2V6OA

Structure of schistosoma mansoni thioredoxin-glutathione reductase (smtgr)
Total Genus 180
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
180
sequence length
586
structure length
586
Chain Sequence
SQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
publication title Glutathione Reductase and Thioredoxin Reductase at the Crossroad: The Structure of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
total genus 180
structure length 586
sequence length 586
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2007-07-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2v6oA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2v6oA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2v6oA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2v6oA03
1XOAA 4OD7A 3TOUA 4YSHA 3PINA 2YQUA 5CRHA 4J56E 4OVIA 3QCPA 2RUEA 2H6ZA 5KVHA 1TDEA 3P4QA 4ZB6A 1K4QA 2GS3A 5ECQB 4H7UA 2ARDA 2MBTA 3AD8B 4Z25A 3F4SA 3Q18A 2PMTA 5KN3A 4O5RA 1SYXA 1WRYA 3L9SA 3GX8A 2FWHA 3K7MX 2BYBA 2WCIA 3IHMA 5EB5A 4KCEA 4B1BA 2GRTA 4GQCA 4U8LA 3C96A 3UMAA 2DJJA 4POLA 1EEJA 1PKZA 1K0MA 2V3BA 4AP3A 2XFNA 1SJZA 2R45A 4PNGA 2YWNA 5KOWA 2C1YA 3W8SA 1MD4A 3IF9A 4ML6A 2YG3A 4K7ZA 1K0BA 1M2BA 1LVLA 3QOUA 5DQYA 4WCTA 1XPQA 4HB9A 5CKUA 1L9CA 4AOSA 3H93A 4GQFA 4FYCA 2GDRA 4H4QA 5CNWA 3KCMA 4HS1A 2XDOA 2BCPA 3C7MA 2P5QA 4D73A 3D6IA 1FO5A 5G30A 1UC7A 1D5TA 2OE1A 3UBKA 4U8IA 5L46A 2B9XA 1Z7RA 1T8EB 4ECCA 5JCLA 1PHHA 2XVJA 4GR1A 1L9DA 2OE0A 4GF7A 4I59A 5B7CA 2WDQA 2R9ZA 3QSMA 4N9XA 1JHBA 2DIZA 4PQ1A 3GYIA 2GSQA 3CMIA 5C00A 1FB6A 4I8BA 4K2DA 3AE1A 3CNSA 4HQZA 2F51A 5D9XA 3QFBC 2YVFA 3VWVA 3EANA 1XANA 1JFUA 4XRDA 3AECA 3MDKA 3UKKA 2ZUPA 2R4EA 4FK1A 3EF6A 2YWIA 1BKWA 2QA2A 3NH3X 2I9HA 2XVEA 1N2AA 1CJ3A 2CFYA 4ACSA 3N9JA 4EC0A 3BI2A 1N4UA 4YTPA 2CVBA 2WULA 4TN8A 1T4ZA 2F8FA 2OBKA 3HJOA 4O32A 4RI7A 4C74A 3ZREA 1XIYA 4IVOB 1S3AA 3EWLA 1TDKA 4YXDA 3QR6A 2DJ0A 3SQPA 1YKCA 4OFTA 2WPEA 1TXXA 4U2SA 1GERA 3I6DA 2H6YA 2OA7A 2P31A 2EC4A 1CBOA 1E39A 3NG7X 2FWEA 4O92A 2RGOA 2V3AA 4BVXA 1AW9A 3HVVA 3IRAA 4JDRA 3P4PA 3L4NA 5JWQB 1A23A 4MLYA 2P5RA 4TR0A 4MCUA 4IW9A 3V3OA 4WEYA 1IUUA 1F6MC 3UTHA 3QFAA 1WP0A 2B1KA 3ADAB 2IVEA 4YKGA 2APGA 4Q5RA 3Q6JA 1X5CA 3EINA 4NTDA 1GESA 2BCGG 2WP9A 3HA9A 3NK1X 1DBYA 2H75A 2PVOC 1XW6A 1TI3A 2VCWA 1GULA 4MF6A 3LZXA 3CRUA 1SKSB 4MF5A 3KD9A 3TJJA 1D4CA 5EL8A 4L8EA 3P90A 1YF1A 3IV4A 2EIOA 4ZL9A 3Q6OA 3WGXA 2H1BA 2R4VA 3AYIA 1Z5YE 4K7OA 6GSVA 3O6TA 2Z5YA 2ON7A 3IOSA 4ZB8A 2JADA 4PX1A 2FHEA 2FCHA 1B4PA 1EP7A 2X3NA 5A4WA 1ZYEA 2AAQA 3HZLA 3IR4A 2Y6QA 2VRMA 4J57A 1GLPA 2KUCA 1ERTA 3FYGA 4HDEA 2XHFA 3O76A 2GR3A 3G5RA 2FLSA 1W89A 1CC2A 2GEWA 2Q7VA 3KEBA 2TIRA 4K9ZA 4J56A 3GDPA 4PABA 4IN0A 2ALBA 2RM6A 3FMWA 2HNLA 2CVDA 4Y4MA 1TRBA 4L5OA 2XFUA 4Q5QA 3EPTA 4CNKA 3NN0X 1R5AA 2GB0A 2LJKA 4J36A 2C80A 3IDVA 2C0GA 3DIEA 3AE2A 1PXCA 1M6IA 4IGJA 1TRUA 1QUWA 3L9UA 5EBKA 4P9SA 5JCUA 4A7AA 1R4WA 19GSA 4JRRA 1BYEA 3M1GA 4GDEA 1EOGA 1H81A 3D22A 1X9MB 4JE1A 5H5SA 3PGTA 4IJ3A 3CGCA 2ON5A 4MH3A 4TR1A 5COHA 1TK8B 2WEUA 1NG3A 1CJ4A 2IFQA 4H4ZA 1XPVA 2IN3A 1G6WA 4H4PA 3SWLA 2R37A 2JAEA 3K7QX 5FS9A 4PGTA 2H73A 4D03A 3AEDA 1XWKA 5ABRA 3FW2A 3B6DA 1EZKA 3KD0A 2OE3A 4F2IA 1K0IA 4FH8A 4H4VA 1IUXA 2RABA 1M64A 3A2VA 3GMFA 1ZKQA 4K8DA 1DOEA 1O95A 3OZ2A 2GZPA 2CVKA 2BA9A 3Q19A 2C3DA 3DYRA 3IPZA 1ZMAA 3NOFA 3LORA 1G7EA 3C71A 3ALMA 2K8SA 4GLTA 2X64A 3CTFA 3UJ1A 3NYFA 2O8VB 1NAAA 4I5QA 1W4XA 3F63A 4MA9A 5E4WA 3R9UA 4OO4A 1PBBA 1MDIA 4JQ9A 2YLWA 4USRA 4BA7A 2O9ZA 3O3TA 4A6NB 4ZILA 1G7OA 2YZHA 1TDFA 2VQBA 1R5PA 2NBSA 2YG7A 3DD3A 3UOMA 4RUVA 3W6GA 1ILOA 3TJKA 1MEKA 3U6VA 5AN1A 2LRTA 3ZLPA 2FBWA 4O5UA 3RDWA 2Q6UA 3UAPA 4CW9A 1JU2A 4EIQA 2AB6A 4EDZA 1SEZA 2YLZA 2GR1A 1EBDA 1GRFA 2IMKA 3CPHG 1G0TA 4LIIA 2YG4A 4H86A 3C4NA 4MPGA 3NK2X 2VCTA 4Y4NA 5HY5A 1Q1WA 5DVBA 1FAAA 1SL1B 3GD3A 1BAYA 1YY7A 5IPYA 1ERWA 5DAKB 3GH9A 4B65A 4K5RA 2CZ2A 2PWJA 2YOIA 1USBA 5ID2B 2GSRA 3DK9A 1TI1A 4JNAA 2C67A 5H5QA 2WB9A 4BL7A 4ZN0A 2WOWA 4YSZA 2L4CA 4A9WA 1RQMA 6GSWA 3FG2P 3F4TA 2YP6A 2ZCTA 4TKYA 1EV4A 2YVGA 3KKJA 3GN3A 2J3NA 3UEMA 1KF6A 2YN1A 4FYBA 3RBTA 2CT6A 2C66A 2GQMA 2OLNA 2GZYA 2QKEA 3D8XA 4YTMA 5J7XA 16GSA 4TXOB 4GTUA 5INYA 4GF0A 4A79A 5C2TA 4OPCA 2WDRA 3LXZA 5G5EA 2GQKA 1CC6A 4NPBA 1FOHA 1FVJA 3KM6A 3QAGA 4H2RA 1NEKA 4KDUA 1G6YA 3KP9A 2YR5A 2C65A 2IMIA 5ECNB 1TU8A 5CO3A 2IVDA 1D4EA 5AIVA 2YG6A 3VPQA 2XYOA 5IMDA 4X9MA 2WESA 4TOPA 4PNFA 2VCQA 4IP6A 2LEGA 1NENA 1X0RA 1PN0A 4K7IA 2H89A 3BHKA 1YZXA 2F8AA 3QAVA 3QFBA 2IIYA 1VRSD 4XS1A 5IOWA 5FMHA 3ZFLA 4K22A 4AJ7A 3JSKA 3DRNA 3F3RA 2VVMA 4ZB9A 1GT8A 3SM8A 4N10A 5JWRB 5LD0A 1JRXA 2VD0A 4YH2A 3GKXA 5ECKB 2WU5A 3M0FA 5IO2A 3QVRA 3IC4A 3GSIA 4HJ2A 3APQA 2JB3A 3AE9A 3HDCA 2PBJA 3GMBA 2R46A 2FNOA 2YM2A 2L59A 3KTBA 3L8KA 1S2QA 4XWZA 5KWFA 2DMMA 1ON4A 2JB2A 2RM5A 1XVWA 3APOA 1EL5A 1D7LA 3HJMA 1PBEA 4MZWA 3NTAA 1AIUA 1TDNA 3G7JA 3QAWA 2OA1A 2WPCA 5GAND 4J33A 5LV9A 1H83A 1OKTA 5BULA 4USQA 2FJDA 4GXZA 3AXBA 1SL0B 5C3JA 3R2QA 1ZY8A 3TCOA 4AJ8A 2BK3A 4OWYA 2O89A 4B63A 4GSTA 3AD7B 4KA0A 1SL2B 1P2HA 3FRCA 1PBDA 1F6MA 4OO5A 2OALA 4KCAA 4KSMA 4FX9A 1V57A 2LUSA 3FK8A 3DA1A 2FD3A 2VM1A 1PSQA 4H4RA 3CGDA 4Z26A 2H30A 1EL9A 5FS6A 5CAXA 1D7YA 1GPEA 4REKA 5IQ1A 3QJ4A 1OKDA 4KDYA 4Z2TA 4A5LA 3UKPA 1FVKA 5BUKA 3UBLA 2JL4A 3APSA 4OCFA 4DNAA 1DODA 4KX6A 1H4OA 1R7HA 3P7XA 1UN2A 1GSNA 4TM4A 4C5OA 1AQXA 1GNWA 3G7IA 1GL8A 3FR9A 3IHGA 1B48A 1CL0A 3ERFA 1CQGA 3ZRDA 3G5QA 1YQ4A 3RHBA 2DKHA 2XBQA 4IBPA 4WR5A 3KA7A 3VK9A 1AUCA 2B1LA 2E1MA 2DLXA 4CY6A 3DKSA 2EQ9A 2H8LA 2A2RA 1U3AA 3SGLA 4U8JA 1ST9A 1B4VA 2LQOA 3F4RA 3DWVA 4YSYA 2EQ7A 5CREA 4JN9A 2LKUA 3KU9A 3W8JA 1VF4A 2WPFA 1K3YA 3DGQA 3MSZA 4H50A 2BC0A 4G2EA 3F6FA 1E6BA 1SK0A 3GUSA 3T37A 3IK9A 4Z44A 1U87A 10GSA 1A0RP 2VOCA 3GL3A 3CSHA 1AC1A 1O8XA 1U88A 2XLSA 3A2XA 5HYMA 4HA6A 4A65A 2IIDA 2JKCA 5GSTA 3M3MA 1TK5B 4NHWA 4GCIA 4HJMA 3AEFA 4CDOA 4GDPA 1WMJA 2FWFA 1A2JA 3DGZA 3RP8A 1J08A 9GSSA 2Q0LA 2LJAA 4J2WA 2C73A 4NMUA 2CDUA 3C1RA 1JZDA 3GFKA 5IOXA 2A87A 1V2AA 2VM2A 5L71A 2LNSA 1JLWA 5HFKA 5F0GA 1ZP0A 1BX9A 2AYTA 2GMHA 1NPXA 1S3DA 1R26A 4MZCA 5CRDA 2WS2A 3J7Yk 2B5YA 2TRXA 1OC9B 1FG4A 1OJAA 1BG5A 1PRXA 2JZSA 1KFYA 2RGJA 3AB1A 3VRAA 3AY8A 1PD21 3K7TA 3ZYWA 1ZCPA 5EVOA 1K0NA 3MNGA 1K0LA 3NTDA 3UARA 4A6NA 1A8YA 2V1MA 2HSHA 4EMJA 1B8XA 5IQYA 2XFOA 3VFIA 4YKFA 2L57A 3F8RA 1GRAA 1OC8A 4PQIA 1LTXR 1Z7PA 1GRBA 1MTCA 1PBFA 4JY3A 3AYJA 1XWBA 2I3YA 3HZ8A 3UOXA 3BHFA 2WGRA 3VQRA 2XBIA 4ICYA 3CNTA 2TPRA 4X1UA 4N30A 1VDCA 2OBIA 1KNRA 2UZZA 1COYA 2BS4A 2B7RA 2PHHA 3RPNA 4K8MA 1A2MA 2R2JA 1GNEA 2YLRA 2ZZBA 1DE1A 5U25A 4O5QA 1KTEA 2VCXA 5DAKA 5EB4A 2YR6A 1KEBA 2HYXA 3AE3A 2BK4A 2GR0A 5ID2A 1VF3A 2RIIA 4IQ1A 3ICSA 1T4YA 4DSGA 1URMA 2EIQA 2VL3A 3CRTA 4XS6A 4F9ZA 2CVJA 5JCIA 4PUFC 4TRXA 4YT0A 4Y4LA 4TLXA 2C0DA 3ISOA 4E0VA 2L5LA 1Z3EA 1PKWA 2LQQA 3M12A 3ALLA 2FJAA 5FHIA 5DALB 5DCGA 4CY8A 1VRQB 4JBBA 4RSLA 5BRTA 3D0ZA 2I1UA 3HD5A 4NXIA 3IWAA 3IE3A 1FECA 2O7KA 2PU9C 1S3CA 3DVXA 5ECSA 4POBA 11GSA 1PDHA 1PJ6A 2QGVA 3PVCA 2HT9A 4H4YA 1SKWB 1V59A 4TXOA 1H86A 4TXVA 2XFQA 2M46A 2GH5A 3ITJA 5D73A 2RUFA 4WBRD 2NVLA 2CQ9A 3KH9A 2VL2C 1L9EA 1XFLA 5KXJA 4JR6A 2YLXA 4H4SA 1SKRB 2C70A 2VLVA 2ZZCA 1XOBA 3TUEA 5FWGA 12GSA 5KRQA 4U2TA 2XVFA 3ICTA 3ZIJA 5ECHB 4MABA 3DJEA 1XDIA 3LWAA 5B8BA 1ABAA 3Q9TA 22GSA 1UKVG 1NHPA 3BNUA 5EY6A 4OPDA 1PL2A 5IIZA 3CPJG 2B7KA 4JU5A 2CAIA 3CNJA 1RSGA 1X5DA 1PX6A 4EKZA 1XWCA 2F3MA 2FWGA 1K0JA 2OADA 1NHYA 2H0HA 5M0ZA 2BXSA 1V40A 4WETA 4MJCA 2IMFA 3UTGA 5DJLA 2DJ1A 5D8IA 1GWCA 4ZCCA 2QSIA 5U1OA 3ZYXA 5ECPB 1MDKA 2CX3A 3GTUA 4MJBA 1PX7A 1GETA 1NHSA 3F6DA 5GZZB 2GSSA 2Y6RA 1ERVA 4U8MA 1LQUA 2E2MA 1EL7A 5JCGA 4MK3A 3K30A 2WDUA 1VG9A 1M99A 2X8CA 2KLXA 5CYYA 2MYGA 1ONFA 1EV9A 4MF7A 1B4QA 2FA4A 2GAGB 1QFNA 3DMLA 3WGDA 4ZBDA 4H2QA 3A5WA 3UL3A 3E1TA 1GSEA 1TRWA 3ERGA 4NHZA 4U2LA 3CBUA 2PYXA 4ULXA 2ZNMA 1TTZA 4CNJA 4OFNA 3RNMA 2V6OA 1XVQA 3IA1A 4FO5A 5G5FA 3US3A 5J4UA 2C0FA 1H82A 3P1WA 4U8OA 2DKIA 2GT5A 2ZBWA 4KGIA 2REMA 3E9JB 1K0DA 4IA5A 2CA8A 2PN8A 3VWWA 4ZBAA 1GP1A 2C3TA 3DXBA 2GLRA 2GTUA 1GTEA 3GH6A 2M80A 5D96A 5F05A 3I69A 4BK2A 1PJ7A 2TMDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4NEV A;  1V9W A;  2XPD A;  1KNG A;  4YSX A;  3SXI A;  2C76 A;  3V3W A;  3H4K A;  3NVW B;  5BOE A;  6GSU A;  3QDN A;  3QPE A;  4GWR A;  3ICR A;  5JCM A;  1SJD A;  3KXO A;  3GDN A;  3IHQ A;  3CYJ A;  4BVY A;  2WET A;  1TOF A;  4HCL A;  2AHE A;  1HNA A;  1P48 A;  2W3R A;  1W6T A;  1ZK7 A;  2J9H A;  1LBK A;  4TLZ A;  1K0C A;  2JSZ A;  1PS9 A;  1AQW A;  1ZOY A;  3HXS A;  2LTK A;  3ZLF A;  3NGC X;  1Z6M A;  2YM1 A;  4ECB A;  4ZXG A;  1NG4 A;  2WOI A;  1NSW A;  5A4V A;  8GSS A;  3MWH A;  4K0N A;  1OJT A;  1SJI A;  2OQH A;  3UIW A;  4TR1 B;  3LOV A;  1E1K A;  1FCD A;  4EQR A;  1O5W A;  3F8D A;  2W3S A;  2IFQ B;  4J2F A;  5AIS A;  1GTA A;  4P3Y B;  2GL5 A;  3TDG A;  4QQ7 A;  18GS A;  1BJX A;  1D4D A;  2V2G A;  2LST A;  1OJC A;  1MDL A;  2H6X A;  4BJZ A;  3RAZ A;  5IPG A;  4J31 A;  3UOY A;  1NHR A;  2ACZ A;  3D1C A;  4IS0 A;  3CN8 A;  1BQG A;  3TJG A;  1GOS A;  3QPM A;  2B7J A;  3CND A;  4Z43 A;  1Y25 A;  1JLV A;  2YWM A;  4MP4 A;  3TB2 A;  3D21 A;  1T3B A;  2GQF A;  1KSS A;  3V3N A;  3KMO A;  4MMM A;  1OEP A;  2AUV A;  4GYP C;  1O7U A;  3DEX A;  4XRA A;  3T8Q A;  2YV7 A;  3A7A A;  4AT0 A;  3GL5 A;  3L9V A;  4WF4 A;  5B6M A;  3FIM B;  2GT6 A;  2OJL A;  1FL2 A;  1KDG A;  1WJK A;  2PGW A;  4UP3 A;  4HCH A;  1GUK A;  4J57 E;  3COX A;  1XBS A;  2H66 A;  3H70 A;  4OPI A;  3IAM 2;  1BGN A;  4ZIJ A;  2VUP A;  4MH2 A;  2C7G A;  3BCK A;  6GST A;  3SZ0 A;  2GQL A;  2H01 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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