3PINA

Crystal structure of mxr1 from saccharomyces cerevisiae in complex with trx2
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
104
structure length
104
Chain Sequence
MVTQLKSASEYDSALASGDKLVVVDFFATWCGPSKMIAPMIEKFAEQYSDAAFYKLDVDEVSDVAQKAEVSSMPTLIFYKGGKEVTRVVGANPAAIKQAIASNV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Electron transport/oxidoreductase
source organism Saccharomyces cerevisiae
publication title Structural plasticity of the thioredoxin recognition site of yeast methionine S-sulfoxide reductase Mxr1
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin-2
total genus 33
structure length 104
sequence length 104
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3pinA00
1MDKA 2LRCA 1KTEA 2HZEB 3A3TA 5CRDA 2XPDA 3Q74A 2PGTA 3KP8A 4V2LA 4EUYA 5KN0A 1SD9A 2YANA 1ON4A 4FYUA 5ECRB 2MMAA 1ZGNA 2L6DA 4ZB6A 3QAWA 2HI7A 2QC7A 2V6KA 1SK1A 3FZAA 4X0XA 1HYUA 4JR6A 5IMVA 3KTLA 4HDEA 1PQNA 3TKQA 4N11A 1O6JA 2YZHA 3GURA 1ABAA 1QQ2A 3I69A 1TTZA 1H75A 1OVNA 2PU9C 4BPYA 1RK4A 5CAXA 5IOWA 3KCMA 3EMXA 3VWXA 1AQXA 1FHEA 4PQHA 2LEGA 4GQFA 2B7JA 5KN1A 4EVMA 5IQYA 2KOKA 2FWHA 1SJ6A 1U3IA 4POBA 1AW9A 1MDJA 4OMVA 1ML6A 2YN1A 3IHQA 3MDKA 1XOBA 4MDCA 5J4UA 4GSNA 4IP1A 1YF0A 2V6OA 1M99A 5ABRA 1R7HA 2PBJA 1KBNA 1B48A 2VCTA 4WR4A 1OC9A 3C73A 4XS6A 4LMWA 1O85A 4JU5A 1AXDA 1MD4A 2L5OA 1G0TA 4MF7A 4WF4A 1KNGA 2CAIA 1FOVA 2C80A 5CRHA 1TJDA 4ZXGA 1GULA 4WXTA 3GMFA 1TP9A 1AQVA 1SKWB 4KDXA 2F51A 5F0GA 3ZYWA 4MJAA 5B7CA 1M2DA 4ZB8A 2LS5A 2EIQA 2L6CA 2IFQA 2FY6A 2H76A 2LQOA 4XHMA 1FB0A 2GS3A 2LNTA 2LKUA 5FHIA 4EL1A 2YJHA 3GYKA 2RM6A 3L9UA 4MZWA 3HKRA 3VPQA 3TRXA 2X8GA 4TW5A 5G31A 3ZFLA 4F0CA 4FYBA 2DMLA 3NZNA 1Y25A 1T4YA 5CRWA 1GH2A 2V2GA 4AGSA 4HS1A 1R26A 5KN2A 4K8MA 1K0AA 2DJJA 4XS1A 3DRNA 4JRRA 2Z9SA 5G5EA 2O8VB 2MMZA 3CSHA 4XIHA 3CRTA 3RPPA 5G1LA 5D73A 4IW9A 3GSSA 5GZZB 3ZIVA 5EPFA 3GFKA 2ZUPA 3FEUA 3FR3A 1THXA 2GGTA 3GTUB 2IMEA 1OYJA 1XZOA 3QAVA 3SBCA 2GDRA 4GTUA 2OBKA 2PUKC 2HSYA 4MABA 3HVXA 1ILOA 1PRXA 1GL8A 3WGXA 1G6WA 2NTOA 3FZ4A 3P8WA 4GRFA 2XC2A 2DJ0A 4RQXA 2GVPA 2L57A 5IO2A 14GSA 1TW9A 4MJBA 2A4VA 2YJ7A 3ME8A 2GSQA 4ISDA 1XWGA 5E59A 2FLSA 1X5DA 3FZ9A 17GSA 2GZPA 3KTBA 1M7TA 2CX4A 1FAAA 2GT5A 2LJRA 2VL3A 1WRYA 3US3A 3HZ8A 4IKHA 1QGVA 1XOAA 3DVXA 3KP9A 1TRVA 2CT6A 2M72A 1LU4A 5LD0A 3UARA 4ZB9A 1E6BA 3IK7A 3NIVA 3QOUA 2FCHA 3DYRA 2BMXA 3L0HA 4PXOA 1GUMA 1EV4A 4NV5A 1Q4JA 4K7IA 2JU5A 4I2TA 1K0CA 1U3AA 2ES7A 2H19A 2FGXA 3LJRA 3F9UA 2RUFA 1HQOA 4J2FA 4QL9A 5DQYA 5D93A 1EEMA 3QAGA 2NBSA 3MAKA 1LBKA 2QSIA 4XCSA 6GSUA 5B6NA 1VF4A 1W4VA 2NDOA 1F3BA 2MMNA 2JL4A 2H71A 2GQLA 4L8EA 3TKSC 3F0IA 1PD21 2REMA 4Q5QA 4MPGA 4MLYA 5HR1A 4F0BA 1GSUA 2EIOA 3VPTA 3BD2A 5J5NA 1J9BA 2H6ZA 3LWAA 1DE1A 5DAKA 4POMA 4DSSB 4N0ZA 1M0UA 4HU9A 2FD3A 3C1SA 2VLUA 3D22A 4TXOB 4TRXA 2G2QA 2HE3A 1UN2A 5D9VA 3EU4A 3TGZA 2K18A 4F9ZA 5CO3A 3GSTA 3QDNA 3VURA 1QXHA 3F3RA 4G10A 4KUNA 2PPTA 3G7YA 2D2ZA 4HJMA 5HQPA 5J41A 2I1UA 1YDKA 4K6XA 3F3QA 4XRAA 3ZL5A 3H4KA 1XVQA 1SU9A 1DUGA 5KEJA 1E2YA 3KH9A 4IGJA 4GSSA 2JZRA 4KX4A 2FA4A 2FUG2 3Q18A 2GQKA 2B6MA 3MSZA 3H79A 4L5LA 1WIKA 4BL7A 4BVYA 2R6KA 4TKYA 5DCHA 2VD0A 3IK9A 4BVXA 1AIUA 5D9TA 2LQQA 4YH2A 2K9FA 3WYWA 1M9BA 3S9FA 3IA1A 2RLIA 2O87A 3HZ4A 4D73B 2GLRA 1ZL9A 1UC7A 3FY7A 1WE0A 3IV4A 2B1KA 3WT1A 1EGOA 3LEFA 3F8UA 1K0OA 3RPNA 5EL8A 2CZ2A 3CMIA 1NSWA 4V2MA 3P7XA 2AHEA 5B8AA 1K0MA 5D96A 5JCWA 3C71A 3O76A 4KE3A 4EE0A 1XWAA 1SKSB 2QKEA 1XBSA 3LFLA 3KJYA 4F2IA 1XXUA 2E7PA 1ZMAA 1A2LA 1MEKA 4V1Ap 2AYTA 5B6MA 2E2MA 4FO5A 1CQHA 2FHEA 5A4VA 5F06A 4MF5A 3TOUA 4WEYA 1V98A 3HCZA 4K7NA 6GSSA 3EWLA 4ZILA 5DALB 4OO4A 4NWYA 1ERWA 4IELA 1GWCA 2H74A 5G2ZA 4I8BA 3E9JB 3UEMA 4JE1A 1YQ1A 3C1RA 2VCXA 3LORA 4PURA 3IC4A 1ST9A 2FWFA 3ZVJD 2XBQA 2FA8A 2VCQA 5JWOB 3GKXA 4N0VA 3L78A 3UMAA 3ZMKA 2C0EA 1F9MA 5IPHA 5ECMB 2R2JA 4KA0A 2JSZA 4BWSA 1ERTA 2X64A 3GHAA 3BJ5A 3WGDA 4J57E 5FT3A 1JZWA 3FZ5A 4NHZA 4NMUA 4XS4A 1FO5A 1WP0A 3IE3A 4AJ7A 3ERWA 2HNLA 2GZYA 3FKFA 3F63A 2KUCA 5L71A 5EY6A 4HJ2A 4MZBA 3IXRA 4ECJA 3DMLA 1HNCA 1R4WA 2OA7A 3PR8A 3TJFA 1MD3A 4LLRA 5IM9A 2K8VA 4TR1A 3ERGA 3EC3A 1TK5B 5G1KA 2A2SA 1PN9A 2KP2A 3LXTA 2PMTA 4ECCA 2YCDA 1RQMA 3EVIA 2C3QA 3WGEA 1AQWA 2IMFA 5H5RA 4V2NA 5CP1A 5IPGA 1OE7A 3KEBA 5DQSA 2X99A 1B9XC 3KMNA 4OD7A 3EMPA 4LMVA 5GAPD 3A2WA 3VWVA 4EKZA 1V40A 2C8UA 4GLTA 4NAXA 3APSA 1T00A 5IMZA 4ILFA 4ZIJA 5COHA 1I9DA 1ZYEA 2YWMA 2R37A 4JEDA 3ZRDA 3DIEA 5HFIA 1BG5A 2H73A 2C3TA 5ECNB 1ERUA 1ERVA 2YP6A 2L5LA 2PERA 2VL2C 1GSEA 2NPBA 3P2AA 3CTFA 5HFKA 1F37A 3GA4A 4TN8A 3ZVJA 3DVWA 3DKSA 1TK0B 2RUEA 4I97A 5ELAA 1VF1A 2LJAA 4O92A 3ZREA 2B7KA 2B5XA 3F6DA 1BQ7A 4IJ3A 3GL3A 1T8EB 3VLNA 1F6MC 3O3TA 4TR3A 4K9ZA 2H70A 4G19A 1OE8A 1XWKA 2IFQB 3D21A 3GH9A 1XW9A 3IDVA 1PKZA 4G9HA 4EDZA 3MWHA 3DD3A 5G30A 5AISA 3V1WA 1M2BA 3DEXA 3GX0A 3LQ7A 1VF2A 2CA8A 2DIZA 2B5EA 2PVOC 3HD5A 2V32A 1Z6NA 3PH9A 2O7KA 2V41A 3F6FA 6GSTA 5DVBA 2H1BA 2I9HA 2OBIA 1T4ZA 3BBYA 4K0NA 2WJUA 1EP7A 4K1FA 4AJ6A 3CBUA 3ZFBA 1SL2B 4PNGA 1K0BA 3GN3A 2H6YA 4CDOA 1X9MB 4POLA 3A2XA 1Z9HA 1U87A 5HR2A 4G2EA 1S3AA 5A5KA 4IN0A 3M9KA 2VM2A 5KN3A 4ZBAA 1Z7PA 4FYCA 1GSFA 2JACA 3LYPA 4NPBA 4MMMA 3A2VA 5IMFA 1YEPA 2O89A 3GIXA 1TI1A 3IR4A 4ML1A 3LSZA 4HQSA 2VM1A 2YWOA 4PUFC 4QQ7A 4IQAA 16GSA 3OR5A 3CXGA 2DJ1A 4ZL9A 2H1AA 5JWRB 2WDUA 4PNFA 3KM6A 3RDWA 5CREA 1YF1A 3D4MA 1M2AA 2IMDA 4PUAA 3KH7A 3TRQA 2KP1A 3GRXA 2WS2A 4IS0A 3IPZA 1H4OA 1S3CA 1XIYA 1CQGA 1WWJA 1JFUA 1TI3A 3KXOA 8GSSA 1GUHA 3TOTA 1DSBA 4KGIA 4Q5NA 1KEBA 1HD2A 4POKA 1FVKA 1TDIA 2CV4A 1THOA 5HR3A 1OC8A 3BOAA 10GSA 3RBTA 1DE2A 1VRSD 3PINA 4GSTA 1F3AA 3E3EA 2J23A 2H66A 1WJKA 2DSAA 4MH2A 3EYTA 3F4SA 1X5EA 2TRXA 2TRCP 5A4WA 2F9SA 1GTBA 2QGVA 3FK8A 2FWGA 1TK8B 1WPIA 3TKSA 4KSOA 2VCVA 3ISOA 11GSA 2AJQB 1GP1A 1WOUA 1NM3A 1USBA 3LXZA 4MP4A 4ACSA 4TXVA 5AGYA 4EC0A 2XHFA 3HJPA 3LGCA 2C1YA 5ECIB 2I3YA 2LV3A 1YY7A 4O32A 1MTCA 4ULXA 2VL9A 4MJEA 5DDLA 5ECPB 3EE2A 1M9AA 4YAPA 4K0GA 3DXBA 1O7UA 3EU3A 1XCCA 1U6TA 5H5QA 2HFDA 3TB2A 3IAM2 13GSA 1ZCPA 2VLTA 2JZSA 4RI6A 3M3MA 2GSTA 4HQZA 3TJJA 1B8XA 4RQRA 5DAKB 4ZL7A 4OWYA 5IMAA 3KZQA 2DJ2A 19GSA 1FW1A 4KB3A 2OJLA 2E2GA 1SYRA 3FRCA 2R3XA 4H86A 3CSIA 3GL5A 2P5QA 4IVFA 3ERFA 4IP6A 1TXXA 3NOFA 4NV2A 3H93A 1Z6MA 3J7Yk 3UIWA 4TVEA 2MZCA 3TJGA 2YWIA 5J9BA 4GQCA 2N5FA 4WBJA 3J7Yb 2C0GA 3TKSE 3GV1A 1HNAA 3I43A 2J9HA 1T7PB 1VGLA 2H75A 4JBBA 1GLQA 3RAZA 2DMMA 1J0FA 4GWRA 3UBKA 4DSQA 4LA1A 2JSYA 3KMOA 1GNEA 4IBPA 4MJCA 2X8CA 3KIJA 1XVWA 2P5RA 5DCGA 1ZZYA 2IMIA 5G5FA 5ID2A 2CVDA 2OACA 2DBCA 1V58A 1K3LA 1NHOA 2CZ3A 2VIMA 1GRXA 4I5QA 1GUKA 3C8EA 3FYGA 1BYEA 1EGRA 2MYGA 3TJKA 2H30A 1SL0B 1O8XA 4RI7A 1ZYQB 1G7OA 1BEDA 4KH7A 4ECBA 3QMXA 1TRSA 2RM5A 1PSQA 5DALA 1AUCA 2VUPA 1TRWA 1QMVA 2WULA 1TU7A 3ZMLA 1GSSA 3HA9A 4IHUA 2LSTA 4DVCA 4OCFA 2JADA 2PN8A 1Y6EA 1QK8A 2YV7A 3UOMA 3IAS2 2YWNA 2H72A 4I6XA 3ED3A 3FW2A 4Z7XA 3E0UA 6GSXA 1F2EA 3ZTLA 1GTIA 3L9SA 2OKAA 1A24A 2F3MA 4DEJA 4CW9A 4BWQA 3ME7A 5ENUA 2O85A 1JLWA 1T3BA 1OKTA 2B1LA 4X43A 3CSJA 4IQ1A 4HU7A 2HZEA 1B4QA 5JCGA 1PX7A 4CHSA 3LG6A 1GSYA 1Z3EA 3D0ZA 5F8BA 2L4QA 3ZLPA 2F8FA 5C04A 1PX6A 2H6XA 3I6AA 3M9JA 1G7EA 2OE3A 3G7IA 22GSA 2ZCTA 5F05A 5ECHB 1XWCA 5LCZA 1EEJA 1XWBA 3GH6A 4XS4B 2TIRA 1PA3A 2C0FA 1DBYA 1U88A 1GNWA 2VOCA 2HXKA 4YAVA 2IMKA 3HJOA 4PX1A 3D6IA 7GSSA 2IPAA 3UVTA 4X1UA 3O6TA 1GTAA 3AY8A 1FG4A 3TKRA 1N8JA 2C0DA 1C72A 3C7MA 1SJZA 2ALBA 3TUEA 4TR1B 1K0NA 3HY2A 3TKPA 2VO4A 3BCIA 1ACVA 1X9WB 2YZUA 1EWXA 2BJXA 1GLPA 5JCUA 1V57A 4L0WA 3LYKA 5J3RA 4KSMA 2HYXA 5ECOB 2VD1A 4RUVA 2K6VA 5ECLB 2VAFA 1JZDA 4KDYA 3L9VA 1TKDB 2CX3A 1GTUA 2LJKA 2N5BA 2KLXA 1JZRA 2DJ3A 5GSTA 3VFIA 9GSSA 4YQVA 2GSSA 2YPMA 1J08A 3M0FA 4V1Ag 3VWWA 3CYNA 2GZZA 2VL2A 4J56E 5ECQB 1JHBA 3GX8A 4BA7A 2L4CA 2HLSA 1FVJA 1B4PA 2IWTA 2KHPA 1OC9B 1NW2A 4KCEA 2H0GA 2OE1A 3A5WA 4P3YB 4ECIA 4WETA 4GXZA 2R4VA 4YQMA 3KGKA 3WD6A 5EVOA 2MBSA 3WT2A 1PL1A 1SJIA 2GTUA 18GSA 4O7HA 3TRPA 3BCKA 3Q19A 3UJ1A 1AC1A 4EXJA 4HOJA 6GSWA 3HVSA 2LRTA 2H0IA 2EC4A 1JLVA 3UVHA 1IYIA 4MPFA 5DBQA 4WF5A 4Q5FA 4MH3A 1K0DA 1N2AA 1OC3A 5FWGA 1YKAA 2DLXA 2VLVA 1XW6A 3F4RA 4I2UA 5IO0A 3JCML 2CAQA 3HHVA 4KNDA 3EURA 3DGQA 1EZKA 5GSSA 1SD8A 4LL1B 2RIIA 1HNBA 4F03A 4XRDA 3APQA 5HFGA 3KD0A 5CNWA 1ZOFA 2EIRA 2M46A 3IRAA 1A8LA 3GTUA 2HRFA 5F07A 4QL7A 3MNGA 2OE0A 5B8BA 1A0FA 2PVQA 1A0RP 2HRNA 4OFMA 2YV9A 4IJIA 3W8SA 3VK9A 2CVKA 4KCAA 4HEA2 1A23A 4K7OA 4HZ2A 2G0FA 3HYPA 1B9YC 3U5RE 1XW5A 2AAWA 3U6VA 4MK3A 1Z5YE 2C3NA 2H1GA 1SYXA 3HXSA 3R2QA 4K2DA 1RW1A 3QPMA 1IYHA 3K8NA 12GSA 1MDIA 1A2MA 3GKNA 4OCEA 3QD9A 2E0QA 1UA5A 1SK2A 4DSRA 1O73A 4O5RA 1URMA 4MCUA 5AIVA 4PGTA 4F82A 1YKCA 1S3DA 1TRUA 5IMCA 3TJBA 1TOFA 3QCPA 2JZTA 1PGTA 3ZZXA 3FHKA 3CTGA 2C4JA 5INYA 4YQUA 2GSRA 2HZFA 5AIXA 1O81A 2ON7A 1R5AA 1K3OA 4Q5RA 3DWVA 2WRTA 5CYYA 5A4UA 4WKWA 1PMTA 5ECSA 3M1GA 2NVLA 3I9V2 2HT9A 20GSA 1EP8A 5E4WA 2MBTA 1BX9A 1A2JA 5HR0A 6GSYA 3VI5A 4MF6A 5LNKe 2LTKA 3EINA 4WR5A 2CQ9A 2CVBA 1OAZA 3W8JA 1GSDA 4GF0A 1A8YA 5ECKB 2H8LA 4JR4A 2F8AA 3H8QA 3RHBA 1YEXA 5CRGA 2IIYA 4DSSA 1SKRB 1O8WA 2MMOA 4OFNA 1R5PA 2L59A 3GNJA 2FNOA 4TXOA 2WFCA 2ON5A 4LL4B 4N10A 2M80A 2AUVA 3ZITA 3H1NA 3TDGA 4NHWA 1AAZA 3RHCA 3GKMA 1V2AA 1VF3A 3Q6OA 2IJYA 2B3SA 1Z7RA 4KDUA 4N30A 1PL2A 3FR9A 4TR4A 3VWUA 4FIWA 1WMJA 2GQMA 4MZCA 3L4NA 1FB6A 1YJ6A 1TU8A 2P0GA 2IN3A 3PGTA 2VCZA 2DIYA 3M8NA 2WB9A 4GCIA 5J9CA 1SENA 1SL1B 2BTOT 4ID0A 2WGRA 2VCWA 3UBLA 5DJLA 1BJXA 1T1VA 4FH8A 5D9XA 4MA9A 1EOHA 3QR6A 2H1DA 4EO3A 1K3YA 2AB6A 1EV9A 2FWEA 2X8HA 2XBIA 1W89A 2N5AA 3HJMA 3UAPA 4E8EA 1V9WA 2R5GA 4OFTA 2P31A 2WZ9A 4D73A 3D5JA 3HVVA 1OKDA 4AJ8A 4JZQA 1QUWA 5D9WA 3P90A 1UVZA 4HZ4A 4ZBBA 1X0RA 3G7JA 5IOXA 2LUSA 1EOGA 1LJRA 2WCIA 1JZOA 3GUSA 2HSHA 3HDCA 3QFBC 1XPVA 2PWJA 4KW6A 5C00A 3N9JA 2H01A 2A2RA 2XPEA 4AF2A 4L5OA 5DJMA 3ZIJA 5ID2B 5GAND 2OADA 4ZL8A 4OO5A 4HI7A 4PQIA 1XFLA 2B5YA 4PQ1A 1GSQA 4TR0A 4XTSA 3D4TA 1I5GA 2AV4A 3F4TA 4KAEA 3G9BA 3SWLA 2DC5A 2I4AA 2GT6A 5ELGA 4ML6A 3QFAC 2V1MA 4TOPA 2YOIA 4E8HA 1YZXA 3N5OA 3APOA 3UL3A 2H0HA 2DJKA 4ZBDA 2LRNA 2YNXA 3IOSA 3TCOA 6GSVA 3VI7A 1QFNA 1X5CA 1NHYA 1BAYA 4WBRD 3GKKA 1G6YA 1X9SB 5D8IA 1PKWA 4EF0A 5IIZA 3W6GA 4HUAA 5JWQB 2LNSA 5AN1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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