2HYXA

Structure of the c-terminal domain of dipz from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
GAMEIREQLNLGGIVNAQNAQLSNCSDGAAQLESCGTAPDLKGITGWLNTPGNKPIDLKSLRGKVVLIDFWAYSCINCQRAIPHVVGWYQAYKDSGLAVIGVHTPEYAFEKVPGNVAKGAANLGISYPIALDNNYATWTNYRNRYWPAEYLIDATGTVRHIKFGEGDYNVTETLVRQLLNDAKPGVKLPQPSSTTTPDLTPRAALTPETYFGVGKVVNYGGGGAYDEGSAVFDYPPSLAANSFALRGRWALDYQGATSDGNDAAIKLNYHAKDVYIVVGGTGTLTVVRDGKPATLPISGPPTTHQVVAGYRLASETLEVRPSKGLQVFSFTYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Unknown function
molecule keywords Protein dipZ
publication title Structure of the C-terminal domain of DipZ from Mycobacterium tuberculosis
rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 92
structure length 333
sequence length 333
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF17991 Thioredoxin_10 Thioredoxin like C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.260 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Galactose-binding domain-like 2hyxA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2hyxA01
3FZ9A 3IAPA 4KW6A 1ERWA 3ACIA 4MJAA 2R37A 3T2OA 1R26A 2V6KA 3WGDA 3FRCA 1SK1A 5E59A 1XVQA 3AY8A 1UYYA 4JU5A 3HJOA 2RM5A 3P1IA 4WETA 4A3ZA 2YWNA 1Z9HA 3HVVA 2WGRA 4YH2A 1PQNA 2VZ3A 5J3RA 1SK0A 3OR5A 3EB7A 3MV11 4KGIA 1F3BA 2TIRA 3CRUA 4AF2A 3NNGA 3VWXA 5F7UA 4IQ1A 1AXDA 1WJKA 5JR2A 5ECQB 3ME8A 2TRXA 3VWVA 4XS6A 3TKSA 1MPXA 2BGPA 4D73A 4RI6A 1GOFA 3P6BA 1TRWA 4W50A 1XW5A 2X64A 4ZBDA 2WB9A 1JZ7A 3BOAA 2OE1A 4E8EA 1F4HA 3HA9A 4A42A 3FHKA 4G19A 3NQHA 3CRTA 2Z4FA 5GZZB 2HI7A 1OT5A 2GQKA 1JZ6A 1BG5A 2ZNMA 5DQYA 5EJZB 3F4RA 2LS6A 3SWLA 2W91A 3BCIA 1EZKA 1W89A 4XIHA 1GOHA 4XUTA 2KD7A 1HD2A 3GL5A 3NOFA 3D3AA 1ERTA 2DLXA 13GSA 5G30A 1PMJX 2JL4A 2BJXA 1FB6A 1GSSA 2MMOA 3WF2A 1JLVA 3WF0A 1YJ6A 2WULA 3KXOA 2FWGA 1OYJA 1GWCA 3MUY1 1TK8B 2VD1A 4HOJA 4OZOA 3GFKA 4KDXA 3I43A 3GKXA 3VDCA 1SJZA 1SD9A 4W8JA 2K8SA 4V1Ag 2IPAA 4CDOA 4A41A 1ZCPA 1JU3A 4GWIA 5FHIA 4XS1A 4KMQA 4TRXA 1K42A 6GSVA 4JZQA 4P5YA 4YPJA 4LMVA 3WT2A 1AAZA 4JBBA 4DXTA 1GSQA 4NHWA 5ID2B 2B6MA 3WT1A 2VCXA 1GTAA 3KMNA 2LQQA 1TG7A 4MO3M 3DGQA 4QX3A 4QL7A 4MMMA 4OO5A 2EIDA 2J9HA 2RLIA 3M9JA 3GNJA 3QFAC 4KSMA 1MDIA 2L5LA 1GUIA 3LSZA 4IJ3A 1SENA 2H1DA 2JSYA 5IMVA 2HRNA 1MDKA 5GSTA 1TI1A 2CVKA 2YB7A 3MWHA 1NHOA 2HSYA 3HJRA 2IFQB 5F0GA 3EINA 1DBYA 3VFIA 2J22A 1XCCA 5IMDA 4KH7A 5ECSA 4GRFA 2YPMA 1OC3A 3J7Yk 4QDRA 1KTEA 2Y6GA 3UOMA 2YC2A 4I6XA 1I5PA 3G7YA 2NVLA 3QPMA 4EKZA 2F8AA 2XONA 3OBAA 5DN2A 4HU9A 3ZM8A 4F0BA 1JHBA 2VM2A 5C70A 2HE3A 2Y6JA 3CZJA 4FYBA 5ABRA 1OC9B 2A4VA 5B8BA 2W1UA 1CX1A 4OYUA 3K4DA 1GTIA 4MADA 3CSHA 3LEIA 4XUNA 1FB0A 2DC5A 1R7HA 1MD3A 4BXSV 2CV4A 4ILFA 3ABZA 1I5GA 2DCKA 3MV01 3CTFA 1MEKA 1T4ZA 5INYA 1GTUA 5D9XA 2H0GA 5JCGA 5EPFA 4LL1B 3K75B 1WPIA 1PX3A 3MDKA 2VO4A 2AJQB 1BYEA 3VDBA 3C1SA 2C0FA 4L0PA 2B1KA 2MMNA 4OO4A 9GSSA 2D2ZA 4HQZA 2W46A 3UVTA 2YWOA 2EC4A 5JCWA 2WBKA 2W95A 3G9BA 1XNTA 1XOAA 2GSQA 3ZMLA 2P31A 4TXOB 5ECLB 4NV2A 2RJ2A 2LTKA 5IPGA 1A0FA 3VI7A 1SKRB 3A2XA 2IMFA 4ZB8A 2EIOA 4MF5A 4WBJA 3GX0A 5LD0A 2XHNA 1GLPA 4ZILA 3D4MA 1U3AA 1NSWA 5CNWA 5ID2A 5H5SA 4DUWA 3THCA 4WKWA 4CUCA 3M8NA 2FWHA 1JYWA 3WF3A 2YJ7A 4PNFA 3M1GA 2H01A 4I2TA 2A2SA 2O7KA 3LPFA 2LEGA 2CZ3A 3QR6A 4A44A 5DALB 2Y6HA 1EEMA 2WUHA 5ECPB 2XBQA 2ZXQA 3DIEA 2VCTA 3C7EA 1XOBA 3FL7A 3IBHA 3IDVA 4KWUA 5J5NA 5B4NA 2RUFA 5DVBA 2C0EA 2IFQA 4J57E 3TKRA 4CUAA 2PBJA 4OMDA 2VMFA 3LXTA 4H86A 2GSTA 5JMOA 3M0FA 1O8SA 2AHEA 2LNSA 4KDYA 1BQ7A 1SDDB 1MD4A 2B5YA 3O76A 3ZVJA 4PF1A 2L9LA 3MAKA 5DQSA 1GMMA 2KHPA 4QDQA 3HDCA 2VOTA 2VQUA 1OC9A 3UAPA 1PMTA 2OADA 1U3IA 2ON7A 1LBKA 4MF6A 4MCUA 1WRYA 2RV9A 1A2JA 2E2GA 1TRVA 2Y8KA 3GYKA 5KN0A 1NKGA 3IAQA 2CVBA 2JADA 1FO5A 1WIKA 1H75A 4Q5FA 1DYOA 2CX3A 1F3AA 2PPTA 5IFTA 1A24A 2H76A 3GKNA 3TCOA 3U6VA 2X99A 1L7RA 4E8CA 3FR9A 1G0TA 3SEPA 2OJLA 1U88A 2PVOC 2WDUA 3HNYM 5KN3A 3ISOA 1UYXA 4OCEA 5DDLA 5IFPA 1U87A 5A4WA 2KLXA 5ECHB 2HLEA 4RQXA 3TKSE 1A23A 1J84A 2EIRA 5IYYA 4TXOA 1K0BA 2W1SA 1O6JA 2VC9A 2F9SA 4MJEA 2Y6KA 1R5AA 2V4VA 5HFKA 2J1EA 5C04A 2HNLA 4ZXGA 5IHRA 5IM9A 4F03A 2VCAA 1YF1A 3UMAA 3T0DA 2WQ8A 2W94A 5IO0A 1JYNA 2LW8A 1GOGA 3VURA 4PQHA 1PN9A 3GH9A 2GQLA 4WXTA 2BTOT 5ECRB 2WZ8A 1JZRA 4HQSA 1K3OA 3DXBA 1OF3A 1OKTA 4ULXA 2H71A 5LCZA 4GF0A 4TXVA 3GKMA 5DALA 2C4XA 1QXHA 4ID0A 3OGVA 4OFTA 2ZEZA 4NAXA 3LJRA 2CAQA 5L71A 3HVXA 4RI7A 4CU7A 2CAIA 4KCEA 1ST9A 1TP9A 3UJ1A 6GSUA 4FYCA 2R3XA 2YV7A 4ZY9A 2DJ3A 3MNGA 2B5XA 2KOKA 5D96A 3F3RA 1AUCA 1GNYA 3RAZA 4AJ8A 3JXSA 2VIMA 1UMHA 4YAVA 1K3YA 4J2FA 2B3SA 5GAND 2J7MA 2N5FA 3DD3A 4TKYA 1A0RP 3RPNA 3I69A 2KP1A 2L4QA 4FO5A 2GGTA 2VMDA 4IP6A 1HN1A 3GH6A 4M4RA 2AYTA 2NTOA 2QQNA 6GSYA 2WN3A 4JX0A 3V1WA 3ZRDA 5DBQA 4XHMA 3RDWA 4CW9A 2PMTA 3HD5A 2VCQA 1V98A 4YQVA 2XPDA 3WGXA 2PWJA 4ZB6A 3C7GA 4OFNA 2W87A 5ECOB 4HI7A 4Q5NA 3U5RE 3DYPA 1USBA 2QBXA 2H73A 1TRSA 3F8UA 3GA4A 2OE3A 3TKQA 4IS0A 4KUNA 3DWVA 1Y6EA 1D7PM 1GSYA 2W3JA 1B9XC 1K0CA 1CZTA 1E2YA 2Y6LA 4TR1B 3LWAA 5HPOA 4KB3A 3LORA 2X8GA 4E8HA 1SKWB 2W1QA 2H6ZA 5B7CA 2YNXA 1K3IA 4JKKA 4A4AA 3WQBA 2VCVA 1QGVA 2FY6A 1XFLA 2VCWA 1GQPA 3M3MA 2DSAA 1GUKA 3APQA 4PXOA 4ZL8A 5A5KA 2EIEA 3DKSA 1R4WA 3OGRA 4DUXA 1F37A 2HZEB 4TR3A 1OE7A 1RK4A 2B4KA 1UA5A 1QK8A 3APOA 1XNAA 1DE2A 4HEA2 1K3LA 3WNMA 2QKEA 3IC4A 5EIYB 4P08A 1M2DA 4BWQA 2OE0A 2J1UA 6GSXA 2LS5A 4NHZA 2WS2A 1OKDA 2YZHA 4NWYA 2ORXA 5ELAA 1PMHX 2I9HA 2L59A 2JZSA 5H5RA 3T09A 3SKJE 2O8VB 3T2QA 1JZ4A 2X05A 3FZAA 3F6FA 4EDYA 3GTUB 5D9TA 5KN2A 1EEJA 5IMFA 3LYPA 2J1TA 1LJRA 3ECQA 4V2LA 1O73A 4KSOA 4HJ2A 3PR8A 1K0OA 3P8WA 5IO2A 1PA3A 3A23A 4GWJA 16GSA 3VK9A 3I2JA 1IYHA 3A22A 4MZWA 5IMAA 2CVDA 3QD9A 1W4VA 3GL3A 4P00B 4JHZA 1YKCA 5D9WA 3I3EA 1VRSD 2JE8A 5JXJA 2QQKA 4K0GA 1GULA 3EMXA 3UIWA 1AIUA 1WP0A 5CREA 2J1SA 3IB3A 3FEUA 3GX8A 2CX4A 1TOFA 2CZ2A 4K8MA 1KBNA 1RW1A 1VGLA 3GDBA 4F0CA 2FWFA 1AQWA 3D22A 3C1RA 2K9FA 5HR2A 3TDGA 5LNKe 4GXZA 1YQ1A 3DVXA 3O3TA 4TR1A 1T2XA 2HYXA 2LNTA 2ZUPA 1T3BA 2B7JA 3ZIJA 2XC2A 4WF5A 2YC4A 2HLSA 1ZL9A 5AGYA 2C1YA 4GQCA 4OMVA 1JZDA 4GZ9A 1T1VA 3APSA 5HR0A 4POLA 1VF2A 1EP8A 4MPGA 2E31A 1XIYA 4G2EA 4EL1A 4RQRA 7GSSA 2VL2C 4EO3A 2YWIA 4Z7XA 2MMZA 3FHAA 5DPNA 2KUCA 3HOBA 2M72A 3HPNA 2HZEA 4HS1A 1O85A 2IWTA 5D8IA 1HNBA 1N2AA 4ML1A 4KNDA 3A7QA 4E8DA 4PQIA 3CTGA 4MJBA 4EDZA 2X8CA 4RN5A 5IJRA 1J9BA 3HKRA 4YQUA 4QQ7A 3TJJA 1FVJA 3OEAA 10GSA 1NUKA 5CYYA 2FNOA 1ABAA 1W8NA 3CQOA 2E0QA 2AV4A 3ERGA 1TU8A 1UZ0A 3TJBA 3NRUA 3I2IA 1DSBA 1XWGA 3LQCA 1EGOA 3C8XA 1GSDA 3QMXA 3GTUA 2BBAA 1A2LA 4POMA 1XWAA 2RVAA 3BCKA 2YANA 2JKXA 5G5EA 1E6BA 5JWOB 3HNMA 4DSRA 5B6MA 3UEMA 5FWGA 5KN1A 2JZRA 3VD3A 3ZVJD 2RIIA 2WRTA 2IN3A 3M9KA 4BVXA 2VL4A 1C72A 1XWCA 4FI9A 1Z6NA 1ACVA 4ZIJA 5ECKB 4XRAA 1O8WA 3D21A 2CQ9A 2W9XA 4PQQA 3TUEA 1L7QA 2C26A 1YKAA 1M9BA 2ZCTA 3DECA 3W8SA 1SD8A 4MPFA 2VR4A 3LXZA 1I9DA 1THXA 4BA7A 2ZEWA 1BX9A 4DVCA 4CU8A 1UX7A 5G1LA 4XTSA 2FHEA 2VL9A 1MTCA 2V72A 4XUOA 1NM3A 4ECCA 2FA4A 2H30A 5A4UA 3TOUA 4UI9L 2WJUA 1BEDA 3EE2A 5A4VA 4XCSA 3L78A 2LJAA 3CKHA 3WNLA 4RUVA 2OACA 2FCHA 5JWQB 3O6TA 4I97A 2F8FA 4MGQA 1G7OA 4CU6A 3BJ5A 2WAOA 2PN8A 2HT9A 1GLQA 3F6DA 2W1WA 3DYMA 3HEIA 3L9SA 3TJGA 1R64A 5JXHA 1UXXX 4F82A 1ON4A 1EV4A 1FOVA 2W5FA 3ME7A 2GTUA 4N0ZA 3TJKA 3T08A 1XWBA 2I1UA 1YEPA 5JUVA 3IV4A 3HZ4A 4LHSA 4W4ZA 2I3YA 1M7TA 1UY2A 2X09A 4YQMA 3HZ8A 2VTFA 3I2HA 2WDBA 3I3BA 1EOHA 2FA8A 1X9WB 2PUKC 2H6YA 2DIYA 1G6WA 1O8PA 1GNEA 3F2ZA 1P8JA 5CRWA 5B4XA 5G1KA 5D9VA 3IRAA 3P90A 3W8JA 4BPYA 1SYRA 3D6IA 1PGTA 3FR6A 1BJXA 1SG3A 1CZVA 1PD21 4PUAA 3HCZA 2V32A 4MZCA 4N11A 3I2GA 1G7EA 3PINA 4O32A 3E9JB 3UL3A 1G6YA 2V2GA 1JZWA 1H4OA 4GLTA 3HY2A 3IPZA 4MGSA 1FHEA 1O59A 4YAPA 2N5AA 2X10A 5IIZA 4P02B 4GTUA 5CRGA 2E33A 4DSQA 1ERUA 1SJ6A 1UY4A 1J0FA 1GUHA 1ZGNA 3OG2A 1M2AA 1GSEA 4MABA 3PUHA 3F4TA 4WR4A 2IMDA 4IKHA 3ERWA 4JR4A 3ZLPA 3TGZA 2O85A 1YY7A 1CQHA 3IXRA 1DLCA 2DMMA 4WR5A 4OCFA 2GS3A 1KEBA 3LPGA 1O7UA 3DVWA 3K8NA 3TRXA 2L6DA 3ZYWA 2XQXA 3ZIVA 1W9WA 4IQAA 1EOGA 2H70A 4MLYA 2P0GA 4CHSA 3KEBA 5IMZA 1GL8A 3ED3A 1S3DA 1TK5B 1X0RA 2IMIA 3ZREA 2DJKA 5HXMA 2GZZA 4CVUA 3H8QA 1TRUA 4IGJA 1UY0A 1LNSA 3ZFLA 3L4NA 2VLTA 4TVEA 2YN1A 3SEEA 1S3AA 4I8BA 2ZEYA 1WE0A 14GSA 3CXGA 4LLRA 2JU5A 2O89A 2BMXA 4HUAA 4I2UA 2L5OA 2FUG2 2KP2A 1EWXA 3WNKA 1CZSA 2E32A 1B9YC 3TOTA 2N5BA 3D4TA 3K46A 3S9FA 2ALBA 3GSSA 2LRTA 4ZL7A 1ZYEA 1FG4A 1RQMA 4ZBBA 4ET7A 1FW1A 4UOJA 2R7EB 3H1NA 1A8YA 1RYYA 4QX1A 3C7MA 4O7HA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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