1H75A

Structural basis for the thioredoxin-like activity profile of the glutaredoxin-like protein nrdh-redoxin from escherichia coli.
Total Genus 21
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
21
sequence length
76
structure length
76
Chain Sequence
MRITIYTRNDCVQCHATKRAMENRGFDFEMINVDRVPEAAEALRAQGFRQLPVVIAGDLSWSGFRPDMINRLHPAP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords GLUTAREDOXIN-LIKE PROTEIN NRDH
publication title Structural Basis for the Thioredoxin-Like Activity Profile of the Glutaredoxin-Like Nrdh-Redoxin from Escherichia Coli
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Electron transport
total genus 21
structure length 76
sequence length 76
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1h75A00
4V2MA 5G5EA 4BL7A 1A2MA 1XCCA 4K2DA 5CRHA 4Q5NA 1DE1A 1SENA 4N0VA 1THOA 1TU7A 5KN1A 1WRYA 3HD5A 1SK0A 2JL4A 2MZCA 1V2AA 1ACVA 2H0GA 3TOTA 4IKHA 1H75A 4MP4A 4AF2A 5IMZA 3OR5A 5LNKe 3HCZA 3VWWA 3HA9A 1Z3EA 2H1AA 4BVXA 3ME7A 1XW9A 2M72A 1USBA 5ECOB 3H8QA 3C1SA 4MF7A 4TVEA 1A0RP 1OE7A 2R3XA 3TCOA 2L59A 4G2EA 2MYGA 4KDUA 4O5RA 2WGRA 5C00A 4K7OA 1K0OA 3BCIA 4FYUA 3RPPA 5DALA 3QAGA 5F07A 4ECIA 4O32A 1S3AA 2FCHA 4I5QA 4IS0A 3Q74A 5IO2A 4MCUA 2JSZA 2XPEA 1X5DA 4L5LA 5J4UA 4K7NA 4NWYA 3ZL5A 2BMXA 2OBIA 4HUAA 1TI1A 1OKTA 1PQNA 2PERA 1PN9A 2CVBA 4G10A 4TXOA 2KP1A 4PX1A 4GQCA 1XW5A 2C8UA 3IBHA 4MJBA 4DSQA 5CNWA 5IMAA 5COHA 3ZREA 3CBUA 3U5RE 5IMCA 2IMIA 4GQFA 2YCDA 4IJ3A 1Z6MA 5D9TA 5DJLA 4HI7A 1CQGA 3N5OA 2TIRA 1F3AA 3I43A 2K6VA 1J0FA 4X0XA 3QCPA 2CA8A 3FZ5A 2E7PA 1GUKA 1A2JA 3ZVJA 1Q98A 1C72A 2GSRA 1VF1A 5H5RA 1ZYEA 4POMA 1T4ZA 1GTUA 5GAND 2VM1A 5J9CA 1YEXA 2WJUA 5HFIA 3VWXA 1M9AA 2YJHA 3ZMKA 3O76A 5D96A 1EOGA 1GNEA 1EWXA 4MDCA 4I8BA 1Z5YE 5DVBA 2YJ7A 6GSTA 1T3BA 2K18A 3IE3A 4Z7XA 4JBBA 5CO3A 2FUG2 3TRQA 1G6YA 2AYTA 4HQSA 3KXOA 1OVNA 1M99A 4KDYA 2X99A 4O92A 5IQYA 4D73B 2JACA 2PVQA 2LJAA 1TK5B 3KTBA 1K0CA 3H79A 1GTBA 2YN1A 2VOCA 2F8AA 2P0GA 5D93A 2KHPA 2HXKA 3KH7A 4XS4B 4DSSA 4POLA 3G7IA 3IXRA 1GSYA 2WRTA 2HLSA 3HJPA 4TR0A 3RHCA 4YQVA 1VF2A 1OC9A 1FO5A 2PPTA 4L0WA 3KD0A 5CRWA 2GT5A 3C73A 4JZQA 4EKZA 1G6WA 1TRSA 4EUYA 2MMAA 2VO4A 5EPFA 1F3BA 3F9UA 2RIIA 1O7UA 4WF4A 4OD7A 1XXUA 4ML6A 2DIYA 1XWBA 3APSA 1QMVA 1Z9HA 2YWOA 4ZB9A 2IPAA 5G5FA 3PGTA 2B5EA 2L57A 4EXJA 3UARA 1G0TA 5G31A 1IYIA 4OO5A 5HFGA 1FB0A 3I69A 1PX7A 3M9JA 3W6GA 4L0UA 2CAIA 3A2WA 3RBTA 3D4MA 5LD0A 4KSMA 2OADA 5A4WA 2V32A 4PQHA 3GRXA 5FWGA 1G7OA 2PN8A 3I9V2 3U6VA 2C0EA 2FD3A 4AJ6A 3SBCA 1W89A 3D4TA 2PVOC 3F4RA 2C3QA 3F63A 1GLQA 4RI7A 3HVXA 5EY6A 2BJXA 4MH2A 3Q19A 2C1YA 4RUVA 3VPQA 13GSA 3F6FA 1ZCPA 2FA4A 1U3IA 3TRPA 4TRXA 5GSSA 3D22A 5DCGA 2MMOA 1YZXA 3UBLA 2GQKA 3FYGA 2LSTA 4MLYA 3I6AA 4LMWA 1Y25A 5AIVA 5ECPB 4MMMA 4WEYA 2N5AA 4TW5A 2VCVA 2CT6A 3EU3A 2AUVA 3ERFA 1XOBA 4YQMA 2E2MA 1A8LA 1MD4A 3KIJA 2FWFA 3ZFLA 3GX8A 4Q5RA 5JCGA 2GSSA 4IJIA 4ZB6A 1WE0A 2VL2A 3GH6A 1TJDA 3FW2A 2BTOT 4YH2A 4N0ZA 1TP9A 2IFQB 2LUSA 2HRFA 3DWVA 2EC4A 1QGVA 3QD9A 3Q6OA 5JCWA 1TOFA 2XC2A 1O81A 3MSZA 1EEJA 1TKDB 2P5QA 3EMXA 2IMFA 2H6YA 4JR6A 3FZ4A 3UVTA 2B5YA 3WYWA 5B8BA 1GSUA 1TK0B 3US3A 2VL2C 1PA3A 2VLVA 3H4KA 3TJKA 1GTIA 3N9JA 4HJ2A 4IGJA 3KP9A 1FW1A 2F9SA 2JZRA 2L5LA 4IN0A 2HE3A 2DLXA 1Y6EA 1XWKA 5HFKA 4OO4A 20GSA 1EP8A 3HYPA 3IOSA 2H66A 3DKSA 2GZPA 3GL5A 2WB9A 5HQPA 5EL8A 4ZBAA 2LEGA 1F9MA 4Q5FA 5IO0A 3DXBA 4PUFC 1I9DA 3ME8A 2ON5A 2VCWA 4NXIA 2WFCA 11GSA 2IL3A 2ON7A 4CHSA 1ZYQB 2IMEA 1KNGA 1Q4JA 3LG6A 5HR1A 1FG4A 2VCZA 1OKDA 1F37A 4FH8A 3FRCA 3ZMLA 4EDZA 5G2ZA 2GQMA 3D6IA 1X5EA 3KM6A 2O89A 2O87A 4DSRA 2CVKA 1O8WA 1RW1A 1E2YA 2DIZA 2KUCA 4ID0A 5A4UA 4X1UA 4TOPA 5IIZA 3TJGA 2YPMA 3EWLA 1JLVA 2O7KA 2IMDA 5IPGA 4TR1A 2V6KA 4V2NA 3C7MA 4PXOA 2DSAA 3HJOA 3ZLPA 1MDJA 2NTOA 3EU4A 3QPMA 3TJBA 2H70A 3CMIA 3IHQA 2C0DA 1OE8A 1A8YA 4J56E 1JLWA 4IW9A 6GSVA 3F8UA 2JSYA 2GQLA 3UJ1A 1O6JA 1DE2A 4PGTA 2DJ1A 1T4YA 3PH9A 1O8XA 4MJEA 4XS1A 2IWTA 2OACA 1N2AA 3IR4A 5HR2A 1F2EA 1YKAA 4F2IA 3V1WA 1PMTA 1WIKA 2IMKA 1HNBA 3QAWA 2KLXA 1B9YC 2GSQA 2VLTA 4OMVA 3S9FA 1M2AA 5D9XA 1YKCA 2ALBA 2R2JA 1SKRB 3VFIA 3TUEA 5DBQA 1K3YA 2KOKA 4LL4B 2LRNA 4NHWA 3IAS2 3QFBC 4XRDA 4MJCA 3G7YA 4OFNA 1SJIA 4OCFA 5H5QA 1AQVA 2VUPA 2YV9A 3NZNA 3EYTA 4YAPA 1SK1A 3GKXA 1PD21 2B1KA 5DQYA 4KUNA 1OC8A 3GKMA 2CQ9A 4IVFA 1U6TA 4PQIA 1R26A 3TOUA 1GLPA 4I2UA 1EGRA 1G7EA 3SWLA 4K1FA 2I4AA 5ELGA 4WETA 2REMA 1BG5A 5ECSA 3ZYWA 1X0RA 3DYRA 4WBJA 1ML6A 3FZ9A 3TJFA 2M80A 3TKSA 1PKWA 2VL3A 1GSFA 1TW9A 3LJRA 4XCSA 5JWQB 3L9VA 1M9BA 2MMZA 1J08A 4GTUA 5ECIB 4F03A 4KAEA 4V1Ag 2L5OA 2WZ9A 4IELA 4WBRD 4RQRA 3C1RA 4X43A 3TKSC 3M8NA 4MZBA 4ECCA 4NMUA 4GCIA 1OC3A 3TRXA 4NAXA 4GLTA 4FIWA 2VCQA 2CX3A 3FR9A 1BJXA 3VURA 5IPHA 1NHOA 4RQXA 4JR4A 4GSNA 4OFMA 2MBSA 1EZKA 3GTUA 3BCKA 2OE3A 3LXTA 2CX4A 3P8WA 1KTEA 2X8CA 1SK2A 1GSSA 3GV1A 4KB3A 4IP6A 3DVXA 2VCTA 1AUCA 3VWVA 2YOIA 1V40A 2ES7A 2GT6A 2DJ3A 2EIOA 3GHAA 3HZ4A 1HQOA 2F3MA 1YDKA 1X9WB 2E2GA 3ZTLA 2K8VA 2IIYA 4ML1A 1A2LA 5DALB 2LJKA 2GSTA 4KA0A 4ZB8A 2DJ0A 1ZL9A 1TRUA 1E6BA 2HRNA 3RAZA 2VLUA 4IQAA 2I81A 3ZVJD 3LSZA 4NV5A 1VF3A 1XW6A 3DRNA 1UC7A 3TGZA 4EVMA 5AN1A 1ERVA 4TXVA 4TXOB 4WKWA 5JCUA 1MTCA 3J7Yk 2B5XA 3FHKA 2FNOA 2RUEA 3EE2A 2B3SA 3EMPA 4F0CA 1UN2A 1OYJA 1MEKA 2DBCA 3GX0A 2YWIA 4KDXA 1GSQA 2J23A 2WS2A 2YNXA 1LBKA 1QFNA 2AV4A 2EIQA 4TR4A 4ILFA 3CTFA 2GZYA 2LV3A 1Z7PA 1T1VA 4K8MA 2LQOA 2FWGA 2H72A 2X8HA 3ZITA 2CZ2A 3GSTA 5H5SA 4JEDA 3GN3A 3DMLA 2VAFA 5CRDA 1DBYA 2H74A 3GH9A 1PX6A 3KJYA 3M9KA 3MAKA 4F0BA 4XIHA 4WR5A 3GKKA 4KGIA 2F51A 3ERGA 2DMLA 2V2GA 2V6OA 1V98A 2VD0A 5KN0A 5CAXA 1THXA 1GUMA 1R5AA 2ZNMA 2PUKC 2R4VA 3GIXA 2PMTA 4N30A 4GRFA 2B7KA 5DJMA 4K6XA 5G30A 4K7IA 4MZWA 1OAZA 5KEJA 4DEJA 1XWAA 1URMA 2NBSA 2H8LA 2LQQA 3KMOA 1QUWA 5F8BA 5JWOB 3HY2A 2H1DA 4GSSA 1LU4A 2QC7A 3UOMA 3TKSE 2DC5A 2HYXA 4Q5QA 2OBKA 4DSSB 3NOFA 1DUGA 2FLSA 2M46A 3ZIVA 2OA7A 2XPDA 1WP0A 22GSA 3UAPA 1OC9B 1J9BA 4LLRA 4F82A 4GSTA 4PURA 1XVWA 4KCAA 1U88A 4QL7A 4WF5A 1JZRA 1YJ6A 2C80A 4HEA2 1A24A 5D73A 3ED3A 4E8HA 1YF0A 1WPIA 2LRTA 1K0DA 2JU5A 4AJ7A 2H71A 2LKUA 1GULA 2H1GA 4V2LA 5GZZB 2JZSA 3AY8A 1K0NA 5ID2A 4I97A 4MA9A 2B6MA 4EE0A 3FK8A 3ZFBA 3DIEA 2VM2A 4ULXA 4BA7A 3DVWA 5ECKB 2NPBA 5DAKA 3GMFA 4ZL9A 2L4QA 3L78A 4XTSA 2HSYA 4RI6A 2LNSA 3TB2A 4WR4A 3HJMA 1PL2A 5FHIA 2RM5A 2HZEA 3EVIA 6GSXA 5ECMB 2GS3A 3C71A 1RK4A 3ISOA 1BEDA 2YWMA 5IM9A 3A2VA 3F3RA 2L4CA 1XZOA 2OE1A 2QKEA 3M1GA 1JZWA 1MD3A 4P3YB 3VI5A 4BVYA 3GL3A 1TRVA 4TR3A 3BOAA 1TRWA 4PNGA 3HVVA 1M2BA 1MDKA 3PR8A 5D8IA 4ZL8A 5EVOA 4K9ZA 1PKZA 3RPNA 4TKYA 4PUAA 1ZZYA 2ZUPA 1TXXA 3P90A 4NV2A 4FYCA 5ECLB 3HDCA 1X5CA 4OWYA 2KP2A 5J3RA 1B4QA 2K8SA 9GSSA 1XWGA 3L9SA 4G19A 3KH9A 5DDLA 18GSA 1AQXA 2GLRA 4L5OA 2H0IA 2DJ2A 4ECJA 5ECQB 2P5RA 3ERWA 1M7TA 3FR3A 2P31A 3H1NA 2AAWA 3K8NA 2AB6A 1U87A 1SD8A 1PSQA 1XFLA 3LWAA 3LEFA 4L8EA 4GWRA 2FGXA 5J9BA 5D9VA 1SL1B 4ISDA 3L9UA 3UBKA 1XBSA 1TTZA 5L71A 2XHFA 2F8FA 2PBJA 3LYKA 2G2QA 1SL0B 2FA8A 3KMNA 2K9FA 3FY7A 4TN8A 4MZCA 5CREA 4H86A 6GSSA 5CRGA 4GXZA 2NVLA 5FT3A 4HU7A 2DJJA 4AJ8A 4G9HA 4BWSA 2A2RA 3BJ5A 3GSSA 5HR3A 5B6NA 2R37A 1GP1A 1MDIA 2H75A 1TDIA 2GGTA 3G9BA 8GSSA 1K0MA 3HHVA 4HQZA 4WXTA 1GNWA 3DEXA 5ECNB 2HFDA 3CRUA 2OE0A 3LQ7A 1AXDA 4MK3A 3DGQA 5F0GA 2R5GA 4ACSA 1JZOA 1VF4A 5AISA 3WD6A 1ZGNA 5B7CA 3GURA 4LL1B 3GYKA 1QXHA 4ZIJA 1FOVA 4OFTA 3WGXA 2OKAA 1WJKA 4YQUA 4MABA 1B48A 3W8JA 3WGDA 2RUFA 2TRXA 3UMAA 1YF1A 2FY6A 4XRAA 4TR1B 3RHBA 1SJ6A 4J2FA 2YZHA 3IV4A 1RQMA 17GSA 4K0NA 5A4VA 2B7JA 2FWHA 3QFAC 4ZL7A 3ZRDA 2AJQB 1AW9A 3L4NA 2AHEA 2YV7A 2RLIA 4LMVA 1NW2A 4D73A 1U3AA 2B1LA 4HS1A 3IPZA 1V58A 2I3YA 5G1LA 5ABRA 1GL8A 3VK9A 4ECBA 1HYUA 1K0AA 1ERWA 4I6XA 2LRCA 1VRSD 5AIXA 1B4PA 3FZAA 3UEMA 4XS4A 5J5NA 1TK8B 4HU9A 1PGTA 5IOWA 10GSA 2O8VB 3FEUA 1XPVA 4HDEA 2H73A 3IK9A 4OCEA 1WWJA 3CRTA 3LGCA 4N11A 2C0FA 4BPYA 3QOUA 3E0UA 3E9JB 19GSA 4IHUA 2N5BA 1I5GA 2D2ZA 3TKRA 3VPTA 1DSBA 4MJAA 3VLNA 3APQA 2CVDA 3IK7A 4EF0A 3PINA 3M0FA 4POBA 4KNDA 4FO5A 2TRCP 3KEBA 3O6TA 2C3TA 2VCXA 2XBQA 1FAAA 1M0UA 1EV4A 1ERTA 1YQ1A 5KN3A 2XBIA 2V1MA 4KE3A 4XS6A 6GSUA 5G1KA 2CAQA 3CTGA 1FVJA 1AIUA 2IJYA 4FYBA 4IP1A 4IBPA 3D0ZA 3P7XA 5F05A 1M2DA 5ECHB 2H30A 1SKWB 1BQ7A 1NHYA 5GAPD 3KGKA 5CYYA 1PL1A 3UL3A 3LFLA 2HNLA 1GH2A 2EIRA 4YAVA 4MPFA 4IQ1A 5ECRB 4XHMA 1UA5A 1NSWA 1WOUA 2H01A 3A3TA 2A2SA 1GRXA 3HXSA 4POKA 4BWQA 5IMDA 1BYEA 3TKPA 4K0GA 1GTAA 5KN2A 2H0HA 3APOA 2MMNA 1R4WA 2PGTA 2X8GA 3CYNA 3BD2A 4CDOA 3UIWA 3GUSA 3F3QA 4KX4A 4EC0A 1WMJA 1EEMA 2E0QA 1T00A 3O3TA 1CQHA 3CSHA 2V41A 2CV4A 3QR6A 4PQ1A 4DVCA 1N8JA 1A0FA 7GSSA 1FVKA 1X9MB 3IRAA 4MH3A 1XWCA 5E59A 3E3EA 4HJMA 1SYRA 3BBYA 3GTUB 3ZZXA 1TI3A 3QDNA 4MPGA 2GTUA 3A2XA 4EDYA 4PNFA 3MWHA 4EL1A 2A4VA 2I1UA 2IFQA 1TU8A 1HNCA 2C3NA 3UVHA 2N5FA 3KTLA 5HR0A 2PWJA 2GZZA 5JWRB 1GSDA 3KCMA 4I2TA 1S3CA 5GSTA 3IAM2 2DJKA 4NPBA 1A23A 1Z7RA 1FB6A 1K3LA 2O85A 1ILOA 3HVSA 2HZFA 3F4TA 4CW9A 1FHEA 2MBTA 3Q18A 1YEPA 3EURA 1KBNA 4MF5A 2VD1A 1V57A 1ERUA 4ZBBA 5B8AA 1EOHA 1AQWA 2X64A 4F9ZA 4JRRA 2JZTA 3M3MA 5A5KA 2I9HA 4ZXGA 1HNAA 1PRXA 1XIYA 2L6CA 2YZUA 3MDKA 2NDOA 1BX9A 4AGSA 1F6MC 2HSHA 4NHZA 4GF0A 1AC1A 3LORA 3IC4A 1GSEA 3KZQA 2GDRA 3F6DA 2LNTA 1VGLA 3HKRA 5F06A 6GSYA 2YANA 1GWCA 5DQSA 1JZDA 1ON4A 1R7HA 3F0IA 2IN3A 4J57E 3WGEA 1T8EB 5LCZA 3CSIA 4KCEA 4MF6A 4KSOA 1X9SB 4EO3A 5E4WA 3QMXA 3F4SA 2H1BA 1B9XC 1XOAA 3JCML 3TDGA 5ELAA 3R2QA 5ENUA 1V9WA 1S3DA 3WT1A 4V1Ap 3TKQA 3EINA 3W8SA 1KEBA 1HD2A 2YWNA 5B6MA 1B8XA 3GKNA 2JADA 2WULA 3GFKA 1O73A 3HZ8A 3VWUA 1EV9A 1O85A 3MNGA 2HI7A 2QSIA 1JHBA 2RM6A 2LS5A 2C4JA 4JE1A 4O7HA 4HOJA 2LTKA 3J7Yb 1H4OA 5IMVA 5DCHA 3ZIJA 3C8EA 3EC3A 6GSWA 1SYXA 3GNJA 3D5JA 3CXGA 3CSJA 1XVQA 5AGYA 4ZILA 16GSA 1EGOA 1UVZA 1IYHA 3WT2A 2H6XA 4KH7A 2G0FA 4QQ7A 3H93A 1W4VA 2VIMA 2J9HA 3TJJA 2Z9SA 1ST9A 2FWEA 3G7JA 5CP1A 12GSA 5IMFA 1K3OA 3NIVA 2H76A 5ID2B 2WDUA 1SKSB 2GVPA 2H6ZA 1QK8A 1ZOFA 1LJRA 3LXZA 4ZBDA 1ZMAA 2L6DA 1ABAA 2CZ3A 1EP7A 2VL9A 1NM3A 3P2AA 3KP8A 1SJZA 5DAKB 3RDWA 1YY7A 1SL2B 3FR6A 1GUHA 3GA4A 2C0GA 4N10A 2OJLA 3A5WA 3FKFA 1T7PB 2DMMA 4LA1A 5C04A 2HZEB 3IDVA 3VI7A 2YP6A 2PU9C 1SU9A 3D21A 3IA1A 5J41A 2WCIA 5INYA 1JFUA 3DD3A 2LJRA 4JU5A 4HZ4A 3L0HA 1BAYA 4E8EA 1Z6NA 5IOXA 1QQ2A 2HT9A 2H19A 4HZ2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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