2HYXA

Structure of the c-terminal domain of dipz from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
GAMEIREQLNLGGIVNAQNAQLSNCSDGAAQLESCGTAPDLKGITGWLNTPGNKPIDLKSLRGKVVLIDFWAYSCINCQRAIPHVVGWYQAYKDSGLAVIGVHTPEYAFEKVPGNVAKGAANLGISYPIALDNNYATWTNYRNRYWPAEYLIDATGTVRHIKFGEGDYNVTETLVRQLLNDAKPGVKLPQPSSTTTPDLTPRAALTPETYFGVGKVVNYGGGGAYDEGSAVFDYPPSLAANSFALRGRWALDYQGATSDGNDAAIKLNYHAKDVYIVVGGTGTLTVVRDGKPATLPISGPPTTHQVVAGYRLASETLEVRPSKGLQVFSFTYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure of the C-terminal domain of DipZ from Mycobacterium tuberculosis
rcsb
molecule keywords Protein dipZ
molecule tags Unknown function
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 92
structure length 333
sequence length 333
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF17991 Thioredoxin_10 Thioredoxin like C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.260 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Galactose-binding domain-like 2hyxA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2hyxA01
3A21A 2DJ2A 1GTIA 2W1SA 3I3BA 1T00A 2AYTA 1V9WA 1GNWA 2DC5A 5H5QA 4YQVA 1FG4A 3HKRA 1A2LA 4DSSB 4PGTA 1J08A 2JACA 5G2ZA 2PUKC 3NZNA 1HD2A 4TXVA 4X0XA 2F9SA 2GSRA 3EB7A 4I97A 1Y6EA 3I3EA 4QAWA 1F3BA 1XNTA 1O7UA 1A0FA 2J22A 4K1FA 1Z7PA 4CUBA 1X5DA 5DPNA 5J5NA 5EJZB 4KSMA 3I97A 5EJ1B 1O59A 3L9VA 4OMVA 5G05L 2VZUA 1K3YA 2E2GA 1AUCA 4KDUA 2PMTA 4N10A 4HJMA 1YF1A 4XUPA 3VDAA 1HYUA 4KGIA 1X5EA 4WBRD 5B8BA 3I2IA 5D93A 2RM5A 3DVWA 1A23A 3TOUA 1KBNA 5LD0A 4JX0A 5GZZB 2I9HA 2Y6KA 2A2SA 3Q19A 5D9WA 3R2QA 1BYEA 2QQKA 1UA5A 4GWJA 1VF3A 3VI7A 1B8XA 3W8JA 5CRWA 4XS6A 4OFNA 2FA4A 2GT5A 4XS1A 1T4YA 5IMAA 2HLSA 4TR4A 5L71A 1G0TA 1O8XA 2HI7A 3VURA 4ECJA 5ECIB 5JCWA 5D96A 5ELAA 4JE1A 4BL7A 5DVBA 4QX3A 5CREA 2GVPA 5IPGA 1GOGA 2VL2C 2QQNA 4BJ0A 4FH8A 5B4XA 2VZPA 1VF2A 2YFZA 3UIWA 4NAXA 6GSYA 3CMIA 5G30A 3TCOA 2WABA 3CYNA 5B6MA 2NTOA 1PQNA 1EP8A 4ZXEA 4ID0A 3LQ7A 2VZRA 2Y6LA 3LQCA 1GP1A 4L0UA 1NM3A 1PX4A 3LFLA 3WT1A 5IQYA 4NV5A 3CRTA 3MO4A 2BGPA 1W99A 4MOAA 1SJZA 3F4TA 4TVEA 2J1VA 3PR8A 4N11A 1O8SA 3E3EA 3SBCA 5D73A 4DSRA 3ME7A 1UYZA 5B4NA 1M2AA 3TJGA 3J7Yb 3UVHA 1XIYA 3W8SA 1OD3A 1IYHA 2Y64A 3EYPA 3J7HA 4IKHA 2CX3A 2DMMA 5DMYA 1US3A 4QDSA 2RJ2A 2KD7A 4L0WA 2F8FA 2VD1A 4BVXA 1TK5B 5JWRB 1DSBA 1W0NA 1VGLA 4JKMA 17GSA 1PX6A 4YAPA 1J83A 1NAEA 1GOHA 1LJRA 1M9BA 4CU6A 5AIVA 4HZ4A 1QFNA 1L7RA 2DJ1A 1GU3A 3T0DA 1BEDA 3EINA 1YQ1A 3GYKA 3I43A 2L6CA 3UEMA 1YQ2A 5G31A 3G9BA 3CSIA 1VF1A 1ABAA 4IHUA 5D9XA 1SJIA 1LU4A 2WRTA 1R7HA 4L5LA 2H30A 4HQSA 4AF2A 3ZMKA 4ZILA 3NJVA 3CTGA 2K8VA 2MBSA 3F2ZA 5GSSA 5CRHA 1ZYQB 4FI9A 2P31A 3KJYA 2H0HA 5A4WA 2V2GA 1QK8A 3KD0A 1QQ2A 4TR3A 2ZEWA 4FYCA 2CAQA 4CW9A 5CAXA 5C7GA 4JKLA 3GSTA 2VD0A 5ECQB 3UBKA 5A1AA 3PUHA 2JL4A 3SEEA 2KOKA 5ECRB 5JUVA 5DALB 3KH7A 2ALBA 2J1UA 2OA7A 4IJIA 3I69A 4LLRA 1PKWA 1TRSA 2E0QA 3WGEA 1VRSD 2R7EB 1MD4A 3IIIA 1GSQA 2XOMA 2BJXA 4E8EA 3WF2A 3FRCA 4LPLA 1UN2A 5ECNB 4ECIA 2FLSA 2V32A 4EL1A 5I0DA 4J56E 3GKXA 3TOTA 2WZ8A 3US3A 1TRWA 4BA7A 5GSTA 2V1MA 2EIRA 1M9AA 3I2GA 3K75B 2YV9A 3C1RA 2W47A 2JZRA 3APQA 5A4VA 1X0RA 4RQXA 4MABA 5H5SA 4GQCA 1OF3A 1O6JA 4GWRA 2W1QA 6GSUA 4KW6A 1WPIA 1THXA 2LJAA 2OBKA 2KP1A 1OH4A 2LUSA 1EUUA 2P5QA 3HJPA 4A45A 2YCDA 3CBUA 3WGXA 5J3RA 3I9V2 5CZKA 2WAAA 1UXXX 3IAS2 2FWHA 3KIJA 3FZ4A 2AV4A 3GTUA 3VD7A 4IELA 1AIUA 2H1DA 3WF3A 2X05A 1A2JA 2FWEA 3K4DA 3CZUA 4TW5A 1F4HA 3K4ZA 1P8JA 3DYMA 1U87A 2EIEA 3HJMA 2NDOA 2R3XA 3WF1A 2IMFA 3QPMA 4FIWA 3RBTA 4PF1A 2H75A 1AQWA 1EP7A 5F0GA 1SKWB 3VWXA 5IJRA 3D6IA 1OE7A 3LGCA 2WN3A 4JHZA 2TIRA 3LEKA 4PQHA 5IO2A 2IMIA 18GSA 5EY6A 3HVXA 2GGTA 4TRXA 3OR5A 1U88A 1PMHX 2YN1A 4TOPA 3HEIA 5KN1A 4MGSA 3UARA 2YV7A 3WNLA 1KNGA 3D4MA 1UMIA 5DAKA 1SL0B 2RV9A 3TKPA 5B6NA 5CYYA 4RN5A 4MJEA 1XW9A 3NIVA 4XS4B 3RPNA 3HZ4A 2JZSA 3OEAA 2W87A 3F4SA 2CDPA 3KTLA 3BGAA 4DEVA 5COHA 2MZCA 9GSSA 2W5FA 2TRXA 3P7XA 1SL1B 6GSXA 1NHYA 3HDCA 5LNKe 4MZCA 1GSDA 4TXOA 1TVGA 3C1SA 3ZFLA 1HQOA 3TJJA 4BK4A 1G6WA 1GULA 5IM9A 4XRAA 2B1KA 4YQUA 4KA0A 4F03A 3LPGA 3WEZA 1B4PA 2H01A 1UYXA 3WNKA 3Q74A 2ON5A 2YOIA 1Q98A 2VZ3A 1D7PM 5CNWA 3VPTA 3M1GA 4Q5QA 3LEIA 2XPEA 5IFPA 4IW9A 3ACHA 2LTKA 3I2HA 1EV9A 5ECPB 2H1GA 3GDBA 1LNSA 3SKVA 1R26A 4GLTA 1K0NA 1TJDA 5G1LA 3ISOA 1F3AA 2B7KA 2VLUA 2CZ3A 3KZQA 1SJ6A 4HI7A 4FYUA 2GSQA 1FB0A 1E6BA 4QPWA 1FB6A 5FT3A 1AXDA 1X9WB 1PMJX 3NOFA 1DE2A 3CZJA 3JCML 2YC2A 3FEUA 3VDCA 1ULPA 3LYKA 5J41A 4MADA 2B5EA 1O85A 3IOSA 3QAVA 4BK5A 2VOCA 1PKZA 2QQMA 2VQTA 1BAYA 3QAWA 1DUGA 3UMAA 4ZL8A 2R4VA 1WOUA 1S3AA 1ERUA 1WJKA 2FUG2 1GH2A 1ST9A 2JSZA 3QD9A 4IBPA 4Z2AA 1GSSA 5JXGA 4DUVA 4Q5RA 1TTZA 4BXSV 2C26A 1F2EA 1OAZA 3GL5A 1CQGA 1VF4A 3ERWA 3ZMLA 2C4JA 4RUVA 2PVQA 3D0ZA 1FOVA 3KTBA 3LORA 1EGRA 3UJ1A 5HFGA 3AY8A 5IOXA 1FO5A 4JR4A 5ID2A 1UX7A 1UYYA 3O76A 4MGQA 3KCMA 5KN3A 4HUAA 4AGSA 4ZBBA 4POBA 3VD9A 2VZOA 3C7OA 4P08A 4RQRA 4HOJA 2WB9A 4K7NA 4NWYA 2QBXA 2W1UA 3DEXA 3GHAA 3QR6A 4BPYA 3GV1A 1MD3A 2LNTA 4PXOA 4ECCA 4W8JA 3OB8A 2CDOA 2ZCTA 1JLVA 2CQ9A 4WXTA 4QB2A 4F2IA 1OC8A 1K0OA 2PVOC 2X64A 4V2MA 2AJQB 6GSVA 1TRUA 3LSZA 1DYOA 1YEXA 4P00B 4TN8A 1EUTA 1XVQA 4XUNA 1PA3A 2QQLA 1W4VA 1EEMA 2LKUA 5J4UA 4RYDA 3GX8A 2VC9A 5C00A 4O92A 2YJHA 1PL2A 4MF5A 3T2QA 3H4KA 1OC9A 5J9CA 1K0AA 1E2YA 4DEJA 5KEJA 2C0DA 2C9KA 3A22A 2GQKA 1XC6A 3HY2A 4KAEA 1TI1A 2NVLA 3DWVA 2EIQA 2D2ZA 2Y8KA 1K3OA 4F0BA 4G9HA 2XBQA 3FR9A 2NPBA 1UY2A 4TR0A 3T0BA 3GMFA 3D3AA 2L9LA 3W5MA 4ZXGA 1OF4A 2FWGA 5D8IA 3FY7A 1IQDC 5JXJA 3VD4A 3QFAC 4MLYA 3GUSA 2QKEA 3LEGA 2DCJA 3G7YA 2W1WA 5JWQB 1FHEA 1GSYA 5DQYA 2RUEA 2LJKA 2VMFA 4E8DA 5LA0A 2H6ZA 2E2MA 3IDVA 2QGVA 4KUNA 4ZB6A 2OKXA 5IMZA 2HZEA 1NKGA 3C73A 1W9TA 2EC4A 4WEYA 3OGRA 4KDYA 1B48A 2GSTA 1TP9A 2N5BA 2MMZA 2HE3A 2H6XA 4YH2A 3PINA 4KE3A 2B6MA 1LBKA 4ARYA 4DEQA 1XPVA 3M9KA 3HNBM 2J23A 3ZREA 1DBYA 3LG6A 1FAAA 4A42A 5JXHA 1K3LA 4P5YA 2FCHA 4I8BA 2Z4FA 3FN9A 5CRGA 4GXZA 2ZUPA 2I4AA 4PT6A 2JU5A 4CU9A 1L7QA 1C72A 3N5OA 2B5XA 3VWWA 1T8EB 4EF0A 1Q4JA 1RQMA 5ECLB 1JZ6A 4KCAA 2W95A 4WR4A 4HU7A 5HFKA 5AGYA 2REMA 5IFTA 2OJLA 1UZ0A 2OKAA 2YZUA 2YZHA 4RI7A 2C80A 1S3CA 3SEPA 1PL1A 2H1AA 4GZ9A 3WNMA 1J84A 1AAZA 4OWYA 2JKXA 2I1UA 2AUVA 4HJ2A 3EC3A 3KGKA 3A2XA 1XWGA 3F63A 4XHMA 5DQ0A 5F8BA 2X09A 3AC0A 4UAPA 4IP6A 3TDGA 4MF6A 2LRNA 2FGXA 3F6DA 8GSSA 3H1NA 5FHIA 3HNMA 1GUIA 16GSA 1AQXA 2AB6A 4P3YB 1TU7A 2HYXA 1WE0A 2GS3A 1SG3A 2WZ9A 4CU7A 2IWTA 2O8VB 2K9FA 5AIXA 2LQOA 1ZL9A 3NNGA 1PGTA 2W92A 2L4QA 1OKDA 2J1SA 3HOBA 5HR0A 2JD9A 1Z3EA 3MV01 2DJJA 4HU9A 3IDAA 1XWKA 3WSOA 1HNBA 4D73A 5F07A 2V6OA 3FZAA 3CIHA 4RI6A 4MZBA 1JZRA 4GCIA 1YDKA 5B7CA 3VWUA 1NW2A 1F37A 4MDCA 3BD2A 5G5EA 4XURA 1A8YA 4ZZ8A 2H0IA 1A2MA 1JZDA 4DSSA 1K0DA 5HQPA 3BN6A 1NSWA 7GSSA 1UMHA 4P02B 4K6XA 1BHGA 3H93A 5GAPD 2PERA 2WQ8A 1QUWA 3IA1A 5JWOB 2VMDA 3MSZA 5KN0A 2JDAA 5LCZA 3ME8A 2YFUA 2GLRA 3Q18A 1ULOA 1UY0A 4K2DA 1TW9A 3C7HA 4LL1B 2L57A 2VL9A 5GAND 2XC2A 2DIYA 4LMWA 1R4WA 1V40A 2C4XA 4TXOB 3JXSA 3C8XA 4EDYA 2F51A 2KHPA 2K6VA 4A6OA 1CZSA 1IYIA 4O5RA 5E59A 2LQQA 5ECHB 4YQMA 2VL3A 5ECKB 1JZ5A 4JBBA 3DVXA 5DJMA 3IK9A 2C1YA 22GSA 4MJAA 1OT5A 2GDRA 3F0IA 4ISDA 5JCGA 2DJ3A 4HDEA 1WMJA 2M80A 3APOA 1F9MA 1PD21 4XRDA 5A4UA 4KH7A 1WWJA 1W9SA 2HT9A 2VCZA 3IRAA 1UWWA 4QL7A 1UY3A 1X9SB 1BX9A 4PUAA 2J1AA 2YNXA 3APSA 4EUYA 3BBYA 1SK0A 3A2WA 19GSA 5IMDA 3A23A 5IYYA 4LA1A 3TUEA 1XOBA 2R5GA 3H8QA 4XVHA 1PRXA 2KP2A 5ECSA 1O8WA 1QGVA 1WRYA 4G19A 4H86A 1TKDB 3FL7A 1J9BA 3LYPA 1UXZA 4ARXA 3G7IA 1QMVA 2PWJA 4A41A 2L6DA 10GSA 2XPDA 3PH9A 4G2EA 4ML1A 1JZWA 2V41A 2P5RA 1HNAA 3FHQA 2VL2A 2H6YA 3L9UA 4L0PA 1XZOA 1ZYEA 4DUWA 1N2AA 2IFQB 1XWBA 1JYWA 1EEJA 1X9MB 3DKSA 4GRFA 4OO4A 3P8WA 4MJCA 3QAGA 3WYWA 1WP0A 2G0FA 4ZL9A 3CDZB 3UL3A 4E8HA 1TDIA 1X5CA 2IIYA 3WF4A 2R37A 2MBTA 4GSTA 2V5DA 1YZXA 2OADA 5DJLA 3OGVA 3ZM8A 1GRXA 4QDQA 2C3TA 3K46A 1HNCA 2JZTA 4XTSA 2C3QA 3VPQA 2I3YA 5DBQA 1JHBA 4WETA 1V58A 3UESA 4MZWA 4ULXA 2N5FA 2H76A 1W89A 2LV3A 1JZ2A 4TXWA 2V4VA 3MUY1 5HR2A 3VI5A 3LE0A 4CUAA 1EGOA 5EL8A 1RYYA 1SKRB 2YWMA 2WDUA 1SU9A 5LA2A 3F8UA 3HA9A 2GT6A 2PN8A 1KEXA 4CUCA 1OC3A 2VCXA 2CVBA 1QXHA 3FW2A 1UY1A 2VO4A 2IPAA 1JZ7A 1JU4A 4TR1B 3TRXA 1ERWA 4MCUA 1BQ7A 2ORZA 3EWLA 2LRCA 1ERVA 4V1Ap 1KEBA 2VZ1A 2Y6GA 5IHRA 4POKA 3WT2A 1A24A 3E9JB 1RK4A 3G7JA 4AAXA 2H0GA 1EOGA 1SD9A 2FY6A 1GTAA 4KI5M 2PBJA 3GX0A 1TG7A 4XZUG 5HR3A 1T1VA 4M4PA 1GWCA 5C04A 1XW5A 2YWNA 3M0FA 2J1RA 4QX1A 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1ML6A 4IQ1A 2C0FA 2VL4A 1N8JA 3VD5A 4I5QA 5INYA 3HJOA 4XS4A 3TGZA 1TK0B 3TJBA 1CX1A 2C0EA 4X1UA 5J1XA 2E31A 2CVKA 1M2BA 4O7HA 5A5KA 2Y6JA 5DCHA 2IJYA 3IK7A 4DVCA 6GSSA 3PUIA 1SL2B 3O6TA 4QL9A 3OEBA 2B5YA 1H4OA 3D21A 3W5NA 4IVFA 2CV4A 3FKFA 4N30A 3P6BA 4D73B 4LMVA 1B9XC 5AN1A 1T3BA 1GUKA 3I2FA 1B9YC 2CAIA 2Z9SA 3WD6A 1PX3A 3RAZA 3KP9A 3CQOA 3WF0A 2BMXA 2MMNA 4V2NA 2H70A 3H79A 3LPFA 1SYRA 1YJ6A 2X8HA 2DIZA 2N5AA 2H8LA 4DXRA 14GSA 4LHSA 1TK8B 4MA9A 1JI6A 3IE3A 4K0NA 3IHQA 5B8AA 4QDRA 2RLIA 3GKKA 13GSA 3MV11 3DYOA 1AQVA 1ERTA 4JEDA 3GKMA 2TRCP 4AJ8A 5IOWA 2V72A 3D5JA 1UY4A 5FUIA 4EXJA 1URMA 2H66A 4HZ2A 2E33A 2RIIA 2VZVA 2M72A 2DJKA 2HRNA 3LWAA 4KX4A 3K77A 3TKSA 2VJXA 2C3NA 4MF7A 1FVKA 4A44A 4NPBA 2VZSA 2O7KA 3UNPA 3TKSE 2ID4A 1PX7A 5IMVA 5IMCA 5LA1A 1SKSB 1EOHA 3KP8A 3GRXA 1EWXA 4OMDA 1DP0A 3TJKA 3U6VA 1JHJA 1OVNA 5E4WA 2VAFA 1EZKA 2YG0A 1K12A 3GXUA 1V57A 4L5OA 3C7EA 1GUHA 3GURA 2BERA 2X10A 1G7OA 5ECOB 1ZMAA 2AAWA 1XPWA 2GQMA 1JZ3A 3VFIA 4KWUA 1Z6NA 3SWLA 3WNPA 4EO3A 4KB3A 1PMTA 4F82A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1DE1 A;  4J57 E;  1NUK A;  2ZEX A;  4EDZ A;  2HSY A;  1U3I A;  1SK2 A;  3F3Q A;  2VCT A;  2WN2 A;  4GTU A;  2VZQ A;  4XUQ A;  1OC9 B;  5F7U A;  4EE0 A;  2FHE A;  3VD3 A;  2VCA A;  1JYX A;  3C7G A;  4HS1 A;  3WNO A;  1UVZ A;  2DJ0 A;  1K42 A;  1MDI A;  4UOJ A;  2A4V A;  4CDO A;  4M4R A;  5H5R A;  1ZOF A;  4V2L A;  1GTU A;  2PQS A;  5JXI A;  4KCE A;  2VZT A;  3IXR A;  4ACS A;  5DAL A;  2J1T A;  4MO3 M;  4L8E A;  3J7Y k;  2WUH A;  5DN2 A;  2IMD A;  2HZF A;  4POL A;  3A3T A;  2HFD A;  2HXK A;  2XHF A;  3MUZ 1;  3A5W A;  3DYP A;  3VK9 A;  2HRF A;  1GSF A;  1GNE A;  5IIZ A;  1FW1 A;  3RPP A;  1CQH A;  1MTC A;  4WBJ A;  3ZL5 A;  2LS6 A;  5F06 A;  4KMQ A;  2L5O A;  2VIM A;  2W91 A;  2QSI A;  5AIS A;  3TKS C;  4XIH A;  1BG5 A;  2YP6 A;  3VWV A;  1KTE A;  1H6Y A;  3TJF A;  2CZ2 A;  2OAC A;  3DD3 A;  4BVY A;  1S3D A;  1Z5Y E;  1A8L A;  3LXT A;  3N9J A;  3NJX A;  1ON4 A;  3GM8 A;  2BTO T;  4OCE A;  2DML A;  4Q5F A;  5DDL A;  5IPH A;  1M2D A;  2YWO A;  2H1B A;  2AHE A;  4GSN A;  2F8A A;  1DLC A;  1A0R P; 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 5DQS A;  4TR1 A;  4ZB8 A;  2VLT A;  3GH9 A;  1XFL A;  4NHW A;  1MDJ A;  4OCF A;  3Q6O A;  3E1F 1;  3K4A A;  2XBI A;  2A2R A;  3CMG A;  3NQH A;  2ZEZ A;  1K45 A;  4OFM A;  4G10 A;  1XW6 A;  2IL3 A;  3KXO A;  1US2 A;  2J7M A;  3ACG A;  4K8M A;  4K7I A;  2L5L A;  1O8P A;  4V1A g;  1WCQ A;  2WZE A;  1AW9 A;  3FZ9 A;  3ZIT A;  2WDB A;  3QDN A;  2MMO A;  5CP1 A;  6GSW A;  2Y6H A;  2X8C A;  1JZO A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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