3QPM | Genus

Total Genus 64

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	64
sequence length	195
structure length	195
Chain Sequence	LHLSKAKISKPAPQWEGTAVINGEFKELKLSDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRVHEFRAINTEVVACSVDSQFTHLAWIITPRKQGGLGPMKIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDQGHTLRGLFIIDEKGVLRQITMNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSDTIIPDPSGKLKYFD

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule keywords	Peroxiredoxin
publication title	The N-terminal beta-sheet of peroxiredoxin Prx4 in the large yellow croaker Pseudosciaena crocea is critical for its peroxidase and anti-bacterial activities rcsb
source organism	Larimichthys crocea
molecule tags	Oxidoreductase
total genus	64
structure length	195
sequence length	195
chains with identical sequence	B, C, D, E
ec nomenclature	ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date	2011-02-14

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00578	AhpC-TSA	AhpC/TSA family
A	PF10417	1-cysPrx_C	C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	3qpmA00

5JWRB 4Q5RA 3F4TA 1MEKA 2CAIA 1I5GA 2M72A 1I9DA 4YAVA 5C00A 5B6MA 3KMNA 3GL5A 2XHFA 5EVOA 5IM9A 3ZMLA 3EMXA 3EINA 2X8GA 1ZMAA 3ZIJA 4KNDA 3M9KA 2VL2A 4KDXA 3F6DA 1M9AA 1RK4A 1AXDA 3KGKA 1SD8A 4PUFC 4BVXA 4LA1A 1A2JA 2CVDA 4MMMA 4AJ8A 2LRTA 2TRCP 4GWRA 2FLSA 2HSYA 1X0RA 2HXKA 4RQRA 1VGLA 1A2MA 5IMVA 2YANA 3JCML 1KEBA 2K8VA 4GSSA 1PSQA 4I97A 5ECRB 12GSA 1WOUA 5DCGA 3MWHA 5J9BA 3A2WA 2LTKA 2D2ZA 2AAWA 4CDOA 5JWQB 4BA7A 2B6MA 3GIXA 4ECJA 4EO3A 3UEMA 3KJYA 1XFLA 2AV4A 1FOVA 2H73A 3TKSC 1X9MB 2H01A 4AGSA 1OE8A 4ECBA 2LS5A 2L4QA 2VL9A 2HRNA 5HFKA 5DJMA 2X99A 4HS1A 2A2SA 1A0RP 1FW1A 4DSSA 1USBA 5D96A 1DBYA 1VF1A 1VF3A 4IKHA 2LQOA 4Z7XA 3DYRA 3D22A 4WETA 1ABAA 4KX4A 4OWYA 5ECKB 2E2MA 4HQZA 2X64A 1A8LA 2PBJA 3HJPA 3ZREA 3MAKA 4GRFA 2FD3A 4IQAA 1AUCA 1TRSA 4EF0A 1SK2A 5IO0A 2DBCA 3VLNA 3KIJA 5E4WA 1U88A 4MA9A 4HOJA 4ML6A 3F6FA 3IXRA 5GSTA 3TJJA 2J23A 1TOFA 4NHWA 4NHZA 2CAQA 4HU7A 2VCXA 3IRAA 3GFKA 1EV9A 4YH2A 3QAWA 3GHAA 2IMDA 3HVSA 5FWGA 3TOTA 4IELA 3CSHA 4MLYA 3DIEA 3G7JA 2PUKC 3TKRA 2L5LA 3WYWA 5GAPD 3UBLA 2X8CA 1QQ2A 3MNGA 5KN0A 5AGYA 3QR6A 3FZAA 2LJRA 3F9UA 2DJJA 1WMJA 5DCHA 4WF4A 4V1Ap 4MJBA 18GSA 1BG5A 2MZCA 5ELAA 2LV3A 3M8NA 4PURA 3QAGA 3LQ7A 4Q5QA 2P5QA 4XTSA 1HYUA 3CRUA 4L0WA 1U87A 3RHBA 1CQHA 3ZRDA 4KSOA 3TCOA 2VUPA 4IS0A 1PKWA 2MBTA 4TOPA 2RM5A 2YCDA 3IPZA 4CW9A 2VM1A 1Z6NA 3GN3A 2O87A 1XWBA 3HZ4A 1V98A 3GUSA 1F37A 2N5BA 3ME8A 1AW9A 2DJ3A 1B4PA 1HQOA 1SYXA 4MDCA 3QPMA 3O3TA 4IN0A 3VURA 2RUFA 4L5OA 3KH9A 3AY8A 3F3RA 1SKWB 1ZCPA 5A4VA 3F3QA 3P8WA 4MZWA 1ZZYA 1EP7A 1ZL9A 3DXBA 2DJ2A 3IHQA 3GKXA 2YJHA 3GX0A 3US3A 4HI7A 4IP1A 2GZZA 2IN3A 1BYEA 4TXVA 2RIIA 4POBA 1G7OA 4N10A 2B1KA 1TTZA 3CSIA 1T1VA 5IMDA 4MPFA 4OO5A 1TU8A 1O8XA 4TXOB 1V58A 5AN1A 2C0EA 5AIXA 5F06A 4MF7A 1Y25A 2AUVA 2IMIA 3EU3A 5J41A 2OADA 1CQGA 2YZUA 3HA9A 1PKZA 4OO4A 1J08A 2PN8A 4J56E 4WF5A 3VPQA 3CMIA 4KUNA 4ZB6A 4MF5A 2H6YA 3NZNA 2MMOA 3ZFLA 4KGIA 2OBIA 3U5RE 2G0FA 4AJ7A 3ZTLA 2YV7A 3Q19A 2ZUPA 1GL8A 2YWMA 3LG6A 2B5XA 1KBNA 2CVKA 1OYJA 3WD6A 4K0GA 1K0OA 3H8QA 5ECMB 2CZ2A 2EIRA 1R5AA 1LU4A 2LJAA 5D73A 2C1YA 1GSFA 3D5JA 3I43A 1N2AA 1Z7PA 4XRAA 4YAPA 2JZRA 1G7EA 2V41A 1T4ZA 4PQ1A 1O8WA 2I81A 1THOA 6GSUA 1JLVA 4WBRD 4E8EA 1PRXA 4NV5A 2CVBA 4IW9A 5KEJA 5IQYA 3IV4A 5J9CA 5D8IA 2ALBA 3HCZA 3N5OA 2E0QA 3LGCA 3GTUB 1OVNA 1T00A 1Z5YE 3GURA 3ZIVA 2OJLA 3EWLA 5AISA 3IC4A 1Z6MA 4F0BA 3R2QA 3IAS2 2IFQB 5H5RA 3HZ8A 4MK3A 4TRXA 1O85A 7GSSA 5E59A 1BEDA 2KLXA 3EURA 2C3NA 2HI7A 1WIKA 4KSMA 3LXTA 4JRRA 3GV1A 1S3DA 1ON4A 1XXUA 4K0NA 5DVBA 4O92A 3ZFBA 2RLIA 2QGVA 1IYHA 1R7HA 1YJ6A 4RI6A 1O81A 3GNJA 3D6IA 2YZHA 6GSVA 1ERWA 3S9FA 3LWAA 2B1LA 4NPBA 2FHEA 4ZIJA 3IBHA 4MCUA 3H93A 3WGXA 3RPPA 2HZFA 1VF4A 4WXTA 1TP9A 3P90A 2GT5A 3QOUA 1PL1A 1FO5A 2VL2C 4IGJA 4K2DA 4WR4A 2FUG2 3TDGA 1EGOA 1H4OA 3M3MA 1EOHA 2NDOA 1A8YA 3L4NA 2OKAA 3FEUA 3F4RA 4ZL9A 3TB2A 4O32A 3GTUA 1F6MC 4DEJA 2VLUA 3CYNA 1BAYA 3HHVA 3GX8A 2O8VB 2IFQA 2GS3A 2TIRA 2YPMA 2JU5A 2VM2A 2LSTA 2AHEA 2P0GA 1SL2B 4IVFA 4L0UA 1ZYEA 5CREA 4WKWA 4D73B 4BWSA 2XC2A 4I8BA 2L59A 5IMZA 5L71A 2VD0A 4I6XA 2K9FA 5A4WA 4MP4A 3WT1A 20GSA 2YV9A 1QMVA 3A2VA 1YF1A 1T4YA 2GLRA 4ML1A 1TK8B 2WULA 3PINA 3IE3A 3KXOA 2WB9A 2RM6A 4TR0A 1PMTA 1XW9A 3CTFA 2KOKA 1JZWA 4WBJA 4PUAA 5DDLA 2HE3A 1SJ6A 5ECIB 2PVQA 4BVYA 2DC5A 3FRCA 1OKTA 1SENA 3ZL5A 3VI5A 4OCFA 2H66A 5DJLA 1V2AA 1GUHA 3UARA 1VRSD 4GF0A 4IJ3A 1TI1A 5JCUA 3BOAA 2AB6A 3VWXA 2C0FA 2FNOA 3APQA 3FKFA 5CRGA 1OAZA 3V1WA 2IL3A 4LMVA 1WP0A 4XCSA 5IPGA 2RUEA 4ILFA 3QFAC 2PWJA 3KMOA 4TVEA 4HJ2A 2R3XA 1AC1A 5COHA 2GSSA 2Z9SA 4IJIA 5F07A 2H6XA 3CTGA 4NXIA 1GUMA 3HJMA 1GTAA 2G2QA 1EOGA 4D73A 1XVWA 2B3SA 4ZBBA 1GSEA 2ZNMA 1R26A 1QK8A 1NW2A 4V2LA 2DMMA 2H72A 4KW6A 4XRDA 3DEXA 1NSWA 3RPNA 1FVJA 3E3EA 2FWGA 1YQ1A 3QMXA 2PMTA 1PA3A 1NHYA 1TXXA 3PH9A 1WE0A 4GSTA 1U3AA 4J2FA 1XW6A 3H4KA 4POMA 1YY7A 5DQYA 1GLQA 5B6NA 1GNWA 3FR6A 1BX9A 4QL7A 3PR8A 1TI3A 3LYPA 3RHCA 1M2BA 1YEPA 1VF2A 2I3YA 1PX7A 2LJKA 4GSNA 2IJYA 2GSTA 3TRXA 1YKAA 3I9V2 13GSA 4F9ZA 2C80A 4N30A 1NM3A 1M2AA 3TKQA 5CNWA 4K7NA 2NVLA 1XOAA 10GSA 1JFUA 1M0UA 3UL3A 5IMAA 17GSA 1TRVA 5ECQB 2CQ9A 2GSQA 4KB3A 3CSJA 5D9VA 2VO4A 5H5SA 1PX6A 2YJ7A 2LKUA 4MF6A 1K0MA 3UBKA 4HJMA 2H1AA 4JBBA 1SKRB 5KN1A 4GQFA 4CHSA 2FA8A 4KDUA 4MH3A 3VK9A 3W6GA 2CV4A 2EC4A 1TU7A 2WCIA 4HQSA 4KE3A 3HVXA 2H0GA 1HNBA 2CX3A 4TR1B 3H79A 2F51A 3GRXA 3IK7A 3BCKA 2BTOT 3ZVJD 1QGVA 1PGTA 4ZB9A 3FZ9A 5HFIA 3RAZA 2HLSA 4ID0A 3VWVA 4JZQA 3KTBA 2I9HA 3A2XA 1YKCA 11GSA 4ZBDA 1AQWA 19GSA 3DWVA 2LQQA 2YP6A 2F9SA 4N11A 2GSRA 4KCAA 5DAKB 2YWIA 4X0XA 2H0IA 1V9WA 4HUAA 1PL2A 2IMFA 3EVIA 2OBKA 3Q6OA 2VLVA 3ISOA 3WGDA 1A2LA 3D4TA 5HR2A 3UAPA 3RDWA 3TGZA 4YQVA 1B4QA 2WZ9A 2AJQB 2LEGA 4V2MA 3J7Yk 4K7OA 4TR3A 3UIWA 1K0NA 2XBQA 4GXZA 2KUCA 3DMLA 2OA7A 3ZVJA 1GTIA 3GH6A 2DLXA 2N5AA 1XWKA 4JR4A 4EUYA 3FY7A 4OFTA 1PD21 2JSYA 4PQIA 2QC7A 2H8LA 4X43A 2GGTA 2N5FA 2ZCTA 4XIHA 3KTLA 1K0BA 2P5RA 3LJRA 2DIYA 4TR1A 1BQ7A 1A24A 5JCWA 2H1BA 2CT6A 3TUEA 1SKSB 1WRYA 2LRCA 5IIZA 3D21A 4POKA 1EZKA 3ERGA 1AIUA 1FAAA 4K7IA 5A5KA 1KNGA 2K8SA 2H1GA 3LXZA 4MJAA 2L5OA 3L9UA 3MDKA 2PPTA 1ML6A 5DAKA 3U6VA 2C3TA 5D9WA 4N0VA 3I69A 1K3OA 1UVZA 2QKEA 2IWTA 3CXGA 5G1KA 5B8AA 2VL3A 4G2EA 2IPAA 3PGTA 2V1MA 2B5YA 2XBIA 1TKDB 4GLTA 4ZBAA 2TRXA 2PVOC 1X5EA 1M7TA 1ST9A 1J0FA 1V57A 3NOFA 4TXOA 3DVXA 1G0TA 2YOIA 1GH2A 2JZTA 2LUSA 3L0HA 4OFMA 3UJ1A 1ERUA 2MYGA 5CYYA 2HNLA 3VFIA 3IAM2 4PNGA 1FB6A 2V32A 1OKDA 5JCGA 5LD0A 1GTUA 2HZEB 3TRQA 3DRNA 3GKMA 2H1DA 1EEMA 5J4UA 1RQMA 3ZYWA 5CAXA 5IO2A 2ON7A 3HXSA 4F82A 5ENUA 3TKPA 4POLA 9GSSA 2V6OA 3IOSA 2O89A 3UOMA 4GQCA 1W89A 4FYUA 4FO5A 5ID2B 6GSSA 5FT3A 4LL4B 2VOCA 2I4AA 3F8UA 2K18A 4HU9A 4K8MA 1F3BA 5EL8A 4QQ7A 2O7KA 1TK5B 5ABRA 1K3LA 4EC0A 4Q5NA 3KEBA 1G6WA 4IP6A 3NIVA 3ZMKA 1XVQA 1GSYA 5KN2A 1NHOA 1W4VA 1GTBA 4PNFA 4MH2A 3ZITA 5GSSA 4KDYA 1EV4A 1F9MA 3KH7A 5EY6A 2DJ0A 3GSTA 1U3IA 1H75A 3M1GA 2MMZA 1U6TA 4FYCA 3EU4A 2C4JA 5LCZA 1AQVA 5IOXA 1FB0A 4YQMA 1LJRA 2HRFA 3O76A 1XWCA 2DJKA 3KCMA 1G6YA 2WS2A 3E0UA 2VCZA 5J3RA 1B8XA 3LORA 5C04A 1B48A 3L78A 1XOBA 2CZ3A 3W8SA 4ECIA 2WFCA 1XWGA 2H74A 2VD1A 2HZEA 3ED3A 1JHBA 2MMAA 4DSRA 2VCWA 4EL1A 2H0HA 2M46A 5IMCA 2XPEA 5FHIA 4KAEA 2DJ1A 1XPVA 3M9JA 1TRWA 1SL0B 1SU9A 4L8EA 1X5CA 2VCTA 2H70A 4EDZA 1ZGNA 1TW9A 3HY2A 3BJ5A 2DSAA 3P7XA 2L6DA 3LEFA 1DUGA 2R6KA 5ECPB 1HNCA 3VWUA 1THXA 2F8FA 2IIYA 4E8HA 1JZRA 3KP8A 3F4SA 2V2GA 2LNSA 4NMUA 3KM6A 5A4UA 2PERA 4XS6A 3QAVA 2IMEA 4DSQA 4ZILA 2NPBA 3LSZA 1MD3A 4ZL7A 4L5LA 2L57A 1X9SB 2NTOA 3EYTA 5IMFA 3L9SA 3GH9A 1DE1A 4G9HA 2XPDA 3P2AA 1Z9HA 2R4VA 2VIMA 1AAZA 1E6BA 1Y6EA 2PU9C 3GKKA 4MZCA 2LNTA 3CBUA 2DIZA 1FG4A 4GCIA 4I2UA 5B8BA 1M2DA 2GTUA 3RBTA 3DVWA 22GSA 3QDNA 3ERWA 1MDKA 4ZB8A 5HFGA 6GSWA 3VWWA 3ZLPA 3FYGA 4GTUA 5INYA 1M9BA 4TN8A 3TJFA 1O6JA 3WGEA 3IDVA 2LRNA 4K9ZA 2KHPA 5ECHB 4OFNA 3O6TA 1XCCA 3HJOA 1SJZA 2WDUA 1GRXA 2FGXA 2HFDA 4PX1A 1C72A 1XIYA 2GQKA 4I2TA 2CX4A 1GSSA 2F3MA 3CRTA 4XS4B 5CRHA 5H5QA 1X5DA 1YF0A 3C71A 2YWNA 3G7YA 4ZXGA 1MTCA 2E2GA 2JL4A 3GYKA 3IK9A 5HR0A 3EE2A 1GWCA 2F8AA 3TKSE 4HEA2 2WJUA 1JLWA 2H71A 3M0FA 1EGRA 3DGQA 2H6ZA 1Q98A 3W8JA 3APSA 4XHMA 16GSA 2L4CA 3APOA 1O73A 2VCQA 2FWEA 5G5FA 1MD4A 1T7PB 3F0IA 2OE0A 5HR3A 5D9XA 1FHEA 4LLRA 4V2NA 4WEYA 3TJGA 3KP9A 2A4VA 5ECLB 4ACSA 4BPYA 3A5WA 3K8NA 1PQNA 4OD7A 4HDEA 4IQ1A 4V1Ag 1GULA 1WWJA 4FH8A 2JSZA 4BWQA 5J5NA 3E9JB 4QL9A 2CA8A 1WPIA 3HDCA 4YQUA 2AYTA 2JZSA 1FVKA 4ULXA 4EVMA 3I6AA 2NBSA 3VPTA 1QUWA 3G7IA 3GMFA 2OE3A 3LFLA 1EWXA 2V6KA 2VCVA 2I1UA 2FWFA 5F0GA 4XS4A 1Q4JA 1TJDA 3FZ4A 3TKSA 5DBQA 5HR1A 1EP8A 3IA1A 5G1LA 6GSTA 3KZQA 4KH7A 4TKYA 2MBSA 4NWYA 1T8EB 3C73A 2C8UA 5ECSA 4F2IA 1A23A 2ES7A 3UVHA 1Z7RA 4PGTA 1OC9B 3UMAA 2BJXA 1SK0A 2C0GA 1K3YA 4H86A 3HKRA 2PGTA 3FR9A 4EKZA 3H1NA 3BCIA 4AF2A 5ECOB 1GSDA 3C8EA 4EXJA 1F3AA 5GAND 4F0CA 5JWOB 4X1UA 4PQHA 4ZL8A 1F2EA 3QD9A 8GSSA 4AJ6A 2E7PA 2FWHA 1HD2A 4DVCA 3OR5A 1ERVA 2DMLA 5ECNB 1URMA 5IPHA 5D93A 4N0ZA 1GP1A 2WRTA 2J9HA 3BD2A 1R4WA 1QFNA 2P31A 2IMKA 4P3YB 4MZBA 1KTEA 2H75A 3FW2A 3Q18A 5CP1A 1TK0B 2GQMA 2H30A 3FK8A 4HZ4A 1GNEA 1GUKA 1K0DA 1SK1A 4BL7A 2X8HA 3WT2A 1O7UA 2A2RA 3EC3A 2B5EA 4MJEA 2GT6A 1K0AA 1WJKA 3DD3A 2REMA 2ON5A 2GVPA 1OC9A 3C1SA 4MPGA 3C1RA 5CRWA 1B9XC 5G31A 4WR5A 1YDKA 3TRPA 4KCEA 1XBSA 1SL1B 1GSUA 4G19A 1ERTA 2R5GA 3GL3A 1S3CA 5D9TA 1BJXA 1IYIA 2GZPA 5F05A 3TOUA 2R2JA 2MMNA 3QFBC 4EDYA 1E2YA 2HSHA 2FCHA 4IBPA 4LL1B 1MDJA 6GSXA 1YZXA 2FY6A 3J7Yb 1ILOA 2L6CA 3F63A 3ZZXA 2YNXA 2GDRA 4MABA 1J9BA 3A3TA 1XZOA 4IHUA 1OC8A 3QCPA 5G2ZA 3TJBA 3G9BA 5IOWA 3FHKA 4JU5A 4O7HA 2VAFA 4FIWA 2QSIA 2M80A 1T3BA 1B9YC 3HVVA 1PN9A 1JZDA 3FZ5A 2GZYA 3KD0A 1M99A 3TJKA 1YEXA 1JZOA 1XWAA 5F8BA 1UN2A 2WGRA 4HZ2A 5DALB 1UC7A 3UVTA 1GLPA 1SD9A 1XW5A 1OC3A 1RW1A 2B7JA 3DKSA 2H76A 3C7MA 3BBYA 1V40A 1ZYQB 1N8JA 2OE1A 3N9JA 1SYRA 4K1FA 4K6XA 14GSA 5EPFA 1TRUA 4JR6A 1AQXA 2FA4A 1EEJA 4JE1A 3SBCA 4ISDA 1S3AA 3L9VA 4NAXA 3ERFA 4TR4A 5LNKe 2EIOA 4OCEA 5KN3A 3GA4A 2R37A 5CRDA 3SWLA 1TDIA 2K6VA 2C3QA 3D4MA 4I5QA 4TW5A 1HNAA 3D0ZA 1ZOFA 3ME7A 5AIVA 4F03A 3FR3A 1QXHA 3LYKA 4XS1A 3IR4A 2C0DA 2OACA 4PXOA 4RQXA 2YWOA 3EMPA 1A0FA 4LMWA 4O5RA 2JACA 1MDIA 1R5PA 4J57E 4KA0A 5GZZB 4RI7A 3HYPA 3GKNA 5ELGA 2YN1A 4FYBA 1ACVA 6GSYA 2KP2A 5ID2A 1SJIA 1DSBA 1Z3EA 1K0CA 2VLTA 1X9WB 5DQSA 5DALA 4EE0A 3MSZA 1LBKA 1DE2A 5B7CA 5HQPA 4G10A 2GQLA 3HD5A 2H19A 1UA5A 5G30A 2HT9A 2O85A 2BMXA 4NV2A 3Q74A 2KP1A 1OE7A 4OMVA 4DSSB 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

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3QPMA

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sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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