2DBCA

Solution structure of the thioredoxin-like domain of phosducin-like protein 2(pdcl2)
Total Genus 19
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
19
sequence length
135
structure length
135
Chain Sequence
GSSGSSGKFGELREISGNQYVNEVTNAEKDLWVVIHLYRSSVPMCLVVNQHLSVLARKFPETKFVKAIVNSCIEHYHDNCLPTIFVYKNGQIEGKFIGIIECGGINLKLEELEWKLSEVGAIQSDLEENSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
source organism Mus musculus
publication title Solution structure of the Thioredoxin-like domain of Phosducin-like protein 2(PDCL2)
rcsb
molecule keywords unnamed protein product
total genus 19
structure length 135
sequence length 135
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2dbcA00
1M7TA 3KCMA 1JZDA 4KCEA 4KDYA 4MMMA 4N0ZA 4KSMA 2DMMA 2LJRA 4ML1A 3BBYA 1TU8A 2H0GA 3ZVJD 1EWXA 3F4SA 5E59A 1T4YA 3G7JA 3HJOA 1WE0A 2DJ2A 4V2LA 3PGTA 2X99A 4XS1A 2C1YA 2DJ1A 1GSUA 3HA9A 2VLUA 3CSIA 1KTEA 2FA8A 5HR1A 2HSHA 2QKEA 5A4UA 1SKRB 1GSFA 1T7PB 4X1UA 1VF1A 3DIEA 3TCOA 2B7KA 4AF2A 1ERVA 3VWXA 2D2ZA 4ZB6A 3TRPA 1K3LA 1X9SB 5IIZA 2FWGA 2VUPA 1YKCA 2FUG2 2B5YA 3GSSA 4EL1A 4IVFA 2IMFA 4KW6A 2MBTA 3IHQA 2M72A 1MDIA 3FRCA 4GSSA 2VM1A 4PQIA 3UL3A 2O85A 2H70A 2PU9C 3E3EA 4IQAA 2WDUA 5DAKB 4DSQA 3E9JB 5KEJA 2M80A 1J0FA 1CQGA 1A2MA 3F3RA 2VL2C 3RHCA 1PL1A 3VWUA 2L5LA 3TJGA 4OWYA 2CVKA 1HYUA 2A4VA 3PR8A 4ECCA 3GUSA 1S3CA 2K6VA 3GKKA 5JCWA 2VCWA 4MLYA 2F9SA 2EIOA 4DVCA 1XWCA 2L4QA 3BJ5A 3CTFA 4K9ZA 1OKDA 5F05A 3PH9A 1TKDB 1R4WA 3PINA 3QDNA 3ME7A 4EC0A 5HFGA 2WB9A 4NV5A 3UAPA 4EXJA 3RPNA 1QUWA 1TOFA 2GT6A 4E8EA 4OFTA 1MD4A 2VCZA 1EP8A 2V41A 4J57E 1TDIA 1DUGA 3RPPA 4GXZA 1F6MC 4FH8A 2FGXA 2H1BA 1GLQA 1TI1A 3Q19A 4KUNA 1I5GA 3UJ1A 3L4NA 4YAVA 2C80A 2X64A 4GTUA 5J3RA 4ZB8A 3D6IA 2IMKA 4IS0A 4POMA 2DJ3A 4MZWA 1S3AA 3AY8A 1A8YA 2YANA 1GRXA 4ACSA 2LJKA 4IJIA 4OCFA 2LSTA 2GZZA 1BG5A 1USBA 3J7Yb 1KBNA 1R5AA 4ZBDA 3APQA 6GSYA 3F63A 3GRXA 3VPTA 1A0RP 3EURA 2V32A 4DSRA 4ECJA 3GURA 3HJPA 2CAIA 5CREA 2GVPA 3VPQA 5B6MA 3F9UA 1YY7A 12GSA 2J23A 2V6OA 1GSEA 2PPTA 2H8LA 1JFUA 5IMCA 3CYNA 3GNJA 1HNCA 1EV4A 1F3AA 4MJAA 3GL5A 1ERTA 3KM6A 1JZOA 3UBKA 1TK5B 4TXOA 3FZ9A 5ELAA 4IN0A 1PN9A 5AIVA 1NSWA 4E8HA 2AAWA 4EDZA 4FYBA 4MJCA 2GSQA 5B8BA 5ECMB 4WEYA 2GTUA 1NM3A 5KN1A 3HYPA 1TRUA 1KNGA 3TKSC 5LNKe 2AV4A 3GKMA 4AJ8A 3GYKA 2HLSA 2DIZA 5DALA 1YKAA 2P5RA 2HE3A 5G5FA 4OMVA 4DSSA 4ECIA 1A23A 1EZKA 2IPAA 3ZVJA 4WR5A 1A8LA 3FR9A 4F03A 4FO5A 5IO2A 3E0UA 1U3IA 3JCML 4N0VA 2NDOA 2QSIA 4MP4A 3TKQA 1SJZA 4GWRA 1FO5A 1SK0A 1O81A 5J41A 4V1Ap 4O7HA 1E6BA 3A3TA 1O6JA 2MMAA 2FWEA 2H0IA 1SK2A 2DLXA 2C8UA 2Z9SA 1AUCA 1TU7A 5A4WA 2CZ3A 5JWRB 4ML6A 1EGRA 3KMOA 2B5XA 2BJXA 5IM9A 1GWCA 2DJKA 4ZL7A 3IA1A 3QCPA 2RM5A 3WGXA 3G7IA 3KH9A 2AYTA 3QFAC 1Q4JA 1ZGNA 3J7Yk 5JCGA 2AHEA 3BOAA 1TJDA 4OO5A 2EIQA 1Q98A 1BQ7A 1GP1A 4EUYA 3U5RE 4O5RA 3VK9A 5A4VA 1B48A 2PVQA 4V2MA 3M9KA 1SL2B 7GSSA 3EU3A 1F9MA 1XOAA 1SKSB 3SWLA 4NPBA 4I97A 1N2AA 5GZZB 4XRDA 2YCDA 1UVZA 3ZIVA 5ECLB 4BVXA 5INYA 2WGRA 4LLRA 1YZXA 1SL0B 4K0GA 4K8MA 3ZFBA 3IBHA 5G2ZA 1FB0A 4G2EA 5CRWA 4LA1A 3TJFA 1PMTA 2C3QA 4ZBAA 5G30A 2FNOA 2PN8A 3QOUA 4OO4A 3TGZA 3HXSA 5ELGA 5HQPA 1VGLA 1ZZYA 2C3NA 2IWTA 3GH9A 5IPGA 1A2JA 2RUFA 1X0RA 1ZMAA 4I6XA 5DAKA 1Y6EA 4HZ2A 2LTKA 1TI3A 3EMPA 1FAAA 3L9VA 4EF0A 1GTBA 2I81A 4PXOA 4F9ZA 3KP8A 3GFKA 1AC1A 4O92A 5DQSA 2LV3A 3EC3A 3O76A 1XWKA 1HNAA 2OADA 1Z6NA 4EO3A 4ULXA 2YNXA 3KMNA 1X5CA 1X5EA 2XC2A 4GSNA 4F0CA 1PX7A 2JL4A 5KN0A 1V58A 1G0TA 5ECSA 1YEXA 2C3TA 1B4QA 1ZYQB 1PKZA 1XOBA 2O89A 1M99A 3S9FA 5GAND 1O85A 1SU9A 5CAXA 1GUHA 2I9HA 1PKWA 1WJKA 2VD1A 2GQMA 5AGYA 2H73A 2PBJA 1FB6A 3DMLA 4GLTA 5ENUA 2I3YA 1Z5YE 3VURA 2FD3A 4OFMA 22GSA 5IMZA 4IBPA 4WR4A 3FHKA 4PUAA 1Z3EA 1GLPA 4QL9A 1K0MA 4G9HA 1OE8A 3O3TA 3IK9A 1V40A 2CA8A 3R2QA 5D8IA 5L71A 3GN3A 3A2WA 3TRXA 3HVXA 1R26A 2LRCA 3ZZXA 1X5DA 3ERGA 5ECQB 3GKXA 1Y25A 4D73A 1G7EA 2IN3A 1LJRA 5ID2B 3TKSA 1O73A 2RLIA 4V1Ag 3I43A 1BJXA 2EIRA 2GQLA 18GSA 2DSAA 2H71A 4POLA 1X9WB 4AJ7A 2X8GA 4TR1B 1MD3A 3LJRA 2XHFA 5IQYA 1Z7PA 3ZYWA 3H4KA 1PD21 4IW9A 3UARA 1XCCA 4HUAA 1GSDA 2FWFA 3IPZA 3IAS2 4MCUA 1K0CA 1OC3A 4K7IA 4KX4A 6GSSA 2B1KA 1F37A 1M9AA 3P90A 1VF3A 3LXTA 5A5KA 1V2AA 3DGQA 2VAFA 3IDVA 4EE0A 3Q18A 1AQVA 3HKRA 1SYRA 2CV4A 2HI7A 2K9FA 1PQNA 4RQXA 3EINA 1ILOA 1AQWA 2LS5A 20GSA 3A5WA 4PX1A 1WP0A 5D9WA 1XZOA 5HFKA 1F2EA 3QAVA 1OKTA 14GSA 3FW2A 2GZYA 2VCQA 5DCGA 5IMDA 4RI7A 1UA5A 2GQKA 4MZCA 3FZ5A 4JR6A 3HHVA 2B3SA 1BAYA 1XPVA 2YWOA 3VI5A 2A2RA 3CSJA 3I69A 3EMXA 1GL8A 3LORA 2HT9A 4KNDA 3V1WA 2LQQA 5HR0A 2WJUA 2N5FA 3VI7A 5ECRB 1XVWA 3VFIA 1ZL9A 2QGVA 4NHZA 5COHA 3HD5A 5F0GA 3UVHA 3RDWA 4LL4B 4DEJA 3LYKA 3BD2A 1YF1A 1Z9HA 2KHPA 4BWQA 5IOWA 4JU5A 2X8HA 1DBYA 5JWOB 3TJKA 2MBSA 4GQFA 3GIXA 5ECIB 2C0FA 5GSTA 1K0NA 1Z6MA 1GUMA 2G2QA 2HNLA 3P8WA 4ILFA 1AAZA 5DJLA 4JBBA 5FT3A 3LXZA 1JHBA 1XWBA 4CDOA 1DE1A 4Q5FA 4KSOA 1B9XC 9GSSA 2ZCTA 1JLWA 3FYGA 4L0UA 3HZ4A 1OE7A 1NHOA 16GSA 1TRVA 4BWSA 3LWAA 5AN1A 1T8EB 2IFQB 2WZ9A 4QQ7A 5F07A 2VLVA 3ZRDA 4YQUA 4K7OA 3GSTA 1XVQA 6GSVA 1W4VA 3IOSA 3C71A 1M2AA 2GZPA 1A2LA 1PX6A 3GTUB 1M2BA 3IV4A 1OC9A 3F6DA 5G1LA 2YV7A 2GDRA 3FR6A 4WBRD 1H4OA 4PQHA 1GH2A 2WS2A 2V2GA 5EL8A 3GHAA 1AXDA 2N5BA 4NAXA 2XBQA 4N11A 3QAGA 2I1UA 4MH2A 3KTLA 5D9TA 2JZRA 3F0IA 1ML6A 2JACA 4G19A 3HZ8A 2REMA 1SD8A 4YAPA 1WOUA 1EGOA 1H75A 2PVOC 2FLSA 3WYWA 5EPFA 4MJBA 2B5EA 2QC7A 1RQMA 3HDCA 3D22A 19GSA 3KD0A 1PRXA 1IYHA 3A2VA 3TKRA 5J4UA 4MF6A 1SK1A 2YPMA 2GSSA 3IC4A 4JRRA 1ABAA 1XW9A 3GMFA 4X43A 4TVEA 1SL1B 4Q5RA 2F51A 5ECHB 1CQHA 3W8SA 1JLVA 4K1FA 3UBLA 4PGTA 2HZEB 2PGTA 1FVKA 1R5PA 1DSBA 3CMIA 2R2JA 5CO3A 2YZHA 4WETA 3GX8A 3FK8A 3Q74A 5B8AA 5E4WA 4YQVA 4YQMA 3BCKA 4RUVA 4FIWA 1THOA 3LFLA 3H8QA 1EV9A 2FCHA 2WFCA 4CHSA 4F82A 4YH2A 2IJYA 2K8SA 2DBCA 1U6TA 1QMVA 2XPDA 4EDYA 1A24A 3LGCA 3NIVA 1EOHA 4GCIA 4JR4A 5HFIA 5LCZA 3HVVA 3BCIA 1DE2A 2C0GA 3L0HA 4O32A 4HS1A 5DBQA 2PWJA 2ON5A 1THXA 5B7CA 5FHIA 4WXTA 4EVMA 2NTOA 4ISDA 2WULA 3C1SA 1GULA 4HDEA 4IKHA 4MH3A 2P0GA 4AGSA 3WT1A 2YJHA 3OR5A 5CRDA 1VF2A 3ZTLA 4I2TA 3W6GA 5C04A 2IMDA 1G6YA 2JZSA 3M1GA 2LRNA 2X8CA 1PSQA 1GSSA 2LNTA 3D4MA 1NHYA 1XWGA 1GSYA 4IJ3A 4KDXA 4FYUA 2YJ7A 2V6KA 2CT6A 3APSA 4TR1A 4EKZA 3GKNA 3QFBC 3FKFA 5ECKB 2O8VB 1TRSA 2VCTA 3N9JA 2RUEA 2AJQB 4GQCA 4ZL9A 2B6MA 1X9MB 4TOPA 2RM6A 1KEBA 3M9JA 2F3MA 2HYXA 2K18A 3F6FA 3DVWA 5CP1A 2JSZA 3U6VA 1YEPA 4IGJA 2OBKA 2P31A 5D96A 4BL7A 4KB3A 4PNGA 1FG4A 1U87A 2L6CA 2LRTA 4ZB9A 3EYTA 1FW1A 2YN1A 1LU4A 4KGIA 2YWIA 3FEUA 4PQ1A 4PUFC 1YF0A 5H5QA 2V1MA 2LQOA 2E7PA 3TOTA 1XIYA 2CZ2A 5ECPB 8GSSA 2AB6A 4V2NA 2OJLA 3P7XA 1UN2A 1K0AA 4TR4A 3DYRA 4N30A 4P3YB 1A0FA 2TIRA 2FWHA 4OD7A 3KXOA 2VO4A 4IELA 4MF5A 1SYXA 4L8EA 3ZREA 1ERWA 4HJ2A 2H72A 3GX0A 2EC4A 3TDGA 2BTOT 5GAPD 3DWVA 4WBJA 4I5QA 3NOFA 2F8FA 3O6TA 4ZL8A 3DXBA 2IL3A 2VIMA 2NVLA 4BPYA 2R5GA 4L0WA 2GSRA 3L9SA 4HQSA 3CBUA 4MK3A 3GH6A 4TW5A 4ZXGA 3P2AA 2L57A 2VM2A 3H1NA 2MMZA 2G0FA 4DSSB 1G6WA 2TRCP 2J9HA 3IRAA 1GNWA 2LEGA 1M0UA 2ALBA 2FY6A 2YP6A 2TRXA 1QK8A 4MPFA 1EOGA 3VWWA 2VOCA 2HRNA 3UOMA 2L59A 4KCAA 2H30A 2HXKA 2VCVA 4H86A 5JCUA 5G31A 4TR0A 4IHUA 2LJAA 3FR3A 2K8VA 5DDLA 2HRFA 5IMFA 1HD2A 3WD6A 1VRSD 3F3QA 3CRTA 2JSYA 6GSWA 2CX3A 1N8JA 1IYIA 5ECNB 5D93A 3SBCA 2OACA 1XW5A 6GSTA 4X0XA 5HR2A 3ME8A 4MJEA 2R3XA 2F8AA 4NXIA 2JU5A 1XFLA 2DMLA 3LEFA 2ES7A 1B9YC 5F8BA 2XBIA 3LQ7A 4I2UA 2R6KA 3FZAA 2C4JA 3ED3A 4KAEA 2C0DA 1UC7A 4NMUA 4ECBA 4Q5NA 1TK0B 1GTIA 1K3OA 4K0NA 1J08A 1TP9A 1SJIA 3TB2A 4HEA2 3TKSE 2HZEA 2M46A 3KJYA 5IOXA 4HI7A 3GV1A 3APOA 1TK8B 1XW6A 3FY7A 1R7HA 4HU9A 2CVDA 4JZQA 1ERUA 1WPIA 2IIYA 5DCHA 4WF4A 2E2GA 2GSTA 3ZL5A 3EVIA 4CW9A 3DRNA 3TUEA 3KP9A 3ISOA 3Q6OA 3MAKA 3F8UA 3UVTA 3UMAA 4NHWA 4XS4B 1YJ6A 1TTZA 5J9CA 1M2DA 5D73A 5G1KA 1QFNA 4J2FA 2H0HA 1I9DA 2PMTA 5ABRA 2E2MA 5B6NA 2YOIA 1MTCA 2O7KA 1K0OA 3MWHA 1FOVA 5LD0A 4HZ4A 4BA7A 3QR6A 1XWAA 2IMEA 3D5JA 1SJ6A 4XIHA 2O87A 3ZMKA 2VCXA 3L78A 1O8WA 2YV9A 5KN3A 4F2IA 5FWGA 4WKWA 3CRUA 2OE1A 2AUVA 2NPBA 13GSA 2MZCA 2JZTA 4ZILA 1ACVA 2RIIA 1HNBA 4XS6A 2CVBA 3ZLPA 2ZUPA 3M0FA 1SENA 1G7OA 2GGTA 3FZ4A 5H5SA 4TRXA 3CXGA 17GSA 3N5OA 2A2SA 1BYEA 3QPMA 2MMOA 1ZOFA 1URMA 1XBSA 4POBA 4PNFA 5IO0A 5D9XA 1EEMA 1QGVA 3KZQA 1PL2A 5G5EA 3DVXA 4TKYA 2OA7A 2H74A 5DJMA 4Q5QA 4IP1A 2VL9A 3TOUA 2H6ZA 1FHEA 4N10A 1K3YA 1AQXA 2OE3A 3M8NA 4BVYA 4D73B 3TKPA 2WCIA 3KIJA 2IMIA 5F06A 1ST9A 2CQ9A 2H6YA 4GSTA 3A2XA 3ERWA 1K0DA 1GTAA 3QMXA 1QXHA 1U88A 4XCSA 1NW2A 5CYYA 3DEXA 4TR3A 1F3BA 4OFNA 2YZUA 3IR4A 3ZITA 4GF0A 1SKWB 2YWNA 2PERA 4JE1A 1M9BA 2DC5A 1V98A 1B4PA 2C0EA 4I8BA 3IXRA 1V9WA 2L4CA 4L5LA 3LSZA 1WIKA 4MF7A 1BX9A 3NZNA 2KUCA 4AJ6A 3KEBA 2OE0A 1Z7RA 1YQ1A 3GA4A 2DIYA 2YWMA 1HQOA 4K6XA 2H66A 1K0BA 2KOKA 1OC8A 1GNEA 2B7JA 3RHBA 1WMJA 4XTSA 4Z7XA 3EWLA 2BMXA 1T00A 2DJJA 2LKUA 1OVNA 6GSUA 3H79A 2GLRA 4HU7A 2H1GA 3ZFLA 1OAZA 3VWVA 3TJBA 3KH7A 4TN8A 5J9BA 5C00A 1AW9A 2L5OA 5CNWA 3WGEA 1W89A 1MDKA 4MA9A 2WRTA 2H75A 3UEMA 4ID0A 2OBIA 2HSYA 4KH7A 1JZRA 4POKA 1MDJA 5AIXA 2GS3A 2MMNA 4RQRA 4HJMA 1ZYEA 1RK4A 1WRYA 1TW9A 3IK7A 3G7YA 1WWJA 1VF4A 2NBSA 5ID2A 1U3AA 3ERFA 3QAWA 4KE3A 1PGTA 3ZMLA 1FVJA 3I9V2 1OYJA 4HOJA 1MEKA 4GRFA 1C72A 1V57A 2H1AA 1QQ2A 1PA3A 1O8XA 3CSHA 1AIUA 3IE3A 4KDUA 2CX4A 3TRQA 1B8XA 5HR3A 2H76A 4F0BA 3HY2A 3W8JA 1GSQA 2I4AA 4MZBA 1SD9A 2VL3A 3MDKA 4NV2A 4LL1B 5IMVA 1GUKA 1TRWA 4LMWA 6GSXA 2VD0A 4MPGA 2L6DA 2LNSA 5EVOA 2N5AA 1RW1A 2VL2A 2VLTA 4ZIJA 1TXXA 4IP6A 3F4RA 4KA0A 3VLNA 2R4VA 3C73A 3HJMA 2FA4A 1T3BA 3TJJA 1EEJA 3C8EA 1OC9B 4TXVA 4MDCA 4RI6A 3RAZA 4XRAA 3WGDA 3I6AA 5CRHA 3C1RA 4LMVA 3GL3A 2OKAA 3MNGA 3K8NA 4XHMA 3UIWA 3US3A 2R37A 4ZBBA 2KLXA 3D21A 1GTUA 4FYCA 5DQYA 3HVSA 2DJ0A 2KP1A 4QL7A 4G10A 10GSA 4XS4A 3LG6A 3D0ZA 4TXOB 3QD9A 3F4TA 3WT2A 4NWYA 5D9VA 5CRGA 1O7UA 5H5RA 5JWQB 1J9BA 1ON4A 2E0QA 2KP2A 3L9UA 3LYPA 5IPHA 3IAM2 1T4ZA 1ZCPA 2P5QA 5EY6A 2FHEA 5DALB 2JADA 3KGKA 4PURA 3KTBA 3MSZA 2ON7A 2GT5A 1E2YA 4HQZA 4K7NA 4OCEA 1BEDA 2XPEA 3G9BA 2LUSA 2H01A 2H6XA 3H93A 2PUKC 4MABA 3ZIJA 2MYGA 3RBTA 1JZWA 2ZNMA 5J5NA 2CAQA 1LBKA 2H1DA 3DD3A 5IMAA 3CTGA 2IFQA 3M3MA 2HFDA 3DKSA 5ECOB 4JEDA 2B1LA 4IQ1A 5GSSA 3EE2A 3EU4A 3C7MA 1YDKA 3D4TA 5AISA 2H19A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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