2I4AA

Crystal structure of thioredoxin from the acidophile acetobacter aceti
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
SEHTLAVSDSSFDQDVLKASGLVLVDFWAEWCGPCKMIGPALGEIGKEFAGKVTVAKVNIDDNPETPNAYQVRSIPTLMLVRDGKVIDKKVGALPKSQLKAWVESAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Atomic-resolution crystal structure of thioredoxin from the acidophilic bacterium Acetobacter aceti.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Acetobacter aceti
molecule keywords thioredoxin
total genus 33
structure length 107
sequence length 107
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2i4aA00
4MJBA 4TVEA 1PL1A 3TGZA 1YF1A 3QD9A 4BPYA 5G30A 2CQ9A 4HS1A 1X9SB 3M8NA 4IS0A 4EXJA 2OKAA 4Q5QA 3DKSA 5EPFA 4KDUA 4MF6A 1SJIA 5F06A 3FW2A 4NHWA 2P0GA 1Q98A 3ZLPA 1BYEA 2WFCA 2GTUA 4K0GA 1YJ6A 1GNWA 3NZNA 1A2MA 2IMIA 2B7KA 4BL7A 1O6JA 1X9MB 3EC3A 1GSQA 2ZNMA 3VWXA 4P3YB 1K3OA 2VL2A 4MPFA 2VLTA 3HXSA 1A2LA 2R5GA 1DE1A 2K6VA 1JZDA 1ZL9A 5H5SA 1RW1A 3IXRA 1TK5B 2PGTA 2YZHA 2H6XA 2F8AA 1A23A 1VF1A 3Q18A 2HE3A 2QC7A 4HU7A 2F51A 3A2VA 1T8EB 1K0AA 4Q5RA 3EWLA 1GTIA 2FA4A 3HY2A 3HJOA 1BAYA 3G9BA 3QAWA 3W8JA 3EE2A 5HFKA 5ABRA 1NSWA 1PD21 4PQ1A 2GVPA 2GZPA 1G0TA 1M2BA 1QXHA 3M9KA 4TKYA 3KCMA 3PGTA 2VCVA 2LV3A 3QAVA 1TTZA 5ECKB 1NHYA 2HZEA 4IVFA 1EEJA 4OWYA 1A8YA 4TW5A 4AJ7A 2KUCA 2N5FA 4GSTA 3C73A 1XCCA 1LU4A 1FVKA 13GSA 1GUKA 3KD0A 1K0NA 3P90A 2O85A 2L4QA 1XW9A 3KP8A 5A4WA 4ZILA 1J0FA 1BX9A 2O89A 3KH9A 1FVJA 1TK8B 4TOPA 2H1GA 3TOUA 2H19A 4JZQA 2H70A 5H5QA 4I2TA 4PX1A 4XRAA 1F6MC 3H79A 3UVHA 1UC7A 1OKTA 4HOJA 2IPAA 3APSA 4N10A 3TJFA 1PSQA 1PN9A 2OADA 3TKRA 11GSA 3LGCA 3E0UA 3VWVA 1XW6A 2JU5A 1XWAA 3ZRDA 3D0ZA 3A5WA 1YY7A 1GP1A 2IFQA 2YJ7A 2L57A 4FYCA 5IMCA 1C72A 4DSRA 1V40A 5ECRB 3QR6A 3RBTA 1VF2A 19GSA 1BQ7A 4K0NA 2FLSA 3BBYA 2IMDA 2JL4A 4Q5FA 1ZOFA 2AAWA 5A4UA 1GRXA 5ID2B 5IO2A 4MJCA 4PUAA 3US3A 4IP6A 4Q5NA 1VRSD 3KMOA 4X43A 1XWCA 4K9ZA 3D5JA 4HEA2 2YWOA 1AC1A 5DQYA 1IYIA 2CV4A 3GSTA 3UVTA 3TOTA 2IMKA 3IR4A 3IPZA 1GSSA 2PVQA 5HR0A 1B8XA 4OD7A 1B9YC 2RUEA 3TKPA 1MEKA 3LYPA 3ZZXA 3RHCA 2B7JA 4HU9A 2DIYA 2PMTA 4QL9A 4V1Ap 2RIIA 1ERVA 5IOXA 3EMXA 3RPNA 1HD2A 1GL8A 2EIOA 4MJAA 1Q4JA 5JCUA 4WF5A 4GQCA 1O85A 1YDKA 1H4OA 3UL3A 3G7YA 5GSTA 2VM1A 2QKEA 2C0FA 4IELA 2L59A 2GQMA 3ZL5A 2YNXA 5DAKA 5B8BA 3I69A 3C8EA 2CZ3A 1UN2A 2RM6A 5DJLA 1XZOA 1GTAA 3TJJA 3L4NA 5J41A 1SKSB 4OO5A 1GNEA 4F2IA 1TOFA 1K3YA 4XS4B 4NV5A 4OFNA 4PUFC 1U88A 3F4TA 3ZVJA 4N30A 4I5QA 3GN3A 3M3MA 4D73B 5IIZA 4HQZA 4DSSB 2XPDA 3IBHA 2WS2A 3GTUA 1XXUA 1Z9HA 4IQAA 14GSA 1DE2A 2HXKA 5DALA 2VD0A 20GSA 3ED3A 4MH3A 1MDJA 2LNTA 3CYNA 4WR4A 3TKQA 4XTSA 2AHEA 1TW9A 4HI7A 3CMIA 2H0GA 2P5RA 4KCEA 1WMJA 4TR1A 3MSZA 4OFTA 2OACA 1OE8A 1WE0A 3F3QA 3GL5A 7GSSA 4KX4A 1EZKA 4KW6A 1SYXA 4EDYA 3VK9A 4EUYA 2EC4A 3EINA 3HCZA 1G7OA 3UAPA 2L6CA 1XIYA 3VI7A 2CVDA 2JZTA 1QUWA 1NM3A 2VCXA 1JZWA 3FEUA 3VPQA 1T4YA 5FHIA 1GULA 4L8EA 3AY8A 4GSNA 1W4VA 1X5DA 2HI7A 2XPEA 5ECLB 4NV2A 2VL9A 4H86A 4K2DA 3GH6A 5D8IA 3UIWA 1X9WB 4K1FA 4TXOB 2Z9SA 4YH2A 5JWQB 4KSOA 4ECIA 3HJMA 2CX3A 2I81A 2VCQA 3KXOA 5KN0A 2J23A 3ZIVA 5G1KA 2A2SA 2VOCA 2KP1A 1X5CA 1YQ1A 1O73A 4LL1B 1USBA 4F82A 1GH2A 2H1DA 3TJGA 1G6YA 2C8UA 2L5LA 3MDKA 2LSTA 5L71A 3VWUA 1MD3A 3J7Yk 1M2DA 3GX8A 3LXTA 5CAXA 4ID0A 2FD3A 4IN0A 1M7TA 3C71A 3WT1A 1Z6NA 3OR5A 2KHPA 1SK1A 2HYXA 3FK8A 3HVXA 1T1VA 6GSXA 2DMLA 4DVCA 3GH9A 1OC9A 2IN3A 3I43A 5JWOB 3DVWA 3FR3A 1KTEA 2OJLA 1TRWA 1SK2A 2PWJA 4EE0A 2GDRA 5ELGA 4KB3A 5J4UA 2RUFA 4PQHA 3W6GA 3GKMA 4HJMA 3O6TA 2FNOA 2CAIA 2EIRA 4MZBA 1YZXA 2JADA 4YAPA 2YPMA 1SD8A 5DVBA 2BMXA 3VWWA 2XHFA 1FHEA 1V2AA 3MAKA 4ZIJA 1K0BA 5J9BA 2F3MA 3P8WA 6GSUA 2PU9C 1XWKA 4ZB6A 3RHBA 4ECCA 4I2UA 1GLQA 1ZGNA 3I9V2 3HZ4A 2DJ3A 2NPBA 3C1RA 4QL7A 2H0IA 1B4PA 4XS1A 2L5OA 3A2WA 3QFAC 5ENUA 1M99A 1WPIA 4ZBDA 2R2JA 2CT6A 5FWGA 4RQXA 3EU3A 3TB2A 3J7Yb 2KP2A 2HRFA 4ACSA 4KNDA 4MABA 2JZSA 2MZCA 3Q19A 1SU9A 4X1UA 4GXZA 1GTUA 1SKWB 4IHUA 1PMTA 1SL1B 5IMVA 2VL3A 4CDOA 1SL0B 4MJEA 1SJ6A 4ECBA 4WBRD 9GSSA 2R6KA 2YWMA 1U3IA 3FR6A 4BWSA 3QCPA 3ZFBA 2IL3A 5CRGA 3VPTA 1V58A 3RAZA 2I3YA 1TI1A 3GKKA 3PINA 1EV9A 4Z7XA 4AJ6A 3UBKA 5G5EA 3HYPA 2E0QA 4KA0A 4BWQA 1DUGA 3ZVJD 3KM6A 1AQVA 2AYTA 5DCHA 4EDZA 5IM9A 2PPTA 3U5RE 5KN3A 4IGJA 5JCGA 4DSQA 4PURA 3TKSA 3DYRA 5JCWA 1QMVA 3IC4A 4GWRA 3GTUB 4HUAA 1TJDA 1EV4A 3CRTA 3TDGA 3BOAA 1F2EA 4GTUA 3WGEA 5B8AA 1OC3A 2K18A 4AGSA 1KBNA 2C4JA 1S3AA 2H01A 2O7KA 2TRCP 3KJYA 4G2EA 3ERGA 2VO4A 1O81A 3CSIA 5D9WA 1ILOA 3EU4A 4MZCA 3WGXA 3F6FA 1YKAA 5DDLA 3O76A 2H72A 3CTGA 3WD6A 3P7XA 3BCKA 1GUHA 4L5LA 1GSUA 1FOVA 3DMLA 3FKFA 3IHQA 1SYRA 2WDUA 2ON5A 1YEPA 2R37A 5AISA 5GAPD 1NW2A 3L78A 2FWHA 2DJ2A 17GSA 2JACA 2IMEA 3A3TA 3EMPA 3D21A 2E2MA 2YWNA 2DJ0A 2H30A 3TKSC 1KEBA 1T4ZA 1ZYQB 3VURA 1ERWA 1TP9A 2DJ1A 2YP6A 1OVNA 2H0HA 2G2QA 3HA9A 5HFGA 3GFKA 1EOGA 1AW9A 1A0FA 2D2ZA 2P31A 4KSMA 2YANA 1V9WA 3D4MA 2KOKA 5B6NA 4MDCA 3L9UA 4IKHA 3TRPA 2X8CA 1DBYA 4O32A 1MTCA 4XHMA 3ZMKA 1S3CA 4XIHA 1THOA 2VCTA 4PNFA 4MLYA 1PRXA 3E3EA 3TJBA 2FY6A 1Z5YE 10GSA 1GWCA 1O7UA 1XOAA 4EL1A 4QQ7A 2EIQA 1TXXA 6GSYA 4J57E 3LYKA 3CXGA 2OA7A 3HHVA 1NHOA 5CRHA 5INYA 3GX0A 5F8BA 1AUCA 2CVKA 4IP1A 1ERUA 2YOIA 3GMFA 2WGRA 3QFBC 5DBQA 5IPGA 3TUEA 2LJKA 1GTBA 6GSVA 4YAVA 4RQRA 3QAGA 2H6ZA 3TJKA 5D93A 2H66A 4RI7A 1A2JA 2R3XA 4KAEA 1PGTA 1PKZA 3TKSE 4POMA 5KN2A 3K8NA 2L4CA 2GLRA 1WRYA 5CRWA 3UBLA 3F4RA 2O8VB 1GSYA 1KNGA 3G7JA 4ISDA 2V2GA 1X5EA 2MMOA 1RK4A 1QFNA 2X99A 1WIKA 3V1WA 5HQPA 1B48A 5COHA 3ME8A 1XOBA 5KN1A 4JEDA 2V41A 1T3BA 2GQLA 2XBQA 2IWTA 5J9CA 2E7PA 2LTKA 4G10A 3I6AA 2F9SA 2MMNA 3F0IA 4WKWA 5A4VA 2B5YA 2B1LA 4K7NA 2V6OA 5LNKe 3CRUA 3LEFA 3GKXA 3CSHA 3FY7A 4HDEA 3HZ8A 3EYTA 4OCFA 4ZBBA 4N11A 3FYGA 2ZCTA 2B6MA 3N9JA 1AIUA 3F63A 2OBIA 2WB9A 2LRTA 3WT2A 1E2YA 3E9JB 3GYKA 1O8XA 1ACVA 3ZYWA 4XCSA 2C0EA 1B4QA 1PKWA 3MNGA 1VGLA 4PQIA 3GIXA 4MA9A 2OE0A 4BVYA 5D73A 5F07A 1OKDA 3DXBA 1E6BA 2PVOC 3EVIA 4MH2A 5AIVA 3KEBA 3VFIA 2AV4A 3KMNA 4JRRA 2C0DA 4KCAA 5IPHA 5KEJA 1T00A 2R4VA 4KH7A 2WCIA 4LLRA 1M9BA 1TU8A 3UMAA 1EEMA 2HLSA 1N8JA 3ZFLA 2VCZA 5CRDA 2LEGA 4F9ZA 5HR2A 4ZL8A 3WGDA 1M0UA 3HVVA 2JSYA 2N5AA 2HNLA 2HZEB 4WBJA 2FHEA 1CQHA 1RQMA 5CREA 2OE3A 4EC0A 1JLWA 1W89A 4POLA 2PUKC 1GSEA 2E2GA 2VLUA 2WRTA 2C3TA 2AB6A 1U87A 2B3SA 2QGVA 3GV1A 4KE3A 5JWRB 4KDYA 1PX6A 2C3QA 2G0FA 4RI6A 2N5BA 1JHBA 4BVXA 3D22A 5CYYA 3IAS2 4XS6A 4V2MA 2GS3A 2AJQB 2IMFA 3QOUA 1EP7A 3MWHA 3UJ1A 2REMA 1GLPA 5G5FA 1K0DA 1XVQA 1QK8A 5B6MA 4V2NA 3KP9A 5ID2A 1HYUA 1TRSA 1GSFA 3HD5A 5DQSA 5ECQB 2I1UA 5IMZA 3LSZA 1J9BA 4MF5A 4ZL7A 4BA7A 5D9VA 4FIWA 2BJXA 1SL2B 4EO3A 1A24A 2NDOA 3ERFA 4E8EA 2IFQB 1XFLA 3QDNA 2DMMA 1U3AA 2X64A 1M9AA 2C1YA 1XW5A 1DSBA 3F9UA 2LNSA 1SENA 3KZQA 3HVSA 2H8LA 2B1KA 3RDWA 4NMUA 3UOMA 4G9HA 4N0VA 2O87A 1OC8A 1HNAA 5EVOA 3NOFA 1S3DA 2H1AA 4F0CA 4WEYA 4GF0A 2LQOA 1F3AA 4N0ZA 3KGKA 6GSTA 2RM5A 3NIVA 2GSTA 2WULA 4IW9A 2H71A 3GHAA 3TCOA 3L0HA 3LG6A 1K3LA 2FWEA 2LJAA 3ME7A 3VI5A 2MBSA 4TRXA 4XS4A 4L0WA 3HKRA 2V1MA 2GGTA 4MK3A 2GZZA 3IK7A 2I4AA 3Q6OA 4TXVA 5E4WA 2JZRA 2H75A 2MMAA 4D73A 4DSSA 2NVLA 4KDXA 2PN8A 4MMMA 2KLXA 2DC5A 3GKNA 3DIEA 4K6XA 1EOHA 1YF0A 22GSA 1HQOA 3M0FA 2IIYA 1EWXA 3M1GA 5ECIB 5D96A 2WJUA 1VF3A 5DAKB 1AXDA 4G19A 2M46A 3GL3A 1ST9A 1HNCA 4JE1A 5ECNB 3DRNA 4OFMA 3CSJA 3C7MA 5CNWA 1Z7PA 3IAM2 5C00A 3GSSA 5F0GA 2ZUPA 1XPVA 3M9JA 1J08A 12GSA 4FYBA 4LA1A 5D9TA 5AGYA 4V1Ag 2RLIA 1PQNA 1UVZA 2M72A 2OBKA 1U6TA 4IJ3A 4EF0A 4ZB9A 1N2AA 4WR5A 3FHKA 5ECHB 5DALB 3IOSA 3S9FA 1WP0A 2LQQA 1AQXA 1F9MA 1TK0B 3G7IA 2BTOT 4L0UA 2FUG2 5F05A 2V6KA 3VLNA 5C04A 4TN8A 4WF4A 4F03A 4TR4A 2GT5A 1JZOA 3H93A 5HR1A 3DWVA 5LD0A 2XC2A 3BCIA 4O7HA 1A8LA 2DBCA 1G7EA 2CZ2A 1WOUA 1AQWA 3H1NA 4TXOA 18GSA 1OE7A 4CW9A 1OYJA 4FO5A 3FR9A 5LCZA 2LRCA 3FRCA 3EURA 3GUSA 2VL2C 2I9HA 4TR1B 1AAZA 5H5RA 4NAXA 3GA4A 3SWLA 3Q74A 2TRXA 4YQMA 3KTLA 2FGXA 4YQUA 4NXIA 1TI3A 5FT3A 3LXZA 5E59A 4HZ4A 4V2LA 1TRVA 2GSSA 1XWBA 5IMDA 5IOWA 1TRUA 2PBJA 2K8SA 2X8GA 4NPBA 2M80A 2A4VA 4XRDA 4PGTA 1TDIA 1THXA 3LORA 1SK0A 2GZYA 2YN1A 3PH9A 2MMZA 4YQVA 1R5AA 1TU7A 5CO3A 4OMVA 2NTOA 4ML6A 3HDCA 4TR0A 2VUPA 5CP1A 1YKCA 4POKA 1ZYEA 2H76A 2P5QA 3FZ5A 3W8SA 3UEMA 3APQA 5HR3A 1EP8A 2QSIA 1MDKA 4ULXA 3IA1A 8GSSA 3DGQA 1HNBA 4GQFA 4I8BA 1LBKA 4AF2A 5IQYA 4MPGA 3IV4A 3BD2A 2DJJA 1ML6A 5AIXA 1WWJA 2A2RA 4E8HA 4NHZA 1SD9A 2B5EA 1QQ2A 4MF7A 2AUVA 3HJPA 1CQGA 2VM2A 5G1LA 4I97A 2HSYA 4HQSA 1TKDB 4F0BA 1VF4A 2HT9A 1MDIA 2CVBA 2YWIA 1T7PB 1PX7A 2ON7A 3GNJA 3FZ9A 4ZXGA 2JSZA 4KGIA 4GRFA 3KTBA 3DEXA 1GUMA 4NWYA 1BEDA 5IMFA 2WZ9A 1OC9B 3F6DA 3P2AA 3TRQA 2J9HA 5GZZB 4LMVA 5D9XA 4ILFA 1X0RA 2LS5A 5ECSA 1IYHA 5DJMA 1WJKA 1F37A 1ZMAA 5AN1A 3ZREA 2L6DA 4OO4A 5GAND 4JR4A 1FG4A 3L9SA 4OCEA 2X8HA 1ZCPA 1K0OA 4ZBAA 2GQKA 4L5OA 4IQ1A 4J56E 4PNGA 2FA8A 4X0XA 4EKZA 3ZMLA 2C80A 3ISOA 3LWAA 1F3BA 5DCGA 5ECMB 4DEJA 4JBBA 1Z3EA 2B5XA 4EVMA 2DJKA 1K0CA 2ALBA 4K7IA 3SBCA 4PXOA 3WYWA 2CX4A 3ZITA 4GCIA 4MZWA 5GSSA 6GSWA 3H4KA 3IDVA 5EL8A 3BJ5A 1ERTA 1R5PA 1ZZYA 2K8VA 1PA3A 2OE1A 1JLVA 1Z7RA 2H6YA 4O92A 3TRXA 2C3NA 2LKUA 4FH8A 2FCHA 3D4TA 3U6VA 1R7HA 3ERWA 2PERA 3CTFA 1Z6MA 1FAAA 2H73A 4LMWA 4KUNA 1FO5A 3JCML 5A5KA 3F3RA 5EY6A 5B7CA 4LL4B 1YEXA 1XBSA 2VAFA 1R4WA 1R26A 3LJRA 2LJRA 3H8QA 3D6IA 4JU5A 1SJZA 2LRNA 3RPPA 2YCDA 4CHSA 4I6XA 3R2QA 1Y25A 2K9FA 1XVWA 2YV7A 2CAQA 6GSSA 1I5GA 2DLXA 1SKRB 1FW1A 3APOA 1V57A 1ON4A 4K7OA 2YZUA 1EGRA 1B9XC 3IE3A 1URMA 2IJYA 4GSSA 2HFDA 3C1SA 4GLTA 1BG5A 4ZL9A 4FYUA 3GRXA 4ZB8A 4WXTA 4ECJA 2C0GA 3F8UA 4J2FA 1QGVA 2MYGA 1PL2A 2GSRA 5HFIA 3IRAA 1LJRA 4HZ2A 3LQ7A 4AJ8A 3KIJA 1O8WA 3LFLA 2HZFA 3IK9A 4O5RA 4MCUA 2FWFA 2MBTA 5ECPB 2FWGA 2GT6A 3PR8A 1BJXA 4TR3A 1M2AA 2HRNA 1OAZA 2VLVA 3A2XA 3GURA 2H74A 2GSQA 3N5OA 5IO0A 5J3RA 3QPMA 4WETA 1G6WA 3O3TA 2NBSA 1MD4A 2VD1A 1H75A 5G31A 1FB6A 5ELAA 2HSHA 3QMXA 1XWGA 1K0MA 2VIMA 2XBIA 3L9VA 3UARA 5IMAA 1I9DA 1Y6EA 1GSDA 5G2ZA 1JFUA 4POBA 1JZRA 1ABAA 5ECOB 2DSAA 2V32A 5J5NA 3F4SA 2YJHA 1EGOA 3DD3A 4HJ2A 4IBPA 1UA5A 1V98A 2DIZA 2LUSA 4K8MA 3FZAA 1A0RP 2YV9A 16GSA 2F8FA 2TIRA 3KH7A 4RUVA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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