2YZHA

Crystal structure of peroxiredoxin-like protein from aquifex aeolicus
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
170
structure length
170
Chain Sequence
GHMARTVNLKGNPVTLVGPELKVGDRAPEAVVVTKDLQEKIVGGAKDVVQVIITVPSLDTPVCETETKKFNEIMAGMEGVDVTVVSMDLPFAQKRFCESFNIQNVTVASDFRYRDMEKYGVLIGEGALKGILARAVFIIDKEGKVAYVQLVPEITEEPNYDEVVNKVKEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Aquifex aeolicus
publication title Crystal structure of peroxiredoxin-like protein from Aquifex aeolicus
rcsb
molecule keywords Probable thiol peroxidase
total genus 47
structure length 170
sequence length 170
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2007-05-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2yzhA00
3GX0A 1JZWA 3HA9A 1TOFA 1PRXA 1M2DA 2HZEB 2IJYA 3HKRA 4EVMA 2R2JA 4POLA 2DSAA 2FWFA 1G6YA 2ON7A 1JZRA 2EIRA 3G7IA 4WF4A 1BG5A 2AB6A 2GQMA 1FVKA 3O76A 4MF6A 2CVBA 2GSRA 4KW6A 1R7HA 4ZBBA 1OYJA 4EF0A 3IOSA 3DXBA 3ZIVA 3D22A 2OE3A 2DMMA 3U6VA 1PL2A 1JHBA 1HYUA 2LEGA 2V6OA 5ID2A 18GSA 3ZL5A 4ECBA 1XVWA 1K3LA 2AYTA 1XWAA 2DIYA 5DAKA 1ERUA 1GP1A 1OE7A 3RAZA 2H71A 3C1RA 5AIVA 5ECSA 3VK9A 19GSA 4EDZA 4WBJA 3FR6A 2DIZA 2VLUA 1IYIA 3FZ9A 2GT6A 3BJ5A 3IRAA 2FCHA 1SJIA 5FWGA 2H6XA 4JZQA 3C1SA 3ERWA 3ZFLA 4KCEA 4WEYA 2TIRA 4ML1A 3HHVA 2H66A 3C8EA 1Z7RA 2HSYA 2WS2A 4GSTA 3G9BA 1SL0B 2HSHA 2F8AA 4TR4A 3DEXA 4DSQA 3KCMA 3UEMA 4CHSA 4MJEA 1YY7A 4KGIA 4KE3A 5DALB 2R37A 3MDKA 5F0GA 4G9HA 3M9JA 1OKTA 5ECOB 2XPEA 2LJRA 4WR5A 3LGCA 1TRUA 3GHAA 1FAAA 3E9JB 5HFKA 4TR1A 1THOA 2H8LA 3P7XA 3DRNA 1YKAA 1DUGA 1RQMA 2H1GA 4D73A 1GSDA 5ECRB 3EC3A 1GLQA 5JWQB 1V9WA 1GSFA 3VPQA 1GUHA 1BEDA 1B4PA 4ZL7A 3J7Yb 1KNGA 2DJJA 1BQ7A 3HY2A 3PH9A 1MDKA 3D4MA 3BCIA 4ECCA 5IMAA 5JCWA 3VWVA 4TRXA 4KSMA 1GTAA 2LQOA 3KJYA 1NM3A 1O73A 3H4KA 4GCIA 1EV4A 1K0AA 3ZTLA 5ID2B 5ECIB 1U6TA 5KN3A 5IMFA 2O87A 4EE0A 4BWSA 1GLPA 4EDYA 5LCZA 4HJ2A 4PUAA 4POBA 3M9KA 4BVYA 5A5KA 3KTBA 4HJMA 3FZ5A 4HS1A 2L5OA 4RQXA 3FEUA 4V2NA 3FHKA 2VCXA 3QMXA 1FO5A 3DVWA 1PA3A 4G10A 3GKKA 1JZDA 4NAXA 3E0UA 1U87A 4XS1A 2FA8A 3WGDA 1TRWA 4HZ2A 2HI7A 5IMCA 2R6KA 1J0FA 1XCCA 3C73A 1VF2A 1E2YA 2VCQA 3KIJA 1I9DA 3WT2A 5IMVA 1GSUA 2LTKA 4MMMA 1Z9HA 2RUFA 3IBHA 1A24A 2RM5A 1YZXA 2PPTA 4ZB6A 2H75A 4MZWA 4HU9A 2YCDA 3I6AA 4ECIA 3HJMA 1OE8A 3A2VA 1M7TA 6GSUA 6GSXA 4D73B 3W8JA 4IGJA 4KAEA 4KB3A 5HFIA 3ZIJA 4K0NA 4ZIJA 3PR8A 4LMVA 4F0CA 1MDIA 1A8YA 2PUKC 3K8NA 2CX4A 3TJKA 2VUPA 4MJBA 2IFQA 1GULA 3D4TA 3ME8A 2H70A 1O8WA 1WIKA 1GTIA 2EC4A 2VM1A 3F3RA 1O81A 1THXA 2MYGA 2K9FA 1NHOA 3TB2A 4WF5A 1K0DA 3TKPA 1VRSD 3HDCA 3DKSA 1NSWA 4GLTA 1OKDA 1KTEA 3F9UA 4K7IA 2X99A 4HOJA 5D96A 5KN2A 1F37A 2F3MA 2FLSA 1KEBA 2CVDA 3EU3A 4K7OA 5A4UA 1MEKA 2LNTA 2FUG2 1EZKA 4ZBDA 5FHIA 2HE3A 1AUCA 1OC3A 2VL9A 4K1FA 4AJ7A 1W4VA 4ZB9A 2PMTA 1DBYA 5DBQA 2X64A 2L5LA 1YQ1A 2YZUA 2L4QA 4XHMA 1W89A 1JLVA 2LJAA 1ZL9A 2VOCA 1ERTA 3TRQA 3MSZA 3KGKA 1F3BA 3FR9A 6GSSA 3VWXA 4HDEA 4MP4A 2MMNA 3S9FA 1EP8A 2V41A 1YKCA 2ES7A 4WR4A 3W8SA 2O7KA 3R2QA 1RK4A 2R4VA 2N5FA 4JU5A 2V6KA 4K0GA 2X8GA 2XBQA 3FRCA 1NHYA 2DMLA 2YJHA 6GSVA 1ABAA 4O92A 1DE2A 1R5PA 2L4CA 3UARA 2O8VB 5ELGA 1CQHA 1Q4JA 5C04A 1VF4A 1JZOA 1XXUA 1QK8A 4JR4A 1ZCPA 2OJLA 2HZEA 4OO5A 3F6FA 1J08A 3L4NA 4ZL8A 3BCKA 3HVXA 1PMTA 4EL1A 5HR0A 5DQYA 4ZXGA 3UIWA 5GZZB 4IW9A 1X9WB 2FWGA 5GSSA 3IC4A 3IHQA 1XW9A 2KP2A 2P31A 4Q5FA 5FT3A 3QAVA 4XIHA 3D5JA 3EURA 3HZ4A 4F9ZA 2KP1A 2B6MA 2WB9A 1XWKA 3DGQA 1QGVA 4IKHA 1F3AA 4LLRA 1PN9A 2H1DA 1NW2A 3HZ8A 2H01A 1A8LA 1TDIA 3CRTA 2YV7A 4Z7XA 4MJCA 1HQOA 2QC7A 4KNDA 5LNKe 5EVOA 1V57A 1XWGA 1YF1A 2H0HA 1XZOA 1R26A 2JSZA 2PERA 3ZYWA 2M46A 22GSA 1GUKA 1FB6A 1QXHA 2IPAA 13GSA 1N2AA 2WULA 2DJ1A 4KA0A 3QDNA 3G7YA 4MH2A 2GZZA 2N5AA 5ECLB 2CV4A 2FWEA 1Z6NA 2F8FA 3DMLA 2QGVA 4V2MA 4ZILA 2REMA 2YOIA 3HYPA 4PNFA 3NOFA 2CT6A 5COHA 1OVNA 4OFNA 1AW9A 1MD4A 1GTBA 3GMFA 3UJ1A 2GVPA 2IMEA 2WCIA 4WXTA 2H0IA 2BTOT 2LRTA 1QFNA 2VL2A 4JRRA 5DDLA 1PKWA 1SK0A 20GSA 1XOAA 2FA4A 4N0ZA 1MDJA 5G2ZA 4LA1A 4KSOA 5IQYA 2H19A 3EU4A 3KZQA 1AQXA 1ZYEA 5INYA 3KH7A 4X43A 4CDOA 2GTUA 2TRCP 1PSQA 2GDRA 3ED3A 2I9HA 2K6VA 4HZ4A 2Z9SA 3EWLA 2VD0A 2VAFA 1S3AA 4E8HA 4L5LA 1SJZA 3GRXA 4BL7A 3F3QA 5GAND 1ACVA 3IAM2 1SENA 3FKFA 2C8UA 2MMZA 3WD6A 1TK5B 3LYKA 5HQPA 5JCUA 1Y25A 1EWXA 3D21A 1EEMA 1M2AA 1SKSB 2B3SA 4PX1A 2MMAA 1LJRA 2TRXA 2XBIA 3KXOA 5IM9A 3F4TA 4XS4B 1ERVA 3LWAA 4IN0A 2ON5A 1GUMA 2YWMA 2G0FA 1FG4A 2A2RA 5AN1A 4DSRA 5HR2A 3Q6OA 2JU5A 2XC2A 3IAS2 4PURA 2NBSA 1LBKA 2C0EA 4N0VA 2K8SA 4GF0A 2H1AA 1XW6A 1B8XA 5JWRB 5HR3A 1F9MA 4WETA 2YWNA 1SK2A 3F4SA 3QCPA 4TR0A 2PU9C 3F4RA 2O85A 4YQUA 2OE0A 2CAIA 2NVLA 5IOWA 5D8IA 2OKAA 5CRDA 1TU8A 1SD8A 1Z3EA 3ZREA 3GN3A 3F8UA 4OFTA 2A2SA 2IMFA 2OACA 4IBPA 2B7KA 4ULXA 1EOHA 5F06A 4H86A 5G1LA 4J57E 3GKMA 3ZZXA 4KDXA 3QFAC 1HNCA 4FYBA 1PKZA 1ST9A 3V1WA 2LQQA 4EKZA 3HD5A 3DVXA 2DC5A 4XTSA 5AISA 1YJ6A 3MAKA 4IVFA 2B1KA 3H93A 4AJ6A 3TJGA 3QOUA 3HJPA 1XPVA 3LEFA 3DWVA 3O6TA 4TXVA 4OCEA 2DJKA 2IMIA 3VI5A 3O3TA 2H76A 1IYHA 3ZRDA 2GSSA 4JE1A 1QQ2A 3FZ4A 5CO3A 1GH2A 2YP6A 2GSQA 2LV3A 3GURA 5F8BA 2PN8A 2MBTA 2VIMA 3APQA 3M3MA 4L0WA 2GZPA 5J5NA 3ERGA 1VGLA 3UAPA 2JACA 4K2DA 4LL4B 5DQSA 3ZVJA 2RIIA 3UMAA 4MABA 4ZBAA 3TJFA 2YANA 3VFIA 4TN8A 3NZNA 1SK1A 7GSSA 1PX6A 5D9XA 5GAPD 1XIYA 1A2MA 1V58A 1PD21 4WKWA 5CYYA 1TI1A 2B5XA 1R4WA 1T3BA 2PBJA 2P5QA 3CMIA 5EL8A 3VLNA 4FO5A 4NV2A 1X5EA 2VL2C 3HJOA 3QD9A 1URMA 3L9UA 4WBRD 1X9SB 3M0FA 2KOKA 4IP1A 2YWIA 1HNBA 1T8EB 1TI3A 1M0UA 2M80A 3FR3A 3GUSA 3LORA 5HR1A 2QSIA 2YWOA 1PL1A 3LSZA 1ILOA 1X0RA 2OBKA 2LNSA 2IWTA 5H5QA 5ECPB 3HVVA 2YPMA 4TKYA 4AF2A 3L78A 1AQVA 12GSA 2C4JA 3ZVJD 1EP7A 5J41A 4I8BA 4IP6A 3N5OA 3ZMLA 5E4WA 4IJ3A 1LU4A 3UVTA 1FVJA 3KMNA 3U5RE 2CZ3A 2CA8A 4N30A 3L0HA 4FH8A 2MBSA 1XWCA 1OC8A 4MA9A 4DSSB 1SL1B 3IDVA 1B48A 3GTUB 4JEDA 4MDCA 2GZYA 4IQAA 1OC9B 2GSTA 5IO2A 4RQRA 4IQ1A 1GNEA 2WGRA 1ZGNA 1WJKA 2K8VA 2E2GA 1N8JA 1TK0B 3PINA 4X1UA 1GNWA 3RDWA 2CVKA 2HLSA 1EGRA 5B8AA 4F2IA 3CTGA 3MWHA 2VCWA 1SKWB 1QMVA 3APSA 5KN1A 3EINA 2K18A 1GTUA 4MPGA 4YAVA 4NHZA 3QPMA 9GSSA 5CAXA 2DJ2A 1PQNA 4HU7A 5JCGA 4TXOB 2GLRA 1ZYQB 5D73A 4J56E 1U88A 2ZNMA 1YEXA 3D6IA 2OA7A 1TXXA 2P0GA 3BOAA 4GXZA 4J2FA 5JWOB 1M9BA 3M1GA 2FGXA 2H30A 5H5RA 1USBA 2ZCTA 4QQ7A 3CBUA 1EEJA 3RPNA 4NXIA 3H79A 1WWJA 3CRUA 2V1MA 3KEBA 3G7JA 3DYRA 3C71A 2XHFA 3A5WA 1WE0A 5AIXA 3VURA 1FB0A 2WFCA 2F9SA 5DCHA 4NWYA 1A2JA 2GT5A 3C7MA 2FNOA 4XS6A 1GSQA 1Q98A 3VPTA 4HUAA 4G2EA 1SJ6A 1WP0A 5KEJA 4KCAA 1O7UA 5IO0A 5IPHA 2PWJA 2I4AA 1T00A 2DJ0A 3KMOA 5ABRA 4EUYA 4OCFA 2VLTA 1B9XC 3BD2A 1E6BA 3OR5A 2VCTA 5ECKB 2R5GA 3ZITA 3LXZA 2DBCA 3UBKA 1V98A 2LJKA 3LQ7A 4PUFC 3FZAA 3N9JA 1K3YA 2H1BA 2E7PA 2RUEA 4Q5NA 4IELA 3A2WA 4L8EA 2IMKA 5B6NA 3RBTA 4Q5QA 4KH7A 4O32A 4QL9A 2C80A 3P8WA 5CP1A 2F51A 3CXGA 3KD0A 3TKSA 2GS3A 4V2LA 1XW5A 4XS4A 5IMZA 1ON4A 3UBLA 4EXJA 3CSHA 3CTFA 3WT1A 1O6JA 4I2TA 5L71A 2FD3A 1T7PB 2JADA 5EPFA 2H6ZA 1EV9A 4PGTA 5AGYA 2L57A 5DVBA 1C72A 4NPBA 3TJJA 2HXKA 5DCGA 5CNWA 2FWHA 2HFDA 5KN0A 3A3TA 2KHPA 1K0OA 3I69A 4V1Ag 3QAGA 4PXOA 1DE1A 3IR4A 1T4ZA 4MF5A 3TKSE 4GWRA 4N10A 3KM6A 2IIYA 4KUNA 2B7JA 2LRNA 2WJUA 3GNJA 3EVIA 2H74A 3HCZA 4GTUA 1HNAA 3GL3A 2J23A 4BVXA 3Q74A 3TDGA 2HRFA 4XCSA 3GV1A 1I5GA 3TUEA 1XOBA 2H72A 5D93A 3UOMA 4DEJA 1FHEA 3PGTA 3UL3A 1XBSA 4OFMA 1O8XA 2C0DA 3JCML 1FOVA 4ISDA 5F07A 2VD1A 4OMVA 4O5RA 1A2LA 1WOUA 2CAQA 2EIQA 2YN1A 1Z6MA 4IS0A 1TKDB 1BX9A 2MZCA 1SL2B 4GSSA 4E8EA 1KBNA 4I2UA 1WRYA 1U3IA 1T1VA 2X8HA 1X9MB 4IJIA 3IK7A 2GQKA 4EC0A 1RW1A 3F6DA 2PVOC 1H4OA 3TKQA 4F03A 4IHUA 2VLVA 3I43A 2DLXA 5ECHB 3GL5A 3LFLA 3CYNA 2BMXA 1M9AA 6GSTA 4LL1B 1ZZYA 2LSTA 4GQCA 3SWLA 5G31A 1K0CA 1WMJA 4AJ8A 3CSJA 2L6CA 3HVSA 5IPGA 3DIEA 3EE2A 4EO3A 4ZL9A 1XVQA 4MH3A 2NTOA 4OD7A 1SYXA 1BJXA 4NMUA 1TJDA 3MNGA 2VM2A 2WDUA 2XPDA 4KDUA 4BPYA 1F6MC 1ZMAA 3ME7A 3WGXA 5ECNB 2AV4A 2OBIA 5ECQB 1FW1A 4FYUA 1AXDA 3WGEA 2R3XA 2QKEA 17GSA 11GSA 4P3YB 4PQIA 5LD0A 3SBCA 1TRVA 5CRGA 4RI7A 1OAZA 4F0BA 3GH6A 4TW5A 5B8BA 4K8MA 3GA4A 1GWCA 1T4YA 1GL8A 4TOPA 4YQVA 5J3RA 1EGOA 3KH9A 5J9BA 1AC1A 2CX3A 2JZTA 1SD9A 2O89A 3LG6A 3TRXA 2H73A 3KP9A 4BWQA 4I5QA 4XRAA 2VCVA 3P2AA 5HFGA 2FHEA 3RPPA 4ML6A 2LS5A 4DSSA 1BAYA 3LJRA 2OE1A 3GTUA 1TW9A 1X5DA 1UN2A 2C0FA 4BA7A 1OC9A 5J4UA 1SU9A 5DAKB 4I6XA 1QUWA 3TKSC 1AAZA 2YJ7A 3FYGA 2OADA 2LKUA 5IIZA 3VI7A 3BBYA 1WPIA 2WZ9A 3FY7A 4K6XA 1CQGA 4MLYA 4MZBA 4DVCA 5G1KA 4NV5A 1G6WA 2C3NA 2WRTA 2YV9A 5EY6A 3IA1A 3A2XA 1A23A 1K0BA 2C1YA 3EYTA 3Q19A 3GSSA 2HYXA 3VWWA 2P5RA 4ILFA 5G30A 2GQLA 4MJAA 3TGZA 2D2ZA 5CREA 4N11A 5ELAA 4TXOA 4RI6A 2AAWA 2HZFA 3TJBA 1K0MA 3TCOA 1O85A 1ZOFA 4L5OA 4TR3A 5D9WA 4XRDA 4TR1B 3M8NA 1TRSA 4YQMA 4POMA 1AQWA 2G2QA 5IMDA 4ACSA 1G7OA 4HQSA 4GSNA 2IL3A 3HXSA 1M2BA 1SYRA 3GFKA 3GIXA 5G5FA 4MZCA 3I9V2 4RUVA 4F82A 1YF0A 5F05A 2C3QA 1R5AA 2CZ2A 3TRPA 2A4VA 2C0GA 3GSTA 2L59A 3KTLA 1A0RP 4PQ1A 1JLWA 3E3EA 2ALBA 1J9BA 3L9VA 4G19A 4MCUA 2JZRA 1EOGA 4ZB8A 1ML6A 1K0NA 4OWYA 4JBBA 4GQFA 8GSSA 4K9ZA 4KX4A 1BYEA 2IN3A 2E0QA 3F0IA 3IPZA 3TKRA 2X8CA 4GRFA 2E2MA 2IMDA 1K3OA 4YAPA 2J9HA 2GGTA 2NDOA 1MD3A 4MF7A 3QFBC 1TP9A 3UVHA 4FYCA 4CW9A 4FIWA 2KLXA 3CSIA 1JFUA 2RLIA 1YEPA 2VCZA 3LYPA 2EIOA 3EMPA 3GKXA 4V1Ap 2I1UA 1G7EA 3ERFA 2HT9A 4L0UA 4OO4A 1U3AA 4HEA2 1G0TA 4PQHA 2BJXA 1ERWA 1GSEA 5DJLA 2I81A 2M72A 4MPFA 1AIUA 3IV4A 3IK9A 2ZUPA 5D9VA 4HI7A 1XWBA 1MTCA 3L9SA 3J7Yk 1SKRB 2V2GA 3TOTA 1TK8B 1X5CA 2AUVA 4ID0A 2DJ3A 2I3YA 3US3A 3APOA 4HQZA 2IFQB 5G5EA 3GKNA 4QL7A 5C00A 3P90A 2C3TA 1S3CA 3ZFBA 3QR6A 6GSYA 3ZLPA 1GSSA 3FK8A 3GYKA 5GSTA 2V32A 1DSBA 4MK3A 5DJMA 5D9TA 3RHBA 4POKA 4JR6A 2VO4A 1B4QA 1UVZA 3NIVA 1H75A 2VL3A 1F2EA 5E59A 4KDYA 2B5EA 1PGTA 5CRHA 3H8QA 2LUSA 1GRXA 2MMOA 1Z5YE 2FY6A 1Y6EA 5J9CA 2AHEA 4ECJA 2H6YA 2JL4A 2RM6A 6GSWA 3F63A 5ECMB 4PNGA 1XFLA 1GSYA 2PVQA 3KP8A 1M99A 3LXTA 2YNXA 2CQ9A 4NHWA 3Q18A 2B5YA 3QAWA 1YDKA 5ENUA 2B1LA 1UA5A 3FW2A 3ISOA 1UC7A 4K7NA 3IE3A 5H5SA 2H0GA 3DD3A 4Q5RA 3WYWA 1HD2A 4YH2A 3IXRA 4LMWA 1A0FA 3H1NA 2JSYA 5B7CA 1TU7A 3VWUA 16GSA 3ZMKA 3EMXA 2KUCA 1PX7A 2YZHA 4I97A 5IOXA 2HRNA 5CRWA 2NPBA 4X0XA 5B6MA 4TVEA 2HNLA 1VF1A 4O7HA 1VF3A 3TOUA 14GSA 1B9YC 3GX8A 2N5BA 2PGTA 3W6GA 10GSA 3GH9A 2JZSA 3RHCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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