2V6OA

Structure of schistosoma mansoni thioredoxin-glutathione reductase (smtgr)
Total Genus 180
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
180
sequence length
586
structure length
586
Chain Sequence
SQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
publication title Glutathione Reductase and Thioredoxin Reductase at the Crossroad: The Structure of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase
pubmed doi rcsb
source organism Schistosoma mansoni
total genus 180
structure length 586
sequence length 586
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2007-07-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2v6oA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2v6oA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2v6oA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2v6oA03
3AE3A 5J4UA 1B9XC 2WU5A 3P4QA 1Y56B 2FJDA 2MBSA 5ECNB 4YSZA 1YZXA 4EMIA 1E1MA 3AD9B 3QSMA 4NV2A 1G7EA 3NOFA 2WHDA 3EE2A 3UAPA 2PHHA 1ZOYA 1K0CA 1TRVA 3MSZA 4O7HA 1ERVA 1GL8A 3AEFA 1AUCA 1U3IA 2WPEA 2PU9C 4MP4A 3NZNA 2YN1A 12GSA 1D7YA 1YY7A 2CX4A 3M0FA 1H86A 2KHPA 5BRTA 1GP1A 2I1UA 3ME8A 3UKKA 3IXRA 4DEJA 2H1GA 3BI2A 4H4RA 4WCTA 1JZDA 1UC7A 1Y0PA 4ACSA 3SQPA 3UTGA 3QSSA 4FK1C 1URMA 5JCWA 1JZWA 2AAWA 3COXA 2OADA 4G2EA 3L4NA 4EE0A 1DOEA 2YR5A 3OR5A 1RW1A 1F9MA 1ABAA 2RM5A 5IMAA 1B8XA 4G10A 3HJMA 2EQ7A 1K0AA 1VRQB 1WPIA 4EMJA 1Q9IA 2M72A 4ZN0A 1XIYA 1GNDA 5DVBA 1DNCA 4KCAA 3CGEA 3IE3A 4Z26A 2X8HA 6GSSA 2LV3A 1KFYA 3GKMA 2B5EA 1E1KA 1GSEA 2YLWA 1AAZA 3V76A 1X9SB 1H7WA 3JCML 2FHEA 1GRXA 1BGJA 4OPGA 3RDWA 1GV4A 2LRCA 2FWFA 2YAUA 5GZZB 1VRSD 3PH9A 5IQYA 1UVZA 3WT2A 2H73A 5EB4A 2IFQB 2AUVA 1LTXR 6GSTA 1ZKQA 1KSSA 5LV9A 4BVXA 2RUEA 1N4UA 1TU7A 3SFDA 5JCUA 5KN2A 4GRTA 2XPDA 6GSXA 5IQ1A 3Q18A 2V2GA 3UP4A 2B7JA 4GSTA 2FJAA 3RHCA 1SL1B 3BJ5A 1ON4A 3K30A 4I58A 3J7Yb 2YJHA 4PNGA 2C80A 1KBNA 5CYYA 2WDVA 2A2RA 1ZYQB 1A24A 1M2DA 1U88A 2OACA 2H6XA 1TI3A 17GSA 4TN8A 5B8BA 5G5EA 4AP1A 3NN6X 2YLZA 4BPYA 2C0GA 4WF5A 3FZAA 1M7TA 3DGQA 3KU9A 1DXLA 3IHGA 2WJUA 3Q74A 3G7JA 3ISHA 2CULA 3GA4A 1DUGA 4IVOB 3EMPA 4J2WA 2CT6A 1PGTA 1LV0A 3C4NA 3I43A 2WOWA 2QA1A 1NSWA 4GRFA 1CHUA 2WDRA 1O6JA 3P90A 1LBKA 3CTFA 4XXGA 3APQA 2MZCA 5HQPA 2P5RA 2HQMA 4GXZA 3KVEA 2DJ2A 2WRTA 4HOJA 5CQFA 3GL3A 2V3BA 3FZ9A 2R0GA 3IAM2 4K9ZA 2VUPA 2GT6A 4TR1A 4Q5FA 3GL5A 2YG4A 1S3BA 4O92A 3DJJA 5ER0A 1U87A 4HU9A 3LZXA 4Q5NA 1IYIA 20GSA 4FO5A 3BOAA 1ZMAA 4ICYA 4K7IA 4HU7A 4JY2A 3QFBA 2GQWA 5FS9A 2DJJA 5D9TA 1N2AA 1Y56A 2KLXA 3QSEA 3DK9A 1S3AA 2Q6UA 3TCOA 3SWLA 1CJ2A 2GMHA 1T1VA 4LA1A 3KXOA 5DDLA 1BZLA 3IA1A 2N5BA 3G5SA 4DVCA 1SKRB 4YSYA 2CZ2A 3VFIA 2GZPA 2LKUA 3CBUA 2GLRA 3IBHA 5HFIA 3RHBA 1FW1A 4YH2A 5ECIB 1WJKA 5DJLA 1B9YC 3CTGA 4F0CA 3GTUB 1QLBA 1WOUA 2M80A 3SGLA 2R0PA 1X31B 3WGEA 4WR4A 1TRBA 1LQTA 3HKRA 1NDAA 2A87A 4B63A 4REKA 4PX1A 4RUVA 3VRAA 3KLJA 2IMIA 2XFQA 3CNJA 1JU2A 4J31A 1SJZA 3QVRA 4CRTA 4UDRA 3KP8A 4LIIA 1Q98A 1GUHA 4ZB9A 5ENUA 4KNDA 2GQKA 5AIXA 2VIMA 5J7XA 4EXJA 4MH3A 7GSSA 4CHSA 3JSKA 1H75A 4K2XA 2R0CA 2NPXA 1XCCA 1O81A 1GH2A 3VRBA 1DJQA 4K1FA 3D8XA 3M13A 3EU4A 5IPYA 4BJZA 4H4WA 3NKSA 4MJAA 1GALA 4USQA 1USBA 4XHMA 1F8WA 3C71A 1EEJA 3D4MA 1WP0A 1S2QA 3GH9A 3TRQA 3GDPA 3M3MA 3VWUA 2GQMA 3TGZA 3KCMA 5EVOA 4EQRA 1UA5A 1B5QA 3O6TA 1ERWA 4N0VA 1D4EA 1EBDA 4FX9A 4ISDA 3KPFA 5JCIA 2BS4A 1B4QA 4X9NA 1FECA 4A99A 1XANA 2XFNA 5IMDA 4POLA 4OVIA 3SBCA 2V3AA 5FS7A 3FR6A 2DKIA 3PVCA 2BK3A 1B4PA 3D0ZA 4J57E 2I9HA 1PL1A 1M2BA 2NTOA 4I59A 4IQAA 4JQ9A 4E0VA 2R4EA 1XBSA 4M52A 2AYTA 1V9WA 2VCVA 3TKSE 3NIXA 3NK2X 2GV8A 5KN0A 2OLNA 2MMOA 4I5QA 2OKAA 1LJ1A 2O89A 4LL4B 2VRLA 1EP7A 5G30A 4H4UA 2GR2A 2B76A 3HCZA 4K7ZA 5B8AA 1GERA 1O73A 3WGDA 2DJKA 4RG4A 2XYOA 5G2ZA 2IVEA 5DAKB 4L0WA 2DC5A 3FW2A 1EP8A 4TR0A 3CRUA 5D93A 3ZRDA 4ECCA 1IUWA 1F3AA 4KGIA 1MD3A 4GUVA 2XVIA 4EIQA 1XVQA 3DJEA 4B65A 1F3BA 1SK0A 1B4VA 1DE1A 5DBJA 2NDOA 5J5NA 2I81A 3MDKA 1VQWA 1H4OA 3LWAA 3KD0A 2H1DA 3CNDA 2R9ZA 3NT6A 1GESA 2CAIA 2LQQA 2B9WA 1OJAA 4L5OA 1T4ZA 3DYRA 3L9VA 2CFYA 5KOWA 1K0NA 2YWOA 3REDA 4IELA 2H6ZA 2DKHA 4U8OA 1TXXA 4IJIA 4H7UA 4YKGA 2IL3A 3W8JA 5EY6A 2C75A 1T8EB 4FK1A 5AGYA 2K8SA 1TK8B 4XRDA 3GWDA 1MEKA 5ELGA 4O32A 3LFLA 4GF7A 3QD9A 1JRZA 3GWFA 2IMFA 2ZNMA 4OFNA 4UDQA 2JBVA 2XLRA 4K22A 2H74A 4G19A 1R4WA 1PDHA 5DQYA 5IO0A 4O5QA 4AT0A 2VL2C 5HR3A 3GYJA 1HNAA 2OLOA 4OPLA 3K7TA 4C74A 1YF0A 2WS2A 2EIRA 3VQRA 1TP9A 2ES7A 3TKSC 3QOUA 2EQ6A 4XS4A 3TJJA 4ID0A 1DOCA 2REMA 5LCZA 4U2TA 1JRXA 1KNGA 4GCMA 2WOIA 1GTIA 2TRXA 2WEUA 4NZHA 4BJYA 19GSA 1SJ6A 4NHWA 3IRAA 3EINA 3F3RA 3TB2A 3QAVA 3ICRA 3LOVA 4GDEA 4XRAA 3P9UA 4WBRD 4MMMA 3KH9A 3TOTA 4EF0A 2ZUPA 3IK7A 4XWRA 1MDJA 1V59A 4L0UA 2WULA 3A2XA 2YR6A 3ZFBA 5IPGA 4Y4LA 5FS6A 2DLXA 4PURA 2RGOA 3F8UA 1PJ7A 2YJ7A 1QGVA 2I3YA 2YPMA 3C1RA 1E39A 3DGZA 3BCIA 2C3NA 2ZZCA 3IR4A 2EQ9A 3H4KA 3ICSA 5J9CA 4A79A 4DNAA 2VL3A 2LRNA 2WPFA 1TRSA 4IVFA 2Q7VA 2TRCP 4YAPA 2YVGA 1HD2A 2LNTA 4OFMA 3UEMA 3UTEA 2IPAA 3P4SA 5BVAA 4C5OA 3OC4A 1BG5A 3Q9TA 2WBAA 1VF3A 3A2VA 5HR0A 5C04A 4OPTA 4MF5A 3P7XA 2TPRA 3FBSA 4PQHA 3AYJA 2C1YA 1K0OA 3TKPA 4RI7A 2Z5XA 3IF9A 2HXKA 1EWXA 2BABA 2YOIA 4XS1A 2J23A 5JWQB 1Q1WA 2J3NA 4HQSA 5A4WA 2X50A 4NV5A 1PMTA 3FYGA 6GSUA 1TDOA 3IHMA 1PX7A 4JN9A 2PGTA 1Z5YE 2AB6A 2CV4A 1U3AA 3AEEA 1TDNA 2VVLA 1L9CA 2XDOA 3P4PA 5D96A 2BS2A 3UOMA 4EC0A 3QR6A 4POMA 3ERGA 1NHOA 4NPBA 1JNRA 1JZRA 4TM3A 2GSSA 2O85A 1XZOA 22GSA 2KP1A 4N30A 4F2IA 4DSSA 4CY6A 4ZCCA 1FVJA 2X8CA 4U8JA 3VI7A 5JCMA 5J41A 1GRBA 1RQMA 4XCSA 2GH5A 3UL3A 1XFLA 5C2TA 1K3LA 4HZ4A 4A6NB 1Z3EA 2H01A 1DBYA 2YLSA 4GLTA 3GX0A 3TKQA 4KE3A 4NWYA 2X3NA 3UIWA 1OJ9A 3ZVJD 2V1MA 3LADA 2JB1A 2CVDA 3CPIG 3NH3X 2PMTA 4D03A 4YSHA 3R2QA 4HS1A 4ULXA 2CX3A 5FMHA 2GT5A 3CSHA 3GMBA 2V6OA 2GZZA 3CGDA 1FCDA 1D7LA 1YJ6A 3TRXA 4K5SA 3UOVA 1M0UA 1T3BA 1JNZA 2H1AA 1ZY8A 3DXBA 5IIZA 4U8PA 2P0GA 1H7XA 4Y4NA 3UP5A 1AQVA 4WR5A 3RP6A 4TM0A 3CSJA 2JK6A 4MZWA 4AOSA 3W6GA 3ZMLA 2L6CA 1TYTA 4APNA 3VLNA 1PKWA 2O87A 2KUCA 1ZZYA 3S9FA 3E0UA 5KN1A 5B6NA 3A5WA 1CF3A 5G31A 2WOVA 4EIPA 5G1LA 1T00A 1NW2A 1YKAA 2LEGA 3C4AA 4CNKA 1OAZA 2HZEB 2OA7A 4K0NA 1CC6A 3F0IA 1K0JA 4OPUA 2DIYA 4OO4A 2EC4A 1XVWA 2H72A 4G9HA 1GTUA 1HQOA 2M46A 1YY5A 3DVXA 1G0TA 2VCXA 2GR0A 4H4XA 5IO2A 3VPQA 3FEUA 1BEDA 2H75A 1A2JA 1Y25A 2VCZA 2DIZA 2PPTA 4FYUA 3P8WA 3LYPA 4ZL7A 2E7PA 2BC0A 1R26A 4OCEA 2CA8A 2E5VA 5DBQA 2HRNA 1DOBA 3AE7A 1YKJA 2D2ZA 1GRHA 2H0GA 4LMVA 2CVKA 3HVSA 1O8XA 5M0ZA 3GD4A 4CW9A 3KTBA 4KAEA 1O7UA 2Q0KA 2H19A 2H1BA 1O85A 2YANA 2NPBA 3L8KA 5E59A 2C3CA 1FG4A 2I0ZA 5CP1A 3TJFA 1ZK7A 1GLQA 5CO3A 4Z25A 2PWJA 1OJDA 3RAZA 3BNUA 4EM4A 3J7Yk 1KEBA 1MTCA 2O8VB 2EIOA 4X4JA 1XW6A 4RG3A 5GAPD 2OE3A 1ONFA 3D21A 3ZREA 2OE1A 2XFOA 4OPIA 3ED3A 1OJTA 6GSVA 4J36A 4E8EA 1YDKA 2RABA 2LNSA 1A0FA 3AXBA 1ACVA 1K0IA 1VF4A 4H4TA 3HYPA 1M9AA 1QUWA 1NHRA 4YTMA 2HNLA 4OCFA 5HFKA 1F37A 4U8LA 2GVCA 2R4VA 4H4PA 5KWFA 3D5JA 4DSQA 3NLCA 4YT0A 2V5ZA 1OKTA 1GTEA 2ZCTA 2ZZ0A 3GIXA 2Y6RA 2B9YA 3LYKA 3ITJA 4A6NA 4AOXA 1NHYA 4KB3A 4MJEA 2YM1A 2A89A 4K8MA 2JZRA 1S3EA 4J56E 2OE0A 1L0VA 2E0QA 3CPJG 4NXIA 4KUNA 3RP8A 2F8AA 2VL2A 2GTUA 3EURA 3F4TA 3GH6A 4JRRA 1NHQA 4CDOA 5A5KA 2R6KA 1CQGA 1X5EA 2FBWA 1K0LA 2GSTA 3FR3A 1W89A 2DJ3A 3FR9A 3ERFA 4UP3A 1GREA 4X43A 4EM3A 1HNCA 1XWAA 1X9MB 3ZMKA 2R4JA 1SYXA 2GGTA 5IMZA 1M9BA 4BV6A 1EZKA 4GR1A 4ZL8A 3EMXA 5J3RA 1IUTA 2LJRA 3NGCX 1NHPA 2JAEA 3C7MA 1SU9A 3NK1X 4NAXA 2OALA 4YAVA 3IHQA 4F9ZA 2H8LA 2JSYA 3GSIA 3N9JA 4IGJA 1OE7A 3LZWA 5HR2A 4KH7A 2QKEA 3PGTA 2XLUA 2YG7A 2RIIA 3GUSA 3M9KA 1PBDA 5JCLA 1Q4JA 2Q0LA 3WYWA 4YXDA 4Z7XA 3PINA 4X9MA 4ZBDA 1SD8A 4TXOB 2AV4A 3IAS2 2VM2A 1FO5A 1CJCA 2OAMA 2IMEA 1J9BA 1GLPA 4C3XA 2IMDA 1L9DA 3IK9A 3AY8A 1F8SA 1REOA 1T7PB 5CRDA 1EL5A 3ALLA 2CZ3A 1GULA 1HNBA 2BXRA 4NTEA 1E6EA 1TI1A 2VOUA 1XWGA 5COHA 4AT2A 3IC9A 5ECLB 1XW9A 1NPXA 3UVHA 1FL2A 2L57A 1RP0A 3AWIA 3VPTA 4TVEA 1OC9B 1XWKA 2C4JA 3FMWA 2APGA 1BF3A 1X0RA 3I6DA 4OFTA 3C73A 4TLZA 3PR8A 1VGLA 1EGOA 4JEDA 2LUSA 3G5RA 4POBA 4F82A 4V1Ap 1GSSA 1TOFA 4OD7A 6GSYA 1VDCA 3DEXA 1CC2A 1HYUA 4FYCA 3AE4A 2O7KA 1ZP0A 2VOCA 4ZXGA 3CN8A 4P3YB 4Z2UA 5A4UA 4U8MA 2R3XA 4Q5RA 4PQIA 3GSSA 2C76A 4H2QA 1Z9HA 3HHVA 2DBCA 4KDXA 5DALB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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