3A2VA

Peroxiredoxin (c207s) from aeropyrum pernix k1 complexed with hydrogen peroxide
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
243
structure length
243
Chain Sequence
PGSIPLIGERFPEMEVTTDHGVIKLPDHYVSQGKWFVLFSHPADFTPVCTTEFVSFARRYEDFQRLGVDLIGLSVDSVFSHIKWKEWIERHIGVRIPFPIIADPQGTVARRLGLLHAESATHTVRGVFIVDARGVIRTMLYYPMELGRLVDEILRIVKALKLGDSLKRAVPADWPNNEIIGEGLIVPPPTTEDQARARMESGQYRSLDWWFCWDTPASRDDVEEARRYLRRAAEKPAKLLYEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Aeropyrum pernix
publication title Crystal structure of peroxiredoxin from Aeropyrum pernix K1 complexed with its substrate, hydrogen peroxide
pubmed doi rcsb
molecule keywords Probable peroxiredoxin
total genus 83
structure length 243
sequence length 243
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2009-06-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 3a2vA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3a2vA01
1PL2A 3ZVJD 5DALB 3GL3A 2RM6A 3F6DA 1VF1A 4KW6A 1DSBA 5ECIB 3WT1A 4KDUA 3J7Yk 3LXTA 3H79A 4PQHA 1FAAA 3GHAA 4X43A 3GUSA 2B1KA 2ON5A 2R4VA 1JZDA 5AIVA 5F8BA 1A0FA 4YQUA 1XFLA 5IO0A 2A2SA 5H5QA 3GA4A 5CNWA 4FO5A 5DQSA 4F0BA 4XTSA 5CREA 1M2AA 4NHWA 2OJLA 4EKZA 4XS4A 4G10A 5CAXA 1GUKA 2QSIA 4ZL7A 4ECJA 3UL3A 2I81A 5JWOB 4RI7A 2GQMA 1OVNA 5C04A 4BVYA 4LL1B 3EWLA 1Z7PA 3TUEA 5IMZA 3TKQA 3CRUA 3M0FA 2XHFA 3IV4A 3LJRA 3QDNA 4MP4A 2IMKA 2PMTA 3V1WA 3VWWA 2JZSA 2VLTA 2V2GA 4TKYA 4WBRD 4KA0A 2E2GA 2VCXA 1GTUA 3LYKA 1ZOFA 4H86A 4MJEA 2K6VA 3NZNA 4J56E 4MZBA 1HQOA 3IE3A 2YPMA 2VL2C 2C3NA 1BEDA 4WXTA 3FYGA 2B6MA 2H6ZA 4MJBA 2MMOA 1O6JA 4I8BA 4ZB6A 4HJMA 1JLVA 2E2MA 4ZXGA 2YV7A 9GSSA 3EVIA 3HJPA 4OMVA 3KZQA 3CSIA 3US3A 2M80A 1EOGA 5D93A 4EL1A 3D22A 5IMCA 2VL2A 2WZ9A 3CTGA 2K8VA 4F9ZA 2VM1A 4EDYA 2PPTA 1SD9A 4F2IA 3FR3A 1R7HA 1N2AA 2H30A 3TKRA 1KEBA 3Q18A 1ZCPA 3IK7A 2P0GA 4IQ1A 1TK0B 3EE2A 4MJCA 4TXOA 3EINA 1X5EA 1GL8A 4D73A 2H73A 1YEPA 4IP6A 2E7PA 3IRAA 3CRTA 1QUWA 4N0ZA 1A2LA 2H0HA 1URMA 3QR6A 3KH7A 3G9BA 2IN3A 5D73A 3D4TA 1XW6A 4CDOA 1BAYA 3GNJA 2GSTA 3RPPA 2LS5A 3VLNA 2DJ0A 2VCTA 1WWJA 1THXA 4QL7A 4YAVA 4ECIA 2EIQA 1KTEA 2IMIA 3QPMA 2GS3A 4ZBDA 1V57A 5ECHB 12GSA 4GQCA 3O6TA 3F0IA 3GKKA 3GX0A 3LEFA 3M9JA 5ECRB 4CW9A 1OE7A 1TJDA 4NAXA 1SJIA 2HRFA 4K0GA 3K8NA 4NWYA 2FNOA 4PXOA 4I5QA 4EF0A 2H1BA 1BG5A 4MH3A 2WULA 1AXDA 2B5EA 4N30A 4OFNA 3HA9A 1JZOA 2FD3A 3IHQA 2P5QA 3MWHA 1A23A 4EO3A 2DLXA 1NSWA 4GXZA 1B4QA 4LMVA 4DEJA 2AAWA 3D0ZA 1PMTA 1PGTA 4PNFA 4L0UA 3EU4A 3FZAA 5C00A 1K3YA 17GSA 2GZPA 3ZLPA 6GSYA 1F3BA 3H1NA 1EWXA 3LSZA 4K6XA 4XIHA 4TR3A 4HI7A 1GULA 2FUG2 4MPFA 2DSAA 1H4OA 4BVXA 6GSTA 2OE1A 4RI6A 3HVVA 3C7MA 1K0BA 4DSQA 4LA1A 1GSDA 2OADA 2G0FA 2WS2A 3UVTA 1O8WA 3IBHA 4IQAA 2ZUPA 3GYKA 2L5OA 4J57E 3W8JA 4ZB9A 3FZ5A 2MZCA 5J3RA 1A8LA 1U87A 5H5RA 3GV1A 1SK1A 2CT6A 2FLSA 2GSRA 5INYA 1R5AA 3A2XA 4L5LA 1GUHA 4KX4A 1U88A 2WRTA 4K7NA 2CVKA 2AJQB 3F4RA 2GZYA 5HR2A 5L71A 2DJ3A 1EEJA 2HI7A 3ZIVA 2MBTA 2YJHA 5G5EA 3JCML 4KSOA 4KNDA 3TRXA 1B48A 4FIWA 4OO5A 1YDKA 2CAQA 3GH6A 1NHOA 1GH2A 4XS6A 6GSUA 4JR4A 3F8UA 3KJYA 2HZFA 1AC1A 1LU4A 2L5LA 3KD0A 2TRXA 1V9WA 1EEMA 1UVZA 2F51A 4KCAA 3WYWA 2KP1A 1F37A 1Q98A 5GSSA 7GSSA 3WT2A 1XBSA 5J4UA 1WJKA 3TOTA 1GLPA 2YZUA 1W89A 4Z7XA 2EIRA 3Q74A 4IBPA 2F8AA 3PR8A 4G9HA 1A8YA 1TRVA 2C8UA 4KGIA 5J41A 3ZFLA 1A2JA 1TRSA 4GSTA 1FW1A 3QAWA 4TR1A 2YNXA 2HSYA 3NIVA 3BCKA 3EC3A 3DIEA 3ME7A 1XOBA 4MZWA 2CVBA 2YANA 5DCGA 4AJ7A 2P31A 5HFKA 5JWQB 2L6DA 4F0CA 3A2VA 2XPEA 1FVKA 2YJ7A 5JWRB 1JZRA 2AYTA 1ZYQB 3ZREA 1TRWA 2RUEA 3KGKA 5B6NA 1F2EA 4BWSA 4KDXA 2VCVA 11GSA 5DQYA 1VF3A 3FEUA 1QFNA 4EUYA 5ELAA 2XC2A 5KN1A 5IQYA 3CXGA 3BJ5A 3E0UA 5DALA 2LTKA 4ULXA 5ECKB 4YQVA 2IMDA 4BA7A 5B8AA 1FVJA 2PVOC 4I2UA 4O7HA 1XZOA 3HKRA 1RW1A 1PQNA 2JADA 5HQPA 1X9SB 2CZ2A 1E2YA 3WGEA 1T7PB 1QXHA 1R4WA 1PSQA 2CX4A 2OBIA 2MMZA 5DAKB 3HVXA 4TN8A 3EURA 4PNGA 2GLRA 2GQKA 4ML6A 3TJGA 5G31A 2BMXA 2LQQA 1J9BA 3J7Yb 3LGCA 5ECQB 4AJ8A 3SBCA 1BQ7A 2DC5A 4PURA 1G6YA 1R5PA 2OACA 1YKAA 2NTOA 3P90A 3ZZXA 5CRWA 4ZB8A 4OFTA 5KEJA 1FB6A 5JCUA 1K3LA 3LQ7A 3PGTA 5JCWA 3RHCA 4IKHA 4Q5NA 3QAGA 3P7XA 1YF0A 4JZQA 2B3SA 5D9VA 1XW5A 1O81A 4TW5A 4IS0A 2VCZA 3TCOA 5HR3A 3IDVA 4MK3A 4RQRA 5ECOB 2LJKA 2B7JA 1TRUA 4HJ2A 3GN3A 1T00A 2LJAA 1XXUA 2YCDA 2IFQB 1F9MA 1M99A 3CSJA 3FHKA 1LBKA 5AN1A 2VL9A 2OE0A 5KN2A 1KNGA 1XVQA 2VD1A 4XCSA 4BL7A 2XBQA 3SWLA 2OA7A 5ECPB 5ID2B 2HZEB 1AQWA 2HT9A 3WGXA 2M72A 3KTLA 3ZIJA 4FYUA 1K0DA 3BCIA 2YN1A 1U3IA 3FZ9A 2H76A 4OFMA 3TJJA 1SK2A 4TXVA 1YY7A 2ALBA 4HDEA 3GSTA 2O8VB 1O85A 4MABA 4NPBA 5CRGA 1HYUA 3FZ4A 3TKSC 1OC9B 2B7KA 1TP9A 3ZTLA 4GLTA 4GTUA 3UOMA 1SJZA 1Y6EA 3EMXA 5KN0A 1GSEA 1SKWB 4RUVA 1KBNA 4P3YB 3F63A 2AHEA 2FCHA 3TKSA 3F4TA 2IJYA 1HNAA 5F07A 2JSZA 4LMWA 3L4NA 1XWKA 2OE3A 4AJ6A 2OBKA 4XS4B 1ST9A 3TJFA 2A2RA 4ECBA 3RPNA 2KP2A 5FWGA 3LFLA 4TRXA 2VCWA 3GSSA 3QFAC 4PQIA 2C0DA 3KIJA 3M3MA 3L9UA 2KOKA 3HCZA 1WE0A 1GRXA 1FB0A 2DIZA 1FOVA 5GSTA 1BYEA 3GIXA 5LD0A 4K7IA 3C1RA 2H74A 4F03A 3CTFA 1T4ZA 3ZFBA 3EYTA 2I1UA 4POKA 4GCIA 4JRRA 2N5FA 1DBYA 3ED3A 3UJ1A 4XS1A 4HUAA 1F6MC 4JBBA 4TVEA 1PX7A 2X8HA 2GT5A 4I6XA 4ML1A 1VF2A 1FHEA 1GSQA 2HNLA 4K7OA 1EGOA 2CAIA 1AW9A 1LJRA 2CZ3A 1E6BA 2XBIA 2LV3A 2ON7A 2G2QA 2LNSA 4EE0A 2L57A 2VLVA 3IPZA 2LQOA 2C0FA 1AUCA 5G5FA 3BOAA 1PX6A 4YQMA 1V58A 3DKSA 2O89A 3D21A 1GNEA 4Q5FA 2AV4A 2JL4A 2RM5A 1A2MA 3UEMA 3MAKA 4K2DA 2H66A 4V2MA 1C72A 2VO4A 5IOXA 4XRDA 2L6CA 2R2JA 3BD2A 5F0GA 1UN2A 5ECMB 4V2NA 2VM2A 6GSXA 1GUMA 2R6KA 2JACA 3F9UA 4OO4A 2PUKC 2H75A 5EVOA 4WEYA 5GZZB 4GWRA 2X99A 4TR0A 2V1MA 3RAZA 1YF1A 3ZVJA 1YQ1A 4OWYA 3TRPA 3GKNA 2PBJA 3QD9A 2HXKA 1ZZYA 4WF4A 4PGTA 1M7TA 1ABAA 1A24A 1TW9A 4EC0A 1OYJA 1TK8B 1TOFA 1T1VA 1XPVA 1CQGA 5IM9A 3APQA 1XCCA 3HXSA 1U3AA 3C8EA 1RK4A 2VIMA 3FW2A 1Z7RA 4L8EA 1Z9HA 5B7CA 4WKWA 2MMNA 2LRNA 4MLYA 5IMFA 5ECNB 2VL3A 2OKAA 3H4KA 8GSSA 2H19A 1SL2B 3I43A 2EIOA 3IAS2 1V40A 2NPBA 5J9BA 5HR0A 1GWCA 4I2TA 3O76A 4NV5A 2X8GA 1SK0A 5G1KA 3LG6A 1ERVA 3EU3A 3TDGA 2EC4A 2Z9SA 1V98A 1V2AA 4V2LA 4HEA2 3TGZA 3FY7A 4MF6A 3KH9A 1XOAA 4MF7A 1EV4A 2YWOA 3I69A 3VURA 1QQ2A 1X0RA 1M9BA 4IVFA 4MH2A 2CA8A 5E59A 4N10A 2F9SA 3HZ8A 1J08A 3H93A 4O92A 3O3TA 2IWTA 5IPGA 1K0MA 3LXZA 4QQ7A 4HU9A 1SENA 20GSA 4YH2A 2FGXA 1IYHA 2HE3A 3APSA 5J5NA 3DXBA 1VF4A 4EDZA 5HR1A 2GSSA 1M2DA 2H6YA 3GRXA 3E3EA 1UA5A 1IYIA 2KLXA 3UMAA 3G7JA 5ENUA 2JZTA 1B8XA 5CRHA 4OCFA 3FRCA 1PL1A 2D2ZA 2I9HA 1ZGNA 4EXJA 1ZL9A 5LNKe 3KXOA 3C73A 4IELA 1O8XA 3DRNA 2JU5A 2BJXA 2FWFA 1TI1A 3GURA 3ZMLA 1AIUA 2H8LA 1GTBA 3P2AA 1QMVA 2DJJA 2J23A 2HYXA 4DSSB 2NVLA 1EP8A 2H71A 1J0FA 4ZBAA 1QK8A 1EGRA 2J9HA 1I9DA 3BBYA 3DWVA 3KM6A 4GQFA 1VGLA 4IHUA 2LEGA 2R37A 1B4PA 1WPIA 5IIZA 1OKDA 4K8MA 1T4YA 3NOFA 2DMLA 2FY6A 2LRTA 4PUAA 4O5RA 4NHZA 1GTIA 4E8EA 1M9AA 2CV4A 5CRDA 2FWHA 5G1LA 5ELGA 5IO2A 1X5DA 5A4WA 1M2BA 3CBUA 3E9JB 1ILOA 4EVMA 3GTUB 1EZKA 2B5XA 4HQSA 3GKMA 1XWCA 3VWUA 4ZILA 1G7OA 3GFKA 3HVSA 5E4WA 3G7YA 3UVHA 1ACVA 1X9MB 4ILFA 4AF2A 2VD0A 1YZXA 6GSVA 3AY8A 2GVPA 3FR9A 2IIYA 3F3QA 3KMNA 1S3CA 2XPDA 1YJ6A 1MDIA 2IFQA 3I9V2 1O73A 2FA4A 4GSNA 4IGJA 1MEKA 3PINA 3L9SA 2H1GA 4MPGA 5H5SA 3D6IA 2QGVA 5ID2A 3ERGA 4KE3A 1QGVA 5D9WA 2V32A 4POMA 5CO3A 4DVCA 2GGTA 4PQ1A 3VI7A 4LLRA 1G0TA 3KMOA 3MDKA 4IN0A 1PA3A 1Z6NA 2ES7A 3HYPA 5A4VA 4IJ3A 4KCEA 2CVDA 2QKEA 1GTAA 4FH8A 1MDKA 2R5GA 1PKZA 4FYBA 2E0QA 4K9ZA 1SYRA 2YWMA 2WJUA 4MJAA 4DSRA 5AIXA 5ECSA 3CSHA 4MA9A 1TK5B 2O85A 3KP9A 2V6OA 1I5GA 1B9YC 4KSMA 6GSWA 2LSTA 1YKCA 2AUVA 3M8NA 2X64A 1AQVA 4Q5QA 1OKTA 4JEDA 2C0GA 3S9FA 2L59A 4IP1A 2DJKA 2RIIA 1GP1A 2C3TA 1GSYA 1R26A 3MSZA 2F8FA 3VWXA 1EP7A 2PWJA 2PU9C 4POLA 1TTZA 5J9CA 2JZRA 3TKSE 5DCHA 2YOIA 4V1Ap 18GSA 3IXRA 2TRCP 1Q4JA 3TJKA 3LORA 1THOA 2REMA 4KH7A 3QCPA 2A4VA 3L9VA 1SJ6A 5A5KA 1XIYA 3VWVA 5IMVA 1PD21 1PKWA 4L5OA 2H70A 3RHBA 2B5YA 10GSA 2F3MA 2MBSA 2LKUA 5A4UA 3TOUA 4J2FA 5G30A 1G6WA 5DDLA 1Z6MA 2VUPA 2H6XA 4LL4B 5DJMA 5KN3A 1JFUA 2H01A 1ERUA 4Q5RA 3MNGA 4O32A 3RDWA 5ECLB 1Y25A 3HY2A 4MDCA 1OE8A 3GH9A 4V1Ag 4X1UA 4YAPA 5G2ZA 3WD6A 4OCEA 22GSA 2ZCTA 1TDIA 1K0CA 3DVWA 3U5RE 5ABRA 2VLUA 4OD7A 2M46A 2H1AA 6GSSA 1ERTA 3TKPA 2MYGA 1GSFA 3VI5A 1BJXA 1Z5YE 4MZCA 3L0HA 4WETA 2MMAA 1B9XC 2DBCA 1ZYEA 4JU5A 4NV2A 4JR6A 4F82A 3WGDA 2NBSA 2FWGA 5HFIA 3N9JA 1Z3EA 4WBJA 4MF5A 3TRQA 14GSA 3DEXA 2GSQA 5GAPD 5IMAA 1WP0A 3KTBA 3F6FA 4XRAA 1SD8A 4HS1A 1OC3A 3IOSA 5IOWA 3QOUA 2VAFA 4MMMA 4ZBBA 4X0XA 4N0VA 4WR5A 1TKDB 5B6MA 1K0NA 13GSA 5FT3A 3ME8A 1ZMAA 1M0UA 4HQZA 2GQLA 2K9FA 3Q19A 2I3YA 3LYPA 2FHEA 4POBA 1MD3A 3CMIA 3ZITA 5D9TA 3IA1A 1WMJA 2R3XA 2LRCA 1DE2A 3W8SA 1TXXA 1ON4A 4HU7A 3U6VA 2GDRA 4GSSA 1TI3A 3M1GA 2YV9A 2PERA 4IW9A 3DVXA 3C1SA 2YZHA 2VOCA 5B8BA 2NDOA 3A3TA 1JHBA 2DIYA 1MD4A 4CHSA 1SL1B 1EV9A 3KEBA 2TIRA 4IJIA 3QMXA 2C0EA 4TXOB 4G19A 1GSSA 3KCMA 4D73B 3ZMKA 3N5OA 2O87A 3DYRA 4XHMA 2YWIA 1K3OA 3GX8A 2IL3A 3F4SA 2PGTA 4E8HA 3GKXA 1PRXA 3OR5A 3UAPA 1XWAA 1SU9A 3P8WA 3VPTA 2RLIA 4BPYA 2I4AA 4TR4A 1UC7A 1TU8A 3TJBA 2CX3A 5FHIA 3ZL5A 1XW9A 1G7EA 2B1LA 1ERWA 3DMLA 5EL8A 1X5CA 3UBLA 3UIWA 4KUNA 5IMDA 2YP6A 5IPHA 3HD5A 3QAVA 1GNWA 2X8CA 1NHYA 1O7UA 1S3DA 2KHPA 4PUFC 3H8QA 1HD2A 2IMEA 1K0AA 2H0GA 3ZYWA 3IC4A 4KDYA 1T3BA 2N5BA 4N11A 2FWEA 3L78A 2K18A 2LJRA 5D9XA 5F05A 2P5RA 4PX1A 3VPQA 2C3QA 2V6KA 4NXIA 1XVWA 2GZZA 3R2QA 3FK8A 2WGRA 5COHA 2RUFA 3EMPA 1T8EB 2YWNA 3ERFA 4MCUA 1H75A 1GLQA 1WRYA 3IK9A 2LUSA 1SKSB 2HRNA 2HSHA 4DSSA 2HFDA 2DJ1A 3G7IA 2C1YA 5DBQA 1X9WB 4L0WA 5D8IA 3D4MA 4GRFA 1U6TA 1W4VA 2VCQA 3LWAA 4WR4A 5DVBA 2V41A 2DMMA 3VFIA 2GTUA 1MTCA 2H72A 4HOJA 5HFGA 4ID0A 3W6GA 4ZL9A 1DUGA 2WB9A 2DJ2A 2GT6A 1SYXA 1JZWA 1F3AA 3GTUA 2PN8A 16GSA 1ML6A 2WDUA 2JSYA 5D96A 4G2EA 4ECCA 4K0NA 1HNBA 3HZ4A 3IR4A 1AQXA 2HLSA 3DGQA 2C4JA 4ISDA 3PH9A 2K8SA 4KAEA 3UARA 5DAKA 2C80A 5AISA 3A5WA 5F06A 3FKFA 3ISOA 4WF5A 1JLWA 1HNCA 5CYYA 4TOPA 3DD3A 4BWQA 4HZ4A 4JE1A 4ACSA 2WFCA 3HJOA 1PN9A 5JCGA 4AGSA 3FR6A 1USBA 2FA8A 1GSUA 3APOA 1A0RP 4I97A 5GAND 3UBKA 4GF0A 3GMFA 1OAZA 1SL0B 2O7KA 1RQMA 1DE1A 1MDJA 5LCZA 1XWGA 3CYNA 1NW2A 4QL9A 4K1FA 3I6AA 2L4QA 2PVQA 1K0OA 4HZ2A 1WOUA 2H0IA 3ERWA 2IPAA 2KUCA 2AB6A 2BTOT 2WCIA 3KP8A 1SKRB 2N5AA 3F3RA 3HHVA 1BX9A 3C71A 1OC8A 1YEXA 1CQHA 1S3AA 2CQ9A 3D5JA 5DJLA 1N8JA 4TR1B 1AAZA 4ZIJA 3QFBC 3A2WA 5AGYA 1WIKA 3HJMA 19GSA 3VK9A 4NMUA 2HZEA 3ZRDA 4FYCA 3GL5A 3Q6OA 1NM3A 2L4CA 1FG4A 2QC7A 1TU7A 5EY6A 3RBTA 2ZNMA 1VRSD 2H1DA 4RQXA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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