3TKSE

Crystal structure of full-length human peroxiredoxin 4 in three different redox states
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
197
structure length
197
Chain Sequence
b'HLSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYFDKLN'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural insights into the peroxidase activity and inactivation of human peroxiredoxin 4
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-4
source organism Homo sapiens
molecule tags Oxidoreductase
total genus 65
structure length 197
sequence length 197
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
E PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tksE00
1OC9B 3GKXA 2L57A 4YQUA 1YDKA 4FYCA 2B5XA 5ECSA 1V98A 4TKYA 2H0HA 6GSSA 2H66A 4MH2A 4TOPA 1AQXA 3UVTA 1GNEA 4EXJA 2K18A 3UJ1A 1XOAA 3M9KA 3UEMA 3ZVJD 4YAPA 1PGTA 3UARA 1IYHA 1JLWA 3G7JA 3KCMA 4TW5A 1UC7A 1NSWA 3F0IA 3LQ7A 2CV4A 3IOSA 1KTEA 2H72A 3P90A 4MDCA 3PR8A 2CVBA 5INYA 3IXRA 4GQCA 14GSA 1TI1A 5A4WA 3QMXA 1PSQA 2GZPA 1PA3A 4F03A 2FNOA 4JU5A 4GCIA 1URMA 4HI7A 1FAAA 1XOBA 3F63A 1F37A 1GLQA 1JLVA 2KLXA 2DC5A 2RUEA 2V6OA 2VIMA 1NW2A 3QFBC 4TR0A 2R6KA 2B1KA 2VUPA 3APQA 3LJRA 3HCZA 4JR6A 3RPNA 4POKA 3IAS2 5KN2A 2V2GA 3ZIVA 1M2DA 3IE3A 5LD0A 2CX4A 4RUVA 2YZHA 4PUFC 1ZOFA 1G6YA 2FWFA 2C4JA 2AHEA 1A8YA 4KDXA 1V57A 3QCPA 2H8LA 2MBTA 3Q19A 3Q74A 1GH2A 3EMXA 5AGYA 3UL3A 4KNDA 3QAVA 1O6JA 1R26A 5FHIA 4PQHA 1Y25A 5IMFA 1ZCPA 2AUVA 4PXOA 3HVXA 2FGXA 1RK4A 3EINA 4BA7A 3KTLA 4V2MA 2CX3A 2MBSA 3H93A 3TUEA 2PU9C 2H19A 3EE2A 1WIKA 3GH6A 1QXHA 3LORA 4HDEA 1I9DA 1XWAA 2PVOC 4V2LA 4CDOA 3GH9A 3P2AA 2VLTA 3HJPA 2FHEA 3D4TA 2MZCA 1HNAA 1T8EB 1XIYA 1Q4JA 4NXIA 5J5NA 3TDGA 3J7Yb 3HKRA 2NPBA 4RI7A 4KA0A 1AAZA 3DD3A 4J56E 3DWVA 3ZL5A 1WJKA 2WJUA 4MPFA 4IW9A 4WKWA 2FCHA 5CP1A 2A2SA 3VI5A 3WYWA 2L5LA 2YCDA 1XXUA 5H5RA 2P0GA 3S9FA 5F06A 4ECIA 2GS3A 2C0EA 2V41A 1TOFA 2LUSA 3DXBA 4LL1B 2MYGA 3VWVA 1LBKA 4TR1A 4MP4A 3EYTA 2HRNA 5ID2B 3H4KA 1X9SB 4J57E 2V6KA 2OJLA 2LNSA 2I1UA 1WMJA 4DSQA 3GL3A 6GSTA 1SKRB 1AUCA 4JE1A 4HQSA 1PKZA 2ON5A 3EVIA 2IMEA 3GX8A 3GURA 1OKTA 2XBIA 2NBSA 2VCWA 2DJ1A 2XPDA 4WETA 4AJ6A 2REMA 4KX4A 1Z9HA 1FO5A 3EU4A 3K8NA 4BWSA 5ENUA 4XRAA 3TJFA 1QQ2A 4O92A 3HDCA 2FWGA 4G2EA 2FA8A 4L0UA 1T4YA 2CZ3A 1AW9A 2IL3A 2DJKA 2H70A 2QGVA 4Z7XA 1GUKA 1NHYA 1TDIA 4RQRA 1SJ6A 6GSWA 3C7MA 2EIOA 2YWOA 5GSSA 3KTBA 5D73A 3L9UA 1F9MA 17GSA 5IIZA 3TOTA 3FZ4A 1HNBA 1GL8A 1RW1A 3FR9A 4GXZA 3GKKA 10GSA 1XVWA 3P8WA 5DALB 3FZ9A 1GSEA 3F4RA 4ZBBA 3A2WA 2RM5A 1E2YA 1IYIA 4L0WA 5ECOB 3I6AA 4EDYA 5CAXA 4K9ZA 4O32A 5COHA 3DMLA 4LMWA 4MZBA 5GSTA 1PN9A 4KH7A 3FZ5A 5AISA 1HD2A 1JZOA 2RIIA 2L5OA 2VM2A 2X99A 4HJ2A 5D9VA 1VF4A 5EVOA 3KD0A 3WGDA 2ZCTA 2O8VB 3PINA 1O7UA 2X64A 5LCZA 2IFQB 3ZREA 2C3QA 2HNLA 2JSYA 2ALBA 4DSSA 4IQ1A 3I9V2 1U3IA 2GT5A 2C8UA 1A2MA 1B9XC 5AN1A 2C3TA 5ECPB 1GSFA 1YY7A 3VWXA 4WBJA 2EIQA 4HU9A 2YPMA 2VL2C 4JZQA 4PNGA 4GF0A 5G5FA 2DIYA 5CNWA 1PQNA 2LNTA 1A8LA 1Z6MA 5F07A 2WB9A 4IVFA 2LV3A 2CA8A 3G7IA 4EKZA 1JZDA 2H71A 3RAZA 3ERWA 3MDKA 1U6TA 5CRHA 4K7IA 2IMIA 1Z3EA 2R3XA 1BYEA 5IM9A 1EGOA 13GSA 1F2EA 4BVXA 2HSHA 3U5RE 4NPBA 2I81A 4MH3A 2IWTA 2V1MA 4ZB8A 4KCEA 3E3EA 1WPIA 2FA4A 2OADA 3FKFA 3LGCA 4MJAA 4X1UA 5B8AA 3FK8A 2JSZA 3MNGA 1ZMAA 2OKAA 4QQ7A 4WF5A 5HFKA 2N5FA 1XW5A 1MDIA 3CRTA 1Z7RA 1K0CA 4CW9A 22GSA 3KMOA 1V58A 5LNKe 3BCKA 3D0ZA 2TRCP 3KH9A 1SYRA 1TRVA 5L71A 5D9WA 4HS1A 1K3YA 2NDOA 3L0HA 4LMVA 2H76A 3L78A 3UBKA 2LTKA 2F9SA 1OC9A 3NOFA 2J9HA 3KJYA 4I5QA 1PL1A 3ZMLA 5KN3A 1Q98A 3IRAA 1GULA 2FWHA 4OFTA 5IPGA 3CMIA 3LYKA 1A2JA 3BOAA 3UIWA 2VAFA 5AIVA 4HUAA 3F6DA 1ML6A 1SD9A 3V1WA 1LJRA 3KM6A 4XCSA 5JWRB 2JACA 5IOXA 5GAPD 3KZQA 4L8EA 5IMVA 2KOKA 3LG6A 4KAEA 3GX0A 5G5EA 4MF5A 1GP1A 4GTUA 3GV1A 5EL8A 2LQOA 3ZTLA 1O81A 1THOA 3CRUA 1R5PA 4LLRA 2VLVA 1SKWB 2JU5A 4WR5A 1LU4A 1ERTA 4FYUA 2B7KA 1QUWA 3QDNA 2PUKC 1EEMA 1OE7A 1V2AA 2O85A 5DJMA 2K8VA 3NIVA 1GSUA 3KIJA 1HYUA 2KP1A 3DKSA 5A4VA 1FW1A 4JR4A 3TKQA 5CYYA 1XZOA 3GN3A 2RLIA 4OCFA 4YAVA 3TKSE 2QC7A 3KMNA 3VWUA 4G9HA 2H75A 4ZL9A 1K0MA 3ZITA 1SL0B 2OBIA 4ZIJA 4K6XA 5A5KA 5J4UA 1XW9A 3UMAA 2GVPA 1TW9A 2HZFA 3CSHA 4TRXA 4BVYA 1T3BA 3KH7A 1ILOA 5E59A 6GSUA 5F8BA 3QR6A 2DJJA 2VCVA 1MDJA 3HJOA 2PERA 5CO3A 2E2MA 3VPTA 3ISOA 4F0CA 3ZLPA 1B9YC 4OFNA 3US3A 19GSA 1TK5B 4AJ8A 1XW6A 1BEDA 5AIXA 5IMCA 4BL7A 2NVLA 4V1Ag 2PPTA 2MMOA 4IN0A 2JL4A 4QL9A 3IHQA 1YEXA 5J41A 3IDVA 2O89A 4NV2A 1TU7A 1TP9A 3HXSA 2TIRA 3ERGA 2DIZA 5JCUA 5ECLB 4AJ7A 1B48A 4IHUA 1GTIA 6GSXA 4N0VA 1SL1B 4ML1A 2B3SA 3E9JB 3ERFA 3M8NA 2H1BA 1GTUA 3H1NA 3OR5A 1EOHA 5JCGA 2HE3A 3A2XA 2QKEA 3ZFBA 2GSTA 7GSSA 5ID2A 2HRFA 5DCHA 1F3BA 2R37A 4MJEA 1MTCA 4TR4A 5IPHA 5D9XA 5DDLA 2YOIA 1N2AA 2HZEB 3P7XA 1A0RP 1A23A 2C0FA 2E7PA 4MZWA 2WFCA 1PX7A 4EO3A 4ML6A 4K0GA 1EWXA 1FHEA 1YZXA 2DLXA 2DSAA 4HU7A 3MAKA 4KCAA 1K0AA 3EMPA 1K3LA 5DVBA 1GWCA 4TR3A 2LSTA 3RHBA 3ZVJA 3DRNA 2VD0A 2H0IA 3HVSA 3BD2A 1ZZYA 5CRGA 2VLUA 4MF7A 2I3YA 4IP6A 1YEPA 2XPEA 3FRCA 1UA5A 1WP0A 3GIXA 6GSYA 2FUG2 4HQZA 2K6VA 5G30A 3DIEA 3VPQA 5DALA 4DEJA 3A5WA 1JZWA 1EP7A 2HSYA 4MZCA 2F8FA 4G19A 4HOJA 5J9CA 8GSSA 3IC4A 2H01A 3O76A 5GZZB 2IMKA 3FY7A 1SU9A 1VRSD 5HFGA 3D21A 2C0GA 2HI7A 2VL2A 1PMTA 4K7NA 3M3MA 2YWIA 3L9VA 3Q6OA 5ELAA 4EUYA 2X8HA 3FW2A 3QAWA 4DVCA 1PD21 2F8AA 2LJAA 4BPYA 2IFQA 5EY6A 1ON4A 3QAGA 1R4WA 1HNCA 3EWLA 4POMA 5DJLA 4HZ2A 3TJKA 1F6MC 3LXTA 4MJBA 4MLYA 1TTZA 4NAXA 2DJ2A 3PGTA 5IQYA 2FLSA 1YKAA 2B1LA 1FOVA 3WT1A 2YV9A 3APSA 2I9HA 3W6GA 2N5AA 1M99A 1WRYA 2WCIA 1XPVA 2LQQA 3GMFA 2YV7A 2CAQA 2XC2A 3FR3A 3ED3A 1U3AA 3RHCA 2GQLA 2CQ9A 3LXZA 4XS4B 3TB2A 2FY6A 5HFIA 4Q5RA 2JZRA 1SK0A 3TKSC 2IPAA 1DE1A 1XWKA 2H73A 1Y6EA 4OO5A 1GUMA 4N30A 3GHAA 5HQPA 4F82A 4JEDA 1ERVA 3ZFLA 5D93A 1TXXA 5GAND 2CAIA 4V1Ap 2VL3A 5F05A 3F6FA 1FG4A 4PNFA 4N0ZA 1M0UA 1I5GA 4I2TA 3RDWA 1G6WA 1SK2A 4KDYA 2YJ7A 3M1GA 3C73A 1G0TA 4EE0A 1SL2B 1S3CA 4GSTA 1GLPA 1AIUA 4PUAA 1JZRA 2OE3A 1TRSA 3GFKA 2DBCA 1E6BA 3QD9A 2H0GA 4GSNA 1OVNA 1XWGA 2YWNA 2OBKA 1GSDA 2LEGA 2H1AA 4L5LA 2H6YA 4XHMA 5DAKB 4PQ1A 3IA1A 2LKUA 4Q5FA 1H75A 2EC4A 1ABAA 5JCWA 2R4VA 2H6XA 2I4AA 4GWRA 1TRWA 3GTUB 2IMDA 5HR2A 2XHFA 1GNWA 3HZ8A 5KN1A 2K9FA 2YN1A 3UVHA 1BG5A 3JCML 1FB6A 1OKDA 4EDZA 3FYGA 2L6DA 3IBHA 1NHOA 1S3AA 2ES7A 2VM1A 4K2DA 5JWOB 2GQMA 5J3RA 1TJDA 2DJ3A 3GSTA 5IMDA 1BJXA 1XFLA 1T4ZA 5G1KA 1EV9A 3M0FA 3DEXA 2RUFA 5B6NA 2JZSA 1YF0A 1UVZA 3HHVA 2VO4A 3TKPA 1VF3A 2B5YA 1TK0B 1ERUA 2GDRA 4IQAA 4I2UA 4F2IA 2B7JA 3LEFA 2CVDA 1EP8A 2LJRA 2IMFA 2R2JA 1TKDB 2IJYA 4K1FA 3VFIA 2AJQB 2L6CA 3KP9A 2WS2A 3GA4A 4BWQA 4N11A 3DVWA 3EURA 3TRQA 2MMAA 4ZBAA 3EU3A 3PH9A 3I43A 1WWJA 1G7OA 4QL7A 2G0FA 1G7EA 4ZB6A 1PRXA 3C1SA 1DUGA 3F4TA 2FWEA 1EEJA 3C1RA 2WZ9A 5KN0A 4MMMA 4IKHA 3TJBA 1M9AA 3FEUA 2VD1A 4OFMA 4CHSA 2WRTA 2H74A 2J23A 2OACA 1U88A 4G10A 4XTSA 3IR4A 2OE1A 2O87A 2Z9SA 2A4VA 2R5GA 1A0FA 3TGZA 1F3AA 4KDUA 4EVMA 5FT3A 2CT6A 2ON7A 4HZ4A 1MD4A 3SWLA 1ST9A 3RBTA 2H1GA 20GSA 2PWJA 1A2LA 4KSMA 2HT9A 2XBQA 6GSVA 1N8JA 1ZGNA 1XBSA 3D6IA 1ZYEA 1T00A 5D8IA 1EV4A 4AGSA 3HYPA 3QOUA 4KB3A 2HXKA 3TRPA 4E8HA 1BX9A 1W4VA 1X5EA 2V32A 1OE8A 3VWWA 3DYRA 2VCTA 5A4UA 2JZTA 1SK1A 4ILFA 4I8BA 1SJZA 4K0NA 2O7KA 4ECCA 2OA7A 4N10A 1SKSB 3Q18A 3IK7A 1GTAA 2HYXA 1TRUA 1QGVA 3L9SA 2KUCA 4ULXA 2DMLA 2PBJA 2M80A 5IO0A 4ECBA 2HZEA 1J9BA 4IP1A 3UOMA 1A24A 2BJXA 2JADA 1O8XA 2P31A 3C71A 2EIRA 3KEBA 5F0GA 2YWMA 1K0DA 1YJ6A 4KSOA 5IMZA 1RQMA 2B6MA 3A3TA 3HJMA 1B8XA 4NMUA 2F3MA 2X8CA 4ZXGA 2L59A 2BTOT 1K0OA 5C00A 4ISDA 1FB0A 1SENA 3HD5A 1DBYA 5ECMB 4LL4B 4XS6A 2AV4A 3R2QA 5ELGA 3LFLA 1VF1A 2VCQA 3KGKA 4WBRD 5HR1A 2GZZA 4YQVA 1XVQA 2E0QA 2PVQA 3BJ5A 4OCEA 3SBCA 1R7HA 2YNXA 2ZNMA 2DMMA 4LA1A 1AQVA 4XIHA 4P3YB 4TXOB 2VL9A 1X9MB 1J0FA 2AYTA 4ZL7A 3ZZXA 5ECNB 2GT6A 1X0RA 4NHWA 3GKNA 2C1YA 3IK9A 5ECQB 4OD7A 2DJ0A 4KW6A 3G9BA 3UAPA 1K0BA 4D73A 1EGRA 4FIWA 2MMNA 3NZNA 4O7HA 3W8JA 3TKRA 4H86A 4TXVA 4POLA 5FWGA 4I97A 2PMTA 2WULA 1MDKA 1X5DA 4F0BA 1ACVA 4MCUA 3QPMA 1EZKA 2WGRA 1TI3A 1GSYA 4NV5A 2L4QA 2LRNA 2LRTA 4FO5A 2YZUA 2VCXA 1KNGA 1MEKA 2H6ZA 1SD8A 5ABRA 3I69A 5C04A 4Q5NA 3TRXA 3TKSA 2D2ZA 3GRXA 3ZYWA 2AB6A 1THXA 2F51A 3HA9A 3KP8A 5G2ZA 5ECKB 4L5OA 1KBNA 3M9JA 2NTOA 1HQOA 3GL5A 3O6TA 5CRWA 1M2BA 4ZL8A 2OE0A 1GUHA 2K8SA 3HY2A 2CZ2A 4WR4A 3E0UA 2LS5A 4GLTA 1B4PA 4XS4A 5DQYA 4D73B 3GUSA 3LYPA 2H1DA 4GQFA 1QMVA 1K0NA 3F3RA 3CSJA 5H5QA 1Z6NA 2E2GA 1OYJA 5B6MA 4K8MA 1DE2A 4X0XA 2PGTA 2PN8A 1AXDA 2VOCA 2P5RA 3CSIA 1XWBA 1KEBA 5EPFA 4EC0A 2C3NA 2M46A 1TU8A 4IJIA 4OMVA 1JHBA 3N9JA 1PL2A 2QSIA 2YP6A 3F4SA 16GSA 3TJGA 1GTBA 1VF2A 3VI7A 1O73A 5D9TA 3RPPA 5B8BA 4ZB9A 2FD3A 3F3QA 1MD3A 4IJ3A 1CQGA 3GNJA 1ERWA 4X43A 1GSSA 2HFDA 2L4CA 2MMZA 1O8WA 3GKMA 2H30A 2IIYA 1ZYQB 1PX6A 4WF4A 1SYXA 3N5OA 1Z5YE 4KGIA 3CYNA 3ME8A 1W89A 4JRRA 4HJMA 1T1VA 4IGJA 4PQIA 2GSSA 4PX1A 3F9UA 18GSA 5DAKA 4MJCA 2C0DA 2YANA 1QFNA 4TR1B 2C80A 2X8GA 5E4WA 3DGQA 3GTUA 4JBBA 4HEA2 1V40A 1OC8A 3TCOA 1T7PB 1M2AA 5IMAA 1QK8A 1TK8B 3L4NA 1GSQA 1FVKA 4MK3A 2KP2A 3FZAA 1OC3A 3UBLA 5DBQA 1B4QA 4PURA 1WE0A 2GZYA 3ZIJA 3GYKA 3U6VA 2HLSA 3QFAC 5DQSA 4TVEA 2RM6A 3DVXA 3ZMKA 4O5RA 4I6XA 2GLRA 2GSRA 4YH2A 3HZ4A 4OWYA 3D4MA 3WD6A 1YKCA 4RI6A 1XCCA 1OAZA 3CBUA 4ACSA 4XS1A 4IS0A 4FH8A 4MA9A 2GQKA 1UN2A 2YJHA 3D22A 2B5EA 4K7OA 4OO4A 5H5SA 3AY8A 3TOUA 5G31A 3VLNA 4J2FA 5ECIB 3TJJA 4NHZA 3BBYA 3W8SA 1ZL9A 3FR6A 4KE3A 2WDUA 1SJIA 3EC3A 3LWAA 4PGTA 1U87A 1GRXA 3F8UA 3FHKA 3WGEA 4RQXA 3APOA 3WT2A 5KEJA 5ECHB 4ECJA 4EF0A 2KHPA 2CVKA 1PKWA 5CRDA 4ZBDA 2GSQA 3H8QA 3IPZA 5D96A 2N5BA 2BMXA 3CTFA 5DCGA 1S3DA 4ZILA 4Q5QA 4DSSB 4DSRA 5HR3A 3KXOA 1NM3A 1WOUA 1K3OA 2LJKA 1CQHA 3VURA 4KUNA 2P5QA 4E8EA 12GSA 4AF2A 1BAYA 4TN8A 3IAM2 3IV4A 1X5CA 1AQWA 3CTGA 1J08A 4GSSA 3ZRDA 5HR0A 1YF1A 2TRXA 4MPGA 2AAWA 1H4OA 1O85A 3GSSA 4V2NA 5ECRB 1EOGA 3LSZA 3MWHA 5IO2A 5B7CA 3WGXA 3H79A 2VCZA 3HVVA 4YQMA 3A2VA 9GSSA 5IOWA 4ID0A 4IBPA 2G2QA 1BQ7A 2M72A 1R5AA 1FVJA 4MF6A 4EL1A 5G1LA 1USBA 4WXTA 3J7Yk 3MSZA 4MABA 1M9BA 1JFUA 1VGLA 4XRDA 2A2RA 3D5JA 3G7YA 1YQ1A 3CXGA 3O3TA 2IN3A 1XWCA 1M7TA 1DSBA 2GGTA 4FYBA 11GSA 4GRFA 3ME7A 4IELA 2GTUA 3VK9A 5J9BA 1AC1A 5JWQB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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