4TN8A

Crystal structure of thermus thermophilus thioredoxin solved by sulfur sad using swiss light source data
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
103
structure length
103
Chain Sequence
PIEVTDQNFDETLGQHPLVLVDFWAEWCAPCRMIAPILEEIAKEYEGKLLVAKLDVDENPKTAMRYRVMSIPTVILFKDGQPVEVLVGAQPKRNYQAKIEKHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Fast native-SAD phasing for routine macromolecular structure determination.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
molecule tags Electron transport
source organism Thermus thermophilus
total genus 27
structure length 103
sequence length 103
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-06-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4tn8A00
3C71A 2FLSA 3HD5A 2C3TA 2C4JA 3GN3A 4FYBA 2FA4A 1QFNA 2C0FA 3GTUB 3L9VA 4ZB8A 3F4RA 2VUPA 2VL2A 4NHWA 2I3YA 2VL3A 5IO0A 4MF6A 1PKZA 1OC3A 3HJOA 2KHPA 2EIRA 3KTLA 5D9WA 5G1LA 4ZB6A 3ZZXA 5D73A 4OCEA 4Q5NA 16GSA 4G9HA 1ERUA 3NIVA 1BQ7A 5D96A 6GSVA 1Z7PA 5CRWA 4GSNA 3JCML 1XWGA 1BEDA 3CMIA 2HT9A 2XPEA 2QSIA 4J2FA 3CSHA 5J4UA 1A8LA 5G5EA 1QK8A 7GSSA 2AB6A 2DJ0A 2XC2A 2IFQA 1ST9A 1YF1A 2MMOA 4V2NA 1JZWA 5DAKB 2KOKA 2BMXA 1WE0A 1URMA 1GNEA 5DDLA 3KH7A 1TXXA 3HA9A 1XOBA 3LWAA 4KB3A 4HU9A 3A2WA 2X8GA 3UBKA 3ZVJD 2O8VB 4K0GA 5IMVA 1EP7A 6GSTA 3QPMA 4JR6A 4XHMA 1O8XA 1EV9A 4DEJA 5F0GA 3LFLA 1AC1A 3N9JA 1VF3A 2HZFA 1JLVA 3FZ5A 2DBCA 2KLXA 2H01A 3KTBA 3KMOA 4WXTA 1XPVA 3LYKA 4ZL9A 3F4SA 10GSA 5HQPA 3WYWA 3GX0A 2YWIA 2CVBA 1MDIA 5J41A 3FW2A 1WMJA 4TR0A 3ZITA 3UOMA 3F4TA 4XRDA 2KP1A 2OKAA 4HJ2A 1V58A 2K6VA 2WZ9A 5HFKA 1JZOA 1FG4A 3RBTA 13GSA 1OE8A 2JACA 3RHCA 4D73A 5ECLB 3GURA 1GTIA 3MWHA 1TRWA 1GSSA 2GZZA 3M3MA 2KP2A 1ZZYA 1SU9A 2F3MA 2WJUA 4GRFA 3LEFA 1M2AA 4K6XA 3IHQA 4KH7A 1BX9A 2PU9C 3F9UA 1V40A 3IBHA 3SWLA 1A23A 1ZYQB 2OJLA 5IPHA 2P5RA 2OE3A 4K7NA 4IW9A 2GSRA 4P3YB 3MNGA 1HNBA 1SK2A 1THOA 4BWSA 1TP9A 2O87A 1SKWB 3EMXA 4XS4B 2YWNA 2PMTA 3QAGA 1F3AA 4PUAA 2V32A 4L0WA 3FR9A 1FHEA 4HQSA 3KJYA 2LNSA 3D5JA 2IMIA 2TRXA 5GSSA 1TW9A 4TR1A 5EY6A 3GX8A 5COHA 4QL7A 2H30A 1X5DA 5D8IA 1K3OA 3FR3A 1AIUA 5CNWA 1TI1A 3KMNA 4YAPA 2NTOA 2I1UA 4WF4A 3KIJA 4CW9A 4ZBBA 4PUFC 2NVLA 1N2AA 1F2EA 5L71A 4MZBA 4OFNA 1OC9B 3BJ5A 4MDCA 2VLVA 2H6ZA 2JZRA 2A2SA 2IWTA 5JWOB 1G7EA 2L6CA 2H0GA 4XIHA 1THXA 1NHOA 3EMPA 4IBPA 3BCIA 1WRYA 3VI5A 5ELGA 2V2GA 1B4PA 3EC3A 4MJEA 1Z9HA 2K18A 1TU8A 4RQXA 3UL3A 3I6AA 3DXBA 4O32A 5G5FA 3TJGA 4FO5A 3LXTA 3D4MA 2GS3A 4CHSA 1WWJA 3GV1A 2GDRA 4EUYA 4KE3A 4OO5A 2FY6A 4BL7A 4TR3A 3AY8A 1V57A 1BG5A 5H5RA 1JFUA 5CO3A 1F6MC 4PGTA 3KP8A 1EP8A 2LJAA 1SL2B 1JZDA 1OKDA 3GKXA 5DQSA 2IPAA 3ZREA 1MD4A 1PRXA 2LEGA 2VL2C 5HR0A 4IJ3A 4MZWA 3ERGA 2JU5A 3RPNA 1PX7A 3F3QA 1O85A 3C1RA 1EOHA 1M9BA 2G0FA 3EINA 2C0EA 2H1GA 4TKYA 2YNXA 5D9VA 2P0GA 1TRUA 1GH2A 2C80A 1TI3A 3EYTA 5DALB 3HVSA 4WR4A 1QGVA 1G0TA 2DIYA 1NHYA 1XWAA 4KSMA 3KH9A 4GCIA 3APOA 1R5AA 2VIMA 1A0RP 2LS5A 2RM6A 4XS1A 1U87A 3HKRA 4MF5A 12GSA 1M0UA 1XWCA 4GXZA 1GTUA 2NBSA 5G1KA 2L59A 4DVCA 3EURA 5E59A 1AQWA 2VL9A 1XZOA 3ED3A 2RUFA 2C3QA 2F51A 2LUSA 2AUVA 3ISOA 2IMDA 2R37A 2N5AA 3PINA 4KCAA 3QR6A 2DMLA 4F9ZA 5IPGA 4IKHA 5J9CA 3EU4A 1T00A 4FIWA 3IAM2 4HZ2A 1SYXA 3BOAA 2X8CA 2H6XA 2LJKA 4TW5A 1GSFA 1UN2A 4PQIA 3H79A 4HI7A 4FH8A 3IC4A 5IMCA 1EV4A 3VPQA 1FB0A 1EWXA 3HHVA 4N11A 5F8BA 2HRFA 1O6JA 5LCZA 2GSTA 3MAKA 1B9YC 1JZRA 1TRVA 2B7KA 2DJKA 2B1LA 1PGTA 1YKAA 5AIXA 2EIQA 2G2QA 2YN1A 2J23A 1G6WA 3TKPA 1YDKA 5A5KA 4ISDA 2AV4A 1ERWA 1R7HA 3F6FA 3M0FA 1JHBA 5ECSA 2L4QA 3QD9A 2R6KA 4ZBDA 3IRAA 2VCTA 2X99A 5ID2B 1PX6A 1MTCA 2MYGA 3UJ1A 1X9SB 4KW6A 5DAKA 2IMEA 3DWVA 2DMMA 2YWMA 4POBA 4JBBA 3BD2A 3GSTA 4FYCA 4NMUA 5HR1A 2FNOA 5B8BA 2DLXA 1KNGA 5FT3A 4AJ7A 2M72A 2L4CA 4TN8A 3LXZA 1A24A 3H93A 3APSA 3UIWA 1HQOA 5ELAA 2WCIA 1JLWA 1X9MB 4IN0A 2LQOA 4TRXA 1GSYA 2H74A 2H70A 1EOGA 4IGJA 2HZEA 3KP9A 5ECMB 4MMMA 6GSXA 2VCWA 2VCVA 3UVTA 4JEDA 1F3BA 2CX4A 2VM1A 4MZCA 2JZTA 2MMAA 3W8JA 3G7IA 2M46A 4O5RA 4OWYA 1DUGA 3H8QA 1A2LA 1T4ZA 3ZLPA 4I8BA 3FZAA 4KX4A 2E7PA 3TDGA 3DKSA 4NPBA 3HZ8A 1NW2A 1T4YA 1TTZA 2JSZA 5KN1A 2H1DA 3F3RA 3D6IA 2DIZA 3GKMA 1IYHA 2WULA 1YQ1A 3Q74A 4GF0A 5CYYA 3HZ4A 4POLA 1A2MA 1R4WA 4PXOA 3SBCA 2RM5A 4KSOA 4K7OA 5CRDA 5CRHA 3ZFLA 2C0GA 3W6GA 1OYJA 2XBQA 2HFDA 2VOCA 3A2XA 1SYRA 2LQQA 3WGDA 4F82A 1WPIA 3P8WA 2R4VA 2N5BA 2ZUPA 4MF7A 5H5SA 3Q19A 3GMFA 2WFCA 2GSQA 1GTBA 4ULXA 3VK9A 2O85A 2LRTA 3CSJA 3W8SA 3GRXA 2FWHA 4MP4A 5ECPB 4MH2A 3G9BA 1Z6NA 4AGSA 1ZYEA 5HR3A 2WS2A 5CP1A 4I2TA 5JCUA 1ZMAA 2PUKC 4DSSA 1OAZA 4IVFA 2QKEA 1OC8A 3LG6A 4AF2A 4NV2A 2CX3A 4TXOB 1J08A 3H1NA 3VPTA 1KTEA 4QL9A 2FA8A 3GKNA 2VD0A 3TOUA 5DJLA 9GSSA 5LNKe 2HSHA 1ERTA 1K0OA 2LRNA 4XS6A 1UVZA 3ZL5A 4EVMA 1B4QA 1SJIA 1GUHA 2B5XA 4IELA 5IO2A 4GQFA 4OFTA 1TOFA 3LJRA 1K0NA 1Y25A 1HNAA 3IOSA 3WT2A 4WETA 2FWFA 1H75A 5EVOA 2DJJA 3PR8A 3ME8A 3EU3A 1TK8B 2CZ3A 2B7JA 1ML6A 2H0HA 3J7Yk 5JWQB 2A4VA 2H72A 3L78A 3D21A 3LQ7A 1OVNA 5AISA 2GTUA 2CV4A 1AUCA 3CBUA 3E3EA 3D0ZA 19GSA 2OADA 2E2GA 1CQHA 2YV9A 3CTFA 1K3LA 3TCOA 4PQHA 3A3TA 2H71A 1DE1A 2OBIA 3C7MA 2HYXA 1GULA 3A5WA 1YEPA 4ZBAA 1F9MA 2JZSA 8GSSA 5KN0A 4YH2A 2C8UA 5INYA 5EL8A 2PWJA 1QXHA 3I9V2 3VWXA 1GP1A 3K8NA 4J57E 4BVXA 4N30A 2DC5A 2H0IA 2IFQB 3ZIVA 4BWQA 5B8AA 1SL1B 4RQRA 2K8SA 1WOUA 4F2IA 4N10A 3Q18A 1BJXA 2KUCA 4KDXA 5ECKB 1FW1A 3U6VA 4IP1A 4POKA 1BAYA 4K2DA 3QFAC 1XWKA 2IMKA 4HJMA 2EIOA 2X64A 1K0MA 3Q6OA 4N0VA 3ERFA 4EDYA 2R2JA 4AJ8A 3M8NA 2FWEA 1YKCA 2LJRA 3VURA 2Z9SA 1WIKA 2K9FA 3UMAA 4MABA 1BYEA 1U3IA 18GSA 3CSIA 4CDOA 5IIZA 2VLTA 3GL5A 3IV4A 3HJPA 1TU7A 2O7KA 3TOTA 5B7CA 2F8FA 4F0BA 4KUNA 3CXGA 3KD0A 4ILFA 5J3RA 1PL1A 3FKFA 3OR5A 4HS1A 3TGZA 4EXJA 2F8AA 1W4VA 1XVWA 2V6OA 3O6TA 6GSWA 2ZNMA 4D73B 4GQCA 4ID0A 3CTGA 14GSA 2N5FA 4JZQA 4E8HA 5IMAA 1C72A 5J9BA 4V1Ag 1USBA 1FVJA 1DSBA 2PVOC 4HEA2 4OO4A 4L0UA 4OFMA 2LKUA 4EC0A 1O81A 5JWRB 2GT6A 2QC7A 1ACVA 3VFIA 4Z7XA 3C8EA 3RHBA 2L57A 4LL1B 2E0QA 5DJMA 1GLQA 4OCFA 3S9FA 4WKWA 2JL4A 2LSTA 5ABRA 4KAEA 1J0FA 3KXOA 4F0CA 4KCEA 2RIIA 1Q4JA 2F9SA 5DCGA 2PBJA 2HLSA 3HCZA 1Q98A 4KA0A 5D93A 3WGXA 4TOPA 4TR1B 1H4OA 2XHFA 3LGCA 4EF0A 3WD6A 2V41A 1EZKA 3TRQA 3ZMKA 2ZCTA 3QDNA 3IA1A 2OA7A 1ON4A 1WJKA 4YQUA 4RI7A 4PQ1A 5B6NA 3C73A 2MBTA 1T1VA 2IIYA 2HXKA 2AJQB 3C1SA 2YWOA 3P90A 3APQA 2DJ1A 3D22A 3GTUA 1ZOFA 2H1BA 2RUEA 3E9JB 3GFKA 4IQ1A 4HUAA 1HYUA 2V1MA 2H73A 1X0RA 3H4KA 2OE1A 2EC4A 2D2ZA 2VLUA 4GSTA 4LMVA 1K0CA 3A2VA 4NXIA 3GHAA 1V98A 5C04A 3UEMA 4WEYA 5ECNB 4JU5A 3VWWA 5GSTA 1XW9A 3FZ9A 5IMDA 2HSYA 5LD0A 4ECCA 1V2AA 4BA7A 4Q5FA 4LMWA 2FWGA 6GSYA 1G6YA 1Z3EA 4EDZA 1R26A 5B6MA 4K0NA 2TRCP 3L0HA 3FRCA 3I69A 4FYUA 2DJ3A 1TK5B 3VWUA 1PQNA 3TJJA 2ES7A 1WP0A 3IAS2 2C1YA 1GUKA 3TUEA 4MH3A 1T3BA 4X1UA 3ZYWA 1QMVA 1UA5A 2NPBA 3KCMA 2IMFA 4I2UA 4K1FA 5AGYA 2LTKA 4OMVA 3HY2A 3KGKA 2ON7A 5DCHA 5A4VA 4IHUA 3FR6A 4TVEA 3IXRA 1U3AA 5FWGA 1LBKA 2P31A 3NOFA 5FHIA 1F37A 2I81A 3TRPA 1XFLA 2GT5A 4KDYA 5HFIA 1K0BA 2OBKA 2LNTA 2R5GA 5DQYA 4JR4A 2AYTA 2V6KA 5ENUA 4G10A 1M2DA 1B8XA 4ZIJA 4KDUA 5GAPD 4MJBA 3TKSE 2VCXA 4HZ4A 2H19A 2LRCA 2CVDA 2MMZA 1V9WA 1T8EB 5EPFA 5KEJA 4PNGA 4HQZA 4MK3A 1AW9A 4RUVA 2C0DA 3DMLA 2AAWA 1B48A 2GZYA 2H6YA 1ZGNA 5ECQB 1SKSB 4QQ7A 1LJRA 4IP6A 4AJ6A 2FHEA 4BVYA 2IN3A 2YCDA 1SD8A 4KNDA 2QGVA 1NSWA 4WBJA 2H8LA 3J7Yb 4PNFA 2HNLA 3O76A 4POMA 4YQVA 2JSYA 3D4TA 5F06A 4XS4A 4EKZA 22GSA 3HDCA 1Z7RA 3ME7A 3M9KA 5DBQA 4TR4A 1PKWA 3FY7A 4G19A 3PH9A 1PL2A 3TKRA 3F63A 4HOJA 1GUMA 3WGEA 2AHEA 1I9DA 2WGRA 4RI6A 4ML1A 1TRSA 1U6TA 4E8EA 17GSA 3V1WA 3BCKA 3R2QA 5IOXA 1VGLA 3GKKA 3DRNA 3TJKA 2BJXA 4GLTA 3EE2A 3QCPA 2VCQA 2XPDA 2CA8A 3M9JA 3FEUA 4IS0A 3TKSA 1AXDA 3GYKA 4Q5RA 5D9XA 3G7YA 1FAAA 4L8EA 1OC9A 4EE0A 1DBYA 1MDKA 4L5OA 2CAIA 1FO5A 2IL3A 3KZQA 2HZEB 3IE3A 3EVIA 4V2MA 1M7TA 3HJMA 4MA9A 2B3SA 5DVBA 1GSQA 2HRNA 3BBYA 1XBSA 5AN1A 2ALBA 1RK4A 5IQYA 4JE1A 3UBLA 1E6BA 1M2BA 2HI7A 11GSA 1XVQA 3TKQA 4K8MA 1EEMA 3GH9A 3VWVA 2PERA 4BPYA 1Z5YE 1AQVA 5A4WA 3F6DA 3QOUA 2OE0A 1SL0B 1SKRB 3ZRDA 2L5LA 4I6XA 4LL4B 1TKDB 2GLRA 1X5EA 1Y6EA 2YP6A 3L9UA 2B6MA 1QUWA 2GVPA 3HVXA 3UAPA 1PMTA 2WDUA 4H86A 4X43A 1X9WB 1XIYA 2YPMA 4WR5A 4JRRA 3ZVJA 1XWBA 3DYRA 3P2AA 3ZMLA 2FUG2 3U5RE 3HXSA 2L6DA 1UC7A 3RDWA 2DJ2A 1SJ6A 1XW6A 2PGTA 4XRAA 3FYGA 1ZCPA 1MDJA 2CT6A 3GUSA 3LYPA 1YF0A 4O92A 2K8VA 3CRTA 1QQ2A 2PN8A 5HR2A 5CREA 4PX1A 5DALA 3ZFBA 1Z6MA 4YQMA 1YEXA 3ZIJA 5CAXA 3DGQA 4ZB9A 1HNCA 4DSQA 1YZXA 2GQMA 1A8YA 3IK7A 1TJDA 3IDVA 3TJFA 3IK9A 2YOIA 2GZPA 1TK0B 1J9BA 3IPZA 3TRXA 1A0FA 1VF4A 5F07A 1O7UA 2VAFA 5H5QA 4DSSB 1FB6A 4MPFA 4N0ZA 2E2MA 5A4UA 5G2ZA 1OKTA 2VD1A 1GWCA 5F05A 4GSSA 1EEJA 3QFBC 2RLIA 5HFGA 4LLRA 4PURA 2YANA 2H66A 3RPPA 5ECRB 1A2JA 1FVKA 5KN2A 3FK8A 2CAQA 3GIXA 1IYIA 1PA3A 5D9TA 1KEBA 2JADA 4MPGA 1AAZA 2WB9A 3F0IA 3GA4A 4IJIA 4ZXGA 3VI7A 5ECHB 4EO3A 4ZL7A 3G7JA 1SK0A 2XBIA 2H75A 4MCUA 1M9AA 6GSUA 5E4WA 4WBRD 2I9HA 3GSSA 4ECJA 1T7PB 2REMA 2BTOT 5CRGA 3VLNA 5G30A 3KM6A 2B1KA 4GTUA 1S3DA 3HYPA 1OE7A 3DVXA 1SJZA 1MEKA 4OD7A 4KGIA 4G2EA 3ZTLA 5IOWA 3DVWA 1N8JA 4WF5A 1M99A 2GGTA 1RQMA 5ID2A 1GLPA 1GNWA 3KEBA 1K0DA 2HE3A 4LA1A 4MJCA 2R3XA 4V2LA 5ECOB 1K0AA 4K7IA 2IJYA 4HDEA 5KN3A 3E0UA 3L9SA 4TXVA 1TDIA 4L5LA 3WT1A 1LU4A 3TJBA 4V1Ap 1PSQA 1YY7A 4ZILA 2A2RA 5IMZA 3L4NA 4I5QA 4X0XA 4MJAA 2B5EA 3PGTA 1GSEA 3ERWA 2GSSA 4MLYA 5C00A 3DEXA 1PN9A 3EWLA 3TB2A 2J9HA 5IM9A 2TIRA 1XOAA 5ECIB 4EL1A 4ZL8A 1U88A 4F03A 2FD3A 1YJ6A 3NZNA 1E2YA 1VF1A 4ECBA 1S3AA 4Q5QA 5GAND 4K9ZA 1XW5A 1GSDA 4XTSA 1KBNA 1O73A 3LSZA 3M1GA 2B5YA 1FOVA 4NAXA 1O8WA 5J5NA 3TKSC 4J56E 3UVHA 3GL3A 1S3CA 3DIEA 3FZ4A 4ML6A 2MBSA 4O7HA 3QAWA 2OACA 5G31A 2H76A 6GSSA 1PD21 2O89A 2ON5A 1DE2A 3IR4A 2X8HA 5IMFA 3QMXA 2M80A 4ECIA 1NM3A 3GNJA 4ACSA 1CQGA 3LORA 2C3NA 2GQKA 3O3TA 2PPTA 4HU7A 2YV7A 3DD3A 3MSZA 3HVVA 2I4AA 1GSUA 1K3YA 1ERVA 1X5CA 1I5GA 3CYNA 1GTAA 2CZ2A 4XCSA 2YJ7A 1XXUA 2H1AA 1HD2A 1RW1A 2WRTA 2YZHA 1R5PA 2VO4A 2P5QA 4I97A 2CVKA 1SENA 4GWRA 2NDOA 2YJHA 1MD3A 1W89A 4DSRA 3RAZA 2CQ9A 1ZL9A 2MZCA 4NV5A 1SD9A 2MMNA 2GQLA 4TXOA 3I43A 1ILOA 1EGOA 1B9XC 1G7OA 2VCZA 5GZZB 1ABAA 2PVQA 4IQAA 3UARA 2YZUA 4NHZA 3FHKA 3P7XA 2FCHA 3US3A 2FGXA 3F8UA 1SK1A 2L5OA 4YAVA 1GRXA 1GL8A 3QAVA 3MDKA 1AQXA 1VRSD 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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