1KNGA

Crystal structure of ccmg reducing oxidoreductase at 1.14 a
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
144
structure length
144
Chain Sequence
RPAPQTALPPLEGLQADNVQVPGLDPAAFKGKVSLVNVWASWCVPCHDEAPLLTELGKDKRFQLVGINYKDAADNARRFLGRYGNPFGRVGVDANGRASIEWGVYGVPETFVVGREGTIVYKLVGPITPDNLRSVLLPQMEKAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords THIOL:DISULFIDE INTERCHANGE PROTEIN CYCY
publication title Structure of CcmG/DsbE at 1.14 A resolution: high-fidelity reducing activity in an indiscriminately oxidizing environment
pubmed doi rcsb
source organism Bradyrhizobium japonicum
molecule tags Oxidoreductase
total genus 46
structure length 144
sequence length 144
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1kngA00
2YN1A 3NOFA 4TR1B 2LKUA 1XFLA 4PURA 4OFMA 2O7KA 1YY7A 3A2WA 1UC7A 4GCIA 5CRHA 3KM6A 1U88A 1THOA 2I81A 5HR3A 5GSSA 3LXZA 5J3RA 1OC8A 2KLXA 4MK3A 11GSA 1KNGA 5KN3A 1B4QA 2JSZA 1H4OA 2AUVA 2FWHA 2LRTA 2DJ1A 5IQYA 4IP1A 1TRSA 1S3CA 4BPYA 1M2AA 4PNGA 3TRPA 1V58A 4HOJA 3UOMA 4POLA 4NMUA 4NHZA 2F9SA 2IMFA 3WGXA 4ZBDA 1TW9A 3H1NA 1WOUA 3L0HA 2VD0A 2H71A 1XVQA 1GLPA 2FNOA 3QFBC 4L5OA 4AGSA 1N8JA 5ECSA 2DC5A 4OFNA 2I9HA 3GRXA 1XWKA 2B7KA 2CVBA 2FWFA 5J9CA 5G5EA 5FT3A 3QFAC 3VURA 2FWEA 2HRNA 1SJZA 3IDVA 2P5QA 3DWVA 4IP6A 1K0DA 3KGKA 2H66A 3VFIA 5EY6A 1PKZA 2HRFA 4OFTA 3U5RE 3QD9A 3HA9A 4BL7A 3LQ7A 1MEKA 2H0IA 1O8XA 3FZ5A 4ZBAA 1MDIA 1RK4A 10GSA 3HCZA 4TVEA 4P3YB 3EMPA 2H8LA 1PRXA 2JZTA 2YWIA 5DDLA 5ECPB 4KB3A 3UMAA 5DAKB 2FD3A 1OKTA 3GL5A 3F8UA 5ECRB 4QL9A 2LEGA 2E2GA 3LFLA 3P90A 5ECQB 1CQGA 5AGYA 2R5GA 1TKDB 2KP1A 3F4TA 2YNXA 3OR5A 1ZOFA 4G9HA 3MAKA 3TKPA 2LUSA 5E4WA 3O76A 3ZYWA 4AF2A 1X5DA 1R26A 1GSQA 1XWGA 4PUFC 1S3AA 3GHAA 4FYCA 1O8WA 2EIRA 3GUSA 1AQVA 3EWLA 2HZEA 2HZFA 5IMFA 4FH8A 4I8BA 3LEFA 2MMOA 4PGTA 1TXXA 1SENA 1BJXA 1ABAA 5AISA 5DQSA 3HDCA 4MJAA 5IOWA 1B48A 4GSTA 6GSXA 5LD0A 4G10A 2E2MA 3VWUA 1F3BA 2R37A 2WZ9A 2PN8A 5J4UA 4BWQA 1SKRB 2V6KA 4TXVA 2H75A 3TKQA 2NPBA 3ZZXA 4PNFA 1V9WA 3F9UA 2M46A 1K0OA 5HR0A 2VL2C 5HR2A 3GTUA 4TXOA 3C1SA 4PUAA 2KOKA 2E7PA 3MSZA 2N5AA 2R6KA 5G1KA 1GWCA 3A2XA 5D96A 2V2GA 2O87A 2MBSA 1MDJA 2FLSA 3AY8A 1I9DA 2LJRA 3CSIA 3JCML 4KW6A 2FCHA 2L5LA 2H0HA 3D0ZA 3BCIA 2PWJA 1E6BA 5CYYA 3UAPA 3HVXA 1XW6A 5EL8A 1EOGA 1GULA 1TJDA 4TW5A 4TR1A 1PL1A 1K3LA 2M72A 2QSIA 1USBA 4E8HA 3FR3A 1AUCA 4MF7A 2CT6A 2H1AA 1TU7A 3O6TA 2IMKA 5F8BA 2TIRA 4MA9A 5F06A 4POMA 3I43A 1YDKA 3DRNA 1H75A 3QR6A 3CRTA 3HVVA 1SJ6A 1SL2B 1YEXA 3L9UA 1O7UA 1M0UA 5JWOB 1TTZA 2AYTA 2MBTA 3LXTA 4V1Ag 4KUNA 4XTSA 1SKWB 1JFUA 3GKMA 4J56E 1PL2A 3CBUA 4BVYA 4LMVA 3FK8A 3VPQA 4YQUA 3TB2A 1XWCA 2RM6A 2L4CA 1T7PB 2K6VA 2CAIA 5C00A 5AIXA 4N30A 1TU8A 2HNLA 3C7MA 3GA4A 3M1GA 4K0NA 4HJMA 5G1LA 1OC9A 2C0FA 3ZFLA 4NAXA 4V2NA 1K0CA 3M8NA 3ZITA 4RQRA 1EOHA 1SD8A 4HDEA 2IMEA 2CVKA 3WT1A 2GZPA 4MH3A 3HZ4A 2RUFA 4ZBBA 1HYUA 1HNAA 4O5RA 1BQ7A 1GTAA 2WJUA 4G19A 5B8BA 4KX4A 3VPTA 1ERUA 4IW9A 4IJIA 1U6TA 4X43A 3IV4A 4GSNA 1Z5YE 3FR9A 4I6XA 4KCEA 1GTBA 5D9WA 2JZRA 1TRVA 4QQ7A 2PUKC 4KH7A 4F0BA 3LWAA 3O3TA 2VLVA 4KAEA 2JADA 2ON7A 4HEA2 1U3IA 2YZUA 1BX9A 3Q19A 1ERVA 2VD1A 3NZNA 2QGVA 9GSSA 2V6OA 1TDIA 4ZB6A 5DAKA 1A24A 3CTGA 3HVSA 2PBJA 4G2EA 3A5WA 1OC3A 4H86A 3W8SA 3TKSE 3J7Yk 4WF5A 3EU4A 2KP2A 1K0BA 4I2TA 4MZCA 4DSSA 4N11A 2DIYA 2EC4A 1R5PA 3DVXA 4GXZA 6GSYA 3GV1A 1J0FA 3GMFA 3C71A 3F6DA 3QCPA 2P0GA 4EE0A 3TOTA 2VL2A 1NSWA 4HQSA 4K6XA 1QFNA 1Y6EA 3IR4A 1XWAA 5F07A 2HI7A 4YH2A 4ZB8A 5IMAA 2H6ZA 2PGTA 1GL8A 3TJJA 1ZCPA 5EPFA 4KDXA 3L9SA 2I1UA 2IMIA 1PMTA 4GRFA 1F3AA 2PVQA 4WR5A 3GL3A 1GSDA 1X5EA 2AJQB 1YF0A 2F8AA 1Y25A 2IJYA 1SL1B 4JEDA 1PX6A 1G0TA 3UARA 1FW1A 5CO3A 2FA4A 2GSSA 2DMMA 1WE0A 4GTUA 4MDCA 5FHIA 3RAZA 1VF1A 4TXOB 1QXHA 4IS0A 1M9BA 2VLUA 3TCOA 4F03A 4TKYA 1JLVA 1FAAA 4DVCA 1XIYA 4EXJA 4LLRA 3DXBA 1HQOA 4GLTA 1FHEA 1GTIA 4XRDA 4AJ7A 2GQMA 2LSTA 2PU9C 3APQA 5B6NA 1GSUA 1PD21 4GF0A 5IOXA 4LL4B 3KMOA 3KXOA 3FR6A 2FA8A 2O89A 2KUCA 2B1KA 4O7HA 1DSBA 2FUG2 1KBNA 1NM3A 4V1Ap 5JWQB 4ZL9A 4CHSA 4EF0A 3KCMA 2X8HA 3DVWA 4MJCA 1OE7A 3KH9A 3APOA 5DALB 4JZQA 2XPDA 5HFKA 4RI6A 2LRCA 2OE1A 2TRXA 4ZXGA 1AXDA 3M9JA 1ZYQB 3EMXA 1ON4A 1F2EA 4HZ2A 3D5JA 4POBA 3DGQA 18GSA 2H1GA 1SK2A 1EEJA 4KA0A 4V2MA 3L4NA 3GN3A 4JRRA 2IIYA 2D2ZA 5JWRB 2DIZA 3F6FA 3WT2A 1ZYEA 4RI7A 4MCUA 5ECLB 4F2IA 1X9MB 3FY7A 1DE1A 4K2DA 3ISOA 5COHA 1PKWA 1K0NA 2IMDA 3Q18A 4DSQA 2YWOA 1OC9B 1M7TA 3IK7A 3LG6A 3ZIVA 2FHEA 3DKSA 1XBSA 1EZKA 2CQ9A 3ZFBA 2JSYA 1M99A 1AC1A 4ZIJA 1KTEA 2J23A 1UVZA 3CMIA 4KDYA 5D9XA 4J2FA 5A4UA 2H0GA 2R2JA 3EVIA 3KJYA 4YAPA 2H1BA 1QK8A 3SBCA 1SL0B 3HHVA 4OO5A 1A0RP 1GRXA 2L59A 1Z6NA 3IPZA 1F6MC 4MF5A 2HSHA 2CZ2A 3BCKA 5LCZA 5ENUA 2X99A 4CDOA 2L6CA 3I9V2 2C3QA 2MZCA 2GT5A 2HLSA 4ISDA 3GFKA 4KDUA 4O92A 2DJKA 2NBSA 1XXUA 4ECBA 2N5FA 4ZILA 3LSZA 1O6JA 2TRCP 4IVFA 1Q4JA 5ECMB 2IPAA 4PXOA 1PGTA 1R4WA 3GIXA 3ZVJA 2WB9A 1GSFA 3WYWA 1QGVA 2LNTA 2GSTA 5HFIA 1TRWA 1FVJA 2JU5A 3A3TA 4DSSB 5D9VA 1LJRA 4MP4A 1WPIA 1VRSD 5ECKB 5H5RA 4K7NA 4ECCA 2HFDA 2EIOA 1AIUA 4XS6A 1T00A 4KSMA 4L0WA 5IMDA 3CRUA 4XS4B 2B5YA 2ZUPA 2LJKA 3HJMA 2HT9A 5ID2A 3US3A 3MWHA 4PQ1A 1CQHA 1OVNA 3CSHA 3MDKA 4ZL8A 5ECOB 3TDGA 12GSA 5JCWA 2X8GA 1B9XC 4K8MA 3DYRA 3IA1A 1YF1A 3BBYA 4POKA 3PINA 2NTOA 4X1UA 4NV2A 1PX7A 2OBIA 2R4VA 1T4ZA 6GSTA 2C3NA 1KEBA 3ERFA 2VO4A 3P8WA 5ELAA 3W6GA 1T4YA 1F9MA 1M2BA 2WGRA 3ZVJD 3ZRDA 1XCCA 1OKDA 4N0VA 3HXSA 2HXKA 4FO5A 3PGTA 5B6MA 2F8FA 1B9YC 4WETA 3TRXA 4IQ1A 3RDWA 3TJGA 3TJKA 1A8LA 2L57A 4IHUA 2R3XA 5CNWA 1I5GA 1SD9A 2ZNMA 2X8CA 3W8JA 5HQPA 1K3YA 3LORA 1FG4A 4HZ4A 2NDOA 3FRCA 13GSA 20GSA 4AJ8A 2DJ2A 4Z7XA 1TK0B 1BYEA 3H4KA 4EKZA 3VWXA 3IXRA 3R2QA 3ERWA 3RPPA 3GKNA 1LU4A 1Z6MA 2MMZA 2LS5A 3IE3A 4O32A 5DALA 2YANA 2ON5A 4IELA 3UBLA 1GNWA 3EYTA 3D22A 1G6YA 1TK8B 3H93A 2LTKA 2DJ0A 5CREA 3KH7A 1X9SB 4Q5QA 22GSA 1W4VA 3Q6OA 3ZIJA 4K0GA 4Q5NA 2XBIA 1JHBA 1YJ6A 5CAXA 4HS1A 5A5KA 4IKHA 2V41A 1URMA 2NVLA 4NV5A 2F51A 3GSTA 1ERTA 2MMAA 3K8NA 2DJ3A 4IJ3A 3KP9A 2LQOA 2CA8A 5INYA 3ZL5A 2M80A 2YPMA 4MJBA 4OCFA 3G7IA 2C0EA 2H6YA 2OE0A 3QOUA 3D21A 2MMNA 2RUEA 3A2VA 2LNSA 2B5XA 3QPMA 2MYGA 4MJEA 3WGDA 1ZL9A 5E59A 3UJ1A 5D93A 3PH9A 6GSVA 3N9JA 1JZDA 2I3YA 1VF4A 4IN0A 3UIWA 1V40A 1PSQA 5EVOA 5CRWA 2C0DA 3DMLA 1GP1A 5GAPD 1TI3A 1XVWA 3KP8A 4OO4A 2L4QA 5DVBA 2WFCA 1TOFA 1AAZA 2WRTA 4XIHA 4TN8A 5AIVA 5F0GA 1A23A 3M3MA 1EEMA 1V57A 3IC4A 2DSAA 1A2JA 3IBHA 3WD6A 2H70A 4F9ZA 3SWLA 17GSA 3D4MA 4XRAA 2H76A 3TKSA 5HR1A 2O8VB 4TRXA 5IMZA 3QDNA 1GNEA 2L6DA 4IQAA 4KSOA 1TI1A 2VM2A 2VL3A 2AB6A 2C4JA 14GSA 3FHKA 3VI5A 3RBTA 1G6WA 2XHFA 3IK9A 2H72A 2VUPA 4OMVA 4Q5RA 2HYXA 5CRDA 1XOBA 3IAM2 3ME7A 3ZTLA 5DJMA 2K8VA 2OBKA 5ID2B 4NWYA 2GVPA 4XS4A 4TR0A 2P5RA 2BTOT 4ML6A 2C1YA 2V1MA 3CYNA 3TRQA 5IMCA 1MD4A 2JACA 2IL3A 5AN1A 4BWSA 4HI7A 2YJ7A 1SYXA 1EV9A 4F82A 3QAWA 2CX4A 3C1RA 4L0UA 1SK1A 3IAS2 2B6MA 4MF6A 1OYJA 4MZBA 3FZ9A 1A2MA 1K0MA 5J9BA 6GSSA 3KTBA 1YZXA 4WR4A 2VAFA 1YEPA 2AHEA 3E9JB 1GSYA 1O85A 3ZREA 3TJFA 2Z9SA 3M9KA 3L78A 5J41A 1A8YA 4GQCA 4KE3A 2VCXA 4MPGA 2XBQA 2DLXA 4K1FA 2VCTA 1VF3A 2YV9A 1UA5A 3LJRA 1EP8A 3APSA 4PQHA 1GSSA 1XPVA 3Q74A 2VL9A 3UEMA 3I69A 3HJOA 1XW9A 3WGEA 1Z7RA 4V2LA 3VK9A 1SJIA 3S9FA 1V98A 1G7EA 5IPGA 4XHMA 1O81A 2GS3A 4YAVA 1QUWA 4ULXA 3QAVA 1O73A 6GSWA 3NIVA 4OD7A 4I2UA 2VM1A 3D6IA 2LJAA 2WULA 3BD2A 3E0UA 4K7OA 1M9AA 2G2QA 2OA7A 16GSA 3EINA 5DQYA 2H01A 5IM9A 3HKRA 3P7XA 1GSEA 1LBKA 1Z7PA 4F0CA 3LGCA 3GKXA 5IPHA 2GQKA 3HD5A 1OE8A 4K7IA 5ECHB 2GTUA 1ACVA 2OACA 2V32A 3CTFA 4HUAA 3F3RA 1HNCA 3KD0A 5IMVA 1NHOA 4EUYA 3KMNA 4GSSA 1GUHA 1ZMAA 4MH2A 1ZZYA 4TR3A 2GGTA 5D73A 3L9VA 2A2SA 1TRUA 1U87A 5KN2A 3FEUA 2H6XA 1HD2A 2LRNA 2CV4A 2HSYA 3IHQA 2IWTA 1FO5A 2OE3A 3F0IA 1J08A 1WP0A 2H30A 2PERA 2CVDA 2B3SA 1SK0A 2K18A 5GAND 1GLQA 1XOAA 2B7JA 5JCGA 1W89A 3UBKA 2IFQA 4X0XA 3C73A 4OCEA 1SKSB 1R5AA 4HU7A 3RPNA 3GURA 3KZQA 4K9ZA 2VLTA 4FYBA 1EGRA 4EDZA 1AQWA 2K8SA 2PMTA 2FGXA 5ECIB 5C04A 1ZGNA 5IO0A 3QAGA 2AAWA 4D73A 4ECJA 3D4TA 4JBBA 3GKKA 2B5EA 5ABRA 2CZ3A 3F4RA 5ECNB 2ALBA 8GSSA 4BVXA 2PPTA 4NXIA 5B7CA 2C80A 3H79A 5JCUA 2OADA 1SYRA 3FZ4A 1FOVA 2YWNA 1TP9A 3TUEA 3F63A 2DMLA 4HU9A 3P2AA 3GX8A 1WJKA 3LYPA 2VOCA 4JU5A 1B4PA 1XW5A 2GSRA 3CXGA 2C3TA 4WBRD 3H8QA 2VCQA 19GSA 2GZYA 1NHYA 3ZMKA 5IO2A 4YQVA 1Z3EA 4CW9A 4LMWA 3GH6A 5G30A 2XPEA 1XWBA 1PA3A 1JZWA 2REMA 4EO3A 4RUVA 3TOUA 2VCWA 1U3AA 1DBYA 1AW9A 3FYGA 2WDUA 3TKSC 4N0ZA 2FY6A 4L8EA 3VWWA 4YQMA 4KCAA 5D8IA 4I97A 5H5SA 4MABA 1A2LA 3VI7A 1QMVA 2QKEA 3G7YA 2H19A 2GZZA 3BOAA 3KEBA 3F4SA 4FYUA 1VGLA 2C0GA 2LV3A 5HFGA 2YV7A 2YP6A 3UVHA 1NW2A 3V1WA 3HYPA 3FW2A 2RLIA 4ML1A 2A2RA 1J9BA 4GWRA 6GSUA 3HZ8A 1UN2A 1K3OA 2OKAA 4LL1B 2K9FA 1MD3A 1Q98A 1ILOA 1MDKA 2ZCTA 3F3QA 3UVTA 4ZL7A 5LNKe 1DUGA 4KNDA 2AV4A 2GQLA 4MZWA 5G2ZA 1GTUA 3GNJA 1JZOA 1YKAA 2IN3A 1WMJA 2X64A 1Z9HA 5KEJA 4JE1A 5FWGA 4ECIA 4N10A 1OAZA 1R7HA 4ID0A 1PQNA 2L5OA 1XZOA 5DBQA 4WF4A 2N5BA 1X5CA 2O85A 4JR6A 1C72A 2P31A 2GDRA 2FWGA 3KTLA 1HNBA 4PX1A 3ZMLA 3CSJA 4HJ2A 5A4VA 1YQ1A 2YCDA 1F37A 2YZHA 3UL3A 2OJLA 3DD3A 4ACSA 1TK5B 2DJJA 1BAYA 2WS2A 3EURA 2BJXA 4PQIA 4Q5FA 1T3BA 5DJLA 1THXA 4J57E 4I5QA 1GUKA 3IRAA 4TOPA 3C8EA 3LYKA 1GH2A 1BEDA 3RHCA 1IYIA 5CP1A 4DEJA 2XC2A 4NHWA 3E3EA 4WEYA 4ZB9A 2IFQB 1EP7A 4EDYA 4MMMA 1S3DA 2YJHA 3IOSA 1BG5A 2VCVA 1GUMA 2F3MA 4WBJA 3TJBA 1FB6A 4IGJA 3GX0A 4D73B 4EL1A 3GH9A 5B8AA 2CX3A 4EC0A 4HQZA 3GSSA 4GQFA 4NPBA 4AJ6A 3G9BA 2J9HA 2C8UA 5F05A 2KHPA 2EIQA 3FKFA 4KGIA 4WKWA 3VLNA 1IYHA 1ST9A 2A4VA 3ERGA 3HY2A 3GYKA 2LQQA 1G7OA 1JLWA 1T8EB 3KIJA 1AQXA 5GSTA 4FIWA 1V2AA 2HE3A 3N5OA 4XS1A 1EV4A 2H73A 2JZSA 3FZAA 3QMXA 2PVOC 5ELGA 5KN1A 1SU9A 4ILFA 1M2DA 1T1VA 2H1DA 2DBCA 1EGOA 2CAQA 5IIZA 3M0FA 2B1LA 5J5NA 3EU3A 2H74A 5H5QA 1B8XA 2YWMA 2VCZA 1JZRA 1VF2A 5DCGA 2HZEB 3DIEA 2G0FA 4WXTA 3MNGA 4IBPA 4EVMA 4XCSA 7GSSA 5D9TA 1WWJA 5G5FA 1N2AA 2YOIA 4LA1A 1YKCA 4MPFA 3ED3A 1X0RA 2GLRA 1MTCA 3DEXA 3RHBA 2WCIA 1ML6A 4E8EA 1K0AA 3TKRA 4TR4A 4BA7A 3J7Yb 2JL4A 5L71A 1DE2A 3I6AA 3EE2A 4JR4A 3TGZA 1FVKA 2VIMA 5KN0A 1FB0A 2GSQA 5CRGA 4QL7A 5DCHA 4DSRA 2RIIA 3GTUB 2GT6A 1WRYA 2BMXA 1RW1A 4MLYA 2QC7A 5A4WA 3HJPA 1A0FA 3BJ5A 4RQXA 1EWXA 3ME8A 2I4AA 4L5LA 5G31A 1WIKA 3U6VA 3ZLPA 3PR8A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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