5ID2B

Asymmetry in the active site of mycobacterium tuberculosis ahpe upon exposure to mycothiol
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
157
structure length
157
Chain Sequence
HPMVMLNVGATAPDFTLRDQNQQLVTLRGYRGAKNVLLVFFPLAFTGICQGELDQLRDHLPEFENDDSAALAISVGPPPTHKIWATQSGFTFPLLSDFWPHGAVSQAYGVFNEQAGIANRGTFVVDRSGIIRFAEMKQPGEVRDQRLWTDALAALTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Putative peroxiredoxin Rv2238c
publication title Redox chemistry of Mycobacterium tuberculosis alkylhydroperoxide reductase E (AhpE): Structural and mechanistic insight into a mycoredoxin-1 independent reductive pathway of AhpE via mycothiol
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis h37rv
molecule tags Oxidoreductase
total genus 54
structure length 157
sequence length 157
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-02-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5id2B00
1RQMA 5L71A 1QXHA 4HZ2A 5EVOA 4MA9A 3UEMA 3DRNA 3DVXA 5ECPB 3D4TA 3ZMLA 2LNTA 2YANA 1XCCA 4KCAA 1JZRA 2GGTA 1AQXA 1VF2A 7GSSA 6GSUA 1V98A 5CO3A 2YPMA 2P0GA 3G7JA 5G1LA 1DE2A 1FO5A 4G2EA 1JZOA 1WJKA 3ZFLA 3J7Yb 1SL0B 2K6VA 4MCUA 1K3OA 1OC9A 1PX6A 2MMZA 3GYKA 1BYEA 1TK5B 3ZTLA 4WBJA 4NAXA 2R3XA 2E2GA 3APOA 3TRXA 2C0GA 5AGYA 3IXRA 1U6TA 4FO5A 1LJRA 1A8LA 2FWEA 5G2ZA 3UARA 1ML6A 1EOGA 1EZKA 2GZYA 1M9BA 2C80A 1XW9A 2JZRA 3DWVA 9GSSA 5DCHA 2LQQA 2OE3A 2REMA 4J57E 1PL2A 2LNSA 1DE1A 3L9SA 4V2LA 1PN9A 3APSA 3G7YA 3CMIA 1A0FA 2PBJA 3MWHA 1GUMA 1SYXA 5ID2B 2DLXA 5ELAA 4ZL8A 1ILOA 3ERFA 1T4ZA 2GVPA 4POMA 1FOVA 2C3NA 3GN3A 4GLTA 2GDRA 3O76A 5EPFA 3ZZXA 1TKDB 4NV5A 1A2MA 4N0VA 4MK3A 2WFCA 2CX4A 2FHEA 1PL1A 2GSTA 3KP8A 2KP1A 1YEXA 3TKQA 1QUWA 2MYGA 4E8HA 1U3IA 3KD0A 3TRPA 3FZ4A 1ON4A 4IKHA 2DJ1A 1K3YA 4MH2A 2WGRA 4KH7A 4IJIA 5KN1A 2R6KA 1T3BA 2PERA 1R7HA 2G0FA 2L5OA 2BTOT 4KB3A 5IOWA 1B9XC 3V1WA 2M72A 3P7XA 4G19A 1OC9B 1SK0A 1UC7A 4HU7A 3VWVA 4HQZA 4EF0A 1SKRB 2WS2A 2HSYA 2JU5A 1F9MA 1Z7PA 1Z7RA 4PUAA 1ACVA 2YCDA 4DSRA 2DJ0A 2PVOC 2CT6A 3I9V2 4CDOA 5D9WA 1K0CA 2Z9SA 4HZ4A 1EP7A 3IC4A 5HR2A 1H75A 4PQIA 4GCIA 1U87A 1XWCA 2LEGA 2QC7A 1TRWA 4XRAA 3LORA 5F06A 2BJXA 2YJHA 1AIUA 5H5SA 4PX1A 2ON7A 5LD0A 3VI5A 2H1AA 4MJEA 1W4VA 2H6ZA 1XWAA 2FGXA 1OAZA 1Q98A 2IMIA 1X5DA 3FKFA 1ZGNA 4MJCA 1AC1A 5AN1A 5HFIA 3IBHA 1GUHA 3GX0A 3UMAA 3ED3A 3EYTA 4ILFA 3TKSC 4HDEA 1PKWA 2IFQA 1GTUA 1K3LA 2V6KA 4H86A 2GT6A 4K7IA 5HFKA 3A5WA 3MDKA 2RIIA 4YAVA 3IK9A 2HXKA 3C1SA 1OE7A 4K7NA 2CVDA 3TJJA 1NW2A 3ERGA 2J9HA 4KCEA 3BD2A 3IAS2 3IK7A 3F6DA 4DEJA 4D73A 3IHQA 1JHBA 2DJ3A 4V1Ag 2LJRA 2H6XA 2KOKA 2ZNMA 3GNJA 1MDKA 5IMFA 4HJMA 1YQ1A 4IP1A 2FY6A 2FLSA 2C3QA 1YF0A 3L0HA 3GKKA 3W6GA 2YP6A 2RM6A 1XOAA 2WJUA 3KJYA 5A4UA 1YZXA 2GSRA 2FUG2 4PNFA 3DGQA 3TUEA 3US3A 4AJ8A 4ECBA 4AJ6A 4NXIA 3GURA 3C73A 3F4SA 1AW9A 3A3TA 3GA4A 4MPGA 1THXA 5ECIB 5CP1A 4OFMA 1ZYEA 2B6MA 3I69A 1JFUA 4RQXA 3A2XA 3QOUA 5KN2A 1TJDA 1F6MC 3TJBA 1PQNA 2OE0A 1ZYQB 4I6XA 5JCUA 1FHEA 1OVNA 2H0HA 3D22A 5A5KA 3BBYA 5CRDA 3CSHA 2HE3A 3IA1A 2IFQB 2K18A 2X8HA 3VK9A 2ON5A 5CYYA 4TR1A 3EWLA 1YKCA 4KE3A 2CVBA 5GAPD 2CA8A 1WRYA 3QMXA 1W89A 2GQMA 1TRVA 5G5EA 4OCEA 5DJMA 3PR8A 1KBNA 4D73B 3CRUA 1AXDA 1GSSA 1R5AA 4O7HA 1XWBA 2O89A 3AY8A 1NM3A 3TDGA 4ML1A 2KLXA 3OR5A 5B8BA 1QQ2A 4GQFA 2NPBA 1SJIA 3G7IA 5IMVA 1EWXA 3U6VA 2R4VA 2CX3A 1B8XA 5CRHA 4IQAA 4GSSA 3L9UA 4P3YB 1A2JA 3QR6A 1G6YA 2DJ2A 4E8EA 1A2LA 3EINA 4PNGA 3TOTA 1SJ6A 5F0GA 5JWRB 2K9FA 19GSA 2DSAA 4V2NA 3WGDA 1YDKA 5GSSA 1PMTA 1ABAA 5J9CA 3LQ7A 3LYPA 1JLVA 1NHYA 3TKPA 3KXOA 4MJAA 1RW1A 3FZ5A 1KEBA 1UA5A 3HCZA 4HJ2A 4JZQA 3ZRDA 2B5EA 1O7UA 4TXOA 1HYUA 2F51A 4GXZA 2IWTA 2H01A 2K8VA 1O6JA 1R26A 3HYPA 2HSHA 4NMUA 5IPGA 4XS1A 2AJQB 3RHBA 4FYCA 3ZREA 17GSA 4KNDA 1WP0A 1BQ7A 3NZNA 4BVXA 1AUCA 5EL8A 1KTEA 1K0DA 2AV4A 1GNEA 3HXSA 3GHAA 3QD9A 5D8IA 4GF0A 2RLIA 3GL5A 1GSYA 1OC3A 4EE0A 3M8NA 1WOUA 2HRFA 4MZBA 5GAND 2YWOA 1AQWA 3ZFBA 4G9HA 5LNKe 1GH2A 3DD3A 4HU9A 1GSEA 1M99A 1X5EA 4ECIA 5CAXA 2A4VA 4OCFA 4POLA 1A8YA 2X8GA 3Q74A 1THOA 2RUEA 2E2MA 2X99A 4KDYA 4X0XA 3LSZA 2DMLA 1GTIA 5F07A 3EMPA 4PUFC 2DIZA 2AAWA 1Z9HA 5ENUA 2B7KA 2ES7A 2EIRA 2QSIA 4KDUA 3PGTA 4K1FA 1V40A 10GSA 1YEPA 2X64A 1TU8A 2MBTA 4F03A 4IN0A 2HYXA 5A4WA 2OBKA 2I3YA 4XS6A 18GSA 1YKAA 3EE2A 2GQLA 1E2YA 1FG4A 3F8UA 3J7Yk 3ZITA 1B4QA 4Z7XA 4MLYA 5FHIA 2AB6A 5E4WA 4HEA2 4MMMA 1X9MB 1TDIA 1GLQA 3FYGA 4LL4B 3GSTA 3KCMA 1SK2A 4TXOB 2WRTA 4PGTA 1HNAA 4V1Ap 5D93A 3NIVA 3JCML 1GSDA 4F82A 1LBKA 4BWSA 1GUKA 2D2ZA 3GTUA 3GUSA 4GTUA 4OFNA 1TK8B 5D9VA 2JZTA 4XTSA 1O85A 1YF1A 4X43A 2PMTA 4RQRA 4BVYA 2K8SA 5F8BA 3WD6A 3W8JA 2HLSA 3RBTA 2GLRA 4MZCA 1MD3A 1XWKA 4TR4A 1MD4A 1OKTA 3TB2A 4DSSA 5D73A 1FAAA 5C04A 4MF7A 1XWGA 2GSSA 4IP6A 1O8WA 2PGTA 1QK8A 3UL3A 3TJKA 2DIYA 3EU3A 4KDXA 5HFGA 2OJLA 2MBSA 1SL1B 1T1VA 4RI6A 4J2FA 1F37A 1MTCA 2P5RA 3ISOA 3FHKA 4KSMA 3WT1A 1Y25A 2GZZA 2VL2C 2YZHA 4ZL7A 4EDYA 5B7CA 3LG6A 2YN1A 2XHFA 3D21A 3CYNA 2NBSA 2VCXA 3C7MA 4WETA 1Y6EA 4GWRA 3CSJA 2ZUPA 3D0ZA 3FR9A 1HQOA 3FZAA 4N30A 2B5XA 2HI7A 1OKDA 4JR4A 1G0TA 3IAM2 2CAQA 4AGSA 1GRXA 2H30A 3KM6A 4XRDA 2H19A 3VWUA 1M2BA 2C3TA 2I9HA 2JSZA 2VOCA 1T4YA 2DC5A 3GTUB 1WMJA 4V2MA 1GWCA 2F8FA 3WT2A 4EO3A 5ECHB 2PUKC 1BJXA 4ZIJA 4NV2A 2C0EA 5HQPA 4F9ZA 3I6AA 3C8EA 4EC0A 3M9JA 1B9YC 2L6DA 3ZLPA 2KP2A 2WCIA 2FNOA 1F2EA 1SU9A 2CZ3A 2JADA 3KH7A 5AISA 5AIVA 4JEDA 1J0FA 1WPIA 1V2AA 5D9TA 1FB0A 4POBA 2JACA 4TVEA 1BX9A 4J56E 3GFKA 1TXXA 5ECSA 2KUCA 3DEXA 3SBCA 3C1RA 4TKYA 4KAEA 2YJ7A 1ZZYA 1GLPA 1ST9A 2VLUA 4I2TA 3TOUA 4JU5A 1ERUA 1I5GA 5J41A 2WDUA 6GSYA 3F6FA 3N5OA 3HZ8A 1FW1A 3SWLA 1NSWA 3HKRA 2PU9C 4F0BA 4IVFA 4ECJA 2HFDA 20GSA 3F9UA 4QL9A 1VF1A 2C8UA 4JE1A 2V41A 1BG5A 3E0UA 4IHUA 5HR1A 4YAPA 5ECMB 5DQSA 5DAKA 5DALA 4K7OA 3NOFA 2RM5A 4POKA 3FW2A 2ZCTA 2VD0A 1A0RP 2QGVA 1PX7A 3EC3A 3Q19A 1H4OA 2N5BA 6GSWA 1XW6A 4WR4A 3IPZA 2B7JA 3TJFA 1XVQA 1O81A 2LRNA 4I2UA 4ZBBA 3ERWA 2B3SA 2M46A 3LFLA 2GSQA 1FVJA 3MNGA 1SYRA 3HY2A 3IDVA 4OWYA 1SD9A 2N5AA 5ECLB 4L0WA 3Q6OA 1K0BA 3HA9A 2GS3A 1SKSB 1S3DA 5H5RA 2VM2A 1TI3A 3DYRA 4ZL9A 1C72A 2NVLA 2L4QA 5G1KA 1XW5A 1M9AA 2XPEA 3M0FA 2O7KA 4NHZA 2LUSA 5A4VA 1U88A 5B6NA 3ZVJD 5KN0A 4ZB8A 4K9ZA 2LQOA 2MMAA 3HVSA 2L59A 1B4PA 1TRSA 3VWXA 3QAWA 3VWWA 1SL2B 4OMVA 1Z3EA 4XHMA 4FYBA 3DKSA 3WGXA 2YV9A 1ZL9A 4WR5A 5KEJA 2V2GA 4GSNA 1ERVA 5IPHA 1M0UA 5DDLA 4K0NA 3QFAC 4EUYA 4JR6A 3APQA 1XFLA 4ZB6A 2M80A 2EIQA 3CTGA 2PN8A 4K8MA 1VRSD 4BA7A 4ZB9A 1WIKA 1R5PA 4ID0A 3M3MA 4HUAA 3ME8A 3GH6A 5DAKB 5DALB 3BJ5A 3LEFA 1URMA 4IGJA 2CVKA 2FWGA 2TRXA 2GQKA 3TCOA 2VCZA 5INYA 2DJKA 5DCGA 4L5OA 1R4WA 2FCHA 1GNWA 2FD3A 2FA8A 2H66A 5IMCA 3IR4A 4WF5A 2PPTA 4BWQA 1M2DA 2VM1A 2B5YA 5GSTA 4O5RA 5IMAA 6GSTA 3GIXA 5IQYA 5IOXA 3EU4A 4KUNA 3K8NA 3UAPA 2LJKA 4O92A 4YQVA 1WWJA 1V9WA 4X1UA 1ZOFA 2VLTA 2TRCP 5G30A 2H0IA 3ZIJA 3H1NA 2J23A 4XCSA 4O32A 2JL4A 3F3RA 22GSA 1X5CA 2I1UA 4MJBA 1TK0B 3M1GA 5JWQB 2LKUA 2V32A 5J4UA 1SENA 2H70A 5COHA 2F9SA 2NDOA 3PINA 3IE3A 2IMKA 3FY7A 3R2QA 2LRCA 3WYWA 3DIEA 4ML6A 1YJ6A 1G6WA 3TKRA 4TR1B 6GSXA 3A2WA 2VCTA 1ERWA 3A2VA 3HD5A 3D4MA 2A2RA 1SJZA 1TOFA 5IM9A 4K2DA 2OKAA 5DVBA 3P90A 3FEUA 5D9XA 3UVTA 1QGVA 2RUFA 5ECKB 2IN3A 3MAKA 2NTOA 1OYJA 3Q18A 3IRAA 4GRFA 1DUGA 4WKWA 1O8XA 4NHWA 3W8SA 1JZWA 4AF2A 3LXZA 3FK8A 1EV9A 1XXUA 1S3CA 3VPQA 2PVQA 2YNXA 1GSQA 4HS1A 2HNLA 4ECCA 4N0ZA 3TGZA 4IJ3A 1T7PB 2XBQA 4IBPA 4IW9A 2CAIA 4N11A 4AJ7A 4WBRD 4BPYA 2YWIA 2YZUA 4IS0A 5DBQA 1JLWA 1FVKA 3HJMA 1GTBA 2R5GA 2QKEA 4Q5QA 6GSSA 2HRNA 2BMXA 1CQHA 3UJ1A 4I8BA 4LMVA 3F0IA 5G5FA 4KX4A 4EL1A 2IMFA 2H74A 2V1MA 4EKZA 1GP1A 4TOPA 5IMDA 4I5QA 1UN2A 2HT9A 3ZYWA 1N8JA 3UBKA 5IO0A 5C00A 4L5LA 1ZCPA 3DVWA 1TU7A 4TN8A 3GKNA 1WE0A 2OADA 4FYUA 3TKSE 1SD8A 4Q5FA 4WXTA 4MP4A 1VGLA 1GL8A 3CXGA 3FR6A 3LGCA 1V57A 2CV4A 3LJRA 5JCWA 4KSOA 5DQYA 1SK1A 4WEYA 2O8VB 2R37A 4ZILA 3EVIA 1EP8A 1Z6MA 4WF4A 1ZMAA 2HZEA 3HJPA 1LU4A 5ELGA 3L78A 3TKSA 1DBYA 1T00A 2H72A 1BEDA 4TRXA 4LL1B 1QMVA 1S3AA 1XVWA 4ZXGA 2E7PA 1ERTA 1F3AA 12GSA 3N9JA 1GTAA 1DSBA 2GZPA 2VLVA 3P2AA 5ECQB 5J3RA 16GSA 2CZ2A 3GX8A 3CRTA 1EEMA 2F8AA 3VI7A 3C71A 1GSFA 2OA7A 3HZ4A 2VL9A 1PKZA 3KH9A 4JRRA 4KGIA 5DJLA 2H6YA 3LYKA 3WGEA 4EVMA 5GZZB 1M2AA 1V58A 5ECRB 2I4AA 4HI7A 1XIYA 4RUVA 3QCPA 4MABA 2V6OA 1X0RA 1TW9A 2IPAA 5HR3A 4KA0A 4CW9A 5AIXA 3G9BA 2P5QA 3O6TA 1AAZA 4TXVA 3KP9A 3ZVJA 1MDIA 1XBSA 1KNGA 3GMFA 3GV1A 1Z6NA 3EMXA 2H1DA 4YH2A 2L4CA 3PH9A 1PSQA 1RK4A 5B8AA 2LSTA 2FWHA 5F05A 11GSA 2VO4A 1QFNA 1FB6A 1CQGA 3RPPA 2TIRA 4ZBDA 2ALBA 5FT3A 1XZOA 3E9JB 5JCGA 5ECNB 1O73A 2WULA 5J9BA 4DSSB 1EGRA 3DXBA 3TJGA 2HZEB 2H1GA 3ZL5A 2VCWA 1A23A 2YOIA 2LV3A 2GTUA 4PXOA 4TR3A 3QAVA 2VCVA 1PA3A 2AUVA 3RDWA 4CHSA 3H8QA 1AQVA 1TRUA 3KMNA 4DSQA 3GKXA 3FZ9A 1X9WB 1XPVA 4TR0A 1HNBA 5D96A 2IL3A 4ZBAA 5HR0A 5LCZA 2VD1A 1OE8A 1PD21 2A2SA 2OBIA 4EDZA 1YY7A 2H75A 3MSZA 1K0OA 2GT5A 1I9DA 3CBUA 4IQ1A 2PWJA 5CRGA 4FIWA 3P8WA 1SKWB 4G10A 2IMEA 3QAGA 2P31A 3BOAA 2B1KA 4YQMA 3CSIA 3I43A 2VIMA 5JWOB 3L9VA 1TP9A 1G7EA 2HZFA 2LS5A 4YQUA 3VURA 1VF4A 1GSUA 3LWAA 2JSYA 3BCIA 4GQCA 4MF6A 4MZWA 1IYHA 4NWYA 2AHEA 3UVHA 4QQ7A 5CREA 4Q5NA 3L4NA 1F3BA 4HOJA 2DJJA 3D6IA 4OD7A 5J5NA 5EY6A 4NPBA 4XIHA 4L0UA 2L5LA 1GULA 1EEJA 1OC8A 2KHPA 3VPTA 1E6BA 4L8EA 2H1BA 3KEBA 2B1LA 3DMLA 1PRXA 3QFBC 4FH8A 2C4JA 4IELA 1N2AA 4MH3A 14GSA 3KZQA 3ME7A 3H4KA 1HD2A 4ACSA 3D5JA 1NHOA 3KIJA 1EOHA 2O85A 1TTZA 3FRCA 3O3TA 2VL3A 1UVZA 2XPDA 1B48A 2N5FA 2IMDA 4XS4A 4BL7A 3HVVA 2VCQA 1X9SB 5IO2A 1XOBA 4TW5A 3GKMA 2O87A 2VAFA 3CTFA 3F4RA 4F2IA 2LTKA 5G31A 2OACA 3FR3A 1T8EB 2FA4A 3EURA 2YWMA 3GSSA 4OFTA 1K0NA 2X8CA 3ZIVA 2VUPA 5CRWA 5IIZA 3RHCA 5KN3A 2G2QA 2H76A 3KTBA 2IJYA 3F4TA 1MDJA 2C0FA 1A24A 3H93A 2DBCA 2I81A 2WZ9A 4ULXA 3VFIA 4JBBA 5CNWA 3S9FA 1HNCA 8GSSA 1Z5YE 3GL3A 4DVCA 3HDCA 3F3QA 1M7TA 3KMOA 2MMOA 3QDNA 2JZSA 2OE1A 5B6MA 1G7OA 4PURA 2CQ9A 1USBA 2H71A 3LXTA 1J08A 3VLNA 1VF3A 4OO5A 2DMMA 2XC2A 13GSA 2LJAA 1K0AA 3BCKA 3IV4A 4PQ1A 5H5QA 4EXJA 4ISDA 3U5RE 3UBLA 2F3MA 2YV7A 3KGKA 3ZMKA 1JZDA 1J9BA 1EGOA 2C0DA 2XBIA 4MDCA 2H8LA 3F63A 3E3EA 5E59A 4XS4B 4KW6A 2EIOA 2IIYA 1PGTA 4K0GA 3H79A 4K6XA 5ABRA 1MEKA 2YWNA 3IOSA 4LA1A 3HJOA 3UOMA 4MPFA 2H0GA 2L6CA 4RI7A 5FWGA 3RAZA 2E0QA 3UIWA 5IMZA 2LRTA 1EV4A 3KTLA 3HHVA 2EC4A 3M9KA 2MZCA 1Q4JA 2VL2A 1K0MA 4MF5A 1IYIA 4LLRA 4N10A 2FWFA 2AYTA 2L57A 4QL7A 5ECOB 3TRQA 2H73A 2MMNA 4Q5RA 4GSTA 3GRXA 2C1YA 4LMWA 6GSVA 3RPNA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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