1GH2A

Crystal structure of the catalytic domain of a new human thioredoxin-like protein
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
VGVKPVGSDPDFQPELSGAGSRLAVVKFTMRGCGPCLRIAPAFSSMSNKYPQAVFLEVDVHQCQGTAATNNISATPTFQFFRNKVRIDQYQGADAVGLEEKIKQHLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords THIOREDOXIN-LIKE PROTEIN
publication title Crystal structure of the catalytic domain of a human thioredoxin-like protein.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Electron transport
total genus 35
structure length 107
sequence length 107
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-11-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1gh2A00
3C8EA 2AB6A 2VCZA 2J23A 4EC0A 3O3TA 3DEXA 3ZVJD 2FUG2 2VD0A 3GH6A 3F9UA 2CAQA 1OE8A 1YZXA 4MA9A 1M9AA 2C0FA 2K6VA 1TKDB 3BD2A 2F3MA 4FH8A 1M99A 5JWQB 1ERTA 2GS3A 1UC7A 3GA4A 2FHEA 2LJRA 1PGTA 2VO4A 4O7HA 2C3QA 1V98A 3TRQA 2L5OA 1AAZA 1TK5B 2A2RA 2K8VA 5DCHA 1LU4A 3DVXA 3PGTA 5DVBA 3ME8A 3Q18A 2B7KA 4YQMA 3W8JA 1GSDA 3H79A 2H1GA 1T00A 4MJEA 1SKRB 1SU9A 3M8NA 5CRHA 1YF1A 3Q6OA 1AQVA 1Z3EA 3EMXA 2GQLA 4JR4A 3VWUA 3ZMKA 2LTKA 1BEDA 3LEFA 3TGZA 1FG4A 2H1BA 4GCIA 3TKSE 1RQMA 3EVIA 5C00A 1R5AA 5LD0A 3C73A 1V40A 6GSYA 16GSA 1GLQA 1O85A 2I4AA 3WGEA 3DKSA 2GSQA 4TN8A 3FKFA 1K3YA 5F0GA 2OADA 1O8WA 2GZZA 5H5RA 3FZ4A 5HFKA 1GTUA 3IHQA 1GRXA 1PKWA 3HKRA 1U3AA 6GSWA 4MZWA 2HSYA 2H30A 5AN1A 5IM9A 3P2AA 2B1LA 3F4RA 1FB6A 20GSA 2L4QA 1GWCA 3SBCA 2JZRA 1N8JA 3P90A 3D5JA 3EE2A 4YQVA 3VURA 4ECIA 3FZ9A 1X5DA 3QOUA 3A2WA 5KN2A 4Q5FA 4QQ7A 3ERWA 1TK8B 1FAAA 1GSSA 1QUWA 3EURA 3GSTA 1GL8A 4OFMA 2PGTA 1XFLA 3CRUA 3S9FA 4X43A 4LMVA 4DEJA 2MMAA 5A4WA 3DIEA 2E2MA 1SK2A 1E2YA 4NHZA 4XS4B 3WD6A 4WF5A 4TKYA 5IO2A 1OC3A 1ZMAA 4KA0A 4TR3A 4XS1A 3TOUA 17GSA 3IRAA 3GKXA 2H75A 4DSSA 4BA7A 5D9XA 1ZGNA 4OFTA 2H70A 3D0ZA 4K6XA 1NHYA 3GTUA 1J9BA 1T1VA 3GX0A 2GSSA 1TOFA 2CA8A 5D9WA 3TDGA 3PH9A 5ELAA 3CSIA 4OD7A 2DC5A 3TKSA 2F51A 1I9DA 2GVPA 3G9BA 1F37A 4KDYA 4TXVA 5EPFA 1WRYA 3F4TA 2IWTA 3ZZXA 3IDVA 3UEMA 1JLWA 4HS1A 2WB9A 4EUYA 1C72A 3GKKA 1ON4A 1Z6NA 1T3BA 1K0AA 1WMJA 3LYPA 3D21A 1SYRA 5CYYA 5D8IA 2MMOA 4KAEA 2HLSA 4DSRA 2MYGA 5DAKB 4YAPA 2AHEA 2L59A 4TXOB 4KSOA 2I3YA 3RAZA 4ZB8A 2B5EA 4BPYA 3D4MA 2VAFA 4ILFA 2YV9A 2YZUA 1F2EA 2WZ9A 5IPGA 5FHIA 1XW5A 4PQ1A 2DIYA 2JACA 3APSA 3VFIA 1U87A 4KH7A 2P5QA 2DJKA 4JR6A 3LFLA 1JZWA 4NMUA 2CZ2A 3UJ1A 3GH9A 2E0QA 4ML1A 3GFKA 1K0CA 1PX7A 5J9CA 5B6MA 2H72A 3KP9A 5GSSA 2YWIA 3GKNA 3HZ4A 4XCSA 2WJUA 5KEJA 1XW9A 4HZ2A 4I97A 4FYBA 2QC7A 4J56E 4EXJA 2V1MA 5G1KA 4MMMA 2OA7A 4K7IA 3TOTA 1GTIA 1OC8A 2GT5A 1U88A 2C80A 4RUVA 4ZILA 2V32A 2FNOA 1F9MA 2OE3A 1THOA 1QK8A 1YEPA 1TXXA 4ECCA 3L9SA 2FA8A 2QKEA 5ECKB 3CTGA 2EIRA 3F0IA 1A8LA 2V6KA 4BWQA 5KN1A 3A2VA 3DD3A 2VL9A 2L4CA 1G6YA 3D6IA 5ECRB 1X5EA 2WCIA 1G0TA 3A5WA 1F6MC 4AJ7A 1XVWA 4WR5A 5B8BA 5GAND 1TRSA 3M3MA 3LSZA 4I6XA 4JU5A 1GUMA 2WFCA 3GNJA 4Q5NA 1ZZYA 3FR6A 3LORA 4E8EA 1SL0B 4EVMA 2V6OA 2YV7A 1NW2A 1T4ZA 1KBNA 1AIUA 3UOMA 2EIOA 4TOPA 2CV4A 3HJOA 2C0EA 1QFNA 3GURA 3KZQA 1WOUA 3RHCA 3E0UA 3K8NA 1GSEA 4MH3A 4RQXA 1YY7A 2P5RA 2XBIA 1FOVA 4J57E 2B7JA 2YJHA 4KW6A 1TRVA 1XVQA 2VL2C 2X8CA 1T8EB 3MWHA 2JZSA 5H5SA 2H01A 2VCXA 18GSA 4WKWA 1ST9A 4N10A 1M2BA 5JCWA 2HYXA 4OFNA 2C8UA 1U3IA 3HYPA 5G5EA 3NIVA 3UVTA 3IR4A 1ML6A 4FIWA 1B4QA 1XBSA 2A4VA 4EE0A 2GLRA 1TK0B 4GSSA 1HNCA 3KMNA 4MP4A 1ABAA 3CRTA 3GL5A 3H93A 2M80A 19GSA 5B6NA 4NV2A 2CVBA 2HXKA 2YP6A 2RM6A 1TU8A 4TRXA 3RBTA 2BJXA 3FRCA 3GN3A 2E2GA 4K9ZA 1PRXA 3H8QA 4JZQA 2IMFA 2DJ3A 3P8WA 4OCEA 1EGRA 2HFDA 3WT2A 4K2DA 3TKSC 4DSSB 5DAKA 4ULXA 3DYRA 5KN3A 3FHKA 5CO3A 4IKHA 2DMMA 1XWGA 2GSRA 3DMLA 3QAGA 2XBQA 1GUKA 3LQ7A 2IIYA 1R4WA 2KHPA 1CQGA 3D4TA 5AIXA 4NXIA 1JZOA 4RI7A 5J5NA 2VCWA 1Y6EA 3LXTA 2FGXA 3APOA 2YCDA 5JCGA 6GSVA 4LL4B 1G7EA 3KJYA 1VF2A 4CDOA 4I2UA 2AJQB 1EOHA 3L9UA 4P3YB 5IOXA 3EU3A 3DXBA 5ID2B 3F6DA 3APQA 1QQ2A 2L5LA 1TU7A 2LV3A 2VM1A 5G1LA 3HVVA 1V9WA 5CP1A 1EZKA 4IP6A 1A24A 1A2MA 4ZIJA 4WETA 4Z7XA 2DJ0A 4WBJA 2L6DA 2LNSA 4V2LA 3FK8A 4ZL9A 2F8AA 2KP1A 1ZOFA 3MDKA 2YJ7A 3IBHA 3IPZA 2CX3A 1HQOA 4V2MA 1ZYQB 1K0MA 2YANA 2LRCA 3OR5A 1A0FA 4EDZA 1JZRA 4K8MA 1F3BA 3ZTLA 1GTBA 2R37A 4N0VA 1K3LA 4PUFC 3KIJA 3QDNA 3HJPA 2CZ3A 1EEMA 2ZCTA 2ZNMA 2EC4A 4O92A 1XWCA 3IA1A 1MEKA 2DBCA 4KDUA 3UIWA 1YQ1A 5D96A 3FW2A 3TJFA 2K8SA 4OCFA 2TRXA 5L71A 1VF1A 3CMIA 13GSA 2TRCP 4WF4A 3H4KA 2H1DA 5EVOA 3GKMA 4POKA 1PX6A 2HRNA 1LBKA 3V1WA 2IMKA 4L8EA 5ENUA 3HVSA 4PURA 4XIHA 2LEGA 1TW9A 4N0ZA 1WIKA 3QAVA 5F05A 1Z9HA 3MAKA 2IJYA 2QGVA 4NAXA 5J9BA 2FWHA 2N5FA 1OC9B 3ZIVA 1DBYA 3EC3A 3UAPA 2DLXA 4TVEA 4GF0A 4L0WA 1EEJA 2DSAA 1X9MB 3VI5A 4L0UA 1R7HA 4WBRD 3FZAA 2VD1A 5DJLA 3EMPA 4BL7A 4DSQA 3GYKA 1G7OA 5IOWA 1S3AA 4IQAA 4HDEA 5IMAA 1Z7PA 2I1UA 4MF7A 4GRFA 3GIXA 5JCUA 4LMWA 1A2LA 1OKDA 2N5AA 1YKCA 3AY8A 5IMFA 1SENA 2A2SA 2CQ9A 2GQMA 5AISA 4ZL7A 4GLTA 3UBKA 4HU7A 1PA3A 4HJ2A 1MDIA 1V58A 4PXOA 1BQ7A 5HR3A 3HZ8A 1MTCA 2B6MA 3H1NA 1N2AA 4JRRA 1PSQA 2CVKA 5G2ZA 2PERA 4HU9A 2ALBA 4IHUA 3BCIA 1PQNA 2C3NA 5HQPA 1ERWA 1M7TA 3BOAA 2LQQA 5A5KA 4LL1B 5HR0A 4GXZA 3HDCA 5D93A 2H6ZA 2TIRA 1XZOA 2OBIA 1EGOA 2DMLA 5ID2A 1GNEA 5H5QA 5GZZB 3L78A 1RK4A 2V2GA 4CW9A 2RUFA 1TRUA 3HVXA 3JCML 4LA1A 3R2QA 5IMZA 3G7JA 2JADA 1R5PA 4KX4A 4NV5A 3LGCA 1TI3A 2HRFA 4HEA2 1FVKA 1XPVA 3EWLA 3FYGA 2H76A 3HHVA 1ERUA 2VOCA 5FWGA 3ERFA 2BTOT 1B9XC 1HYUA 1YEXA 2WGRA 5CRWA 2LNTA 3F6FA 1GNWA 1AQXA 2MZCA 2LQOA 3WT1A 4MH2A 4EDYA 4POBA 4V1Ag 2WS2A 1O81A 3EYTA 2HT9A 4Q5RA 2ON5A 3LJRA 1FB0A 4PNGA 4RQRA 3Q19A 3FEUA 2HI7A 2J9HA 4E8HA 1WWJA 3QAWA 2AV4A 4FO5A 4HUAA 5LNKe 2FCHA 4HOJA 2YWOA 4XRAA 4KCAA 2JU5A 3CBUA 4ECJA 2RM5A 4O5RA 1WP0A 2DJJA 2P0GA 3TKRA 2HZFA 4BWSA 4CHSA 2H71A 2GDRA 3ISOA 4L5OA 3TJGA 4BVYA 1T7PB 3KMOA 3U5RE 2YOIA 12GSA 2AUVA 1AC1A 3HCZA 1TJDA 3GUSA 5ECPB 5C04A 1YJ6A 3GSSA 3U6VA 2GTUA 3TJBA 1BG5A 3N9JA 3HD5A 2VCQA 3BCKA 3DRNA 4PNFA 4F0BA 2X8GA 5DQYA 1H4OA 4N30A 4DVCA 2GGTA 2DJ2A 1OC9A 2C0GA 2FLSA 2JSYA 4G10A 1J0FA 4AJ8A 2HNLA 2H0IA 5FT3A 3ZFBA 1O73A 2PUKC 6GSSA 2E7PA 2VIMA 2WRTA 1KTEA 1B9YC 1JHBA 5ECQB 2IL3A 3C7MA 3WYWA 2LSTA 4GSTA 4AF2A 3QMXA 3HJMA 1U6TA 5A4UA 4ZL8A 1Y25A 2AAWA 4IELA 3KH9A 2VLTA 5G5FA 3UVHA 3KCMA 1TTZA 3ZREA 3TRXA 2O7KA 10GSA 5F06A 1AW9A 1PD21 2F8FA 2KLXA 4V1Ap 3IAS2 3G7YA 3QFBC 5INYA 2KOKA 2RIIA 1BYEA 3UL3A 1DE1A 1OAZA 3UBLA 1FHEA 5CAXA 4EO3A 3M9JA 4LLRA 2WDUA 2VCTA 4NWYA 1PKZA 2C4JA 3GRXA 2L6CA 3NOFA 3ZRDA 4IS0A 4K7NA 4L5LA 11GSA 3UARA 2YPMA 2LUSA 4IN0A 4G2EA 1B8XA 2YNXA 1SKSB 5A4VA 2B5XA 3E3EA 4NHWA 2NTOA 3O76A 4KUNA 3TKPA 4G9HA 2R2JA 2IN3A 2Z9SA 2YZHA 5IMDA 1M0UA 2H1AA 4PQHA 3WGXA 5GSTA 2CVDA 2H0HA 1E6BA 1G6WA 4FYUA 2ZUPA 3VWXA 1J08A 3MNGA 4I2TA 1USBA 1ACVA 3J7Yb 1QMVA 4MZBA 1UVZA 4MPGA 2R4VA 4HJMA 3ZIJA 1Z5YE 1SKWB 3LXZA 1O6JA 2NBSA 2KP2A 2H0GA 3PR8A 5ECLB 4GSNA 1VF3A 5ECOB 4WEYA 4YH2A 1GP1A 1H75A 3M9KA 4ECBA 4I5QA 4MPFA 1NSWA 1JZDA 1MD3A 1JFUA 1XWAA 2EIQA 1PMTA 1SJ6A 2FD3A 5D9TA 2H6XA 2H74A 1X9WB 4K7OA 3GL3A 4HI7A 4HQZA 1NHOA 1YF0A 2FWEA 2PWJA 4ID0A 1KEBA 3TJJA 5DCGA 5CNWA 4XTSA 1THXA 5E59A 1SJIA 3GMFA 3GV1A 4XRDA 1K0NA 4POMA 4MABA 3C1SA 3ED3A 4POLA 2LS5A 4ISDA 1XW6A 5HR2A 4IW9A 1MDJA 4KGIA 5HFIA 4TW5A 1AUCA 4TR0A 5CRGA 4F82A 3ZL5A 4GWRA 1VGLA 2B3SA 3ZLPA 1I5GA 3QD9A 2BMXA 3M0FA 1S3CA 4PUAA 4NPBA 2HSHA 22GSA 3HA9A 4MLYA 3N5OA 1JLVA 3FR9A 4MJAA 4X0XA 2ON7A 3I9V2 3G7IA 4Q5QA 1WJKA 2JZTA 5ECMB 1EP7A 4FYCA 2H66A 2IMEA 3KH7A 5DQSA 3ME7A 5G30A 2WULA 3FZ5A 1A8YA 2NPBA 1AXDA 1ZYEA 2R3XA 5B7CA 1TRWA 4KNDA 2OKAA 5AIVA 9GSSA 2LJAA 2FA4A 5KN0A 5AGYA 2PVQA 4MCUA 1FO5A 3I69A 1V2AA 3P7XA 3VI7A 2O87A 1FVJA 5IMVA 3D22A 3KXOA 2L57A 2V41A 1GLPA 1TI1A 2GZYA 1M2DA 2VL3A 3VK9A 1HNBA 2XC2A 1MD4A 2O8VB 3TUEA 3GHAA 2ES7A 1X9SB 4TR4A 3US3A 1HD2A 2R6KA 2AYTA 7GSSA 5ECSA 3KEBA 3ZFLA 1R26A 1EWXA 4MJBA 4KSMA 5J41A 1YKAA 14GSA 2M72A 2K9FA 2REMA 4RI6A 3W6GA 1OE7A 3KTBA 5IMCA 2HZEB 2X8HA 1GH2A 5IQYA 4KE3A 3CXGA 6GSXA 4F9ZA 2K18A 2GSTA 1PL2A 5IIZA 5ECNB 5IO0A 2VL2A 4IJ3A 1LJRA 3F4SA 1TDIA 1W4VA 1RW1A 2CT6A 2P31A 3A3TA 4JEDA 4AGSA 1A2JA 4IJIA 3IK7A 5LCZA 1Q4JA 3IV4A 2IMDA 1DUGA 3KTLA 2B5YA 4IVFA 3WGDA 2PU9C 5DALB 4HZ4A 2H73A 1X5CA 1XIYA 1ZL9A 2H6YA 2I9HA 1K3OA 3TJKA 1Z6MA 2XPEA 1ILOA 1OYJA 2I81A 1UN2A 2OACA 3J7Yk 3C1RA 2IMIA 4EL1A 2JL4A 1O8XA 2CX4A 5COHA 2RUEA 2VLVA 1W89A 3F63A 3RPNA 2M46A 2MMZA 1V57A 1EP8A 4XHMA 4KDXA 2B1KA 2OE1A 4MJCA 3F3QA 3UMAA 1M9BA 5CRDA 3EU4A 1NM3A 2YWMA 5JWRB 3TKQA 2IPAA 1ERVA 3I43A 4JE1A 4ZBDA 1ZCPA 4IGJA 4K1FA 1TP9A 1GTAA 4BVXA 1K0OA 3EINA 3KP8A 5J3RA 2PMTA 3L9VA 1B48A 3IOSA 4KCEA 4JBBA 3F3RA 3ZVJA 4MK3A 1SJZA 3Q74A 3BJ5A 4HQSA 5EL8A 1MDKA 1SK1A 1IYIA 3DWVA 1AQWA 2NVLA 4MF5A 3HY2A 4MDCA 3DVWA 2F9SA 5ECHB 2RLIA 2XPDA 3QFAC 4ACSA 1OKTA 4ML6A 2MBSA 5EY6A 2DJ1A 1PN9A 2FWGA 4F0CA 3L4NA 4TR1B 5HR1A 4ZBBA 3IAM2 1HNAA 4K0GA 2MBTA 3RHBA 1SL2B 1A23A 4XS6A 4YQUA 4PQIA 1FW1A 1SK0A 5HFGA 4D73B 1GSYA 1BX9A 2IFQB 3IE3A 5B8AA 5J4UA 5F07A 2C3TA 3IK9A 1F3AA 5D9VA 3QR6A 1EV4A 5F8BA 2OBKA 2PN8A 2G0FA 1T4YA 1PL1A 2O85A 3RDWA 3VWVA 1IYHA 1GSFA 4X1UA 2YWNA 2H8LA 2PVOC 5CREA 1SL1B 3HXSA 2GT6A 3QCPA 4N11A 4IBPA 5DDLA 4PX1A 3F8UA 3CTFA 3TCOA 4K0NA 4AJ6A 3VPTA 3FY7A 4I8BA 1UA5A 3I6AA 3LWAA 2XHFA 2HZEA 1SD9A 2NDOA 4GTUA 1KNGA 2X99A 1X0RA 5JWOB 4KB3A 3CYNA 3KM6A 1M2AA 1A0RP 3TB2A 4OMVA 4MZCA 1EV9A 4YAVA 3CSJA 4WXTA 2H19A 2LRTA 1SYXA 8GSSA 2OE0A 1YDKA 5GAPD 1DE2A 1URMA 1O7UA 5DALA 3VPQA 4XS4A 1CQHA 3TRPA 3ZMLA 4OO5A 2YN1A 3IXRA 3SWLA 2LRNA 2PBJA 1GSUA 4J2FA 2D2ZA 3LYKA 4V2NA 1WPIA 1XOAA 1XCCA 2N5BA 2VM2A 4F2IA 3E9JB 3M1GA 2R5GA 2C0DA 2CAIA 3IC4A 1Q98A 2MMNA 2KUCA 1WE0A 1XWBA 2LKUA 3C71A 2LJKA 5G31A 3VWWA 3ERGA 4EKZA 3O6TA 1QGVA 3DGQA 3PINA 6GSUA 2VCVA 4QL9A 5DJMA 3KD0A 3CSHA 2QSIA 4OO4A 3KGKA 4H86A 2OJLA 2GQKA 1QXHA 3MSZA 2FWFA 4ZB6A 5ABRA 4ZXGA 3BBYA 4QL7A 1DSBA 4G19A 4PGTA 5D73A 5IPHA 1Z7RA 2DIZA 3GX8A 1GULA 4IQ1A 2FY6A 2HE3A 2O89A 1EOGA 4TXOA 2PPTA 3GTUB 3ZYWA 3ZITA 2X64A 4O32A 2GZPA 4OWYA 4WR4A 1GUHA 3L0HA 1VF4A 5DBQA 2C1YA 5ECIB 3QPMA 4MF6A 1XXUA 3A2XA 1XOBA 2VLUA 2G2QA 4TR1A 4EF0A 1OVNA 1VRSD 1K0DA 1K0BA 4ZB9A 1XWKA 1S3DA 4GQCA 4D73A 1BJXA 2JSZA 2IFQA 4GQFA 1BAYA 3LG6A 4ZBAA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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