2DBCA

Solution structure of the thioredoxin-like domain of phosducin-like protein 2(pdcl2)
Total Genus 19
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
19
sequence length
135
structure length
135
Chain Sequence
b'GSSGSSGKFGELREISGNQYVNEVTNAEKDLWVVIHLYRSSVPMCLVVNQHLSVLARKFPETKFVKAIVNSCIEHYHDNCLPTIFVYKNGQIEGKFIGIIECGGINLKLEELEWKLSEVGAIQSDLEENSGPSSG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution structure of the Thioredoxin-like domain of Phosducin-like protein 2(PDCL2)
rcsb
molecule keywords unnamed protein product
source organism Mus musculus
molecule tags Signaling protein
total genus 19
structure length 135
sequence length 135
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2dbcA00
3V1WA 3LXTA 2GLRA 5C04A 4JR4A 4XS4B 2H1AA 1EOHA 4IGJA 2VLTA 3Q74A 4CDOA 4IN0A 2BTOT 5D8IA 6GSUA 3A5WA 4WBRD 3GSTA 4WF4A 2ON7A 3CBUA 5H5SA 3H4KA 2YZHA 4TXVA 1EV4A 3BD2A 2LEGA 5G31A 2REMA 3ERFA 5B7CA 3UL3A 1Y6EA 2LSTA 2JZRA 2OE3A 1X5CA 1M99A 1TW9A 5AIVA 1S3AA 3BOAA 2H6YA 3FYGA 3I9V2 4TR4A 4MABA 2H75A 4PUAA 3O76A 4XS1A 1G7OA 4XS4A 1AQVA 3DVXA 3DIEA 4NV2A 1A2JA 4EDZA 2LRTA 3GKMA 1GWCA 3ZFLA 4KUNA 2O85A 5HFKA 2ES7A 5ECMB 1AQXA 5HR1A 1OC3A 1PQNA 3O6TA 4ULXA 3J7Yk 2HFDA 4GF0A 2VM2A 1XPVA 3GX0A 2LJAA 2AJQB 4MPGA 3DD3A 4N11A 3UMAA 1MEKA 2GQMA 4KE3A 4K0NA 4RUVA 1Q98A 2LJKA 3CRUA 1GTAA 1USBA 2H1BA 2O7KA 2L4QA 12GSA 3TJBA 1F3BA 2NVLA 4XCSA 8GSSA 2H76A 4I5QA 1PKZA 1BYEA 4V1Ag 1M2BA 2C80A 4TN8A 2N5BA 6GSVA 3EMXA 3FKFA 5B8AA 1OKDA 4XRAA 1MDIA 1NSWA 3F6FA 3F4SA 3EU4A 1SENA 3KCMA 2M80A 1J0FA 3K8NA 1UC7A 4XRDA 3DEXA 2XBIA 2YNXA 4XIHA 3A3TA 2H6ZA 3LORA 2DJKA 4AF2A 4Z7XA 4F0CA 1T00A 2L6DA 1THOA 4TR0A 1YY7A 4OO5A 4LA1A 4ZL8A 4D73A 1F2EA 1URMA 4K9ZA 2FWEA 1AQWA 1PX6A 1X5DA 5IM9A 4OFMA 2WS2A 2L4CA 3G7YA 2YOIA 4YQMA 4HEA2 1X9SB 2C3QA 4BL7A 3HXSA 2PVQA 5JWQB 3L9SA 1GLQA 5F8BA 4GTUA 2VM1A 4ZB6A 3VWUA 3D4TA 4V2MA 2J23A 2PBJA 1SK2A 2YWMA 2IMDA 5ENUA 4IHUA 2H66A 1Z6NA 2IMIA 1TRUA 2P0GA 1GSUA 2XHFA 1HYUA 3TRQA 2H72A 2E0QA 3F8UA 1GSEA 5J4UA 5G1KA 3KZQA 1WP0A 3HZ8A 3HJOA 3QFBC 4KSOA 2P5QA 5ELAA 3UIWA 2KP2A 13GSA 3F9UA 2IMFA 4G9HA 4ZL9A 2C0FA 5GSTA 2YV7A 4IS0A 3EC3A 4EVMA 2YWOA 3E9JB 2MZCA 4HJMA 3C1SA 2JSYA 1ZGNA 4N10A 3IPZA 4TXOB 2LV3A 1M0UA 4L5OA 3BJ5A 1OC8A 4FIWA 2HRNA 4J56E 3L9VA 3VPTA 5A4VA 2DMLA 3IAM2 3PH9A 1ZYEA 2YV9A 4JRRA 1HNBA 2FA8A 2QGVA 5HQPA 1S3CA 5ECHB 4K7OA 3U6VA 3HDCA 5D73A 1XWAA 3TJKA 4ILFA 2WDUA 3RHCA 2XC2A 3QR6A 3FEUA 1QUWA 2LRNA 5G5EA 4TXOA 3KJYA 3NOFA 5JWRB 3N9JA 1T3BA 3D4MA 2IFQB 1WE0A 5INYA 3NIVA 1FAAA 3VURA 2EC4A 1TU8A 1FO5A 3APOA 1R5PA 1YF0A 1AAZA 3JCML 5DCHA 1LJRA 2MMOA 2VLVA 1RW1A 1WIKA 3HD5A 4Q5RA 3ISOA 5CRGA 2VCZA 4QQ7A 1H75A 2LRCA 3IRAA 4PNFA 1TJDA 2OBKA 1XW5A 2IIYA 2A2SA 2IFQA 4MH2A 2X8GA 4KCEA 2OBIA 4AJ6A 2FWHA 1K0CA 1AC1A 3ZREA 5KN1A 3P7XA 1R5AA 2R4VA 4MA9A 5IOWA 6GSYA 3HJMA 1YF1A 3L78A 4ML1A 2DBCA 4F9ZA 4N0VA 2KOKA 1GSFA 3CYNA 1GUKA 1GSSA 3L9UA 4V2NA 5J41A 1JHBA 1ILOA 4J2FA 2DJ2A 2C4JA 4ZILA 2CT6A 1Z7RA 2FA4A 1EEJA 1SD8A 1XFLA 2AAWA 3GSSA 5DQYA 1GSQA 1QXHA 5KN2A 2ON5A 5IMZA 4MPFA 3MNGA 2JZSA 3IR4A 2IMEA 2RUEA 1O8XA 1FOVA 4BWSA 4CW9A 2GS3A 6GSSA 3S9FA 1YKCA 3IK9A 2VCTA 1EGRA 2KHPA 1BEDA 5LNKe 4NAXA 4WBJA 1S3DA 2HNLA 3GL5A 1K0MA 2VCXA 2RIIA 4ECJA 4LMVA 2MBSA 1HD2A 2VL9A 2JSZA 2YCDA 5JCGA 1JLWA 1OYJA 4JU5A 1GUMA 3VK9A 2FWFA 1SKWB 2VIMA 2LTKA 1M2DA 4F82A 3M9KA 1K3OA 1J9BA 2JACA 3ME8A 2GQKA 3R2QA 1ST9A 1DE1A 4X1UA 1EP8A 4L0WA 3DRNA 5D9TA 1A8YA 6GSXA 3RDWA 1TRSA 5CP1A 3C1RA 3EVIA 1SL0B 3DMLA 3IOSA 3GMFA 4Q5NA 2CX3A 2HSHA 4O7HA 2OKAA 5D9WA 3CRTA 2HSYA 10GSA 3ZRDA 3WGDA 1G6YA 4PNGA 5B8BA 2MMNA 4BVXA 3F6DA 4LMWA 4O92A 4MF6A 2H0GA 2F9SA 2B5YA 4ECCA 1DSBA 1U88A 2TRCP 2RM5A 5AISA 2PWJA 2QKEA 2AHEA 1TTZA 3EE2A 4NWYA 4ZBAA 5JCWA 3KMOA 3FZ5A 1K3YA 2WJUA 1GH2A 1GNEA 2V2GA 1TDIA 5KEJA 2ZCTA 4F03A 2C3TA 4XS6A 4NV5A 3E0UA 4POLA 3I43A 3WD6A 2V6KA 1YZXA 4KDXA 1G7EA 1E2YA 2FGXA 4L8EA 3FK8A 4ZB8A 2LNTA 2Z9SA 1VF2A 2KP1A 3CSHA 14GSA 4E8EA 1SYRA 1WWJA 2IL3A 3TOTA 5CYYA 3LGCA 4DSRA 17GSA 1EEMA 2YJHA 3APSA 4FO5A 2VL2A 3U5RE 1H4OA 5IMDA 3WYWA 1TRWA 4WETA 4MLYA 2F8AA 4GQFA 3DVWA 2MBTA 4POMA 2PUKC 3KM6A 1M9BA 3G7IA 5A5KA 4RI7A 1A24A 1NHYA 5AN1A 5D9XA 3H79A 3Q6OA 5D9VA 3PGTA 3I6AA 1GTBA 1JZRA 2C1YA 2IWTA 2XPDA 3KIJA 2GSQA 1HQOA 3KH7A 4IP1A 2E2GA 1T1VA 4HU7A 3A2WA 4WF5A 2R6KA 4POKA 5ECLB 3M0FA 1ON4A 1WPIA 1XW9A 2DJJA 2OE1A 2PMTA 1K0DA 1A23A 1A8LA 2CVKA 2R3XA 4K7IA 4I2TA 2L5LA 2VOCA 1VF4A 1VRSD 3HHVA 4JBBA 1U6TA 4KSMA 1M9AA 2H0HA 1OKTA 4ECBA 2VCWA 4MH3A 2F51A 2DIYA 2K6VA 4PX1A 2HT9A 2DJ0A 4L0UA 3QOUA 1IYHA 1G0TA 1PD21 3G7JA 5DJMA 5ECIB 4D73B 2CA8A 5JWOB 1BAYA 3F3QA 2PVOC 2GSSA 1T8EB 3M9JA 5F06A 5ECRB 2FCHA 1HNAA 4EC0A 4G2EA 5IO2A 4ZB9A 1EV9A 4BWQA 2R2JA 4OD7A 2KUCA 1TXXA 3H93A 2CAQA 2J9HA 2H19A 4OO4A 2MYGA 1ACVA 2CX4A 2AB6A 3CTFA 4KGIA 5IPHA 3GTUB 3BCKA 5HFGA 5B6MA 2N5FA 2O89A 1KBNA 4K1FA 2F8FA 2K8SA 4KCAA 3P8WA 3CSIA 5L71A 3KGKA 2MMZA 3A2VA 1XWGA 5EPFA 1XOBA 22GSA 3LXZA 4YQUA 3C8EA 1B4QA 1GL8A 4JEDA 3Q18A 3CTGA 2K18A 1DE2A 3H8QA 5IIZA 2DJ1A 2EIQA 5DALA 4I97A 3D6IA 4BA7A 3QMXA 4ZIJA 4KNDA 1O85A 1DUGA 1SKRB 1NHOA 1JFUA 3C7MA 5G5FA 5ECOB 1MTCA 1WJKA 2FHEA 4X0XA 3GTUA 2OADA 4LLRA 5GZZB 3SWLA 2DMMA 4GRFA 2YANA 4JZQA 4K2DA 4MDCA 3DGQA 4HOJA 4ID0A 2YZUA 3TKSC 4LL1B 3IHQA 3C73A 1C72A 1ABAA 3QFAC 2NPBA 4MJCA 3ZIVA 2VD0A 1SJIA 1PN9A 4P3YB 1BX9A 3KMNA 3TJFA 5IMCA 3GKXA 5G2ZA 4PGTA 4ZL7A 2B1LA 4EXJA 4KA0A 1TK8B 4HZ4A 4BPYA 3P2AA 3RAZA 3ZIJA 1YDKA 2FUG2 2HRFA 3BCIA 2VUPA 3GURA 4POBA 2NBSA 4YAVA 5E59A 4ACSA 5DVBA 1Z7PA 3M8NA 2LQOA 1EGOA 1K0BA 2P31A 5F07A 1XBSA 4PUFC 4H86A 1DBYA 4YQVA 5IMFA 3HY2A 3RPPA 16GSA 1FVKA 3ZVJA 1B9YC 2NTOA 3J7Yb 2HZFA 3LEFA 1Z9HA 5DCGA 2OJLA 5IMAA 1MDKA 1ZMAA 2A2RA 4K6XA 1B48A 2V6OA 2V41A 5AGYA 4RQXA 1JZWA 1MDJA 4MZWA 3PINA 1PSQA 1PX7A 1PA3A 2DIZA 2RLIA 5ABRA 3TKSE 1U3IA 4IJ3A 2N5AA 5IO0A 2BJXA 2X8HA 1V98A 3SBCA 4WKWA 1GRXA 1RK4A 1A2MA 6GSWA 1V58A 2L6CA 2EIRA 5EY6A 4TW5A 1N8JA 1FHEA 2VLUA 3LWAA 1R7HA 1TU7A 1WRYA 1IYIA 2DC5A 5CO3A 5ECKB 3HVSA 4ISDA 2AYTA 2HE3A 1X9MB 1B8XA 4WXTA 1OAZA 1YEXA 1OVNA 5E4WA 1XOAA 1PL1A 1BQ7A 1V2AA 5FHIA 4ZXGA 2HZEA 2V1MA 3VWXA 1T7PB 1YJ6A 3EURA 4I6XA 3CMIA 2AUVA 3UARA 2CVBA 2IN3A 4HJ2A 1XZOA 1PRXA 5IPGA 1I9DA 1A0RP 1TK0B 3ZVJD 2HLSA 3EYTA 3QCPA 1XWKA 3ZZXA 3WT2A 4HS1A 1F6MC 2X8CA 3HVXA 2B7JA 1V9WA 3F0IA 3N5OA 4MJAA 1K3LA 3BBYA 3IK7A 3HCZA 3GKNA 1E6BA 7GSSA 3HVVA 1PGTA 3I69A 2LJRA 4AJ7A 1V40A 2R5GA 3FHKA 4O5RA 4IBPA 1MD4A 5IQYA 1JLVA 5D96A 3KXOA 1GULA 4X43A 1F9MA 1YKAA 1SL2B 2GZZA 3FZ9A 2FLSA 4MF7A 1AUCA 2X64A 4WEYA 1K0OA 1TI1A 1A2LA 1UA5A 2GQLA 2LS5A 3TJGA 2LUSA 3WGEA 4ECIA 1EZKA 1XVQA 3IV4A 4KDUA 2K8VA 4GWRA 1BG5A 5CRDA 4RI6A 5IMVA 4V1Ap 3QAVA 1EOGA 1SKSB 3VFIA 4AJ8A 3MDKA 4F2IA 3D21A 3FZ4A 5DBQA 3GA4A 5GSSA 5DQSA 2LQQA 3LYPA 3UVHA 2YP6A 3ME7A 3TUEA 2YWNA 4IELA 2WZ9A 2H8LA 4HUAA 3DYRA 5EL8A 4OWYA 1GLPA 4OCFA 2DLXA 3GRXA 1SD9A 2H73A 3UJ1A 3ERGA 3TKQA 2L57A 3LJRA 4MCUA 1FVJA 2L59A 2ZNMA 1JZOA 4FH8A 5FT3A 2KLXA 5KN3A 4AGSA 2FD3A 3QD9A 4HZ2A 1XW6A 1VGLA 2D2ZA 5ELGA 4EKZA 1SL1B 3KEBA 1AW9A 1O8WA 2C0EA 2GDRA 9GSSA 20GSA 2CAIA 4N0ZA 4PQHA 4BVYA 1TK5B 4PURA 2QSIA 5ECPB 5F05A 2ZUPA 3APQA 5CRWA 2OA7A 4K7NA 4DSSB 4IJIA 1U87A 1G6WA 3MSZA 2I3YA 6GSTA 1O6JA 19GSA 2WB9A 5HR2A 1ERTA 1THXA 2C8UA 3G9BA 2HYXA 1TOFA 1EP7A 5J9BA 3TJJA 1T4YA 3DWVA 4TKYA 2G0FA 3IA1A 4KAEA 2H01A 2VCVA 4MJBA 1GP1A 1N2AA 1BJXA 2RM6A 4N30A 1O73A 4NPBA 4KH7A 4DSSA 5GAND 1QFNA 4IVFA 4YAPA 3VI5A 5HFIA 1TRVA 5ECQB 3IDVA 4G10A 4RQRA 1VF1A 1KTEA 11GSA 1U3AA 3ZTLA 2O87A 1GTIA 2DSAA 3GX8A 2GTUA 1O81A 1K0NA 2PN8A 3RPNA 2ALBA 2GT6A 2JZTA 2RUFA 3PR8A 3LFLA 3KH9A 4DEJA 4MJEA 4Q5FA 2YWIA 3TCOA 5LD0A 5FWGA 5AIXA 4MF5A 3ZITA 4WR5A 2HXKA 2LKUA 5DAKB 4TVEA 4GSTA 4IQ1A 3EMPA 2P5RA 4ZBDA 3MAKA 1K0AA 3CXGA 2PGTA 1GSYA 1A0FA 3TDGA 5A4WA 4IKHA 4EDYA 4MZBA 3LSZA 1QK8A 4CHSA 3OR5A 5B6NA 3IAS2 3GHAA 4G19A 5G30A 4EUYA 3DKSA 4FYBA 2WRTA 3FW2A 3ZMLA 3ZL5A 3LQ7A 2C0GA 2H70A 2FY6A 1XWCA 2I81A 1I5GA 3TKRA 2H6XA 5DAKA 2I4AA 3QDNA 3FZAA 3IC4A 4GCIA 5A4UA 5DALB 2VCQA 2H71A 3L0HA 1QGVA 2H30A 4IQAA 1FB0A 1XXUA 1QQ2A 4TR3A 3EWLA 1ZYQB 1LBKA 1QMVA 1M2AA 1XVWA 3ZYWA 2E7PA 2GT5A 4LL4B 2NDOA 2V32A 4OCEA 4HDEA 3TRXA 4EE0A 1GUHA 3UEMA 4XTSA 3O3TA 3VWWA 3GH6A 3CSJA 5CRHA 4KDYA 3H1NA 3KTBA 3VPQA 3UAPA 3D5JA 4TOPA 1UVZA 4TR1B 3KTLA 1SYXA 2H74A 1WMJA 5CNWA 5ECNB 1KNGA 2JL4A 2CVDA 2L5OA 5COHA 4MP4A 4L5LA 2VAFA 3P90A 5CREA 4O32A 1ERWA 3QPMA 3E3EA 3GN3A 1ZL9A 5D93A 4DVCA 2BMXA 4IP6A 3HA9A 4ML6A 1HNCA 3GUSA 4GSNA 1Z5YE 4K0GA 5H5RA 2OE0A 3VI7A 2GGTA 4HQSA 1RQMA 3LYKA 2VL2C 1SK0A 1FG4A 3W8JA 2AV4A 4EO3A 4NHZA 5J5NA 4WR4A 1WOUA 1NM3A 2IPAA 4TR1A 5LCZA 1FB6A 3GKKA 1MD3A 3KP8A 3WT1A 1TKDB 1B9XC 3IXRA 4I8BA 3DXBA 1R4WA 2B1KA 3C71A 4OFNA 2A4VA 3AY8A 3TB2A 4OFTA 5H5QA 3VWVA 3ZLPA 4J57E 1X9WB 1M7TA 2H1DA 4V2LA 4KB3A 4GSSA 3GNJA 2CV4A 3HKRA 4F0BA 3FY7A 2YN1A 2IJYA 4QL9A 4NHWA 4MZCA 2DJ3A 3FR6A 3HYPA 1LU4A 5JCUA 1XWBA 1ERVA 1AXDA 3FR3A 2QC7A 4NXIA 2XBQA 4MMMA 4PXOA 2M72A 18GSA 2PPTA 3QAGA 5J9CA 1NW2A 4KX4A 3GYKA 2B6MA 2GZPA 3M1GA 4E8HA 2HZEB 5C00A 4FYCA 5HR3A 2C3NA 5ECSA 2C0DA 2MMAA 3TKPA 3D22A 3UVTA 3LG6A 2G2QA 1XIYA 4JR6A 3ED3A 4Q5QA 2GZYA 1ML6A 3UOMA 2B5XA 2B5EA 1AIUA 1F3AA 1Z6MA 3W8SA 1W89A 3F3RA 1GSDA 2VL3A 4IW9A 3Q19A 5G1LA 1O7UA 2WULA 4FYUA 2M46A 4NMUA 4MK3A 3UBLA 4HI7A 1CQGA 3GH9A 4TRXA 2YJ7A 4PQIA 3US3A 5HR0A 1SU9A 5IOXA 1OC9B 1GNWA 2I1UA 5DJLA 2TIRA 2PU9C 1YEPA 5CAXA 4DSQA 1Q4JA 1UN2A 2VO4A 1PMTA 4I2UA 3QAWA 1W4VA 3FRCA 1ZOFA 2FWGA 1SK1A 4K8MA 3UBKA 2YPMA 1ZCPA 2F3MA 2H1GA 3FR9A 3A2XA 2CQ9A 3IE3A 1SJ6A 5J3RA 2FNOA 5GAPD 3ZMKA 2HI7A 3F4TA 2O8VB 1OE8A 2B3SA 3TRPA 2LNSA 1OC9A 1ZZYA 3ERWA 3NZNA 1XCCA 2XPEA 5F0GA 1F37A 2OACA 2CZ2A 3TGZA 3F63A 4ZBBA 1CQHA 2IMKA 4XHMA 1JZDA 1YQ1A 4JE1A 2GSRA 2H0IA 2GVPA 1OE7A 1Y25A 1R26A 2JADA 4OMVA 5EVOA 2GSTA 2WCIA 1X0RA 3GIXA 3EINA 3WGXA 5DDLA 2X99A 2I9HA 4KW6A 3RHBA 3TOUA 3RBTA 3D0ZA 3HJPA 2E2MA 2R37A 3KP9A 1X5EA 3F4RA 3EU3A 2TRXA 4GXZA 3ZFBA 5KN0A 4YH2A 1TI3A 1SJZA 2VD1A 4EL1A 5ID2B 1J08A 2WFCA 3GL3A 3M3MA 3GFKA 4GQCA 1ERUA 1PKWA 1Z3EA 1VF3A 2WGRA 1TP9A 4GLTA 2JU5A 1GTUA 1V57A 2K9FA 1KEBA 4QL7A 2PERA 1PL2A 4HU9A 1FW1A 3L4NA 4PQ1A 3IBHA 4EF0A 2B7KA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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