2L5OA

Solution structure of a putative thioredoxin from neisseria meningitidis
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
150
structure length
150
Chain Sequence
DSKTAPAFSLPDLHGKTVSNADLQGKVTLINFWFPSCPGCVSEMPKIIKTANDYKNKNFQVLAVAQPIDPIESVRQYVKDYGLPFTVMYDADKAVGQAFGTQVYPTSVLIGKKGEILKTYVGEPDFGKLYQEIDTAWRNSDAEGHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Putative thioredoxin
publication title Solution Structure of a Putative Thioredoxin from Neisseria meningitidis
rcsb
source organism Neisseria meningitidis serogroup b
molecule tags Oxidoreductase
total genus 46
structure length 150
sequence length 150
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2l5oA00
1OC8A 1N8JA 1R5AA 1HNAA 3GIXA 3GA4A 3GN3A 1KEBA 4IGJA 1ON4A 5IOXA 4F03A 2A2RA 3RDWA 4NXIA 3HYPA 2K8VA 4CDOA 2IJYA 2GSQA 5ABRA 1BX9A 2FD3A 2PVQA 5IO2A 2CX4A 1YZXA 2AV4A 2MBSA 2XPDA 1WJKA 1DE2A 4EXJA 4ZILA 1V9WA 1J9BA 5DDLA 1QMVA 2EIRA 4O5RA 3M8NA 3W8SA 2X8CA 1GSSA 3P90A 1XPVA 2IFQB 2H72A 4MH3A 3BJ5A 3HD5A 1Z6NA 4BA7A 4KW6A 2M72A 2OBIA 1JZDA 2X64A 1EP8A 5G31A 3C1SA 5J5NA 5HQPA 3VWUA 4YH2A 4TVEA 4RUVA 5J4UA 3ISOA 2OACA 2GTUA 1XOAA 4L0WA 4ZBDA 3WT1A 4IQAA 3RHCA 1EEJA 2F9SA 3BBYA 2V41A 1RK4A 1SKSB 2X99A 4Q5FA 4ZB6A 2C80A 3ZMLA 4OMVA 2LRCA 3VFIA 3KM6A 2E2GA 2DC5A 3FR6A 3TKSA 3CSJA 4JE1A 3EYTA 4LA1A 2YP6A 1OVNA 3FRCA 3I69A 5A4WA 5DQYA 1AC1A 3FEUA 2V2GA 1IYHA 4N10A 2LNSA 3MWHA 2CVKA 5GZZB 2LNTA 4HQZA 5G1KA 2WULA 4K2DA 2HRFA 3VI7A 2PN8A 2R4VA 5F07A 1NW2A 3UVTA 4KX4A 6GSWA 1Z6MA 4I6XA 3P7XA 2GZZA 1MD3A 3EMPA 3F4SA 3GUSA 1GSUA 1R7HA 3GFKA 2YPMA 4TOPA 1K3OA 2C0DA 2PU9C 2CA8A 2NBSA 1F3AA 3DEXA 3ME7A 1F9MA 3HZ8A 4KDXA 2I3YA 4BVYA 2H6YA 3KCMA 4MZCA 1EZKA 2XBIA 4IBPA 3FHKA 2FWGA 5HR2A 1GUMA 2B1LA 4POMA 5EY6A 1PN9A 1ZYEA 2LEGA 6GSSA 4LL4B 3HKRA 2V32A 4EF0A 4TXVA 1Y6EA 1C72A 2H66A 1G7OA 1HNCA 3U5RE 1A23A 2MBTA 3EVIA 3TB2A 4OO5A 4ULXA 2B5XA 3D22A 3TDGA 2RM6A 2O85A 5EPFA 2DIYA 1TRUA 1AUCA 2DJKA 4ECIA 1VF1A 2YZHA 4YQMA 4IS0A 1WPIA 1Q98A 3ZVJA 3TRPA 5A5KA 1S3AA 5E4WA 4L5OA 1ERWA 2VD1A 1OE7A 1CQGA 1E6BA 5H5SA 5J9BA 2CVBA 3APSA 3QFAC 3I43A 4TR1B 2HLSA 2RUFA 1NHYA 2AHEA 3GH6A 1GSEA 1XIYA 5L71A 1CQHA 1VGLA 2H1DA 4GWRA 2X8HA 3UOMA 3BD2A 3F3QA 4MPGA 5ECPB 2TRXA 1MD4A 4V2LA 1O73A 3ZZXA 4RI7A 5DALB 2GLRA 2P5QA 2QSIA 2GZPA 1GTIA 1YKCA 2IN3A 2B5YA 1TKDB 4MABA 1G6YA 2EIQA 1X9WB 1IYIA 1DBYA 4X43A 1QXHA 1PRXA 2C3QA 4FIWA 2OA7A 3ZFBA 3KEBA 19GSA 4AJ6A 3TKSC 1M2BA 5IO0A 3M0FA 1MDKA 5H5RA 4MMMA 1K0BA 3CYNA 4PNGA 2HT9A 3H1NA 3GX0A 5IMVA 2K6VA 3CSIA 1TU8A 4MF6A 2IL3A 4FYBA 4F0BA 3LSZA 5F8BA 4JRRA 5CNWA 1J08A 3FZ5A 3O6TA 2R5GA 2FNOA 3ERGA 5HR3A 3PGTA 2MZCA 1SK2A 1M9BA 3HZ4A 4OFMA 2VD0A 1JLVA 3WGDA 2O87A 3IPZA 5JCGA 4XTSA 4IN0A 4DEJA 4XS4A 4XS6A 5DCGA 3Q18A 4I8BA 3D6IA 4ZXGA 4KH7A 1DUGA 2VL2A 5EVOA 1XCCA 2C0GA 2RIIA 5ENUA 1K3LA 2BTOT 4KB3A 3VWVA 4GRFA 3GX8A 4FO5A 3TKRA 5D9WA 5JCWA 4PURA 2PMTA 2KOKA 4MF7A 2LJRA 1TOFA 4YAPA 2YWIA 4BVXA 3R2QA 2FA4A 3VPQA 2DBCA 2OKAA 1GSQA 1FB0A 3L9SA 3KZQA 3LJRA 4GQFA 2H70A 1KNGA 1XW5A 3CRUA 3H93A 1BYEA 5CRWA 1R26A 4HEA2 4K1FA 3LFLA 1B8XA 2WB9A 2H1AA 1GRXA 3CXGA 1O81A 3RBTA 1U88A 1XW9A 3M3MA 2VCQA 3IBHA 5ELAA 1EV9A 3A2VA 4O7HA 2LTKA 3ZIJA 3HVSA 3KD0A 3L0HA 2WCIA 4KNDA 10GSA 1TJDA 4PXOA 2V6OA 2OE0A 3F8UA 1M0UA 4Z7XA 1XWBA 1ZOFA 2IFQA 2C0FA 2R2JA 4PGTA 4K9ZA 3EC3A 3ZL5A 5IMAA 2K8SA 5GSTA 3HVVA 3SBCA 2DJ0A 3M9JA 3GKXA 4RQXA 1U3AA 1YQ1A 2H76A 4IW9A 2EIOA 4POBA 4F2IA 3UMAA 2G2QA 3EMXA 3UARA 1K0CA 2PUKC 4Q5RA 4YQVA 2IMDA 2VCVA 2AJQB 5F0GA 4V2MA 2JU5A 4POKA 4HZ4A 1AAZA 5INYA 4JEDA 2TRCP 4ML1A 3MDKA 5IMFA 2GSRA 1SL1B 4KDUA 4MDCA 3M9KA 2DJJA 3DWVA 2N5BA 4JR6A 5D96A 2JSZA 4DSSB 1GULA 5FWGA 5FHIA 4PNFA 2CV4A 2HNLA 2L5LA 3TUEA 1X5CA 4LLRA 4FYUA 3BOAA 4DSQA 1BG5A 1V57A 1THXA 4K7IA 1ZL9A 3KJYA 2RM5A 5CRDA 2VLTA 3I9V2 1VF3A 5DCHA 4WBJA 3F4RA 4ILFA 1PGTA 1SYRA 1EGRA 2FWFA 4GSNA 3F6DA 3ZIVA 2DJ3A 1JZOA 2AYTA 5ECNB 1V2AA 4HZ2A 1OAZA 3ZVJD 2GQKA 2GGTA 3Q19A 3F4TA 4MJBA 1GH2A 4L8EA 1MTCA 2MMZA 2VL2C 3DGQA 1ZYQB 3GSSA 1ILOA 1V98A 4IJIA 2LJKA 1FHEA 2YZUA 3TJKA 18GSA 1OKTA 1M99A 1F6MC 4XCSA 3F63A 4JU5A 3QMXA 4J57E 3G9BA 4MK3A 1USBA 5G30A 1GSYA 2ZNMA 2CT6A 2H8LA 1URMA 3WT2A 2BMXA 4KAEA 4EKZA 4OWYA 4KCEA 4ZBAA 1XVWA 4WR5A 4NV5A 4Q5NA 5COHA 4QL9A 3IA1A 3E0UA 4HUAA 2GSTA 2VCWA 3TRQA 4EDZA 1XVQA 1SL2B 3MNGA 1LBKA 1SK0A 2O7KA 3GYKA 3KXOA 3C7MA 2K9FA 13GSA 1F37A 3QD9A 2L4CA 1H4OA 3GKKA 1XBSA 1ABAA 2VCTA 3HY2A 2MMOA 4TKYA 4TR1A 3IXRA 3GV1A 1GL8A 2H0IA 5KN0A 1EOGA 3F6FA 3UJ1A 2HZEB 3VURA 4E8EA 2OJLA 4FH8A 1WWJA 5ID2B 2XBQA 2RLIA 3D4MA 6GSTA 2JACA 2IMEA 1QFNA 5GAND 5J3RA 1KTEA 3TOTA 3RPPA 2FA8A 2Z9SA 5DALA 2HSHA 6GSXA 2V6KA 5CRGA 3FR3A 1T4YA 3ED3A 6GSVA 4J56E 2E0QA 1UA5A 2D2ZA 4NHWA 3KTBA 5C00A 4WBRD 1DE1A 2WZ9A 3C71A 4MLYA 2BJXA 5E59A 1R5PA 1PKWA 3KTLA 3ZREA 1PQNA 2H0GA 4IKHA 1ZZYA 3ZTLA 2L59A 1TTZA 1XWGA 2L4QA 5D9TA 2H6XA 4ISDA 2PBJA 1M2AA 5IMDA 4L0UA 2QGVA 1OE8A 4EO3A 3TKSE 3NIVA 4MJAA 3DVXA 4EL1A 1AQWA 5ECQB 1Z5YE 4GLTA 4RI6A 3LGCA 2F8AA 2NDOA 2H71A 5GSSA 1TK8B 4EVMA 5GAPD 4KGIA 3TCOA 3ZYWA 3VWXA 2XPEA 9GSSA 3TJBA 3LXTA 4PX1A 4WR4A 2HZFA 4K0GA 4X0XA 1WRYA 2H73A 5D93A 3EWLA 2VM1A 1YF0A 1XWAA 3CRTA 1TU7A 5HFIA 1AXDA 2VOCA 3ZLPA 3HVXA 2I9HA 2GQMA 4OD7A 3FR9A 5ECRB 1PKZA 2HXKA 2V1MA 1GTBA 3HHVA 4OCFA 1F3BA 1GTAA 3Q6OA 5HR1A 1Z3EA 3C1RA 3LG6A 1JFUA 4LMWA 3DXBA 4V2NA 3GTUB 1BEDA 4MF5A 1O85A 3FK8A 4TR3A 1GSFA 2N5FA 3TKQA 1SU9A 2AAWA 1HQOA 2LKUA 2IPAA 5AN1A 1ERVA 2B5EA 3KH9A 1UVZA 3IAS2 2H0HA 5DAKB 4AJ8A 2VLVA 3FKFA 2L6CA 4MCUA 3ZFLA 4J2FA 2CAIA 3MSZA 3HCZA 4NPBA 4MH2A 5B7CA 2C4JA 3ERWA 5KN2A 5D9VA 3A2XA 3L9VA 3D0ZA 1SKRB 3H8QA 2LQQA 2JZSA 2P0GA 3IHQA 3VWWA 2E7PA 4TXOB 16GSA 4ZB8A 2H01A 5ELGA 5F06A 1Z9HA 2G0FA 4DSSA 3BCKA 5ECLB 4EDYA 2C1YA 5G2ZA 2GS3A 5IOWA 4O92A 4TN8A 4WF4A 4HU9A 1T7PB 4K8MA 4KUNA 2R37A 3LWAA 2RUEA 1FAAA 4WETA 3D4TA 3TGZA 3IAM2 5LNKe 3F9UA 2LRNA 4TR0A 2OBKA 2R3XA 1SD9A 4N0ZA 2CQ9A 1NSWA 3EURA 4ECJA 4I97A 2KP1A 4XIHA 1A0FA 1DSBA 4KSMA 4Q5QA 1PL2A 3ME8A 1W4VA 2VCZA 2YJHA 1T8EB 22GSA 4NV2A 5KN3A 3UEMA 2FCHA 1AW9A 1N2AA 3WYWA 4HJ2A 5HFKA 2A4VA 1PL1A 4D73B 3QAWA 1A2MA 4K6XA 2AUVA 3CTGA 4DSRA 1WE0A 3BCIA 3DKSA 3K8NA 2JL4A 1MEKA 2VO4A 2WDUA 2HFDA 2F3MA 2L57A 3PR8A 7GSSA 4POLA 3N9JA 2K18A 4F0CA 2YOIA 3TRXA 2H1BA 4TR4A 4XRDA 1EGOA 1QGVA 5IPHA 4WEYA 2DIZA 2KP2A 5D8IA 5D73A 3FZAA 4ZL7A 2OE3A 4F9ZA 1O8WA 5CP1A 1TXXA 4GXZA 4EUYA 1I5GA 4ACSA 2I81A 5JWQB 5DJMA 2HZEA 4PQ1A 3FW2A 3L4NA 1J0FA 1B9YC 5ID2A 4YQUA 1G6WA 1WMJA 2C0EA 1O6JA 3G7IA 2PVOC 2OADA 1OC9B 3VPTA 5HR0A 1GLQA 3LQ7A 2CZ3A 2ALBA 3TOUA 6GSUA 2GVPA 2I1UA 3E3EA 4IP1A 2VL9A 4AJ7A 2HE3A 2MMNA 4I2UA 5EL8A 5CREA 5AIVA 2LV3A 3C73A 1U3IA 3UIWA 3H79A 2MMAA 4GF0A 2M46A 4GQCA 2EC4A 3VK9A 4BWQA 2O89A 1V40A 3GKMA 2REMA 1K0DA 3LEFA 3FZ9A 1T1VA 4ZBBA 4RQRA 5ECOB 4JBBA 1WOUA 4HI7A 1AQXA 1O8XA 4G19A 4BWSA 2FUG2 1FW1A 2GSSA 5ECHB 1FB6A 4HQSA 3APQA 1TI3A 1JHBA 2HYXA 2VM2A 2CZ2A 1VF2A 6GSYA 5AIXA 5D9XA 2JZRA 4L5LA 4I2TA 2GDRA 1QQ2A 2VUPA 4K0NA 3KGKA 1G0TA 1T00A 3GRXA 3PINA 3GL5A 5J41A 1NHOA 2JZTA 3J7Yk 2JADA 3KH7A 1TRSA 4V1Ag 4ZB9A 4V1Ap 1OKDA 5IMZA 2YJ7A 2HI7A 3LYKA 4OO4A 2CAQA 1UC7A 3P8WA 3KP8A 3W8JA 2IMIA 2A2SA 3IC4A 2YNXA 1F2EA 3J7Yb 5LD0A 1OYJA 2DMMA 4AGSA 5KN1A 4MZBA 2P31A 2PGTA 1S3CA 1A8YA 1SYXA 4GSTA 1H75A 5KEJA 5DVBA 1GLPA 4OCEA 1Q4JA 1TK0B 3OR5A 4KA0A 2DLXA 4K7OA 4XRAA 5F05A 1PSQA 3D21A 1K0OA 1ACVA 3O76A 3GTUA 2HRNA 1K0AA 4P3YB 2WRTA 2C8UA 1SJ6A 2AB6A 3AY8A 2KHPA 1PX6A 3M1GA 4HDEA 3ZMKA 3QAVA 3PH9A 3RHBA 2I4AA 3GURA 5C04A 5DQSA 5IIZA 1ERUA 4N11A 4G9HA 3IV4A 4E8HA 1RQMA 1X0RA 1PMTA 5DAKA 3UL3A 1GP1A 3D5JA 1ST9A 4N30A 2KUCA 2DJ1A 3SWLA 1PX7A 2WFCA 5B6NA 1G7EA 2H1GA 2J9HA 3QPMA 4TRXA 3QAGA 1A8LA 1YEXA 3IE3A 3LXZA 5CRHA 4EE0A 3F3RA 4YAVA 2H30A 4NHZA 1EV4A 1JZRA 2H6ZA 2LRTA 2B1KA 5IPGA 2ES7A 1HD2A 1QUWA 4ZL8A 4TXOA 1THOA 3JCML 1TP9A 2O8VB 2L5OA 1MDIA 20GSA 1YY7A 4KCAA 11GSA 1GUHA 3GKNA 3IK7A 1GNEA 1ZMAA 2WJUA 2ZUPA 3EINA 17GSA 2R6KA 4MJEA 1EOHA 5CYYA 1XWCA 3KP9A 1GUKA 4WF5A 1U6TA 3IR4A 3ERFA 4PQHA 3KIJA 3G7JA 2YWNA 3I6AA 1A2LA 3S9FA 5JWOB 2XHFA 3DD3A 3TJGA 1ML6A 3NOFA 3UBKA 4HOJA 1BAYA 3WD6A 4K7NA 12GSA 1VRSD 2GT5A 1UN2A 2YV7A 2KLXA 1LJRA 5H5QA 1Y25A 5G5FA 3UBLA 3DYRA 1R4WA 2M80A 4D73A 2FLSA 3HDCA 1TK5B 3H4KA 1XWKA 4JR4A 3QCPA 1QK8A 1GNWA 2YCDA 1YF1A 3IDVA 1XXUA 2YWMA 2X8GA 4QL7A 4MZWA 4O32A 3O3TA 4F82A 2ON7A 1PD21 1AIUA 3IRAA 2E2MA 2WGRA 5CAXA 2F8FA 2LUSA 2OE1A 5IQYA 3L78A 3WGXA 3QR6A 3FZ4A 3QFBC 4I5QA 2C3TA 2C3NA 3GSTA 5ECSA 5A4UA 5B8BA 3VI5A 3KMNA 4KDYA 5IM9A 3TJJA 1TRWA 1OC3A 4XS1A 1FO5A 3FY7A 1ZCPA 2P5RA 1XW6A 1OC9A 1X9SB 2ZCTA 4H86A 3CBUA 1PA3A 2YV9A 3GH9A 4NAXA 4WXTA 5ECMB 4IVFA 4HJMA 5HFGA 1S3DA 1BQ7A 2IMKA 2NTOA 1T4ZA 3KMOA 2GQLA 8GSSA 1WIKA 4DVCA 1GWCA 2CX3A 5IMCA 2DMLA 3ZRDA 1I9DA 3QOUA 1TI1A 2JSYA 1K3YA 2IMFA 3US3A 1VF4A 3TKPA 1A24A 5J9CA 1SK1A 1K0MA 3ZITA 1KBNA 1SL0B 4TW5A 5ECIB 3G7YA 1Z7RA 1FOVA 4G2EA 1W89A 1Z7PA 5FT3A 3DIEA 4IELA 4OFNA 5AGYA 2IIYA 1M7TA 3LORA 4NMUA 3A2WA 3WGEA 1M2DA 1LU4A 3DRNA 5DJLA 3GHAA 14GSA 4OFTA 4GCIA 3RAZA 2VLUA 1JLWA 3APOA 3P2AA 4LMVA 1TRVA 4IQ1A 1XOBA 1YKAA 3EE2A 3GNJA 1X5DA 5JCUA 2DSAA 2GZYA 4ZIJA 5B8AA 5LCZA 2VAFA 1WP0A 2LSTA 4HU7A 2N5AA 3CSHA 2PWJA 1GSDA 1HYUA 2LJAA 3CMIA 3GL3A 2YWOA 2VL3A 3LYPA 1B4QA 2HSYA 1SJZA 3VLNA 3A5WA 3CTFA 1NM3A 4BPYA 1O7UA 2QC7A 4GTUA 5G1LA 3DMLA 2MYGA 1B48A 1YJ6A 5JWRB 2GT6A 4ML6A 4EC0A 4LL1B 4PUFC 4WKWA 1ERTA 3FYGA 2B7JA 4G10A 4X1UA 2NPBA 4ECCA 1A0RP 1YDKA 1X5EA 1SD8A 3UVHA 4KSOA 3MAKA 3E9JB 4IHUA 2LQOA 3GMFA 1FVKA 3DVWA 5CO3A 4MP4A 2QKEA 3HJPA 2VIMA 1EP7A 5G5EA 4GSSA 1TW9A 3V1WA 1FVJA 3HA9A 1E2YA 1B9XC 4CW9A 2YANA 4ZL9A 4AF2A 2NVLA 4XHMA 2PERA 1EWXA 2LS5A 2CVDA 4MPFA 3EU3A 1B4PA 3N5OA 2IWTA 4JZQA 3F0IA 2J23A 4MA9A 1U87A 3RPNA 1RW1A 3HJOA 1AQVA 4QQ7A 1SJIA 2XC2A 2H74A 3U6VA 4IJ3A 4BL7A 3C8EA 5B6MA 4CHSA 1FG4A 4IP6A 2FWHA 4ID0A 2DJ2A 1ZGNA 2FHEA 1XFLA 3TJFA 3UAPA 3HJMA 1TDIA 5ECKB 2L6DA 4FYCA 4KE3A 1JZWA 2TIRA 1V58A 2FGXA 2ON5A 5DBQA 2PPTA 1BJXA 4NWYA 2H75A 1SENA 1X9MB 2FWEA 5A4VA 3HXSA 4N0VA 4PQIA 2FY6A 1MDJA 3IOSA 3A3TA 4HS1A 2B7KA 3NZNA 4MJCA 1HNBA 2H19A 4PUAA 3EU4A 1EEMA 2WS2A 4XS4B 1K0NA 1GTUA 1SKWB 1YEPA 3QDNA 1T3BA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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