3BCIA

Crystal structure of staphylococcus aureus dsba
Total Genus 62
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
165
structure length
165
Chain Sequence
GKPLVVVYGDYKCPYCKELDEKVMPKLRKNYIDNHKVEYQFVNLAFLGKDSIVGSRASHAVLMYAPKSFLDFQKQLFAAQQDENKEWLTKELLDKHIKQLHLDKETENKIIKDYKTKDSKSWKAAEKDKKIAKDNHIKTTPTAFINGEKVEDPYDYESYEKLLKD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Disulfide bond protein A
publication title Staphylococcus aureus DsbA Does Not Have a Destabilizing Disulfide: A NEW PARADIGM FOR BACTERIAL OXIDATIVE FOLDING
pubmed doi rcsb
source organism Staphylococcus aureus
molecule tags Oxidoreductase
total genus 62
structure length 165
sequence length 165
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-11-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3bciA00
1G0TA 5EY6A 3HD5A 5ECIB 3FRCA 1X0RA 1NW2A 1KTEA 2K8VA 2O87A 1I9DA 4OO4A 5ECNB 1T4ZA 3ZMKA 4OWYA 2K18A 1WE0A 2H70A 1G6YA 1M2DA 3NIVA 20GSA 1O8WA 1UN2A 3E3EA 4QQ7A 2HSHA 2OACA 3GKMA 1V57A 4NAXA 3TRXA 3KGKA 2IMFA 3F4RA 4JEDA 1B48A 4XS1A 3ZFLA 2M80A 5ECPB 1JZDA 5HR3A 1PA3A 2IN3A 3GX8A 2LQQA 3FKFA 3ERGA 1F6MC 1C72A 2IJYA 1K3OA 2IMKA 2O89A 1SENA 4PX1A 4XIHA 4MMMA 2DJ1A 3M1GA 2GGTA 1BEDA 3IK9A 2AUVA 3CSJA 4IHUA 1YJ6A 4KDXA 4G10A 4Q5FA 3HJPA 5JCUA 1TOFA 1RK4A 4EUYA 3DD3A 1MDIA 1M2BA 1U88A 2MBTA 2OBKA 1GUMA 3HVSA 5H5RA 2WB9A 1ZZYA 1S3AA 3GUSA 3UVTA 4TR1B 4V1Ap 2GQMA 3FZ5A 4CW9A 1YKCA 5IPHA 3GV1A 3TJFA 4LMVA 2PU9C 4AF2A 1J0FA 2REMA 1EGOA 1EOGA 1AW9A 2DC5A 1GTBA 5KEJA 5HR2A 3DMLA 1EP7A 2LV3A 2H8LA 1SJIA 2KLXA 3TGZA 2FWFA 4PUAA 4CDOA 2GZPA 4MJEA 3VWUA 5IOWA 1J08A 4ML1A 5DVBA 5J5NA 3F3QA 1A23A 1K0NA 2NDOA 3GX0A 2C80A 4TOPA 1URMA 4ZL7A 1B8XA 2J23A 2M46A 1F9MA 1S3CA 2C0FA 3TJGA 2JL4A 2ON5A 3HXSA 4EC0A 2L4CA 4KB3A 5DDLA 4HU7A 1Y25A 1NHOA 3D22A 2PPTA 2XBIA 1QQ2A 1R5PA 4HDEA 1M0UA 4JZQA 3IBHA 3IR4A 2VCTA 5H5SA 4K0NA 5HQPA 3KCMA 2YWIA 4K2DA 5KN0A 5J3RA 5GSSA 2Z9SA 3IHQA 4V1Ag 3E9JB 3ZVJD 2V1MA 3F0IA 3ISOA 1EV9A 1SU9A 3NOFA 3GFKA 4FYBA 1AAZA 4DEJA 3R2QA 1TK8B 3IPZA 1PL2A 5DJLA 3UEMA 3QFBC 2I9HA 5CRHA 3W8SA 3DVWA 1K0DA 1XIYA 3HCZA 3FZ9A 5AN1A 2EC4A 5IPGA 4XRAA 3BOAA 2ZUPA 2NTOA 5GAPD 3LXZA 2PWJA 3HHVA 2IIYA 6GSWA 4IVFA 4EL1A 2C0DA 3W8JA 1XOAA 3VPQA 3PINA 5JCGA 3KTBA 2H1BA 4GQFA 4N11A 1GSEA 3I6AA 3A5WA 3EU3A 2FD3A 2FCHA 2IFQB 2A2RA 3LEFA 2CQ9A 3RAZA 2GSTA 3LJRA 3RPNA 2C0EA 6GSVA 2HLSA 3GIXA 3EVIA 4MJCA 3TOTA 3VI5A 2YP6A 1I5GA 1OAZA 2XBQA 3ERFA 5IMZA 3GYKA 2VL2C 4ZB8A 4V2MA 5H5QA 3EURA 1BYEA 2VL9A 4JU5A 3LGCA 17GSA 2EIOA 2HYXA 2LRNA 1EEMA 1SJ6A 2FWGA 2NBSA 4GLTA 2JSZA 1XWKA 3TOUA 1XPVA 2WFCA 4TRXA 4JR6A 3C7MA 2XHFA 1R5AA 4GSTA 3KP8A 2B5YA 4HQSA 1RQMA 1JLVA 4J2FA 3ZFBA 1KNGA 2YZUA 3ZIJA 4I8BA 2LRCA 1SK0A 2IL3A 1K0CA 4EKZA 3EU4A 2AHEA 5JWOB 2QC7A 1A2MA 3EE2A 1XW6A 2L57A 3ZZXA 2E0QA 3NZNA 1S3DA 4IS0A 3HJMA 4J57E 4GXZA 5C04A 5F06A 2GDRA 3BCIA 1GP1A 3O76A 4IQAA 1KBNA 1V58A 3MWHA 3TJJA 3HA9A 1O8XA 4BWSA 1HNCA 3ZL5A 5G5FA 3LYPA 5J9CA 1ILOA 3TCOA 2RM5A 2RM6A 1ZYQB 1SYRA 1MD3A 5A5KA 4Q5QA 2LJAA 4TXOA 3DEXA 1T4YA 1GNEA 3ZLPA 3D4TA 4KA0A 3KIJA 4DSSA 5CRDA 3DXBA 4ZILA 2KP2A 1BJXA 4MH2A 3C73A 1K3YA 1FVKA 4YAPA 5IMDA 1TRVA 5DJMA 2GZZA 2XPEA 3UIWA 4I5QA 3EMPA 1H75A 4K7NA 3GSTA 2DBCA 1SK1A 4FIWA 2K9FA 1A0RP 2R2JA 2WGRA 2IMIA 3FR3A 2H76A 2YN1A 3MSZA 4X43A 1WMJA 4PNFA 2HXKA 5J9BA 4MDCA 4Z7XA 3UBKA 2O85A 1GLPA 1TU8A 3FZAA 3F4SA 3GL3A 4PGTA 1XFLA 1ERUA 4MJBA 1OE8A 2FY6A 2N5BA 5ECMB 2FA4A 2WRTA 1AXDA 1PMTA 1VGLA 1TRUA 3P90A 4JE1A 4IJIA 1GSFA 2MMNA 3RDWA 1ML6A 3GKNA 1XOBA 2V32A 1HYUA 3QCPA 2HRFA 3US3A 1GL8A 3G9BA 1LJRA 1M99A 3D4MA 3MDKA 3ZMLA 4ZB6A 5L71A 2PGTA 3IA1A 4AJ8A 4MZCA 1GTUA 1USBA 5J41A 4POBA 3MNGA 4JR4A 1EOHA 4HJ2A 3CTGA 3Q18A 3DRNA 4GTUA 4KUNA 1ZL9A 2PUKC 3U6VA 3IRAA 2X8CA 1HD2A 4I2TA 5IMCA 1O6JA 3ZITA 1UA5A 3UARA 1QMVA 1GSQA 3KM6A 3ZYWA 4NMUA 2VM1A 4Q5NA 1VF4A 2GT6A 3WT2A 2YCDA 2CVDA 5D9TA 2VCVA 5G1KA 2JACA 2DSAA 4TR0A 3QAWA 1IYIA 1XW5A 2YNXA 2CAQA 4EVMA 5EL8A 4K7IA 2PBJA 3EC3A 11GSA 1DBYA 3VWVA 3QAGA 5IIZA 3FHKA 1AIUA 3BJ5A 4L0UA 2FNOA 4GCIA 1J9BA 1OC8A 2JU5A 2B7KA 4TXVA 4GWRA 5HFIA 4EXJA 5DAKA 4KDYA 4WKWA 2X8GA 4NHZA 1PSQA 2N5FA 2H75A 4EO3A 2V6OA 5FWGA 2H66A 3KH9A 2C0GA 5E59A 1ABAA 2L6DA 1DUGA 1EP8A 2VCXA 2M72A 2VLVA 4KH7A 4OD7A 4MJAA 4NPBA 1OVNA 4O7HA 2F9SA 2LJRA 2YJ7A 1HQOA 3QFAC 2DIYA 4HEA2 2HRNA 5DALA 5ECOB 3C1SA 5IMFA 2VOCA 5ECLB 2DMMA 4YH2A 5B8BA 5GZZB 1GTIA 1X9MB 2YPMA 3PH9A 3BCKA 1TXXA 4WETA 3Q74A 4TXOB 2DMLA 2VD1A 4IN0A 5D96A 4E8EA 3QR6A 4TW5A 4DSSB 3AY8A 1ON4A 2OKAA 2MMOA 3RPPA 3KMOA 1DE2A 3HVVA 1KEBA 3RHCA 3CMIA 3DKSA 4X1UA 4TR3A 2YWNA 1M2AA 2QSIA 5F07A 5GAND 3CSIA 1O81A 5G5EA 1X5DA 3TJKA 2CAIA 3DVXA 5LD0A 1SKSB 4ZBDA 1R26A 4MABA 3BBYA 3UBLA 19GSA 2OA7A 4IELA 2RUEA 5D9WA 2LTKA 2O8VB 4DSQA 1V40A 3HY2A 1A8YA 4ISDA 4RQRA 2VL3A 2YZHA 3RHBA 1BX9A 2E2MA 6GSSA 1NM3A 2LEGA 2GS3A 2OE1A 4KCAA 1FAAA 2B1KA 3GSSA 1ZYEA 1LBKA 3LG6A 3TRPA 1JLWA 4LLRA 4QL7A 1H4OA 4KNDA 2DJ2A 2P31A 2MYGA 3TKRA 1YY7A 2H71A 1AC1A 3I9V2 4HOJA 4YQVA 3A2VA 3FZ4A 2WS2A 3M8NA 2NPBA 3VFIA 1E2YA 1GUHA 1GUKA 4BL7A 3HVXA 5CO3A 4E8HA 2L59A 1U3AA 5CREA 1TI3A 5G2ZA 5CRWA 3GN3A 18GSA 3GMFA 1F2EA 3O6TA 3G7IA 2D2ZA 1YZXA 1SKRB 4MP4A 5ELAA 4IP1A 2H30A 1W89A 5ELGA 3GURA 4L5LA 1UVZA 3DYRA 4MH3A 2VLUA 2H0GA 1A2JA 3HDCA 4MCUA 4HJMA 5CYYA 3ZIVA 1JFUA 4K8MA 1E6BA 2HT9A 4TKYA 2AJQB 2P5RA 4ZL8A 1GTAA 2KUCA 4X0XA 2H1DA 1YF0A 1N8JA 3KD0A 1TU7A 4JRRA 3FEUA 3L9SA 2DIZA 1FO5A 1Z6MA 2G0FA 5AIXA 4RQXA 3QOUA 4L5OA 4TN8A 3L78A 2GQKA 2OJLA 1XZOA 1MDKA 4IP6A 3P7XA 5EPFA 3LFLA 2AAWA 2LNTA 2C4JA 2YV7A 1IYHA 3OR5A 4HZ2A 2MZCA 4MLYA 3LSZA 4POLA 1XXUA 2ZNMA 3KZQA 3EMXA 3HKRA 2I4AA 2H6ZA 1V98A 2P5QA 1GSUA 4HUAA 4V2NA 2BTOT 2ES7A 3LQ7A 1EV4A 2ZCTA 4F03A 4NV5A 2CVKA 1SKWB 1N2AA 4ILFA 1XVQA 3LXTA 2VCWA 3APQA 4RUVA 4GSNA 2JADA 4ECCA 1SL0B 3CYNA 3KTLA 1RW1A 3ZREA 3F6DA 1OE7A 1GSYA 3VPTA 4PQIA 2H0IA 1F3AA 1TI1A 2H74A 3J7Yk 5DALB 2H6YA 2E2GA 2F3MA 1QUWA 4RI7A 3KJYA 4HU9A 3VURA 2H6XA 4F9ZA 3TUEA 3ME8A 1MD4A 2AYTA 1EEJA 3A2XA 2CVBA 3TKSA 2IPAA 3F8UA 3FK8A 2DLXA 4F0BA 4V2LA 1LU4A 2N5AA 1B9XC 3LORA 5G31A 4ZXGA 1O73A 4NWYA 2BMXA 4EE0A 4K6XA 5IMAA 5AGYA 4OFMA 2LSTA 4PUFC 3ERWA 4WBRD 1X9WB 1WOUA 2PMTA 4YQMA 3D6IA 1TW9A 1WPIA 4KE3A 2WJUA 3EYTA 3UOMA 3H8QA 4TR1A 4K1FA 4XS6A 3APOA 4IW9A 4K9ZA 2A2SA 4YAVA 2I81A 2FA8A 3EINA 3KH7A 4G9HA 3DWVA 1JZWA 5ECQB 1YKAA 3F9UA 4O32A 1XCCA 2WZ9A 5EVOA 1Q98A 2GSRA 3GTUA 1G6WA 1K3LA 2H73A 2YWOA 1XWAA 3GL5A 3GH6A 4WBJA 2JZSA 1PGTA 4ZBAA 3VWWA 1PX7A 12GSA 4YQUA 3VI7A 5D93A 1MEKA 9GSSA 3QAVA 2R4VA 1SYXA 3RBTA 2DJKA 4Q5RA 1U6TA 2MMAA 3TKQA 3UJ1A 2OBIA 5KN2A 1NSWA 2PVOC 5CAXA 1X9SB 2GZYA 1THXA 2B6MA 3H1NA 2B5XA 2B1LA 3HZ8A 3CRTA 2VUPA 4KGIA 1BG5A 5J4UA 2CZ2A 4IKHA 2KHPA 1EWXA 1YDKA 2VCZA 4OCEA 2VO4A 4FH8A 2FWEA 5LNKe 5GSTA 4MF7A 3ZVJA 4OCFA 1Z5YE 1ZGNA 4MZBA 3GKXA 5IO2A 5HFGA 1JZOA 1T3BA 1VRSD 1V9WA 4J56E 4ECJA 4TR4A 1GULA 3WD6A 2VCQA 4BVXA 4G2EA 4KSMA 3KEBA 4AGSA 4ULXA 5JWRB 2VD0A 1PKWA 1PL1A 1PN9A 4ZL9A 4HI7A 4PQHA 2CX4A 6GSXA 1Z9HA 1GSDA 2FWHA 2LUSA 3WGEA 5B7CA 3L9VA 5IMVA 3F63A 1TRSA 2IMEA 2L4QA 1T00A 4POKA 3IV4A 4OFNA 5C00A 3K8NA 4LMWA 2XC2A 2I3YA 5HR0A 1PX6A 2PN8A 2RUFA 3ZTLA 3TDGA 1THOA 1BAYA 1WP0A 2L5LA 4AJ7A 4ZIJA 3L9UA 2X64A 3TRQA 1U87A 3VWXA 2FUG2 3FW2A 3C8EA 4FYUA 2JZRA 3H4KA 5B6NA 3J7Yb 1GRXA 16GSA 13GSA 1QGVA 1TRWA 1ZOFA 5DQSA 2HI7A 1B4QA 2ON7A 1T7PB 4DVCA 3ZRDA 3E0UA 4FYCA 1BQ7A 1A24A 5DQYA 1A2LA 5JWQB 1W4VA 2V41A 1ACVA 1M9BA 3Q19A 3LWAA 4WR5A 3TB2A 3P8WA 1OC3A 4PQ1A 5CRGA 2GQLA 3FR6A 1DE1A 2LRTA 1CQGA 4NV2A 5COHA 3QDNA 2G2QA 1VF2A 2VM2A 2YJHA 5LCZA 4XS4A 3PR8A 7GSSA 2H19A 4H86A 1F37A 2R37A 2X8HA 2EIRA 3QPMA 2C8UA 3QD9A 3QMXA 2FHEA 1GLQA 2VIMA 2MMZA 4POMA 4OO5A 1TDIA 1NHYA 1VF1A 5D73A 5FHIA 1OC9A 4GSSA 5A4UA 2H0HA 2HZFA 2H1AA 1SL2B 1WJKA 4JBBA 3FYGA 4MF6A 2V2GA 3VK9A 3IE3A 2TRCP 2DJ3A 4TVEA 2F8FA 5F05A 1XVWA 4KX4A 3F6FA 4CHSA 2GVPA 2JZTA 2CV4A 1A8LA 3V1WA 2YWMA 4EDZA 4PNGA 3UVHA 2VAFA 1GH2A 1QK8A 3CSHA 1M7TA 4P3YB 3M0FA 4I2UA 1F3BA 4BPYA 3HZ4A 2XPDA 2LJKA 1TTZA 2WCIA 4I6XA 3EWLA 1CQHA 4K7OA 1SD8A 3M3MA 4D73A 3GTUB 3LYKA 3P2AA 1MTCA 3TKPA 2KOKA 4DSRA 1ST9A 1TJDA 4EF0A 1WRYA 1XWBA 1ERVA 4MPFA 1XBSA 1AQVA 5IO0A 1TKDB 4XCSA 2RIIA 4RI6A 5ID2A 3WYWA 2GSSA 1Q4JA 1OKDA 3WGDA 3DIEA 2F8AA 1K0BA 1SL1B 6GSYA 5IM9A 4IBPA 5IOXA 2H01A 4L8EA 1X5CA 2AV4A 2V6KA 3O3TA 5A4VA 5JCWA 3VLNA 2C1YA 5DCGA 1K0MA 3IDVA 5ECHB 1FVJA 2FGXA 4IQ1A 2DJJA 1Z7PA 4EDYA 4KCEA 1G7EA 1FOVA 4GQCA 2YV9A 2CT6A 2K8SA 3M9JA 3L4NA 4ECIA 4QL9A 1DSBA 1T8EB 1PQNA 3Q6OA 3SWLA 3D5JA 1PD21 5G1LA 1EZKA 3BD2A 2H1GA 2OE0A 4WR4A 4HQZA 5ECRB 1VF3A 3C71A 1PKZA 2VL2A 2JSYA 1FG4A 1AQXA 3G7JA 3I43A 4MK3A 4WF5A 4NHWA 2DJ0A 4ZBBA 1M9AA 5HFKA 1XW9A 5CNWA 2PERA 4AJ6A 4IJ3A 2TRXA 3IXRA 2CZ3A 4GRFA 5AIVA 3KXOA 3GKKA 4HZ4A 3SBCA 4XRDA 3F4TA 4O92A 2HZEA 4IGJA 1Z7RA 1AUCA 4KSOA 5HR1A 2LNSA 2YANA 2VLTA 4G19A 1TP9A 4BWQA 1PRXA 4LA1A 1ERWA 3JCML 1GWCA 6GSUA 2TIRA 3UMAA 4F2IA 2P0GA 3WGXA 3C1RA 4KAEA 1O85A 2QKEA 3L0HA 4LL1B 5B6MA 2LKUA 5DAKB 22GSA 2B5EA 2NVLA 1FB6A 4HS1A 3S9FA 1UC7A 2H72A 3GA4A 2OADA 5D9XA 2O7KA 2GT5A 3IAS2 2B3SA 1X5EA 4XS4B 2YOIA 2C3TA 2BJXA 5DCHA 4BVYA 5KN3A 5E4WA 2C3QA 2IWTA 2HSYA 2HFDA 1B9YC 1Z6NA 3CXGA 2FLSA 1OC9B 4L0WA 6GSTA 4N0ZA 2GSQA 4ML6A 3GHAA 4N0VA 1ZMAA 5ENUA 1SJZA 2IMDA 1G7OA 5INYA 3H79A 4PURA 1SK2A 3W6GA 3A2WA 1EGRA 3CTFA 1U3IA 1MDJA 1HNBA 2R5GA 2QGVA 3H93A 1SD9A 3M9KA 5D9VA 4WXTA 3D21A 5F8BA 1WIKA 2R3XA 1JZRA 3IAM2 3N5OA 4MF5A 2KP1A 4F0CA 2C3NA 1FB0A 3ME7A 5KN1A 4XTSA 4PXOA 5ECKB 4F82A 1OKTA 4NXIA 5B8AA 3ED3A 2WULA 3TKSE 4D73B 2EIQA 3PGTA 2GTUA 3GRXA 1O7UA 3CRUA 1WWJA 3F3RA 5CP1A 3U5RE 2HE3A 3HJOA 1T1VA 1TK5B 5A4WA 3DGQA 1YQ1A 2R6KA 10GSA 2CA8A 2LS5A 3FY7A 3KMNA 1K0OA 1JHBA 3KP9A 1V2AA 4K0GA 4KW6A 3I69A 5ID2B 1XWGA 3TKSC 3UAPA 1Y6EA 1R7HA 1B4PA 4KDUA 4ID0A 8GSSA 1QFNA 1YF1A 2ALBA 3A3TA 4BA7A 1HNAA 1K0AA 3FR9A 5FT3A 4OFTA 1TK0B 5F0GA 4I97A 4MZWA 2GLRA 3WT1A 2F51A 3N9JA 4MA9A 5ABRA 2HNLA 4FO5A 14GSA 2B7JA 2J9HA 1YEPA 4N30A 2I1UA 4WEYA 1YEXA 5AISA 1OYJA 3G7YA 3UL3A 3IOSA 2CX3A 2PVQA 1GNWA 2X99A 3CBUA 1FHEA 3APSA 4LL4B 2LQOA 4OMVA 4WF4A 2E7PA 2RLIA 5D8IA 4ACSA 2HZEB 2MBSA 2L6CA 1Z3EA 2K6VA 1AQWA 4XHMA 1GSSA 3GNJA 1A0FA 3GH9A 4N10A 2OE3A 1FW1A 4GF0A 4ECBA 1XWCA 4O5RA 3HYPA 2L5OA 5ECSA 3TJBA 1ERTA 1ZCPA 3MAKA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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