2VLU | Genus

Total Genus 32

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	32
sequence length	111
structure length	111
Chain Sequence	AEVISVHSLEQWTMQIEEANTAKKLVVIDFTASWCGPCRIMAPVFADLAKKFPNAVFLKVDVDELKPIAEQFSVEAMPTFLFMKEGDVKDRVVGAIKEELTAKVGLHAAAQ

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule keywords	THIOREDOXIN H ISOFORM 2.
publication title	Crystal Structures of Barley Thioredoxin H Isoforms Hvtrxh1 and Hvtrxh2 Reveal Features Involved in Protein Recognition and Possibly in Discriminating the Isoform Specificity. pubmed doi rcsb
source organism	Hordeum vulgare var. distichum
molecule tags	Oxidoreductase
total genus	32
structure length	111
sequence length	111
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.8.1.9: Thioredoxin-disulfide reductase.
pdb deposition date	2008-01-16

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00085	Thioredoxin	Thioredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	2vluA01

3WGEA 1M2DA 1O8WA 2EIOA 4DSQA 3F0IA 1O81A 2OBIA 4KSMA 1R7HA 3M0FA 3GYKA 4F0CA 2VLTA 2H66A 3PR8A 2J9HA 1XFLA 2FHEA 3NIVA 1TJDA 1TK5B 3QAVA 3A3TA 2WJUA 2GSSA 4NAXA 2IMIA 2AV4A 4H86A 4ILFA 6GSVA 1EV4A 1XWAA 2YNXA 2L4CA 4ACSA 4ZBAA 2FD3A 1A0FA 1PMTA 1AXDA 1M2BA 1CQGA 2G0FA 1AQWA 2R37A 3HHVA 3TKSA 2ALBA 4GWRA 2PBJA 3O3TA 3TRXA 4TKYA 4MZCA 2WFCA 2QGVA 2YWMA 4XIHA 3GKKA 3LYPA 1YJ6A 2YOIA 4MPGA 3C1SA 1YKAA 3I43A 2YWOA 2V6OA 1ERWA 1SKRB 1SK2A 1Z9HA 2VO4A 4F03A 2ON5A 3QOUA 2K18A 3ZFLA 4FO5A 1V40A 2JACA 1TOFA 2OJLA 1N2AA 3F3QA 5HFKA 4HJMA 3KTBA 1ERTA 3UVTA 2V32A 2CAQA 2HZEA 5D9WA 5ECNB 2F9SA 2CVBA 1Z6NA 3E0UA 3RDWA 3BCIA 1PX6A 4E8EA 3D5JA 2WRTA 5IO2A 1G7OA 2VL2C 4CDOA 2OE1A 5D96A 1NHOA 2DJKA 1GSEA 2O7KA 4XRAA 1TXXA 4V2LA 2PWJA 1A2LA 2GS3A 5DCHA 4PNGA 2X64A 1OVNA 3FW2A 1EOGA 2IFQB 1JHBA 9GSSA 1W89A 3EE2A 1VF2A 2HT9A 2L6DA 1TK8B 2XPEA 4EVMA 4K6XA 1Z7PA 3KM6A 2GQLA 2GQKA 3FY7A 1GTUA 2JSZA 3UOMA 3DVXA 3QCPA 2KP2A 3PINA 4EXJA 1H75A 2I1UA 2GVPA 4ZB6A 3CSIA 5JCWA 1S3DA 4L8EA 1M9BA 1GLPA 4MF7A 4HJ2A 2L5LA 2LSTA 2GGTA 3D4TA 4JR4A 1TP9A 4P3YB 2MMZA 1ST9A 3AY8A 4HEA2 2KOKA 4I2TA 3GTUB 3FR3A 1OKTA 2CZ3A 3GA4A 3KMOA 3ZREA 2A4VA 1AAZA 3ZMKA 4N30A 2N5FA 3CBUA 4NHZA 1DE1A 3EMXA 5IQYA 2HRFA 4K8MA 3DIEA 2XPDA 1SK0A 2CVKA 2CQ9A 2L57A 5A4UA 3CSJA 4WBJA 2B5YA 2PPTA 1GSFA 4TR1A 5ECKB 1V57A 4LMVA 5CNWA 3MAKA 4OO4A 2LJKA 2OADA 1ACVA 2B7KA 3DD3A 5IM9A 4OFNA 3ZL5A 2WDUA 2VCVA 19GSA 1EEMA 1QK8A 3TJFA 1TI3A 1X9MB 2IIYA 1EGOA 2WB9A 4HDEA 1TRSA 3P8WA 1BAYA 1U6TA 2LJAA 5DJLA 2LQQA 4XRDA 3PGTA 3UBKA 3CYNA 3CTFA 3RPNA 4ULXA 2CX3A 3ZLPA 1R4WA 4GQCA 3H93A 2J23A 4BPYA 1WJKA 2KLXA 2NPBA 1GH2A 1DUGA 4ZB8A 3TUEA 3IOSA 3UVHA 5EL8A 5G1KA 3FYGA 2C80A 2RM5A 4IN0A 4YQMA 4IKHA 1HD2A 3L9UA 1K3YA 3WGDA 1F3BA 5JWOB 1ILOA 4FYBA 5B7CA 1I9DA 2DJ0A 2V6KA 3OR5A 3C7MA 1XZOA 1SL0B 11GSA 3QAGA 5CAXA 1GTAA 3KEBA 2PGTA 1ZYQB 4JE1A 3E3EA 3VURA 3I6AA 4TXOA 3LXTA 1HNBA 2A2SA 1SK1A 2H76A 5G1LA 2VL3A 3DGQA 3F6DA 2I4AA 5DAKA 2LUSA 1G7EA 1KBNA 3GRXA 1SENA 2HYXA 3W8JA 2DJ1A 4HU7A 1V9WA 4E8HA 3CRUA 2C4JA 4O7HA 3HJPA 4MP4A 1TU8A 1Z5YE 3GIXA 5ECMB 5CRWA 2YJ7A 3MSZA 4XS4B 2DJJA 3HVSA 2O8VB 3ZVJD 4TN8A 5IO0A 2MBTA 3U6VA 1GSDA 3CTGA 2XBQA 2X99A 2LNSA 4YAPA 3EC3A 5D9VA 5HFGA 1GUKA 1M2AA 1OE7A 2FCHA 3TGZA 1PKZA 1BEDA 1B4PA 2N5AA 3VWVA 2AUVA 1IYHA 3HJMA 3GX8A 1XOBA 3D6IA 1SYRA 1TRUA 2M80A 3TKSE 3ZVJA 1A8LA 2N5BA 1T7PB 1WE0A 4JZQA 2D2ZA 4O92A 2FGXA 3JCML 3ZZXA 5JCUA 1QQ2A 2GTUA 4GXZA 3KP9A 1YDKA 2X8HA 5CRDA 3BCKA 2GQMA 1K0NA 2FWEA 4OCEA 3GH9A 3LXZA 5IMDA 4N0VA 2K9FA 2CX4A 1JZWA 1GTBA 1MDIA 4IHUA 2LNTA 2B1LA 2H75A 4FIWA 2E2MA 1G6YA 1GLQA 2GT6A 1GWCA 5FHIA 4NWYA 3HVVA 2FWHA 2YCDA 1JZRA 3RHCA 4KA0A 1MTCA 3APQA 2E2GA 2R3XA 4NXIA 3GL3A 4MZWA 3KP8A 4WXTA 5AISA 4RI7A 4L5LA 4RUVA 1F9MA 4ZIJA 1G6WA 1GSQA 1TRWA 3H4KA 3GHAA 2XBIA 4YQVA 6GSUA 4LL4B 4CHSA 4GSSA 1DSBA 1A2JA 2GLRA 1LU4A 1GRXA 4XS6A 4K1FA 3A5WA 2I81A 4HQSA 3L78A 3IK7A 3QPMA 5IIZA 3P2AA 4MA9A 5B8AA 4DSSA 4G2EA 2LS5A 3QFAC 3N9JA 1H4OA 1LJRA 1T3BA 4K9ZA 2JU5A 3TRQA 5ELGA 3FR9A 4F82A 4RI6A 3KTLA 1FOVA 3EU4A 3U5RE 5JWRB 3DEXA 2KHPA 3GFKA 3VI5A 2X8CA 1XBSA 1HNCA 4DEJA 1E6BA 3MNGA 3EU3A 2HE3A 20GSA 2B1KA 4J56E 8GSSA 2HSYA 3FZAA 5ECRB 2Z9SA 3S9FA 2CVDA 3TOUA 1K0OA 2C3TA 1XOAA 4YH2A 1WMJA 1PN9A 3TB2A 1K0BA 1XIYA 3TOTA 3IPZA 5ECIB 5ENUA 1SJZA 3ERWA 3A2VA 1M99A 1B8XA 5F07A 2MMOA 2MBSA 2RLIA 4OFTA 1PD21 3M3MA 2DIYA 2RUEA 3D22A 1SKWB 3ZIVA 3TJBA 2O87A 1M9AA 3KCMA 1AUCA 3HA9A 3L0HA 1S3CA 3L4NA 1SU9A 12GSA 3ISOA 1GUMA 1BG5A 3ED3A 2ON7A 2FUG2 3SWLA 2VM1A 2TRCP 1K0CA 2F8FA 2DMMA 5H5QA 4LLRA 3W6GA 1TTZA 3UL3A 1AC1A 5DBQA 1LBKA 1BJXA 1EEJA 2ZUPA 4I2UA 4HZ4A 3ZMLA 1K3LA 1TU7A 4RQXA 4MF5A 2PVOC 4V1Ap 4KB3A 1GSUA 4AJ8A 2PERA 4J2FA 3F4SA 4MCUA 1TW9A 1ZL9A 3DWVA 1K0DA 1SJ6A 2YZUA 1FW1A 1XW6A 3RAZA 18GSA 4ZBDA 1GULA 3C71A 2GZZA 3EWLA 5IPHA 2QKEA 1PL2A 2WCIA 3EYTA 1GSYA 5AIVA 2I9HA 4EDZA 3VPTA 3BOAA 2DLXA 3UAPA 4N11A 1DE2A 4KDYA 1ZGNA 2FNOA 2EC4A 3TJKA 1RK4A 2PUKC 2WGRA 4MLYA 1A8YA 4MJAA 3ZITA 5CRHA 5CP1A 4GQFA 1JFUA 2HNLA 4IJIA 2L5OA 1OC9B 4POMA 5DQSA 3VK9A 2GT5A 3C1RA 3O6TA 1F3AA 4I8BA 4O5RA 4X1UA 4KAEA 2BMXA 3RHBA 5F0GA 5ECLB 3IE3A 5D73A 2IFQA 3LEFA 5HFIA 2OE0A 3WYWA 2V1MA 1B48A 2MZCA 1O85A 3V1WA 1KEBA 4L5OA 4Q5FA 5D9XA 2YWIA 5KN3A 5INYA 1K0MA 2BTOT 2DBCA 4MDCA 1YEXA 2H0GA 1YQ1A 5A5KA 3LSZA 1V2AA 2HRNA 4IQAA 1WRYA 1J08A 1CQHA 2DSAA 3QAWA 3FZ4A 4ZXGA 1B9XC 5D8IA 4TR3A 5ECSA 5G5EA 5KEJA 5GAPD 3GTUA 4GF0A 3NOFA 5A4VA 17GSA 1BX9A 4TOPA 4TR1B 1HNAA 1JLWA 2WULA 1PL1A 3C73A 3IAS2 4D73B 5HQPA 1XXUA 4ECCA 4LA1A 1XWKA 4TXVA 3D4MA 2VCTA 1SL1B 3P90A 4NMUA 2VCXA 4K0NA 1R5PA 4EF0A 1YZXA 3PH9A 2C3NA 1T00A 5G31A 2OACA 1XVQA 2B6MA 2HFDA 4EDYA 3GMFA 5LD0A 5F8BA 2E0QA 1A2MA 1WOUA 3UJ1A 4JEDA 4JU5A 4K7NA 3J7Yb 2GSQA 4OCFA 5DQYA 1MEKA 2IMFA 2YN1A 4OO5A 2C3QA 5CRGA 2P31A 2JZRA 5FWGA 4DVCA 3HY2A 3GUSA 2EIQA 2B3SA 2HSHA 2M72A 5IMFA 1MD4A 4V2MA 3IDVA 1HQOA 4WKWA 4HUAA 5HR0A 3G9BA 4F9ZA 3QFBC 2QSIA 4BL7A 1FVJA 3H79A 4PUAA 4XTSA 2HXKA 3Q19A 2TRXA 2H1GA 5HR3A 5JCGA 1GSSA 3APSA 2CV4A 3TDGA 4TXOB 4PQIA 3WT1A 1TRVA 2YJHA 4OMVA 2REMA 2IMKA 4AJ6A 3IK9A 5HR1A 4MZBA 2R4VA 3M9KA 4TR4A 1M0UA 1WP0A 2K6VA 1ABAA 2LRTA 4CW9A 4BA7A 4IP1A 4POLA 2H73A 1TDIA 5G5FA 10GSA 1ZOFA 2C0FA 4NPBA 5LNKe 2VL2A 3VWXA 3WT2A 3FR6A 4MJEA 4N10A 1XCCA 2C0GA 2GDRA 4XS4A 3EINA 1V58A 1NW2A 3H8QA 1YY7A 4LMWA 7GSSA 2XHFA 1OC3A 4KUNA 3TKSC 1N8JA 3GKXA 4MJCA 4PNFA 4Q5QA 2YWNA 1NHYA 4PXOA 2JZSA 4WEYA 1YKCA 1SD9A 2MMAA 2H70A 4OWYA 4X0XA 5ID2B 2WZ9A 2F8AA 3BBYA 2H0HA 2YV7A 5DVBA 3KJYA 4KDUA 3O76A 4ECBA 1IYIA 5CREA 1EZKA 1PX7A 3LWAA 2HLSA 4TRXA 5DALB 1THOA 3IR4A 1J9BA 1MD3A 2VCQA 4IVFA 3MDKA 1KNGA 1M7TA 4KW6A 2JL4A 3VWWA 5B6MA 2WS2A 4IELA 3UIWA 1QGVA 3F9UA 2P5RA 1Q4JA 2HI7A 1BYEA 2NDOA 1R26A 1UA5A 2H72A 3QDNA 4GSNA 3VPQA 4K0GA 4ECJA 4HQZA 4MABA 2C0DA 5IMVA 5D93A 1T4ZA 1OKDA 2VUPA 1F2EA 1O8XA 3ZYWA 4WF4A 1O73A 1EP8A 3DYRA 5J9BA 4KX4A 4AJ7A 4ID0A 4HS1A 3ZFBA 3P7XA 3GN3A 3DRNA 2TIRA 4FYCA 1RW1A 2VLUA 1THXA 2IJYA 3IC4A 5KN2A 1DBYA 3KIJA 5ECOB 4JBBA 5AGYA 3F8UA 1EP7A 4OD7A 4TW5A 1TI1A 1AQVA 3FEUA 4PQHA 3H1NA 2FLSA 1BQ7A 3F4RA 4XHMA 5H5SA 2G2QA 1Q98A 2DMLA 1JZDA 4G9HA 1XPVA 4L0WA 4NV2A 5GSSA 3DXBA 5E4WA 1JLVA 4QQ7A 3UEMA 2VOCA 2IWTA 1ZMAA 6GSSA 1EOHA 3MWHA 3KMNA 4L0UA 3TKRA 4YQUA 4EL1A 4MH2A 4EE0A 2IMEA 2VCZA 3A2WA 4WBRD 1GL8A 1GNWA 4PX1A 5F06A 1XWBA 1TK0B 2XC2A 3DKSA 3I69A 3LORA 22GSA 2VIMA 1F6MC 16GSA 3IHQA 3LJRA 1XWGA 4POBA 5IMCA 4KSOA 1PQNA 1VRSD 2ES7A 2H30A 1VF4A 4XS1A 2IN3A 1HYUA 1OC8A 3HVXA 2X8GA 3BJ5A 1EWXA 5G2ZA 2KP1A 4PQ1A 5A4WA 2ZCTA 1WIKA 1NSWA 3RPPA 3LFLA 5L71A 4OFMA 5J5NA 2MYGA 3ZRDA 3R2QA 2DC5A 2ZNMA 4PURA 3GSTA 3DVWA 14GSA 2GSTA 4KH7A 2QC7A 4NV5A 1RQMA 4JRRA 5G30A 3IRAA 3NZNA 5J4UA 2CAIA 2AB6A 4ZL7A 5LCZA 1X5EA 1AIUA 2AHEA 2AJQB 1FAAA 4K7OA 2P0GA 2GSRA 1X9WB 4KDXA 1PA3A 3TJGA 1OE8A 4KNDA 4IQ1A 2OA7A 4I6XA 2DJ3A 2FY6A 1FB6A 4IP6A 2VM2A 1VGLA 1Z3EA 4IW9A 3QMXA 3KD0A 2HZEB 4F2IA 1XW5A 3ERGA 2IPAA 2FA8A 1URMA 3C8EA 5CO3A 2H6XA 4V1Ag 2P5QA 2B5EA 4TVEA 3GV1A 3RBTA 3VI7A 4TR0A 3LGCA 3APOA 3KGKA 3G7JA 1WWJA 1UC7A 4EUYA 5D9TA 2VLVA 3M1GA 1UVZA 2H0IA 3IXRA 3L9SA 3IV4A 1J0FA 1B9YC 3GKMA 3F4TA 1S3AA 2VAFA 13GSA 1O6JA 2NVLA 4KCEA 2AYTA 2L59A 2PN8A 4F0BA 4ML6A 1O7UA 1OC9A 3G7IA 1QMVA 4X43A 4MMMA 1VF3A 1Z7RA 2H19A 3KZQA 3HZ4A 2I3YA 3HCZA 3HZ8A 1JZOA 2VD0A 5J3RA 5DDLA 1Y25A 3CXGA 2C8UA 4I97A 2A2RA 1C72A 5B6NA 1K0AA 5KN0A 2LJRA 3HKRA 2LQOA 3KH7A 2VL9A 5ECHB 2CT6A 4WR5A 4ZBBA 2DIZA 2LTKA 2VD1A 2O89A 2F3MA 3L9VA 5EVOA 2PMTA 5CYYA 2YPMA 3SBCA 1EV9A 1FG4A 2BJXA 3F6FA 2M46A 2LV3A 5J41A 5C04A 4HI7A 1ON4A 2RM6A 1OAZA 3HJOA 5EPFA 1XVWA 2F51A 3GX0A 4WR4A 5DCGA 1U87A 1E2YA 3M8NA 5GSTA 2R6KA 3GSSA 4GRFA 1B4QA 4HZ2A 2FWGA 4K2DA 1QFNA 3IA1A 3QD9A 3E9JB 4D73A 2KUCA 1SJIA 2YANA 2OE3A 3G7YA 3EURA 3TRPA 3TJJA 3J7Yk 1F37A 4MK3A 4PUFC 3I9V2 4BVYA 3N5OA 1X9SB 2PU9C 2R2JA 2V2GA 2JADA 3VLNA 5E59A 4LL1B 4ZILA 1A0RP 1SKSB 2L6CA 2H6ZA 3FK8A 6GSYA 4XCSA 5IPGA 1YEPA 5ELAA 3IBHA 2DJ2A 4MJBA 1U88A 3F3RA 2C1YA 2B7JA 6GSXA 1ML6A 1FO5A 2H1DA 1SD8A 4IJ3A 1AW9A 3M9JA 1SYXA 4EKZA 1T4YA 5IMZA 2C0EA 4IBPA 3ERFA 1A23A 3VFIA 1QXHA 2FWFA 1XWCA 4FH8A 4YAVA 2LRCA 1MDKA 4MF6A 3Q74A 1I5GA 3US3A 2JSYA 4QL9A 1GTIA 4KGIA 3GNJA 1ERVA 1AQXA 5DAKB 1FVKA 5IOXA 2NTOA 2OKAA 3DMLA 3LG6A 4GLTA 2IMDA 4ZL8A 4GTUA 1NM3A 1ZCPA 4ISDA 1X5CA 3EMPA 3W8SA 4MH3A 5FT3A 3GH6A 5JWQB 4G19A 3ZTLA 3FKFA 1PGTA 2B5XA 1YF0A 3QR6A 1FB0A 1OYJA 4AGSA 2K8VA 4AF2A 3K8NA 3GKNA 2E7PA 4V2NA 5C00A 3VWUA 3HYPA 3TKQA 1WPIA 2HZFA 3UMAA 2AAWA 4BWSA 3D21A 5KN1A 2YZHA 5EY6A 6GSTA 1U3IA 4HU9A 5AN1A 3IAM2 4Q5RA 2LKUA 3KH9A 1X5DA 3TCOA 2O85A 2H01A 3FRCA 1K3OA 1FHEA 1TKDB 3TKPA 3LYKA 1R5AA 3UBLA 3ME7A 2LRNA 4BWQA 4QL7A 3WGXA 1UN2A 2MMNA 3GURA 4RQRA 2H1BA 4ECIA 5ID2A 4ZL9A 4J57E 1PKWA 5COHA 4K7IA 4WF5A 4ZB9A 2H6YA 4KCAA 5HR2A 3A2XA 1KTEA 4DSRA 5ECPB 1YF1A 4EO3A 2GZPA 5DALA 1GUHA 1X0RA 5J9CA 3UARA 3ZIJA 1GNEA 1U3AA 2YP6A 1T8EB 2H8LA 4ML1A 1USBA 3GL5A 1MDJA 4I5QA 2OBKA 3WD6A 1GP1A 3CSHA 5H5RA 4EC0A 2LEGA 1EGRA 1PSQA 3HXSA 4POKA 2EIRA 3HD5A 1PRXA 3CRTA 1G0TA 4GCIA 2RUFA 3FZ9A 4IS0A 3Q18A 4FYUA 4PGTA 5GAND 2FA4A 3F63A 3EVIA 2NBSA 3BD2A 3HDCA 2R5GA 5IOWA 4BVXA 6GSWA 1T1VA 4G10A 5ECQB 2V41A 2L4QA 4Q5NA 5AIXA 2H71A 2CA8A 4KE3A 3LQ7A 4N0ZA 5DJMA 2RIIA 4DSSB 2VCWA 5IMAA 1V98A 1XW9A 1ZYEA 1SL2B 1Z6MA 3Q6OA 3ME8A 4O32A 2IL3A 2H74A 2K8SA 2JZTA 4WETA 4JR6A 1ZZYA 1VF1A 1Y6EA 4MPFA 1A24A 3D0ZA 4NHWA 2PVQA 2H1AA 5ABRA 4GSTA 3FZ5A 5F05A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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