2FWEA

Crystal structure of the c-terminal domain of the electron transfer catalyst dsbd (oxidized form)
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
122
structure length
122
Chain Sequence
HLNFTQIKTVDELNQALVEAKGKPVMLDLYADWCVACKEFEKYTFSDPQVQKALADTVLLQANVTANDAQDVALLKHLNVLGLPTILFFDGQGQEHPQARVTGFMDAETFSAHLRDRQPHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein dsbD
publication title High-resolution structures of Escherichia coli cDsbD in different redox states: A combined crystallographic, biochemical and computational study
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Oxidoreductase
total genus 43
structure length 122
sequence length 122
ec nomenclature ec 1.8.1.8: Protein-disulfide reductase.
pdb deposition date 2006-02-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13899 Thioredoxin_7 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2fweA00
4Q5NA 2TIRA 3RAZA 3TRPA 3CYNA 1O85A 3UVTA 2HRFA 3GSSA 2XBQA 3M8NA 2HRNA 1EEMA 1X9SB 3RHBA 4PQ1A 3HDCA 3VWWA 4OFTA 2HI7A 4LMVA 4F03A 5AGYA 5IOXA 5H5SA 4BWQA 1ZYEA 4XTSA 1VRSD 2F9SA 3BCIA 5D9WA 4FO5A 1A8YA 2H73A 4TR0A 3ZL5A 1CQGA 1S3DA 2F51A 4JEDA 12GSA 5JWOB 4PGTA 1FO5A 1N2AA 2GT6A 1R4WA 2N5AA 3DVWA 2LKUA 1WE0A 5E59A 9GSSA 5H5RA 4EKZA 3CBUA 4DVCA 1EP7A 4EVMA 3VURA 1K0OA 3VWVA 1HQOA 3GKNA 1NW2A 1JFUA 4IP1A 4WF4A 2C0FA 2E7PA 2VL3A 3I6AA 2LRCA 1TI1A 5ID2B 3UL3A 1ACVA 4X1UA 1GSSA 1G6WA 2GDRA 2XC2A 4TR4A 2MYGA 1Y25A 3CTFA 4DSSA 1A0RP 2E2GA 2EC4A 4IJIA 1MDJA 4MPGA 4IBPA 1ILOA 3E9JB 1KBNA 4DEJA 3Q6OA 2WJUA 1J0FA 3TJJA 2JACA 2PGTA 3RBTA 2VLUA 3FZ5A 3M0FA 1Z6MA 1SJIA 4JBBA 3LYPA 3HJPA 4IKHA 2PERA 3F9UA 4O7HA 4MF5A 3ED3A 3F8UA 4AJ8A 3LJRA 2CVDA 2KOKA 3IBHA 4NAXA 2LQQA 2LSTA 3VI5A 1OVNA 2FWHA 3LSZA 1GULA 3D5JA 2KHPA 1DE1A 1R26A 3F63A 4K7NA 2TRCP 2VCZA 1A8LA 1Z7RA 1B4PA 2YWIA 3LGCA 3KJYA 2CAIA 5ENUA 1FAAA 4TXOB 3HVSA 1TRVA 1OAZA 1AQVA 4EDZA 5A4VA 2H71A 1YEXA 4KDXA 5DAKA 5J4UA 2WCIA 3E0UA 2A4VA 2DC5A 3EVIA 4IP6A 5AISA 3MAKA 5JCGA 2K9FA 2FD3A 1GNEA 3GNJA 1QQ2A 1VF4A 2G0FA 2ON7A 3QAWA 4KGIA 5DALA 1XBSA 2HT9A 4O5RA 1GTBA 4ZBAA 1GLPA 1OC3A 2VL9A 2HSHA 2DLXA 2VLVA 4E8HA 3IA1A 1G0TA 2X99A 1SYRA 2YWMA 5ECIB 1V40A 1O7UA 1XPVA 1PGTA 1PN9A 3EYTA 1F3BA 4KX4A 3G7YA 2DJ0A 3ZIVA 3CXGA 2JADA 3A2XA 1LU4A 1NHOA 1WOUA 1MD4A 4JR6A 1T7PB 4GWRA 4BVYA 2TRXA 1GH2A 6GSTA 2MBSA 5DCHA 2WZ9A 3C73A 5CRWA 1X5EA 3TCOA 5GAPD 5DBQA 4YQUA 5ECHB 2B3SA 1SKWB 2M46A 3FY7A 1M9BA 1MEKA 2H19A 1XOAA 3L4NA 3ZZXA 1TK0B 5KN2A 4GSNA 2A2RA 1BYEA 1THOA 1NHYA 3BJ5A 3TKSE 2F8AA 1CQHA 2PVQA 2MMOA 3VFIA 2DSAA 4RI7A 1XCCA 1QMVA 1AQXA 2RUEA 2CQ9A 4ZB8A 1R5AA 1EGOA 4YQMA 4D73B 1A2MA 3KMNA 3TJGA 1M2DA 4I5QA 5CRDA 2BMXA 5IMCA 1FW1A 3F6FA 5CNWA 2YCDA 4POKA 4BPYA 4ZXGA 3HJOA 4V2NA 2H0IA 3MNGA 2FLSA 4HUAA 5J9CA 3NOFA 4FYBA 3HHVA 1GSFA 1G7OA 1VF1A 4K0NA 3UAPA 2N5FA 2VAFA 4WR5A 1TRUA 4OD7A 4TKYA 2VCXA 2GZYA 3FHKA 4V2MA 2N5BA 3TOTA 2LRNA 4ZL7A 1K3YA 4BL7A 4K0GA 1TI3A 3GN3A 2IMIA 3GRXA 2GQLA 3G7IA 4RUVA 3ZTLA 2NBSA 2YOIA 2K8SA 3IK7A 1TRSA 2H0HA 3APSA 1RK4A 16GSA 2IN3A 4KDYA 1F3AA 2WRTA 3GH6A 1TK8B 4PUFC 4GCIA 2B5EA 1OC9B 4K9ZA 1XZOA 2JL4A 3Q74A 4PNFA 3D6IA 4V1Ag 2CZ3A 2HE3A 1PSQA 2NVLA 1HYUA 1GTIA 5JCUA 1M99A 1XWAA 3OR5A 2D2ZA 2L59A 3GL3A 4MF6A 2GSQA 2MZCA 3LYKA 1T4YA 5L71A 2V6OA 2GSSA 3KP8A 5D9XA 4LA1A 4MA9A 2FGXA 2G2QA 2PBJA 3FZAA 4TRXA 2FA4A 4I2TA 1X9WB 5HR1A 1V58A 4HZ4A 4ID0A 1OE8A 3I43A 13GSA 2NPBA 2FNOA 2LRTA 3QD9A 3PH9A 1XWCA 1GSQA 4PQHA 1RQMA 5GAND 3TJFA 1FB6A 2LS5A 5G5EA 2C80A 1T1VA 3LG6A 2L6DA 2HLSA 4WXTA 3TGZA 1R5PA 3FEUA 3V1WA 3C7MA 3W8SA 1K0DA 3HVXA 4K6XA 2H30A 2FHEA 2REMA 2VOCA 2O89A 1OYJA 1F6MC 3F0IA 4HI7A 2DJ3A 3UBKA 3IV4A 3GUSA 1XW6A 3HZ4A 1YKCA 2B6MA 1PD21 2GGTA 4Q5RA 3IC4A 3KIJA 4EE0A 1EZKA 1U3AA 2M72A 4L8EA 5HR3A 3CRTA 4XS6A 1QUWA 1XOBA 4MZCA 2R3XA 1W89A 1WRYA 4ZILA 3ERWA 3Q19A 4XRAA 1FVJA 5KN3A 2DJ1A 4G19A 3FW2A 1EV9A 3ZRDA 3ZREA 3TDGA 4X43A 2X8GA 4F0CA 3HYPA 1PMTA 1UVZA 3E3EA 3ZMLA 3FR3A 5G5FA 1A23A 1DUGA 3A2VA 2HNLA 3FRCA 2VUPA 1TP9A 3LXTA 3JCML 1QGVA 1BG5A 5EY6A 1SYXA 3TUEA 1SENA 2C3NA 4MJBA 2V41A 3O6TA 1N8JA 3GA4A 2IMEA 2VCVA 4PNGA 4I97A 3FR9A 3A2WA 1AQWA 3TKSA 4OFMA 2VIMA 4WKWA 1C72A 5IO2A 3MDKA 2HXKA 3C1SA 3GX8A 3A5WA 1ERWA 1X9MB 3G9BA 2OBIA 4PURA 2HYXA 2YV7A 2HSYA 2V2GA 2C3QA 3GURA 3CSIA 5ID2A 2OE0A 11GSA 2H70A 4JRRA 3KM6A 3VI7A 1F9MA 1V98A 3QPMA 1X0RA 1NSWA 3GH9A 22GSA 3O3TA 5F06A 4KNDA 3CSJA 1MD3A 3QMXA 2GSRA 1PQNA 3GL5A 2EIRA 4PUAA 3U6VA 3VWXA 2QGVA 5B6MA 2PPTA 2O87A 5D73A 1DSBA 2O85A 2FWGA 4F0BA 2E0QA 5LNKe 2P0GA 4KE3A 1RW1A 2HZEB 5ECKB 2A2SA 5J41A 4KSMA 1ST9A 1GSYA 3IRAA 1UN2A 2OACA 2WDUA 1W4VA 7GSSA 6GSSA 2J23A 2VO4A 4H86A 1I9DA 4MJAA 8GSSA 1YF1A 2LJKA 4TXOA 1GUMA 1NM3A 1OC8A 3DGQA 4ML1A 2H1BA 3KMOA 3ZMKA 4QQ7A 4ECIA 3J7Yk 2X64A 2AJQB 3QAGA 3LWAA 3H1NA 4GLTA 1KNGA 1GP1A 4TR1B 2GT5A 4POMA 2QKEA 3IXRA 4AJ6A 5A5KA 4HU9A 5HR0A 3EU4A 4YAVA 2PWJA 2YZHA 4GTUA 5F8BA 1PA3A 5DVBA 2IPAA 5H5QA 1ZZYA 2FWEA 6GSXA 4F9ZA 1EOHA 3EINA 1DE2A 2VM1A 1GNWA 3KXOA 3DEXA 1AAZA 3IHQA 5LCZA 4MP4A 2JZRA 1PKWA 4ZBDA 19GSA 4JR4A 2YN1A 3ERFA 3KGKA 3LORA 1XVWA 4TW5A 4E8EA 2F3MA 1K0MA 1SKRB 4MH2A 1GSDA 2DJKA 3ME7A 2KUCA 4RI6A 2H8LA 4HOJA 4GXZA 3U5RE 2IFQA 4NV5A 5G1LA 5C04A 5DQSA 2WS2A 2CX3A 5D9TA 5ECMB 3C8EA 2B7KA 4L5LA 3L78A 2Z9SA 1S3AA 2ALBA 3GKKA 1LBKA 3L9SA 2R37A 3GTUB 2JSZA 2OJLA 1Z9HA 2H1AA 2K18A 4D73A 3LFLA 4GF0A 2BTOT 3BCKA 4HDEA 4O32A 1YF0A 1TDIA 3F4TA 3GX0A 2YP6A 3WT1A 5GZZB 4FH8A 2C4JA 2H66A 4HJ2A 1YEPA 1YZXA 4V2LA 2V1MA 3G7JA 1FHEA 1IYIA 2ZNMA 4JU5A 5EPFA 4LL1B 2H6XA 1PKZA 4N0VA 1T3BA 5D93A 3RPPA 3C1RA 3TKSC 2RM5A 2YANA 6GSYA 2R5GA 5J9BA 5FT3A 1TK5B 3DXBA 2IWTA 1U6TA 4XRDA 5IPHA 5D96A 1FG4A 3ERGA 3UIWA 3J7Yb 2P5RA 2AV4A 4N30A 1SK0A 2CV4A 5IMDA 5ECQB 2H6YA 2PUKC 4G9HA 2R6KA 4I2UA 3HJMA 3K8NA 1ML6A 1OC9A 4LL4B 4BA7A 1HNAA 4LLRA 3IAM2 2GVPA 1M9AA 2YZUA 5G30A 4KH7A 3EC3A 4GQCA 2VCTA 1T00A 4NPBA 2H72A 5B7CA 2C8UA 3EU3A 1ZGNA 3F3QA 4NXIA 4ECBA 1GRXA 4IVFA 3HVVA 2DJ2A 3VWUA 5ECOB 4G10A 2DMLA 2OKAA 3EURA 3P90A 2OE1A 1K0NA 4YH2A 2MBTA 4K7OA 5AIVA 1V57A 1B8XA 1ZMAA 4G2EA 2FCHA 2XBIA 2DMMA 4O92A 1K3LA 3HKRA 3QFBC 4EO3A 3ZYWA 5CREA 5COHA 2FWFA 1Z5YE 1URMA 3VPTA 3H79A 4TR3A 1FOVA 3TRXA 1X5DA 3GKXA 1R7HA 4OWYA 5ECPB 4KAEA 4X0XA 3GKMA 1UC7A 5KEJA 4EXJA 4ULXA 5EVOA 4CW9A 1EP8A 1Z3EA 3D4MA 6GSVA 3ZVJD 1TKDB 3APQA 1TU8A 1O6JA 2GS3A 1IYHA 5ELAA 1OKDA 2YPMA 1MDIA 4IELA 3UARA 2WULA 5JWQB 3KCMA 3ZFLA 3FKFA 3TOUA 1B9YC 1VF3A 1JZWA 4MMMA 2OBKA 4GRFA 4ML6A 4ACSA 1EV4A 4K8MA 3HD5A 2FUG2 2E2MA 4RQXA 4QL7A 4V1Ap 3GMFA 3EMXA 4XS4B 2K8VA 1EWXA 1SL2B 10GSA 2MMAA 1O8WA 1ZL9A 2QSIA 2IL3A 1LJRA 1X5CA 3ME8A 2EIOA 5IOWA 2AB6A 1ZYQB 1SK1A 1ON4A 3UMAA 4CDOA 4EF0A 2PMTA 2JU5A 2GTUA 3C71A 2C3TA 2B7JA 3KH9A 3Q18A 2OA7A 4ZB9A 4NMUA 4RQRA 3DWVA 3KTLA 1JZRA 3NZNA 3IOSA 2H75A 4ECCA 1SL1B 1J08A 1GSEA 2YNXA 4XCSA 4F2IA 1ZOFA 1SJ6A 2V32A 2I4AA 1JZOA 1B48A 1K0BA 5HFKA 1S3CA 4N0ZA 4KSOA 4N11A 1E2YA 4WEYA 3CRUA 2C0EA 5DJLA 2J9HA 1XW9A 1Y6EA 1M2AA 2CX4A 3BBYA 5J5NA 2B1LA 3KH7A 3KD0A 4HU7A 3TKPA 1AUCA 2L4QA 1ERTA 4OO5A 3TJKA 1A2JA 5A4WA 1XW5A 5IMVA 2WFCA 2CAQA 4HS1A 5INYA 2YJ7A 3UOMA 1G7EA 1M7TA 5F0GA 1TRWA 1FVKA 5DCGA 2NTOA 4OCEA 1PX7A 4IS0A 1H4OA 1XWBA 4IJ3A 2IMFA 5FHIA 3GIXA 1I5GA 1XFLA 3KEBA 1AW9A 2RIIA 3UVHA 3QOUA 3DD3A 3RPNA 2DIYA 1KEBA 5DJMA 2L57A 2BJXA 2XPEA 3FR6A 1TXXA 2C1YA 4K7IA 4MLYA 3HZ8A 4P3YB 2LJAA 1KTEA 3TRQA 2I3YA 2KP2A 1BQ7A 2ON5A 1YJ6A 2VM2A 2LUSA 2HZEA 4AF2A 1QXHA 3H4KA 2VD1A 1XXUA 5G1KA 4EUYA 1GLQA 1SKSB 1WP0A 4ZBBA 3QAVA 2R4VA 2H6ZA 3HXSA 2M80A 2LJRA 1JHBA 4Q5QA 2YV9A 4NV2A 5IMAA 5AN1A 3TKQA 4TN8A 4EC0A 2MMNA 2X8CA 3LXZA 4K1FA 2KLXA 3MSZA 3US3A 3I69A 2JZTA 4AJ7A 3VK9A 4TR1A 5D8IA 3DVXA 4ECJA 5C00A 2VD0A 1GUKA 4BWSA 1F37A 2LQOA 1BX9A 3ZIJA 4HZ2A 5IM9A 3CMIA 1EOGA 4NHZA 5GSTA 4OCFA 5IPGA 3MWHA 3H93A 3NIVA 3D21A 3M9JA 3HCZA 5IMFA 2VL2A 3PR8A 1GUHA 5G2ZA 2P31A 4J57E 5GSSA 2I81A 2GZPA 2C0GA 3BD2A 3EWLA 3A3TA 4OMVA 1GL8A 3DYRA 4Q5FA 2VLTA 2VCWA 3F4RA 3EMPA 3WD6A 3D4TA 1U88A 4ZIJA 1AXDA 3GHAA 1MTCA 2L5OA 4L0UA 2CA8A 3P2AA 4DSSB 1K3OA 4PQIA 2H01A 18GSA 3CTGA 1F2EA 1YQ1A 2JZSA 1OE7A 2NDOA 2GZZA 5G31A 3HY2A 2ES7A 1WWJA 4KW6A 4HQZA 4AGSA 4ZL9A 4MCUA 3FYGA 1ERVA 2L6CA 4NWYA 1GTUA 1GTAA 5B8BA 1OKTA 5ABRA 2H1GA 5JWRB 1T8EB 1HNBA 3GTUA 5LD0A 3WGEA 1EGRA 4FIWA 5ECLB 5FWGA 3GFKA 2EIQA 1USBA 3WT2A 3GV1A 4Z7XA 3RDWA 2X8HA 4MH3A 3RHCA 2QC7A 1T4ZA 1EEJA 1HNCA 2GQKA 2H0GA 2I9HA 2YWNA 1YKAA 3P8WA 1XWGA 1FB0A 5F05A 4LMWA 4POBA 4IHUA 3O76A 2B5XA 5DAKB 1BAYA 1V9WA 5B6NA 4YAPA 5CP1A 4MZBA 1TW9A 3LEFA 3LQ7A 1SU9A 3KZQA 1WMJA 5CRHA 3H8QA 2WB9A 4ILFA 4KA0A 1E6BA 4WR4A 1THXA 4KCEA 3I9V2 1ABAA 1H75A 3CSHA 1WJKA 3ISOA 1UA5A 5ECRB 1MDKA 5DQYA 1K0AA 1PRXA 4J2FA 5DALB 2LTKA 1TU7A 1BEDA 3GSTA 5ECNB 2PU9C 2RLIA 5CYYA 5JCWA 2P5QA 2IFQB 4MF7A 3IPZA 2K6VA 1A0FA 2YJHA 2PN8A 1JZDA 1J9BA 2F8FA 1QFNA 3GYKA 3IR4A 4I6XA 1BJXA 5IO0A 3QDNA 4XS1A 2WGRA 4WETA 3ZVJA 2XPDA 5KN0A 2HFDA 2AAWA 1B9XC 5EL8A 5J3RA 4POLA 2PVOC 4OO4A 4PXOA 4TVEA 2IJYA 4IGJA 3IAS2 5D9VA 3IDVA 2L4CA 3L9UA 4F82A 4WF5A 2IIYA 4KUNA 4N10A 2CT6A 4BVXA 4QL9A 2CVBA 4FYUA 2CZ2A 3UEMA 1YDKA 3QFAC 4PX1A 3FZ4A 1AC1A 2HZFA 3F6DA 4DSQA 1A2LA 4YQVA 3R2QA 1Q4JA 3WGXA 3PGTA 3D0ZA 2GSTA 5IQYA 3IE3A 1G6YA 1HD2A 5CO3A 4DSRA 14GSA 2LV3A 3D22A 4HEA2 3SBCA 5DDLA 2JSYA 2FA8A 1TOFA 1U87A 2KP1A 4MJCA 2H76A 2OE3A 4IW9A 3TJBA 2B5YA 2OADA 4FYCA 1VF2A 2IMDA 2AYTA 5CRGA 1O8XA 1VGLA 2RM6A 4ZB6A 3PINA 2VL2C 3WYWA 4IN0A 5IMZA 3M3MA 2GLRA 17GSA 4XHMA 4KCAA 4MDCA 2ZCTA 4XS4A 5ECSA 5F07A 5HQPA 2LNSA 1DBYA 4EL1A 3IK9A 2H1DA 2MMZA 3FZ9A 1GWCA 4MABA 3DMLA 2YWOA 4MZWA 1YY7A 3DKSA 3KP9A 1M2BA 4KDUA 2FY6A 1K0CA 4GSTA 3WGDA 4L5OA 2H74A 2XHFA 4HJMA 5HR2A 5AIXA 4MPFA 1PX6A 2AUVA 4OFNA 1AIUA 1M0UA 5HFGA 2R2JA 4WBJA 1SK2A 3S9FA 4JE1A 4CHSA 1TTZA 4TOPA 1Q98A 4HQSA 5E4WA 1SD9A 2IMKA 4MJEA 2B1KA 2AHEA 1XIYA 3UJ1A 3VPQA 3HA9A 2GQMA 1GSUA 20GSA 3ZFBA 3TB2A 1ZCPA 4ZL8A 3QR6A 6GSWA 3W6GA 3L9VA 4ISDA 2C0DA 2DIZA 4IQ1A 1ERUA 4I8BA 3W8JA 1SL0B 1U3IA 5B8AA 1V2AA 3EE2A 3ZLPA 3QCPA 2CVKA 4TXVA 3KTBA 1PL2A 4WBRD 4IQAA 1QK8A 1SD8A 3M1GA 5HFIA 1JLVA 4J56E 2O8VB 3BOAA 2L5LA 3AY8A 5CAXA 3TKRA 2DBCA 4XIHA 1SJZA 1WIKA 1Z6NA 2LNTA 3L0HA 1PL1A 1A24A 4GQFA 6GSUA 2ZUPA 4EDYA 5A4UA 3VLNA 2V6KA 3F4SA 4JZQA 2RUFA 3DRNA 1XVQA 5ELGA 1O73A 4K2DA 1WPIA 3P7XA 3FK8A 1JLWA 1Z7PA 4NHWA 1TJDA 3UBLA 4MK3A 3N9JA 2VCQA 5IIZA 3DIEA 1O81A 2I1UA 3F3RA 1XWKA 4GSSA 4L0WA 3M9KA 3SWLA 3N5OA 4KB3A 3ZITA 1B4QA 2O7KA 2LEGA 5KN1A 3APOA 2DJJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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