 3VPTA 1WWJA 4EL1A 1SD8A 4F0BA 1FVJA 4OMVA 2HNLA 4NWYA 3F0IA 1WMJA 2DC5A 3HZ4A 5DQSA 3EWLA 4PNGA 3GH6A 5D9VA 1SD9A 3TDGA 5J9CA 2CVKA 3RDWA 1M2DA 1GRXA 1FB6A 5GSTA 4ZBBA 1EEJA 3LXTA 4AJ8A 1EGOA 4TXOA 2FA8A 4GRFA 5DDLA 1V57A 4GF0A 2VL9A 2KHPA 2A2SA 3Q74A 5H5QA 1I5GA 2GZYA 2B7KA 6GSTA 2N5AA 4H86A 4ZL9A 2HZFA 1X9SB 3RPNA 4RI6A 1ZL9A 2H0GA 3F6DA 5INYA 2C1YA 1XXUA 5CNWA 1AAZA 5DCGA 4IELA 1UN2A 2WCIA 2CX3A 4ZILA 4MF5A 5JCGA 4F03A 2E7PA 2B7JA 2K8VA 4NHWA 2YJ7A 4ZB6A 1PQNA 4EC0A 3M9JA 1VRSD 5ECRB 3TOTA 5J9BA 4L5LA 1AQXA 4MH3A 4L0UA 4HU9A 6GSWA 4PNFA 2P31A 2IPAA 5G5EA 2VD0A 1FAAA 3KCMA 3CXGA 1M99A 4EDYA 1TJDA 3FW2A 1KNGA 1PMTA 3IPZA 3LEFA 4J2FA 2V41A 4EXJA 2L4CA 3O76A 5D9XA 1JZOA 1IYHA 3CYNA 1XFLA 1F3BA 3W6GA 5KEJA 2I9HA 4TKYA 4ILFA 1VF2A 1Y25A 3D4TA 3C73A 4F2IA 1A8LA 3GSSA 1G6YA 4NV2A 3FZ4A 5GAND 2DJ1A 4Q5QA 1PSQA 3CSJA 2VCQA 3IE3A 4BVYA 1SK1A 3MNGA 2I3YA 2FWGA 2JSYA 4L5OA 2NBSA 2C3QA 3G7IA 4MH2A 1RK4A 1K0DA 1AQWA 1WE0A 4CDOA 2JZRA 3BD2A 2CV4A 2FCHA 2JZSA 3I9V2 1JLVA 1SJ6A 3D6IA 3HY2A 3M8NA 1O85A 2B5XA 3WYWA 4BVXA 3L9SA 3H79A 2DBCA 4IP1A 4EKZA 2L6DA 2GGTA 2PVOC 1GULA 3KJYA 1OC9B 4GXZA 1JZWA 3TRQA 2LSTA 1W4VA 4PGTA 1YDKA 3F63A 1PKWA 3JCML 3Q18A 5LD0A 3GN3A 1TK5B 4TR0A 1SJIA 5AIVA 2K18A 4K6XA 3PH9A 2YV9A 5DAKB 2H1BA 3F4TA 5CRWA 3DIEA 5A4UA 3IDVA 1GSDA 1BJXA 3KD0A 1PA3A 4EO3A 4IW9A 3WD6A 2LRTA 1BYEA 2H66A 1M0UA 2QKEA 3EYTA 5HFGA 5F07A 2IWTA 3GTUB 1OE8A 1N2AA 5CP1A 1EGRA 3WGDA 1FHEA 2G2QA 4PQIA 4TR3A 4GLTA 1GNWA 2VUPA 1QFNA 1JZDA 2YP6A 2V2GA 1TRUA 4KSOA 3ZMKA 4MJEA 1M2BA 1E2YA 3RBTA 1KEBA 5IIZA 2DJ2A 1PX7A 5EY6A 3OR5A 1GSYA 3BOAA 1WOUA 2PMTA 4NV5A 1EP8A 2KP2A 1Z6NA 4WR5A 3QMXA 3EINA 3U5RE 3HVSA 4NHZA 3H8QA 2REMA 3ZRDA 1OC9A 4GQCA 2VIMA 3A5WA 4YAVA 4XRDA 1PGTA 4KDXA 18GSA 1VF3A 3KEBA 2VM2A 5ENUA 2YOIA 1PKZA 2VOCA 4ECCA 3M9KA 2WS2A 1B8XA 2CX4A 19GSA 9GSSA 1ERWA 2DIZA 2L4QA 3PINA 3N5OA 3TKSE 5ECSA 5IMAA 4TOPA 3BCKA 4I97A 2AYTA 1GSUA 2LRCA 2C0FA 4MPFA 3WT1A 2YWIA 5B8BA 2E2GA 4KSMA 3FZ5A 3KMNA 3TOUA 2VCVA 1ZOFA 5A5KA 3QAWA 3D22A 3TCOA 3GL3A 1XWKA 3F9UA 3UVHA 1H75A 1DE1A 2RUEA 3L78A 5ELAA 4AJ7A 3VWXA 1BX9A 4J57E 1HQOA 1GTAA 2C0EA 1EP7A 4IHUA 2HI7A 4FH8A 2GSRA 3ERGA 4NXIA 1Q4JA 1GL8A 1XPVA 2HSHA 4EDZA 1EZKA 1O6JA 2LEGA 3EC3A 3TKRA 2C0DA 1HNAA 1GWCA 5AGYA 2OA7A 1JHBA 1DSBA 3QPMA 5ECNB 2ZUPA 5G1KA 1UA5A 2OE0A 3J7Yb 2H72A 5HR2A 5D8IA 3W8SA 1THOA 2H0IA 2LNSA 4MCUA 1A24A 2XPDA 3LJRA 3L0HA 2IMKA 1T8EB 1BG5A 3WT2A 3LXZA 4XS4B 1X0RA 6GSUA 3FHKA 1EV4A 3DVXA 1Z6MA 2PWJA 4F0CA 1K3LA 4WETA 2TRXA 2KOKA 4HU7A 3VWUA 5COHA 2X8GA 3GUSA 2LV3A 3LFLA 1T1VA 1PX6A 2H74A 3DMLA 5ECMB 1R5AA 3QD9A 4MP4A 2VD1A 3M3MA 3M0FA 3C1SA 2PVQA 4PQHA 3M1GA 2MBTA 4IGJA 4TRXA 3GMFA 1GSEA 4YH2A 3R2QA 4E8EA 4FYCA 3ME7A 4JU5A 4POLA 1R7HA 2HYXA 5H5RA 3ZFLA 1R4WA 4MJBA 2GQMA 1GUHA 4TXOB 1GLPA 2IJYA 1SKSB 3BCIA 8GSSA 3FR9A 2PPTA 2CVDA 5FWGA 1A0RP 3IOSA 4KUNA 4Z7XA 4NAXA 5IMCA 2P0GA 4X43A 5KN0A 2H01A 5KN2A 3A2VA 1R5PA 3QFBC 5ELGA 3SWLA 1O8WA 1GSFA 1ABAA 1AUCA 2HSYA 2AB6A 2XPEA 1JLWA 1JZRA 5JWRB 4WKWA 5GZZB 5JWOB 5AN1A 1NHOA 3EU4A 3FR6A 2LRNA 2BMXA 4ZBAA 2CAQA 4WBJA 4PUFC 2A4VA 4V2NA 2Z9SA 4K0GA 3FZAA 4OWYA 4IN0A 1U3IA 3SBCA 2GS3A 2H1AA 2H76A 4TVEA 3IC4A 2YNXA 3GKKA 4IVFA 5ECPB 5IOWA 1MTCA 2GT5A 3V1WA 2I81A 2JU5A 2GZZA 4FIWA 2YWMA 2GT6A 1K0OA 1U88A 4BA7A 2TIRA 3LORA 3DWVA 12GSA 1A0FA 2HRFA 3VK9A 4RQRA 5H5SA 6GSSA 2FD3A 5IMVA 4MPGA 5A4WA 3UEMA 4G2EA 2WDUA 2MZCA 3HDCA 1THXA 4AGSA 13GSA 4ULXA 2AAWA 2JACA 3F3QA 3F6FA 3AY8A 5EVOA 2X8HA 5G1LA 1Z9HA 5IM9A 1MD4A 3QR6A 4DSRA 4XTSA 2LJRA 2JSZA 3ZMLA 4HS1A 2NPBA 5DCHA 2F51A 4ECBA 2R4VA 1SENA 1VF1A 2MMAA 4K7NA 3UJ1A 4OD7A 3IR4A 2O85A 4POMA 3MSZA 3FR3A 2H73A 4N0ZA 2GTUA 4GSTA 2DSAA 2VCXA 4ECJA 1TI3A 2KLXA 4Q5RA 5ID2A 4LL1B 5ECQB 1TW9A 3DD3A 3KP9A 1EV9A 4BPYA 5F06A 2H19A 1UC7A 6GSYA 4FYBA 2EC4A 1X9WB 1AW9A 1MD3A 3GYKA 4LMWA 2XBIA 1G7EA 1I9DA 2TRCP 1T4YA 1WPIA 1TK8B 2V6KA 1J08A 1TTZA 4K0NA 3APQA 2GSTA 1K3OA 4PUAA 1ON4A 3GKXA 1X5EA 1SK0A 16GSA 3E3EA 3P7XA 5IMZA 2WZ9A 4RQXA 3EE2A 10GSA 1EWXA 4Q5NA 3UMAA 3D0ZA 4TR4A 1ERVA 4WF5A 1ACVA 2DJ0A 1SU9A 4EUYA 2VCWA 3A2WA 3CRUA 3G7JA 1MDIA 4N10A 2YJHA 2H75A 3KZQA 1A2LA 3TRPA 1SYRA 2MMZA 4HZ4A 4YQVA 3RAZA 4WXTA 2B1LA 3VLNA 1SKWB 1MDKA 4ML1A 2H6ZA 5GAPD 2EIRA 2WB9A 4EVMA 3FK8A 3IA1A 3Q19A 1Z3EA 2LUSA 2K6VA 1NW2A 3NOFA 1NHYA 4PX1A 3UL3A 2OBIA 3L4NA 3DEXA 1X5DA 5F05A 3RHCA 1AIUA 1T7PB 5ECKB 2OJLA 1XCCA 1DE2A 3MAKA 2R5GA 1Q98A 1M2AA 5GSSA 4G19A 2X64A 3HA9A 2WGRA 3UIWA 2NTOA 3UARA 3DGQA 2L57A 1GUKA 1PRXA 1HNBA 3S9FA 1U6TA 1YJ6A 4OO4A 5LCZA 3TJFA 1EOHA 2YPMA 4YAPA 2DJ3A 3KTBA 5IQYA 2AJQB 1YKCA 1K0NA 3EVIA 5J3RA 4I5QA 4OFNA 2C80A 5G5FA 4DSSA 4XS1A 3J7Yk 2H0HA 1QK8A 4L8EA 1T00A 2WRTA 3GKMA 1G0TA 4ZL7A 4BL7A 1QQ2A 4POKA 3C8EA 2B5YA 1OE7A 2P5RA 4XIHA 2OACA 2HZEA 1MDJA 3BBYA 1O73A 2YANA 1UVZA 1ZCPA 4IP6A 2P5QA 2HT9A 2GQLA 3HVVA 2H71A 1Z7PA 3DRNA 5J41A 2R37A 3CRTA 2VL2A 2YZUA 4NMUA 3VURA 3APOA 1HD2A 1XBSA 3DVWA 4WEYA 1OKDA 1YKAA 2V6OA 3FYGA 3GH9A 1ST9A 4ZB9A 1ZYEA 1YZXA 3DYRA 3VWVA 2CQ9A 1OYJA 2XHFA 2IMFA 4ZL8A 5CO3A 1G6WA 4KW6A 3P2AA 2VO4A 1GTIA 3IK7A 4JEDA 2VCZA 5LNKe 5CAXA 2ON5A 5CRDA 4I2TA 1PN9A 17GSA 5B8AA 3H4KA 4YQMA 5JCWA 5IOXA 4KX4A 3GNJA 1ILOA 2PU9C 3LG6A 1ZYQB 3ZVJA 3LQ7A 4QQ7A 3HXSA 1K3YA 4HDEA 2LQOA 5L71A 1WP0A 3IK9A 2IFQA 3RHBA 22GSA 3QFAC 4NPBA 3TKQA 2B1KA 2VAFA 3HJMA 2OADA 4MF6A 3ZIJA 1V40A 2GDRA 5E59A 2ON7A 1K0CA 3E9JB 2J9HA 3F8UA 3H1NA 1GTUA 3F4RA 5EPFA 4D73B 4HZ2A 4V1Ap 2FGXA 2O8VB 2PN8A 2LQQA 1YY7A 5CRGA 2YWOA 4TN8A 4ZXGA 1F2EA 1ERUA 3EU3A 1VGLA 3F3RA 3VWWA 2H1GA 3HD5A 1E6BA 2BJXA 2H6XA 2CT6A 1TRSA 4DVCA 2PERA 1PL1A 3LYKA 5HQPA 1TOFA 3L9VA 4I2UA 1T4ZA 1HYUA 3EURA 4K2DA 1USBA 2YWNA 2B5EA 1ERTA 2YN1A 5IO2A 4KNDA 3TKSC 3LYPA 4MK3A 1XW9A 4JR6A 1J0FA 1OVNA 2C8UA 4TR1A 2C3TA 4K9ZA 5D93A 2M80A 1SL2B 4ISDA 4HOJA 1GNEA 3HKRA 1T3BA 3O6TA 3VI7A 4ACSA 1BEDA 1O7UA 4MZWA 3IBHA 3TJKA 2LTKA 1A23A 2MBSA 3FY7A 4Q5FA 3KTLA 4I6XA 4EF0A 3CSHA 1OAZA 2YZHA 2L6CA 5E4WA 4CHSA 2IIYA 11GSA 4WBRD 1ZGNA 1M9AA 1F9MA 3ERWA 3DKSA 4OO5A 1GUMA 1CQHA 3GFKA 4D73A 3UAPA 2XBQA 2RM6A 1QXHA 3GX0A 4LL4B 4PURA 1V9WA 4GCIA 4KDYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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