1R7HA

Nrdh-redoxin of corynebacterium ammoniagenes forms a domain-swapped dimer
Total Genus 18
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
18
sequence length
74
structure length
74
Chain Sequence
MSITLYTKPACVQCTATKKALDRAGLAYNTVDISLDDEARDYVMALGYVQAPVVEVDGEHWSGFRPERIKQLQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Corynebacterium ammoniagenes
publication title NrdH-redoxin of Corynebacterium ammoniagenes forms a domain-swapped dimer.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NrdH-redoxin
total genus 18
structure length 74
sequence length 74
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1r7hA00
2B5EA 5F8BA 2IFQA 2YWOA 5J3RA 5J41A 4V1Ap 1F2EA 2CVBA 2R4VA 5IMDA 3WGEA 2RLIA 1DSBA 1N2AA 2VLUA 1Y6EA 4KAEA 1OE7A 2PGTA 1BAYA 5B6MA 6GSYA 2H76A 4BVYA 4V2MA 2WFCA 2XBIA 1G7EA 2KP1A 4YQMA 2GQLA 3P8WA 3GTUA 2H1DA 3KD0A 3ZTLA 4X0XA 3ED3A 2F3MA 2VCZA 1VRSD 14GSA 4FYBA 1Z6NA 2E0QA 2DJ0A 3LORA 3F0IA 4PUFC 1TKDB 2KHPA 2RUEA 2B5XA 1XCCA 2FWHA 1R26A 3L4NA 1SD8A 2HSYA 2HYXA 1M9BA 1MD3A 1MTCA 5D93A 1J08A 3TKSA 3A3TA 3E0UA 1SKWB 17GSA 4GQFA 3TOTA 2CVDA 3ZZXA 3FR9A 2VLVA 1AAZA 2KOKA 4KGIA 2XBQA 3WT2A 1A23A 1AW9A 4FH8A 3QAWA 4L5LA 3BOAA 1XWGA 4LMWA 4NHZA 3VWWA 1GRXA 5DAKB 4HEA2 4K2DA 4WETA 2PERA 4XRAA 2HZEA 4HU7A 1GUKA 3KEBA 1M99A 3KCMA 1XW5A 3PINA 1ZOFA 5HFIA 5JCUA 1TK5B 4LLRA 1G0TA 3C73A 4K0GA 5DBQA 4PGTA 4HU9A 2E2MA 3GH6A 4HJ2A 3VPQA 2FUG2 3QAGA 1OC8A 4L0WA 2C3NA 1VF2A 5D9XA 5INYA 4ULXA 2OE1A 3MDKA 2M46A 5CRDA 5EL8A 2P5RA 2HZFA 2V2GA 2L6CA 2OA7A 4BWQA 5G1LA 10GSA 2DC5A 4I97A 2YZUA 2GQMA 2LRCA 5A4WA 1PSQA 2X8HA 2PUKC 4V1Ag 5KN3A 1BEDA 3GX8A 2O89A 4KB3A 3TJJA 1U88A 2PN8A 3ZVJA 1K3OA 3G7IA 1XWCA 1YZXA 2RIIA 4WR5A 1SL0B 4D73A 1GH2A 4O7HA 2BJXA 3ZIJA 2R2JA 1OC3A 1TRVA 5GZZB 1TJDA 4XS4B 3ERWA 1S3CA 1CQGA 2M80A 2D2ZA 2JZTA 2ZUPA 3HZ4A 5HQPA 1TOFA 3BD2A 5A4UA 4IQ1A 4WF4A 2MMOA 1EEMA 2FCHA 4MLYA 1M0UA 4TXOB 2FY6A 1SKSB 2HRNA 4HQZA 1LJRA 2FD3A 4POMA 5HR3A 3DYRA 5JCWA 2LJKA 3HXSA 1PN9A 4FO5A 3HYPA 4ML6A 3A2VA 2XC2A 1JZOA 1XXUA 4IVFA 3GV1A 4MF7A 1R4WA 2FWFA 4X43A 2FA8A 1YKAA 3EURA 4GLTA 1K0AA 2V32A 3UVHA 1QGVA 1GSQA 2EIOA 5B8AA 2KUCA 2HNLA 1TDIA 1WPIA 2QGVA 3CXGA 4E8EA 5CRGA 1A8LA 3ZFLA 2F9SA 2VL9A 2H0IA 4MPFA 4WBJA 1KBNA 2WRTA 1G6YA 2FA4A 3TKRA 1JZRA 4NWYA 4HZ2A 1SD9A 5G31A 2L4QA 4IKHA 3I6AA 2ON5A 1HNCA 1M2BA 3CSIA 3GSTA 3VI7A 3UIWA 3TRQA 3D4MA 4GCIA 4WEYA 3J7Yk 3HVVA 4Q5QA 5ECIB 2NVLA 4GSNA 3C1RA 5ELGA 1TI3A 1T7PB 1JLVA 1GNEA 1GSSA 3V1WA 5IQYA 1NSWA 2GGTA 4FYCA 5AISA 1I9DA 4AJ7A 4V2LA 2PVOC 2DIZA 3TDGA 4KSOA 4X1UA 4GSTA 1JFUA 1GLQA 2CVKA 2LRTA 3MSZA 3TKSE 3ZFBA 3EYTA 4O92A 3ZVJD 1B9YC 4ECIA 4EF0A 3F4TA 2FNOA 4OD7A 3M1GA 3KZQA 3DVXA 4AGSA 8GSSA 5LNKe 5IMFA 5HFGA 2V1MA 2IMFA 1LBKA 1GSEA 1QFNA 1EV4A 5IOXA 1TXXA 2H01A 4RI7A 5J4UA 2GS3A 2JZSA 1URMA 4HDEA 2C1YA 3AY8A 2I9HA 1K0OA 5D73A 4ACSA 5L71A 3S9FA 2H1GA 2MZCA 2B7KA 3F6FA 2AJQB 4KW6A 2LNSA 3QDNA 1GTAA 1QXHA 2VCWA 3FR3A 1VF4A 1F3BA 3GH9A 4KCEA 3PH9A 1WIKA 3ERGA 1WOUA 3O6TA 4V2NA 1AIUA 5B7CA 5JCGA 4EE0A 3EC3A 3CBUA 3FZ4A 4XS6A 2TRXA 2O87A 4L0UA 1GTBA 4JBBA 2CQ9A 2DSAA 3IK9A 3H1NA 4QL7A 4DSSA 1V9WA 1X5DA 5D9TA 1XZOA 2R3XA 1PKZA 1M9AA 2XPEA 2CZ2A 4OFNA 4MJCA 1JLWA 3HVXA 4Q5FA 3P90A 5F06A 1BX9A 3TB2A 1XPVA 1KEBA 4HOJA 2IIYA 4GRFA 2OBIA 3ZMKA 12GSA 4PQ1A 4K9ZA 4PX1A 2MBTA 3HA9A 1SYXA 5J5NA 2JL4A 2H73A 2GDRA 4RQRA 2HSHA 3APQA 3KGKA 1R5PA 1SL1B 4MA9A 4BA7A 3GX0A 3D4TA 3DIEA 3F8UA 5H5SA 4ZILA 4TVEA 1ACVA 5JWOB 3FYGA 4KX4A 2P0GA 3UBLA 3MWHA 3TUEA 1XIYA 2PU9C 4MZCA 1GP1A 5C00A 4BVXA 5CO3A 5ID2B 3BJ5A 1HYUA 3U5RE 2C0GA 5DCGA 3KTLA 3CYNA 2GTUA 5CRHA 1XWAA 5IMVA 5F0GA 1GL8A 3ME7A 3LYPA 1V58A 2GSQA 2B1KA 4F0BA 3FR6A 4XIHA 1XWKA 3I43A 2B1LA 2LV3A 5IMZA 2P31A 3TJKA 5CREA 4YQVA 3ZL5A 4DVCA 1O73A 3UMAA 1MDJA 4J2FA 4YAPA 1N8JA 5IIZA 3CTFA 4IHUA 1XW6A 1UA5A 4EL1A 5KN1A 2H30A 1JZWA 5DJMA 1OYJA 5GSTA 2LEGA 2IN3A 2JADA 1ZL9A 2VCQA 2VL2C 4G9HA 5ECOB 5JWRB 1A8YA 3QMXA 5DVBA 2RUFA 2REMA 5G1KA 2YWMA 3VWVA 3DWVA 1O85A 1FG4A 3CRTA 5ECPB 1Z7PA 4PNFA 3CMIA 1B48A 3PGTA 3DRNA 2OACA 3TKQA 2VM2A 5DDLA 1E6BA 1T4YA 2H6XA 3Q19A 5AGYA 1XFLA 3D22A 5AN1A 2IFQB 3W8JA 3C1SA 2CZ3A 2EIQA 3FRCA 1PX6A 3ERFA 1U3AA 3FZ9A 2HFDA 5IMCA 1XOBA 2VUPA 3GL5A 6GSSA 2VL3A 3GIXA 4YH2A 4N0VA 4TR1A 2KP2A 3O76A 2GVPA 2DMMA 5C04A 2JSZA 2E2GA 2K6VA 1Z6MA 3GTUB 4MP4A 4E8HA 4ZL9A 2E7PA 5LCZA 4EO3A 1HQOA 2G2QA 3DVWA 3TOUA 1A2LA 4KE3A 2FHEA 5CAXA 5IPHA 3HY2A 4JR4A 1NHYA 2H70A 2VIMA 4ILFA 2FWGA 4YAVA 3L0HA 1G7OA 3FZAA 2VM1A 4F9ZA 2RM6A 3VWUA 1AQXA 1I5GA 5DALA 1F37A 4BL7A 4JU5A 2MMNA 1AXDA 2VCVA 2LQQA 2L59A 3LEFA 3TJBA 2LTKA 1V2AA 1U3IA 3W8SA 4I2TA 3N9JA 1OC9A 2C8UA 4TN8A 1TTZA 1ZGNA 1A24A 2IJYA 3A2XA 2HZEB 2FGXA 2CX3A 1BQ7A 2BMXA 1ZZYA 2H0GA 3WYWA 3CRUA 3SWLA 2FLSA 1GSYA 1GTIA 5ECMB 4H86A 3PR8A 2PBJA 4TR4A 5B8BA 4PQIA 4WXTA 4KCAA 2J9HA 2YV9A 3WGDA 1K0MA 3RHCA 1OVNA 3RBTA 4K1FA 4JEDA 1XVWA 5IO0A 2AUVA 2PWJA 3RHBA 4OFTA 2NDOA 1SKRB 3APSA 1GSDA 3BCKA 1RK4A 5ECNB 4WKWA 5B6NA 1ERTA 2YJHA 4ZB8A 3A2WA 2TRCP 1MD4A 3FZ5A 4N0ZA 5EVOA 4D73B 3DGQA 3US3A 1FVJA 2OE0A 4FYUA 3D5JA 3NOFA 4ZXGA 6GSVA 3G9BA 2LSTA 3MNGA 1YEXA 3DEXA 1T8EB 4JE1A 2LUSA 3ZRDA 4EC0A 2C0EA 1EGOA 1ABAA 1B4PA 1DE1A 2DJ2A 4LL1B 2H66A 3GURA 4IQAA 3F6DA 1U87A 3LG6A 3F3RA 3H79A 1K3LA 2CT6A 2ALBA 1QK8A 1PKWA 4RUVA 22GSA 3IPZA 2JACA 1SENA 1V40A 2EC4A 5D9VA 3J7Yb 1TRWA 2N5FA 2WULA 3EU4A 3RDWA 5G5EA 3TJGA 1C72A 4MDCA 5FT3A 2O7KA 1ZMAA 3KTBA 3CTGA 3IK7A 3GN3A 4MH2A 4ZB9A 4F2IA 3I69A 1PL1A 3G7YA 5E59A 4KNDA 4G10A 1TP9A 4TW5A 3UL3A 2JU5A 2YWIA 4EXJA 3ZREA 3P2AA 1EOHA 2VCXA 3ZITA 3EVIA 3HJPA 1JZDA 4DSRA 3U6VA 3BBYA 3UJ1A 4ECBA 5IMAA 4MZWA 3GL3A 3APOA 2C0FA 1SJIA 3LJRA 2OBKA 1SL2B 1YY7A 2LKUA 2X64A 5D9WA 3KH7A 3TJFA 1CQHA 1SK2A 4IJIA 1DE2A 2YPMA 2A2RA 3IA1A 5COHA 4BPYA 1BG5A 3IOSA 2YANA 1PQNA 4F82A 5HR0A 1SU9A 5LD0A 2DJ1A 5ECHB 2MYGA 3C7MA 2QC7A 3GYKA 4GF0A 5D8IA 3F4RA 1XVQA 4K6XA 3ZYWA 1Q98A 2AAWA 3M8NA 3EE2A 3TRXA 3LQ7A 4XS1A 3VLNA 3A5WA 1O7UA 1XBSA 1EP8A 5ELAA 1XOAA 4K7OA 5G30A 2IWTA 2VCTA 1EP7A 2AV4A 4K0NA 2YOIA 2X8CA 2IMIA 9GSSA 2YZHA 1V57A 1TI1A 1J9BA 1M7TA 4I5QA 3H8QA 3E9JB 3GFKA 2MBSA 1YQ1A 4WF5A 1ZYQB 5GSSA 2N5BA 5ECLB 4HZ4A 4NHWA 3KH9A 3O3TA 1ZYEA 3FHKA 1MDIA 3M3MA 6GSXA 3W6GA 3FKFA 1X5EA 2H72A 2F8AA 3TKSC 2DBCA 4WBRD 1UC7A 4P3YB 1VF3A 4LL4B 4KSMA 1W89A 3HDCA 1V98A 2NBSA 3D0ZA 1XWBA 4Q5NA 4POLA 4IP1A 2DJ3A 3SBCA 4DSSB 3GHAA 1YJ6A 3FK8A 2H6ZA 5ECRB 4EDYA 1OE8A 3WGXA 2IPAA 2YCDA 1OKDA 2B7JA 5DQSA 1GWCA 1W4VA 3FEUA 2ON7A 1ON4A 2BTOT 4L8EA 3DMLA 3GKMA 3VPTA 2DMLA 1FOVA 2H19A 2HRFA 3LFLA 11GSA 1T1VA 3WD6A 4LMVA 2C3TA 1X9MB 3H4KA 4IP6A 2C80A 2DLXA 2OJLA 3M9JA 1IYHA 2VO4A 4TR3A 1K0BA 4ZBBA 1R7HA 1BJXA 2A2SA 6GSWA 4MJAA 1JHBA 1NHOA 3LWAA 4HQSA 5HR2A 3EWLA 3Q18A 4MABA 4K7IA 1F3AA 1FO5A 2AYTA 4KH7A 2JSYA 1S3AA 2HI7A 4IJ3A 5A4VA 3VWXA 1YEPA 5CRWA 2ZNMA 3I9V2 4Q5RA 1X9WB 3IR4A 1ILOA 4ZB6A 4MH3A 3IXRA 4AJ6A 3TKPA 1A2MA 1O6JA 1PX7A 2M72A 5DQYA 5F05A 1TRSA 2WB9A 2PPTA 5HR1A 4NAXA 2QKEA 3LYKA 2K8VA 4IGJA 4O5RA 3N5OA 3CSHA 5JWQB 3KJYA 5F07A 1ZCPA 2O8VB 1M2DA 4KDXA 3F63A 2H1AA 3QFAC 2OE3A 1F9MA 2V6OA 3ZIVA 2CV4A 3GRXA 5KEJA 1O8XA 4XCSA 3L9UA 1BYEA 5ABRA 3RAZA 2CAQA 3QR6A 3GKKA 2GZZA 4IS0A 4NMUA 2C3QA 3KMNA 5E4WA 1QMVA 4MPGA 3H93A 4FIWA 2FWEA 1SJ6A 3UOMA 3IC4A 4PQHA 4OCEA 2G0FA 2GT5A 3QAVA 1PA3A 4IN0A 4F03A 2LJAA 1ERWA 3Q74A 4KDYA 1A2JA 1GUMA 3VFIA 3TCOA 4YQUA 4ZL8A 1S3DA 1O81A 4GXZA 5A5KA 5DAKA 2VLTA 4PXOA 3L9SA 7GSSA 5HFKA 5KN0A 5FHIA 4RI6A 2OKAA 3WT1A 3MAKA 2O85A 1SK0A 3ZMLA 2Z9SA 4TR1B 5IPGA 2HE3A 3BCIA 2DJKA 2MMZA 1KNGA 2WDUA 1G6WA 1H4OA 3IDVA 1FHEA 1GTUA 3GNJA 4CDOA 2JZRA 1GNWA 4CW9A 1YF1A 2XPDA 4IW9A 1Y25A 2H71A 4DSQA 2B6MA 2WJUA 3Q6OA 4HS1A 1WP0A 3D6IA 1T00A 3HCZA 4I6XA 1T3BA 1PD21 2DIYA 4NV5A 2AHEA 2H75A 5CNWA 4N30A 3FY7A 1QUWA 1YF0A 5DALB 1WRYA 3F3QA 4J56E 3IHQA 3JCML 1Z3EA 4XS4A 2WS2A 3UBKA 4G2EA 5ECSA 1OC9B 3F4SA 1K0DA 4ML1A 2YV7A 2OADA 4DEJA 1HD2A 4KDUA 3E3EA 4TXOA 5H5RA 1GSFA 2K8SA 5KN2A 2GZPA 1AQWA 4JZQA 1SK1A 3RPNA 1VF1A 3LGCA 4KA0A 2C0DA 6GSUA 4N10A 2KLXA 5CP1A 5EY6A 4XRDA 5G5FA 1Q4JA 2IMKA 4QQ7A 3IE3A 3F9UA 1X0RA 3DXBA 1MDKA 4QL9A 4PURA 3GKXA 2R6KA 2YP6A 4XHMA 4GWRA 4TKYA 5GAPD 3K8NA 4RQXA 1RQMA 3HVSA 3KIJA 2V6KA 2VL2A 1NW2A 1F6MC 3QOUA 2L4CA 2GZYA 1TW9A 1ERUA 1WMJA 3CSJA 2R37A 1EGRA 3VI5A 3LXZA 3GA4A 2YWNA 1M2AA 2IMEA 1UVZA 3RPPA 2N5AA 2WZ9A 1GULA 2H74A 2LJRA 2LNTA 4WR4A 1X9SB 3IV4A 3IRAA 1VGLA 4G19A 2GQKA 1EEJA 5IOWA 1AQVA 1B8XA 2R5GA 2EIRA 4AJ8A 1GUHA 4K8MA 1NM3A 5D96A 4OCFA 5J9CA 3LSZA 4NPBA 4AF2A 1B4QA 3IAM2 1WWJA 2PVQA 1TRUA 2CA8A 3QCPA 5ECKB 4TOPA 3TRPA 1TU8A 5J9BA 2I3YA 2H6YA 3KM6A 3HKRA 4XTSA 2HLSA 1USBA 4HJMA 5AIXA 3QFBC 4BWSA 3KP9A 1ST9A 1TU7A 4GTUA 1WJKA 3EINA 1ML6A 2H0HA 2XHFA 1OKTA 4OO5A 2AB6A 3VURA 1B9XC 4EDZA 1J0FA 2GT6A 1HNBA 1K0CA 19GSA 2C4JA 1MEKA 1ERVA 2I4AA 1YDKA 4EVMA 4IELA 3UARA 2CX4A 5CYYA 2HT9A 1FB0A 1FVKA 3NIVA 5FWGA 2LQOA 4LA1A 2QSIA 4HI7A 1PMTA 3DD3A 1IYIA 1K0NA 5AIVA 4N11A 3QD9A 1FW1A 2MMAA 1U6TA 3C8EA 3OR5A 1T4ZA 4NV2A 2B5YA 1PRXA 1RW1A 3UEMA 1DUGA 2I1UA 4ZL7A 4MMMA 2I81A 2YNXA 1EZKA 13GSA 4EUYA 1PL2A 4GQCA 1SJZA 3TGZA 1PGTA 4I8BA 3HHVA 2K18A 3ME8A 2GSRA 3ISOA 18GSA 16GSA 1GLPA 1AC1A 4KUNA 4ZIJA 2NTOA 2VD1A 4TR0A 3GSSA 1K3YA 2L6DA 3M9KA 4ISDA 3IBHA 20GSA 2V41A 4OWYA 1FB6A 2NPBA 3HZ8A 4ECCA 2DJJA 1XW9A 1A0RP 4Z7XA 2H8LA 3KXOA 3EMXA 4JRRA 4POBA 1TK0B 4OO4A 2ES7A 4PUAA 1AUCA 4ID0A 3UVTA 1GSUA 3L78A 4JR6A 1Z5YE 5ENUA 2IL3A 2TIRA 5IM9A 2VAFA 3R2QA 3KMOA 3P7XA 3ZLPA 3LXTA 4HUAA 4CHSA 1H75A 2H1BA 1EV9A 3G7JA 4ZBDA 3HD5A 3M0FA 3C71A 1Z7RA 4K7NA 4ECJA 2X8GA 3D21A 1E2YA 4O32A 4EKZA 2WCIA 2K9FA 2YJ7A 2LS5A 5ID2A 2VD0A 2YN1A 1O8WA 1Z9HA 1LU4A 6GSTA 3GMFA 2X99A 2GSTA 3QPMA 4GSSA 2L57A 1A0FA 2B3SA 2IMDA 4NXIA 1DBYA 2L5LA 4MK3A 4L5OA 3KP8A 3L9VA 5H5QA 4MZBA 1HNAA 4J57E 1FAAA 2WGRA 5EPFA 1SYRA 1TK8B 2RM5A 4IBPA 1THOA 2CAIA 2LRNA 4MF6A 3EMPA 4I2UA 1WE0A 4TXVA 1THXA 2A4VA 3FW2A 1OAZA 2GSSA 1R5AA 5DJLA 5GAND 2PMTA 3GKNA 4TRXA 1EOGA 3NZNA 2P5QA 1EWXA 3HJMA 2F51A 2ZCTA 5G2ZA 3UAPA 2L5OA 2GLRA 3GUSA 4ZBAA 3VK9A 4MJBA 2HXKA 2F8FA 3HJOA 4OMVA 1UN2A 5DCHA 3EU3A 4MF5A 4F0CA 3IAS2 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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