5ID2B

Asymmetry in the active site of mycobacterium tuberculosis ahpe upon exposure to mycothiol
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
157
structure length
157
Chain Sequence
HPMVMLNVGATAPDFTLRDQNQQLVTLRGYRGAKNVLLVFFPLAFTGICQGELDQLRDHLPEFENDDSAALAISVGPPPTHKIWATQSGFTFPLLSDFWPHGAVSQAYGVFNEQAGIANRGTFVVDRSGIIRFAEMKQPGEVRDQRLWTDALAALTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Putative peroxiredoxin Rv2238c
publication title Redox chemistry of Mycobacterium tuberculosis alkylhydroperoxide reductase E (AhpE): Structural and mechanistic insight into a mycoredoxin-1 independent reductive pathway of AhpE via mycothiol
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis h37rv
total genus 54
structure length 157
sequence length 157
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-02-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5id2B00
4POBA 2DJ3A 3EURA 1ZOFA 5LD0A 3M1GA 5F05A 3V1WA 3QD9A 1GTAA 5KEJA 1F9MA 4BPYA 6GSWA 3UBKA 1YEPA 3Q19A 5C00A 1XFLA 1VF2A 2LNSA 2VD0A 2YOIA 4LMWA 3VFIA 2M72A 4PXOA 1AQWA 5IOWA 2H0HA 5H5RA 1T4ZA 1YEXA 4NV2A 5DQSA 3GHAA 2PU9C 2KP2A 2K9FA 4JRRA 4PQHA 2MMNA 4FIWA 5KN2A 5GAND 1WP0A 4K7NA 5G1LA 1A0FA 3ZITA 4TW5A 1DE2A 4K7IA 1OC8A 2LQQA 4L0UA 1FOVA 4LL1B 1N8JA 2PUKC 2CX3A 2VCXA 3TRQA 1SJZA 5CP1A 5HR3A 1TI1A 2WCIA 4D73B 2XPDA 4MMMA 1K3OA 3KMOA 1G0TA 1ZYEA 1Y25A 2BMXA 3LG6A 4MABA 1BAYA 1XOAA 2F51A 1TXXA 2FNOA 3HHVA 2B7JA 2P5RA 2LKUA 2ALBA 4OFMA 3RPNA 5JWQB 1M2BA 3KGKA 1H75A 4I8BA 3FRCA 2CQ9A 3FR9A 4MF6A 3D4TA 2X64A 3JCML 3WT2A 2NTOA 5ECSA 3IK7A 2YWNA 3EC3A 4L5LA 3PINA 4BWQA 1X9SB 3VI5A 1HYUA 1GSDA 2IMIA 2C0DA 4HQSA 4IELA 1B48A 4JEDA 4HJ2A 5G1KA 1XW6A 4ZB8A 5IMVA 3M3MA 5J4UA 3A5WA 3WGXA 1WMJA 1XVWA 12GSA 2ZCTA 1B9YC 2XBIA 4NMUA 2C3TA 2VCTA 4E8EA 5IO2A 2VO4A 1DUGA 3LGCA 4GWRA 4RI7A 5IPHA 1TJDA 1JZWA 3C8EA 1Z9HA 5H5SA 1AXDA 2CVDA 3L9SA 2OE0A 2LJAA 16GSA 5B6NA 1ON4A 2LSTA 2LS5A 2I81A 2C80A 4GSSA 2YNXA 2OE3A 4HJMA 5CNWA 3GL5A 2JACA 4FYUA 4K0GA 5ECOB 1J08A 1O73A 4MCUA 4TR3A 1GTBA 1U3AA 2HRFA 2RM5A 4YQUA 4HZ2A 3FHKA 3F6DA 3EVIA 1XCCA 3GA4A 2FHEA 7GSSA 1XWBA 4ZL9A 5IIZA 1V57A 5KN1A 3A2VA 3APSA 3S9FA 2NPBA 1VRSD 2OACA 1GULA 2FWGA 1GTUA 5EY6A 1SK2A 1B8XA 1MDKA 1UVZA 3CMIA 1Q98A 3FR3A 1R7HA 3QFBC 3IAM2 2F9SA 1BYEA 5FHIA 3ERWA 1FVKA 1PN9A 5CRWA 3KTLA 2RUFA 1SL0B 3CXGA 4POMA 2HLSA 2P31A 4D73A 3LORA 2M80A 2WGRA 2H66A 2H71A 1R5AA 4YQMA 2H74A 2PBJA 5IM9A 1CQGA 4OFNA 2TRXA 4XS6A 5F8BA 4TR4A 2J23A 3F8UA 1SD8A 1XZOA 1YF1A 5DQYA 3CBUA 1DBYA 5D9VA 1XWCA 3Q74A 2PVOC 3WYWA 4EC0A 2VCWA 4Q5FA 1M2AA 3QR6A 4PQ1A 4EDYA 1F3BA 1SK0A 4ML1A 3GKNA 22GSA 1M2DA 2VM2A 5FWGA 5DVBA 4HU9A 1OC3A 2OADA 5DCGA 3LFLA 1XW5A 3KIJA 3ZTLA 6GSXA 2YWOA 2K8VA 4AJ6A 3J7Yb 1XIYA 1K0MA 2N5BA 4IQ1A 1WJKA 1ERTA 2K18A 1WRYA 5A4UA 4Q5NA 3FZAA 1X5EA 6GSTA 2WJUA 6GSUA 4KCAA 5H5QA 4YAVA 1U87A 4EF0A 5IMAA 1LU4A 4GXZA 3L4NA 3FEUA 4F82A 1QQ2A 2DJJA 2HT9A 3D5JA 1O6JA 1TU7A 4V2MA 3HVSA 2GQMA 4F0BA 5J5NA 4OWYA 4PNGA 5GSTA 3Q6OA 1LJRA 3D6IA 2H19A 2V41A 3SBCA 3W6GA 3KXOA 4K8MA 1OVNA 1GSUA 4LA1A 1MD4A 1PL1A 3F4TA 2H6XA 1B4PA 1TK5B 3IPZA 4ILFA 4GTUA 5KN3A 1OYJA 4WR4A 2RLIA 5DCHA 5HFKA 3BBYA 1T4YA 2DMMA 1YZXA 4O92A 2DC5A 2H1DA 2FGXA 2VUPA 1PKWA 3DKSA 2R3XA 1YDKA 3HYPA 1QUWA 1GLQA 1PKZA 1SYXA 5B8BA 4IW9A 4X43A 2PPTA 4ECBA 4HU7A 2XBQA 1SD9A 1HD2A 5IMCA 4ZXGA 2I4AA 5E59A 1WOUA 5L71A 3HVXA 1V98A 3ME8A 3HJPA 2HSYA 2H76A 1VF1A 1EP7A 2CV4A 3TJBA 4Z7XA 4ECJA 3UVTA 2IJYA 3LYKA 2HSHA 5ECIB 4K9ZA 2BJXA 3FKFA 1ACVA 5ECNB 1Y6EA 2H30A 1QXHA 2B1LA 2OBKA 1S3DA 4HDEA 3GKKA 3CRUA 1SENA 1EP8A 3ED3A 3P8WA 4MF7A 2V1MA 1OKTA 3GKMA 1JZDA 1JLVA 1A8YA 1RQMA 5AISA 3QAWA 4J2FA 1M7TA 2QKEA 5GAPD 2ON5A 3WD6A 2H1GA 2GSRA 1M9BA 4MDCA 1TW9A 2N5FA 2YJ7A 4FH8A 1TI3A 4I2TA 1ILOA 4Q5RA 1AAZA 3KM6A 3HZ4A 5EL8A 2B6MA 3UAPA 1XWKA 3ZFBA 1ML6A 3ZMLA 1K3YA 2VCQA 1XBSA 5G5FA 4WBJA 1Z7PA 3DVWA 5IQYA 1CQHA 5J3RA 4FO5A 1K0OA 2IWTA 1EGOA 3G7YA 3TKPA 3U6VA 5AN1A 4ZBAA 2FCHA 2VCVA 4TR0A 1GSEA 2KP1A 1GWCA 1OC9B 1URMA 2R37A 2WS2A 2R2JA 1SK1A 1BX9A 3EMPA 3GH6A 1Q4JA 3I43A 3IOSA 5D9TA 2G2QA 2HZFA 4TN8A 1Z7RA 3M9JA 2RIIA 1JZOA 3ZLPA 3GUSA 4NHWA 2YN1A 1AW9A 4K2DA 1A2MA 2J9HA 3IR4A 1AQVA 3L78A 3CYNA 1R5PA 3GRXA 1UC7A 1KBNA 4N11A 3O76A 2A4VA 2LRNA 2F3MA 3H1NA 3R2QA 1BQ7A 6GSSA 5FT3A 2NVLA 3TUEA 4MK3A 3TJKA 1T00A 4RI6A 1AIUA 2K8SA 1WPIA 1YKCA 1X9WB 4OD7A 2LTKA 3DGQA 1K0CA 3ISOA 5D96A 3KH7A 4PUFC 2Z9SA 3HJMA 4PX1A 2L59A 3GX0A 1THXA 1ST9A 3DYRA 5HR0A 2HE3A 2H0GA 3C7MA 1SKWB 3MAKA 3VWXA 5ID2B 3FZ9A 1PL2A 1U88A 3US3A 1UN2A 1BEDA 2E0QA 4TXVA 2L4CA 3F9UA 3DWVA 19GSA 1JZRA 3LSZA 4MP4A 5G2ZA 1ZL9A 5ECKB 3W8SA 2WB9A 2PMTA 2I3YA 2GLRA 2REMA 3DEXA 4DSSB 1R26A 2NDOA 4BWSA 2B5XA 2C3NA 5EVOA 1PX6A 2MZCA 1TU8A 2KOKA 5AIXA 3KTBA 2H75A 2C0FA 3E9JB 4TR1B 3UBLA 4XIHA 5ECLB 3GN3A 2L6CA 2B3SA 4N0VA 2P0GA 4GSTA 1GSFA 3EU4A 1X5CA 2IMEA 5G30A 4H86A 1I9DA 1OC9A 1KEBA 4KCEA 2HZEB 3TJFA 5IPGA 2JZSA 3ZRDA 2QGVA 1K0NA 4O7HA 2FWHA 1EEJA 2IIYA 2DMLA 4WETA 3LWAA 5D73A 4JBBA 1MTCA 4HS1A 4TKYA 4MA9A 3LJRA 1BG5A 1UA5A 3EMXA 2OE1A 1GRXA 3WGDA 3KJYA 1EEMA 4HI7A 1GNWA 4OO5A 1O7UA 1FAAA 1THOA 3FZ4A 2GS3A 2G0FA 1HNCA 2VL9A 2X8CA 1PD21 3GYKA 3CTFA 3ZIJA 1XXUA 4EE0A 2QSIA 2L4QA 3VPQA 1F37A 4EO3A 2FD3A 3GSSA 3WGEA 2PERA 2JADA 5JCUA 2CT6A 3KP8A 2WDUA 1T3BA 2LRTA 2VL3A 4ZBBA 2GT5A 4GRFA 2LEGA 4X1UA 2PVQA 2VOCA 2CVBA 3P7XA 1GH2A 1PX7A 2EIOA 2DBCA 3KCMA 1YJ6A 4HEA2 3LXTA 3IBHA 4BL7A 1M0UA 5ID2A 1K0BA 3IK9A 4YH2A 1S3AA 1Z5YE 3H93A 2D2ZA 1F2EA 4OFTA 2H70A 5IMDA 4NPBA 1ABAA 3ZIVA 4G19A 4OO4A 1A8LA 4RQXA 3QFAC 4DSSA 4O5RA 2WZ9A 5DDLA 1J0FA 2H73A 1FW1A 4ZILA 1ERVA 2YWMA 1RW1A 1TRUA 3HA9A 5D93A 4E8HA 1XW9A 3UEMA 2KHPA 2ON7A 3MSZA 4MZBA 3IE3A 3KMNA 4AF2A 8GSSA 3NIVA 2ES7A 3QDNA 4MJAA 1V58A 5AGYA 1F6MC 3TKSC 5F06A 1V40A 1PA3A 3MWHA 3F4SA 4XCSA 4MPGA 1HQOA 4F0CA 5E4WA 5ECQB 4GQCA 1Z3EA 4KNDA 2KLXA 5CAXA 1FB0A 3KEBA 3BD2A 5CYYA 5JWRB 4ZBDA 3HKRA 2IPAA 3BCIA 3C1RA 1GSSA 1T8EB 4L0WA 2HZEA 3PR8A 3NOFA 1YY7A 5IO0A 1GUMA 3IRAA 1WIKA 4F2IA 3BJ5A 2LJRA 3F3QA 2P5QA 5JCWA 3A2XA 1A23A 1A2LA 4ACSA 3K8NA 4KSMA 1TRVA 1VF4A 2VCZA 3GNJA 3NZNA 1GL8A 1SJIA 1XVQA 4KE3A 1PMTA 3QAVA 5G5EA 4KA0A 4WXTA 5DJLA 3F0IA 3EYTA 5GZZB 2CA8A 3L9VA 1OAZA 4EKZA 4NXIA 2C0GA 2HXKA 5B8AA 2JZTA 1G7OA 1V9WA 2RM6A 2LV3A 3ZVJD 1G6WA 2WULA 3IAS2 4N30A 2VIMA 2JL4A 2QC7A 2LQOA 2IFQB 3ME7A 2GZZA 4IS0A 2YANA 1TOFA 5DJMA 5A4WA 4MJEA 5KN0A 1YQ1A 4NAXA 3UMAA 2FY6A 2YZHA 2C8UA 3ZMKA 1B4QA 4WR5A 1MDJA 2VAFA 4XS4B 4ZL8A 3G7JA 4YQVA 3GV1A 3H4KA 4KUNA 2DLXA 3P90A 1O8WA 4I97A 3QOUA 2O7KA 1YF0A 1QK8A 3VK9A 2MBSA 4F9ZA 4MF5A 4IKHA 4IJ3A 2EIQA 2H0IA 5IOXA 2AJQB 6GSYA 4MZWA 4GLTA 1SJ6A 2BTOT 1SU9A 1K0DA 1O85A 4WKWA 2ZNMA 4ZB9A 3TJGA 4RUVA 3IC4A 3ZREA 2E2GA 3F3RA 4HZ4A 4BA7A 3W8JA 3OR5A 2H1BA 2DIZA 1LBKA 2XHFA 2LUSA 3D22A 3TDGA 3CSHA 4POKA 3APQA 3P2AA 4ID0A 3ERGA 3ZVJA 1WWJA 2XPEA 2AUVA 1TK0B 5DAKB 1S3CA 4GQFA 1SL1B 3KZQA 4X0XA 2MMAA 1GTIA 3PH9A 4V1Ag 1DE1A 1AUCA 1GP1A 5ELGA 1MDIA 3D21A 2H8LA 4V1Ap 2O85A 4TOPA 4IN0A 3QPMA 3L9UA 1GSQA 3RPPA 2FWFA 4I2UA 2MMZA 3IA1A 1H4OA 1X0RA 2L5LA 2YV9A 3SWLA 2OBIA 5D9WA 2JZRA 2PGTA 2TIRA 3J7Yk 1HNAA 2GQLA 3HXSA 2JSYA 2X8GA 1SL2B 4GF0A 1A0RP 3LXZA 3N5OA 1KTEA 2VL2A 4OMVA 3DRNA 3UVHA 3RBTA 4CHSA 4GCIA 2HFDA 1FB6A 2FUG2 2V6OA 3C1SA 1SYRA 5AIVA 3U5RE 4FYBA 3TRXA 3TCOA 2AYTA 3ZL5A 3I9V2 3L0HA 5INYA 3IV4A 2CVKA 3WT1A 3EE2A 2IFQA 4QQ7A 2DJKA 10GSA 2GSQA 4XRDA 4KH7A 2B5YA 1U6TA 3C71A 2H01A 4FYCA 1W4VA 3CSIA 1FG4A 2EIRA 3M9KA 3F4RA 2MBTA 1FVJA 4XS4A 3QCPA 1KNGA 5J9CA 2GSTA 3PGTA 4IJIA 3RHCA 2C4JA 2C3QA 1PRXA 1J9BA 4KDUA 3BOAA 2YV7A 1EOHA 5D9XA 4CW9A 4POLA 1ZGNA 3TRPA 4KAEA 1W89A 2GZYA 4LMVA 2MYGA 1XWGA 5GSSA 1ZCPA 4PGTA 3DIEA 2CAIA 1XPVA 1MEKA 3GIXA 5HFGA 3IXRA 2GSSA 3VLNA 2O89A 1WE0A 2H6YA 4MJCA 2E2MA 2V2GA 3GMFA 2DSAA 1R4WA 1ERUA 4MPFA 1TDIA 3GSTA 6GSVA 3CSJA 4EXJA 5G31A 1QMVA 3HJOA 2CAQA 2GGTA 1AQXA 1N2AA 1O81A 1NW2A 2L57A 3LQ7A 2JSZA 1M99A 5DAKA 4NHZA 5LNKe 4ZIJA 1OE8A 4ECCA 1T1VA 4ULXA 2I1UA 1T7PB 1FHEA 2DJ2A 4K6XA 1K3LA 3QMXA 1VGLA 5J9BA 4QL9A 3FZ5A 1AC1A 3FY7A 2C0EA 5A5KA 2PN8A 2E7PA 1GUKA 4MLYA 2F8FA 2YWIA 2V32A 4N0ZA 3DMLA 4IGJA 3A3TA 4JE1A 2IMDA 5DALB 3CTGA 1BJXA 2H1AA 3GL3A 3VWVA 3HY2A 1TKDB 1EV9A 2IL3A 1EV4A 4MJBA 18GSA 5F0GA 4TVEA 1YKAA 1M9AA 3MNGA 1F3AA 2O87A 17GSA 3EINA 2PWJA 4G9HA 5IMZA 4TXOB 3DVXA 5IMFA 2FA4A 4RQRA 1FO5A 1EZKA 13GSA 1E6BA 3GH9A 4XTSA 3ZYWA 14GSA 3TOTA 9GSSA 4LLRA 3VWUA 4K7OA 3KH9A 2O8VB 4JR4A 5ECMB 4IVFA 3C73A 4AJ8A 2A2RA 2NBSA 2RUEA 2JU5A 2GZPA 4WBRD 4NV5A 5HR2A 1GSYA 1QGVA 1XOBA 3F63A 5EPFA 5ELAA 4L8EA 1U3IA 3KD0A 5HQPA 3A2WA 4KSOA 2HI7A 2H6ZA 3IHQA 4OCEA 3AY8A 5DBQA 4ML6A 4NWYA 3GX8A 2X99A 1NSWA 4QL7A 3UL3A 2H72A 1DSBA 1XWAA 3UJ1A 2L6DA 1O8XA 2YJHA 2R4VA 2VM1A 1JHBA 2R5GA 5B6MA 4EDZA 1Z6MA 4I5QA 1USBA 4WEYA 1PGTA 1X5DA 3HCZA 2CZ2A 4CDOA 4MZCA 3F6FA 3GTUB 4WF5A 4P3YB 2K6VA 2C1YA 4J56E 4BVXA 3Q18A 3KP9A 5HFIA 5HR1A 1V2AA 2AAWA 4EVMA 3VPTA 4IP6A 3M8NA 3FYGA 4XHMA 2VD1A 1C72A 1EOGA 4PNFA 1E2YA 3TJJA 4EUYA 2L5OA 4JU5A 3CRTA 3EWLA 2LRCA 4MH3A 3ZFLA 4IQAA 2B5EA 4G10A 2OJLA 4J57E 1EGRA 3D0ZA 4TR1A 1NM3A 1SKSB 4KDXA 3TKRA 3UOMA 4IHUA 4O32A 1OKDA 2HRNA 2GQKA 3H8QA 3HZ8A 1OE7A 1JFUA 4OCFA 1ZYQB 5ECRB 5C04A 2VLUA 4N10A 3LYPA 4PQIA 1NHYA 2HNLA 2XC2A 5DALA 1G7EA 2GDRA 3LEFA 5J41A 4IBPA 1TP9A 3QAGA 2V6KA 5B7CA 3UIWA 2YCDA 4KDYA 4TXOA 3MDKA 2MMOA 4KB3A 3VWWA 4KGIA 5A4VA 4HOJA 2A2SA 2GT6A 4AJ7A 3HDCA 4G2EA 4KW6A 3HVVA 1Z6NA 1EWXA 5CREA 2YPMA 5F07A 4IP1A 1PSQA 2VLVA 2AB6A 4TRXA 4DSQA 2I9HA 1IYIA 3FK8A 4JZQA 5CRGA 4AGSA 2IMKA 1GUHA 2DJ0A 2VLTA 4LL4B 4MH2A 2DJ1A 2VL2C 4PURA 2B7KA 4ZB6A 1ERWA 2LJKA 5JWOB 3TGZA 1QFNA 4HUAA 3GURA 4I6XA 4EL1A 2GTUA 2B1KA 5ABRA 4L5OA 3GTUA 4ZL7A 1I5GA 2WRTA 4KX4A 5ENUA 4GSNA 2WFCA 1SKRB 3RAZA 2X8HA 3TKSE 3TKSA 2HYXA 2FLSA 3TB2A 3VI7A 1TRWA 2LNTA 3IDVA 3RDWA 2M46A 3E3EA 3VURA 3DXBA 1HNBA 1JLWA 5JCGA 3E0UA 3FR6A 1VF3A 3O6TA 5CRDA 2N5AA 2F8AA 3G9BA 5D8IA 1IYHA 5CO3A 2IN3A 4ISDA 2FWEA 5ECPB 3RHBA 4DEJA 1GNEA 2CX4A 4PUAA 3FW2A 1K0AA 2CZ3A 4JR6A 3D4MA 1A24A 2ZUPA 1MD3A 4YAPA 3M0FA 1TK8B 2AHEA 3UARA 3TOUA 1TTZA 1NHOA 4ECIA 2R6KA 1TRSA 3I6AA 4HQZA 4K0NA 4K1FA 3DD3A 4XRAA 1G6YA 1RK4A 3TKQA 2KUCA 5LCZA 4DSRA 4XS1A 2FA8A 2YP6A 3G7IA 3ZZXA 2GVPA 2DIYA 4V2NA 3EU3A 4Q5QA 3APOA 11GSA 5ECHB 3HD5A 1GLPA 3I69A 3BCKA 2OA7A 3N9JA 1ZZYA 2IMFA 5COHA 3GFKA 4DVCA 1ZMAA 2TRCP 5CRHA 3ERFA 3H79A 3O3TA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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