3UVTA

Crystal structure of the third catalytic domain of erp46
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
107
structure length
106
Chain Sequence
b'STVLALTENNFDDTIAEGITFIKFYAPWCGHCKTLAPTWEELSKKEFPGAGVKIAEVDCTAERNICSKYSVRGYPTLLLFRGGKKVSEHSGGRDLDSLHRFVLSQA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the third catalytic domain of the protein disulfide isomerase ERp46.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin domain-containing protein 5
source organism Homo sapiens
molecule tags Isomerase
total genus 33
structure length 106
sequence length 107
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2011-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3uvtA00
4NV5A 2CV4A 3GH9A 5GSSA 2ES7A 3HD5A 2CVKA 5B7CA 1JHBA 5D9TA 5DCGA 2MYGA 2PWJA 5IMAA 2AHEA 1A2JA 4AGSA 5J9BA 3WD6A 1QFNA 6GSUA 5LCZA 4GWRA 3IBHA 5G5FA 4POBA 2ZNMA 4K8MA 2ON7A 1OC8A 1MDIA 1XPVA 1A24A 1VF4A 2JL4A 3VK9A 1LBKA 2LQOA 3EMXA 2LJKA 4K9ZA 2YJHA 1B4QA 4K6XA 3A2VA 4NWYA 5JWOB 4K2DA 2IMDA 1K3LA 2G2QA 1BAYA 2G0FA 1V98A 4IGJA 1O6JA 1DBYA 1TRUA 1T4ZA 3GX8A 1GUMA 2E2GA 1GSUA 3LWAA 2YV9A 2B5EA 3DYRA 2WFCA 4GLTA 1K0BA 5ECLB 1F3BA 2DJ1A 4GSSA 3HZ4A 2CAQA 1XWKA 1OC9A 4POLA 2BTOT 5COHA 1O7UA 2M72A 4F03A 2GSQA 1X5CA 1BG5A 3PH9A 2VCQA 3ZVJD 2DIYA 2WGRA 4MH2A 4MDCA 4KX4A 2C0DA 2OACA 4L5OA 4EF0A 3IAS2 3H1NA 4KGIA 5DQYA 1TP9A 3GKNA 1KTEA 4I6XA 5B6NA 4EVMA 2QSIA 2DIZA 2CZ3A 5G2ZA 4GTUA 2XPEA 1K0MA 3APOA 3TRQA 3GV1A 2L4CA 2VOCA 1OC9B 1ZCPA 5G5EA 4G2EA 1ILOA 1X5EA 3KD0A 3QAVA 1GTIA 3RPPA 3NZNA 2F8AA 3QFAC 1VF2A 1R4WA 5ECQB 2L6DA 4WXTA 4XRDA 2YNXA 1YY7A 2FWHA 4V1Ap 2AUVA 4NMUA 4IP1A 4F9ZA 3QR6A 2HRFA 3DGQA 5IPGA 2O8VB 2B3SA 4JR6A 10GSA 3TRPA 1F37A 1AQWA 2O89A 4OD7A 2YWNA 4BWQA 1XFLA 5HR2A 4HZ4A 5AGYA 1XXUA 5B8AA 4TR1A 3L4NA 2L4QA 1UA5A 4LL1B 1B48A 1GWCA 5ECHB 4IHUA 1EV4A 1QK8A 3J7Yb 2H75A 2GSSA 4MJEA 3LGCA 4OFMA 1AQXA 1VF1A 4TW5A 2ALBA 4WR5A 2DSAA 3U6VA 3ZREA 3F6FA 1H75A 1E2YA 2HZEA 4KA0A 3ERGA 2X99A 1SKWB 1A8LA 2GQKA 2VO4A 2MBSA 17GSA 2LRTA 2CT6A 3LG6A 1A0FA 3M0FA 2XPDA 2BMXA 4JBBA 1OAZA 2JU5A 4TN8A 3D22A 3LYPA 2WDUA 3FR3A 4TR1B 4WBJA 3KP9A 1Q4JA 13GSA 1OKTA 2HRNA 1FOVA 4ZL8A 1ERWA 2E7PA 1VGLA 5J3RA 4YQUA 2X8HA 2I1UA 5ECIB 4FYBA 4K7OA 1F9MA 1EOGA 1USBA 2ZUPA 3C1RA 2H0GA 4EO3A 3QDNA 1T00A 2PUKC 3QPMA 3TKQA 1OYJA 2HZEB 1SYRA 4TR0A 1GSQA 2B5XA 2GT6A 1EV9A 3LFLA 5FHIA 4XS6A 2V2GA 1O73A 2DJ0A 4MABA 2DBCA 3UBLA 1ABAA 4FH8A 4KH7A 2H8LA 2V41A 3HCZA 4K0NA 4KCAA 2CZ2A 3A5WA 1THXA 2D2ZA 4JEDA 2A4VA 3G7JA 1AAZA 1ERVA 1K3OA 4K7IA 2C4JA 3UOMA 3E3EA 19GSA 4TR4A 5EY6A 4J57E 4HQSA 5HFKA 4KUNA 1S3AA 3KIJA 5C00A 2CVBA 2DJ2A 2AV4A 1NM3A 2Z9SA 4MK3A 2LNTA 3M9JA 1ON4A 1F2EA 3W8JA 3FR6A 4MF6A 3RAZA 3HJOA 1GTAA 2H01A 4IELA 6GSXA 1Q98A 1WIKA 2DC5A 3IHQA 3QAWA 2GS3A 1ZL9A 1GUKA 4BWSA 1GSDA 1SJZA 3GRXA 5F0GA 2YPMA 3TUEA 1BQ7A 3DXBA 1ST9A 3IOSA 2HI7A 1N8JA 1XWBA 3KH7A 3UIWA 3UBKA 1XW6A 4IJ3A 4RUVA 1BX9A 2LUSA 3HVSA 1MTCA 1SL1B 1Z6MA 5F05A 1TRVA 3APSA 2H6YA 4FIWA 4RI7A 3EVIA 2L5LA 2H76A 2LSTA 1EP8A 2C3NA 1FG4A 3ZIJA 4RI6A 3M3MA 1B8XA 1JZRA 3KM6A 1SD9A 3IDVA 4DSRA 5E4WA 1QGVA 1JFUA 2VLTA 2B7KA 1K0DA 3TCOA 3MSZA 5DDLA 4I2TA 2B6MA 4O5RA 1TK8B 4XS1A 1J9BA 3QMXA 1MDKA 2WJUA 1S3CA 3WGXA 1WWJA 2VL9A 3D4TA 4HUAA 3ZMLA 1T4YA 5JWRB 3DWVA 5IOWA 3SWLA 1GUHA 1YF0A 1GTBA 2OE3A 2VL2C 1PL2A 3LJRA 5KN2A 1YZXA 3BD2A 4MPFA 1FVKA 3TKSC 4L8EA 4N0ZA 1GSEA 2IMIA 4POKA 2WCIA 3EE2A 2AAWA 2C3TA 5JCGA 3FYGA 4IVFA 2CX3A 1UVZA 1W4VA 3VI5A 4GCIA 2AYTA 1AQVA 3EYTA 3VWUA 4ECBA 3P2AA 2OADA 4ZBAA 2C1YA 3FW2A 3M9KA 2I81A 4N30A 5A4UA 2YN1A 2F51A 3D0ZA 4KW6A 1GLQA 5CRGA 5DBQA 3GA4A 2KOKA 4GRFA 3QCPA 5FT3A 2VUPA 3KZQA 1X5DA 2TRCP 5DVBA 1W89A 2HNLA 5J5NA 1B9YC 2H70A 4IQAA 4OO5A 2FLSA 3HZ8A 2R6KA 2JADA 1AXDA 3R2QA 1PD21 2MMZA 2HXKA 2M46A 1PKZA 1CQGA 4J2FA 2R2JA 4PNFA 4TR3A 4PQ1A 2PBJA 5EL8A 2J9HA 1A0RP 5E59A 7GSSA 1B9XC 2K8VA 2YJ7A 1E6BA 1AIUA 5EPFA 3VPTA 3Q74A 4MJBA 4ZBBA 1ZMAA 1YJ6A 1Z6NA 5J9CA 3DEXA 4EDYA 1U87A 4HOJA 3VLNA 1NSWA 4PQHA 2XC2A 2A2SA 4OCEA 3GSTA 1GP1A 3DMLA 4HQZA 5IPHA 2JZRA 2MMAA 4AJ8A 1GL8A 3IAM2 3G9BA 3L9UA 2K9FA 2H73A 3H4KA 1FB6A 3UJ1A 3RHCA 3EU3A 2PERA 4TKYA 2K8SA 5FWGA 2DJJA 4Q5FA 4CHSA 3N9JA 1K0CA 1XW9A 1SK0A 2QGVA 3CRUA 1ACVA 4JR4A 3MAKA 3HVVA 3DKSA 2FY6A 1TKDB 4LMVA 2K18A 2V6KA 2TRXA 2RUEA 5HQPA 3IRAA 1K3YA 3TJJA 4AJ6A 3F6DA 3WT2A 5A4VA 2M80A 3IK7A 1WJKA 1G7EA 4ISDA 3IR4A 3GKKA 4TOPA 2CX4A 3CMIA 3DD3A 4MZWA 3TJBA 3CTGA 3KMOA 4TRXA 6GSVA 3KH9A 1BEDA 3BBYA 2H1BA 1SK2A 4I2UA 1EOHA 2LJAA 2J23A 3O3TA 5G31A 2H1AA 4RQRA 4ML6A 1PRXA 2RM6A 2CQ9A 3KTBA 2FD3A 5EVOA 5CNWA 5DALA 3KXOA 5IIZA 1C72A 5JCWA 1TRSA 3RHBA 4IW9A 5D93A 2H6XA 4NHZA 3VWXA 1XCCA 4ZILA 2GDRA 5AIVA 5GAND 1LU4A 3HVXA 4LLRA 2H74A 2PMTA 3F4SA 4LA1A 2C0FA 1G6YA 1TRWA 1GSFA 2P5QA 2NBSA 1M2AA 5KN3A 5KN1A 1OKDA 2EIOA 4EL1A 2I3YA 3GX0A 4CW9A 3D4MA 2MMNA 2AJQB 4XRAA 5INYA 2OE1A 4EUYA 5DALB 3HXSA 5DCHA 4ECCA 1RQMA 1JLWA 3MNGA 1MD4A 2YWIA 5G1KA 2CVDA 5IMDA 3KJYA 2YCDA 2KHPA 14GSA 1PKWA 5ABRA 3M1GA 1SD8A 4GSTA 3BCIA 3CBUA 3SBCA 3EU4A 4MPGA 5ECOB 4ECIA 4IKHA 2HZFA 4ML1A 2RM5A 4KAEA 3IV4A 3TJGA 4ZB6A 1TU7A 3HA9A 4G9HA 4KDYA 3C1SA 4GF0A 1R26A 4KE3A 2E0QA 3BCKA 3GHAA 3M8NA 4Q5NA 3EWLA 5ECPB 18GSA 2YV7A 3PINA 2EIQA 1Z7PA 3V1WA 1HNAA 2VLUA 4ZL7A 3ZVJA 2QC7A 11GSA 4PUFC 2BJXA 2IFQA 2HSYA 3IC4A 4BVYA 1CQHA 3LSZA 2OBIA 3NOFA 2VL2A 3W8SA 3C71A 3GURA 3GKMA 2PPTA 3TKSA 2JSYA 1OVNA 2TIRA 2F8FA 2XBQA 3P90A 2PU9C 3QAGA 2O87A 4ILFA 1Y6EA 3F9UA 4D73A 2VD1A 3ZIVA 2JSZA 2IMEA 4MMMA 2X64A 5DJLA 1TXXA 3GKXA 3ISOA 1MD3A 3GH6A 4I97A 1FAAA 3F63A 3RPNA 3GSSA 2VCXA 4L5LA 2GSTA 2IFQB 3FHKA 2FWEA 2YOIA 3EURA 4MZBA 1Z3EA 5KN0A 9GSSA 1SJ6A 5GSTA 1TW9A 4V2LA 3TGZA 1FO5A 3ME7A 3QFBC 3L9SA 3HJPA 1I5GA 5D96A 3KGKA 3GFKA 4N10A 3CRTA 2JZSA 1QXHA 1TU8A 3H93A 4D73B 1K0AA 3UEMA 3G7YA 4YAPA 1YF1A 3LQ7A 3KCMA 2EC4A 2IIYA 2RIIA 5IMCA 1XVWA 5IMFA 1XBSA 2NDOA 3RBTA 4ZIJA 3F3RA 4Q5RA 4HEA2 3C7MA 4WEYA 4G10A 2DJ3A 4YQVA 2NVLA 2F9SA 3TRXA 2C8UA 2FCHA 2IJYA 1UN2A 1VRSD 2QKEA 2DJKA 1LJRA 1M2DA 2R5GA 4F0BA 1XWGA 4XHMA 1TDIA 3JCML 4IN0A 4V1Ag 2YP6A 3TKRA 2GQLA 4MA9A 1RW1A 1QUWA 5CRHA 1KNGA 1XW5A 8GSSA 4K7NA 3GTUA 1V2AA 4DSSA 1A23A 5F07A 3GL3A 1R5PA 2DLXA 4ZXGA 2V1MA 3CYNA 4QL9A 2RUFA 3GUSA 1X0RA 3ME8A 2CAIA 3TDGA 3ZTLA 1HYUA 3LORA 1X9MB 3RDWA 3QOUA 2H72A 3BJ5A 2B7JA 3MWHA 2L6CA 1ZYQB 4WKWA 5ENUA 3F4TA 4HDEA 2IMKA 3A2XA 2HYXA 3H79A 3I6AA 4HU7A 22GSA 5KEJA 4N0VA 5L71A 5C04A 5G1LA 1JZDA 3GTUB 3HHVA 4NV2A 4MZCA 2YZUA 4MF7A 2REMA 3ZL5A 4DSSB 1KEBA 4NPBA 2HE3A 1M9BA 1WRYA 5ELAA 4PQIA 4PX1A 3GMFA 1ZOFA 1TTZA 1M9AA 4IS0A 1PA3A 3C73A 3J7Yk 5IM9A 4QQ7A 3ED3A 3LXTA 5CRDA 3P7XA 1O85A 1ZZYA 4MCUA 1J0FA 5AN1A 5JCUA 4POMA 1IYHA 2H19A 3LXZA 1GSSA 3FK8A 2AB6A 1I9DA 3GN3A 4KDUA 2FA8A 3CSJA 4LL4B 2B1KA 1YQ1A 2FWGA 2H0IA 4EC0A 1FVJA 1M2BA 4OCFA 1O8WA 5ECRB 2R4VA 4I8BA 2PVOC 4EE0A 5IO2A 4MH3A 4K1FA 1ZYEA 1XVQA 5CO3A 1ERTA 5J41A 4MJAA 1ERUA 4KCEA 4Z7XA 4ID0A 3ZRDA 5CAXA 3GL5A 1S3DA 1WOUA 1Z5YE 5ECNB 4KSMA 1V9WA 2V32A 3QD9A 5DJMA 5HFIA 1M7TA 4JRRA 2FGXA 3CSHA 3DVXA 1AUCA 2GZYA 4JE1A 5ECKB 2R3XA 2H30A 5AISA 1EGOA 1SKRB 2WB9A 1X9SB 4PGTA 2GSRA 3HYPA 1GRXA 2NPBA 3W6GA 12GSA 1DE1A 5B6MA 3NIVA 1AC1A 4GQCA 1BYEA 5HFGA 4JZQA 4ULXA 1PX7A 3L78A 4FYUA 2WZ9A 1FB0A 1SYXA 4ACSA 2LJRA 3OR5A 4MLYA 3ZFBA 1YKAA 1PGTA 2VL3A 2OKAA 3KTLA 3ZLPA 2VIMA 5ECSA 2VM1A 3FEUA 5IMVA 4X1UA 4HS1A 1R7HA 2KLXA 4IQ1A 2XBIA 4ECJA 1YKCA 2VLVA 3VPQA 3KP8A 2VCTA 3S9FA 4H86A 5D8IA 5G30A 4XCSA 2VD0A 3DIEA 4E8EA 2C0GA 2WS2A 3F3QA 2ON5A 2CA8A 3TJKA 1TI1A 1SKSB 2FUG2 3ZYWA 2H1DA 4ZBDA 1UC7A 4J56E 2OA7A 2GT5A 3HDCA 2IMFA 4WF4A 2H6ZA 4DSQA 1PMTA 3TKSE 3UMAA 5IOXA 4MP4A 4GQFA 2IWTA 2L59A 2ZCTA 1X9WB 1SENA 1NHYA 5CREA 3TOUA 3UARA 4OFTA 2P31A 4E8HA 3ZFLA 1N2AA 2JZTA 2N5BA 5H5SA 4NHWA 2LEGA 1OE8A 1EWXA 4O7HA 2VAFA 4AF2A 1XWAA 1JLVA 5J4UA 4OO4A 4F0CA 5H5RA 3EC3A 3DRNA 1EEMA 2NTOA 3N5OA 3A2WA 3IXRA 3D6IA 3F8UA 20GSA 1TK5B 4IJIA 1DE2A 3FZ4A 4KB3A 3UVTA 2H0HA 3UL3A 4WR4A 5D73A 2PGTA 1GLPA 3US3A 3PGTA 1SL0B 4XS4A 1SU9A 1TI3A 2VCZA 1A8YA 1G6WA 2HT9A 1K0OA 2YZHA 2LRNA 3VFIA 3I69A 2VCWA 1JZWA 6GSSA 2C80A 2O85A 4G19A 1U6TA 1YEXA 1EZKA 4YH2A 3E9JB 4QL7A 3F0IA 16GSA 4WF5A 2FNOA 5A5KA 3Q6OA 3U5RE 3ERWA 2KP2A 2P5RA 4GXZA 2WRTA 2HFDA 5HR0A 4GSNA 4V2MA 2DMLA 1QQ2A 1VF3A 2GQMA 1V57A 2XHFA 1XWCA 3KEBA 5JWQB 4HU9A 1OC3A 2N5AA 4XS4B 3G7IA 2EIRA 4AJ7A 2H66A 1GSYA 1OE7A 5D9WA 1PL1A 1PX6A 3VURA 2KUCA 3VWVA 1F6MC 1HNCA 1FW1A 1HNBA 1AW9A 1V40A 2PVQA 3HJMA 3Q18A 5H5QA 3AY8A 4X0XA 1TJDA 4HJMA 3FKFA 3ZMKA 4OMVA 3LEFA 5ID2A 4Q5QA 1O8XA 1WPIA 3MDKA 1T1VA 4KNDA 3FZAA 1Z7RA 2LKUA 4F82A 4WBRD 3WYWA 1EGRA 2L57A 3F4RA 5F06A 5IQYA 5IMZA 4FO5A 1O81A 3VWWA 2FHEA 3L9VA 2OE0A 1XZOA 1NW2A 4EDZA 2V6OA 2B1LA 1M0UA 3D21A 4NXIA 1JZOA 3ZZXA 4BA7A 3FRCA 4TVEA 1Z9HA 1V58A 1F3AA 1RK4A 3WGEA 3PR8A 4PXOA 5IO0A 2GLRA 1KBNA 1PSQA 4IP6A 1ZGNA 4F2IA 2R37A 1XIYA 5ID2B 1M99A 2GVPA 1PN9A 3E0UA 3I43A 4RQXA 3FZ5A 5DQSA 4IBPA 3WT1A 3L0HA 4HJ2A 2F3MA 4WETA 1GNWA 1U88A 1GULA 2HLSA 4I5QA 4YAVA 1YDKA 2LNSA 1GH2A 2VCVA 1TOFA 3GIXA 1T8EB 5LD0A 3A3TA 2YWMA 3GYKA 1GNEA 1B4PA 2OBKA 1NHOA 1EP7A 5F8BA 5HR1A 2IL3A 4V2NA 4DVCA 4O92A 3I9V2 2IPAA 1ML6A 4X43A 4N11A 4DEJA 2I4AA 4EXJA 1T3BA 2L5OA 2GTUA 4BL7A 2H1GA 4NAXA 2MMOA 1G0TA 6GSTA 3H8QA 2DMMA 4TXOA 1GTUA 4ZB8A 2FWFA 1SK1A 1QMVA 4L0UA 2PN8A 1Y25A 2LS5A 5DAKA 2P0GA 2C3QA 4OWYA 5HR3A 4XIHA 2LQQA 4L0WA 1XOAA 1J08A 3O76A 2B5YA 4PURA 2HSHA 4JU5A 1A2LA 4HZ2A 4O32A 3GNJA 1HD2A 1WMJA 3VI7A 3DVWA 1FHEA 1EEJA 3ERFA 4OFNA 4TXOB 1A2MA 2YWOA 1WP0A 5D9VA 2GZZA 3FR9A 5DAKB 5A4WA 3CXGA 1R5AA 3Q19A 4K0GA 5AIXA 1PQNA 4LMWA 2LV3A 4XTSA 3EMPA 1THOA 3IK9A 3BOAA 4EKZA 1HQOA 4PUAA 2LTKA 2H71A 4HI7A 3WGDA 3UVHA 3FY7A 2C0EA 1DSBA 2YANA 1URMA 1H4OA 5CYYA 1K0NA 3APQA 5LNKe 1U3IA 3UAPA 4PNGA 3FZ9A 1BJXA 1SJIA 6GSYA 4BVXA 2X8CA 4KSOA 1YEPA 4YQMA 2X8GA 3TB2A 1U3AA 5GAPD 4CDOA 4MF5A 1DUGA 3TKPA 5CRWA 5ECMB 2FA4A 3EINA 1IYIA 5CP1A 3P8WA 4ZB9A 3D5JA 1TK0B 5B8BA 2K6VA 4MJCA 3C8EA 3O6TA 2MBTA 2WULA 1XOBA 2A2RA 2KP1A 4P3YB 1WE0A 2VM2A 6GSWA 2IN3A 2N5FA 1T7PB 1MDJA 4TXVA 4ZL9A 2LRCA 2MZCA 2O7KA 3IA1A 4KDXA 3TOTA 3ZITA 3CSIA 1G7OA 5GZZB 3HKRA 3KMNA 2GZPA 3HY2A 5D9XA 3IPZA 5ELGA 2OJLA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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