3UVTA

Crystal structure of the third catalytic domain of erp46
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
107
structure length
106
Chain Sequence
STVLALTENNFDDTIAEGITFIKFYAPWCGHCKTLAPTWEELSKKEFPGAGVKIAEVDCTAERNICSKYSVRGYPTLLLFRGGKKVSEHSGGRDLDSLHRFVLSQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Isomerase
source organism Homo sapiens
publication title Structure of the third catalytic domain of the protein disulfide isomerase ERp46.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin domain-containing protein 5
total genus 33
structure length 106
sequence length 107
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2011-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3uvtA00
4KNDA 3IR4A 3MDKA 4KAEA 1K3LA 3VWXA 2FCHA 5FHIA 2ZCTA 5KN1A 3GYKA 3TOTA 3TCOA 1A8LA 1GUMA 3Q6OA 3G7YA 2H74A 5IQYA 1J08A 2QGVA 2FWHA 2RUFA 2X8CA 4PGTA 4JR6A 2J23A 1GLPA 1GNEA 5G30A 1GTAA 4Q5FA 2LV3A 3IE3A 4EC0A 2WZ9A 3UVHA 4LL4B 1PKWA 3F4RA 4GQFA 5A4VA 5IOWA 3F3RA 1ZGNA 2M72A 2AUVA 5IO0A 3ZREA 4ML6A 3VWWA 1TTZA 4ILFA 4MH2A 2E0QA 3F9UA 1KTEA 3QR6A 4WR5A 3UVTA 3P2AA 2DIZA 2YV7A 2VM1A 1V98A 3HD5A 1UC7A 7GSSA 17GSA 2V6KA 1SYXA 5JCWA 1Z3EA 4ECCA 1XWGA 4AGSA 3L78A 2L59A 3GURA 3Q19A 3ME8A 2F8FA 2B5EA 2M80A 3LYPA 1VF4A 2O7KA 2TIRA 5J4UA 5KN0A 3DEXA 1I5GA 5EL8A 3ZMLA 1SKSB 4AF2A 4PUAA 4K7IA 2V2GA 3HJOA 1IYIA 1GNWA 1PL2A 4TR1B 3A5WA 5IMVA 4K7NA 4WBJA 2AYTA 5J9CA 5FT3A 3C1RA 1WIKA 4ISDA 3TKQA 1XW9A 1TI1A 5KEJA 2AAWA 4WEYA 4MMMA 2B5XA 3IXRA 3ZRDA 1USBA 2ON5A 4YQUA 2CZ3A 3NOFA 1F3AA 1K0BA 2NBSA 1LU4A 3G7JA 2G2QA 4ZIJA 4QQ7A 1OC9B 5F0GA 1FO5A 1WRYA 3FW2A 4BL7A 5B8AA 5GAND 1FB0A 1EP7A 1HD2A 2LKUA 2FHEA 1TW9A 4PNFA 3VI5A 5B6NA 20GSA 1O85A 1RK4A 2QC7A 5HFIA 5CREA 1FB6A 2H8LA 4O32A 4BPYA 4LA1A 5HQPA 1DE2A 2H1GA 1GTBA 2I81A 5DDLA 2MMAA 3M9JA 1T4ZA 4HU9A 4MF6A 1B4PA 1CQHA 1Z6MA 5IOXA 5ECOB 1PD21 4ECBA 3K8NA 1NSWA 2L4CA 2OE0A 5GAPD 1OYJA 3SWLA 2OBIA 4KCEA 4DSRA 2IJYA 1K0MA 3ED3A 2H1BA 3L9SA 1BG5A 5DQSA 4WF4A 4LL1B 4KE3A 2H19A 4E8HA 1MD3A 4HZ4A 2X99A 3KCMA 2IN3A 3DVXA 3R2QA 5DAKA 2L6DA 1Z9HA 4KGIA 1NHOA 4EVMA 1A0RP 5ELGA 4KW6A 1NHYA 2C3TA 1JLWA 3RPNA 4X43A 1E2YA 4IQAA 2VCVA 4JBBA 1GLQA 1WWJA 3EU4A 4GSTA 3KIJA 2OJLA 2VM2A 4ID0A 1XOBA 1DBYA 1T8EB 4XRAA 4HDEA 3VLNA 1Y6EA 4V2NA 1XVQA 2HZEA 2LNTA 4IQ1A 1AQXA 5HR2A 2JSZA 1QGVA 2WS2A 2DJ0A 4V1Ag 3Q74A 3L9UA 1VF2A 1QQ2A 2C0GA 2HXKA 5AISA 4OD7A 4E8EA 3DWVA 2AV4A 2DSAA 1E6BA 5ECKB 2IMFA 4EDYA 1M2DA 2KP2A 1TRWA 3GX8A 4HJ2A 1M0UA 3IHQA 2WJUA 4EXJA 3DVWA 2OBKA 1GSQA 4ACSA 4XS1A 1YEPA 1WPIA 1G7OA 3TOUA 2AHEA 3KJYA 4IS0A 2EC4A 4L5LA 1C72A 4MDCA 5E4WA 3E3EA 2PN8A 2QSIA 3EE2A 6GSVA 1X9SB 2H71A 3FKFA 3M1GA 2LJRA 3VI7A 1OE8A 1CQGA 2QKEA 4V2LA 4EF0A 3A2VA 2R3XA 3FR6A 1O6JA 3HCZA 22GSA 1SD8A 5C04A 2Z9SA 2VL2A 1H75A 5DJLA 2JADA 4HEA2 1S3DA 1T00A 3M3MA 4GWRA 3AY8A 2GT6A 1AC1A 4GCIA 4ZILA 4K2DA 4BVYA 2RIIA 2PVOC 1YKCA 4CW9A 2YZUA 4GQCA 5GSSA 4X1UA 5D9VA 3J7Yk 3DD3A 2LRCA 4H86A 3UAPA 1BX9A 4TR3A 1YZXA 4TR4A 2L4QA 4PXOA 3CSHA 4K0GA 2VIMA 2GVPA 1VRSD 5G2ZA 1SL1B 2H1AA 4NAXA 5IO2A 2CX3A 3IK9A 2TRXA 5JWRB 3IBHA 2YOIA 11GSA 3NIVA 3HDCA 2H73A 2YWNA 3RHBA 1TRSA 1EOGA 4Q5NA 5CP1A 1GH2A 2CA8A 3CTFA 2NPBA 3N9JA 3UBKA 2GLRA 2MBSA 2O8VB 3CSIA 2AB6A 1MDJA 2VCQA 2H1DA 3GL3A 4YQVA 5CYYA 4ZL8A 4PNGA 2GGTA 1NM3A 1A24A 2FY6A 1PMTA 2C3QA 5ID2B 2LSTA 3BCIA 2WCIA 3US3A 3D0ZA 1XW5A 3FY7A 2LJKA 4MP4A 1PRXA 5CRGA 5DAKB 5LNKe 4K7OA 3VPQA 2HT9A 3EMPA 5A4WA 3QFBC 1A2LA 1B4QA 5G5EA 2PERA 1XPVA 5DJMA 4V2MA 5ELAA 4Q5RA 4N0ZA 4KX4A 2TRCP 5ECLB 2VUPA 4F0CA 5ECSA 1ML6A 2C80A 4N30A 1SJ6A 2H75A 3GRXA 3KEBA 3KTBA 2KLXA 2X8GA 3LXTA 3TKSC 1FVKA 3LGCA 3UJ1A 1GRXA 2HZEB 4GTUA 2YJ7A 1YF1A 4POBA 4FH8A 1XWCA 3WGDA 1M2BA 4Q5QA 3KH9A 1EV9A 2CZ2A 1B48A 3IDVA 1WMJA 4XS4A 6GSYA 5B8BA 3GL5A 1YJ6A 1ERWA 2VL9A 2GZYA 2X64A 2HSHA 3ZVJA 4HQZA 1PL1A 2I3YA 1ZCPA 4ECIA 4HZ2A 1LJRA 4TXOB 2B1LA 1Z7RA 4MJAA 1GSUA 3MAKA 5GSTA 3GKXA 5HFKA 4TN8A 3GNJA 3LWAA 2GDRA 3S9FA 2CX4A 5HR1A 2VL3A 3IA1A 3PGTA 1DUGA 3LFLA 4JZQA 1BEDA 3GUSA 2FLSA 4XS6A 3I69A 1SL2B 3TJBA 5HR0A 2E7PA 4JR4A 3L0HA 5AIXA 4ZL7A 4TOPA 3UIWA 4NHZA 4O5RA 4AJ6A 2A4VA 3IAM2 1QMVA 2P31A 3CBUA 5INYA 2MMNA 1YEXA 5F07A 4NV2A 3TDGA 2B7KA 2RM5A 1U3IA 3HKRA 1QK8A 2XPEA 2LRNA 3WT2A 1O8XA 2FWEA 2IMEA 1SD9A 1EZKA 4QL7A 1MDKA 1MTCA 1Y25A 3LYKA 3QDNA 3M9KA 4IGJA 2XHFA 3HY2A 3VWVA 3SBCA 3WGXA 2N5AA 2NDOA 3FR9A 1FAAA 2OE3A 4MPFA 1UVZA 1ON4A 1M9BA 2DJKA 4MJBA 5DALA 1XBSA 2H0IA 4OMVA 4PQ1A 4ULXA 2I4AA 3IPZA 2P5QA 4LMVA 1JZRA 3F6FA 3NZNA 1G6WA 3N5OA 4MZWA 4CDOA 2OKAA 4YH2A 3I9V2 3FRCA 5KN3A 3FEUA 4L8EA 2LQOA 3DYRA 4KSOA 4NHWA 2IPAA 1ZYQB 1X9MB 1TOFA 3IK7A 3KP9A 2LRTA 4I8BA 5JWQB 2FA8A 5HR3A 2JACA 3RDWA 4L0WA 2HZFA 6GSTA 1AIUA 2C0EA 3ZL5A 1BAYA 4GXZA 3DXBA 1F37A 3C8EA 1MEKA 1I9DA 1OKTA 1O8WA 3QAWA 3GH9A 1GTIA 5F06A 3H79A 1ERUA 1R26A 3PR8A 2GTUA 3APOA 1BJXA 1SU9A 2R4VA 19GSA 5JCUA 6GSWA 2ZNMA 2RLIA 4WF5A 3CRTA 2WDUA 3KZQA 2O89A 3OR5A 3H1NA 2IMDA 2GZZA 3UL3A 1W89A 2C0DA 3QD9A 1V40A 1GP1A 4XHMA 2LQQA 5EY6A 1YY7A 5ID2A 1S3AA 2K8SA 4NPBA 1T1VA 4RQXA 4XS4B 2BTOT 6GSUA 2ZUPA 1OAZA 1K0OA 2GQKA 2EIRA 1URMA 4KA0A 1K0NA 3HVXA 2NVLA 3FZ5A 3ZIVA 2FNOA 1U88A 3WYWA 2YWOA 3LORA 3QAVA 3QOUA 5H5QA 3D6IA 2B6MA 4K8MA 2G0FA 3D22A 1JZOA 1YKAA 4I97A 1K3YA 3HVVA 3JCML 2YWMA 3IAS2 1TRVA 2LJAA 1W4VA 4PUFC 3DMLA 1XWAA 3TKSA 1GUKA 4EDZA 5G31A 3EINA 1Z5YE 3UEMA 4KB3A 5G1KA 1HNCA 4N11A 4WKWA 2FA4A 2VCWA 1MD4A 3O76A 1QUWA 5D8IA 2CV4A 1TDIA 5JCGA 3A3TA 4IVFA 1ZZYA 3LSZA 4OO5A 2P0GA 4ZB9A 5F8BA 1JZDA 2PU9C 1VGLA 1RQMA 5IMDA 3ZZXA 3VFIA 3F8UA 3LQ7A 1A0FA 1AAZA 4TXOA 2YNXA 2JU5A 3ME7A 3FZAA 4MPGA 3LJRA 3UOMA 2B3SA 2YCDA 5DALB 2L5LA 1GWCA 1K3OA 1XVWA 4J56E 4TVEA 2KUCA 4RQRA 3F0IA 4ECJA 3CXGA 5J5NA 5ECMB 3GKNA 2KOKA 1SENA 4K0NA 1NW2A 9GSSA 1FVJA 4TXVA 1MDIA 2I1UA 4OWYA 4GLTA 1SJIA 4FIWA 4EL1A 4MF5A 3HJMA 1OKDA 2JSYA 2BMXA 2YN1A 2XPDA 2KP1A 2VCXA 3KP8A 1A23A 3TKRA 2M46A 3KMOA 2L6CA 2C1YA 2E2MA 4FYCA 4I6XA 4MK3A 3TKSE 2GSRA 4N0VA 2L57A 1V2AA 1ZYEA 5FWGA 3M0FA 1ILOA 2H76A 4N10A 2HE3A 2K18A 3KMNA 1EV4A 1PGTA 2PPTA 3HJPA 4WETA 10GSA 2HNLA 4IKHA 3RAZA 1QFNA 1B9YC 2HRNA 2REMA 5DBQA 4F0BA 4FYBA 2JZSA 4RI7A 2CAIA 3M8NA 1F2EA 1HNBA 4IELA 4HU7A 1T7PB 4ZBBA 5G5FA 4IP1A 1R7HA 3EC3A 5CRDA 3F4TA 3EVIA 2FWFA 1EGRA 2NTOA 3CTGA 3MNGA 2LTKA 2MMOA 2YWIA 2DJ1A 5H5RA 2GSTA 1X5CA 1DE1A 3D21A 5CO3A 2C4JA 3QMXA 1JFUA 2F3MA 4NV5A 1PX6A 4OCEA 4GF0A 4HS1A 1EGOA 1IYHA 5D96A 1F3BA 4QL9A 4PX1A 5DCGA 2DJJA 2H6XA 4ZBDA 3IC4A 3O3TA 16GSA 3EU3A 2FD3A 2GT5A 1THXA 1YDKA 4O7HA 3TB2A 3WGEA 2HYXA 4BWQA 5HFGA 2OACA 3FZ9A 2FWGA 2OA7A 3VPTA 3GKMA 2R6KA 4OFMA 2WB9A 2GSQA 2GQLA 3F3QA 2VD0A 4G19A 3ZIJA 2H70A 3J7Yb 2DJ3A 3ERFA 1O73A 1B9XC 5IPGA 2WGRA 4RUVA 1A2JA 4BA7A 1V58A 1B8XA 4EE0A 1GULA 3I43A 4DSSA 1M9AA 1THOA 4KCAA 4ZXGA 5C00A 1AQVA 2CVDA 4PQIA 5A4UA 4AJ7A 1SL0B 3ERGA 3GIXA 1A2MA 2CQ9A 1TK5B 3HVSA 1GSDA 5EPFA 3UARA 5JWOB 2XBIA 3GTUA 1ZMAA 3P8WA 2H66A 1UA5A 4FO5A 6GSXA 3EMXA 3CRUA 3IV4A 4PURA 1G0TA 1SK0A 3L4NA 4I5QA 3LG6A 3UMAA 2P5RA 2VLTA 5IMFA 4L5OA 3W8SA 4MJEA 3C7MA 4IP6A 5ABRA 4RI6A 5EVOA 4F2IA 4ML1A 3TJGA 2YJHA 4I2TA 3GA4A 2J9HA 3ZITA 2V6OA 3C1SA 1UN2A 1T3BA 1SJZA 3QFAC 5B7CA 1TU8A 4BVXA 5IIZA 2JL4A 4DSQA 1EOHA 3H8QA 2IMIA 4G10A 4KDUA 2D2ZA 2CVBA 4ZL9A 4K9ZA 2EIOA 2IFQA 1SKRB 2N5FA 1EEJA 1TK8B 3GSTA 5AIVA 2F8AA 4JRRA 5CAXA 2JZRA 3D4MA 1GL8A 2H30A 2VL2C 2H72A 3FZ4A 3GH6A 4WR4A 3QAGA 2VO4A 4HJMA 1S3CA 2DBCA 5IPHA 4AJ8A 2H0HA 1FG4A 3ZLPA 2IIYA 2CVKA 2OE1A 1GUHA 1XZOA 3LEFA 1X9WB 3WD6A 2AJQB 4OFTA 5CNWA 3HZ4A 2MMZA 3GX0A 1AXDA 4TRXA 3GFKA 5D9XA 3RBTA 1HNAA 5KN2A 18GSA 1G7EA 2HLSA 5GZZB 1XW6A 2FUG2 1WE0A 5IMZA 1WP0A 3GHAA 4POKA 1ST9A 3GMFA 1R4WA 2ES7A 1M7TA 13GSA 2YV9A 2K9FA 1TU7A 1XFLA 2V41A 5IMCA 2H0GA 5AGYA 4Z7XA 1GSSA 3TJJA 1Z6NA 5CRHA 2IMKA 3UBLA 1K0DA 2DLXA 1GSEA 4KDXA 5CRWA 3H93A 5DQYA 2B7JA 2XBQA 3RPPA 2WULA 3EURA 5ECIB 1ZOFA 3KM6A 4DEJA 3ISOA 5IMAA 1ABAA 1JLVA 2N5BA 4X0XA 3KD0A 3DRNA 1VF3A 3U6VA 4POMA 1O7UA 3ZTLA 4I2UA 1A8YA 3BCKA 3PH9A 1J0FA 2YPMA 3DKSA 14GSA 8GSSA 2ALBA 3MSZA 3FR3A 4KDYA 1ERTA 2X8HA 3HXSA 4POLA 5ECHB 1ACVA 2EIQA 3GSSA 1V57A 3W6GA 4F9ZA 4D73A 4XTSA 3TRPA 4F82A 5ECQB 3ZFLA 1Q4JA 3BOAA 2PGTA 3E9JB 2H01A 1GTUA 2A2RA 1PA3A 5AN1A 3F63A 5G1LA 4IJIA 5LCZA 4ZB6A 5J9BA 2PWJA 5ECNB 2R5GA 1SKWB 4DSSB 3U5RE 1QXHA 2VLVA 3F4SA 1F9MA 4MABA 2GSSA 5LD0A 3CMIA 1VF1A 4JEDA 2V1MA 2B5YA 4HI7A 3W8JA 4GRFA 2CT6A 2O85A 3GTUB 3HYPA 2LUSA 3CYNA 1TI3A 1N8JA 3L9VA 1XXUA 4ZBAA 3IRAA 1XOAA 3TRQA 2DIYA 1T4YA 3D4TA 3GN3A 3H4KA 4O92A 4YAPA 2F51A 2IWTA 5J3RA 1KEBA 2WFCA 1Z7PA 5IM9A 2H6YA 1KNGA 5DCHA 1XIYA 2VOCA 2C0FA 2VCZA 2YANA 2MBTA 2MYGA 2VLUA 1OC3A 4HUAA 3TGZA 4KH7A 2I9HA 3TKPA 1OC8A 2GQMA 3ERWA 2IFQB 2HFDA 3WT1A 1SK1A 2YP6A 4CHSA 4MH3A 3DIEA 4MZCA 3BJ5A 1TP9A 4NXIA 4KSMA 2R2JA 5H5SA 4NMUA 4TKYA 1X0RA 3VURA 1X5EA 3V1WA 4WBRD 4IW9A 5COHA 3KXOA 4TR0A 2RM6A 4MZBA 3ZFBA 3KTLA 2OADA 3VK9A 4YQMA 5ENUA 2C3NA 4NWYA 3IOSA 3TRXA 3G7IA 4XIHA 1SK2A 1U3AA 2WRTA 2VCTA 1TJDA 3C73A 4BWSA 4MCUA 1PQNA 3APSA 3I6AA 3TJFA 1OE7A 2DJ2A 1U6TA 1G6YA 4FYUA 3KGKA 3EWLA 4JU5A 2BJXA 2PBJA 1R5PA 4OFNA 5DVBA 3ZYWA 3GKKA 4K6XA 2VAFA 1M2AA 4OCFA 5E59A 1AW9A 4GSNA 3P90A 3ZMKA 1JZWA 1ZL9A 1FOVA 3A2XA 4XCSA 1FW1A 3HZ8A 4EO3A 3TJKA 3PINA 5ECRB 1PX7A 1YQ1A 3QCPA 1XWBA 3DGQA 4IBPA 4HQSA 4PQHA 4G2EA 1TXXA 2C8UA 4HOJA 2ON7A 1K0AA 2F9SA 1TK0B 3RHCA 1HQOA 2LS5A 1AUCA 1AQWA 1N2AA 2H6ZA 1GSYA 2O87A 3HHVA 4XRDA 4LLRA 1M99A 2PUKC 1BYEA 2DMMA 4WXTA 1PKZA 2HRFA 3BD2A 1WJKA 3Q18A 4D73B 3KH7A 3HA9A 3APQA 2IL3A 2KHPA 1O81A 2K8VA 2MZCA 2V32A 2R37A 4MLYA 2DMLA 1H4OA 2GZPA 1EEMA 4LMWA 4TR1A 2VD1A 5ECPB 1SYRA 2RUEA 4J2FA 2HI7A 4OO4A 1EWXA 1Q98A 3FHKA 1TKDB 1TRUA 1F6MC 1RW1A 3EYTA 1EP8A 2K6VA 4YAVA 4IJ3A 3LXZA 1J9BA 3QPMA 5B6MA 2JZTA 1R5AA 4DVCA 2E2GA 3TUEA 3C71A 4MA9A 1OVNA 1FHEA 2HSYA 4G9HA 1K0CA 1OC9A 2B1KA 5L71A 3E0UA 5D73A 3P7XA 1U87A 2XC2A 2PVQA 4GSSA 1PSQA 2PMTA 1LBKA 5D9WA 5F05A 4JE1A 4P3YB 1PN9A 4MF7A 3FK8A 1BQ7A 3G9BA 5D93A 12GSA 1V9WA 2CAQA 2LEGA 4K1FA 1XWKA 2LNSA 2YZHA 3BBYA 6GSSA 4KUNA 4ZB8A 4TW5A 1HYUA 1YF0A 2FGXA 1KBNA 1WOUA 5D9TA 4L0UA 4EUYA 2GS3A 1XCCA 1JHBA 5J41A 4IHUA 1GSFA 4V1Ap 4EKZA 4IN0A 3CSJA 1X5DA 4J57E 3O6TA 3D5JA 1ERVA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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