2VLUA

Crystal structure of barley thioredoxin h isoform 2 in partially radiation-reduced state
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
111
structure length
111
Chain Sequence
AEVISVHSLEQWTMQIEEANTAKKLVVIDFTASWCGPCRIMAPVFADLAKKFPNAVFLKVDVDELKPIAEQFSVEAMPTFLFMKEGDVKDRVVGAIKEELTAKVGLHAAAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Hordeum vulgare var. distichum
publication title Crystal Structures of Barley Thioredoxin H Isoforms Hvtrxh1 and Hvtrxh2 Reveal Features Involved in Protein Recognition and Possibly in Discriminating the Isoform Specificity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN H ISOFORM 2.
total genus 32
structure length 111
sequence length 111
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.8.1.9: Thioredoxin-disulfide reductase.
pdb deposition date 2008-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2vluA01
1JZWA 4F82A 4FYBA 4MF5A 2JADA 4RUVA 2WZ9A 4ULXA 5JWOB 5DDLA 1T7PB 4ZL7A 3F4SA 4NAXA 3DIEA 2OACA 4PQ1A 4TKYA 2XPDA 3VLNA 4MH3A 3KJYA 4MPFA 1MDKA 5ID2B 3F6DA 3IBHA 4EKZA 3TKRA 3IK9A 1X5CA 4MMMA 5ECIB 1ZCPA 2B3SA 3MDKA 4XCSA 2VD1A 4JEDA 1SENA 1X5DA 2DSAA 5D73A 3PINA 3IR4A 4HZ4A 2GTUA 1YF0A 5DALB 2A2RA 2KP1A 2GT6A 1R7HA 1QXHA 1MD3A 4Q5RA 4N0VA 1XWBA 3CSIA 1TK0B 3IDVA 1TKDB 3HZ8A 3Q19A 1OE7A 1AQXA 3QAWA 2ALBA 3MSZA 4V2MA 1URMA 3P2AA 4ZILA 3ZITA 2C4JA 1PD21 2B5EA 2LNTA 1A24A 4TR4A 4EDYA 1B4PA 4HI7A 1T3BA 4K7NA 3DGQA 4WR5A 1GUMA 1FVKA 4TR3A 3VI7A 1XVQA 2XBQA 2HFDA 4TN8A 3C7MA 5ID2A 4ZXGA 3G9BA 1V9WA 2VO4A 1GLQA 4LA1A 2N5AA 3W6GA 3TOTA 2RUEA 3HHVA 1LBKA 1GSYA 1B9YC 2TIRA 2F9SA 5ELAA 3GURA 2VM1A 5DALA 3FK8A 4ZB9A 3BOAA 2CQ9A 2LEGA 2C3NA 4QL9A 3DWVA 1YDKA 2C3QA 4MZWA 1T00A 2MBSA 3KP9A 5EPFA 2LJKA 1QFNA 1Z7RA 4PNGA 2B7KA 4ZIJA 4FIWA 1I9DA 1VF2A 2FGXA 1RW1A 3WYWA 2IWTA 4MZBA 2JZTA 3G7YA 1CQHA 1R5PA 1GTUA 1U87A 2OA7A 1TJDA 2OBIA 2F3MA 3KCMA 2Z9SA 5F8BA 2HYXA 3CRTA 2GSQA 3ZIJA 5IOXA 2BJXA 4XS4B 1J9BA 4IQAA 2A2SA 4IJ3A 4LLRA 1TTZA 2H72A 3RHCA 3TKQA 5A4WA 2XPEA 2C80A 4L8EA 2TRXA 4HU7A 1A0RP 5GAPD 4BWSA 4EL1A 1BG5A 5LNKe 1ZZYA 1Q4JA 3LEFA 4QL7A 5DJLA 3GKNA 3TB2A 1M2DA 3WGXA 3W8SA 1PRXA 1XXUA 2HZFA 1GSQA 5D8IA 2YNXA 4OO5A 4K8MA 2FWGA 4AJ8A 2OE0A 5ECLB 2YOIA 4GQCA 3NOFA 2MMZA 5H5SA 3I9V2 3IXRA 1XZOA 3VWVA 2FHEA 2H76A 3HYPA 3ZFBA 2LJRA 1OKDA 2LQQA 2PERA 3VWXA 2LNSA 1SK0A 2WFCA 2H74A 3O6TA 1TRVA 14GSA 4NV2A 2YWOA 4J2FA 4XS6A 1F9MA 4F03A 4YQVA 2CT6A 1V57A 1GSDA 4MK3A 4V2LA 4OWYA 2BTOT 3VPQA 4ACSA 1J0FA 2L5OA 2R2JA 3HKRA 4MZCA 5B6NA 1XFLA 2DC5A 2WGRA 2OJLA 4DEJA 2YJHA 5B8BA 2QGVA 2GVPA 1WE0A 1WJKA 3GHAA 2B1LA 3LG6A 5KN3A 7GSSA 4GF0A 5CRGA 4IQ1A 9GSSA 3D22A 1RK4A 2GSSA 10GSA 4BWQA 1PA3A 1V2AA 4OO4A 12GSA 1N8JA 2V6KA 4K0GA 2PGTA 4IP1A 2K8SA 4GWRA 2V1MA 5D93A 5CP1A 3QFBC 4XIHA 1C72A 3IA1A 1Z9HA 4IN0A 5DCGA 3FR3A 3TOUA 3QDNA 3ZZXA 1JLVA 1EV9A 1PQNA 2O7KA 5ABRA 1K0AA 5D9XA 2K8VA 4F0BA 2LKUA 1G0TA 1OC9B 1OE8A 3UOMA 5A5KA 4EXJA 2PBJA 3HD5A 4JZQA 4K9ZA 5EL8A 2GQLA 6GSXA 1M2BA 5ECMB 2MMNA 5FT3A 4P3YB 1F2EA 1EWXA 1EOGA 1SKSB 2XBIA 1PL2A 2D2ZA 1K0DA 3D4MA 2M72A 4OD7A 1FAAA 4PQIA 3GYKA 3KZQA 4JBBA 3TCOA 3GN3A 2HSHA 5G5EA 3ZMLA 1Y25A 3ERFA 1HYUA 1NM3A 2VIMA 1ERVA 2IMIA 2VCZA 1S3AA 2R4VA 1TXXA 3UBLA 3DKSA 3IHQA 4ZBDA 3NZNA 4Q5NA 3EVIA 2NVLA 1PGTA 4I5QA 2LS5A 2MBTA 2VLTA 5ENUA 3F4RA 3LFLA 1OC9A 1FW1A 5E59A 2GGTA 5JCUA 1SL2B 4OFTA 2AYTA 2GLRA 2C1YA 3W8JA 2WRTA 3APOA 3IK7A 3IRAA 2R6KA 1FHEA 3JCML 4MABA 1G7OA 1K0BA 2OE3A 2H0HA 1XW9A 3TJJA 5A4VA 4XHMA 5B6MA 3RPPA 1VF3A 2O89A 3H79A 1X9SB 1WOUA 1VF4A 3RHBA 2HNLA 3MWHA 4V1Ap 2J23A 3P7XA 4F9ZA 5J9BA 4PUAA 3L9VA 5IO0A 2JACA 3F6FA 1O7UA 1ZMAA 2P0GA 2RM6A 1W4VA 2DBCA 1SK1A 2L4QA 1TU8A 2P5RA 3FZ9A 4WETA 5H5RA 2EIQA 5IOWA 2K9FA 1SJIA 3ZLPA 2L57A 2L5LA 2ZCTA 4PQHA 1O8WA 1B48A 2JSZA 1MTCA 4KCEA 1K0OA 1AQWA 1B4QA 5ECNB 4GLTA 3UVHA 3EE2A 3EYTA 2H1DA 3QOUA 3ME7A 2PVQA 3ISOA 1N2AA 5HFIA 5GZZB 4KX4A 2LRCA 4OCFA 5DVBA 2C3TA 2VL3A 5HR1A 5G31A 1GUKA 2GZYA 3UJ1A 4FH8A 2IMFA 5JCWA 1M99A 3FR6A 4AGSA 4HQZA 3LJRA 3IAM2 4MJBA 4LMWA 2DIZA 2KUCA 4O5RA 5ECQB 2IMKA 4TXOB 3UBKA 2NDOA 4KDYA 3FYGA 5F0GA 3UARA 2V2GA 3TGZA 3FZ5A 3VWWA 2JU5A 2YZHA 3GKKA 5DCHA 4EC0A 2X8HA 1YQ1A 2CVDA 2P31A 5H5QA 3K8NA 5D96A 4HOJA 5DQYA 2WS2A 5HFKA 4HZ2A 1H4OA 1R5AA 2VD0A 1GNWA 4ML1A 2YWNA 3ZL5A 3LXTA 3BCKA 3SBCA 4NMUA 4MP4A 4O7HA 5CRDA 1SKRB 1OYJA 4LL4B 1JHBA 5HR2A 1PL1A 2H71A 3QFAC 1SL0B 2C0FA 2OADA 1YY7A 2I81A 2JSYA 5IMAA 2GS3A 1SU9A 5CRWA 1GTBA 1QQ2A 1YJ6A 5IPGA 3VPTA 5EVOA 1PX7A 1YKAA 4TXOA 3EC3A 4ILFA 3UL3A 5IM9A 18GSA 1SJ6A 2H19A 1YF1A 3I43A 3KMNA 4CHSA 5IMZA 2GQMA 2KLXA 2V32A 3HJOA 2CZ3A 2JZSA 3WT2A 2DMLA 2RIIA 3MNGA 3WGEA 1XOAA 2GQKA 3G7IA 2B7JA 2YWMA 1ML6A 1TI3A 4K1FA 3S9FA 3QAGA 3CYNA 4ID0A 2AHEA 1YEPA 2DJ1A 3D4TA 1TK5B 1KEBA 4RI7A 2ON7A 1F6MC 3GSTA 4YQUA 5CAXA 2H0GA 1G6WA 1M9AA 1U3AA 4POMA 5CYYA 2FA4A 1WIKA 2CAQA 1SD8A 3M9JA 5GSSA 3VI5A 4X1UA 1A8YA 3VK9A 1E6BA 1DE1A 1SYRA 2AAWA 3F4TA 2R5GA 5GSTA 4MF6A 1AQVA 3GA4A 3PH9A 22GSA 3M9KA 3A5WA 3TRPA 3C1RA 3TKSE 2YPMA 1Q98A 3F8UA 5G2ZA 2CA8A 2GT5A 4WXTA 1XBSA 1ERWA 1TK8B 2PVOC 1EOHA 1XOBA 2IIYA 4NXIA 2IMDA 2IFQB 4BPYA 2E0QA 4YAPA 1Z7PA 1H75A 1O6JA 1JZDA 3GL5A 4F0CA 4ECBA 5ECOB 2WDUA 5FWGA 3O3TA 2DJ0A 3HVXA 4E8HA 1HD2A 1NSWA 2HLSA 4CDOA 2ZUPA 1OC8A 1SK2A 2VL2C 3ERWA 3I6AA 4F2IA 2CVKA 4NHWA 2QC7A 1M0UA 3HA9A 2VCQA 4RQRA 3D6IA 3FKFA 4IW9A 2IMEA 3CXGA 5IIZA 1NHYA 1KNGA 3EU3A 4TR1B 1ZGNA 4XS1A 2MMAA 2VLVA 1B9XC 3ZFLA 1X9WB 4IKHA 3H8QA 4AF2A 2A4VA 3QCPA 4I2UA 4ISDA 4K0NA 4WBRD 4XS4A 4ZBAA 5AIVA 1K3OA 1K0NA 3D0ZA 5LD0A 1ST9A 4IP6A 2DMMA 4K6XA 2N5BA 3EMPA 6GSSA 1Z3EA 4ZB8A 2DJKA 1MDJA 1NW2A 19GSA 3GSSA 2DJ3A 3Q6OA 2O8VB 4N30A 2H1GA 4KW6A 4KNDA 2X8GA 5CO3A 3RBTA 2LV3A 2H0IA 3FHKA 3G7JA 1NHOA 5A4UA 2F51A 1PSQA 3CRUA 1OC3A 4AJ7A 1FVJA 4TR1A 2H6ZA 1AIUA 2DJJA 2HSYA 2KHPA 1WRYA 3C8EA 3KD0A 2JL4A 1ERUA 5HFGA 1K0CA 1K3LA 4EVMA 3HCZA 1V40A 3UIWA 2YV7A 4ZB6A 5KEJA 2WJUA 2FUG2 1V58A 5F07A 1XIYA 4LL1B 16GSA 3LORA 3TJBA 3DMLA 1JZRA 3F3RA 2WCIA 4PURA 5HR3A 1GWCA 1PMTA 2LSTA 1OKTA 3V1WA 3TKSC 4TOPA 1AAZA 4KH7A 4HUAA 1THOA 3PR8A 1TI1A 2MZCA 2TRCP 2H66A 5J9CA 1HNCA 2LUSA 4X43A 1QMVA 1XPVA 2YN1A 2H8LA 1WWJA 1GP1A 1G7EA 1VGLA 2RM5A 1TP9A 1AC1A 5IQYA 4LMVA 1GSFA 1ON4A 1VRSD 1XWAA 1GSUA 4X0XA 3D21A 1PKZA 4GXZA 5JWRB 3BCIA 5DAKB 3RAZA 3BJ5A 5L71A 2B5YA 3HDCA 3GL3A 2VAFA 4EUYA 2NTOA 1WP0A 4PUFC 4DSRA 2YWIA 4JRRA 8GSSA 3L4NA 2PN8A 3C71A 1AW9A 3UVTA 5G30A 3FW2A 4ZL8A 2PU9C 1GNEA 3TJKA 3FR9A 5G5FA 1ZYEA 1Z6NA 3L9SA 3UAPA 1PN9A 3M8NA 2X64A 2C8UA 4NPBA 1DBYA 2P5QA 2O85A 4TXVA 2MMOA 4KE3A 2B6MA 2FWHA 1O8XA 3TKSA 3BBYA 2PMTA 3N9JA 2GZZA 4TVEA 4BA7A 4GRFA 1KTEA 3HXSA 3TJFA 2HZEB 1R4WA 3GRXA 2WULA 3LSZA 2H1AA 2L6CA 4ECJA 2LRNA 1THXA 5DAKA 3QAVA 2N5FA 1VF1A 3KXOA 1S3CA 2X99A 1TRSA 3ZREA 4WKWA 1I5GA 4KCAA 1HQOA 5ELGA 4J57E 4G10A 5G1KA 20GSA 2AJQB 4IJIA 2K18A 4MH2A 1F3AA 4KGIA 2XHFA 4E8EA 1U3IA 2VOCA 3GNJA 6GSYA 2ES7A 4KB3A 4HEA2 5AGYA 5F06A 2AUVA 5CREA 3Q18A 3KMOA 5J3RA 1MEKA 1ZYQB 1YEXA 1OAZA 2QKEA 1XWKA 6GSVA 2QSIA 4L0WA 2H01A 4TW5A 3M3MA 4KDUA 2OE1A 4YQMA 6GSWA 5EY6A 4GSSA 1O73A 4POLA 2HZEA 4J56E 4O92A 1DUGA 3GIXA 1EV4A 1XWGA 2BMXA 2CX4A 3APQA 1K0MA 3KM6A 2H30A 4HU9A 1UN2A 2B5XA 3IPZA 1TOFA 5FHIA 3RPNA 1GLPA 1JZOA 2WB9A 3WT1A 3DYRA 1KBNA 3A2VA 4IBPA 3FZ4A 3CSJA 1M9BA 4ECIA 4I2TA 3C73A 3IE3A 3J7Yb 4H86A 1T4ZA 4BVXA 2MYGA 2L4CA 2FD3A 1UVZA 3KTBA 2DIYA 4FYCA 3HVVA 4KDXA 1WMJA 4MDCA 2L6DA 3EINA 4MJCA 4I8BA 3CMIA 1TRWA 1PX6A 2H6XA 2DLXA 4JR6A 5COHA 2FNOA 4MLYA 2JZRA 3TRQA 3GKXA 1BAYA 3EURA 4NWYA 1XW6A 4ML6A 3KP8A 3D5JA 1A8LA 2M80A 1MD4A 3LQ7A 3DEXA 1QK8A 1A2MA 1K3YA 1XWCA 4JE1A 5IO2A 1F3BA 2V6OA 1BX9A 2RLIA 3L9UA 1GSSA 1J08A 4NHZA 2FWEA 3Q74A 4IGJA 2H73A 1ZOFA 5DJMA 5ECHB 1U6TA 3GV1A 4YH2A 5IMVA 3A3TA 2H70A 2CX3A 4YAVA 4GSNA 3U5RE 2HRFA 3L0HA 2OBKA 4N10A 1Z5YE 2C0DA 4GCIA 4JR4A 4GTUA 4Z7XA 2M46A 1DSBA 3DXBA 2CZ2A 4KAEA 3ZTLA 3H93A 2FWFA 2IL3A 2AB6A 3U6VA 2YZUA 4WEYA 1CQGA 2B1KA 1SYXA 5J4UA 2RUFA 4EF0A 2IN3A 1BJXA 4HJMA 2IPAA 3QD9A 2H75A 3GX0A 2C0EA 4GSTA 1SD9A 3US3A 2EIRA 3LWAA 4G2EA 5INYA 2VM2A 4N11A 1TRUA 2HT9A 1PKWA 4V1Ag 4HDEA 2KOKA 5ECKB 1EP7A 3F63A 1A2LA 2GSTA 3IC4A 5ECRB 4EDZA 11GSA 3NIVA 3WGDA 3O76A 1WPIA 5B7CA 4MJEA 2CAIA 2G0FA 4FYUA 3EWLA 1BYEA 2PUKC 5JWQB 1R26A 1Z6MA 17GSA 4DSQA 4V2NA 1FOVA 2VCTA 3LYPA 3ZVJD 4KUNA 2FY6A 2IJYA 3KH9A 5AIXA 4WF4A 3VFIA 2E7PA 1QUWA 2ON5A 1AUCA 1BEDA 1AXDA 1UC7A 5DQSA 3L78A 4DSSB 3C1SA 5D9VA 1USBA 6GSUA 1HNBA 1GULA 3AY8A 4OMVA 5GAND 2KP2A 4IVFA 3TUEA 3GTUB 2CV4A 4WBJA 3ZMKA 3LXZA 4WF5A 1GRXA 3E9JB 2FCHA 3E0UA 4Q5FA 1ABAA 5E4WA 4PNFA 3GUSA 5J41A 2IFQA 3J7Yk 1A2JA 2E2MA 2I9HA 2NPBA 3FEUA 2VCWA 5F05A 3VURA 3APSA 3DRNA 4HQSA 13GSA 3EMXA 4IHUA 3F3QA 4OFMA 3TRXA 1FG4A 4MCUA 5C00A 1GTIA 3TJGA 2YJ7A 4POKA 1F37A 4TRXA 1FB6A 1X9MB 5AN1A 2R37A 1Y6EA 3RDWA 3UEMA 4KSOA 2CVBA 3A2XA 3LGCA 3KH7A 3KEBA 1XVWA 1YZXA 2HXKA 1IYHA 3HVSA 5CNWA 4DSSA 1UA5A 3FY7A 2EIOA 4MA9A 3GH9A 5D9TA 4G19A 3GTUA 5KN1A 2VL2A 2EC4A 2YCDA 1GL8A 4CW9A 3WD6A 2X8CA 1YKCA 2I4AA 2O87A 4IS0A 2V41A 4K7IA 5IMFA 1JFUA 4HS1A 5B8AA 2G2QA 1SJZA 1SKWB 2F8FA 3OR5A 2XC2A 4O32A 1EGRA 3ERGA 4XTSA 3M1GA 5JCGA 2LTKA 4FO5A 5AISA 4WR4A 3QR6A 4OCEA 3KGKA 1EGOA 3FRCA 3QMXA 4PGTA 1MDIA 3GH6A 5IMCA 2I1UA 1S3DA 2H6YA 5D9WA 5CRHA 3H4KA 3ZRDA 5LCZA 3FZAA 1T8EB 5J5NA 1G6YA 2FA8A 2PWJA 1EP8A 3PGTA 1OVNA 2VL9A 4IELA 4G9HA 4XRAA 1LU4A 2L59A 2REMA 1SL1B 4ZBBA 5C04A 5KN0A 3BD2A 3DVXA 4MF7A 1T4YA 4TR0A 4HJ2A 3LYKA 4AJ6A 3H1NA 1ACVA 3CSHA 2GSRA 3CTGA 2J9HA 3GKMA 3CBUA 3CTFA 5HR0A 1B8XA 1DE2A 2GDRA 3DVWA 3F0IA 3HZ4A 4POBA 4EO3A 4RQXA 1ILOA 2FLSA 4RI6A 2YP6A 4N0ZA 1O85A 4L5OA 4XRDA 4K7OA 3UMAA 3KTLA 1T1VA 3SWLA 3P8WA 5IPHA 1JLWA 1EZKA 2HRNA 1TU7A 3P90A 2PPTA 3IOSA 2YV9A 1LJRA 4DVCA 1FB0A 5KN2A 2AV4A 2E2GA 3ED3A 5ECSA 4L0UA 2F8AA 2LJAA 1W89A 4L5LA 4BVYA 3QPMA 1GUHA 3TDGA 3HY2A 3EU4A 3ME8A 4NV5A 1X0RA 3KIJA 4D73B 3HJMA 4MPGA 4EE0A 3GMFA 2VCVA 1M7TA 3A2WA 5ECPB 5HQPA 1V98A 1ERTA 3IV4A 4GQFA 4ZL9A 2VUPA 1ZL9A 3M0FA 2OKAA 4I97A 1HNAA 2C0GA 2DJ2A 2I3YA 4KSMA 1M2AA 2VLUA 2ZNMA 2VCXA 3GFKA 3ZVJA 3F9UA 5G1LA 4KA0A 1TW9A 3TKPA 4BL7A 4PX1A 6GSTA 4OFNA 2GZPA 1GH2A 1EEJA 4QQ7A 3E3EA 3MAKA 5IMDA 3VWUA 3N5OA 1TDIA 4K2DA 2HI7A 3IAS2 1QGVA 1IYIA 1A23A 2NBSA 1A0FA 5DBQA 4MJAA 1GSEA 1RQMA 3I69A 4JU5A 1E2YA 1XCCA 2LRTA 4I6XA 4ECCA 3ZIVA 2R3XA 2K6VA 1U88A 3ZYWA 4PXOA 2H1BA 2HE3A 3HJPA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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