4NWYA

Crystal structure of the b' domain of human protein disulfide isomerase-like protein of the testis (pdilt)
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
128
structure length
128
Chain Sequence
SVIEYNTENKDLISELHIMSHMLLFVSKSSESYGIIIQHYKLASKEFQNKILFILVDADEPRNGRVFKYFRVTEVDIPSVQILNLSSDARYKMPSDDITYESLKKFGRSFLSKNATKHQSSEEIPKYW
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure of the substrate-binding b' domain of the Protein disulfide isomerase-like protein of the testis.
pubmed doi rcsb
molecule tags Isomerase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Protein disulfide-isomerase-like protein of the testis
total genus 47
structure length 128
sequence length 128
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2013-12-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4nwyA00
7GSSA 1O8XA 2VL2C 3VLNA 1JZOA 2IMDA 4DSRA 4GCIA 4BVXA 1TOFA 1SK1A 4HQSA 3D22A 3GL3A 2LV3A 4K8MA 3IRAA 2FA4A 4LMVA 2ES7A 3DKSA 2VL2A 1SKWB 4YAPA 1ACVA 1DUGA 3QAVA 4BPYA 4MJEA 4EDZA 3MSZA 4K6XA 2XC2A 2IMKA 4MPFA 2H6YA 2QSIA 3TCOA 3D4TA 1ZZYA 2GSSA 1GLQA 3TOTA 3DWVA 2E2MA 4TR0A 3O6TA 2YWNA 5HR3A 1X0RA 3IE3A 2JACA 2L57A 2ZUPA 5ECMB 4N11A 1XOAA 4PNFA 2VLVA 3TDGA 1M99A 1PSQA 3GV1A 2F51A 1YF1A 2GT5A 4Q5NA 4NMUA 5DDLA 3FY7A 1WWJA 4PX1A 1HQOA 5EY6A 3GMFA 3GRXA 1GUKA 3BOAA 3ERGA 4LA1A 4MP4A 4IKHA 3TGZA 2GZYA 1YF0A 4K7OA 1FOVA 3HDCA 1A23A 2MMNA 2CX3A 3HJOA 1M2BA 4ML1A 3N9JA 2GVPA 3HVSA 1DE2A 1ZCPA 4YQUA 2KHPA 5IQYA 3BBYA 2O89A 1WJKA 2FHEA 1OE8A 3LQ7A 4ISDA 4PQIA 5D73A 3GX0A 1ILOA 5CYYA 1XWGA 1TW9A 2I81A 1F2EA 2GSRA 6GSWA 3KIJA 3GN3A 2AYTA 2N5AA 1TU7A 2HT9A 5ECQB 1HNBA 5GZZB 4F82A 2HZEA 2GSTA 2FNOA 5IM9A 4PQHA 1K0NA 2VM1A 1WRYA 4POBA 3ED3A 4POLA 2LJKA 2VCTA 5J4UA 4ZB8A 1SK2A 3MDKA 1TI3A 1IYIA 3GKMA 1FHEA 2HYXA 1PL1A 2PMTA 2K8VA 1FO5A 1M7TA 4TR3A 3D6IA 5A4UA 3TJKA 2R4VA 2L4QA 1GSFA 2FUG2 1FAAA 5EL8A 3VWUA 3CSJA 3HZ4A 3WT2A 3UIWA 1X5DA 5JWQB 2A4VA 3GTUA 3E0UA 2ON5A 4XS1A 1U3AA 2J9HA 3ISOA 1S3CA 1SJ6A 2K6VA 4N10A 4XS4B 3ZMKA 2FWGA 4EKZA 2DBCA 2OBKA 2RM5A 2HE3A 4FIWA 1GRXA 3IBHA 3IR4A 22GSA 3S9FA 3IK7A 1A2JA 5ELGA 2PU9C 4HUAA 1TKDB 3A2XA 3WT1A 1FB6A 3CSIA 4F03A 5G30A 1TK8B 1E6BA 3TRXA 1J0FA 1WE0A 1SYRA 2DMMA 3TB2A 3HVVA 2AUVA 1U3IA 2XBIA 3KM6A 2I3YA 2NTOA 2V6KA 4IQ1A 2O85A 4EDYA 4POMA 3A2WA 1PD21 1AQVA 1TK0B 3QMXA 3J7Yk 1QQ2A 3KH7A 5CP1A 4I97A 3U6VA 3IK9A 2GTUA 1V9WA 2L5OA 3CXGA 4MJCA 3Q6OA 1SU9A 5GAPD 4ZL7A 4POKA 2H1GA 3KTLA 3UVTA 1AQXA 5G1KA 2CQ9A 5J9CA 5DCHA 2L59A 3QD9A 2YZUA 5HFKA 2V6OA 4TOPA 2H75A 1DSBA 4J2FA 5HFGA 3ERWA 2LUSA 5G5EA 2IFQB 5J5NA 2B1KA 2OA7A 4IBPA 3QAWA 3GH9A 3SWLA 1M0UA 1PQNA 2C3QA 2HLSA 2YJHA 1M2AA 1B4QA 2RIIA 3TRQA 1A8LA 4CW9A 2KP2A 2NBSA 3FKFA 4JR6A 5DALB 4N0VA 4K0GA 3KXOA 2M46A 3F9UA 1PX6A 2R2JA 1OC9A 5L71A 1KNGA 4GSTA 1G7EA 3KCMA 5G31A 4TXOB 3TKSC 3D21A 2LJRA 4GQFA 1YY7A 4TKYA 4J56E 2CVBA 2YV9A 1EOHA 3F6DA 2C3NA 3CRUA 2V41A 2GQMA 2VD1A 1AQWA 4N0ZA 5ECLB 4FH8A 2PN8A 19GSA 17GSA 5IMAA 3ZTLA 4ECJA 2IMFA 1GTAA 3KEBA 3TKSA 3FZ9A 4ZBAA 2NDOA 2I1UA 3FZ5A 2K18A 5ID2B 13GSA 5IIZA 4BA7A 3O3TA 1T8EB 4HU9A 4EL1A 2CV4A 2YN1A 1XWCA 2LNTA 5E59A 5LNKe 4RQRA 2H70A 3ZZXA 4IELA 3ZLPA 3H93A 2VD0A 3EU3A 5D8IA 6GSSA 2YWMA 4K7NA 4O5RA 3NIVA 3VWXA 3WGXA 1QXHA 2A2SA 1YKAA 2BMXA 4X1UA 2VL9A 2DIYA 3UEMA 1PGTA 4TR1B 1A0RP 4LMWA 1BG5A 4L5LA 2L6CA 5FHIA 4V2MA 5HR0A 2HSYA 2VCWA 1MEKA 4N30A 3GNJA 4JR4A 3FHKA 5ECNB 1J08A 3HXSA 1GUHA 1MDIA 2WZ9A 3FR9A 1QMVA 2YP6A 5GSTA 1Z6NA 5JCGA 1Z7RA 3BJ5A 1C72A 2N5FA 1FVJA 2H72A 2OADA 4AF2A 1GNEA 2L5LA 2YV7A 4L0WA 1Z7PA 4HDEA 4GLTA 2EIQA 3ZITA 4EVMA 4XTSA 3JCML 4K0NA 4KH7A 2C0GA 2V2GA 3GKNA 4P3YB 2J23A 3RPNA 3CMIA 5CRGA 2V1MA 5IO0A 2VCXA 1T1VA 1AW9A 1SENA 2E2GA 2P5QA 4L0UA 20GSA 1SJIA 4WF4A 3LWAA 2O8VB 1X9MB 5F8BA 4MZBA 4NAXA 4O7HA 1Z3EA 1G6WA 2M80A 2BTOT 1JLVA 1XWKA 5ABRA 4WBJA 2CAQA 2GDRA 2KLXA 3C73A 4LL1B 5D9VA 3F3RA 3TJBA 14GSA 3FYGA 1XCCA 3H79A 1LU4A 5FT3A 3H4KA 1O6JA 1T4ZA 3HJPA 1O7UA 1ZOFA 1X5CA 4JEDA 1R5PA 1XW9A 4KW6A 1ERTA 1O85A 5JWRB 2KUCA 2H0GA 4WF5A 2HZEB 3EC3A 2QGVA 5GAND 3OR5A 2B5EA 2I9HA 3GYKA 4KDUA 3W8SA 1RK4A 3D5JA 3GKKA 1AC1A 2B6MA 4XS6A 5IOWA 1EP7A 5DAKA 3CBUA 5IMDA 1TJDA 1AIUA 5B6NA 3RHCA 1YZXA 2VCVA 1U87A 1WOUA 3KP9A 2H30A 5ECKB 4ZB6A 3GTUB 2OBIA 2FGXA 2DSAA 2VAFA 1GSUA 1WPIA 2GT6A 3LJRA 4ZILA 3TUEA 4XRDA 1HYUA 4QL7A 3UOMA 4KA0A 4XCSA 2LRTA 2EIRA 1K0BA 1EEJA 4EC0A 4L5OA 4H86A 4QQ7A 5INYA 3RAZA 1GWCA 4YAVA 3IV4A 1K3YA 3GUSA 5IPGA 1B48A 1VF4A 1SKRB 3D4MA 2H73A 2JADA 3FR6A 4YQMA 2B7JA 1H75A 3VWVA 1G6YA 3FK8A 2YANA 1TRVA 2LRNA 3KZQA 3RDWA 3L4NA 4IJ3A 4TRXA 5AIVA 3GL5A 3VWWA 1ZL9A 4BL7A 3PH9A 3J7Yb 2GGTA 1R4WA 3TJFA 3LG6A 1MD3A 3KD0A 3G7IA 3ZRDA 6GSUA 2X8GA 3IPZA 4OFMA 2WS2A 1MD4A 2PERA 1VGLA 4AGSA 3GURA 4WR4A 3KJYA 3C7MA 4OMVA 3HJMA 4V2LA 2GQLA 3O76A 1PN9A 4RI6A 3UL3A 1J9BA 1T4YA 1ZGNA 1LJRA 4L8EA 2N5BA 1SL0B 2WULA 3VI5A 3ERFA 1M2DA 1Y25A 2OJLA 1VF3A 3W8JA 1T7PB 4G9HA 2C3TA 2OE0A 2F8FA 3FEUA 4GWRA 1R7HA 2CA8A 4I2TA 2K8SA 4EUYA 3DXBA 2A2RA 1TTZA 1Z5YE 3EE2A 3FR3A 2FA8A 4OO5A 2X8CA 2XBQA 4AJ8A 1ZYQB 1ON4A 4DSSB 3GA4A 1QFNA 3UMAA 3K8NA 4FYBA 1TK5B 1GSSA 2B7KA 4G19A 2XPEA 1XVQA 3EINA 4F0BA 3EU4A 3DD3A 6GSTA 4WR5A 1GNWA 5ECSA 4F2IA 4D73B 4TR4A 4ECIA 1OAZA 1GUMA 5FWGA 2WCIA 1GLPA 1YEXA 2CX4A 2PBJA 1OC9B 3CTGA 3GIXA 3FZ4A 2O87A 1NSWA 2B5XA 3BD2A 3HVXA 5LCZA 1BQ7A 3P8WA 3TKRA 8GSSA 5IPHA 3IAS2 1WMJA 4O92A 3F63A 2MYGA 3HD5A 4LLRA 2ZCTA 2LKUA 2VO4A 3P90A 4I6XA 3UVHA 4NPBA 3A3TA 1OE7A 1RW1A 2H01A 2IN3A 1TXXA 1GULA 2MMZA 1A0FA 2KOKA 3VI7A 2F8AA 3IAM2 3ME8A 4DSQA 1U88A 1EP8A 5IMVA 4MF6A 4KGIA 1A24A 2CZ3A 2JZRA 3HA9A 5HR1A 3L9VA 1PKZA 1RQMA 3DIEA 1QUWA 2LRCA 4WXTA 2OKAA 1WIKA 4BWSA 2DJ0A 3GH6A 1Q98A 4PGTA 4JZQA 3E3EA 1GSEA 2YJ7A 4ZB9A 2L4CA 4KCAA 3EMPA 4G10A 4HOJA 1VRSD 1GSQA 18GSA 3M3MA 3UARA 2CVDA 5AGYA 1GTBA 4KX4A 1Y6EA 1ERVA 2VM2A 3I43A 1YJ6A 3L0HA 1ERWA 1K0OA 1PMTA 3P2AA 4XS4A 4KB3A 2WFCA 3HKRA 2DJ1A 2LS5A 2VUPA 1T00A 1V58A 3GSTA 1ST9A 1SYXA 1EGRA 3FW2A 3TRPA 5D9XA 5AN1A 4MJAA 3TJGA 5ENUA 3IOSA 3H1NA 2DLXA 3HCZA 5G1LA 2GZPA 3NZNA 3QFAC 2DIZA 4OCFA 1XIYA 2C0DA 4V2NA 3GFKA 5C00A 5AIXA 1LBKA 2JU5A 3Q18A 5JWOB 4MMMA 5CO3A 3KMOA 1XPVA 1QK8A 5ECPB 1SL1B 1U6TA 1UC7A 2R3XA 4KSOA 4CHSA 3ZYWA 3C1RA 2AJQB 3MWHA 3EWLA 5DVBA 4MF5A 4J57E 2IMEA 3LGCA 4IP1A 3HYPA 2ALBA 3ZL5A 3C1SA 3LSZA 5J9BA 3ZREA 4HEA2 2HRFA 3FZAA 4YH2A 2EC4A 2QKEA 4TXVA 4V1Ag 3DMLA 2C8UA 2AV4A 4GTUA 1XW6A 1Z6MA 2K9FA 2DC5A 3LYPA 1OKTA 2FY6A 3F0IA 1K0DA 1TP9A 5B7CA 1SL2B 4K1FA 2VLUA 5KEJA 2NPBA 2R6KA 3VK9A 2NVLA 2RM6A 2WB9A 4MABA 5J3RA 2VIMA 2IFQA 2ZNMA 3PGTA 2JL4A 5E4WA 3VURA 4PURA 1KTEA 3IHQA 1G7OA 5DJLA 4TW5A 3R2QA 1HNAA 2YNXA 3M9KA 1JHBA 1I5GA 4RI7A 5F05A 1ZMAA 1UA5A 1UVZA 4V1Ap 4NHZA 2TRCP 5DALA 1W4VA 2LQQA 1VF1A 2HXKA 3M8NA 1B9YC 1UN2A 1JZRA 4PNGA 5AISA 3TKPA 4E8HA 3KMNA 11GSA 1DBYA 3CYNA 1PRXA 2FCHA 1SK0A 2F9SA 1GTUA 3DEXA 1A2LA 2O7KA 3APOA 1PA3A 3LORA 3LEFA 1BX9A 1KEBA 4AJ7A 5DCGA 2IL3A 1THOA 3EURA 1OKDA 4NV2A 2X99A 3G7JA 3I69A 1K0CA 2DJKA 2OE1A 2F3MA 2PVQA 3ZVJD 1XW5A 4IQAA 3US3A 3EVIA 1R5AA 2XPDA 4MH3A 1FG4A 3WYWA 2LTKA 2MZCA 4KAEA 4I5QA 3TKSE 4MK3A 3FRCA 1TRSA 1OC3A 1JLWA 4G2EA 5F07A 4OD7A 4OFNA 1CQGA 5IMZA 2LEGA 4MZWA 3DGQA 5DQYA 5CRDA 1B8XA 1XWBA 5IMFA 2GZZA 5COHA 1M9AA 4KCEA 5DJMA 2FWEA 3VPQA 4X0XA 3MNGA 2HNLA 1EWXA 2GLRA 5D93A 2VCZA 1X9SB 3L9UA 1E2YA 4NXIA 1GSDA 5C04A 4GQCA 1NHYA 1EEMA 3F4RA 3ZFLA 1TDIA 4WKWA 4KSMA 5F0GA 2HFDA 4MCUA 2H71A 2R5GA 5A4VA 3KH9A 1G0TA 4IJIA 1K3LA 2E0QA 3LXZA 3NOFA 4MF7A 6GSVA 2VOCA 3D0ZA 3DRNA 2D2ZA 9GSSA 3F4SA 1NM3A 3P7XA 1BAYA 1NW2A 5KN1A 3LXTA 2IMIA 1OC8A 2CVKA 1F3BA 2HZFA 1X9WB 1XVWA 3GSSA 2OE3A 2PGTA 5KN3A 4NHWA 1BEDA 3WD6A 1T3BA 3IA1A 3UBKA 3ZIJA 3Q19A 1YDKA 4ILFA 2PWJA 4NV5A 5IOXA 1GTIA 2I4AA 2REMA 2G2QA 1YKCA 2LNSA 12GSA 4FYCA 1A2MA 4ZL8A 3CSHA 3Q74A 1I9DA 4F9ZA 2PUKC 3F3QA 5A5KA 2TIRA 4MPGA 1K0MA 2H6XA 2BJXA 4EXJA 2YPMA 5EPFA 2FWFA 4ULXA 4E8EA 5DQSA 3W6GA 1O73A 5D9TA 2FWHA 1EOGA 4BVYA 3DYRA 1S3AA 2MMAA 3E9JB 2DJ3A 4BWQA 2TRXA 6GSYA 2H0IA 2P5RA 1V98A 1EZKA 5HFIA 3AY8A 3HY2A 5B8AA 3EMXA 3ZVJA 2H76A 2MMOA 4OWYA 5JCWA 1ML6A 4Q5RA 3M0FA 4ZBDA 2L6DA 2RLIA 5B8BA 4KDXA 2PPTA 4AJ6A 1JFUA 2H8LA 4ACSA 2VL3A 3DVXA 1JZWA 2ON7A 4ZIJA 5JCUA 2H6ZA 2DJ2A 1USBA 2FD3A 1JZDA 3QOUA 4I2UA 4XIHA 4ECCA 4K2DA 1B4PA 4IVFA 4IHUA 3I9V2 3IDVA 3M1GA 1ABAA 4XRAA 5EVOA 2C0FA 3WGDA 4HJ2A 2AB6A 3UJ1A 1W89A 2GSQA 3WGEA 1H4OA 3RBTA 1K0AA 2EIOA 4K7IA 4PQ1A 1XWAA 1IYHA 1F9MA 3QDNA 5ECRB 2FLSA 3QAGA 4ZL9A 3KP8A 1O8WA 5F06A 4MJBA 3TJJA 4HZ4A 3ZIVA 2WGRA 4MH2A 3QPMA 1PL2A 4K9ZA 4WBRD 2QC7A 2E7PA 4WETA 3PINA 2X8HA 1MDJA 1B9XC 4LL4B 2LJAA 1N8JA 1K3OA 3HZ8A 4JU5A 1SD9A 2H66A 3EYTA 2YCDA 5H5QA 4MDCA 1KBNA 1FB0A 1PX7A 3F8UA 3N5OA 4GRFA 3LFLA 2B1LA 1PKWA 1SD8A 1TI1A 4OCEA 4OFTA 1SKSB 2JZSA 4RUVA 2C80A 2H19A 3BCIA 3TOUA 1TRUA 3KTBA 1THXA 3APSA 3L78A 2LQOA 3APQA 2KP1A 3UBLA 1F6MC 3L9SA 3GKXA 1XFLA 4OO4A 1Q4JA 3G7YA 1V2AA 5HQPA 4TN8A 4JBBA 2WRTA 5D9WA 4IP6A 1EV4A 2DMLA 4WEYA 1TU8A 1VF2A 4GSSA 2B5YA 1F37A 4GF0A 3UAPA 2G0FA 3IC4A 4DSSA 3RHBA 2C0EA 4ML6A 2IJYA 1MTCA 10GSA 4FO5A 1AUCA 1X5EA 3H8QA 4HZ2A 5A4WA 4DVCA 4F0CA 4PUFC 1HNCA 2HRNA 3GHAA 4D73A 3I6AA 1V57A 5CREA 1EGOA 3M9JA 4DEJA 1GP1A 4MA9A 4CDOA 4PXOA 2H74A 2IIYA 5ELAA 3G9BA 2DJJA 5IO2A 5CNWA 16GSA 2JZTA 5G2ZA 4RQXA 4MZCA 2P0GA 1URMA 2C1YA 1N2AA 2H1AA 2YWIA 3LYKA 3TKQA 3BCKA 1XXUA 4O32A 2VCQA 1S3DA 2HSHA 1V40A 1EV9A 5H5SA 2YOIA 1AXDA 4EE0A 3RPPA 4HU7A 4IW9A 2LSTA 4IS0A 1F3AA 3ME7A 1ERUA 4IGJA 1DE1A 5CAXA 1O81A 2IWTA 3VFIA 5ECOB 2CZ2A 2H0HA 2CAIA 2MBSA 1BYEA 1SJZA 3CRTA 3V1WA 1XOBA 2YZHA 2VLTA 3QR6A 5J41A 1XBSA 1MDKA 5CRWA 1HD2A 2M72A 2RUFA 2V32A 5H5RA 2CT6A 3PR8A 5ECHB 2MBTA 4TVEA 4ECBA 4KUNA 1YQ1A 1FW1A 1GSYA 4KNDA 1A8YA 4ZBBA 4HI7A 1OYJA 6GSXA 3SBCA 4MLYA 5KN0A 2XHFA 3C71A 1M9BA 1BJXA 2H1DA 5G5FA 2GS3A 5IMCA 1TRWA 4KE3A 3KGKA 3F4TA 3IXRA 5D96A 4PUAA 2JSYA 3ZFBA 3U5RE 2AHEA 1XZOA 4HQZA 3F6FA 4TXOA 5DBQA 5KN2A 1GL8A 3MAKA 4NWYA 4EO3A 3QCPA 3A5WA 4Q5QA 2B3SA 5DAKB 4I8BA 3CTFA 5HR2A 2WDUA 3DVWA 4ID0A 4IN0A 4JRRA 2HI7A 5ECIB 2IPAA 1OVNA 4XHMA 2RUEA 3A2VA 1Z9HA 2AAWA 2JSZA 3ZMLA 2WJUA 4ZXGA 5ID2A 2YWOA 2C4JA 4HS1A 3QFBC 4HJMA 1ZYEA 4QL9A 2H1BA 1NHOA 1R26A 1AAZA 4X43A 5LD0A 2R37A 5CRHA 4FYUA 2X64A 4Q5FA 1GH2A 2Z9SA 3GX8A 2OACA 4Z7XA 4YQVA 1QGVA 2P31A 3C8EA 1CQHA 4JE1A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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