3PINA

Crystal structure of mxr1 from saccharomyces cerevisiae in complex with trx2
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
104
structure length
104
Chain Sequence
MVTQLKSASEYDSALASGDKLVVVDFFATWCGPSKMIAPMIEKFAEQYSDAAFYKLDVDEVSDVAQKAEVSSMPTLIFYKGGKEVTRVVGANPAAIKQAIASNV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Electron transport/oxidoreductase
molecule keywords Thioredoxin-2
publication title Structural plasticity of the thioredoxin recognition site of yeast methionine S-sulfoxide reductase Mxr1
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 33
structure length 104
sequence length 104
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3pinA00
3GRXA 2CZ2A 1ACVA 2YOIA 2GT5A 2HE3A 3KMOA 2VUPA 2I81A 3HA9A 1FG4A 2FNOA 1PKWA 5INYA 1EGOA 1ERUA 4BVYA 1Z5YE 5IPGA 4HU9A 4EDYA 3UBLA 2LEGA 5F8BA 2F8AA 2M46A 2R5GA 2JU5A 4BL7A 3A5WA 1GLQA 2JADA 1OVNA 2QC7A 3KZQA 3LXZA 3EYTA 4LLRA 4Q5FA 4I6XA 4PNFA 3R2QA 3K8NA 2HXKA 4NWYA 1ZYQB 1ERTA 3CRUA 2L59A 4Q5QA 4NV2A 3VURA 5EPFA 3GH6A 5ELGA 2B5EA 2GGTA 4ECBA 5AIXA 4HZ2A 2R4VA 3DRNA 1M2AA 1NM3A 1TXXA 1PD21 1PN9A 1UC7A 1MTCA 4XTSA 1R4WA 1K3YA 1AC1A 1OKTA 4KGIA 4LL4B 3A2WA 3HVVA 3UJ1A 1B9YC 4ECCA 1PL2A 1O7UA 3SBCA 5ECSA 2E7PA 4X43A 2ZUPA 1YF1A 3C71A 4O7HA 3FKFA 1M99A 3UBKA 3KMNA 4HOJA 5DJLA 1M2BA 2F9SA 3APQA 3IR4A 4NPBA 4ILFA 3QFBC 3KCMA 3RHCA 3KIJA 4TOPA 1X5DA 2CAIA 5IIZA 2KOKA 1YKAA 2IMKA 5B8BA 4GCIA 5KEJA 2F3MA 2I4AA 4MF7A 3DGQA 2CX3A 4CDOA 2YJHA 1EGRA 4MABA 2JZSA 4POBA 2MBTA 3KH7A 1W89A 2H0GA 5DCHA 3UVTA 2DIZA 3GH9A 1HNAA 1TOFA 4I5QA 2KLXA 2RUFA 2H01A 2YZHA 1JHBA 5CAXA 2C0EA 2N5BA 4MJBA 4N30A 1WMJA 4OCEA 1SK2A 1SKSB 1V57A 4IP6A 5A4WA 3KJYA 4EVMA 1U3IA 4F0CA 2YWIA 3L9SA 5DBQA 4MF5A 3TB2A 4ZILA 1XOBA 2EIQA 2YN1A 3LYKA 3QFAC 1OE8A 1PKZA 4POMA 4NHZA 3G7IA 5IOWA 5B6MA 3CRTA 5D8IA 4AF2A 10GSA 3UMAA 5KN2A 6GSSA 3GFKA 5HR1A 1FVKA 2V2GA 4DSSB 5IMFA 1F3BA 3ME7A 3E0UA 3IA1A 1QGVA 4FH8A 5EVOA 1X9SB 4O5RA 2JSZA 1SU9A 3EMXA 2VCZA 1WRYA 3HDCA 2L5OA 1T7PB 2PERA 1A8YA 4OFNA 2XHFA 1K3OA 3ZL5A 1H4OA 2WULA 2AV4A 4OMVA 4GSTA 3WT2A 5ENUA 2VL9A 1S3AA 2JZRA 2FD3A 4YQVA 5B6NA 1U87A 5H5RA 5G5FA 1GRXA 2EIRA 3ZITA 5D96A 3US3A 5ABRA 1B4QA 3BD2A 5ECOB 4ACSA 3UL3A 2ZNMA 4HJMA 1HD2A 3GKKA 4TXOB 1XW9A 4GSSA 2OKAA 3W8JA 1RQMA 1TDIA 2O7KA 5DAKA 1K0OA 3O3TA 3NOFA 2V1MA 3RDWA 4YQMA 2IPAA 2E0QA 3WT1A 1SKRB 1E6BA 3C73A 4ZBDA 5G1KA 1GWCA 1R5PA 4HS1A 2A2RA 5J3RA 2R2JA 4L5LA 2PBJA 1ML6A 2GS3A 2K8VA 2HSHA 4HQSA 3LYPA 3FZ5A 3Q6OA 2K18A 4IBPA 1OC9A 2DJ3A 1YDKA 4ZL8A 2VCTA 1TRWA 1PRXA 4ZB9A 2IJYA 2H8LA 3LORA 4NV5A 3TKSC 1SD8A 5CRWA 3TKSE 1M0UA 1NHOA 3M9JA 4PGTA 1X5EA 1XVWA 2R37A 2IFQB 4OFMA 4DEJA 5HR0A 3KM6A 4K2DA 1I9DA 4O32A 2DMLA 3TOTA 5F05A 2P5RA 2KUCA 4TR3A 2KP2A 4JZQA 1EOHA 6GSVA 1SL1B 5CO3A 4ZIJA 18GSA 3TKSA 1Z6NA 2PWJA 1GL8A 4XIHA 1U88A 3C7MA 1XWAA 1T00A 3VLNA 1MDJA 1CQHA 4PNGA 3A2VA 3BCIA 8GSSA 1XZOA 3KTLA 4N10A 3W6GA 2H73A 2CVKA 2Z9SA 2YZUA 3CYNA 1GSYA 5D73A 1M9BA 2GQMA 2G2QA 1DBYA 1N2AA 3H79A 5EL8A 2D2ZA 3A3TA 1YJ6A 2H30A 5IPHA 3GX0A 3CSIA 3V1WA 3F9UA 2IL3A 3FK8A 5A5KA 2VCXA 4RQRA 1GSSA 3VI7A 1QFNA 1XWCA 4IJ3A 4XRAA 4BPYA 3GNJA 2L6CA 3CBUA 2NDOA 4P3YB 22GSA 3UARA 1B8XA 3FEUA 2B5XA 5D9WA 2X8HA 3HVXA 2MZCA 4KDUA 4PX1A 3H8QA 4V1Ag 3VK9A 2CX4A 2O8VB 4ML6A 3ZFLA 1DE1A 2NPBA 2XC2A 1MD3A 1OYJA 3H4KA 3FY7A 4KSOA 1ZMAA 1I5GA 2WJUA 5L71A 3E9JB 4IJIA 1KTEA 4MLYA 2TRXA 2X64A 3GSSA 3D5JA 5IO0A 2P5QA 2GSQA 1C72A 3FZ4A 2WB9A 2XBQA 4JR4A 4WEYA 4ML1A 3DYRA 5A4VA 5ECLB 4EO3A 4IW9A 3TKPA 5C00A 1A0RP 4MJCA 2IMEA 4D73B 1XCCA 1N8JA 5G5EA 1J9BA 2CVBA 2F51A 1ST9A 4TKYA 3UIWA 3TJBA 3HJOA 3KEBA 5CNWA 4GSNA 2MMOA 1GNEA 1GLPA 2H1BA 5B7CA 2OE1A 2H0IA 2AJQB 2NVLA 3ME8A 3OR5A 1FHEA 3D0ZA 4V2LA 3TKQA 3MWHA 4MA9A 2RM6A 3HZ4A 4KDXA 5LD0A 1THOA 3JCML 1GSEA 4GF0A 2C3TA 2DJKA 2B6MA 1TU8A 3PINA 3Q18A 1JZWA 4GWRA 2B7JA 4DSSA 3ED3A 2NBSA 2BMXA 3N9JA 4N0ZA 5DCGA 4BWSA 5GAPD 3ERWA 1PSQA 3IK9A 2REMA 2F8FA 3CTGA 2VM2A 3WGXA 5IMAA 3MSZA 4TW5A 2FHEA 2JACA 5J9CA 3D22A 2QSIA 3DEXA 1QUWA 1AW9A 1NW2A 1ZZYA 1NSWA 5JCGA 3ZLPA 1QQ2A 4Q5RA 2LNTA 2H6YA 3HYPA 3P8WA 1SYXA 3HHVA 1K0MA 5ID2B 1FO5A 3EVIA 1K0CA 2L57A 3TJFA 1SJIA 2FUG2 4JEDA 7GSSA 1ERVA 1G7OA 4KH7A 1VF3A 5DJMA 4BA7A 4EL1A 3IC4A 4E8EA 3VWWA 20GSA 3ZTLA 5HQPA 1XBSA 5A4UA 2M80A 1BAYA 1UVZA 3H1NA 5H5QA 2K6VA 2H19A 2FGXA 2HRFA 2E2MA 3GMFA 5ECIB 4ZL9A 1JFUA 3FR6A 1VRSD 4MH3A 5IM9A 2IIYA 4MPFA 2CQ9A 2JSYA 4CHSA 2EIOA 5IMDA 4JU5A 4H86A 1J08A 5CRGA 4ZB8A 5LNKe 5AIVA 2YV9A 4OO4A 19GSA 5G2ZA 3GTUA 3ZRDA 1UN2A 4GLTA 2RLIA 4XS4B 4TRXA 4MK3A 1T4ZA 2J9HA 4NAXA 5ECKB 1KBNA 1OC8A 5LCZA 1PL1A 5C04A 1FW1A 5JWQB 3F4SA 3P7XA 3LEFA 2IMFA 1PX6A 1OAZA 3GURA 2CA8A 4GQCA 1XOAA 5ECHB 4TR1B 1CQGA 5AN1A 2LQOA 2V6KA 4F9ZA 5J9BA 4MZBA 3DMLA 1V40A 5J41A 1ERWA 2IFQA 1XPVA 4XRDA 1W4VA 2YV7A 4L0WA 1YEPA 5D93A 3VPTA 3FZAA 1WJKA 1WIKA 1K0NA 4X1UA 1AQWA 2K8SA 3M9KA 4FIWA 2C0DA 2PVQA 2EC4A 5DQYA 3M1GA 2GSSA 1HNCA 3GUSA 3HJMA 2V41A 3IAM2 4Z7XA 1TK5B 3EINA 5ECMB 4RQXA 3KH9A 1USBA 4I8BA 3TRPA 1WPIA 1Z9HA 3D4MA 3F3QA 2ON5A 2YWNA 4Q5NA 4EUYA 4IHUA 1M9AA 1SL0B 4WETA 5F0GA 4PXOA 3TJGA 4PUAA 4CW9A 3FHKA 1SL2B 4TR4A 4WF4A 4GTUA 1V2AA 1ZCPA 3KGKA 1O8XA 1OC3A 3I6AA 4GRFA 1XFLA 1FB0A 2CT6A 2OBKA 4IVFA 3J7Yk 2IMDA 3QAVA 5JCWA 3CTFA 4TN8A 3VI5A 1WOUA 4EE0A 4LL1B 1K0DA 1F9MA 3HZ8A 4EXJA 2WZ9A 3UOMA 3IRAA 2NTOA 4GXZA 4XCSA 4KE3A 1PQNA 3GL3A 3D6IA 3APSA 4IN0A 1SJ6A 2VIMA 4ZB6A 2VCVA 1SENA 1J0FA 2IWTA 4K7OA 3IE3A 4ECJA 2LV3A 4JBBA 4AJ6A 2LS5A 2VD0A 5AISA 5COHA 2L5LA 2PMTA 1XWBA 4NXIA 2DJ2A 2RM5A 3LFLA 2B5YA 3E3EA 2GTUA 5HFKA 4RI7A 6GSUA 5DALB 1T4YA 3F6DA 1LBKA 3QAGA 2GSTA 2AUVA 1BYEA 4XHMA 3QAWA 5EY6A 2QKEA 2PVOC 1BQ7A 14GSA 1AIUA 3RPPA 1TRSA 2VD1A 3QDNA 4YAVA 3CMIA 4D73A 2YNXA 2G0FA 4FYCA 2KHPA 3F0IA 1A24A 4X0XA 3KXOA 4KCEA 2FA4A 2X99A 4FO5A 1GTAA 1HNBA 5E4WA 5CP1A 1VGLA 2E2GA 1ZGNA 3C1SA 2OA7A 1URMA 4MZCA 4O92A 2TIRA 4ZXGA 3O76A 3TKRA 1ZL9A 4BVXA 3DVXA 1TJDA 5B8AA 3GHAA 4OFTA 3TGZA 3ZFBA 1GSFA 3QCPA 1TI3A 2DIYA 4V2NA 1B9XC 5CYYA 9GSSA 1VF1A 2LSTA 1ZOFA 4RUVA 11GSA 4HI7A 1MEKA 2RIIA 3RAZA 1BEDA 6GSYA 4IKHA 1FOVA 1IYHA 2WFCA 5KN0A 3ZYWA 2H6ZA 1T8EB 1A2JA 3F8UA 2C0FA 3NZNA 2BJXA 4MJEA 3L0HA 3KD0A 3GIXA 2FWGA 5DDLA 4EKZA 2VLTA 3KTBA 5ID2A 3GV1A 3D21A 2V6OA 3L4NA 3EC3A 1BJXA 1MDKA 3FW2A 3N5OA 5GSTA 2FWFA 5H5SA 5G1LA 4DSRA 2GQKA 3G9BA 2LUSA 4BWQA 1TK0B 3APOA 5IO2A 1LJRA 4G9HA 1XWGA 4K0NA 2A2SA 3DVWA 3FRCA 1ZYEA 2YWMA 4KDYA 2TRCP 2DBCA 1EWXA 2OADA 2CAQA 4F03A 3RBTA 3HJPA 5ECRB 3FR9A 3ZVJA 4DSQA 2LRTA 4J56E 4YAPA 3ZVJD 5GAND 3LSZA 3QOUA 1XW5A 4N0VA 2MMNA 4L5OA 1X5CA 2OBIA 1QK8A 3GL5A 5CRHA 5G31A 4NMUA 5DQSA 4N11A 3WYWA 4ID0A 1TKDB 1Q4JA 3IXRA 3LG6A 2VCWA 3EU3A 4HQZA 2GDRA 4HJ2A 2I9HA 4HZ4A 3UEMA 3L78A 4J2FA 1R7HA 5IMCA 4XS4A 1RK4A 2JL4A 1RW1A 3EMPA 2H0HA 3S9FA 1YQ1A 4TR0A 2IMIA 1GSQA 2L4CA 2VM1A 5KN1A 3Q74A 2P0GA 1F37A 2LJKA 2O85A 16GSA 1M7TA 1A2LA 1YY7A 2C3QA 1GH2A 1AXDA 5D9TA 4HDEA 3TDGA 2LNSA 1PGTA 1MDIA 4K9ZA 2MYGA 5IMZA 2OE0A 4FYUA 3M0FA 2V32A 3GSTA 3L9VA 4MDCA 2OACA 4MH2A 1PA3A 3J7Yb 1GULA 5DVBA 2DJ0A 4LMWA 1GSUA 2LRCA 2GSRA 1S3DA 2C4JA 1EV9A 1HQOA 3WGDA 2GQLA 2H6XA 1ON4A 3TJKA 4PQHA 4V1Ap 1U3AA 3UAPA 4TVEA 3DKSA 4AJ8A 1WP0A 2J23A 5ECQB 2DJ1A 1VF2A 3ZMLA 1GUKA 3O6TA 3ISOA 2ON7A 3PH9A 2HFDA 3MAKA 1SD9A 4IS0A 2VLVA 4KAEA 2HYXA 3RHBA 3IBHA 4QQ7A 2YWOA 2HT9A 4XS6A 1E2YA 4MP4A 1ABAA 1EZKA 2PN8A 6GSWA 3ERGA 1TP9A 1K0AA 2LJRA 1O73A 2YPMA 2ES7A 5D9XA 2L6DA 4IQAA 4ZBBA 1O81A 2BTOT 2ZCTA 1WE0A 1TU7A 5HFGA 2HLSA 1AQXA 4WR4A 3HVSA 1TW9A 4LMVA 4L8EA 4YQUA 2FLSA 2H76A 2B7KA 2HZEB 2DSAA 4TXOA 4AGSA 4OO5A 5IOXA 4MZWA 2YCDA 4WKWA 1MD4A 3LQ7A 3NIVA 1G7EA 4LA1A 2PPTA 1SYRA 5D9VA 3U5RE 2OJLA 1F3AA 1V58A 2AYTA 3KP8A 4F82A 2HI7A 1B48A 2H1GA 2N5AA 4WBRD 1YF0A 3EE2A 1G6WA 5DALA 2K9FA 1R5AA 2FWHA 2A4VA 2VO4A 1Y25A 1JZRA 2LQQA 4E8HA 6GSTA 3DXBA 1GTBA 2HSYA 4AJ7A 3F3RA 4GQFA 1OE7A 2LTKA 5GZZB 2WS2A 1F2EA 1A23A 2HRNA 1BX9A 3CXGA 4MCUA 3TUEA 3EWLA 2VAFA 5J5NA 4IELA 1R26A 3TRQA 4WF5A 1GP1A 1THXA 2LKUA 4XS1A 1X0RA 2P31A 4HUAA 5IQYA 1KNGA 3ZIJA 1JZOA 3LWAA 1SK1A 4KNDA 3SWLA 2CVDA 4DVCA 2VOCA 1SKWB 3QMXA 3IOSA 2I3YA 3IV4A 2C3NA 4IGJA 3MNGA 3TJJA 1NHYA 3GN3A 3AY8A 3HD5A 1GUMA 2H75A 2H66A 2GLRA 5HFIA 3MDKA 1V9WA 3BOAA 3ZMKA 3GX8A 3Q19A 3ZIVA 5KN3A 3G7JA 3HCZA 4IQ1A 3HXSA 3ERFA 5J4UA 3RPNA 4G2EA 2DMMA 1H75A 1G0TA 1YZXA 3LJRA 4OWYA 2B1KA 3DWVA 1AQVA 3TCOA 5IMVA 4NHWA 4ISDA 4MMMA 1XXUA 2H71A 1A8LA 4ZL7A 3HY2A 1S3CA 1EP7A 1EEJA 1XW6A 3F63A 4K7NA 5ELAA 1KEBA 5ECPB 2OE3A 3P2AA 2XPEA 4KA0A 5AGYA 2AHEA 1M2DA 2H72A 2H74A 4EDZA 3G7YA 2H1AA 5FHIA 5G30A 5FWGA 4K8MA 4WBJA 3FR3A 4KSMA 1VF4A 3TRXA 17GSA 5JWRB 3C1RA 1JZDA 2C1YA 1EV4A 4JE1A 2WGRA 2JZTA 3BCKA 4K0GA 1X9MB 3WGEA 1A0FA 3QR6A 1EEMA 3F4TA 3M3MA 1Z7PA 1F6MC 3KP9A 4PQIA 1ILOA 1TK8B 4POKA 4PUFC 2LJAA 4HEA2 2MMZA 6GSXA 4ZBAA 4OCFA 3FYGA 1O85A 2H1DA 4POLA 5CREA 2AB6A 2WCIA 2N5FA 2B1LA 4MJAA 1QXHA 4J57E 1AAZA 1LU4A 4KW6A 1GSDA 4V2MA 2PUKC 3W8SA 3VWXA 2GZYA 4PQ1A 1YEXA 4JR6A 2C80A 1V98A 4ECIA 1Z3EA 2GZZA 1O6JA 5HR2A 5F07A 2R3XA 2YANA 5F06A 13GSA 3GTUB 2O89A 5E59A 1XVQA 3EURA 2VL2C 1X9WB 3QPMA 1G6YA 2B3SA 2RUEA 1TI1A 1WWJA 4I2UA 2YP6A 1Z6MA 2M72A 5HR3A 2HNLA 3VWVA 2WDUA 3QD9A 5CRDA 4PURA 3GYKA 1TRVA 2ALBA 1Y6EA 1O8WA 3I43A 3PGTA 4KB3A 1T1VA 4K7IA 3LXTA 3IAS2 2H70A 1Z7RA 2AAWA 1DUGA 2GT6A 3ZREA 2QGVA 2VL2A 2R6KA 1T3BA 4JRRA 5JCUA 3CSHA 2X8GA 4TXVA 4KX4A 4G19A 3IDVA 2FWEA 3GKNA 2KP1A 1OKDA 1U6TA 2PU9C 2VCQA 4I97A 2MMAA 3BBYA 3I9V2 3M8NA 2CV4A 3H93A 2LRNA 3DD3A 3IK7A 1DSBA 2YJ7A 3F4RA 3FZ9A 4WXTA 3U6VA 2DLXA 4F2IA 3BJ5A 1PX7A 2I1UA 1FB6A 2FA8A 1B4PA 3GKXA 3EU4A 2IN3A 4IP1A 2C8UA 1JLWA 1QMVA 1UA5A 1EP8A 4YH2A 1GNWA 2FCHA 12GSA 1JLVA 1TTZA 2HZEA 1XWKA 3F6FA 3VWUA 2MBSA 1GUHA 4MF6A 4KCAA 4FYBA 1DE2A 3IPZA 3ZZXA 4G10A 1HYUA 4I2TA 4HU7A 1FAAA 1GTIA 3A2XA 4L0UA 4OD7A 4K1FA 1TRUA 3VPQA 1K3LA 3L9UA 3HKRA 2L4QA 4WR5A 3GA4A 5ECNB 1EOGA 1BG5A 3I69A 1SK0A 4RI6A 2DJJA 2O87A 1A2MA 5DAKB 1IYIA 3P90A 1Q98A 2WRTA 3D4TA 2DC5A 3UVHA 2FY6A 1GTUA 3GKMA 3C8EA 4EC0A 1XIYA 1K0BA 2PGTA 4TR1A 3VFIA 3CSJA 1PMTA 4QL9A 4F0BA 5FT3A 4MPGA 1SJZA 4ULXA 3LGCA 1OC9B 1AUCA 5GSSA 2GVPA 4K6XA 3TOUA 4KUNA 2VLUA 3IHQA 5JWOB 3WD6A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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