2ZCTA

Oxidation of archaeal peroxiredoxin involves a hypervalent sulfur intermediate
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
240
structure length
235
Chain Sequence
PLIGERFPEMEVTTDHGVIKLPDHYVSQGKWFVLFSHPADFTPVTTEFVSFARRYEDFQRLGVDLIGLSVDSVFSHIKWKEWIERHIGVRIPFPIIADPQGTVARRLGLLATHTVRGVFIVDARGVIRTMLYYPMELGRLVDEILRIVKALKLGDSLKRAVPADWPNNEIIGEGLIVPPPTTEDQARARMESGQYRSLDWWFCWDTPASRDDVEEARRYLRRAAEKPAKLLYEEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Aeropyrum pernix
publication title Oxidation of archaeal peroxiredoxin involves a hypervalent sulfur intermediate
pubmed doi rcsb
molecule keywords Probable peroxiredoxin
total genus 78
structure length 235
sequence length 240
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2007-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 2zctA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2zctA01
3PR8A 3IA1A 3F9UA 4K7IA 4D73B 1MD4A 1GUKA 5D9TA 1YZXA 3HZ4A 4XRDA 2XBIA 3GKKA 4JZQA 1ZZYA 4POLA 2QC7A 3D4MA 3UIWA 2V6KA 1QGVA 4OO5A 1F3AA 4IJIA 4PQIA 1Z7RA 2EIOA 4AF2A 1PN9A 3TRXA 4KNDA 1V58A 1EGRA 2K8SA 4HZ4A 1R4WA 3VI7A 2H8LA 5JCUA 5F05A 2ALBA 1VGLA 2KUCA 5HR1A 2H0IA 4MLYA 5LNKe 4IQAA 4E8HA 3GX8A 3VFIA 2X64A 1PRXA 5HFKA 2LV3A 3M8NA 4E8EA 3PH9A 3UVTA 3ZIJA 2CA8A 2RIIA 1GSYA 2VCTA 3KD0A 3IRAA 2GSSA 1J08A 1LBKA 4PURA 3WGEA 2AV4A 4DSRA 2FWEA 5G2ZA 1C72A 4I5QA 2OKAA 3RHBA 3UEMA 3UL3A 3IE3A 3I9V2 1Z6NA 5IOWA 1ERTA 4ECBA 2GLRA 1PX6A 1UA5A 4X0XA 1LU4A 5DCHA 4MZCA 5J9CA 2O87A 2LNSA 3UAPA 6GSSA 1M2AA 3IR4A 19GSA 1A0FA 4ZXGA 3NZNA 3TJKA 4XS4A 1OKDA 2O7KA 4ZBDA 3BCKA 5CO3A 3EVIA 1R26A 2C4JA 3KTBA 3UVHA 1NSWA 4CW9A 1A2JA 4MJEA 2DIZA 2VD1A 2B5EA 5DVBA 1SK0A 3DVWA 1XW9A 2XBQA 1ILOA 1QK8A 1WPIA 5IMVA 2LRTA 2K8VA 1JZRA 1SK1A 1YEXA 1HYUA 2XPDA 3H1NA 3DXBA 3CMIA 1U88A 1GULA 2LRNA 1ST9A 4KSMA 3L4NA 1MDKA 1H75A 3QCPA 1A2LA 1SENA 1WRYA 2HFDA 3HA9A 1X0RA 3VI5A 3UJ1A 2FD3A 5GZZB 5D8IA 1F37A 1VF3A 4BWQA 2CVDA 2REMA 2IPAA 2K9FA 4G19A 2C8UA 4O92A 5HR0A 2CQ9A 2VL9A 1EGOA 3LGCA 2H01A 3TKSE 3SBCA 2H76A 10GSA 3TRQA 1QQ2A 1PD21 2YANA 4V2NA 4GRFA 3MNGA 3ME8A 5DQYA 2IL3A 1GSSA 5COHA 2PN8A 2CZ2A 4ECCA 5ABRA 3QAVA 3D6IA 4HDEA 3EMXA 4J57E 4PUAA 4GXZA 4FYCA 2RM5A 2V41A 3FYGA 2C0FA 2ZNMA 2XC2A 3TOTA 2B5XA 3WGXA 2J23A 3E0UA 4EL1A 3FK8A 4JBBA 2IMDA 3ERGA 1A0RP 5LCZA 1SYXA 1BEDA 3GHAA 4KCAA 2V1MA 4GWRA 2YWIA 3LYPA 4RI6A 1VF1A 4MF5A 5A4WA 3IC4A 5ECKB 2LSTA 1M2BA 5D93A 4GSSA 1PKWA 2A2SA 1PL1A 3GN3A 2JSZA 4YQMA 2OA7A 1M7TA 3GKMA 2R6KA 3IBHA 1S3DA 2MZCA 4ULXA 2DMLA 3BOAA 1TP9A 6GSWA 1E6BA 1B9YC 1EP8A 4I8BA 1T8EB 2KHPA 4RUVA 1J0FA 2X8CA 3KCMA 2J9HA 3HKRA 4ZB8A 3I69A 4POBA 1IYIA 20GSA 4GF0A 1TK5B 4F2IA 3K8NA 3KMNA 4BVXA 1ON4A 4KDXA 2H19A 2BMXA 1SYRA 2WZ9A 5G5FA 2TIRA 4TW5A 5KN0A 5IIZA 4I2TA 1EV4A 2HZFA 4Z7XA 2VCQA 4LLRA 5L71A 2NVLA 1AW9A 3LJRA 5B7CA 4AJ7A 1O6JA 2NDOA 3CTGA 5DQSA 2HZEB 5ECIB 5KEJA 1OAZA 5ELGA 4GQCA 4HQZA 1G0TA 4O32A 4XTSA 5AN1A 4TR4A 3ERWA 4GSTA 3IXRA 2JL4A 1B8XA 2X8GA 3VLNA 2GDRA 2H70A 1V2AA 4OO4A 1FVKA 1NM3A 4WF4A 5GSSA 3I43A 1PSQA 1XWKA 4ISDA 1O81A 1WIKA 2XPEA 2OADA 3NIVA 1A2MA 2I81A 3MSZA 4ZIJA 1SL1B 3HJOA 2H71A 1HNCA 2BJXA 3KJYA 1ACVA 3L0HA 2WB9A 1GNWA 1SKRB 4DEJA 2VL3A 1ERWA 4IP1A 2C3NA 4ZL9A 3MWHA 2IJYA 4NAXA 2C0GA 1PMTA 3HYPA 4V1Ap 2I1UA 2N5BA 3U5RE 1IYHA 3TKSA 4G2EA 2CVKA 5AGYA 3HVSA 2YWOA 3D5JA 3ZVJA 2PWJA 2IFQA 16GSA 5KN3A 5ECSA 1B48A 3L78A 3N9JA 1A23A 3GSSA 5E59A 2C3QA 3A2XA 1ZGNA 3GMFA 2B1KA 3IOSA 2LS5A 1XVQA 3HJPA 3ED3A 2CAQA 2YCDA 3CSIA 3F63A 3VK9A 1Z5YE 3VWXA 3FY7A 5AIVA 2IMEA 1GRXA 2L57A 3QOUA 5ECOB 4ZBAA 3TKSC 4XIHA 4N10A 3FHKA 3VPTA 2V2GA 3EMPA 3LWAA 4KDUA 6GSVA 2H6XA 1TJDA 3LFLA 3WYWA 4MK3A 5DALB 2E7PA 5G1LA 3HHVA 3FW2A 1RQMA 1SKSB 4K0GA 1ZMAA 1Y6EA 4IW9A 1OKTA 2E2GA 2HRNA 2EIRA 5G30A 2R2JA 5DJLA 4NHZA 3L9SA 13GSA 1XOAA 1TRSA 3FEUA 1FOVA 2PUKC 2ZUPA 2F9SA 2VIMA 4N11A 1XW6A 3GUSA 3D4TA 5IO2A 3C71A 1SL2B 3VWVA 2HNLA 1W4VA 1K3YA 1R5AA 3TOUA 2RUEA 2P0GA 4PXOA 1TI3A 1OC8A 4TOPA 5G5EA 2QKEA 2AYTA 3DIEA 4WXTA 1AAZA 1FAAA 5EPFA 4HU7A 4IKHA 4EUYA 1EOHA 3GURA 2X8HA 3EURA 2WULA 5IMZA 1V98A 1XFLA 2DJJA 3C8EA 4OWYA 4TR3A 2KP2A 4YAVA 2IMFA 5DAKA 1XXUA 3TKPA 2GTUA 4YAPA 1OE7A 5HFGA 5CRGA 3LXTA 2GSTA 3DKSA 4HQSA 4TRXA 2H75A 4NWYA 5D73A 3QD9A 4LL1B 4WR5A 3KEBA 5D9VA 1WMJA 3KH9A 2H1GA 4KAEA 4HU9A 1TDIA 1B4QA 3VURA 5CRDA 1YF0A 1MEKA 3EYTA 2F8FA 1FB0A 3C73A 1JLVA 3ZZXA 5CYYA 5CAXA 4N0ZA 5H5QA 5CREA 2HT9A 4L5LA 4Q5FA 1AQWA 1WWJA 1T1VA 4WKWA 1DSBA 1K3LA 1DBYA 1EWXA 5KN2A 4EVMA 2OE3A 2YZUA 1ML6A 3EE2A 4ZILA 2GZYA 3ZRDA 2MMAA 2L6CA 2DMMA 1MD3A 1CQHA 1W89A 4X43A 5LD0A 3DYRA 1GLQA 2GZZA 2HSHA 4KH7A 3TKQA 4KB3A 4N0VA 2CX3A 3TCOA 1BJXA 4ML1A 1SKWB 1TRVA 5A5KA 4XRAA 2LNTA 1JLWA 2NBSA 4GSNA 1YY7A 4DSSA 4AJ6A 4AGSA 2DJ3A 2H6YA 4K0NA 2GZPA 2FUG2 3LEFA 1F9MA 1FHEA 4EE0A 4KUNA 4QL9A 3GRXA 3ZLPA 2FLSA 2RLIA 3APSA 2C0DA 1SD8A 2C0EA 3BD2A 3LG6A 3M0FA 5J3RA 4X1UA 2VM2A 3P8WA 2B7KA 2R5GA 4ACSA 2LJKA 1TW9A 4WBJA 1GLPA 3F4RA 3ZL5A 5ECLB 2H1AA 3H8QA 2B1LA 5C00A 2CV4A 2OBIA 5ECNB 1K0BA 2O85A 3R2QA 3EU4A 3O6TA 5IPGA 1OVNA 3W6GA 4K6XA 1ABAA 2ZCTA 1FVJA 1OE8A 2YN1A 1GSDA 2DJKA 4LMVA 3RPNA 4I2UA 1R7HA 3F0IA 1Y25A 2WGRA 2CVBA 4BWSA 2FA8A 3VWWA 2LRCA 1ZYEA 4HS1A 1TXXA 3O3TA 3ERFA 2N5AA 4GLTA 2F51A 3ZITA 5G1KA 4F03A 4XS4B 5JWOB 4MPFA 2B7JA 4DSSB 2AAWA 5KN1A 1DE1A 2TRXA 1JZDA 1GTIA 5ECMB 14GSA 2PVOC 3MAKA 4EXJA 1THXA 2L6DA 1KEBA 4KA0A 5EY6A 3VPQA 2TRCP 4MH3A 2K6VA 3WT2A 5J41A 4LL4B 1S3AA 5H5SA 1TTZA 4WEYA 1M9AA 3DMLA 3CTFA 4EDZA 2GT5A 2DC5A 3ZIVA 1XWBA 2CX4A 1XVWA 1A8LA 1X5EA 6GSUA 5HFIA 3UBKA 1HNAA 4L8EA 3ZFLA 2L4CA 3IAM2 3E9JB 3HZ8A 1EP7A 4MPGA 4EKZA 2VOCA 2N5FA 1WOUA 1TRWA 1S3CA 1SJIA 4WR4A 5DDLA 2IWTA 1FB6A 5ID2A 2B6MA 3RAZA 4FO5A 2NPBA 5JCWA 3KIJA 1U3AA 1X5DA 1K3OA 2ON7A 1O8WA 1O73A 3US3A 4ZB9A 2VLVA 1AQVA 2D2ZA 4KCEA 4F82A 3QAGA 3J7Yk 1TK0B 2WJUA 2HLSA 2GQMA 2YJ7A 3KMOA 1BX9A 3QAWA 4IJ3A 5IM9A 1B9XC 3ISOA 4O5RA 3KGKA 4WETA 1E2YA 4L0WA 1JZWA 2FGXA 1K0DA 4MH2A 2LQQA 1NW2A 4TXOA 1OC3A 2H1DA 4KDYA 1RK4A 2RM6A 3LQ7A 3FR9A 17GSA 2WFCA 1VF4A 2CZ3A 3FZ4A 3Q18A 1Z7PA 2AUVA 1XBSA 3RPPA 1LJRA 4MP4A 2VLUA 5EVOA 1Z3EA 3P90A 1Q4JA 1RW1A 3I6AA 1BAYA 4IHUA 2WDUA 4IBPA 1YJ6A 1YKCA 4J56E 3BCIA 3W8SA 3EU3A 4KSOA 2MMOA 2G0FA 5FT3A 4MZBA 4JE1A 3GX0A 2B3SA 4JU5A 6GSXA 1KBNA 3EINA 1G6WA 3ZTLA 2LQOA 3GSTA 1X5CA 1QXHA 3OR5A 4L5OA 1T00A 3GL5A 3Q19A 7GSSA 3PINA 3GYKA 5D96A 3DVXA 1G7OA 1PQNA 3TB2A 1U87A 4TXOB 4ZL7A 1UVZA 4MF6A 3FZ5A 2PBJA 1GSUA 3Q6OA 3BJ5A 4JR4A 4RQXA 1A24A 3C1RA 4HJ2A 4IP6A 1YF1A 4FYBA 4MMMA 3CYNA 1WJKA 2OE0A 2GQLA 2E0QA 2H0GA 2KOKA 1K0OA 5H5RA 2DSAA 2YJHA 3CRUA 4MJCA 3IHQA 3UBLA 3DD3A 4JR6A 1ZCPA 2PGTA 1YEPA 4TXVA 4ID0A 3C7MA 1UN2A 2GSRA 5FHIA 3G7IA 3CSJA 1TRUA 2HRFA 4PUFC 4NPBA 4IGJA 4F0BA 8GSSA 4HEA2 4MF7A 4OFTA 3BBYA 4JRRA 4XCSA 4IQ1A 4MJBA 3HD5A 2X99A 4H86A 3KZQA 4F9ZA 4RI7A 1G7EA 1V9WA 4Q5QA 3FRCA 5ECPB 3ZVJD 2CAIA 1NHYA 2C1YA 3S9FA 5IMAA 4BA7A 2H0HA 4KX4A 3IDVA 2PU9C 4NXIA 2H74A 5AIXA 2LKUA 3G7JA 5GAND 1N2AA 4MCUA 2FWGA 1SL0B 4OCFA 1GP1A 4PQ1A 2IFQB 3AY8A 4GTUA 5IMDA 3FZAA 2PMTA 3ME7A 3F4TA 3D0ZA 1HQOA 3GL3A 2M46A 4TVEA 1M2DA 2H73A 2F3MA 4OD7A 3CBUA 3F3QA 2GS3A 2YZHA 3LSZA 3D21A 1VF2A 1F2EA 5D9XA 1KNGA 1GTUA 1ERUA 2NTOA 2VLTA 3GKXA 4EDYA 4BL7A 11GSA 3U6VA 5B8AA 1HNBA 2GGTA 2GVPA 3HCZA 2E2MA 1AUCA 3F6DA 1T3BA 2JACA 3LYKA 2IIYA 2WRTA 2HE3A 2LJRA 3KP8A 3NOFA 1Q98A 4TR1A 2A4VA 1FG4A 3W8JA 1PKZA 4FIWA 2XHFA 1YQ1A 3RHCA 5GAPD 4HZ2A 5G31A 3HVVA 2LUSA 2WS2A 2P5QA 2I4AA 2AB6A 2LEGA 2P5RA 2IN3A 4XHMA 2G2QA 2FWHA 4K8MA 1YDKA 2DJ0A 3QMXA 1XOBA 4F0CA 1FW1A 4WBRD 3UOMA 5IMCA 3C1SA 3GNJA 1PX7A 3GH9A 4P3YB 3GIXA 3KTLA 1F3BA 1AXDA 3IAS2 2HYXA 3IK9A 3JCML 4K7NA 5CP1A 1BG5A 3L9VA 2FY6A 2YV9A 3QDNA 1M99A 3LORA 1AQXA 3KXOA 1URMA 2H66A 1QMVA 3GH6A 3APOA 3P2AA 1O7UA 4HUAA 4ECJA 1SD9A 5CNWA 3HXSA 5GSTA 3G7YA 5DAKB 4TR1B 4OMVA 5F07A 1XIYA 3H93A 1HD2A 1X9MB 3F8UA 4OFNA 3G9BA 4MJAA 5J9BA 2L4QA 2JADA 4AJ8A 4G9HA 4HJMA 2GT6A 4RQRA 9GSSA 2PPTA 1XW5A 4KE3A 1JHBA 1XCCA 1XWGA 2VUPA 2I9HA 4EF0A 1GL8A 1K0AA 4YQUA 2DLXA 4ML6A 1GNEA 4GCIA 1XWCA 2MBSA 2EC4A 3HJMA 1NHOA 2DJ2A 3KM6A 5HR3A 4K2DA 4PNFA 1CQGA 3FR6A 3CRTA 4XS1A 5FWGA 1BQ7A 2GSQA 3UMAA 2P31A 1YKAA 3TRPA 4EC0A 2C3TA 2JU5A 4IS0A 4O7HA 2O8VB 4CHSA 3M3MA 3ZFBA 3MDKA 3P7XA 4V1Ag 4TN8A 4ZB6A 3TDGA 2I3YA 1TU8A 3M9KA 4IVFA 3ZMKA 3PGTA 1UC7A 2PERA 4KGIA 1GUMA 1I5GA 2FA4A 4EO3A 2H6ZA 1GSEA 1VRSD 5JWRB 2QGVA 3GA4A 2VCZA 3GTUA 4BVYA 2R3XA 4MZWA 2DBCA 1AIUA 1EZKA 2F8AA 4CDOA 1TK8B 1J9BA 4I97A 4IELA 3RDWA 4NV5A 4FYUA 1X9SB 1A8YA 2YNXA 2Z9SA 2JZSA 4NMUA 1OC9A 1Z9HA 4YQVA 1BYEA 1X9WB 4POKA 3QFAC 1PA3A 1THOA 3FKFA 5J4UA 12GSA 4ECIA 22GSA 3FZ9A 1QFNA 5DJMA 5B6NA 5ECRB 1U3IA 2BTOT 1K0CA 3KP9A 4MABA 2YWMA 4TR0A 2V32A 1B4PA 1M0UA 3QR6A 4J2FA 4QL7A 3L9UA 2L5LA 1GSFA 5IMFA 2AHEA 2H30A 4ILFA 1MDJA 3H79A 1U6TA 5B8BA 5HR2A 4PGTA 2YWNA 2OBKA 2VAFA 3VWUA 2K18A 2IMIA 3A3TA 3A5WA 2KLXA 1EEMA 3GTUB 3E3EA 2LJAA 3SWLA 2FCHA 1GH2A 2HZEA 3TGZA 4OCEA 2VL2A 3GKNA 4K7OA 1K0MA 1TI1A 4Q5RA 2V6OA 4PQHA 2RUFA 5IO0A 2YPMA 5IPHA 2H72A 4N30A 5A4UA 1KTEA 2OJLA 2VCVA 1ZOFA 2MMZA 1OC9B 1T4ZA 4GQFA 1T4YA 2YOIA 1GWCA 3EC3A 4ZBBA 2KP1A 3M9JA 1TU7A 2JSYA 2MBTA 3A2VA 3CSHA 3DGQA 5ELAA 2QSIA 5JCGA 2JZTA 2EIQA 3HVXA 1USBA 1SU9A 3HDCA 2HXKA 2VO4A 2VL2C 4HI7A 2DIYA 3GFKA 6GSYA 2ON5A 5ID2B 1MDIA 3ZYWA 4XS6A 2OACA 4YH2A 2A2RA 3WD6A 1H4OA 4LMWA 2VCWA 3H4KA 4NHWA 3WGDA 5CRHA 5EL8A 5D9WA 3F4SA 3QFBC 4TKYA 2ES7A 3D22A 1QUWA 5HQPA 1TKDB 2IMKA 3F3RA 4ZL8A 1EOGA 2FWFA 1SJ6A 2C80A 1GSQA 3ZREA 3IK7A 1OYJA 3J7Yb 1O85A 4BPYA 3KH7A 2MYGA 1XWAA 4IN0A 3IV4A 2B5YA 3IPZA 3GV1A 5AISA 1DE2A 2AJQB 2VCXA 3APQA 3DEXA 4G10A 4K1FA 4MA9A 4NV2A 1JFUA 2FHEA 5IOXA 3UARA 3TKRA 18GSA 2HSYA 3DWVA 3FR3A 4MDCA 2YV7A 3QPMA 3ZMLA 1V40A 5JWQB 1ERVA 1PL2A 5F8BA 1EEJA 3RBTA 1ZYQB 2VD0A 3M1GA 3TUEA 1ZL9A 5DALA 4POMA 4FH8A 2FNOA 6GSTA 4DVCA 1GUHA 4K9ZA 1SK2A 1AC1A 1DUGA 2YP6A 3N5OA 1FO5A 4HOJA 5E4WA 3Q74A 3DRNA 5F06A 2OE1A 4WF5A 1K0NA 4V2LA 2O89A 1WE0A 4I6XA 3F6FA 1XPVA 5ENUA 3TJFA 2LTKA 1WP0A 5DBQA 5B6MA 5INYA 5J5NA 3V1WA 5ECHB 4D73A 2JZRA 2R4VA 3HY2A 1EV9A 1TOFA 4Q5NA 5C04A 4V2MA 3A2WA 2HI7A 3CXGA 4KW6A 1JZOA 5CRWA 4PX1A 5ECQB 1PGTA 1R5PA 4JEDA 4LA1A 3WT1A 2H1BA 2MMNA 5IQYA 3TJGA 4L0UA 5F0GA 2L5OA 1F6MC 1G6YA 1GTBA 2PVQA 3EWLA 1N8JA 2M80A 4DSQA 1V57A 2CT6A 2VM1A 4QQ7A 2R37A 2DJ1A 1Z6MA 1O8XA 2M72A 3TJBA 3O76A 1T7PB 5A4VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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