4XCSA

Human peroxiredoxin-1 c83s mutant
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
179
structure length
179
Chain Sequence
GSHMSSGNAKIGHPAPNFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYVVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRAEEFKKLNCQVIGASVDSHFSHLAWVNTPKKQGGLGPMNIPLVSDPKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITVNDLPVGRSVDETLRLVQAFQFTDKHGEVCPAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal Structure of Dimeric Human Peroxiredoxin-1 C83S Mutant
doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-1
total genus 54
structure length 179
sequence length 179
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2014-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xcsA00
3LFLA 4IP6A 2HSYA 3P90A 3A2XA 1BEDA 3PH9A 1VF2A 2IMFA 3QOUA 4G9HA 2JZTA 2VL9A 2HYXA 2H73A 3CXGA 3C73A 2HZEB 4GRFA 1HNAA 1V57A 3IRAA 4LMWA 3TRQA 1U87A 3UL3A 2R3XA 2H0IA 3IV4A 4MF7A 1XW6A 4TKYA 2YZHA 5FT3A 2R4VA 5A4UA 4J57E 5DDLA 3CMIA 4MK3A 3FYGA 1K0CA 2H0GA 5G1KA 3DMLA 1G7EA 2GSTA 1GNEA 4N0ZA 1A24A 1XW9A 3WGEA 3RPPA 5ECPB 4MH3A 2P0GA 2PBJA 1YF1A 3IR4A 3W6GA 1FOVA 4FO5A 2B5XA 2C1YA 3EU4A 1AC1A 3GH6A 4XS6A 2VD0A 3S9FA 3RAZA 5GAND 1GTUA 2KUCA 3ZVJA 3N5OA 5INYA 1NSWA 1DUGA 1USBA 1GSFA 4GQCA 4DSSB 5IQYA 3LXTA 2F8AA 3QMXA 1T3BA 2B3SA 2R2JA 1MDJA 2HZEA 2C80A 3APSA 1Z5YE 2WULA 3A5WA 1V9WA 2IWTA 4MJCA 11GSA 1TI3A 4BL7A 4V2NA 1W89A 4GXZA 3US3A 1X5EA 1GTBA 4BPYA 4WXTA 3GKKA 1EOGA 4IBPA 1XWBA 5B7CA 1Y25A 5GSSA 3Q19A 4JEDA 4MJEA 16GSA 2VL2A 1M9BA 3M0FA 2C4JA 3TJJA 1YDKA 2KOKA 2FD3A 2YV9A 2LQOA 1K0AA 3FY7A 1SU9A 4EO3A 1R4WA 3RPNA 5H5QA 1XBSA 4EVMA 3V1WA 4TR1B 3UBLA 1EV4A 2CZ2A 2CVBA 4XCSA 1ZMAA 4BVXA 2GT5A 2O85A 4X0XA 1HD2A 2A2SA 1GH2A 4DSSA 2V41A 4KCEA 4L0WA 3H79A 4TW5A 3QCPA 4Q5FA 2V32A 5CRWA 2E2GA 4MP4A 4QL7A 5D73A 4MA9A 3NOFA 2JADA 3LYPA 1XXUA 4KX4A 4IKHA 4YAVA 3SWLA 1ML6A 2OA7A 4JRRA 4IJ3A 4PQIA 1QFNA 2V1MA 4EXJA 4OO4A 4EC0A 3ED3A 5F0GA 3L78A 3VWXA 3IDVA 3ISOA 3HA9A 2FUG2 2C3TA 2HRNA 1PL2A 2OADA 3LSZA 1A2MA 3ZL5A 1KEBA 4Q5RA 1X5CA 5IMDA 1QGVA 4RQRA 2V6KA 3UARA 2O89A 1IYIA 2D2ZA 2H01A 1ZGNA 1WJKA 3O6TA 4TR1A 3P7XA 3PR8A 3KTBA 3I9V2 1ZOFA 4GLTA 1M99A 1G6YA 4MJBA 2R6KA 1TU7A 3UVHA 1Z6MA 3IOSA 1XVWA 3GYKA 5LCZA 3E9JB 1ZZYA 1F9MA 4NXIA 3Q74A 3PGTA 2HRFA 1KBNA 5EVOA 2P5QA 4HQSA 1X0RA 3GSSA 2RLIA 2K18A 2WGRA 10GSA 3TRPA 2H66A 1O73A 2AJQB 3ZIJA 3DEXA 3VWVA 5G2ZA 1TDIA 1V40A 2GZZA 1TP9A 1GSUA 5IOWA 1GLPA 5ELGA 3UOMA 1C72A 4NMUA 3VLNA 4LL1B 3UAPA 1U6TA 4PUAA 3GX0A 1LBKA 1TK0B 2OE0A 1JZWA 1OC9B 2F51A 1XZOA 3IXRA 1T7PB 3VK9A 2B5YA 1WOUA 3G7IA 1QMVA 4HUAA 2GZYA 3RDWA 4CDOA 3M8NA 4XTSA 4MF5A 2VOCA 1I5GA 2H1BA 1GRXA 5GAPD 2JL4A 2YP6A 5CRHA 5CAXA 3GUSA 5GSTA 4V2LA 1X9SB 2IMEA 1F6MC 1FVKA 3A2WA 3DXBA 4GQFA 2M80A 2IIYA 1OVNA 2REMA 4NPBA 2YWIA 4IQ1A 2K8SA 1AW9A 4TN8A 2B1KA 2LS5A 1XVQA 2FLSA 4WF4A 4F2IA 1TXXA 2PU9C 4JE1A 4MPFA 3GX8A 3H4KA 5D9VA 5G31A 1FHEA 1TOFA 5JCUA 5H5RA 5JWQB 1O85A 3O76A 4MF6A 1OC9A 1ILOA 3W8JA 1GSEA 4MDCA 1HYUA 1K3LA 4IQAA 3L9SA 3A3TA 3F4TA 2B5EA 4H86A 4RQXA 3TUEA 3IK9A 4DSRA 1VRSD 1SL0B 1F3AA 1Z7RA 2YZUA 4I2UA 4O5RA 1BYEA 3G7JA 2L4QA 3D5JA 4GF0A 1PX6A 3I43A 3WYWA 1AUCA 1A23A 4HDEA 3F9UA 1EGOA 4KNDA 3D4MA 4TR0A 3U6VA 3TKSE 2CAIA 2H6ZA 2NTOA 5CNWA 5B6MA 1T4YA 2OKAA 5ECOB 2MBTA 4FYCA 3VURA 3DVXA 2X8HA 3KXOA 2QKEA 2GTUA 4TOPA 4LA1A 2YOIA 4D73B 3FRCA 5D9XA 4ZIJA 3ZMKA 4XS4A 2VL3A 5ECSA 4YQVA 4YQUA 3CTGA 1PA3A 3WD6A 3AY8A 3HD5A 4K6XA 3MAKA 5IM9A 4KGIA 3CTFA 4OCEA 2DBCA 1MDKA 1RK4A 3HZ8A 3HZ4A 3EVIA 3ZITA 5A4WA 1SJZA 3QAGA 1WRYA 3KD0A 7GSSA 1K0BA 1GSSA 1SK0A 4JR6A 4OO5A 2OJLA 1U3IA 5ELAA 2LSTA 3FW2A 1O8XA 3U5RE 4EF0A 2CT6A 1M2DA 3TJGA 5KN0A 4F9ZA 1ZCPA 5D8IA 5DALB 2FA4A 2H6YA 1PKWA 2DJ3A 3APQA 1GUHA 3OR5A 6GSWA 6GSSA 3KEBA 1TI1A 22GSA 2VM1A 2VCWA 2V2GA 2EC4A 2I81A 2O8VB 1Q98A 4ZB9A 1XWAA 1SK2A 4HU9A 3KJYA 2YCDA 3QFBC 2DIYA 4NHZA 5DVBA 4NV2A 1NHYA 3ZRDA 5A5KA 3MWHA 3ME8A 2XPEA 4D73A 1EGRA 2C0FA 3IC4A 3EURA 1J08A 3CRUA 1V98A 2IJYA 3L9VA 2K9FA 4PGTA 4MZCA 3VWWA 4ACSA 2HLSA 4PNFA 4BWQA 5HR2A 3UMAA 3FZAA 1TRVA 4LMVA 4TXOB 3MDKA 4WETA 1Z6NA 2KLXA 13GSA 2L59A 1PMTA 5DALA 4LLRA 4IP1A 2IFQB 5IPHA 4AJ6A 3QPMA 2CX3A 2EIRA 3CSJA 1M2BA 3ZREA 1FAAA 1S3AA 3R2QA 3GKMA 2H72A 3GURA 5FWGA 2ES7A 4ECIA 2XBIA 3DRNA 1NM3A 1SKWB 4KB3A 1G0TA 2N5AA 2X64A 1K0MA 4I8BA 4ZL9A 1ON4A 2ZNMA 5JCGA 3VPTA 5AGYA 5ECLB 2H71A 2DJ0A 3LG6A 4AGSA 2GLRA 4L0UA 1JZOA 4EDYA 2FWHA 2AV4A 2CZ3A 5IMFA 5KEJA 2LNSA 2M72A 4MZWA 6GSXA 1AXDA 1R26A 3M9KA 2MMAA 5CP1A 4Q5QA 2KHPA 1QQ2A 2G0FA 5IMZA 5D93A 1GL8A 6GSUA 2X8CA 2HT9A 5E59A 4TXOA 1YEXA 2QC7A 5E4WA 4X43A 4GCIA 4EDZA 5C04A 3C7MA 4KSOA 2F3MA 1V58A 2MYGA 2OBIA 3M9JA 1THXA 1OC8A 4BVYA 1KNGA 2IFQA 3F3QA 2VCZA 4V2MA 1GSQA 2K6VA 1M2AA 4MH2A 2PUKC 2DMLA 5JWOB 1GWCA 2IL3A 4MMMA 4KDUA 1UN2A 1X9MB 5C00A 2DJ2A 3EC3A 4O92A 3ZFBA 1ERWA 5JCWA 1MD3A 5D9TA 4HS1A 2GS3A 3VPQA 3KH7A 2E7PA 4IGJA 3QDNA 1WIKA 1MEKA 2LTKA 3M3MA 1SKSB 4GSTA 4ZB6A 1M9AA 3GN3A 3GL5A 3WT1A 2H76A 3GIXA 3CBUA 2DJ1A 2LJAA 3FKFA 2PPTA 5F07A 3HDCA 2MMZA 4MABA 5HR0A 3IE3A 5LD0A 1B4QA 4AF2A 2A4VA 1F3BA 1OKTA 1MTCA 2ZCTA 1O7UA 4IS0A 4JZQA 2CA8A 1GTIA 5AISA 1OE7A 3F6DA 3GA4A 3Q6OA 1XWGA 1AAZA 2NDOA 3GL3A 3KCMA 1SL2B 4PNGA 5HQPA 2KP1A 6GSVA 4WF5A 4BWSA 2YWOA 5G30A 1QK8A 4EL1A 2OE3A 2B7JA 1SYRA 4GSNA 19GSA 5G5EA 2VLUA 5CYYA 1ST9A 1OKDA 2WRTA 1OE8A 1GP1A 1YKCA 20GSA 2YJ7A 2VCXA 3C1SA 2I1UA 3GHAA 2OE1A 2FHEA 5ECNB 1T1VA 1X9WB 4HJ2A 2J23A 1XOBA 2PN8A 3W8SA 1FB6A 2LUSA 3ERWA 1EP7A 2JU5A 3TCOA 3L9UA 2WS2A 4XHMA 1QXHA 2HFDA 2WCIA 5ID2A 2LRNA 2J9HA 1XW5A 1URMA 1XWCA 3FK8A 1BAYA 2HE3A 3GMFA 3GTUB 2HSHA 4TRXA 1Z9HA 1B4PA 3ZZXA 1GUKA 1T8EB 1N8JA 3F4RA 4NHWA 3VFIA 4X1UA 2GGTA 4ZBAA 2YJHA 5HFKA 2YNXA 2MMNA 2VCTA 2LKUA 1T00A 3FEUA 5B8AA 3DIEA 3G7YA 4E8EA 4TR4A 4PXOA 3DGQA 2Z9SA 2VO4A 3TJBA 4POLA 4XIHA 3KGKA 3EWLA 4N11A 3KH9A 3LORA 4ML6A 4PQ1A 3HYPA 1A0RP 1JHBA 2YWNA 2MBSA 3EINA 3TKSC 4J56E 4FIWA 2GQMA 3ERFA 3EMXA 4RUVA 3UJ1A 1J0FA 4LL4B 5ECMB 4GWRA 4K9ZA 3TKRA 12GSA 1UVZA 2LQQA 3VWUA 2VD1A 2HXKA 1EV9A 4WEYA 4K7NA 1SK1A 2VIMA 5B8BA 4PX1A 5IOXA 3GSTA 4Z7XA 3GNJA 2V6OA 1UC7A 4F0CA 1PSQA 3GTUA 2I4AA 2C3QA 2LV3A 3TOUA 1EWXA 2DSAA 2VLVA 2C0EA 4K0GA 3HJOA 6GSTA 4XS4B 5IO2A 1FG4A 1FB0A 4HZ2A 1TU8A 3TDGA 2LRTA 3CYNA 4XS1A 5HFGA 1K0NA 4YAPA 1NHOA 1B8XA 3LEFA 2JZRA 5G1LA 1ZL9A 3G9BA 3F0IA 1EZKA 2QGVA 1TKDB 1U3AA 4NAXA 2X99A 3NZNA 4IJIA 5DJLA 4F03A 1XPVA 3O3TA 4ZB8A 3GRXA 3FR9A 1I9DA 4RI7A 4G2EA 3A2VA 3Q18A 4XRDA 5DBQA 3JCML 4KSMA 1HNCA 4K0NA 4L5OA 1ACVA 4HOJA 5A4VA 3D0ZA 1OYJA 1VF4A 4GSSA 5JWRB 3M1GA 2FWEA 4G19A 4G10A 1SJ6A 2VUPA 2C8UA 1GLQA 3SBCA 4AJ8A 3C71A 1S3DA 1ERVA 3IAS2 1CQHA 1THOA 3BCIA 1DE2A 1O6JA 2E2MA 3MSZA 2L6DA 1R5PA 3I69A 3ZYWA 1AQVA 2P31A 3F4SA 2YWMA 2TRXA 4OCFA 3IPZA 4ZXGA 3TOTA 1M0UA 2K8VA 2L5LA 1O81A 3CSHA 1K3YA 3FHKA 3ZMLA 2PERA 3HVSA 1VGLA 3N9JA 3TB2A 4KA0A 3L0HA 3WT2A 1PKZA 4WBRD 2GT6A 4ISDA 2GZPA 2L4CA 2R5GA 4PUFC 4DVCA 4OMVA 1AQXA 1SL1B 3PINA 1TTZA 1N2AA 4HEA2 1Z3EA 2GQKA 4PQHA 4WKWA 4KUNA 1K3OA 1GTAA 4HU7A 5IMCA 4MLYA 2AUVA 3HHVA 5B6NA 1PRXA 2LJRA 2FCHA 2JACA 2MZCA 5ABRA 4TR3A 4YH2A 3IA1A 1M7TA 1J9BA 1EEMA 1U88A 4IELA 4Q5NA 1EOHA 2JSZA 2C0DA 2M46A 1B9XC 5KN1A 5H5SA 4CHSA 5F8BA 4WBJA 3GH9A 2FY6A 2ON7A 4ULXA 2B6MA 1F37A 4L5LA 3HJMA 1JZRA 1A0FA 3GKXA 4NWYA 4O7HA 3QD9A 1ZYQB 1Z7PA 4ZL7A 2XC2A 2H75A 2X8GA 2YPMA 3BJ5A 4E8HA 4YQMA 2OACA 4DSQA 2F9SA 1MDIA 3HJPA 3MNGA 5J5NA 3K8NA 3ZIVA 2AHEA 2ALBA 1DBYA 4O32A 4MZBA 1A2JA 4OD7A 4I2TA 1XWKA 1GSYA 3ZVJD 2H0HA 1YJ6A 3HCZA 1YKAA 4HQZA 4POBA 3P8WA 4WR5A 1K0DA 2H8LA 1PN9A 3KTLA 4ECJA 5HFIA 1A2LA 4K7OA 1CQGA 3DWVA 18GSA 5D96A 4F82A 3TKPA 2YANA 3F8UA 2YN1A 5J9BA 4OFTA 2VCVA 2CAQA 4MCUA 4DEJA 4POKA 4TXVA 4IVFA 1FW1A 1OAZA 4CW9A 2HI7A 2AB6A 2JSYA 1IYHA 2R37A 2EIOA 3FZ5A 1EP8A 3GFKA 3QFAC 3GKNA 5CO3A 2CQ9A 2ON5A 1BQ7A 5DAKB 1GULA 4K8MA 2PWJA 5J9CA 4IN0A 3WGXA 1QUWA 5AIXA 4BA7A 4FH8A 3E3EA 4MJAA 8GSSA 1ZYEA 3EE2A 3KP9A 4I97A 4KDYA 5DQYA 4ML1A 4JR4A 2MMOA 2G2QA 2NVLA 4NV5A 4GTUA 4RI6A 5DQSA 3IHQA 1GUMA 5ENUA 2RUEA 3D22A 1SENA 2VCQA 4QL9A 3LXZA 3QAVA 2H6XA 3IBHA 1TRUA 2VLTA 2H30A 4V1Ag 1K0OA 3LJRA 4JBBA 4J2FA 3FR6A 4L8EA 5J41A 1PX7A 5IMVA 2FNOA 2O7KA 1PGTA 4FYUA 3KP8A 3TJFA 3KM6A 2H1GA 1A8YA 5ID2B 2H19A 3RHBA 1S3CA 2DLXA 3ERGA 1Y6EA 5AIVA 17GSA 2AAWA 3EYTA 4ZILA 5EY6A 5DAKA 2LEGA 3LQ7A 4IW9A 4K1FA 3RBTA 1R5AA 1GNWA 3VI7A 3LWAA 1GSDA 1DE1A 2LRCA 2F8FA 1B9YC 2FWFA 1H4OA 3DVWA 1WMJA 2LNTA 1T4ZA 1R7HA 2C3NA 2XHFA 4HZ4A 5COHA 1AQWA 1B48A 2PVQA 9GSSA 2NBSA 5ECIB 5ECHB 3TKSA 2AYTA 4KCAA 2GVPA 2L57A 1YZXA 5LNKe 1RW1A 1UA5A 2VL2C 1E6BA 2OBKA 1YY7A 1LU4A 3UEMA 4KW6A 3TKQA 3F6FA 1E2YA 2H70A 3KZQA 2WJUA 1LJRA 2WDUA 2BTOT 1OC3A 1TRSA 5KN3A 3APOA 5IPGA 4ZBDA 4ILFA 1SD8A 1MD4A 3KMOA 3HVVA 5IIZA 4IHUA 3D4TA 1VF3A 2PVOC 4V1Ap 1WE0A 2FA8A 1XIYA 4N30A 2GSSA 5HR3A 1SYXA 3DYRA 2DJKA 2XBQA 4ID0A 2NPBA 6GSYA 5CRDA 1H75A 5DJMA 2DC5A 3IK7A 5FHIA 3L4NA 2IMDA 1YQ1A 2YV7A 1XOAA 2WFCA 3F63A 4TVEA 5CREA 1DSBA 4XRAA 4F0BA 2L6CA 5EPFA 1WP0A 4JU5A 2RUFA 2I9HA 2WB9A 1ERUA 2B7KA 1G7OA 4KAEA 2N5FA 4KE3A 2GQLA 2N5BA 2WZ9A 5L71A 4EKZA 3WGDA 3TRXA 2PGTA 1WPIA 2C0GA 2DMMA 3DKSA 1JFUA 5ECKB 2VAFA 3BD2A 2CVDA 4HJMA 1A8LA 2A2RA 4EE0A 4I6XA 3TJKA 1PD21 1TJDA 1TK8B 3VI5A 2E0QA 2RM6A 1JLWA 3IAM2 4WR4A 5GZZB 2CX4A 4HI7A 4KH7A 3ME7A 2H1AA 2EIQA 3NIVA 3P2AA 5D9WA 5AN1A 5J4UA 3LYKA 3UIWA 4K2DA 3D6IA 1JLVA 1ERTA 3ZLPA 1F2EA 3BBYA 5IMAA 1FVJA 2BJXA 2IPAA 3C1RA 5G5FA 1FO5A 5KN2A 3TGZA 3ZFLA 5J3RA 14GSA 3RHCA 1O8WA 1TK5B 5F06A 1SJIA 1SKRB 1TRWA 3UBKA 3BCKA 3FR3A 3I6AA 4N0VA 2GDRA 2I3YA 2B1LA 1PL1A 3HKRA 5DCHA 3C8EA 5HR1A 2CV4A 3QAWA 2O87A 2PMTA 3EU3A 3ZTLA 2DIZA 3GV1A 4OFNA 2HNLA 2HZFA 2RIIA 4ZL8A 4KDXA 1XCCA 1AIUA 3E0UA 3UVTA 3J7Yk 2GSRA 5CRGA 1XFLA 3DD3A 3H8QA 3EMPA 2CVKA 4AJ7A 2TIRA 1NW2A 2XPDA 2BMXA 5ECQB 2QSIA 4POMA 4PURA 1EEJA 2DJJA 5ECRB 1X5DA 3FZ9A 3HXSA 1HQOA 5DCGA 4OWYA 1JZDA 1VF1A 1KTEA 1BX9A 3HY2A 2IMKA 4QQ7A 1TW9A 4OFMA 1BJXA 2FGXA 2VM2A 3H93A 3CSIA 2H74A 2L5OA 3KMNA 3LGCA 3D21A 2TRCP 1G6WA 1HNBA 1WWJA 4P3YB 3FZ4A 2JZSA 1W4VA 4ZBBA 3J7Yb 1RQMA 3QR6A 3CRTA 2GSQA 2FWGA 1YEPA 1YF0A 2H1DA 4ECBA 3HVXA 3KIJA 2P5RA 1PQNA 2KP2A 2LJKA 5IO0A 1Q4JA 4EUYA 2IMIA 3F3RA 5F05A 5EL8A 4ECCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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