3QPMA

Crystal structure of peroxiredoxin prx4 from pseudosciaena crocea
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
195
structure length
195
Chain Sequence
LHLSKAKISKPAPQWEGTAVINGEFKELKLSDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRVHEFRAINTEVVACSVDSQFTHLAWIITPRKQGGLGPMKIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDQGHTLRGLFIIDEKGVLRQITMNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSDTIIPDPSGKLKYFD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Larimichthys crocea
publication title The N-terminal beta-sheet of peroxiredoxin Prx4 in the large yellow croaker Pseudosciaena crocea is critical for its peroxidase and anti-bacterial activities
rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin
total genus 64
structure length 195
sequence length 195
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-02-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3qpmA00
2IMKA 2OA7A 3IPZA 2VUPA 1FHEA 3TKPA 4EF0A 3HVXA 2C8UA 2VOCA 2ZCTA 4HQSA 4DSSA 5F8BA 3ZRDA 5CO3A 2GVPA 2OADA 3ZIVA 2Z9SA 3KMOA 2WFCA 1V98A 6GSVA 1R26A 3ZYWA 2DJ2A 1A2JA 4V2LA 4I6XA 2OE0A 5DDLA 1GTAA 5FWGA 2JSZA 2VO4A 1HYUA 2RM6A 4WETA 4XS4A 2I4AA 1B9YC 4NV2A 17GSA 1OKTA 4IJ3A 5DALB 4MMMA 1SU9A 3DGQA 5IMVA 1AQXA 1AIUA 4ZL9A 5DCGA 3KH9A 3BJ5A 4ILFA 4MH2A 1T3BA 2RIIA 1SKRB 2LRNA 4MJEA 1XWCA 3ZZXA 5G5EA 2WCIA 1B9XC 1WP0A 4KCAA 2FWGA 2HE3A 5G31A 22GSA 1TXXA 3TDGA 2H6ZA 3VPQA 2O89A 1GWCA 3N9JA 4GWRA 2ON5A 1SL1B 3HZ4A 3ZIJA 3ME8A 1URMA 2CVKA 2DLXA 3G7IA 4MJCA 3P90A 4PURA 2O7KA 3EU3A 2O85A 4K7NA 1O73A 2FWFA 1T4ZA 1K0NA 3IE3A 2AYTA 4WF4A 1V57A 4XRAA 2IWTA 4YQVA 2I9HA 4BVXA 2YJHA 3OR5A 1FVKA 5J5NA 3GFKA 4FO5A 1OAZA 1JHBA 3F6FA 3M1GA 4O5RA 3L9UA 2L6CA 3GV1A 5J41A 1OYJA 1AUCA 4XIHA 2O87A 2IPAA 5J4UA 3D0ZA 2ZUPA 3TJFA 3KP9A 3KMNA 1SL0B 4KUNA 5B7CA 2FUG2 3GTUB 5D9VA 1SYRA 3W8JA 3H8QA 4BWSA 2F9SA 2GGTA 2H8LA 3GX0A 3MDKA 3LJRA 4AJ6A 4LMWA 4N0ZA 3KD0A 1A8YA 3FZ5A 1GP1A 1CQGA 4TXOA 3DIEA 3W8SA 3A2WA 2B5XA 3UJ1A 2LRCA 2PERA 3D5JA 1HNBA 1AW9A 4HZ2A 1FOVA 2I1UA 1WWJA 3O6TA 4L8EA 3GKNA 3L9VA 4XS1A 3FYGA 5EPFA 3F3RA 4K9ZA 4TR4A 3BCKA 1TK5B 1TJDA 2YWIA 2G0FA 1THOA 2YPMA 4WBJA 4WEYA 3UBLA 4PGTA 5J9BA 1AC1A 2R6KA 4PUAA 4KDXA 2DMMA 2PGTA 4WR5A 2HFDA 1QQ2A 5IM9A 1ACVA 1TP9A 2VL9A 2N5AA 1FG4A 3BOAA 4HZ4A 4I8BA 2E2MA 1YEPA 1U6TA 4NHZA 4J56E 4MCUA 1I5GA 1Q98A 3TOUA 2YZHA 3NOFA 1F9MA 1GLQA 2XBIA 2REMA 4EDYA 1WE0A 3ED3A 4XHMA 1A0RP 2JACA 1T8EB 1Z7PA 4LL1B 5ECKB 2FD3A 2YANA 2C1YA 2MZCA 4EUYA 4JR4A 1F6MC 4OFMA 4MF5A 3VI5A 6GSYA 2YV7A 1X9WB 3RPNA 4KDYA 3GX8A 4GLTA 3CSIA 4GXZA 1M9AA 2VL3A 1ZOFA 1OC9B 2QKEA 3BCIA 1QXHA 4FYCA 5B8AA 2IFQA 1JZDA 1TKDB 2C3NA 4TR1B 2E7PA 4RQXA 2IJYA 3FZ4A 2H1BA 3LWAA 1I9DA 1GL8A 1U87A 2KHPA 3ZL5A 2O8VB 3H93A 4POLA 3APOA 1R4WA 2FCHA 3CTFA 3A2XA 1PA3A 2GSTA 2WS2A 1MDKA 3ERWA 5COHA 4E8HA 2HYXA 4POBA 8GSSA 2DC5A 2MBSA 1J9BA 4ECJA 2V2GA 1TOFA 2DJJA 5FT3A 1GUKA 2ZNMA 2DJ3A 1YQ1A 3KGKA 5ELAA 2H1GA 3F9UA 3UARA 5D73A 3P8WA 2KUCA 2X99A 2NVLA 1DSBA 4MA9A 1X5EA 6GSUA 6GSTA 3EVIA 2PVOC 7GSSA 1XXUA 2AV4A 1S3DA 3G7JA 2IL3A 1TI3A 2CT6A 2X8HA 4ULXA 3C8EA 4MZWA 1A0FA 2AAWA 2XHFA 3VWXA 4E8EA 1O8WA 4HDEA 4MZCA 2OBKA 1PD21 3KH7A 3CSJA 1X5DA 4HOJA 1USBA 2BMXA 1KBNA 3TOTA 1R5AA 4IN0A 3LXZA 1DBYA 2HI7A 3EMPA 3TKQA 1E6BA 4TN8A 2JADA 3AY8A 3E9JB 2L5LA 5ELGA 5C04A 1W4VA 1X9SB 1XBSA 4BA7A 1MD4A 1MDJA 2FWEA 3M9JA 2GT6A 1K0DA 4WXTA 3GA4A 1GSYA 1M7TA 1MTCA 4GSNA 4KSOA 1OC3A 5HQPA 4PQIA 3GNJA 5A4WA 5GSTA 3UEMA 1OKDA 3EINA 5D8IA 5G1LA 5DAKB 2JZSA 4D73B 5IPGA 3TKSE 1H75A 2R37A 2JL4A 3HKRA 4ZIJA 4PNFA 4WKWA 1V9WA 2OACA 4EL1A 1BX9A 4LA1A 2H71A 1FB6A 3FY7A 3FRCA 2CAQA 2C0GA 1IYHA 5LCZA 3L9SA 1HNCA 3H1NA 1GULA 4NWYA 1AQWA 4P3YB 3VPTA 2LJRA 3D22A 3HJPA 5IOWA 3QR6A 4K7IA 5KN1A 1RK4A 2BJXA 5IMDA 3FZ9A 1EV9A 2L4CA 1AAZA 2LV3A 2H75A 2GQKA 1TW9A 1VGLA 4ML6A 3QAVA 1JFUA 4IELA 1UA5A 2FNOA 3RDWA 5AIXA 2EIQA 5ABRA 5B6NA 2AUVA 3UOMA 4EKZA 3A5WA 1YEXA 3CRUA 2F8FA 4ECIA 5CNWA 1G6WA 3EC3A 3CXGA 1UN2A 3HHVA 3DWVA 1GSDA 2CZ2A 1LBKA 2CVBA 1WPIA 2G2QA 4BWQA 2NPBA 4F82A 4JRRA 2HSYA 1F37A 3FHKA 2EIOA 3D4TA 1X5CA 2DJ0A 3GRXA 4OO4A 3GKKA 1X9MB 3HY2A 2R4VA 2VLVA 3D6IA 4KA0A 20GSA 1Z7RA 3ZMKA 3IK9A 4QQ7A 4ACSA 2H0HA 4EC0A 4TR3A 3VURA 3IXRA 5H5QA 1HQOA 4GRFA 2GLRA 2JU5A 1B48A 5ENUA 3IA1A 1V58A 3KP8A 4IBPA 4KE3A 4EE0A 3WGDA 3TGZA 2DIZA 3P7XA 4WF5A 5F05A 2CZ3A 2LS5A 4V1Ap 5E59A 2DSAA 4TR0A 3NIVA 3WD6A 2BTOT 19GSA 3TRPA 1NSWA 3V1WA 2KLXA 3FEUA 1WIKA 4K1FA 3Q6OA 3IAM2 3O3TA 4IKHA 4MK3A 5FHIA 4DSRA 5C00A 3VWUA 4ZL8A 3EU4A 4TVEA 2HLSA 1R7HA 1B4PA 2FWHA 4O92A 3EURA 2XBQA 1T00A 5ID2B 1ZL9A 4AJ8A 3TKSA 1U3IA 2VD1A 4V2MA 3HCZA 4ZB8A 2NBSA 1ABAA 4JZQA 5JCWA 5IO2A 3GTUA 1S3AA 2WDUA 1PX6A 4F0CA 1GSEA 2TRCP 1GSQA 3GYKA 3KTBA 3PH9A 3ZREA 1YZXA 1O81A 4DSSB 4ECCA 2VCWA 3HJOA 1TI1A 4K7OA 4RUVA 3HXSA 3LGCA 1EGOA 1C72A 1T4YA 4ZBDA 2P0GA 4MLYA 4F0BA 4HJMA 1U88A 3N5OA 4TXVA 3GMFA 2XPDA 4NPBA 1JZWA 1IYIA 5AISA 2R5GA 2MMOA 1XPVA 1O85A 1Z6MA 2EC4A 2GSQA 4GQCA 1GRXA 4XS4B 4KX4A 1HNAA 2HZEB 3GL3A 1ZCPA 1XZOA 2PU9C 2MMZA 18GSA 1GUHA 2VCQA 1ML6A 5ECHB 3DVXA 2C0FA 1PKWA 5KN2A 2I3YA 2VLUA 4YAVA 11GSA 2YWOA 1XOAA 2VCTA 5DBQA 1A8LA 5A5KA 1YJ6A 4K8MA 4PNGA 2DMLA 4LL4B 1DUGA 5GAPD 1GSSA 1BEDA 2KP1A 3GH9A 3IAS2 1CQHA 2K8VA 4OFTA 1K3YA 1YKCA 2LSTA 3PINA 4K0NA 4NXIA 2LUSA 4MDCA 3US3A 2VAFA 2V41A 5G30A 1PMTA 2HRNA 3VWWA 5AGYA 4IS0A 3GSTA 5ECQB 1G7EA 1GTIA 4TOPA 3APQA 4MPGA 1QK8A 2YOIA 4V1Ag 2LKUA 4OO5A 4KAEA 2IMIA 1WOUA 2HZFA 4PQ1A 1PSQA 5INYA 4KB3A 5ECMB 4K2DA 2LQQA 3QOUA 1GSUA 1EOGA 4PXOA 5D96A 1ZGNA 4G2EA 3IBHA 1SK2A 4FH8A 1NHOA 3MWHA 3KM6A 2HNLA 4XCSA 3J7Yb 3HZ8A 4ZXGA 5KEJA 4TXOB 3P2AA 3A3TA 3UAPA 3QD9A 1TDIA 4G19A 3GHAA 3RPPA 1BG5A 1TRUA 3GURA 3HDCA 2H76A 2X8CA 5HR2A 2LJAA 2RLIA 4X1UA 2RUFA 2HT9A 3M0FA 3UL3A 5GAND 2R3XA 2PWJA 3KIJA 2TIRA 1K3LA 5L71A 3F8UA 2NDOA 1M9BA 2CAIA 1UC7A 1GNEA 1G6YA 4IGJA 2PN8A 3TUEA 5HFGA 5CRGA 1HD2A 4IJIA 1JZOA 4ML1A 4IQAA 4FYUA 3PR8A 2B3SA 4K0GA 1EP8A 3CYNA 2LTKA 1EP7A 2OJLA 1S3CA 1PL1A 2LQOA 4NMUA 2AJQB 2DBCA 3QMXA 5G1KA 2ALBA 3KCMA 3ZMLA 4HI7A 3I43A 1JLVA 1O8XA 1BYEA 3TB2A 3ISOA 1ERTA 2H0GA 4BPYA 2GTUA 4H86A 2DJ1A 1VF2A 4AJ7A 3ZTLA 2GZPA 1DE2A 3I6AA 2IFQB 4HS1A 4JBBA 1EWXA 3TJJA 1ERVA 1ZYEA 3MSZA 1G7OA 3GN3A 1LU4A 1MDIA 3CMIA 4F2IA 2OKAA 1ILOA 1SK1A 2QGVA 5JWQB 4KDUA 2WZ9A 3WGEA 4KSMA 4EXJA 2K9FA 4WBRD 4HEA2 3NZNA 2FLSA 3KEBA 4CW9A 4NHWA 2B5EA 4Q5QA 5JCUA 1B4QA 3VI7A 16GSA 4GCIA 5CAXA 4XS6A 4Q5RA 1FVJA 5DQSA 5ECSA 3VK9A 1BJXA 1LJRA 2PBJA 1N2AA 2A4VA 4IW9A 2A2RA 3K8NA 5F0GA 1M2AA 4JEDA 4XTSA 3F0IA 4ZL7A 2H19A 4ZBBA 2PVQA 2M80A 2JSYA 1VRSD 4YAPA 1Z5YE 3GKXA 2AB6A 1FAAA 2K6VA 2H72A 4F03A 3QAGA 2DJKA 5IPHA 3HA9A 2TRXA 3BD2A 3DMLA 2IN3A 3FW2A 1J08A 1XWGA 1YKAA 2L59A 2PPTA 2H1AA 2C80A 1V2AA 2NTOA 1K0MA 2KOKA 2C0EA 5G2ZA 3QDNA 5IMFA 1RW1A 3Q74A 4IP1A 4LMVA 2H70A 3KTLA 4MH3A 3U6VA 2GZZA 4RI7A 1ZYQB 1XWKA 5DALA 4OMVA 3S9FA 4IP6A 2VM2A 4CHSA 4OFNA 1BQ7A 2MMAA 1F3AA 4JU5A 1E2YA 1A2MA 2M72A 2K18A 4ZB6A 3J7Yk 4N0VA 1T1VA 3EYTA 3U5RE 5ID2A 2OBIA 5F07A 2H1DA 3C1SA 2DIYA 2GT5A 2KP2A 1TRSA 4ZB9A 1X0RA 4GSSA 3QCPA 4N30A 1H4OA 3DXBA 1SJZA 2FHEA 3SBCA 1A2LA 2LRTA 3GSSA 3UVHA 2JZTA 4ZILA 1TRVA 5EY6A 3WYWA 3VLNA 2M46A 5IIZA 3TCOA 2HRFA 4TKYA 3APSA 1YY7A 3KJYA 3PGTA 4V2NA 4N11A 4FYBA 1XWBA 1TK0B 1K0BA 13GSA 2IMFA 1M2BA 2GSSA 1OVNA 3ZFBA 2X8GA 1MEKA 3L78A 2YCDA 4L0UA 1SKSB 4GF0A 4IVFA 2GZYA 3IDVA 2LNTA 2LJKA 1B8XA 3TRXA 1TU8A 3G9BA 5D93A 4L5LA 1GTBA 1W89A 3FZAA 3G7YA 2H0IA 5DCHA 3ZVJA 4K6XA 1O7UA 5ECLB 3RHBA 2P5RA 3IOSA 2HZEA 2GS3A 3F4TA 2ES7A 5GZZB 4CDOA 3ME7A 1G0TA 2F51A 2H66A 2D2ZA 1XW6A 4GQFA 4OCFA 4N10A 3FR6A 3GIXA 4MJBA 3DEXA 2YV9A 3Q18A 2RUEA 5CRWA 2ON7A 1ERWA 3CBUA 5J9CA 5JWOB 4OD7A 2IMEA 2VL2C 2C0DA 4DSQA 1RQMA 2R2JA 2C4JA 2YJ7A 5ECOB 1GH2A 5KN3A 1OE8A 2WJUA 1PKZA 3IV4A 2YNXA 2H6XA 3QPMA 1ON4A 2L57A 4G9HA 4ID0A 4YH2A 1A24A 1A23A 4ISDA 1PGTA 2GDRA 3SWLA 5KN0A 4X43A 2XPEA 1GLPA 3LYPA 6GSXA 1WRYA 2LEGA 3E0UA 12GSA 3ZITA 1JZRA 4I2UA 4QL7A 4QL9A 2CA8A 4RI6A 3GL5A 2V32A 1QGVA 4EVMA 1KEBA 4POKA 1SJIA 5H5RA 1QMVA 1ZMAA 1AQVA 14GSA 1YF0A 4HU9A 2J23A 2P5QA 1BAYA 5IMCA 3LSZA 1ERUA 4JE1A 10GSA 2LNSA 2A2SA 3JCML 1AXDA 3FKFA 4X0XA 4Q5FA 4HU7A 4L5OA 3F3QA 4Q5NA 1U3AA 1VF4A 5DJLA 3QAWA 1SJ6A 5IO0A 3TJGA 1XW9A 2YP6A 1TRWA 1Y6EA 3IRAA 2MBTA 5ECIB 3ERFA 3TKRA 6GSWA 3EMXA 3VWVA 3ZFLA 2VLTA 2WB9A 3DKSA 1DE1A 3GKMA 5IMAA 2I81A 1VF1A 1PRXA 5EL8A 4KNDA 1OC9A 5HR3A 3TRQA 4MABA 2CQ9A 1M0UA 4MF6A 1WJKA 4HQZA 4TR1A 3Q19A 4YQMA 5CRDA 2F8AA 3DD3A 2FY6A 3KXOA 2X64A 4MPFA 4MF7A 1SYXA 1K0OA 3E3EA 4O32A 2CX3A 4L0WA 1SKWB 1FB0A 1K0CA 1SL2B 3HYPA 1YDKA 1M2DA 2H74A 3F6DA 4AF2A 3W6GA 1FW1A 2L4QA 5AIVA 5CREA 1Y25A 4IHUA 3CRTA 3IHQA 3MAKA 4DVCA 1N8JA 4KW6A 4NAXA 3UMAA 3GH6A 9GSSA 3UVTA 5DQYA 3WT1A 3I9V2 1EV4A 4AGSA 3HD5A 4I97A 4J57E 4HJ2A 5A4UA 1O6JA 3C1RA 4PX1A 2YN1A 3D4MA 1FO5A 3FR3A 4PQHA 3F4RA 1THXA 4G10A 1T7PB 4TRXA 2PMTA 3LQ7A 3FK8A 2J9HA 4MZBA 5F06A 3LEFA 4I2TA 3DVWA 1KTEA 3ERGA 2OE1A 4J2FA 1GTUA 5ECNB 3LXTA 1XCCA 1EGRA 5AN1A 3TJKA 2VL2A 3L4NA 5B8BA 2FGXA 4PUFC 1XWAA 3M3MA 2GQMA 1Z6NA 1XOBA 3LFLA 2QC7A 4FIWA 3LORA 1V40A 3C73A 4XRDA 1Q4JA 3D21A 2PUKC 2AHEA 3GUSA 1EZKA 3EWLA 4F9ZA 5IMZA 5JWRB 1EOHA 2GSRA 5DVBA 3MNGA 2VIMA 4NV5A 2F3MA 4MP4A 2L5OA 4O7HA 2V6OA 2JZRA 4KH7A 3WGXA 1KNGA 3HJMA 1TK8B 3RAZA 3QFBC 2OE3A 4LLRA 5DJMA 1SK0A 1TU7A 3A2VA 5DAKA 3WT2A 3ZLPA 5A4VA 3RBTA 4D73A 1PQNA 4KGIA 5LD0A 4JR6A 1PL2A 1GSFA 5ECRB 5D9WA 3RHCA 1XW5A 2MMNA 3DRNA 4TW5A 2B7JA 4GTUA 2N5FA 2L6DA 4EO3A 1K3OA 1EEMA 3IK7A 3R2QA 3FR9A 3I69A 3M8NA 2GQLA 1TTZA 5IOXA 2EIRA 2RM5A 1EEJA 1SENA 1Z3EA 1YF1A 5CP1A 2C3QA 2YZUA 4IQ1A 3TKSC 2CX4A 3HVSA 1GNWA 3UIWA 4GSTA 3VFIA 2H01A 6GSSA 2P31A 2B7KA 4POMA 1XVWA 5H5SA 5LNKe 1NHYA 2IIYA 3KZQA 5B6MA 2B5YA 2FA4A 5J3RA 3O76A 1XVQA 5ECPB 5GSSA 5HR1A 3QFAC 4ZBAA 2VCXA 2C3TA 5IQYA 3CSHA 2CVDA 1Z9HA 1J0FA 3H4KA 4OWYA 2H30A 5CRHA 1QFNA 2CV4A 1MD3A 2VD0A 2HSHA 4HUAA 3C7MA 2E0QA 3CTGA 1XFLA 3M9KA 4I5QA 4DEJA 3ZVJD 2V6KA 5EVOA 1ZZYA 5CYYA 2N5BA 3F4SA 2XC2A 1UVZA 5E4WA 1R5PA 3H79A 5HFIA 3L0HA 2K8SA 1SD9A 2VCZA 3UBKA 2YWNA 2VM1A 2MYGA 2B6MA 1XIYA 1PX7A 2WULA 3TJBA 4OCEA 3IC4A 2B1KA 3EE2A 2HXKA 3DYRA 5JCGA 1F2EA 1OE7A 3LYKA 2V1MA 1NM3A 2QSIA 2WRTA 1K0AA 4ECBA 1M99A 4BL7A 1ST9A 4EDZA 2H73A 1NW2A 2FA8A 5D9XA 3C71A 1QUWA 5HR0A 2YWMA 1F3BA 1VF3A 4Z7XA 4BVYA 1OC8A 3HVVA 4MJAA 1PN9A 1GUMA 2E2GA 2B1LA 3F63A 2IMDA 2H6YA 2VCVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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