3A2VA

Peroxiredoxin (c207s) from aeropyrum pernix k1 complexed with hydrogen peroxide
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
243
structure length
243
Chain Sequence
PGSIPLIGERFPEMEVTTDHGVIKLPDHYVSQGKWFVLFSHPADFTPVCTTEFVSFARRYEDFQRLGVDLIGLSVDSVFSHIKWKEWIERHIGVRIPFPIIADPQGTVARRLGLLHAESATHTVRGVFIVDARGVIRTMLYYPMELGRLVDEILRIVKALKLGDSLKRAVPADWPNNEIIGEGLIVPPPTTEDQARARMESGQYRSLDWWFCWDTPASRDDVEEARRYLRRAAEKPAKLLYEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Probable peroxiredoxin
publication title Crystal structure of peroxiredoxin from Aeropyrum pernix K1 complexed with its substrate, hydrogen peroxide
pubmed doi rcsb
source organism Aeropyrum pernix
molecule tags Oxidoreductase
total genus 83
structure length 243
sequence length 243
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2009-06-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 3a2vA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3a2vA01
3TKSA 4Q5RA 3ZLPA 2VLTA 1K0OA 2PPTA 2WFCA 1XPVA 2V32A 2MZCA 2L4CA 3GFKA 4ZBAA 4IJ3A 4X0XA 3LG6A 6GSSA 1RQMA 3UIWA 1V98A 1TW9A 3L78A 3RHCA 1YF0A 4IP1A 2AB6A 2KP1A 5IIZA 1S3DA 2HE3A 3F3QA 3TGZA 4AF2A 4RUVA 2O8VB 3QAGA 4JBBA 3VLNA 1JLVA 3HVXA 2I9HA 1A0FA 5FWGA 2C1YA 2LRCA 1XCCA 4JRRA 5GZZB 3OR5A 1LJRA 2KHPA 4O92A 4GF0A 2P31A 2OKAA 1U3AA 2PVOC 2YV7A 2FCHA 4KSMA 5B6NA 3A2WA 3DD3A 1LBKA 1HQOA 1VF3A 2GGTA 4ILFA 3GL3A 2YANA 3ZFBA 3WD6A 2YZUA 4FYBA 8GSSA 3ZVJA 4KH7A 1OC9A 3FRCA 5KEJA 4MDCA 4CDOA 4NAXA 1SU9A 3EYTA 3P2AA 4MPGA 3LFLA 3UBKA 2LQQA 1R5AA 4KDYA 4FIWA 4POBA 3F4TA 5GAND 5DALB 4GRFA 4PUAA 3GUSA 3DWVA 2B7KA 1C72A 2YWNA 1GLPA 3V1WA 2VM1A 3UL3A 3E9JB 4KSOA 4QQ7A 7GSSA 4Q5NA 4I2TA 2ON7A 1V57A 2M46A 1RK4A 4MH3A 6GSXA 4XRAA 2CA8A 4I8BA 1T3BA 3W8SA 4BVXA 3PINA 3RHBA 4XS6A 2OBKA 5ECNB 4QL9A 3PR8A 2YCDA 1QQ2A 1XVQA 2V41A 3FW2A 5GSTA 1TRVA 3A2XA 1CQGA 2F3MA 2GZPA 22GSA 1AUCA 1WIKA 4PGTA 4IKHA 4OFNA 4WF5A 5D9WA 1K0NA 2IMIA 4EO3A 1DE2A 3FZ9A 5JCUA 1X5CA 1PL1A 1T1VA 3IAS2 4X1UA 3PGTA 1O6JA 1ZYEA 2DIZA 14GSA 2XC2A 2BTOT 2CAQA 3F4RA 2YWOA 2H01A 5HFIA 3FHKA 4NV5A 2AYTA 3BBYA 2R5GA 4TR1B 1O8WA 3SBCA 1UVZA 4IS0A 4YH2A 1QUWA 2HZFA 5CRDA 2VCZA 3KCMA 1URMA 5CREA 3FK8A 3VPTA 3HD5A 1XWBA 4RI7A 2IFQA 1WRYA 5LD0A 3GHAA 5J41A 3N9JA 5D9XA 1YZXA 4TR3A 3EWLA 4YQMA 5ELAA 1KNGA 2R2JA 1AQWA 1M2AA 4HJ2A 1HNAA 1WJKA 2C3TA 5CYYA 3ED3A 4IGJA 3HXSA 2HLSA 2FNOA 3LXTA 1X9SB 2N5FA 3TKQA 2IJYA 4LLRA 5J5NA 4HJMA 2GQMA 2HZEB 4GLTA 2H1DA 2HT9A 1XW5A 4HUAA 1AQXA 1U6TA 3NIVA 3Q6OA 3C8EA 1TTZA 2PGTA 2K18A 1VGLA 3HVSA 1ML6A 1TK8B 1N8JA 3MNGA 3BD2A 5ECRB 3LQ7A 2EIQA 2D2ZA 3KJYA 4TVEA 1G7EA 4TOPA 6GSTA 3ERWA 5D96A 2C0EA 3KIJA 1SD9A 2DMLA 4LMVA 2E7PA 3LORA 4NPBA 3JCML 2RUFA 4WKWA 1GULA 2CX4A 2H8LA 2H0HA 4J56E 2DIYA 2BJXA 3ZITA 2CVKA 5KN3A 3GNJA 2VUPA 1HYUA 3Q19A 2YWIA 2CT6A 3GTUA 2IN3A 3M3MA 1M7TA 1B9XC 1AQVA 3IXRA 4XTSA 2YP6A 3TB2A 5IQYA 1EGOA 5A4VA 4L5LA 1BYEA 2JL4A 3DGQA 2MMAA 3ZIVA 2LEGA 2H1BA 4IW9A 3C73A 2GQKA 1JFUA 5CRGA 1O81A 1PMTA 1X0RA 3NZNA 2P5QA 3PH9A 3TRPA 1SK1A 2JZSA 2YJ7A 4ZXGA 2JADA 3TJJA 3E0UA 4PQ1A 1ZZYA 1JZDA 2XPEA 5JWQB 4Q5FA 3WGXA 4ML1A 2AV4A 3IOSA 3G7IA 1F6MC 3DKSA 4KE3A 4BVYA 5EL8A 2P0GA 4OFTA 1SJZA 3DEXA 3GKMA 1G0TA 3LGCA 4BWSA 1SKRB 2AUVA 5J3RA 2K8VA 2E0QA 4OCEA 2EIRA 1Z3EA 5KN2A 3KH7A 2NBSA 4ACSA 5DQSA 2I4AA 2L59A 2GZZA 2GLRA 1ZL9A 2IMDA 2NPBA 1NM3A 1GSEA 1SK0A 4IJIA 1R5PA 4PURA 4WR4A 1ON4A 4WXTA 5A4WA 6GSYA 3K8NA 2NVLA 2GTUA 4K1FA 4JEDA 2H75A 2JZRA 1KEBA 1Z6NA 2HYXA 4MJEA 4O7HA 4I6XA 5DAKB 5JWOB 2QGVA 1GSUA 4OO5A 1EP8A 1I9DA 3FKFA 4FO5A 1R7HA 4WBJA 1IYIA 5ABRA 4XCSA 1TK0B 5AN1A 2J23A 3C71A 2C3NA 3UAPA 2TRXA 4RQRA 3LJRA 5KN1A 4BPYA 1X9WB 2X8CA 3LYPA 4DSSB 1A2MA 5DALA 1AXDA 5DBQA 5J9CA 3IK7A 2VL9A 2VM2A 3VK9A 1YKAA 3GN3A 3VWWA 1T4YA 3ZYWA 4FYCA 3HCZA 2TIRA 5LNKe 3VPQA 4E8EA 4JU5A 3TJKA 2WCIA 4GWRA 5IO0A 2OE3A 3TKRA 1SKSB 4BL7A 17GSA 1TXXA 1WPIA 2RM5A 5IPGA 4PXOA 2HFDA 3O76A 1VF4A 3KD0A 2CZ3A 1ST9A 2X8HA 3APQA 1PD21 1K0CA 4HU7A 4G19A 4ZL9A 2LJAA 3EU3A 5IMVA 2JU5A 4YQVA 2VL2C 5ECKB 2OACA 1O7UA 20GSA 3HZ8A 4K6XA 5HQPA 2KLXA 1TI1A 1BAYA 1OVNA 1LU4A 1GTUA 3P7XA 1ZGNA 1SJIA 1UC7A 1B48A 5ECMB 1S3AA 4DSQA 2XHFA 2B7JA 3LYKA 2GVPA 1ZYQB 4HZ4A 5G2ZA 1J9BA 1PGTA 2C8UA 5L71A 4TR1A 1PN9A 4V2NA 4NXIA 2JSYA 1U88A 2F8FA 3CMIA 2DJ1A 4XRDA 5G30A 4GTUA 4TN8A 2P5RA 1O85A 1YEXA 4ECBA 2H0IA 4N0ZA 16GSA 5H5QA 3HJPA 4MH2A 3UMAA 19GSA 1I5GA 1JHBA 3GL5A 4MP4A 3HA9A 3QOUA 3ZMLA 5FHIA 1V58A 3IDVA 4MABA 4MK3A 2HRFA 2HZEA 3CTGA 3IBHA 3F9UA 2OJLA 3F6FA 3EU4A 2H72A 4LL4B 4ZBBA 1TU8A 4XHMA 1OC3A 1EGRA 5ECSA 4K0NA 2IMKA 5D73A 9GSSA 1A8YA 3CTFA 1YQ1A 2EC4A 5ID2B 2DSAA 2ZUPA 1K0MA 4LMWA 2MMOA 1FAAA 5EVOA 3VWXA 3CSJA 3Q74A 3UOMA 2K8SA 1T00A 2KOKA 4HDEA 3KZQA 3M9JA 2H30A 3CYNA 4F2IA 1PKWA 1GTBA 4EDZA 3ZRDA 3IRAA 1PRXA 2FGXA 2VD0A 2NDOA 3IPZA 2H1AA 5DQYA 2H74A 2XPDA 4F0BA 1AIUA 1SYXA 3Q18A 2MYGA 2VCTA 4YAPA 2CZ2A 3FR9A 1T8EB 2FWGA 1VRSD 2WB9A 4MJAA 2BMXA 2ZCTA 4TW5A 3HHVA 1F37A 2GS3A 3E3EA 2B1KA 1EEMA 2LSTA 2LQOA 1G7OA 4ZIJA 2C0GA 2B3SA 1J08A 4FYUA 4G2EA 3WGDA 4GSSA 3TDGA 3TKSE 2MBTA 3DVWA 4YAVA 4MLYA 4LL1B 3VWUA 1BX9A 4X43A 2FD3A 2WGRA 3HKRA 4XIHA 4K7IA 5G31A 3UVTA 2GSTA 1EZKA 5EY6A 5LCZA 2CVDA 1DUGA 3MWHA 1Z6MA 4IELA 1G6WA 2HXKA 3FYGA 5COHA 2AAWA 1B8XA 2YV9A 3GYKA 2FWFA 2L5OA 3SWLA 2V2GA 3KTLA 3KP9A 1NHOA 5DVBA 3ZREA 5IOXA 3I9V2 3DIEA 4K7OA 1J0FA 1GWCA 2GDRA 1F9MA 3IE3A 2H0GA 2ZNMA 3FY7A 3EMXA 4JR4A 4MJCA 2LUSA 4GQCA 2OE0A 3ZTLA 3ME8A 2XBIA 3ME7A 5C04A 4FH8A 1EEJA 2RLIA 4GQFA 1YY7A 4NWYA 1Z9HA 4OD7A 2TRCP 2VL2A 2JSZA 3U6VA 1U87A 5DAKA 1W89A 1ERTA 4MZCA 2C3QA 13GSA 3ZFLA 5GAPD 3GX0A 3IC4A 1AC1A 3QMXA 4L0WA 4KX4A 2YWMA 5HR1A 1XBSA 3W8JA 2WZ9A 1DE1A 4WF4A 2VIMA 3L9UA 3DXBA 4TXOB 4EXJA 2H1GA 3F3RA 2O7KA 2PUKC 1JZRA 2IMEA 3UARA 4DSSA 3EMPA 2H19A 5G1KA 1SKWB 3P8WA 4OMVA 3RAZA 5F05A 2HSHA 4TKYA 4V2MA 3FEUA 4Z7XA 2VL3A 4NV2A 4HI7A 4POMA 3R2QA 1ZMAA 3EURA 4TR4A 1AAZA 3BOAA 2MMZA 4WETA 2FLSA 4IHUA 2PN8A 3QCPA 1T7PB 2EIOA 2V6OA 4MZBA 2RIIA 1SENA 4POLA 2FUG2 2WULA 1YDKA 2GT6A 5ELGA 4TR0A 1DBYA 1ERWA 4PX1A 2K9FA 4OWYA 2FA4A 2VCQA 3D0ZA 1HD2A 3M0FA 4MJBA 6GSUA 1NSWA 4JZQA 4EDYA 3A2VA 1EOGA 1GTAA 5IMFA 4MF5A 1XWGA 2DLXA 4V1Ag 2LS5A 2LNSA 3APOA 2H6XA 1XFLA 4DSRA 3C1SA 1EOHA 1KTEA 2VLUA 3KP8A 3LWAA 2AHEA 4ZB9A 1XW6A 4K7NA 2N5AA 1XWCA 3ZIJA 1SD8A 5ECHB 4H86A 4ZILA 5ENUA 2K6VA 1XW9A 1UN2A 2L57A 4N0VA 1GUKA 5D9TA 2H71A 4IP6A 2VO4A 1U3IA 3GKNA 4XS4B 4ID0A 5F0GA 4O5RA 3FZAA 1EV4A 3TJBA 3TOUA 2DJJA 4WBRD 1NW2A 4AJ7A 2IMFA 1PKZA 1IYHA 4MMMA 3BCKA 1OE7A 3HYPA 1M2DA 1GTIA 4KNDA 5HFGA 3N5OA 5IMAA 3US3A 1YEPA 2R3XA 2QC7A 2C80A 4ECCA 1E2YA 1EV9A 1TRWA 3IR4A 3VFIA 2XBQA 3TCOA 2Z9SA 5ID2A 1XWKA 5IO2A 3CSHA 3F4SA 1XOAA 5ECOB 3UEMA 2DC5A 3GKXA 5JCWA 5B8AA 4PQHA 11GSA 2KUCA 3WYWA 2FWEA 3KMOA 4MZWA 2LJRA 18GSA 3A3TA 3HDCA 4BWQA 3UVHA 4MCUA 3TRQA 3O3TA 1SL0B 1A2JA 3VI5A 4EVMA 3RDWA 4E8HA 3KGKA 2FY6A 2DJ0A 2PVQA 4K8MA 5H5RA 4PNFA 2GQLA 5IOWA 5ECLB 1GP1A 1OE8A 2I81A 5FT3A 3GURA 5JWRB 4MPFA 1TU7A 5IMDA 1X5DA 2PBJA 3G7YA 5DJMA 2AJQB 4F82A 1M2BA 3QPMA 3D4MA 1BG5A 5HR3A 3CBUA 4HU9A 1FVKA 3HJOA 1A8LA 4IQ1A 1XIYA 3F0IA 3TOTA 2J9HA 3GMFA 2PU9C 1B9YC 2L6CA 3IK9A 1XXUA 1Z7RA 2WJUA 1K0AA 2H73A 5JCGA 4I2UA 1XWAA 4I5QA 1F2EA 1A24A 2MBSA 3ZZXA 3I43A 1F3AA 3G7JA 3WT2A 1G6YA 5CP1A 1GSDA 1K0BA 4KB3A 4I97A 4TRXA 2WS2A 1MDJA 2H66A 4AJ8A 2C4JA 5CO3A 4JE1A 2LJKA 4GSTA 3M1GA 2O89A 4IVFA 3GX8A 1X5EA 2C0FA 3J7Yk 3F6DA 5F07A 3GRXA 3L9SA 4NHWA 4XS1A 5CAXA 3IHQA 2HNLA 3ERGA 1O73A 2GZYA 1Q98A 2QKEA 3CXGA 2R4VA 4Q5QA 2O85A 2CX3A 3GV1A 2M80A 3QAWA 2A4VA 4F03A 1K3LA 1GUMA 5J9BA 1K0DA 5A4UA 1GUHA 4HEA2 1OC8A 4G9HA 4IQAA 4G10A 1TDIA 1UA5A 1FOVA 4ML6A 4TXOA 3W6GA 3KTBA 4HS1A 5GSSA 5DJLA 3GH9A 2I1UA 3DYRA 1M9BA 4L0UA 1M99A 3IAM2 4ZB8A 4EC0A 4V1Ap 5A5KA 3CRUA 4DEJA 2O87A 3VURA 1S3CA 4PUFC 3CSIA 2VD1A 1HNBA 3VI7A 5HR2A 4EUYA 3KXOA 4KDUA 3QFBC 1B4PA 5B7CA 2FHEA 2L6DA 4KW6A 3H79A 1OAZA 1W4VA 3GIXA 1BEDA 1XZOA 1H4OA 5F8BA 5C00A 4ISDA 2F8AA 3GA4A 4AGSA 4KAEA 3H1NA 5ECQB 5EPFA 1KBNA 1E6BA 4EL1A 1THOA 2IPAA 5G5FA 1YF1A 3AY8A 2M72A 4L5OA 3O6TA 1A23A 2VCVA 3EC3A 1PSQA 1Y6EA 3ZMKA 2GSSA 2R6KA 1QFNA 2E2MA 1SJ6A 3TJGA 2VLVA 5D8IA 3KH9A 1TRSA 4EKZA 5IMZA 4N30A 4CHSA 1GSYA 1F3BA 1BJXA 1WWJA 2LRTA 1FB0A 3TUEA 2VOCA 4F0CA 12GSA 5CRHA 2OA7A 5G1LA 1K3YA 1MD4A 2IIYA 4D73B 4KDXA 1EWXA 5HFKA 4EE0A 1MTCA 1WP0A 3ISOA 4JR6A 5CRWA 3QDNA 4NMUA 2L4QA 1THXA 3HY2A 3GH6A 5E59A 1Z7PA 1OYJA 1DSBA 3LXZA 3WT1A 2RUEA 4XS4A 2X64A 2H70A 1TI3A 2OADA 1Q4JA 4K0GA 2L5LA 4KA0A 3P90A 3IV4A 4POKA 1FG4A 3RPNA 3DVXA 3QR6A 2IL3A 3C7MA 2OE1A 2PWJA 1FVJA 1A0RP 1YJ6A 2LKUA 1SK2A 2V1MA 1MD3A 3QD9A 2YNXA 4ZL7A 1GSFA 2X8GA 2LTKA 4HQZA 5DCGA 2A2RA 4QL7A 2G0FA 2LNTA 1PA3A 1MEKA 1M0UA 3TJFA 3TRXA 6GSVA 3U5RE 3L4NA 4LA1A 3KMNA 2DMMA 3CRTA 3H8QA 1GLQA 2CV4A 2RM6A 2WDUA 1ACVA 4ZB6A 1QXHA 1JLWA 5G5EA 1Z5YE 3F8UA 3MAKA 1A2LA 2YPMA 1ZCPA 5ECPB 3RBTA 4WEYA 1WE0A 5B6MA 2DJ2A 1Y25A 2H76A 1B4QA 2V6KA 2DBCA 3S9FA 1T4ZA 1X9MB 1TRUA 2IWTA 4ZBDA 5HR0A 1ERUA 5ECIB 4ECIA 3D21A 1SL1B 4K2DA 3L0HA 1YKCA 2F51A 2JACA 1OC9B 2B5EA 10GSA 5KN0A 4IN0A 5B8BA 4N11A 4HOJA 1ILOA 4GSNA 3TKSC 3UBLA 3HZ4A 1PX7A 2PERA 1GL8A 4ZL8A 1GNEA 4CW9A 1PQNA 2I3YA 1SL2B 5E4WA 1BQ7A 1PL2A 3QAVA 4BA7A 2CQ9A 5J4UA 1K3OA 1ERVA 1EP7A 2ES7A 3D4TA 1WOUA 3APSA 1M9AA 2E2GA 3F63A 2B5XA 4AJ6A 1NHYA 1H75A 5INYA 1V40A 2VAFA 3LEFA 2JZTA 4K9ZA 4ULXA 1TP9A 4N10A 3H93A 3MSZA 3DRNA 5D9VA 4J2FA 1JZOA 1TJDA 1TOFA 2LRNA 2YJHA 2DJKA 2C0DA 4WR5A 1FB6A 2HRNA 3I69A 1GRXA 4KCAA 3UJ1A 5D93A 1TKDB 3MDKA 5AGYA 1ZOFA 3GKKA 1XVWA 4GCIA 1V9WA 3QFAC 5AIXA 3FR3A 4J57E 1QMVA 3VWVA 1RW1A 1VF1A 1FO5A 1FW1A 4NHZA 2H6ZA 4RI6A 3D22A 3C1RA 3BCIA 2YOIA 3HVVA 5F06A 2IFQB 4IBPA 4HQSA 4P3YB 3L9VA 4MF7A 3M8NA 5AISA 3EVIA 2GSQA 3G9BA 2REMA 4OO4A 2GT5A 3IA1A 3I6AA 1GNWA 3M9KA 3DMLA 2B6MA 2ON5A 3H4KA 2HI7A 1GH2A 5H5SA 1FHEA 4MA9A 2HSYA 4OCFA 5AIVA 2YN1A 2F9SA 2R37A 2CVBA 2X99A 3EE2A 1OKTA 1QGVA 1O8XA 1TK5B 2MMNA 3A5WA 2WRTA 1QK8A 1R26A 3D5JA 2G2QA 4DVCA 4KCEA 2N5BA 1WMJA 1N2AA 3KM6A 4ECJA 2FWHA 4TXVA 4YQUA 2GSRA 2LV3A 4V2LA 5DCHA 4GXZA 5CNWA 1PX6A 2OBIA 2ALBA 1MDIA 2PMTA 4RQXA 1GSSA 1MDKA 3ERFA 1JZWA 1V2AA 1SYRA 1VF2A 1CQHA 4KGIA 3ZL5A 1OKDA 3KEBA 3GSSA 3FR6A 1HNCA 3FZ5A 2DJ3A 3FZ4A 4D73A 3J7Yb 3ZVJD 4HZ2A 4PNGA 4EF0A 4OFMA 3LSZA 1AW9A 3GTUB 4MF6A 4F9ZA 2KP2A 3TKPA 4O32A 3D6IA 5IPHA 1R4WA 4KUNA 4L8EA 1ABAA 2QSIA 1USBA 2NTOA 2A2SA 2FA8A 2VCWA 2B1LA 1GSQA 3BJ5A 5IM9A 4PQIA 5IMCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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