3ZITA

Crystal structure of the thioredoxin-like protein bc3987 mutant t8a
Total Genus 22
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
22
sequence length
74
structure length
74
Chain Sequence
KIEVYAQPDCPPCVIVKEFLKHNNVAYEEFDVKKDAAARNRLLYDYDSYSTPTVVIDGEVVAGFQIEKLQQLLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Tuning of Thioredoxin Redox Properties by Intramolecular Hydrogen Bonds.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Bacillus cereus
molecule keywords THIOREDOXIN
total genus 22
structure length 74
sequence length 74
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3zitA00
4H86A 4ZBAA 2VLTA 3ERWA 1EZKA 4N30A 2B7JA 4WF4A 3GX0A 2FA8A 4POKA 4ZL7A 4L8EA 3APQA 1XOAA 4BL7A 1T4ZA 4JR4A 2E7PA 4N11A 4BPYA 1HNAA 1I9DA 2WRTA 4EVMA 2OADA 4TXOA 3HA9A 1SYXA 2DMMA 3ZTLA 3F63A 2CAIA 2V6KA 4LLRA 1GSYA 2GZZA 3H4KA 3O6TA 2C8UA 1K0NA 4K1FA 5FHIA 4KSMA 1O85A 1DUGA 2LJRA 4KSOA 1EV4A 3RAZA 2VL3A 2I9HA 1BG5A 2O87A 4EE0A 4DEJA 2JZRA 4XRDA 4QQ7A 2C3TA 2JSYA 4DVCA 1N2AA 4KNDA 5LD0A 3UVHA 3TRPA 4ILFA 5GSTA 1GTIA 5B8BA 3ZMKA 3C7MA 22GSA 1X5DA 4XS4B 1WE0A 2PVQA 5GAPD 4KH7A 5CAXA 1FHEA 3FZ5A 3VI7A 5J4UA 2VAFA 2KP1A 3EE2A 3C71A 2CQ9A 3LG6A 1RK4A 3H93A 2R2JA 2H0IA 4G19A 1NM3A 1BJXA 2YWNA 2GSSA 1K0AA 4YQUA 1G6WA 4TR1A 4QL9A 1B9XC 3TJBA 1MD4A 3KTBA 3L9SA 1GSEA 3IRAA 1ZCPA 2HFDA 3IOSA 3GYKA 2AYTA 1BQ7A 3SWLA 4HJMA 4LL1B 4GF0A 2YPMA 2HZEB 5GAND 2GT6A 3ERFA 3Q74A 4K8MA 4KA0A 6GSWA 4J57E 6GSTA 1EWXA 1V57A 2IMFA 3UBKA 3DGQA 2A4VA 5EY6A 2PN8A 1SL2B 4ZB8A 2J23A 2VM1A 2X99A 1M99A 1FB0A 3P90A 4ZL9A 2V41A 3LYKA 3F9UA 1XBSA 2RM5A 2ON7A 5AISA 4MABA 2GSRA 1R26A 1A0FA 2J9HA 2C0GA 4HJ2A 2ES7A 3ZIVA 2VD1A 2YNXA 2NVLA 1ZYQB 1EEJA 3GHAA 3F3RA 1F9MA 4OMVA 1TXXA 4RI7A 2OKAA 1SD9A 3G7IA 2OBKA 5HFIA 5J5NA 1FVJA 1TU7A 5D9XA 1EGRA 3CXGA 3I6AA 1OKDA 3R2QA 4V2NA 5ECOB 3HVXA 3QAVA 2YP6A 3GUSA 2DJJA 1XW9A 2GTUA 5CRGA 3HXSA 1SENA 4G2EA 2ZNMA 1GP1A 4ECIA 4YQVA 4IP1A 1K3LA 4BWSA 1VF3A 3GFKA 5F8BA 3UIWA 3ZVJA 5J9CA 1SK0A 2H8LA 2DBCA 3IR4A 4NHZA 5KN3A 5A4UA 3QPMA 1XWKA 3ZREA 3HCZA 1OKTA 2K9FA 2CAQA 5DAKA 2YZUA 1OC3A 4PNGA 3HVSA 3H8QA 3KM6A 5COHA 3IV4A 2QC7A 1G0TA 2KUCA 4RUVA 2IJYA 1RQMA 2YOIA 2K6VA 3ZYWA 2X64A 3HJOA 4XCSA 1K0BA 3KD0A 3DEXA 2VM2A 1EGOA 2XPDA 2KOKA 1NSWA 2AJQB 4MJBA 2HI7A 1YEXA 2TRCP 2IMEA 3UOMA 3TUEA 3TB2A 3GKNA 3FKFA 2N5FA 1M2AA 2IPAA 2FHEA 5IMAA 1TJDA 5ECSA 2H0GA 2F9SA 3EU4A 3GNJA 2GSTA 1FOVA 4F03A 3DVWA 2BTOT 1Z5YE 1KTEA 2VCQA 1EP8A 3U6VA 3W8SA 1HNCA 3WGDA 3VFIA 1TOFA 5DALB 1A2LA 2LS5A 3F0IA 4MDCA 2GDRA 6GSYA 4MA9A 2DJ2A 3HD5A 3J7Yk 2C0EA 4KDXA 3L4NA 4YH2A 3I9V2 1SJIA 2IN3A 3ZZXA 4ECCA 3LXZA 4GTUA 1VF4A 2I4AA 2PWJA 3WT1A 5G1KA 4ULXA 3U5RE 2LV3A 3KH7A 2B1KA 5EPFA 4K0NA 3AY8A 2YWMA 3GRXA 5HFKA 1T1VA 3GURA 5HR1A 1DE1A 5D9TA 2IMKA 3CRUA 4JRRA 5IO2A 2GVPA 2HNLA 2WDUA 1YKCA 1JZOA 4OO4A 4KCEA 1WP0A 3UL3A 3VURA 2FLSA 4I6XA 2DMLA 1HNBA 2MMZA 2IWTA 4MJCA 3DKSA 5AIVA 3GMFA 4HOJA 1ML6A 1EEMA 1YQ1A 1PN9A 2E2MA 4I8BA 2VD0A 5EVOA 1LJRA 5ID2B 4KDUA 5INYA 2G2QA 4ZB6A 2EC4A 3IXRA 5KEJA 3EINA 1R7HA 5IQYA 1KEBA 4TOPA 5FWGA 3JCML 1PGTA 3GL5A 1R5AA 4RQXA 4KX4A 3ME8A 2AB6A 4PX1A 3KZQA 2H6YA 1PSQA 4ZILA 3TGZA 2DSAA 2CX4A 1A24A 4HI7A 2VOCA 3CMIA 2CVDA 1Y6EA 3CRTA 1GSFA 2GZPA 1YJ6A 2K8SA 4TVEA 5C04A 1ERUA 4NV2A 3VK9A 2OE1A 2NBSA 2EIRA 3EC3A 4L5OA 5DJMA 4MJEA 1MDIA 4PXOA 2TIRA 4IJ3A 5H5SA 4HU7A 2H6XA 4WEYA 1EOGA 2LTKA 5AGYA 5J41A 2PGTA 4MZWA 3QAGA 2BJXA 3VPQA 4OFNA 1AQWA 1U6TA 2VL2C 2REMA 2RIIA 1TRVA 4ISDA 1KNGA 3A2VA 2R37A 2DJ3A 1QK8A 5DBQA 1B4PA 1ILOA 1AQVA 3ZITA 2CX3A 1ON4A 2JU5A 3GN3A 5HR2A 3IK9A 4TW5A 3KIJA 1DE2A 1DSBA 4DSSB 2GT5A 5DJLA 1X9MB 4WKWA 2G0FA 10GSA 2L5LA 3L9VA 5DVBA 4MCUA 5HFGA 2FA4A 3M8NA 1Q4JA 3HVVA 3D21A 3LWAA 1TDIA 5CNWA 4GSTA 4JR6A 1JFUA 2IMIA 3APOA 3UJ1A 1NW2A 4ZL8A 3W8JA 4GQCA 1JZWA 4L5LA 5JWOB 5B7CA 4TN8A 1TW9A 2M80A 3TJGA 4IBPA 2KHPA 1XW6A 4Q5FA 4POMA 5D93A 1R5PA 2HRFA 3EMPA 2FWGA 3D4MA 4AJ7A 3CTGA 2AHEA 5G1LA 4K0GA 4GSNA 4WETA 3RPPA 1H4OA 2VL9A 4XTSA 3G7JA 4HQZA 1AAZA 2C0FA 5E4WA 1TP9A 2JZSA 1C72A 4HU9A 2YJHA 1QXHA 3TCOA 1SD8A 3CBUA 1QFNA 3E0UA 2VLVA 1IYHA 5ECHB 4LMVA 4MH3A 3TJKA 8GSSA 1QUWA 3IBHA 2L5OA 5IOXA 1UA5A 1U88A 4D73A 3DIEA 1PKZA 1ACVA 1PX6A 4NAXA 3IPZA 2IIYA 1OYJA 1GSDA 3P7XA 2HXKA 1XCCA 1J9BA 4QL7A 3DD3A 1GTAA 2VLUA 5H5RA 3MNGA 3UBLA 3PH9A 4OD7A 1TK8B 4IS0A 1FVKA 1ERWA 5B6NA 2B5YA 2LQOA 5IOWA 4V1Ag 1J08A 5IMCA 3V1WA 4CDOA 7GSSA 2H6ZA 5KN1A 2H1DA 2QGVA 1MDKA 2H01A 1N8JA 3QR6A 5FT3A 3TKQA 4TXOB 3FW2A 5ECNB 4EF0A 1UN2A 3MWHA 4FYUA 4OCEA 3TKRA 4IHUA 4DSQA 4N10A 3TKSE 3G9BA 2AUVA 4MP4A 5F06A 4O7HA 4NV5A 1X0RA 1PL2A 2DJKA 4X1UA 1W89A 1XWAA 2C1YA 2DIYA 2P5RA 1EOHA 2DIZA 3ZVJD 3LEFA 4KCAA 2L6DA 4BA7A 1T7PB 4CHSA 1E2YA 1R4WA 1DBYA 6GSSA 4PQIA 3PGTA 1XFLA 1GLPA 4GWRA 3IDVA 4MPFA 3UEMA 3VWUA 2JL4A 2HLSA 4L0WA 1AQXA 2LRNA 3GX8A 3BOAA 3GTUA 5L71A 4OCFA 5JWQB 9GSSA 2P0GA 2IL3A 1GUMA 1YKAA 3VWWA 2GGTA 1PD21 2O7KA 3VLNA 3GH6A 2DC5A 2EIQA 4MLYA 5ELGA 5EL8A 3GH9A 3C1RA 5KN0A 3WGXA 3M0FA 3IA1A 4PUFC 1GL8A 3EURA 3FY7A 4TR1B 1TRWA 1BAYA 2HT9A 1Q98A 1GTUA 2CA8A 3F3QA 3ED3A 19GSA 1GH2A 2H72A 2LEGA 1M7TA 1T00A 3OR5A 5DCGA 4EKZA 1SK1A 2FUG2 4IJIA 1T8EB 2OA7A 3GKXA 2R5GA 3WYWA 16GSA 1B48A 1PKWA 3VWXA 2VCXA 3W6GA 1WRYA 2CZ2A 4IKHA 3TDGA 3ZFLA 5IPGA 1HQOA 1HYUA 4E8EA 3LXTA 1A2MA 2MYGA 5ECMB 4MPGA 4J56E 1O73A 5ECIB 1EP7A 2XHFA 4WBRD 3O76A 2VIMA 4TR0A 4TRXA 3GSSA 4YQMA 5ELAA 4EUYA 5H5QA 2X8CA 4P3YB 1B4QA 1XVQA 2LNTA 1XXUA 1O7UA 3WGEA 1E6BA 4MF7A 1A8YA 1A2JA 5E59A 4K7OA 1MDJA 2I1UA 2RM6A 2V2GA 3IK7A 1TU8A 4GSSA 1Z3EA 4BVXA 4FIWA 4LL4B 4JEDA 2OBIA 1TTZA 4O32A 3M3MA 5D9WA 3ISOA 4ZBBA 1YDKA 2L4QA 4AJ6A 2WULA 1B8XA 3TKSC 3LORA 3RBTA 3N9JA 3KMOA 2H1AA 3NOFA 1O8XA 4IN0A 3GKKA 2FGXA 2B7KA 2XBIA 3S9FA 1K0CA 2CT6A 4PQ1A 1GRXA 1VRSD 4AGSA 5DAKB 2DJ1A 3QD9A 1ZYEA 4PUAA 4MZBA 4AF2A 3UVTA 1XWCA 1SKWB 3TJFA 1IYIA 3HZ4A 3TOUA 1PA3A 2H75A 2GQKA 1M0UA 2XBQA 1Z9HA 1X5EA 2YZHA 2YV9A 3US3A 1V40A 4FYBA 1U3IA 3O3TA 5A4VA 4MF5A 5ABRA 2H0HA 3K8NA 4HDEA 2OE3A 2LRTA 3FK8A 2YWIA 1CQHA 2ZUPA 2VCWA 4GLTA 5JCWA 3KCMA 2H76A 5DQYA 4G9HA 3TKSA 1ABAA 5B6MA 1CQGA 1SL1B 2NDOA 3C1SA 3A5WA 5ECLB 1TI3A 1SYRA 4I97A 2O89A 2DLXA 1JZRA 4ML6A 1XZOA 4KAEA 5JCUA 1ZZYA 3KEBA 3Q6OA 5JWRB 4IELA 1OC9B 3E3EA 2M46A 3FZ9A 4MF6A 4IP6A 4KGIA 3ZFBA 1AIUA 3ZIJA 3VWVA 4F0CA 4JE1A 4PGTA 4EXJA 2YN1A 1S3CA 4V2LA 1V98A 1ZGNA 2H1GA 2I81A 4MJAA 2H74A 1YZXA 3QMXA 2CV4A 1SJZA 3HZ8A 1X9WB 1J0FA 1GNEA 1BX9A 3PR8A 6GSUA 2M72A 3DWVA 4V2MA 1EV9A 1XPVA 4PQHA 5G2ZA 3GIXA 3M1GA 5DDLA 3C73A 2CVKA 5C00A 1JZDA 4DSRA 4BWQA 4L0UA 1TRUA 2LNSA 4OFTA 3D5JA 2HZFA 3IAS2 5ECKB 4ZBDA 1K0OA 2R6KA 4POLA 2FWEA 3QOUA 1WWJA 3LYPA 1OE7A 4MK3A 4TKYA 1LU4A 1FO5A 2O85A 4BVYA 2N5BA 4XS6A 2IFQB 1KBNA 3MSZA 2MMOA 1F3BA 3LSZA 2E2GA 4HZ4A 3LFLA 4XS4A 4ECJA 2WB9A 20GSA 2ON5A 3QDNA 1OVNA 3KMNA 4RI6A 5ECPB 3F8UA 4JZQA 1M9AA 5J3RA 4F9ZA 2B3SA 3KH9A 3P8WA 1BYEA 5A4WA 3BD2A 2HYXA 2JZTA 1G7EA 3HKRA 4TXVA 2VL2A 1ZMAA 4IQAA 3L9UA 3CYNA 5CP1A 2MBSA 4MZCA 1Z7RA 2KLXA 4HQSA 2CVBA 5F07A 3CTFA 4ID0A 3E9JB 3D6IA 4WBJA 3MAKA 4FH8A 3Q19A 2GQMA 12GSA 1VF2A 4V1Ap 5CYYA 3QAWA 4XHMA 1FB6A 1MD3A 2HZEA 4F2IA 4N0VA 3BBYA 4X0XA 3GL3A 4Z7XA 4GXZA 2ALBA 1XVWA 5D73A 4XS1A 4OO5A 1O6JA 2PBJA 4IGJA 3EYTA 5HQPA 5IMVA 5D9VA 1FAAA 1TK0B 2L6CA 2C0DA 3HYPA 3F4SA 4WR5A 4KDYA 1NHOA 2EIOA 1TI1A 2O8VB 3VI5A 1ZL9A 3APSA 1U3AA 4K9ZA 1AW9A 1GWCA 3KJYA 5GZZB 4KW6A 3NIVA 3UARA 1PRXA 1OC8A 1O81A 4HS1A 2A2SA 3EWLA 3LJRA 4YAVA 2LRCA 3ERGA 4EO3A 1Z7PA 3I69A 1MEKA 4N0ZA 3NZNA 4OWYA 2JACA 2E0QA 3MDKA 3QFAC 1H75A 4TR3A 2H66A 3QCPA 5A5KA 2F8FA 3M9KA 4ACSA 3IAM2 2K18A 3UAPA 1GNWA 1VGLA 3RHCA 1K0DA 1S3DA 1K3OA 1XWBA 4MMMA 17GSA 1M2BA 5G30A 2P5QA 3DRNA 1F37A 3A2XA 2PUKC 4HZ2A 3HJMA 1ERVA 2OE0A 5B8AA 3GKMA 1WMJA 1YEPA 2PPTA 2TRXA 5D8IA 1GULA 5AN1A 2NPBA 3CSJA 3IC4A 1M9BA 1X9SB 3DMLA 3HJPA 1W4VA 5J9BA 2YCDA 2WZ9A 3HY2A 2H70A 2V6OA 3FEUA 1XIYA 2C3NA 1FG4A 1PX7A 2LUSA 4K7IA 1K3YA 2CZ3A 3H79A 3F6DA 2B5EA 2RUFA 3FZ4A 2X8HA 2VCZA 4HUAA 1WJKA 3FHKA 4NPBA 2XC2A 4GQFA 3CSIA 1GSQA 2V32A 1K0MA 1URMA 2H30A 2C3QA 4D73B 4X43A 3FR3A 2VUPA 6GSXA 5LNKe 5F0GA 3FR9A 2LJAA 4ZIJA 2VO4A 5JCGA 1U87A 1ERTA 2JSZA 3GV1A 4PNFA 2B5XA 1GSUA 2BMXA 5KN2A 4AJ8A 5IMZA 3IE3A 3BJ5A 2PU9C 4RQRA 2V1MA 2GQLA 5HR0A 2GLRA 1XWGA 3HDCA 3VPTA 2HSHA 5DALA 4XRAA 5AIXA 2QKEA 3A2WA 3DVXA 3L0HA 4KUNA 2MMNA 5ECQB 4ECBA 4EL1A 2OACA 1AUCA 2WS2A 2JADA 4EDZA 2FY6A 2C4JA 3IHQA 1G7OA 1UC7A 1QMVA 4O92A 2R3XA 4JU5A 5IPHA 2L4CA 4I5QA 1G6YA 3C8EA 2B6MA 4K6XA 2WGRA 2FCHA 1PQNA 5D96A 4Q5QA 1WIKA 4NWYA 1JLWA 2F8AA 2RUEA 3UMAA 2HSYA 1YF1A 4KB3A 4LMWA 3TRXA 1XOBA 2P31A 4JBBA 3CSHA 1LBKA 3FYGA 4GRFA 1XW5A 2D2ZA 4IVFA 1T3BA 2AV4A 3BCIA 1RW1A 5LCZA 11GSA 6GSVA 3GTUB 4CW9A 2XPEA 2WFCA 3F6FA 2AAWA 5CREA 2MBTA 3HHVA 2QSIA 5ENUA 1HD2A 1SU9A 3D22A 2WJUA 5CRDA 5GSSA 2MZCA 3QFBC 3GA4A 3FZAA 1F6MC 5ID2A 3H1NA 3LGCA 14GSA 4J2FA 3KTLA 3LQ7A 5IM9A 1THOA 3ZL5A 2YWOA 2LJKA 4IW9A 2YANA 1SL0B 4E8HA 1VF1A 4ZXGA 2VCVA 3G7YA 2NTOA 1WOUA 1GUKA 3BCKA 4POBA 3F4TA 3M9JA 3TRQA 3PINA 1B9YC 2DJ0A 5HR3A 1Z6NA 1A8LA 4F0BA 1JHBA 1OC9A 4FYCA 5DQSA 1WPIA 18GSA 2F51A 1PMTA 4NHWA 1GLQA 3ZMLA 4ZB9A 2PVOC 5IMFA 1BEDA 4EC0A 1TRSA 1JLVA 3ZRDA 4GCIA 2FWFA 5IIZA 5ECRB 1FW1A 1F3AA 2GSQA 4XIHA 3RHBA 2FWHA 2H73A 2ZCTA 4LA1A 3FRCA 1YF0A 3I43A 2HE3A 4OFMA 2F3MA 2LQQA 4WF5A 1AC1A 1X5CA 4O5RA 1UVZA 1M2DA 3ZLPA 3P2AA 5IMDA 4TR4A 3SBCA 4I2UA 1ST9A 1GSSA 2B1LA 1A0RP 5G5FA 1S3AA 1V58A 5CRWA 2Z9SA 3N5OA 3RPNA 2H1BA 1V2AA 1SKSB 2MMAA 1ZOFA 1OE8A 1TK5B 2FD3A 5G31A 4DSSA 1OAZA 3KGKA 3WD6A 2L57A 2HRNA 4WXTA 4Q5RA 3KP9A 1QQ2A 2FNOA 2IFQA 2R4VA 1TKDB 4YAPA 2LSTA 3ME7A 4ML1A 2IMDA 2YV7A 4KE3A 1V9WA 1AXDA 1GUHA 3Q18A 2GZYA 2L59A 2X8GA 1PL1A 3EMXA 3KXOA 3RDWA 3TJJA 2OJLA 4G10A 1MTCA 3WT2A 1SK2A 3EVIA 3F4RA 1A23A 4K2DA 4I2TA 4PURA 1O8WA 4F82A 1T4YA 2N5AA 1SKRB 2K8VA 2H19A 3A3TA 2WCIA 3DXBA 4HEA2 5CRHA 4K7NA 4IQ1A 4FO5A 2VCTA 2GS3A 1NHYA 3GSTA 1I5GA 4MH2A 1SJ6A 13GSA 1USBA 5IO0A 2YJ7A 2PMTA 3KP8A 2KP2A 5G5EA 4NMUA 3D0ZA 3EU3A 3TKPA 2LKUA 1QGVA 1THXA 2I3YA 3DYRA 4Q5NA 3J7Yb 1Y25A 5CO3A 1GTBA 3L78A 5F05A 3D4TA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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